|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 11]] |
| − | GeneName = Os11g0293900|
| |
| − | Description = UBX domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001074245.1 GI:115485138 GeneID:4350306|
| |
| − | Length = 9050 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os11g0293900, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 11|Chromosome 11]]|
| |
| − | AP = Chromosome 11:10783027..10792076|
| |
| − | CDS = 10783258..10783499,10783629..10783901,10785403..10785913,10785996..10786208,10788157..10788224<br>,10788333..10788398,10789023..10789104,10789421..10789473,10790302..10790401<br>|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008404:10783027..10792076
| |
| − | source=RiceChromosome11
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008404:10783027..10792076
| |
| − | source=RiceChromosome11
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggagagggcacttgattccttgacgtacaaaggctccattccagacgctatccttcagtcaagaagggataacaaactctttgtagtgtacatatcaggtgaagatgagacttcgagtagtttggaacagtcgacacttgttaatgaaagtgtggctgaagtgataggcaactgttgcgtattcctgcatctaaaacaaggcaacgtcgatgcatcccaattttcagctatatatccacagaaggctatcccaagtatatctgtcattggacagaatggtgttatgctatggtgtcatgagggatacatcagctcgaaagatctgaaagaaaatattgagaaagcttgggctacccttcacctgcagggtacagcagcagcctttctgactgcatcacttgcttcaagaatgactgaacctgtgaataccaccccgaccactctacctactcaaggaggctcatctgctgcagagaatccctctacttcatcaaatcaatctacaggaacttctggagccagtgggtttgctaatcctactgattcggtggcacagccacctagaagcacaagccgtgatgaaactcccagcataagtgaaaaagaatcctcaaatttggattcaagtccaggtaatagaactgttcaagaaaggccagattcagatagtgcgcaagttaaaggttctttgcctgatcatccaaggagctcaaatatagaaggttgtgcaaatccagttcaatcaggcaatacagcatcactaaaacagaaaaataaagtggatgatggtttcaccaaagtttcctcagagtcagttcctaccagagtagctagtagaggtaaatcgtcaaaggtagctgtggatcaagacaaggcaacaaccactagcacccctattgaacctgcccctgtgaggtcaaatgatattcagctggtcgttcgcattcctgatggacctagtctgcagattaaactgacaaaagatgataacttaaggaaggtgaagaattttgtggatgaaaaccgtgctaatggggctggatcttacgatcttgctatgctttatccaagaaaagttttcactgaacaagacatggaagccacgttgcatgaactgggtattgaaacccggcaggctctcactattgttccacatcataaaaccattcgagcagcaaagcgccaatcatcatcatcaccccatgaaggggataacaatatggatgcagacagctcaggtggttcgggatatttcggttatctgagaactgccctatcgtttgtgaatccactgtcctacttgagagcaaatgctgctccatcaaaccctgatcagttggcaaatcaggggtcgccacagtacagaccgagcactggaccctggaatcgtcctggagaggacactgcttcggaaagccgtattcctgatagtgcgaggcaacaggctgctagggatactagctccgggagcaccttgaggaggcggccgagacaattcggtggcaacgttcacagtttgagaagtgatgaccaaggcccatctgatgataggaatgtttactggaacgggaattctacagagttcggaggcgaagataagaaatga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MERALDSLTYKGSIPDAILQSRRDNKLFVVYISGEDETSSSLEQ STLVNESVAEVIGNCCVFLHLKQGNVDASQFSAIYPQKAIPSISVIGQNGVMLWCHEG YISSKDLKENIEKAWATLHLQGTAAAFLTASLASRMTEPVNTTPTTLPTQGGSSAAEN PSTSSNQSTGTSGASGFANPTDSVAQPPRSTSRDETPSISEKESSNLDSSPGNRTVQE RPDSDSAQVKGSLPDHPRSSNIEGCANPVQSGNTASLKQKNKVDDGFTKVSSESVPTR VASRGKSSKVAVDQDKATTTSTPIEPAPVRSNDIQLVVRIPDGPSLQIKLTKDDNLRK VKNFVDENRANGAGSYDLAMLYPRKVFTEQDMEATLHELGIETRQALTIVPHHKTIRA AKRQSSSSPHEGDNNMDADSSGGSGYFGYLRTALSFVNPLSYLRANAAPSNPDQLANQ GSPQYRPSTGPWNRPGEDTASESRIPDSARQQAARDTSSGSTLRRRPRQFGGNVHSLR