|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 7]] |
| − | GeneName = Os07g0530100|
| |
| − | Description = Tyrosyl-DNA phosphodiesterase family protein|
| |
| − | Version = NM_001066379.1 GI:115472490 GeneID:4343446|
| |
| − | Length = 9951 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os07g0530100, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 7|Chromosome 7]]|
| |
| − | AP = Chromosome 7:21399664..21409614|
| |
| − | CDS = 21399928..21400001,21400086..21400227,21400314..21400391,21400527..21400617,21400709..21400762<br>,21402828..21402931,21403228..21403377,21403871..21404005,21404746..21404835<br>,21405533..21405790,21405868..21405944,21406863..21406923,21407424..21407642<br>,21408673..21408945,21409051..21409242,21409500..21409517|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008400:21399664..21409614
| |
| − | source=RiceChromosome07
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008400:21399664..21409614
| |
| − | source=RiceChromosome07
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgacgtcctcgtctcgagtaagggttggcaatctagtccccctcaatgaaggaaatgcgagctcgtcaaatggatcggtgtcaagcattcctatctatctgggtgccaatgttgtagggaggaatcatttggtggtcgtcgacaagagagtcagccgcaagcatctgagcctacatgcctcggcggatggttccattgaagcggtagtggaaggaccaaatcctatcattgttcgatctgagggccagaggaggaaggtctgtgctcaagagagagtaaagattgcacatgatgatgtcctggaactcatccctggtgaatattttgtgaagtatttgaatgtgggcgataaccataaaagttccacatcaatgggttcaagtgattttaaaaaggggaagaggctctgtgaggatgatactgtagttatcaaaagaaatcgtcagattatggaagatgaggctttggcaagaagtttacagaaaagctttgcagaagaaagttcaactatttccggtttgggttgtgatcaaatgttaagttcacttgatagtgctggtttttctgagagaaataacgagagaatacactctgttgattatctgaaagatgtactttcattgacttttcggctcatgcgtgtccaaggtcttccttcatggactaatacttcctcagttaccattcaagatgtcatacagggtgaagtgcttcttgctgtactctcaaattatatggtggacatggaatggctgcttacagcatgtccaagcttaaggaaagttcgacatgtcctagttatacatggagaagatggtgcatcagtggagcttctgaagaaagtgaagccagccaattggatccttcacaagcctccacttccaatttcatttggaacacatcattcaaaggccatgctgcttgtatatcctcaagggattcgtgttgttgtgcacacagcaaatttgatacatgtcgactggaataacaaaactcaggggctatggatgcaagattttccctggaaagatgcaaaagatgtgaatagaagtgtttcctttgaaaacgatttggttgattatctgagtgcaattaagtggcctgagttcagggtaaatttaccagtggttggtgatgtcaacatcaatgcagcattctttaggaagtttgattataagagctcatcggtcaggttgattggatccgttcctggttatcatgttggccccaatattaaaaagtggggtcatatgaagcttaggagtgttcttgaagggtgcacatttgaacaacagttttgcaaggctcccatgatttatcagttctcttccttggggtcacttgatgagaaatggatgagtgagtttgcattctcactatcagctggtaaatcagataatggttcacctttgggtattggtaaaccactgattgtctggcctacagtggaggatgttaggacatcaatagagggttatgcagctggtagttgcattccaagccctcaaaagaatgttgaaaaagatttcttgaggaagtattgggccaggtggaaagcggaccatgtgggtcgttgtcgtgcgatgcctcacataaaaacttttactcgatacaatggtcaagacattgcatggtttctactaacctcggcaaatttaagcaaagctgcttggggtgcgttgcagaagaataatacacaactgatgatacgctcatatgagttaggtgtactgttcttgcccaaaactcaccaatctgtaccacaattttcatgtacggggaagaacaattcaaacctgaataacctggcccctgggaaagagatcaaaaccaaactggtcacactctgctggaaaagcgacgaagaaaaagaacaatccacggaaattatcagattgccagtgccatatcaacttcctccaaagccttacggcacagaagatgtcccatggtcttgggacaagaggtacacaaagaaggacgtgtatggttcagtctggccgcgccatggttag</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MTSSSRVRVGNLVPLNEGNASSSNGSVSSIPIYLGANVVGRNHL