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| − | {{JaponicaGene|
| + | The rice '''Os01g0118300''' was reported as ''' sui1''' in 2011 <ref name="ref1" /> by researchers from the China. |
| − | GeneName = Os01g0118300|
| + | <br> |
| − | Description = Phosphatidyl serine synthase family protein|
| + | ==Annotated Information== |
| − | Version = NM_001048394.1 GI:115434201 GeneID:4326076|
| + | ===Gene Symbol=== |
| − | Length = 6563 bp|
| + | *'''Os01g0118300 <=> sui1''' |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os01g0118300, complete gene.|
| + | <br> |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| + | ===Function=== |
| | + | *'''SUI1''' plays an important role in regulating uppermost internode length by decreasing longitudinal cell length in rice. |
| | + | <br> |
| | + | ===Mutant=== |
| | + | *The '''sui1-1''' mutant exhibits a shortened uppermost internode and a partly sheathed panicle, and the '''sui1-2''' mutant shows an extremely shortened uppermost internode and a fully sheathed panicle. |
| | + | <br> |
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| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | *State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, 359 Tiyuchang Road, Hangzhou 310006, China |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | <br> |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | ==References== |
| − | |
| + | <references> |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 1|Chromosome 1]]|
| + | <ref name="ref1"> |
| − | AP = Chromosome 1:1045604..1052166|
| + | Identification and characterization of SHORTENED UPPERMOST INTERNODE 1, a gene negatively regulating uppermost internode elongation in rice |
| − | CDS = 1049508..1049624,1049712..1049796,1050375..1050466,1050947..1051200,1051592..1051680<br>,1051768..1051895|
| + | </ref> |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | |
| − | name=NC_008394:1045604..1052166
| + | </references> |
| − | source=RiceChromosome01
| + | <br> |
| − | preset=GeneLocation
| + | ==Structured Information== |
| − | </gbrowseImage1>| | + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 1]] |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
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| − | name=NC_008394:1045604..1052166 | |
| − | source=RiceChromosome01
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| − | preset=GeneLocation
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| − | </gbrowseImage2>| | |
| − | CDNA = <cdnaseq>gagatcctttttgatgagtttgttattgcccatatccttggatggtgggggaaggctataatgataagaaaccaaccacttttatgggtattatcaattggctttgagctaatggagctcacctttcgccatatgctgccaaactttaatgagtgttggtgggatagcatcgtactagacatattaatctgcaattggtttggtatttgggctggaatgaagactgtgagatactttgatgggaggacatatgaatgggttggtttgagtcgtcaacccaatattatcagtaaggtaaaaaggacgctaggccagttcacaccagcacagtgggacaaagatgagtggtaccctctgcttggcccttggagattcatccaggtgctgagcctatgtattgttttcatgattgttgaacttaacacattctttctcaagttctgcctttggattcctccccgaaaccccttgattgtttaccgacttgtcctttggtggttaattgcgataccaaccattcgcgagtacaatacatacttacaagacaggaaacctgttaaaaaggtggggtctttctgttggctttccctagctatttgcattttggagcttctactatgcatcaagtttggacatggtctctttccgaagtcgatgccgtcatggttgttcatagcctggacgaccgtggcgtcgcttctgatgatgttccttcttgtgtggacttggaaaatttaccgaacaatgataaggaaaaggctatga</cdnaseq>|