SDDQGPSDDRNVYWNGNSTEFGGEDKK</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>8578..8819#8176..8448#6164..6674#5869..6081#3853..3920#3679..3744#2973..3054#2604..2656#1676..1775#cggctcacatctgaaccaaatcgtgctcggtctccgtctccacctccgcatatcatcctccgcttcgcttccgctcgatcgattcctcccccccatcaccaccactcctccgccgcgtcgccgtcgccgtcaccgacaagcctcgcctctcctcgccggttcgccgtcgcggccgcctcctttgtccgctccagcgccctcctcggcccggatcggcccttccccaggtgagtcttgactcttgacagtctgactgacttgactgactggttagctagctagccctaatcattccccctcaaatcttgattcctcggggagtgggacgaatcttgctgggcgatggattggccttgctggtctcaggaaactacgtagtttactgctagtgaatccctccgttccgtgcctgtgtgggcaaggccaatcgatccatggaatttcagctagcctatgattgtgtttgtgattgttcgtggtcattccaagcggttctttgctggtatggcaactattctgtgtgcttgtttgttgctggtatggagtagtctagaacttccgtcaattcctaggctgtttgacctgcagctatatctccttggaaaatctgagtaaatttcataaaactacggatactttgaccaaattatcgcaaaactatagatttaaggtcatatatatcatagaactacatatttagcaacacatttatcacaaaactacaggtttaagactaagtataacaaaactacatttttaatgataaaattatcacaaaactatagattttgggtctaaatcctttgcactaatgttatgcttgagttataaatgtccaagttttgtgattaaattgatattaaacctgtaattttgtgataactttgttactgaatctgtagttttgcgatattttaccttaaatttgtagttttgtgataaaattagtattaaatctgtagttttctgataatttaaccgaagtatctgtagtttttgtagttttgtgaaatttactttcatattcggtctaagaggtaatgaaaaggacctgtgatgttttttgtggtccttgtatttggacatgcttacggtagatagctatgcagatttgccgggctaacatgtcaaattggtattagtattttcaatccgttacttatcagtatgtgctccccacaaccaaagaaaaaaaaaagaaagttatcattatgtgcctgcgtggtgtttggtcaacaggattcagagttttttttttgaaccatacattttcactgtttttgccattcaattgaaattacagtacgcctactgttagatgaattgcttgggtaattgaatgcatttatgattctgtttttttggggtgtaaactcatgtaatctatgaatcagttcttaaaatcaaagatcttattgtgtctttcacttggtggtgattagaaagtgaacaccttacttttagaaggctagtataagtttgctgtcagcatattttctttcattacttgggtatacatgactttaacttgtaataacacaatgcatattatgattttgattaataaggaagatactaaaagaaaggaagaaatgcataatggatacgttgtattttcacacttgattctttgtattttccatgtaatgatgcaccatttctttgtctaacttagatggagagggcacttgattccttgacgtacaaaggctccattccagacgctatccttcagtcaagaagggataacaaactctttgtagtgtacatatcaggtcagcttgctaatcctagcagctcgttgttatgctatctaccttactaattgtctgatgatatccatgatttatgctgcaaaagtcaaatataggaggcaaacattttattttatttggaacaaaattagtgatgcacaatcagacagatattataacctcaggttgaaattagtcatgctaattacttttctgttcagttattctctagatcagccaaatattaattttctcacgagacttgtttattctgattcaatggggaaattactggaacactaataatttctcttgttaacttggaattgatttgcactgaatctagtacatgcccaatttgcaacaacataacaaaaattctttgcatgcactctttttcaaaaaaaaaaaccagaaatttaaattcaaatttcaaatatgtgaaatttgtctggtttagtgagttctgatcttagacatcagtgaagtttgggaaatccattaacccctgaccaggaggtaaatcacattctgtagaaacaaatctaatcctttttcttaaaggatagcatgagcatgtctcctatctggaggggcttctaacgttgtatctagaggcaaatgaaagtaaaacctattgacagtatgcaattcaactaaactacttacttttctaccaaaataattttctgttggcgcatgctgcaatatgcagtacattatccccttatgcaacacaaatgtgcattatagcacattgttcaatacctcttatgttgtaattgacaatatgcagtacattgatcagtccaggatattgacagaacatcatatattgctgcatttcaggtgaagatgagacttcgagtagtttggaacagtcgacacttgttaatgaaagtgtaggtttctttcataattgcctggataattctgttttggtgaaagtccactctggatccttcaaatttcgttacaattttttttcagtcttagctttaatatcgattaattacatccctcaagtgtcaaattatggggttttttggggggttgggggagggggggaggtggggtttattacgcaccgaacactgaggttaagggtaaaaattagactcctaacaggactggagggaccagagatggacttattttctgtgattgttatatattgaagttaccaagttgctcttgtgtctttatgtatgtgcacaggtggctgaagtgataggcaactgttgcgtattcctgcatctaaaacaaggcaacgtcgatgcatcccaattttcagctatatgtatcctttgtacacatgcattttttttactgtaactttatgtttgctttggattggccagagacaattcactcttgattttacacttcagtgccaaggggtattagtgcttgtcctgattccgatttaaaatgaatgggcagatgtccttgcatccattttaaaaacaattatttgatgatgttcacatttgaacttcatgccataatttgttgtggtgaaatacatttgtttaacttaaaactttaattgcaagggtatcttactgacatcatggattgttagtgctccgatatgaatagaatgttgaaacattttgatttgattatcatttgctgatggttgaatgtgatgagataggttcatcatattttcttatacaacagtagaactgcatcatgattgttataacggtagaactacatgataagcattcaattatatccaggaggttatctgtaagtatatgttataactttatctcatttccatactttacatttggtacttaaaatggttaatcaggagttagttctgttatcttgcacaggaaatgttttattatctataatcacgagtcttatttgtgcgtgcagttttatccttaacatactttttgattagatccacagaaggctatcccaagtatatctgtcattggacagaatggtgttatgctatggtgtcatggtatgaatacttcagaaaagtagttttaaagtttagcagtagaacctttctttcataaggtcaagctattgcaacagtgctatttttttttttttttgcttttcttagagggatacatcagctcgaaagatctgaaagaaaatattgagaaagcttgggctacccttcacctgcaggtactccattccagaaaaaaaattgacattcaattgtgataatttatttatttgttttcaactgctacttttgaataccacttggctagttcacttcacaatggattttaatacatgatgtttgagtaatttttttagtaaatttcacaaaactactggtatcttgcacaatttatcacaaaactacatatttaagagcttgtttcacaaaactacagatttagtgtctccgtttatcacaaaactacatgtactttgtataatcgatcacaaaactacatatttaagaacttgtttcacaaaactatagatagattagcgtattcatttatcacagaactacacatttcatatcttcatttatcacaaaactacaggtatagtgtctccgaatgctaaaacctgtagttttgtgataatgaaaacactaaacctgtgtagttttgtgatgaatgaagatattaaacctgtagttttgtgatatataatgcaaagtacctatagttttgtgataaacgaagacactaaatctgtagttttgtgaaacaagttcttaaatatgtagttttgtgatagatcgtgcaaagtatatgtagttttatgaaatttactctttttttattaaccactatctgtttttctattttatgtccaaatgccccacatatgtttttgaagttattttatactctctccataaggctttattgaaaaaaaaatgttatcattaagtggttgaggtgacacatccgtagaccttcttttcttttatgtatattcaaattgcaaagtaaaatttgttagataatagaaacatatgctctatgcaaataaaggtctagtgagacttgtgaattaccatgtcaaatgctccatttcctttcacatctggaagcagcagatgaagaggtggcatgcctatgagttggacactgtagcccactggtgagctgggggcagcagtgtgtgacgagttgagttctcctctctatgatatgctgcaggcattggccatgaaattggtgttttttctgttgtatccaggctgtttataccttccttcaagcccaagccactgattagtcactgcataagagcaagtttaatagtatagccaactaatagctccaatttatctatagccaatctaataactcattcatacaatagttacatactacactattaatacctggtctcacctgtcatacacacatgtgtcttggagttcgtgctacagctggctatacatctgtagtccgctgctcttctctctcctcatttatatccttaaaatatgtttgcagctggcttatagcgtgctattgtacctgctctaagctgacttcgtcactgtggctgaggaattgccgagttggcctgtctgactaacttgccacctactccctccatcccaaaatataagtatttctagcatttctcgagagagattaaggatgaagggaaaagactatgatgcctctcattaaacaaggggtggttgaagagtgggagggtgaagattaaatgagtagtggttggtgggggaagtagtactctagaaaatatagttatattttgggataaattttgaatgctaaaagtaactacattctaggacagagagagtagttccaaattgtgttgcagctagattcttgactagctggcaaaccttttctggcttccccggcactgatcacatgtgtttaacttgtaagaatcctgtttaaaaaccacctcaacgaagcatgaaatcatgttcttacagcctgccatttctgaatgtatcgaatttactggtaaatatcataagttaaagaaaagaaaaaaaagagtggttgtttgctttttaagtaattatgagttagttacttggttgtatgttttatgtacttccactagtggtttagctccaataaatatgacctgttgtcaaatattgcagggtacagcagcagcctttctgactgcatcacttgcttcaagaatgactgaacctgtgaataccaccccgaccactctacctactcaaggaggctcatctgctgcagagaatccctctacttcatcaaatcaatctacaggaacttctggagccagtgggtttgctaatcctactgattcggtggcacagccacctagaagcacaagccgtgatgtatgttttctcccatttcatagaatattatcttctcatttgaggattgccttgtgcatcttatcacttctttgtgcaacaggaaactcccagcataagtgaaaaagaatcctcaaatttggattcaagtccaggtaatagaactgttcaagaaaggccagattcagatagtgcgcaagttaaaggttctttgcctgatcatccaaggagctcaaatatagaaggttgtgcaaatccagttcaatcaggcaatacagcatcactaaaacagaaaaataaagtggatgatggtttcaccaaagtttcctcagagtcagttcctaccagagtagctagtagaggtaaatcgtcaaaggtagctgtggatcaagacaaggcaacaaccactagcacccctattgaacctgcccctgtgaggtcaaatgatattcagctggtcgttcgcattcctgatggacctagtctgcagattaaactgacaaaagatgataacttaaggaaggtgaagaattttgtggatgaaaaccgtgctaatggggctggatcttacgatcttgctatgctttatccaagaaaagttttcactgaacaaggtactgggtcttttccttcacagtaagattatcattttattctctattcactcaaagcttgttggctgggtggacattgcagccaaggcatggatggataaaataatgtcttttactcctggaacttgacaagagattaatcctatgccattctttacttcaatgaaatacttttagctgccatgtttttgcattggtgctattctattctcataatatcattttggtcaaatgatattctattcttcgatgttttagtaattacaaagtatccttcctgctccagcaggacaataaaatgaaattggcttaggacatcagacattagtagagagtagactgaccgaaaaagaaatgtgaagcatgaaaaatgcggtatttattttcttaatcagctggaattttagttcatagatgatctttggttttgttggatgatttgattacatgactaagttataatttgtaactcaaagatggagtggtggtactacccccataacatgcatttcatatagacatgggacagtaacctttctagaatcattacaccagatgtttttatgcagtactatgaagtttgcacatgcttcattccgcttgtttagtttgttatcgtattcttgcttcatttagttcacggattatcaatcagaaatgttaagcttcctctatgtttgtttttagccactaccgcctgccttcatgttcttacacatatatgtacctattctttcttaccccaaaatgctgcatccgaatttccaaaggttatttgatgaactgataggaattaagaataactgcagcttgtaagaaacttttgaagtagtttagtaacacattgactcaattttcacgtttgcaatgtcattgtttgagtaacattcctttgtgatacaattgaacaaattaactctgatttttcttgtcgcctgctaataatatactataatgattttgaaatatcttatatgaaaaacccgcgcatatcctttagacctttacagctgaaatacatttcctatggtgctcaagtgttctgggcttcaaaaacaaaccatgctcaataagccgtaaacaaattacctggacgtctaccaaataggctaaatgatgcactatcctatctatccaatccaatgtgtggagattgatgtgacctttcaaaattaaccaacatcccatcttgtctctaataattttatgtactttgtgcagatctgaaagcatttttcaatggataataaacatccagatatgtaatatatgtaaaaataaagtttgtagcacatgtttagagcatctttagaacaagcttatcaagtaaccttcatttatgcatgtaatttgctccaatgatatcatttgtcaaatatggcaattctataagcatgttgagtgttaaccttttcggtttctgattggagcatttcattcattttgtgttacttcattgactgttctctatgtttggactgattatcaaaattttattcagacatggaagccacgttgcatgaactgggtattgaaacccggcaggctctcactattgttccacatcataaaaccattcgagcagcaaagcgccaatcatcatcatcaccccatgaaggggataacaatatggatgcagacagctcaggtggttcgggatatttcggttatctgagaactgccctatcgtttgtgaatccactgtcctacttgagagcaaatgctgctccatcaaaccctgatcagttggcaaatcaggggtcgccacagtacagtatgttttcttactctttagtctcgaatttctaaagatgaggtgttaacgattccgtggagtttcacctttttcagccttgctattcatggttgctagttcagaaatgtctatatttccatgaaacaggaccgagcactggaccctggaatcgtcctggagaggacactgcttcggaaagccgtattcctgatagtgcgaggcaacaggctgctagggatactagctccgggagcaccttgaggaggcggccgagacaattcggtggcaacgttcacagtttgagaagtgatgaccaaggcccatctgatgataggaatgtttactggaacgggaattctacagagttcggaggcgaagataagaaatgagagctgagcaccggcaatatcatggcagagttaaatatatacttggacaaataacacgatctaggtaaataaatacaaacaaatttgagatgttaaattcagtggtaccagtaccacaacatagacttctagtgtaaaatgataatacatctgatgattggctgtgatggttcgtttccgggagccgattcttcgtcagtttgggtagtatggagagatattttcgtttgc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001074245.1 RefSeq:Os11g0293900]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 11]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 11]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information