|
|
| Line 19: |
Line 19: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| |
| − | GeneName = Os04g0509300|
| |
| − | Description = Protein of unknown function DUF283 domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001059813.1 GI:115459355 GeneID:4336362|
| |
| − | Length = 7383 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os04g0509300, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 4|Chromosome 4]]|
| |
| − | AP = Chromosome 4:25872631..25880013|
| |
| − | CDS = 25872881..25873052,25874123..25874237,25874648..25874984,25875406..25875735,25876197..25876469<br>,25876578..25877036,25877414..25877623,25877724..25877935,25878411..25878511<br>,25878691..25879115,25879193..25879467,25879543..25879808,25879916..25880013<br>|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008397:25872631..25880013
| |
| − | source=RiceChromosome04
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008397:25872631..25880013
| |
| − | source=RiceChromosome04
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>gagaacatttatcaagtggataacaccggtgcttccattagcactgcttgtagtgtatctctactacattgctactgcgacaaccttcctagggatatgttttttactccttccccagtgttcttctacattgatggcatcgagggaataatctgcagactaattcttccaccaaatgctgctttccgtcaagcagatggtcaaccatgtctgtcaaaagatgaagctaagagagatgcatgcttaaaggcatgcgtaaaacttcataaattgggtgctttgacagattttcttctgccgggtccaggttcaagaaagaataaagtatcagtaacaaataattcatcaaacaacaaagttgaagatgatagtctaagagaagagcttcatgagatgttaattcctgcagttctcaaaccttcgggattaaagttggattctttatcgaacttgcatttctactatgttaaatttattcccataccagaagataggcgatatcagatgtttggtctctttgtgatcaatccccttcctgtggaagctgaaacattgcaagttgatttgcatcttgctcgtggcaggattgtgaaagcaggaattaagcatttggggaaaatagcatttgagaaagagaagatgatgcttgcacacaagtttcaagagatgtgtctgaagattctcctggacagatctgagtttacttcaccccatgttaaattgggcaatgatgttacattagaaatcaattcaacattttaccttctgcttcccatcaagcaaaagtgttatggtgatagatttatgattgactggccagcagttgagcgctgtttatcatcaccgatttttaaagaccctatagatgtgtctgtgcatgcctcatattcatcaaatgagtctctgagacttcttgatggaatcttcagtaaaaccgatgtagttggcagtgtagtctttagtccccacaacaatatctttttctttgttgatggcattctggacgaaataaatgcttggagcgagcacagtggtgcaacttatgcagaacacttcaaggaaaggtttcgtattgagctatcacatcctgaacagccacttttgaaggctaaacagatcttcaacctgcgaaatttgcttcataatcggttaccggagaccacagaatcggagggccgtgaattactagagcacttcgtggagttacctccagaattatgctctttgaaggtcattgggttttcaaaagatatgggcagttccctgtccttgttaccttctttaatgtatcgtttggagaatttgctggtggctattgagttgaaggatgtgatgttatcttcttttccagaggcatctcaaattagtgcttctggtatacttgaagcgcttactactgagaaatgtttggagaggatatctttggagcgatttgaagtcctaggcgatgctttcttgaagtacgtagttggacgtcacaagtttattacatatgaaggacttgatgaagggcaattgaccaggagacgttctgatgtagtgaacaattcacatttatatgagttatcgatcagaaaaaaattgcaggtatacatacgggatcaacagtttgaaccgactcagttctttgctccaggaaggccttgtaaagttgtttgcaatactgacgtggaagtgagactacaccagatggatattcatccagataacagagaaaactgtaacctgagatgtacaaggtcacatcattggctgcataggaaagtgattgcagatgttgtcgaatcgcttattggagcatttcttgttgagggtggattcaaagctgcatttgctttcctgcattggattggaatagacgttgattttaataatccagctctctatagggtattagattcaagctccatcaatttatctcttatggactacactgacattgccgggcttgaagaattgataggttacaagttcaaacataagggtctacttctccaagcattcgtacacccttcatttagtcaacattctggaggctgctaccagagactggagtttcttggagacgctgttttggagtatgtgataacttcgtacctctactctacttatccggatataaaacctggtcaaataacagatctaagatcgttagctgttggtaatgattcgcttgcttatgcggcggttgagaaatctatccataagcatcttataaaggattcaaaccatctcacgtcagcaataagtaaatttgagatgtatgtgaagctctccaattcagagaaagacttgcttgaagaaccagcatgtcccaaggctcttggtgatattgttgaatcttgtattggcgcagtgcttttagattcaggcttcaacctgaactatgtttggaaggtaatgcttatgcttctaaagccagtattgaccttcgccaacatgcacactaatccgatgagagaacttcgagagctttgtcagtgtcatggatttgagttaggccttccgaaacctatgaaagctgatggagagtaccatgtcaaagtagaagttaacataaagagcaaaattatcatttgtactgcagcaaatcggaattcaaaagccgctagaaagtttgctgcacaagaaacactttctaaactgaagaattacggttataagcacagaaacaagtcccttgaggagattttgattgttgccaggaagagggaatcagaactgataggatataatgaagatccaatcgatgttgaggctgacatatctgtaaaaatgaagagtccacatatacatgaagagaacataccttttcaaaatacagaaacatctttcactaggagttctaaattccacaatcaaattatagcagggtctggcaaacatgatgtcaataatggaaggaacaatcaacccaagttggcaacacagagtggtcgtctgcctagtgaagcaacagagaaaagcaataaaaaggtgtatcatggtgacatggtacacaaaacagcaagatcattcctttttgaactatgtgctgcaaattattggaaacctcctgaattcaagttatgtaaagaggaagggccaagccaccttcggaagttcacttacaaggtggttgttgagatcaagggtgcttcggcgacccttttggagtgtcatagcgatggtaagcttcagaagaaggctgcacaagagcatgcggcacaaggggcgctctggtgtctcaagcaacttgggcacctaccaaaagaagaggacgttcgtgtatag</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>ENIYQVDNTGASISTACSVSLLHCYCDNLPRDMFFTPSPVFFYI DGIEGIICRLILPPNAAFRQADGQPCLSKDEAKRDACLKACVKLHKLGALTDFLLPGP GSRKNKVSVTNNSSNNKVEDDSLREELHEMLIPAVLKPSGLKLDSLSNLHFYYVKFIP IPEDRRYQMFGLFVINPLPVEAETLQVDLHLARGRIVKAGIKHLGKIAFEKEKMMLAH KFQEMCLKILLDRSEFTSPHVKLGNDVTLEINSTFYLLLPIKQKCYGDRFMIDWPAVE RCLSSPIFKDPIDVSVHASYSSNESLRLLDGIFSKTDVVGSVVFSPHNNIFFFVDGIL DEINAWSEHSGATYAEHFKERFRIELSHPEQPLLKAKQIFNLRNLLHNRLPETTESEG RELLEHFVELPPELCSLKVIGFSKDMGSSLSLLPSLMYRLENLLVAIELKDVMLSSFP EASQISASGILEALTTEKCLERISLERFEVLGDAFLKYVVGRHKFITYEGLDEGQLTR RRSDVVNNSHLYELSIRKKLQVYIRDQQFEPTQFFAPGRPCKVVCNTDVEVRLHQMDI HPDNRENCNLRCTRSHHWLHRKVIADVVESLIGAFLVEGGFKAAFAFLHWIGIDVDFN NPALYRVLDSSSINLSLMDYTDIAGLEELIGYKFKHKGLLLQAFVHPSFSQHSGGCYQ RLEFLGDAVLEYVITSYLYSTYPDIKPGQITDLRSLAVGNDSLAYAAVEKSIHKHLIK DSNHLTSAISKFEMYVKLSNSEKDLLEEPACPKALGDIVESCIGAVLLDSGFNLNYVW KVMLMLLKPVLTFANMHTNPMRELRELCQCHGFELGLPKPMKADGEYHVKVEVNIKSK IIICTAANRNSKAARKFAAQETLSKLKNYGYKHRNKSLEEILIVARKRESELIGYNED PIDVEADISVKMKSPHIHEENIPFQNTETSFTRSSKFHNQIIAGSGKHDVNNGRNNQP