|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 8]] |
| − | GeneName = Os08g0514300|
| |
| − | Description = Peptidase C48, SUMO/Sentrin/Ubl1 family protein|
| |
| − | Version = NM_001068765.1 GI:115477267 GeneID:4346026|
| |
| − | Length = 8647 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os08g0514300, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 8|Chromosome 8]]|
| |
| − | AP = Chromosome 8:25597821..25606467|
| |
| − | CDS = 25597821..25597907,25599759..25599812,25600668..25600802,25601101..25601211,25601287..25601430<br>,25601511..25602131,25602217..25602390,25602486..25602711,25602807..25602898<br>,25602991..25603089,25603183..25603231,25603318..25603371,25603559..25603731<br>,25603808..25603879,25603960..25604055,25605220..25605318,25605628..25605731<br>,25606187..25606373,25606459..25606467|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008401:25597821..25606467
| |
| − | source=RiceChromosome08
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008401:25597821..25606467
| |
| − | source=RiceChromosome08
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgtccggccattgccgccaccactcgatctccctcaccggtgcattacggaccaaaccctcgcgccaccgtgcttgcctcgacgagatgggtcatcaaaagaactgttgtacagattcagaaactttgcatcatgatgatatggttcaccaaaagcgttcaaaattggataattgtagccagcccataagtgaatctgatgatattaattctgagtctttgcctgctaaagatgatgattacaattgtgattctgatgataactcagccagtcatgatatggatgtttcacaaccacatgtaaatgaaatttctacaaatgaacttctgaaaactttgaaaaggaaactcagtaagtctaaaagaagtgaagatgataacattaagatgaaaaggtctgaatctattgaattggacaatgatgtaatgataaatcaggttctacgtgatatcatacaaagggatcaaattatcaacagtttgaaaaaaaagcttaatattcatcacaacataggtgatcaaaatttgaaggacaaaaatgttgacactgatttgaagtctgatgcattctctagattctcagtcaaatatttctcaaaagttgattctttaagtccacatcacaaaacagtcattgaaaattcttgttttcaaagcatgctgctatttgacaagtgttttgttcccaattcttttgctctctggattgcaaaacaagtagatgtgaactgttctgatatagttttgggccaaaaacttattccattgaacaagcaatttgtccatgttgtgctaggcctccctgttggtggtagtacaatccattcaaaatttgattctggcaaacaaaagattcttcagatttttgggaaaacttctattccttctgtcaagttctttggagaaaagttaattaaaaatgaagaacttcctgatgatcaaattctcatctgctttatgattgtttccttgaattgctttctttgtccaaactcttctttgattccaagtacaaaatacctaagtgcctttgaagacatggacttaattgaaagtttggactggtgcaagttagtttttgactggttgatggaacacattagcaagattgagaaatcaaaaacttttggtggttgtttattccatttagcggttaattacctggattttctcaactttggttcacaaaaagtattacttgatacaccaagaataaaagtttggaaaagatctatgattaaggactattccaaatttgataaaatatctgaaggagtgtatggaaaaagaccagtcaatgatattgcttcaacttgttacccaatggtgaataatagctcatcttcatttgctgatatgctcaaaagttctgttggtgatctgttgccaagtgatgttcaagacaaaatttgtcatttgctctgctatcattttggaaaagaagatgaaatctttgaagacaaggctaagaaacttcttatagatgttctgttgttgttagctgattgtagttccaattatcctactcaacctgctgcacatgaaaattcaggaattgaaccagatcatgaaccagttgaagaaaataatgatgatgttaatcaagctgtgaaaaaaaataacaatttcacctcatctccaaagggaaacagtaaaacaatactagatgatgataagttgccaattccaaatgaagaatttaatcctgtgaataagtctaccattttgaattcttcagaagagattaaacatatcaacattgatgaaataatgacaaagttgaacaaaacaggtcatgttcctattaatccaccagatgaaacagagaaaaattctgccttgactgctcgaaacaatcaagtttttcatgatcaaccgtcttttaaaatctgggattctgatgatgacctccatcatgaaaatgatgatttcaaaaaagaaattacacctgctcatcttgtagattcatatcaagttattcctgattcatactccccaaatcctgttttaagaaataagatcactccaagaaagttgtctcaaacttttgctgctgctgttgaaagcccaataatctgttcagacagtccggataagatgtacatggtgacacttgaaaattcaacttctcctaatgcttctctcaatgaaaacaaagaaaatgaaaaaggttgtcacatcataaaggatgatcttctaaagcatccatcaagaactgatttctcatcagttaggaaatgctttgatggtgcatcaaaagctagacctattcaatcatgtgaaatgacatccaattttgcacttgcttggaattccattatggaagaatatcaaatcaattttgatgctttcaaaattgtatatccaccagtacctcgccaaaataatctttttgattgcggagtttttactctaaaatacatggaactatggggtccaagagttcagctgacaaaccatttctctcaaaaagacattcaaaacattaggattcaatatgtcaaccgtcttttcttccatccagacaattctgttctcggtacaggaacaaagaaactagtgattgactttgctcagggaaattga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MSGHCRHHSISLTGALRTKPSRHRACLDEMGHQKNCCTDSETLH HDDMVHQKRSKLDNCSQPISESDDINSESLPAKDDDYNCDSDDNSASHDMDVSQPHVN EISTNELLKTLKRKLSKSKRSEDDNIKMKRSESIELDNDVMINQVLRDIIQRDQIINS LKKKLNIHHNIGDQNLKDKNVDTDLKSDAFSRFSVKYFSKVDSLSPHHKTVIENSCFQ SMLLFDKCFVPNSFALWIAKQVDVNCSDIVLGQKLIPLNKQFVHVVLGLPVGGSTIHS KFDSGKQKILQIFGKTSIPSVKFFGEKLIKNEELPDDQILICFMIVSLNCFLCPNSSL IPSTKYLSAFEDMDLIESLDWCKLVFDWLMEHISKIEKSKTFGGCLFHLAVNYLDFLN FGSQKVLLDTPRIKVWKRSMIKDYSKFDKISEGVYGKRPVNDIASTCYPMVNNSSSSF ADMLKSSVGDLLPSDVQDKICHLLCYHFGKEDEIFEDKAKKLLIDVLLLLADCSSNYP TQPAAHENSGIEPDHEPVEENNDDVNQAVKKNNNFTSSPKGNSKTILDDDKLPIPNEE FNPVNKSTILNSSEEIKHINIDEIMTKLNKTGHVPINPPDETEKNSALTARNNQVFHD QPSFKIWDSDDDLHHENDDFKKEITPAHLVDSYQVIPDSYSPNPVLRNKITPRKLSQT FAAAVESPIICSDSPDKMYMVTLENSTSPNASLNENKENEKGCHIIKDDLLKHPSRTD FSSVRKCFDGASKARPIQSCEMTSNFALAWNSIMEEYQINFDAFKIVYPPVPRQNNLF DCGVFTLKYMELWGPRVQLTNHFSQKDIQNIRIQYVNRLFFHPDNSVLGTGTKKLVID FAQGN</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>1..87#1939..1992#2848..2982#3281..3391#3467..3610#3691..4311#4397..4570#4666..4891#4987..5078#5171..5269#5363..5411#5498..5551#5739..5911#5988..6059#6140..6235#7400..7498#7808..7911#8367..8553#8639..8647#atgtccggccattgccgccaccactcgatctccctcaccggtgcattacggaccaaaccctcgcgccaccgtgcttgcctcgacgaggtgaacccatttttctagtttcccctttcccttagtaatcctataagccactatagccacttcttttatcgccggagcaaagcttttgtctccaccgttccggcctcctcccttgttcccttcgcctgccactgcctttcctaagtgcgccgtgcgcgggaacacgcgccgccgctgacgccgccgtcccccatccaccagagcgccggcagcccgctcgccttcccctcttcctcctctcggttctctgtgaaacagagagaagagagaagacgggaggaagaaggaggaaaagaaaaagaaacggaaaggctatatgactgtcgcatgtttttgttgggctgtatcagtcgtttttttggtcccttggattttgtttgagattcgtgctatctagacttttgttttcttttgtatgtgggcttttgattattgtaagttcgggcttccatacgtgggctaaatgggcttcttttttttttacatttttgtgggacccactttgtgttgccgatagagaaatttttttgtgagagtgttaatggtgggacccacatacactattcaaattttgaaatccgcaccggagagagagattgtctgaatcagactagagagagagtgtgagagattcattttgctttttgcctttttcctcgtcgtctcgtccggcgatttcggcggagatttcgtcggcgactccgggaggcgacgacgctgcgtaagctacgccgcggcgtggattcgtgcaggctacgtcgcggcggtgattccactggagtttgcggtgtgggcttctccatcttgtcctcgagctccttctcctctttttctctggtgagtatgttttgattcttctccagcttcatttgttagcttgctgctcgattcgttgttgttttgctccgctagttgtgctccttttgccgatggagagagagagttatagaaggagaggttgacgattttgtcgtctcgttctcatcgtctccggcgacgcggcggcgatttagcgaggcgacgaggctgctcttcggcgagccgcgccgtcgattgcgcaagattattccagtggctttcctttttgttttttttccttttttgttcatttccatctcctatttagcatgctacatgttgtgtttcgttgattctgtagtactagtcgttctagttttcgtagatctgagcaccttttgtttcggtgtttgtttcattgaatccccatgattcgtgttcgattttgcttttgtgattttttttaggtttctgtgatatatttgttcataaatttgtgctatgcgatgttctagaaagtttcgtttatgtgatgtgtgatgtgtgatctgtgatatgtgatatgtgatttacgaattgtgctctgtgatctgtgatgtgtaaagttagatctagtttttcccatgggaatttgagttgaatctatagttgctcccttgttctccggatgttaggttgtgatttgttgaatctgcgagttgctattttagtagatgcgtgtgatttgttttgaatgatgtttatgaagaagtttgctcatgtttggatttatagaagtttgtgttgcattattttgtctctcttactatttgtactttatttgtagtcttcaactatttgtttagcttgctagctgatgaattattgttagctgtagatctgatagtgaattattgctgtgatttatgtattgattatgtttctattttccctgtgtgctatgcaatgttctatttctcatttcatttttttccattgcttatgatatgtgcatccttataataactccttgtgcttttttttttgtctctctccctttgttttaattattagatgggtcatcaaaagaactgttgtacagattcagaaactttgcatcatgatgatgtgtgtgatttagttgtgtgttgtattactattgctacataagtactatatccacgttgtattttgttttctagttctttgtgtgtactcaaatgtaagctagaaatatgaagcctgagatattgatctgaagtgtagatcaatataggttttaacttatatagatcattcgattcctatatagacagccccttaatttaatttctgttaagttagggcaggcatgcaggttaattgattttgttacgctagtttattgagaactttatgatctatgcaaatttgttagccttgtgggatttggatgtctttttgtagctgttcataatgtttgtagtagactggattacactctagtgcaaaccccatttttgttattggactcgtgtttatgtacttaggtctaacatgtcttcccctttggggatttagacgccatttgtgtcggttctactgctaatgtttgtagtagactggattcattggattgcgtgcctctgcatagaccaactgtggaatggtcatgttccctagtgtgaatcaggtgtacagggcttaagtttgtgagattgtttgactttttatcatagtgtggacctctttgcatatatttgtgaggacatggagatatactataacatttgacttacaagttgaaagtactaaccaacgtatatatattgtactgggagttaattttgttcgtttgccatgtttaagtaatgttcatttttttcttgaataaagtggtcaatttctgaggaattatatatctttttttaatgcataccttcacttattttataatttatagtctgccaaactttattgattttttattgctatttttaatagatggttcaccaaaagcgttcaaaattggataattgtagccagcccataagtgaatctgatgatattaattctgagtctttgcctgctaaagatgatgattacaattgtgattctgatgataactcagccagtcatgtaagtttattttacatttcaatttcattgatttgtaatatagttgtttttttcatttccatttgtaaattcatgaagagtttgcaattatacattctcattgcttggtagccaatgtaatagtatgaccaatattttcttgttttatttgttcttgaattgtcatgttgttccaaggtcagaatagtatccattattctttcattattttttttcattagtatgcagttgtagctctgttgtagccatgtttcatagcacatttgcaatgttttaattgtttaatatgtttttttaggatatggatgtttcacaaccacatgtaaatgaaatttctacaaatgaacttctgaaaactttgaaaaggaaactcagtaagtctaaaagaagtgaagatgataacattaaggtaattattttgtttgttatttttcattttatatttttccatcattcttgtttttaattttgaattttttttaagatgaaaaggtctgaatctattgaattggacaatgatgtaatgataaatcaggttctacgtgatatcatacaaagggatcaaattatcaacagtttgaaaaaaaagcttaatattcatcacaacataggtgatcaaaatttgaaggttagttttttgcaatgcccttttatatctatgtttggtttttatttattgattaaattgttttattttctttttgtcaggacaaaaatgttgacactgatttgaagtctgatgcattctctagattctcagtcaaatatttctcaaaagttgattctttaagtccacatcacaaaacagtcattgaaaattcttgttttcaaagcatgctgctatttgacaagtgttttgttcccaattcttttgctctctggattgcaaaacaagtagatgtgaactgttctgatatagttttgggccaaaaacttattccattgaacaagcaatttgtccatgttgtgctaggcctccctgttggtggtagtacaatccattcaaaatttgattctggcaaacaaaagattcttcagatttttgggaaaacttctattccttctgtcaagttctttggagaaaagttaattaaaaatgaagaacttcctgatgatcaaattctcatctgctttatgattgtttccttgaattgctttctttgtccaaactcttctttgattccaagtacaaaatacctaagtgcctttgaagacatggacttaattgaaagtttggactggtgcaagttagtttttgactggttgatggaacacattagcaagattgagaaatcaaaaacttttggtggttgtttattccatttagcggtaaatttttttccctccatttatgctaatttatattttgtactaaatgactattcatttaatttctatattcaatgtttcataggttaattacctggattttctcaactttggttcacaaaaagtattacttgatacaccaagaataaaagtttggaaaagatctatgattaaggactattccaaatttgataaaatatctgaaggagtgtatggaaaaagaccagtcaatgatattgcttcaacttgttacccaatggtaaatgttcagttttttttttcaaattttttatctttttaagttctaataaattttcttagattggaattgaaaattctgttttaattttttaggtgaataatagctcatcttcatttgctgatatgctcaaaagttctgttggtgatctgttgccaagtgatgttcaagacaaaatttgtcatttgctctgctatcattttggaaaagaagatgaaatctttgaagacaaggctaagaaacttcttatagatgttctgttgttgttagctgattgtagttccaattatcctactcaacctgctgcacatgaaaattcaggttattacttttaatttacgaattttgttgtttattttatttttaatttttttccattcatatgtcttgattttttttataaattttaaattaaggaattgaaccagatcatgaaccagttgaagaaaataatgatgatgttaatcaagctgtgaaaaaaaataacaatttcacctcatctccaaaggtacattgttttctgttctcatttcaattttttttattctaatagtcatgtgaatcattaagcatttttttgtccttttattttttttgtagggaaacagtaaaacaatactagatgatgataagttgccaattccaaatgaagaatttaatcctgtgaataagtctaccattttgaattcttcagaagaggtttttttttcatttttatttcaatcattataatctgaatatatagaactgtaattgttgatagtttttaactgttattttttatctgtgcagattaaacatatcaacattgatgaaataatgacaaagttgaacaaaacaggttatttttttttctaaatttgttaatctgtttttttaaaaaattaaatatgaattattgatgtttgtgcctatttaacattgaaggtcatgttcctattaatccaccagatgaaacagagaaaaattctgccttgactggtaaatttttttttaatggaatctcatttgtttttactcgtatatctttaattgttctagcatcaaaaaaattgagttattgtaatatttcatttcttttgtcatgtgattttagtgcactgtactatggtcctcttactttttgttgccatattttttgtttctaattcttatgttattgctatagctcgaaacaatcaagtttttcatgatcaaccgtcttttaaaatctgggattctgatgatgacctccatcatgaaaatgatgatttcaaaaaagaaattacacctgctcatcttgtagattcatatcaagttattcctgattcatactccccaaatcctgttttaagaaataaggtacttgtgaagtaacttcaaatttcataaggaatacttttttagaacattatattgatttatacaaatcttgcagatcactccaagaaagttgtctcaaacttttgctgctgctgttgaaagcccaataatctgttcagacagtccggtaattctaacattaatttctttctttatttcttctgtatatacaaactaactttcatttgttaaattttgaaattttaggataagatgtacatggtgacacttgaaaattcaacttctcctaatgcttctctcaatgaaaacaaagaaaatgaaaaaggttgtcacatcataaaggtatgaataatctcatagtttattttcattgatgttccctttttgaaattaaatggtgtttaaaaatttttctaattccatttttgcattgttgttctccatagttttgctgtaattcttgtaggttacaatgtatttcagttctagttaataacataccttctttctttttttattccaaaaggtttttcttctcactgcttattcatttctttttattcagtttataatctcaagtttgtaagtttgctgttgaacatcactagtttatttgctgaactgttatttcatattgatatttcaaatatttcatgccctgtaccttacttttatttatcatttttctgttctggttataagctaataattattattttttatttctagttattttgattttctttttttaatgtgtttctaactgtactatttaatttatttgttaaatttcaagattcacctgatgttgtttttattggtgaaaagaaattctctaagaaatgtgctgatatttgaaacaaaaccaacatgatgtacaataaaatgaatagaattcagttggattctcagaaacaaaacttcaaaacctttgctagtccagaaagagttttgttatgaaacatgaagaatttcaatccaagtacttctggaacaaaaccaattcatcacgatcttagaagggtaatcaatcccgcaaagtattgcacagatccttatactcctcaaagatcaaacttcacagtctcacaatatgaaagacaaatttataatgctgtctgcactctatcaacaagcagatatcaagagtaagtactattttgtactttttttttctaataatcttcattttcaatgtatgatttgtaatttgaatttatttgtattctgaatgtagacgacatgcaattgaaattgatggtgttcactgcaaattcagttcttttggaggatcatttaattttggacatgaagtttctaattttgttgtctctgtgttctgccgatatttgtttcatttatctcacccctcaaaatccaaaaaacattatttcttctcttctattggagtaagtttcttaatttctgttttattatatttataattgaaaaccaatttttactatatgtttaatatttaaattattgaatacacttgtgctataggatgatcttctaaagcatccatcaagaactgatttctcatcagttaggaaatgctttgatggtgcatcaaaagctagacctattcaatcatgtgaaatggtttgtgaatttgtaaattacttgtcatatttaatttcatatttccttttacatttataatttattttatttaattgtttcaactcttctttccaattctctacaagcgccactggtttgtttttattgttcatctgaaagatgaaatgtttgtctttcttgactcattacatgaagaaggttctgaatatcaagatgaagttaagaatagattggtcagtttattttcaaatttttaaatatatgtattactgttcaatttgtgatttggaatttataattacagagttttctttttatgttttgtagacatccaattttgcacttgcttggaattccattatggaagaatatcaaatcaattttgatgctttcaaaattgtatatccaccagtacctcgccaaaataatctgtaagttgtttttctttactgtaacttttagtccaataatattttttatttgtttgtttttgttggttagagttgtacagatgcccaattgttctcttgttgacaggaatcttgtatgttctgttggtcattcagaaattcttgactgttctgcttttctaattgttgcataacctgtttgttttgctgttaatgcacaattttagtttgtttgttatgattatcattcaaaaaatttagttcctgtttgtcaattgtttcattcagaattactagatgggataagagcctgtttcttagtacaacatggactagaactgcaatagatttcattagtaaatttacagagtaaatagtatgaccataactgcattagctttttttaattttttttgttttttttattttttatgataagtaactgtggttacttatgtcctttttctttttcctagttttgattgcggagtttttactctaaaatacatggaactatggggtccaagagttcagctgacaaaccatttctctcaaaaagacattcaaaacattaggattcaatatgtcaaccgtcttttcttccatccagacaattctgttctcggtacaggaacaaagaaactagtgattgactttgctcaggtaaattttttttagaatcattatttttttcacaattttgttttttatttagtgcttatatttttatatctctttttatttgtagggaaattga</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001068765.1 RefSeq:Os08g0514300]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 8]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 8]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