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| − | AA = <aaseq>EILFDEFVIAHILGWWGKAIMIRNQPLLWVLSIGFELMELTFRH MLPNFNECWWDSIVLDILICNWFGIWAGMKTVRYFDGRTYEWVGLSRQPNIISKVKRT LGQFTPAQWDKDEWYPLLGPWRFIQVLSLCIVFMIVELNTFFLKFCLWIPPRNPLIVY RLVLWWLIAIPTIREYNTYLQDRKPVKKVGSFCWLSLAICILELLLCIKFGHGLFPKS MPSWLFIAWTTVASLLMMFLLVWTWKIYRTMIRKRL</aaseq>|
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| − | DNA = <dnaseqindica>3905..4021#4109..4193#4772..4863#5344..5597#5989..6077#6165..6292#attctgctaaaaatttcatcttggggggtatatttctcatattttagttcatgccgccgccactatgtactaatcccaccatagcagctcatagtattctccattgcaatcctgtcgtctatttgtatttgttttttgtttgttagtattagggtgcttttgggtttggggtttctgccattgacggttacctgaagagctctcgatgaagcggttcttttttattttattttattttcggtgcctagtgaaatacagtggtggttttgaatcattcctgggagttccctggtggttttgactgatcaaaacgctacattttttttatgtttatgttccctgttgttgtttcttgcccaaatgcagattcactcttgcatttgtttctcttgatttcctctgctgttttgctctacaaggacagaggacttagtctgcttgttcgtcagccttgcaggaaaaaaaatgcagtaaaaaacctgtctattgcgattactttgtgttcatcttggggcgctcttattatgcgtgggaatcaccagcagagttcatccgatttgatgcgcgcatctctaattcccatcttttgcagcattgcaaaagctgctgccttttagcttttgcgctttcttaattaggaggggttgtacggcgcccctgttggacctgattacttccacagtaattgcatcatgacattttattcctttttaatcgtttccttttgctaatctttttaagtacaaatggagtttccccccaaaaaaatattgcaaatggagtttttttttccccttctcctctcgccttttgctgtttcaggtttcgtatgttatcttcacatcaatgcagcctttaattgcagcagaccacccttctttgctactagtatgggaaaaaaaaatcagagccacacgaactgtgggtatttgctatgggaacttcacaagttcgccagcaatacaacttgaatgcgtcctgaagatctagattccgcaggtcaaatcgtcgaatttcagagctagtagtactgtaggcttgcctggtgcaactgtgggttatgcttcaatagcctttaactgtgggttaatgtgtagagtatatgtcaaatacagaatttttacttgaagaagatgtgtttattttcagatgtgttggaccatttcatgttgtccacttgtaggtactttcgtggcctaagtagtacattattcagttgttagttatttgtctcactgaatgcaagtgtatctttagtaagagttggactgcattgtacttgttttaatcttcttgaaggccagtaagaatttgtactctaatacaaaattgtggaaattttacagataataagctgctaagaattatcaccatggaggtcaatggtcatcacaaaccaagaagagaatataatggccgagagtgcaatggtgtacaatcagtaaacaattttggcgatatcgatccatggacagcatgggcatacaaaccgcgcacagtttcattgctactgatgggaacatgctttttaatgtgagatcagaatctttatctgtggattttttttaaagattttaaagagcattttaataatcaaggtgttttatgcatttgttagtgttggcctacggcacctttttgaaatatgttttattttcttcagtttcgaccattgttaggactatcaacaagatatttaggacttgcaaaggtgctctatgtttaacagaaatttaatttacattctttatcagttgggcaagtggtgctcttgatccagaaagaagcttctctgttgaccgcgtttcatctgttaaaaggtattctactcatccaggttagacggtagttgtttttaccattcactcactaattggacatctttaaaactagtgttacctggtcatctgtgttcaaaatattttttattgaaatcacacgagtcagatccatagcagatttcatgtgttgatgttttttttgctgcactagacacgcaaattctagtcggtttccaaccacatgagtgttcattttatttttaccatcatttttctcaacaatttatctgttgattatcatttaaggattcctttttgttgatatgtcatatgtttctcttttattgacaggggtgtctttgcaatgattgctgtttttttggcttattcatttcttcaggcaccttctacgtgagtcacataaaccccttatccgaactctgattatcgaactctgtttatggtagggatggccgtgcagatataaataatgctattgcacattgatatggaacagaagggggtacgcgttcctgcgtactccatttctgaaaataacttttcaatatcactgaggaattgtatcattttcctagatgtgttacttttatcatgaaactgaaataacttcataaattctcctaaataacagttttaatttaaaaatcccttgaaagtgaggcactgttccatttcctaaaaatataacctcattgggggcttctctgtaattttgtttaacatttacttatatttatttatactatgattcagtgtacttattagaccacatcctgccatttggcggctggtccacgggatggcagttgtttaccttgttgctctaacttttttgcttttccaggtaagtacagctttttcttattactcttgctcaacacatttttattggatcattgatattcatggattattaaggcattgcattcttttactttttttatctcttccacataaccttataatatcaacttcttttctaatgaacggcatagaagtccctgtctcagtttctcgtttaattgattagcataaggaattgcactgtgcactaatacctcacttccctcttgattccaaccaaaaataggttatttttattaaaggaaaaaagagtcgtcattggcattacacatcagcagcagaagatgaggttaccaatgtcaaaagtttaacagtataactataggtgaacatagatcagtttggaactaggatgactcaagagattaacacacattggaaagaaaagcctggtatcccatttttatgttaccctgggaacttttttagtcaataggaagcttcccagaaatgttttcaagtcatccaactaattgcgattagtcatcctagtcggtactaaggcaacttgattctaaccacgattgatcggaaagtctcctaattagtcgcgattagttatgattaatcatcctagtcggtactgaggtgattttcctcgagtttccgatttgaaaacatgctgccttgttgtggtttactcctagaggtagctagtcaaagtgccaagagactattctcccgtatctttactattgtgctatactggtccatgttgcatgcaccagatgagacaatgtctcaaaaagtgagggtcttgttataaatattttttttcttctcaaatacgcaagagaattgtgcatcattggtcttgttataaatatcataaaagagagaacaaaacctgtagtttgcatgggattcatactctgttccacttaatcttgcagacccgtgatgatgctaggcaatttatgaagtatcttcaccctgatcttggtgttggtaatgaatttaatttccatatatgatctagcagtgcagagttatgtgattggaaaaataaaaacctgatttttacccacctttgagcagaattacctgaaagatcttatggaaccgactgccgcatatatgtacctgatcatccgaaaagcaggtttaacaatgtttatgtatgactccattcaccaacttgcttctcctttttgttctatttgatttaccttaaaactccagttctgcaaagtcttggagatgcttcaagttactgatttgaatataggtttctctaggagatcctttttgatgagtttgttattgcccatatccttggatggtgggggaaggctataatgataagaaaccaaccacttttatgggtattatcaattggctttgagctaatggaggtatgcatttaatcttacacgatcaatttatttttggcttctgtcttctgaatctagattccttacatagtttcacatgtcctgcagctcacctttcgccatatgctgccaaactttaatgagtgttggtgggatagcatcgtactagacatattaatctgcaattggtttggtgagattttttatattttatcagtatttttaatatacaattctcatttcctttaaatgtagattagacaccctcattcagtttattcagaaatcatttttttgtttattggcttctttctttattgtggttgtataagctgctggagtagtatcttctgatttactgaaacctcattcagaattttgtaccttagcatattaaagttaatcatggcaaacctatgtttcacattgttttgcttatctctttctgcaaatcgctaagacagaatattagtgttttaatagttttgtgatgtattagacatcttttaaatgctaagtgtacctatggtatttcactagctatttcgtatgaagttgtgcgctataattgttactttaaatgctaagatatttcatgtgattaaaatttcgggacagttttcatgcgaatgtctgtctttacctctattcgttagcctcccataagtttgattcttctctgctgcaacatcgtgttatgtatcttttgcttgagtaatagagtgacagttgctttcaactcttcctgactgggacccttatttggtttaggtatttgggctggaatgaagactgtgagatactttgatgggaggacatatgaatgggttggtttgagtcgtcaacccaatattatcagtaaggtatgctcattagatgtcaaggggaatgaagttgcccagcaaagcatatggtggcat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| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001048394.1 RefSeq:Os01g0118300]|
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| − | }}
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| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
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| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]]
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| − | [[Category:Japonica Chromosome 1]] | |
| − | [[Category:Chromosome 1]]
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