KLATQSGRLPSEATEKSNKKVYHGDMVHKTARSFLFELCAANYWKPPEFKLCKEEGPS HLRKFTYKVVVEIKGASATLLECHSDGKLQKKAAQEHAAQGALWCLKQLGHLPKEEDV RV</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>6962..7133#5777..5891#5030..5366#4279..4608#3545..3817#2978..3436#2391..2600#2079..2290#1503..1603#899..1323#547..821#206..471#1..98#gagaacatttatcaagtggataacaccggtgcttccattagcactgcttgtagtgtatctctactacattgctactgcgacaaccttcctagggatatgtatgtcaagattttttttttttgctcttcagtctgtcaccaactcgccatgacaatgatttattgattagttctttgcgatgctaatataactcctttttatgaaggttttttactccttccccagtgttcttctacattgatggcatcgagggaataatctgcagactaattcttccaccaaatgctgctttccgtcaagcagatggtcaaccatgtctgtcaaaagatgaagctaagagagatgcatgcttaaaggcatgcgtaaaacttcataaattgggtgctttgacagattttcttctgccgggtccaggttcaagaaagaataaagtatcagtaacaaataattcatcaaacaacaaagttgaaggtattttcacttgttcatacagtaccataagcgcataatgctggctctggcttaactcttgtttccttgtttcagatgatagtctaagagaagagcttcatgagatgttaattcctgcagttctcaaaccttcgggattaaagttggattctttatcgaacttgcatttctactatgttaaatttattcccataccagaagataggcgatatcagatgtttggtctctttgtgatcaatccccttcctgtggaagctgaaacattgcaagttgatttgcatcttgctcgtggcaggattgtgaaagcaggaattaagcatttggggaaaatagcatttgagaaagagaaggcatcatcctgctcatctgttcaattgataacacatgattgtttgttggatattatttaatattcttttattttcagatgatgcttgcacacaagtttcaagagatgtgtctgaagattctcctggacagatctgagtttacttcaccccatgttaaattgggcaatgatgttacattagaaatcaattcaacattttaccttctgcttcccatcaagcaaaagtgttatggtgatagatttatgattgactggccagcagttgagcgctgtttatcatcaccgatttttaaagaccctatagatgtgtctgtgcatgcctcatattcatcaaatgagtctctgagacttcttgatggaatcttcagtaaaaccgatgtagttggcagtgtagtctttagtccccacaacaatatctttttctttgttgatggcattctggacgaaataaatgcttggagcgagcacagtggtgcaacttatgcagaacacttcaaggaaaggtaataagtcaattattatccgtgctcaccttcctggtttacatgtttttttaatgggattttactaaataaagtacaacattgcaatacctctattgagcattctttaaggtagatatagcaacacaatcaagtttaagagctttatacatgtcctgatgaacttatgcattaattaggtttcgtattgagctatcacatcctgaacagccacttttgaaggctaaacagatcttcaacctgcgaaatttgcttcataatcggttaccggagaccacaggttattccgttgtcccaccgtaacaagacaccttattcattacttctgattattatgacatgataaaaaatgtaatcagtatatcattatgctaccaagaatgttttgtcatccattagaccacagctcagaaagagcataataaattttatataactacatatatgtcgcggagaagttgctttgtaaacttctattatttattgtttcaaaattattgaactgcttgtggattgctttagagtttggaaactgcttgggaatcagttggatctgttatttttcctatttccttctccggcttttgtatactgggattactatagtagactagtagtacatttataatcttgggacccaatgcattactgaatcctattttgaatatcttactctgctgtgaatctttgcatggttctgatccaggtatagtacttctaatgttgttacatcttttgttattattatttttaagaatcggagggccgtgaattactagagcacttcgtggagttacctccagaattatgctctttgaaggtcattgggttttcaaaagatatgggcagttccctgtccttgttaccttctttaatgtatcgtttggagaatttgctggtggctattgagttgaaggatgtgatgttatcttcttttccagaggcatctcaaattagtgcttctggtgtaagttgcaccatcttttgtacctttgatcctgaacatctagtttgaatttgcttatccatgccgaaaatagttgtgatcttagacgggttcatttcagatacttgaagcgcttactactgagaaatgtttggagaggatatctttggagcgatttgaagtcctaggcgatgctttcttgaagtacgtagttggacgtcacaagtttattacatatgaaggacttgatgaagggcaattgaccaggagacgttctgatgtagtgaacaattcacatttatatgagttatcgatcagaaaaaaattgcaggttagttaaccttgaacccatttttttattgctaagttgtatgatctacaattctaccagaatcatcatattctgcactatctggctctttcattatgatctactacctcggtaccaaaatataagcatttctggctctgaatctagtgtccagattcagagctagacatgcttatattttggggcggaggtagtagcaatattgacaaacattttgtgacacttgtgatctattaattttgtctgcttatttatacaacggttccctttccgtttatttttagatggattccttttatcgctgtagaagatacaactttcctgtcaagtatttattgcaaaattcttaatcagcaatgctttctcgtgaaatttaggtatacatacgggatcaacagtttgaaccgactcagttctttgctccaggaaggccttgtaaagttgtttgcaatactgacgtggaagtgagactacaccagatggatattcatccagataacagagaaaactgtaacctgagatgtacaaggtcacatcattggctgcataggaaagtgattgcagatgttgtcgaatcgcttattggagcatttcttgttgagggtggattcaaagctgcatttgctttcctgcattggattggaatagacgttgattttaataatccagctctctatagggtattagattcaagctccatcaatttatctcttatggactacactgacattgccgggcttgaagaattgataggttacaagttcaaacataagggtctacttctccaagcattcgtacacccttcatttagtcaacattctggaggctgctaccaggtcagagttgcccctctctctctctctctctctctctctctctgattgcacaggtgctgtgattcttgatagttgctcacctgctatgttcttttcatttctggtcagagactggagtttcttggagacgctgttttggagtatgtgataacttcgtacctctactctacttatccggatataaaacctggtcaaataacagatctaagatcgttagctgttggtaatgattcgcttgcttatgcggcggttgagaaatctatccataagcatcttataaaggattcaaaccatctcacgtcagcaataagtaaatttgagatgtatgtgaagctctccaattcagagaaagacttgcttgaagaaccagcatgtcccaaggtattgacgttattgcagagatttttttccatctgcacctttgtagtaacccttttttagccgagaggaagaaagaccatggtcttgtggttgctccctctgtcccacaaaactcaacctagtacttgatgttgatgcatcatagtactacaaatctggacatgtctctgtctagattcctagtactaggatgtgtcaatatccaatactaggttggctttttatgggacggaaggagtactcctcaaggatactgtttaatattcaatatgataggggagatttataagttctacaaaatgagcaaaagtgttatcaataattgcaagtgtattagagaattattaatcatagctcattaccatgattgtgatcttttctgtaagcaattagttatatgtaattgattgattgattttttttatggcaaaagcttataagttttatctacaacaatacaggctcttggtgatattgttgaatcttgtattggcgcagtgcttttagattcaggcttcaacctgaactatgtttggaaggtaatgcttatgcttctaaagccagtattgaccttcgccaacatgcacactaatccgatgagagaacttcgagagctttgtcagtgtcatggatttgagttaggccttccgaaacctatgaaagctgatggagagtaccatgtcaaagtagaagttaacataaagagcaaaattatcatttgtactgcagcaaatcggaattcaaaagccgctagaaagtttgctgcacaagaaacactttctaaactgaaggtacaattttgttcccttagcattttcttctgcaattaccatgcaacacgaatgctttgctttcagttagctgcacgaagcactctctgtagtctatacagaagatatattttttgtgatttttccatttgctttacttttttgcgggaacactatttattttattattagaatgtgagtatcagaacctcagccattacaacgatctattttattttgcttaattgttgacatgaatgtgaaagatcattgatttaatagattggaaagaaactattcattgtgttcattgctttccagtccaacttgccaaatttacacaatatctctttgttgtttgtgttaatctgtccattcaaataccctgtttcttaaaatgcatgccacaaccagcttactggtccttttgtaaattatgcagaattacggttataagcacagaaacaagtcccttgaggagattttgattgttgccaggaagagggaatcagaactgataggatataatgaagatccaatcgatgttgaggctgacatatctgtaaaaatgaagagtccacatatacatgaagagaacataccttttcaaaatacagaaacatctttcactaggagttctaaattccacaatcaaattatagcagggtctggcaaacatgatgtcaataatggaaggaacaatcaacccaagttggcaacacagagtggtcgtctgcctagtgaagcaacagagaaaagcaataaaaaggtgtatcatggtatgctaaaatttcttactttaaagtgctaccattagaaaatttgaaacctggtggaagtctaaacagttacctacatattcagatttacagttacaatattgtggtgtagctcaaactaagcaattacatattccattcaactttgtagtgtacatttgacttaattttgttgcgtgtacgcgaaaaataacttaattttgttctgttgggcacaaccgcacaagtggacacataatatatgttatctctttttaactttatgtgctaaaatgtacgagattggcaaccgtgtcgttgtactaacatcattttaaactatgtgtttaccaaatactgggttcacacttcacagttttgattgtttaattttagaggaaatgccttaacactgtcaatcatcttggtaggtgacatggtacacaaaacagcaagatcattcctttttgaactatgtgctgcaaattattggaaacctcctgaattcaagttatgtaaagaggaagggccaagccaccttcggaagtaagttcatcttcttactgagagcacccgcaatagtaaagtaaggtgctatctataaaacatgtacatctcagcaataggctagattaatagtaaaccacttcaatggtatgtctatatgggtatatataactctctaatccattgcattgtttttctctatagactatttctaggttagtagatagttttgctctctctcttcatttaatatcttccaagtaggaaaatatgctgacatggatgtcttgtagagagcctatagcaggtacaatagcaggctattagccagctgtaaacatatttgtagccagctacagcacggactctaagacgcaatgtgtatataataggtgggaccatatattagtagtatagtaagcaactattgtatgaattggctattagattgactatagataaattggagctaatagtgggctatactattaaacttgctctaagggtgaaataataacctttacgtgttacgatgaaacttacgtcctacctgtactgtttcctttcctttgtgcagtaatatatacatggcctacccagagtagtagatgctcatatttaagttctttatagtctatccagaacgcaaattagcttgtacattttatgatcagaatttcgatgatgcaccttggcttttaggttaaacatggtgttctaaaatgtggattatacataatgccattctcatactaaagcttggtataagctggagcagcaatcgtttaactgacaagcagaactattaagcacgattctgtcatataataatttctatgcctagggaactagatgacacatggcttatacattttttagtaatattgtacttcctccgtttcacaatgtaagtcattctagcttttcccacattcatattcatgttaatgaatctagataaatatatatgtctagattcattaacatcaatatgaatatgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaacggagggagtacacaactatctctgttgccacttgcatatgtacacatgcttgctaacttccctggaggaatgatacaggttcacttacaaggtggttgttgagatcaagggtgcttcggcgacccttttggagtgtcatagcgatggtaagcttcagaagaaggctgcacaagagcatgcggcacaaggggcgctctggtgtctcaagcaacttgggcacctaccaaaagaagaggacgttcgtgtatagcaacattgtcatgttttgggggtcacagtgcgaaagtacagtgatatttgtttgtccagagataaacgtgcctttctctcttttgctctgatgtccaacctcccttattaagggacgtgtataaattttcacttctccagtgccctttgaatggctagagttgtatagctagtccattattttccatgagacgtatattggtatatagttttattcttcaatagacgcatatagtattctttcaagttcc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001059813.1 RefSeq:Os04g0509300]|
| |
| − | }}
| |
| | [[Category:Genes]] | | [[Category:Genes]] |
| | [[Category:Japonica mRNA]] | | [[Category:Japonica mRNA]] |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information