|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os08g0295300|
| |
| − | Description = Similar to Threonyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (EC 6.1.1.3) (Threonine--tRNA ligase) (ThrRS)|
| |
| − | Version = NM_001068010.1 GI:115475757 GeneID:4345200|
| |
| − | Length = 9581 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os08g0295300, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 8|Chromosome 8]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 8:11975902..11985482|
| + | |
| − | CDS = 11976088..11976183,11976397..11976468,11976718..11976789,11977796..11978017,11978096..11978188<br>,11978756..11978848,11979793..11979879,11980205..11980237,11980338..11980432<br>,11981837..11981921,11982025..11982111,11982226..11982322,11982416..11982504<br>,11983004..11983093,11983176..11983303,11983629..11983704,11983915..11984004<br>,11984096..11984155,11984321..11984558,11985099..11985433|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008401:11975902..11985482
| + | |
| − | source=RiceChromosome08
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008401:11975902..11985482
| + | |
| − | source=RiceChromosome08
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgctcgtctgcctccggcgacgaggcctctcgctcctccggcagcgcccgccccgccccttcccccctctcccgcgcccgcgcagcagcccaccccgcgtcgcctccctccgccccctctccgccgcggcgatgggggagaactccgccgccgccgccgggaaggggaaggaagcgaaggggaaggcgacgacctcggcctcggcctcggcaccgaacgtcgagcccgacgtggcctaccttgaggcggtgacgcagaagcggatccggcagttcgaggagatccaggccaagcaggccctcgagcgcctcaacatcggaggcgagcccatcaggataactttgccagatggtgcagtcaaggacggaaagaaatggatctcaacccctatggatattgctaaggagatatcaagtggattagcaaatagctgcttgatagctcaagtgaatggaacactgtgggatatgacgaggccactggaaggtgattgtgaattgaagttgttcaagtttgatagcaatgaagggcgtgacaccttctggcactcaagtgctcatattcttggagaatctcttgagagggcatatggctgcaagctgtgtattgggccatgtactacaagaggggagggtttctattatgatgcctactacaatgatctgacattgaatgagacacattttggtatcattgatgcccaagcacagaaagctgttgcggaaaaacaaccatttgaacgaattgaggtctccagggcagaggcccttgaaatgttcgcagaaaataaatttaaggttgaaatcattaatgagttgcctgaagacaagaccattacagtatacagatgtggtcctctagttgacctttgccgtgggccacacatccccaatacttcctttgttaaagcttttgcttgtcttaaggcatcatcgtcgtattggagagggaaagcagatcgagagagcctgcagagagtatatggaatttcttttcctgattctaaacgtctcaaggaatataaacatctgctagaagaggctaagaagcgtgatcataggctattaggacagacccaggatctcttctttttccatcaacttagtccaggaagctgcttcttccttccacatggtgctataatatacaacaaattgatggattttttgcgacagcaatacagagatagaggatatcaagaggttttgagcccaaatatttacaatatgcaactctgggaaacctctggacatgctgcaaactacaaggagaatatgtttgtttttgagattgagaaacaggaatttggtctcaagccaatgaattgtcctggccattgcctaatgtttgagcacagggttcgttcatacagagaattgcctctccggatggctgattttggagtccttcacaggaatgagcttagtggtgcacttacaggtttgacacgtgttagaagattccagcaggatgatgcccatattttttgcagagaaagccaaatcaaggacgaagttaaggctgttttggacttcatcaattatgtttacgagatatttggatttaaatatgaattggagctatcaacgagaccagaaaagtacttaggtgatattgaaacctggaacaaagcagagcaacagctgacagaagccttaaatgagtttggaaagccatggcagatcaatgaaggtgatggtgccttctatggtccaaaaattgatattggtgtgtttgatgccctcaagaggaaatttcagtgtgcaactctacagctcgattttcagctgcccctacgcttcaagctgacttactctgcagaggatgaagccaaacttgagaggcctgtgatgattcacagggcaatcctaggttctgttgaaaggatgtttgctattcttttggagcattacaatggtaaatggcccttgtggttgagtcctcgccaagccattgtttgctccatatcttccaattcagtggaatacgctaaacaggtccgtgctaggatacatgaagctggttttcatgtagccatcgatgagacagacaggacaatacagaagaaggtacgggaggctcaattagcccaattcaactacattcttgtcgttggtgcacaagaagcagagactggacaggtcagcgtcagggtaagggacaaagctgaactagccacagtgagcattgatgacatcatcacacgttttaaggaggaagtagcagcttacaaatga</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MLVCLRRRGLSLLRQRPPRPFPPLPRPRSSPPRVASLRPLSAAA MGENSAAAAGKGKEAKGKATTSASASAPNVEPDVAYLEAVTQKRIRQFEEIQAKQALE RLNIGGEPIRITLPDGAVKDGKKWISTPMDIAKEISSGLANSCLIAQVNGTLWDMTRP LEGDCELKLFKFDSNEGRDTFWHSSAHILGESLERAYGCKLCIGPCTTRGEGFYYDAY YNDLTLNETHFGIIDAQAQKAVAEKQPFERIEVSRAEALEMFAENKFKVEIINELPED KTITVYRCGPLVDLCRGPHIPNTSFVKAFACLKASSSYWRGKADRESLQRVYGISFPD SKRLKEYKHLLEEAKKRDHRLLGQTQDLFFFHQLSPGSCFFLPHGAIIYNKLMDFLRQ QYRDRGYQEVLSPNIYNMQLWETSGHAANYKENMFVFEIEKQEFGLKPMNCPGHCLMF EHRVRSYRELPLRMADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCRESQIKDEVKA VLDFINYVYEIFGFKYELELSTRPEKYLGDIETWNKAEQQLTEALNEFGKPWQINEGD GAFYGPKIDIGVFDALKRKFQCATLQLDFQLPLRFKLTYSAEDEAKLERPVMIHRAIL GSVERMFAILLEHYNGKWPLWLSPRQAIVCSISSNSVEYAKQVRARIHEAGFHVAIDE TDRTIQKKVREAQLAQFNYILVVGAQEAETGQVSVRVRDKAELATVSIDDIITRFKEE VAAYK</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 8]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>9300..9395#9015..9086#8694..8765#7466..7687#7295..7387#6635..6727#5604..5690#5246..5278#5051..5145#3562..3646#3372..3458#3161..3257#2979..3067#2390..2479#2180..2307#1779..1854#1479..1568#1328..1387#925..1162#50..384#ctatctaccctaatccatccgccgccgccgccgccgccgccgccactttatgctcgtctgcctccggcgacgaggcctctcgctcctccggcagcgcccgccccgccccttcccccctctcccgcgcccgcgcagcagcccaccccgcgtcgcctccctccgccccctctccgccgcggcgatgggggagaactccgccgccgccgccgggaaggggaaggaagcgaaggggaaggcgacgacctcggcctcggcctcggcaccgaacgtcgagcccgacgtggcctaccttgaggcggtgacgcagaagcggatccggcagttcgaggagatccaggccaagcaggccctcgagcgcctcaacatcggaggcgagcccatcaggtgagccccgttctgcgattcgttgtgaatttgatgtagttaagaaactgggagggctttgattcggaaaccgtaatgcttgcggcgcgttatagatgaaaatggagttagatactacatggatggcagatgtctcaggcattgagatgtagatataggcatatagcacaccaagggaatatcctcgatagccatgctttgtgctgcataatttggagtcggattttgagtgttgggaatatttgaatgtcgatgcgacgacaaaatgggcgctgcgcaaactgcataataatgccataatgttattcaactttaacatccatctgtctttaataagaaaatagagacggcaagcatttcttctgcctaaatattctaatatagaaaacccttgattatatggtgcttaggtttccttttctcaatgtacctttgctagttacaatacaaatgtggcacactgtgacctgcaatgtgcagcacaatggcaatggcaattaattcttctcatgtgatttttttccctgcaactttcttcaggataactttgccagatggtgcagtcaaggacggaaagaaatggatctcaacccctatggatattgctaaggagatatcaagtggattagcaaatagctgcttgatagctcaagtgaatggaacactgtgggatatgacgaggccactggaaggtgattgtgaattgaagttgttcaagtttgatagcaatgaagggcgtgacaccttctggcactcaagtgctcatattcttggagaagtgagttaaagcttcataatttccttgtatcatgtttttttctttaagcaagttgtatggttgtctctttttcttttttgtttacacatcgagtgattttgcatgtctctctgctataagtccttttgaattcagtattttctaattgaagatgcacttttgcagtctcttgagagggcatatggctgcaagctgtgtattgggccatgtactacaagaggggaggtattgaattaatcaaaaatcgtgttcagtgcaagaaagataataagccctcttagtgattaacataatgtttctacttttacctgttaagggtttctattatgatgcctactacaatgatctgacattgaatgagacacattttggtatcattgatgcccaagcacagaaagctgttgcggtatgctcttattttgaactcattttaaagtttgtgtttacccttttttgtggacgctacttagcagttttactctttgacttatttgatattaatctgtcatgaagtgtgatatcgttattggattccatgattatgccatgttttctttgtaacgtaattggaatcatctatctgctaactcttggtttttaacccaacatggtgcaggaaaaacaaccatttgaacgaattgaggtctccagggcagaggcccttgaaatgttcgcagaaaataaatttaaggcaaaattcctgatttatgcttgttcttgatcttttcttgtactctaacagtcccattgtttcgcttattcatatgcttatccgaattgcttattaacaaacaaaaaaaatcatttgtgactaaaacgactcaaaagaaaatgctgtaaaataaactataatgaaagaaacaagaaaaaaattaaattaaattaagttctaaatttcaaaacttgacttataagcataagcataagcgaattaatgaggccctaaatatctatttctgcttatatcacatttgagattttattaaattttttatttgtttgaattgtgtttctaggttgaaatcattaatgagttgcctgaagacaagaccattacagtatacagatgtggtcctctagttgacctttgccgtgggccacacatccccaatacttcctttgttaaagcttttgcttgtcttaaggtaattctttggttgtcttaagcttttgcttgccaatatttttatggaactatccaatttgtacttgcatgtaaatatgtaggcatcatcgtcgtattggagagggaaagcagatcgagagagcctgcagagagtatatggaatttcttttcctgattctaaacgtctcaaggtatagcatatgattttggctattgttcagatatgggcgttcattaattaatgtggagtctgtttttgtgctatcatgtctgtgctactggacacaataatgtaccctctatgtttgcattttagacactagagtattaatatttcattgtgataagattggagttgatttggcaggaagtttagcgtgcactacatggcatgtaaattgcacaaaatatacaactatatctcaaaagtgtatctatgggctctgtgctttggtggaggttggggttgatttgcccaactgaacaacaattgtcattacagaagtatatggtttctttttattagtcagttattacgaatttcttcaattaatacatggttaggttcagacagtgcaacccttgtcagctattttacaagttactaattcctaagttcttttttatccatttgttttatcactggtacactatggttttcatatatgtttcctgctcaataatccataggaatataaacatctgctagaagaggctaagaagcgtgatcataggctattaggacagacccaggatctcttctttttccatcaacttaggtaactcaaggttttcggtttgactttttcatatcttaatttaccttggcttctattctgcctcaggatgtttgattcactttgactgtgcagtccaggaagctgcttcttccttccacatggtgctataatatacaacaaattgatggattttttgcgacagcaatacagagatagaggatatcaagaggtgggcattaatttgattggctggtcaatcttttgttcagattatgattagattactagatcatgggcatgcatttccactgtttctctctgttcatgatgtctgtattttcaggttttgagcccaaatatttacaatatgcaactctgggaaacctctggacatgctgcaaactacaaggagaatatgtttgtttttgaggtaagtctagtgtgcagaggatttgctctgtacatattatagattacattttggatgaattacgatctttattactgggtgcttgttggtcttattcttgcagattgagaaacaggaatttggtctcaagccaatgaattgtcctggccattgcctaatgtttgagcacagggttcgttcatacagaggtaaatctccttcataatggcatagttgtatcacaaaatgtatctcttttatcaagtgaaaattcctgctgtcaaagtaatcgcttcaaccttctgcctgtatgaactgtttttcttctatgatttaattctccctctatttctttgatattgtgcatgcacatttattatctagtggcttgtgctttctcattaaaattttcataaactgaaaatgtaggcagcaaaaacagttccttagttgtctggcaattaaactaggggtgggcataattaaccgtgacgaagaactgaacccgaaatgacccaaactggaatccagtaaaaatatcgggcttcagctctcaataactgaatttagtcctgttattttggttattaggctcgggtaattgagaaatcgaaacatatcaataagccttgtccagttcagcccaagagagaaaaccctaacttcccctcacctccccactcttaactccccagtccccacttctcctaccactaccccgactcctcccacacacggcaaacgctgctgttgccgccccgccctggctcccgcctgtgcccccacagcatgctgctgtctctgcaacactctgcctccgttgccgcaattccacgccatcaacagtggggaccaccttcaccagagatctcaaggaggctctcggtgctctgccacgccggagagctcaaggcggcggttgctggggaacactggtgtcgccaccgttgtgaacatgcggttccctgcccatggtcccctgatggcagcggattggtggacacgtctatgcccgctggctacatctcgtgctctttgctccaaattgtgttgatttgaacttcatctatgtagggtattgtgcatagatctaatttgtgttgatttctgttgattctgtggctgattttgggattatatgagttgattctgtggctgatttgagtattctatgatttctttttggatgtgtaaaacagcagttgtaatatcttggttagtttggtcacaaccggagaccgaactgaactagccgaaaccgaattcgtcagtattcatttttttttccaatgtgtttcggtctctattttcagatgaccgaacttttcaaaacaccgacgaactgaaccgaatgcccacccctaaattaaattcctaattcggcaaaagtaacggctctagaattacttagtgaattgttttttggtgaatgatgtagtactgaaattgttgtccacatgtacattttgaactattggcttttgctattgatataaatgatgaacttcccttttctaatattatagcaaggggaattttatatatgatgtgttgtgtttttgtgttttgacaacctttttcttaacactaacaacttaattaaaatgctgcagaattgcctctccggatggctgattttggagtccttcacaggaatgagcttagtggtgcacttacaggtttgacacgtgttagaagattccagcaggtaatgctaatgttgttttgtgggttgttaatttctatactaattcaatccagttagtaatctccttgttttaaccacttctgatgcattttccctgtaggatgatgcccatattttttgcagagaaagccaagtaagtttgaattctgcaccattctgtatatctgtttttagtagggaaggggtgccattgcaatcataatgacatgctactgaacagtgtatttacactgtgtgacataaattagtttaggcaccagaagctcataatatttagatgttcatgacttgcatactgtatggatgctagtttgtattcccatttgttttcacaatgtttcagatggtgttaatcacaacctccttttaacagctgcactgtgcttcggataattttaaatagtgtcccctgattgtataagggcctacttttcttaagagttctttctttgttgcagatcaaggacgaagttaaggctgttttggacttcatcaattatgtttacgagatatttggatttaaatatgaattggagctatcaacggtaatcatctcgttgttgctgtatgattaatagcatctagaaattcacaggaactaggattcttggaacttcaatatgtattcgagaagtcacataaatagatgcttagcaagtgttaggttgctgttataatctggatgaagttggttaagtatctttttaccatttctgcttcccatgtctactcctgcctaaatcccaacataccaggtaactttgtgatgattgcatttaagagaaaaaaaggttatctctatacaaatttttaaaggttaacaagtcatttcatctcctatggtcctactggaattcctgtgcacatttcttgaacaacgtagaaggaaaatcgaactggctatgaagtataactatgttggtacgatacaatccatttttgcactgtgtattgtgaacctgaggttggtgaggtttatgaaaggcctatgaacctgctagtctctgttttggcatcgtagatcatttcatactttttgtttaatttcaatcgttgtaggcgaatcataatttatcattgtatgtgggctttggacatgtgctgagaaaataagcatgccagatgttgaacatgttacttgtattttgcatctatgtactccctctgtccacaaatataagcattccatgtgtttgatatttgttcacaaatataaggcattccacagtactaattgttccattcctcctttaatgaggggcaccaaagtctttctcctcaaccttaatatctgctgaacaacctagaaatgcttatatttgtggacagaggtagttgttttcccattttcctatcactattgtgaactgctaatgtttgggaaattctcagcatcctacggaacaatatgtgaataactgatggttatggcttgatcctcagcatggttgtaatgttgcatatctttctcttttttttttttttgcagagaccagaaaagtacttaggtgatattgaaacctggaacaaagcagagcaacagctgacagaagccttaaatgagtttggaaagccatggcaggtactatgacagtcactcccctcagaatgtttgtttcagtctatgctattagaagtgcatttccaacattcattattttcacaatatggttaacgagagtttgcactaatttcttccactatttttaattttacctgcactcagcattatcactagagtcctttgtcaaaaggtattatgctttatttagttttggcttaactctaatgtcgttttggtaacaacatgtactgtatgttgattactattgatagaaatatatttttttaatactgatttctattgatacaaatatatttctttatgccggataatattgatagaaatataatttagtggtaatgttttcagtaaacatcttaggagagattattcttctttgactcaattggctggttcctgtcatttttaaatttcaaataatttcatattctcaatctgaagtttggatgtaatactggcggaatacccaatcttgaagtctggctcgcaagttgtgattactggttgtttcctagcagtttttttatcccttattggtgtacttatttagatgtctacatgcagatcaatgaaggtgatggtgccttctatggtccaaaaattgatattggtgtgtttgatgccctcaagaggaaatttcagtgtgcaactctacaggttatattgaatgtcattttgtttttaattgtagacagaatagaaggttatttatctaaacttcatttcctgttacagctcgattttcagctgcccctacgcttcaagctgacttactctgcagaggatgaagccaaacttgagaggcctgtgatgattcacagggcaatcctaggttctgttgaaaggatgtttgctattcttttggagcattacaatggtaaatggcccttgtggttgagtcctcgccaagccattgtttgctccatatcttccaattcagtggaatacgctaaacaggtaaaaggtccttgtgtcatagaatttactaattactattaattagtagctcttctccattgatcaaagtgtgaaaatcttctagtaccttctgattcgataggtggtgctttgtcttagttttccgtggtggtccaaactatatttcttttagttcaataaaaactacttgttaaatttgagttgcctgatgggttttaaacatgtataatttttttatatgttactattattttgacgtggaatttgtctggtgaacctatcgctacaacccccagctgtgaaatatttttaaactttttgtactgcatgatgcactgtgtcaacttatttcatagaatacttatgtaccgaactaaatgccaaacaatttacacgtgtcattagactgtagtatgcatgatgcaggtttttattttaaattatagcctgatgtcgttcgaatgcaagtccaatttgatacagattatccacagctaagggcttctttttgatttatcagatctcacacatttgtctgacataagttttttgatatgtttgcatgagtaactattcagctaattgttaatttaagtcccagacaacattagctttctttttgcaaggtgaggatggcttttaaaaagtctcatgatgaaatgataacaacagtacaagattgtctttggtttcttatttgatcatatatacttcctcgatttcttgatggatataaacatccatgcagtgctggaaatgtttattccttattaattaggcttcgtttttgtattgagtggatttcatcacacagcattggaagtctgtctagtccattattattttaattggctcaatttatcttaaatggattccagatgacacttgggtgtattagtaatgtactttttataaacataatacattttgaagttcgcccactaattccacgcatggtcaaatgaaaccttgcttacagtggagtaagaattttggtaactaatcagttctcttctgtactcaggtccgtgctaggatacatgaagctggttttcatgtagccatcgatgagacagacaggacaatacagaagaaggtagttccatcatgtcatagtgtaatttatgtttgtcctttattattgtttgctttcaactctttgaatagcaaaacggaggtatgcaacaatatgtggtatgcattgttctgattttttgttgcagggactgttccattttggttttgcccatgctgcaagaaagttctattattttagtaatttagtttacacggttctcaacaatgtaatctgtgaattggtcacgaccatttttcatctttgcaggtacgggaggctcaattagcccaattcaactacattcttgtcgttggtgcacaagaagcagagactggacaggtttttaccctttgcacccctgttttcactagagatgtggaataattatttctttctgccatccatatgtacaggtgaactagacaattaaattcaagagatgaagtagtcatcctcagataactaaaaaaaacagcccactggttcatatgaaatgtgtagtcctatattatttatacggttgccttatcattatggcttacgctattgcaggtcagcgtcagggtaagggacaaagctgaactagccacagtgagcattgatgacatcatcacacgttttaaggaggaagtagcagcttacaaatgattttgatttcacacccttttgctaagaatttactccaaatttgtgattttgatggtgtagcgggcagtgtaatcttgctattttatttcttgacaaaagtacatctgattgtcttttcttaataacgaaagtgtgctattcttcatcagcgacatatatagggatgggtgtttgatcaactcttgc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001068010.1 RefSeq:Os08g0295300]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 8]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 8]]
| |