VVVDKRVSRKHLSLHASADGSIEAVVEGPNPIIVRSEGQRRKVCAQERVKIAHDDVLE LIPGEYFVKYLNVGDNHKSSTSMGSSDFKKGKRLCEDDTVVIKRNRQIMEDEALARSL QKSFAEESSTISGLGCDQMLSSLDSAGFSERNNERIHSVDYLKDVLSLTFRLMRVQGL PSWTNTSSVTIQDVIQGEVLLAVLSNYMVDMEWLLTACPSLRKVRHVLVIHGEDGASV ELLKKVKPANWILHKPPLPISFGTHHSKAMLLVYPQGIRVVVHTANLIHVDWNNKTQG LWMQDFPWKDAKDVNRSVSFENDLVDYLSAIKWPEFRVNLPVVGDVNINAAFFRKFDY KSSSVRLIGSVPGYHVGPNIKKWGHMKLRSVLEGCTFEQQFCKAPMIYQFSSLGSLDE KWMSEFAFSLSAGKSDNGSPLGIGKPLIVWPTVEDVRTSIEGYAAGSCIPSPQKNVEK DFLRKYWARWKADHVGRCRAMPHIKTFTRYNGQDIAWFLLTSANLSKAAWGALQKNNT QLMIRSYELGVLFLPKTHQSVPQFSCTGKNNSNLNNLAPGKEIKTKLVTLCWKSDEEK EQSTEIIRLPVPYQLPPKPYGTEDVPWSWDKRYTKKDVYGSVWPRHG</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>9614..9687#9388..9529#9224..9301#8998..9088#8853..8906#6684..6787#6238..6387#5610..5744#4780..4869#3825..4082#3671..3747#2692..2752#1973..2191#670..942#373..564#98..115#ctctttcccttccccatcctcctccccattgcgctgggtaggattccaatgtgggggactagggtttagggtttggagtcaatcccagaccgcgcccatgacgtcctcgtctcgagtaagttgcgttctgtattatcttcctctctctctctctctctctctctccgcgcgtgcgattttttttgggggtgtggttttggcgatgatatgcgcgtgcgattttttctccccgggtgggtttggggatgggaggcgtgattagaatcagcgaatcgcttcagtgcattgcgctgtattctgatcagtgtttttccataggagatttaagattttgttgttgagctgatgtgtgaaaactggtgtattgcttaggtaagggttggcaatctagtccccctcaatgaaggaaatgcgagctcgtcaaatggatcggtgtcaagcattcctatctatctgggtgccaatgttgtagggaggaatcatttggtggtcgtcgacaagagagtcagccgcaagcatctgagcctacatgcctcggcggatggttccattgaagcggtagtggtgagtgtgataaggcatggggatattccaattaactgcgcagtattgttctgatggcttttttttcagaaaataacttgttgttcattggcattggatgtgcaggaaggaccaaatcctatcattgttcgatctgagggccagaggaggaaggtctgtgctcaagagagagtaaagattgcacatgatgatgtcctggaactcatccctggtgaatattttgtgaagtatttgaatgtgggcgataaccataaaagttccacatcaatgggttcaagtgattttaaaaaggggaagaggctctgtgaggatgatactgtagttatcaaaagaaatcgtcagattatggaagatgaggctttggcaagaagtttacaggtaacttaagtacttaacctttctagttgcactgcctgtattgtgcagtttgtttaacttagaagagagcaatccatggttttccgtgtatcatatttccgtttagtctgatcatggcttaatctgggcaatgctgtagttttaatataacataaatgatcctagtgctggacatagaatacttagggcacgtttggatctaaggctagcattagcctagcctggcctggcaaggcccagcgtttggaaccataaatatatcgcagcttctgggggcaagctagccctacgggcaaggaaaagctcgctcgcagtggagagccaattcggctctccttcgacgacaaacttctctttagactaactaactgcccgtcaaaaactaaacaaccaaacaactcagtaaagcaagcctagcaacgcagcaacaacctggtttgcctagctgggctatagctcaaggtgacaaacaaccaaacatacccttaaagaatgcctttaaaagaagggattttccagtgtatattctgataactttatcgtggataaactaatttaaattatgtcagacaattgtttatgaaattgatcagtggctatctttatatatttctggtaggaaaataaagtctttacgtcttaattcatagactccaggctgtgacactgaaagatcctgattcataaatataccactgaaagatcctggtacacttaaataccatccaaaggtgcaagcgtttagaaatgtacttatctgtggtgaatatttatcaaatagtatctaagtattggatgtttggatttgctttctgaaactcagcattggatatgctatccttgtatgcttctgttgtttagtgttggcatattttatattttgcattgtaaaaaatggtgccccttagcttgctgaatattagtttagctgtatgttttctttccttgtgtaaaattaccagtatactattgaattgtagtatagtacattaccatcttagtttcattactatttcctgtcctattccagaaaagctttgcagaagaaagttcaactatttccggtttgggttgtgatcaaatgttaagttcacttgatagtgctggtttttctgagagaaataacgagagaatacactctgttgattatctgaaagatgtactttcattgacttttcggctcatgcgtgtccaaggtcttccttcatggactaatacttcctcagttaccattcaagatgtcatacaggtatcatccatttaacaggagctcttgcggaagttatgtggttgatttcgtttaacatggcgtgccacaacatcttttagatatgatctgttcaggacacaaatgttgcataagaacaaatttcttagcctgctcatcattaccaacatatttgttcaaaaagaaaatcattaccaacacaaactcttgctcatataccatttgtgatttatcactatatagcctcaactcatgtagtctgctgtttgaaagatggaattgttctctagttggaccttgtaaagatttctgtctatattgtcaatggtatcgtgtatggtgggggagcaaaggctagttcttattctgctgatctgttcagttttcagggatactgtgttgcatatcatttcccaaccatttctctaaaacaaatgttctcttatgttcacactctattcatgcattgccagattcatcaaagaagtatactagttcttacatgatgaatgaattattagggtgaagtgcttcttgctgtactctcaaattatatggtggacatggaatggctgcttacaggtgggttattgtggtggaaatcatacaagtaatattgtttgtccttgtatgagggctgcttcctttttaccataagtagtgaccttttttgcaaacaaaataaatttggcgcctctgccactttacagtttcagaagtcagaacactcaatcatgaaaccaactacgatcctgtgctatttatatttgtctgctccttttaattttttttgtactgcacaattaatactaaattctacgtgcttgttggtaagaggaaaagcagtcctttctttgttgctgaaagtaatctgccacatttttttcattgaataagcatttagtttctgccatcctggtagctttcccctcaatgttttgtttgctgtaactattcattggtataattctttttgaagtgaaagtagctgctggtaacaacctaactcatctcatattcttcattactgataaattgatgtaactatattggtcactctctattggtttctagaatcatagtcatttatgttattgatttacctaaattgtttcctgtgcaataattttggaagctcatctttctgagcctctatggctaggattacaatttgtatgtttactagttaattgtaaagcataatatatttgtggaataaaaaaactggactacaaagataagcaaaacatgtacttttggccttttattttgctatttttgattatgattctcatttgtcttctattttccactacttcatgtatctttttgttgacatgcacttagttatgaaatgtatgtatttactaaggagtttggcaaccagcgcccatctgtgttccctatgctatgtggtgaaatatcactgtgctttcttttccagtcattgccattatctacatcctttagttttaatgtaaataacattgcactgtgcagcatgtccaagcttaaggaaagttcgacatgtcctagttatacatggagaagatggtgcatcagtggagcttctgaaggtgacaacattactagagtaattcatgatatttttgtatttcctttttctcatctcatattcatggttgggtgacagaaagtgaagccagccaattggatccttcacaagcctccacttccaatttcatttggaacacatcattcaaaggccatgctgcttgtatatcctcaagggattcgtgttgttgtgcacacagcaaatttgatacatgtcgactggaataacaaaactcaggggctatggatgcaagattttccctggaaagatgcaaaagatgtgaatagaagtgtttcctttgaaaacgatttggttgattatctgagtgcaattaaggtagcagctagcagggcacttgtctttgcttcttgattaacgtatcactccaattgtgtttcacttttttagaaaagaagttaaatgttgttttcttactgatatattttaaattatcatcataatgtgttttgccggaggttaccagaataaaaattaacaaataactgtgcacttctcgaacaatcacagttaacactggcaacttctgtttctactcttctgctactcaataaaaagaaatcatattaaatactactgaattggttcacaaggggatccactgttctcatgttagtaaaacactgaattggtaaaatatgcatatcatgattttgttagagagagatcttggaattgctggcaacatgttgcaaacttatagtaagacagtagctgtctcattgctaaaagcaatgagccatgttaaagaataccttaaaataagtataatgaaagtttcagcaaatcacaaaacatggtcttattttctgtggaacattgtacagagttctgtaataagtacctctaaattggagtgaatgaaaataggatgtctcgggctgtctagcttcgaaaagccccagttcattctaactattacttttgttctagtttaattccctaccgttgcagtgtactaaacacatcttctctatgtatgttgtaatgtattattctcttcatgacaatgcagtggcctgagttcagggtaaatttaccagtggttggtgatgtcaacatcaatgcagcattctttaggaagtttgattataagagctcatcggttagtataatccattaatcttagtttacacttagtgtgcagtgctcagctgtaaacatctcgttttttttttctccatgcaataggctgacatgaaaaagaaaaaaaattgaagtccgctttgcatgataaatgctggcaattacttaatcacgtgatcactgatttatgcttgtgcctccgccgtaaataggctgctttatgcaaaagttcccttttcttcaataaatgaacagatttcatcatcttttagcactgtttttattgcttgtcctacaaagtatttactgttctgaaggattttcagttcacaagaaaccattctattgctccttttgttatccattttaaaatcttatgttggaccttaccagtttggttgcatttgaaattaatctatgcattttttttctgcaccttctgtattgcgtgtttagtgataaagtccacatatgccactgaaaacttgcccaatcctcctattgtcagtaagacatcaatggcaaataaggaatgaagtgatatttaaagcgaaaaatgaggaattgcctcatcattttggcccttgatctttctctccctgttggatgcacaaaaactaaataaactgtacatggaagctcagcagcactcgcaaaaggtctattagttttacatagaagcaaacatactagcacacacaccagttctcctctctcgtgtattcataatttagtctcagctgattttacatcttataggtcaggttgattggatccgttcctggttatcatgttggccccaatattaaaaagtggggtcatatgaagcttaggagtgttcttgaagggtgcacatttgaacaacagttttgcaaggctcccatgatttatcaggtatctttgaatgtgtgagttatttatccatttatcttagcatttagcacaggcaacttttcgaagtgatgtagtgaatgccttaataaccctgttaaggttgaagcagaaatgcttaagattgagaaacaaaaatcacatggtgcctagtttaccttaggaaagaccttctagtaccttaaccctgcactttgtagcacactaatgccattaatagaagctgtaaaaaaatttgcactaatggtcaaaggaatatgtacttagttaatagctgtttcttgttttgtattgcaagaatgagcgagactataaggagtgcgggatatgttatattgtcacctgcatcatcacggattaattggacttaaaatctggcattcatctcccctttctgtttcactgaaagtttatattgtaattttttactcgcctattacttcccaggcttgttctccttaaaggacatttagcattttaattctcttgtatgcagttctcttccttggggtcacttgatgagaaatggatgagtgagtttgcattctcactatcagctggtaaatcagataatggttcacctttgggtattggtaaaccactgattgtctggcctacagtggaggatgttaggacatcaatagaggtataaacctaacatctgtaaaaattctctaatcatacttcctgtatattgcatcgtaaaacacacgagcatgaaagctccttgtgctttcttgatctgttgagaaccttcttcagatatgatgtcctatgatagatcagtgctggccccaaaataacaaaaaagaagtataaaccgattgtgttccctctcaaaatcagcatgttccatgacctgaattttttctaatccttttacccgagtactagtatcaccgcttatctgattttcttttatgtcaaatgtttcttatgtagggttatgcagctggtagttgcattccaagccctcaaaagaatgttgaaaaagatttcttgaggaagtattgggccaggtggaaagcggaccatgtgggtcgttggtatgttccctgattccttcaattatctaacaagctattgtcttgttcaaatggaacttcctaatggttaccttgcccgtatggtgctgcatatcacaagaaattgtttggtgatgtttctttaatcacgacagccatgtttggaggaacggtcatttgtgaccaaacattaaattgataggttggtgctgttcaaccttaattatgtgtccatgtgtaggatcaaggactagagagagagggggaggggtgaataggcgatttttaaaataaatgatacctaatcaaaactaacctaagttgctaggtttggttaggaagaagtctaaccaagcaactagattaagttttgcaatcctagggtgataagggctcaaaaaatctgtataaaagtaaattacacaaatgtaaatgcaataagtaaatagaacaagagacaaggtgtttttcaccgaggtccggaaactcgctggtttcctaatccctgttgaggtgagccctacttcaccgctcaaaccacaaaacctcgatcactagggtagttccttcgctctgaaggaggtgaatttcgaaccactcacacccaacaccgggtctcctccacaaccttctcggagaggccaccggacaactcctccaagccgtctagaaggtgtcaacctccaagagtaacaagtagcaaccaaactcgtagatgatcaagtggcacactagctcaatcgatgatgcaatgcacttgacttcgctcaaactattctcaaacacccacaaaggatgaagaagtgctcaagtggtgtgagagtgaatgcaagaggtttatacaattgaacaatgtgccaagagaacctccttgctgctggtgggggagtatatatacccccacacataaaaactagctattgggggctgaaacacgactcacaggagtctgtcggtcgaaccaccaagggatgttcggttagactggcctctagtgcaacggatagaaaactagccgttgcagtacatttaatgcaccttcagtctaaccgccataggctggccggttagaccgcgggtggctccggttagattgagctaccaccgatcagaccgtcttaagctctagtggctctagagcgccaagtccaggcctcctattttgctccaagtgctcccgatcagaccgggctgggcccggtcagaccgcagcggttagaccaccacaagggcgccggtcagatcggctttcaggacttggagcctgaggcaaccgcgagaatagaactctatggtctaaccgcccacaaggcctcggtcagaccggagcacataccacggtcagaccggcatgaaaccttcggtcaaaccacctgaggtcagagaataaaagcagatttggaccaagagaagcacccacatgcatgtgacctaatatggcattttgataatttcctcaccaaggttaccacccctatacagcaaagctattaagaaacctagcaaatttgatcatccaacacctcaattgataaaaacgaaaagctatatttatcacattcatctcattgcttggccatcagtttttaatccgtggtaatcatccttcatatgcacatcatgtggtcctaactcaaactcttactcaaattgaataggtagtccataattagcgcttgtcattaattaccaaaatcaataccacataccaggggcctaatgtttcttctatatgatctgtagtgctgtgcaaaatgagttttatattttctctacccccaaggttaggcaaggcaaatttatatttaattgcaaagatagcgaagaatatcattgtaatctaaaaagcagcagttcattgaagtagtcatatatactaataaaaacaagagggagtaatgattatgattgtctatattttatagtattccttgagcatatttagttgatcgatggatatttgttatagcttgcaaaggttggcatccctgccatacctagatctgtaatattttgatcctttttagagtgtttattactttatcactgacttggactgacattctgatttgggttttcttaccagtcgtgcgatgcctcacataaaaacttttactcgatacaatggtcaagacattgcgtaagcatccatataaactgttttgaactctagaattaataacagtatttccattgaatcattgtctggaatctttgtatatcctcatcagatggtttctactaacctcggcaaatttaagcaaagctgcttggggtgcgttgcagaagaataatacacaactgatgatacgctcatatgaggtggatgattttgttccattgttgaattgaggaaattttctgaacatccagacttttacaggaaaactgctctgcaacatagtgttggtcatcatggaatcgtagcttataccttgccatttgatctcttttcagttaggtgtactgttcttgcccaaaactcaccaatctgtaccacaattttcatgtacggggaagaacaattcaaacctggtactatctaatttctccttccttttgtattataataatgtgatcactttgcttttttttttcatcattttaagttccttacccagaataacctggcccctgggaaagagatcaaaaccaaactggtcacactctgctggaaaagcgacgaagaaaaagaacaatccacggaaattatcagattgccagtgccatatcaacttcctccaaagccttacggcacagaaggtgagctggattaatttaacgattgatacaacttcagtggagtaacaatagtaaaacacttagaaatgttttttttactttcagatgtcccatggtcttgggacaagaggtacacaaagaaggacgtgtatggttcagtctggccgcgccatggttagctaagcggtatgcggacaatatatgatcaatgaaaggctaaccctgctccgatgtcgacaacaagaaggccggtagctgatcgcctgtcagtgcccactactcaaccattagcaggaagtagtactatttcctgggagagattagatatttctattactaatttgtacgagcacaggatattttctttcttgttggtacgaatcgtgtgccttgtctgcttccgatcgtgatgtttatgcctccatcctcttttacagagtagt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001066379.1 RefSeq:Os07g0530100]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 7]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 7]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
