Difference between revisions of "BGIOSGA001799"
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Revision as of 18:13, 20 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001799 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001799, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_01583 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001799-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001799-PA |
| Length |
11289 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:12664344..12675632 |
| Sequence Coding Region |
12675549..12675632,12674459..12674560,12673851..12673969,12673543..12673684,12673226..12673393 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:12664344..12675632 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:12664344..12675632 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGATCGTCGGGGTGTCGCGGGGCGACGCCGGGGACATCACGCCCATGCTGCTCTCCTACACCGTCGAGGTCCAGTACAAGCAGTTTAGGTGGCTTCTATATAAGAAGGCATCACAGGTTCTATATCTACATTTTGCGTTGAAAAGGCGTGCATTTCTTGAGGAATTCCATGAGAAACAGGAACAGGTCAAGGAATGGCTTCAAAATTTGGGAATTGGGGAGCATATGCCAGTTGTGCATGATGATGATGAAGCGGATGACGTGCATGTTCCTTCACAACATGATGAACACTCTGTCAAAAATAGAAATGTTCCCTCTAGTGCTGTCTTGCCTGTCATTCGTCCAGCCCTTGGTCGTCAGCAATCTGTTTCTGATCGTGCAAAGGTTGCCATGCAAGAATATCTGAACCATTTCTTGGGAAACATGGAAATTGTCAACTCAAGAGAGGTTTGTAAATTTTTGGAAGTCTCTCTGTTATCATTTCTACCAGAATATGGGCCTAAGCTAAAGGAAGATTATGTTACAGTTGGACACTTACCAAAAATTGACGAAGGTAGCAGTAACATATGTTGTTTGTGTGGATGTTTTAGTTTCTGCAACAGTAGCTGGCAGAAGGTTTGGGCTGTACTGAAGCCAGGATTTTTAGCTTTGCTCCAAGATCCATTTGATCCAAAGCTTTTGGATATAGTTATCTTTGATGTATCACCTCACATGGATAGAAATGGAGAAGGCCAAAGCACTCTAGCAAGAGAGATTAAGGAACATAATCCATTGCACTTTGCATTTGAGGTGTCTTCTGGGGGGCGGACAATAAAATTGAGAACAAGAAGTTCTGCTAAAGTGAAAGATTGGGTATCTGCAATAAATACTGCTCGACGACCCCCAGAGGGTTGGTCTCACCCACACCGTTTTGGTTCATTCGCACCACCTAGGGGTTTGACTGAAGATGGTAGCGTCGTACAATGGTTTCTTGATGGGCAAGCTGCGTTTAATGCTATTGCTTCTTCAATTGAGGAAGCCAAATCGGAGATATTCATTACTGATTGGTGGCTGTGCCCAGAACTGTACCTTCGACGCCCTTTCCACCATCATGAATCCTCTAGACTTGATATTCTTCTAGAATCAAGGGCAAAGCAAGGTGTACAGATCTATATTCTTTTGTACAAGGAAGTTTCTCTTGCATTGAAAATTAACAGCATGTACAGCAAACAGAGGCTTTTAAACATTCATGAGAATGTTAAAGTTCTGCGATACCCTGATCATTTCTCAACTGGCATATACTTATGGTCACATCATGAGAAAATCGTTATTGTTGATAATCAAGTATGCTATATTGGAGGCCTTGATTTATGCTTTGGTCGTTATGATACTCCTGAGCATAAAGTTGTGGATGTTCCTCCTTCAATATGGCCAGGAAAAGATTACTACAATCCTAGGGAATCTGAGCCAAATTCTTGGGAGGACACCATGAAAGATGAGCTTGATCGTACTAAATATCCTCGCATGCCCTGGCATGATGTTCAGTGTGCTCTTTATGGTCCTGCATGCCGAGACATAGCAAGGCATTTTGTTCAGCGCTGGAACTATGCAAAGAGGAACAAAGCACCAAATGAGCAAGCAATTCCCTTATTGATGCCTCAACATCACATGGTAATTCCCCATTACATGGGTAAAATCAAAGAATCAAATGAGGAAGTAAGTAAACAGACTCATGTTGAGGATATTAAAGGCCAGAAGTTAAGCTCCTTGAAAGCACCAGCATCATGCCAGGACATTCCATTGCTTTTGCCTCATGAGCCTGATCACCAGGCATCAAATAATGGAGAGTTAGGTCTGAATGGTTTAGATAACAATCATGGTCACTCAGATCACCCAAATAAAACCCATTGGAAACAGCCCATTCCCAACCGGAAGGCCAAGCAAGATACTTCTCTTCAGGATTTACAGATGAAAGGTTTTGTGGACAATCTTGGTACCCCAGATGTTTCATCAGTAATTGGACATTATGACACCTCAAAACAAAATGTGCATCACATGGATAACGAATGGTGGGAGACACAGGAGCGAGGAGACCAGGTCGATTATGTGCTTGATATTGGAGAAGTTGGTCCCCGAGCAACTTGTTGCTGTCAGGTTGTTCGAAGTGTTGGTCCGTGGTCAGCAGGAACAACTCAAATTGAAGGGAGCATCCACAATGCCTATTTTTCTCTCATCGAAAAAGCAGAACATTTTGTGTACATTGAGAATCAGTTTTTCATATCAGGTCTTTCAGGAGATGACACAATAAAAAACCGTGTATTAGAAGCATTATACAGGCGTATACTTAGAGCAGAAAAGGAGAAAAGGTGCTTCCGGGTTATAATTGTCATACCGCTTTTACCTGGATTTCAGGGAGGCATTGATGACGGTGGAGCAGCATCTGTTAGAGCAATTATGCACTGGCAATACAGGACCATTTGTAGAGGGCCTAATTCAATACTTAAGAATCTTTATGATGTGGTTGGTTCCAAAGCCCATGATTATATCTCCTTTTATGGGCTCAGGGCACACGGCAGACTAGGTGATGGTGGTCCTTTGGTCACCAATCAGATATATGTGCACAGTAAGTTGATGATCATTGATGACCGGATGACACTGATTGGATCAGCTAACATAAATGACAGAAGTTTGCTTGGATCAAGGGATTCTGAGATTGGTATGATTATTGAAGATAAAGAGGTTGTCAGTTCAATTATGGATGGAAGACATTGGGAAGCAGGGAAGTTCTCTCTTAGCCTACGACTTTCTCTATGGGCAGAACACCTTGGCCTTCATCCAGGAGAGGTTAGTCAAATTATGGATCCTGTGGACGATTTGACTTATAACAACATCTGGATGGGCACTGCTAAGGCAAACACCAAGATATACCAAAATGTCTTCTCGTGTGTTCCCAATGATCACATCCATTCTAGGTCCCAATTTAGGCAAGGATTTGCTCACCGGAAGGAGAAAATCGGCCACACAACCATTGACCTGGGTGTTGCTGTAGAGATAACAGAAACTCACAAGGATGGGGATCTGGCAGGCACCGATCCTATGGAAAAATTACAGGCCGTTAGGGGCCATCTCGTTTCCTTCCCTTTGGAGTTCATGTGCCAAGAGGACTTGAGACCATTCTTCGGCGAAAGCGAATATTATACGTCCCCGCAAGTTTTCCATTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MIVGVSRGDAGDITPMLLSYTVEVQYKQFRWLLYKKASQVLYLHFALKRRAFLEEFHEKQEQVKEWLQNLGIGEHMPVVHDDDEADDVHVPSQHDEHSVKNRNVPSSAVLPVIRPALGRQQSVSDRAKVAMQEYLNHFLGNMEIVNSREVCKFLEVSLLSFLPEYGPKLKEDYVTVGHLPKIDEGSSNICCLCGCFSFCNSSWQKVWAVLKPGFLALLQDPFDPKLLDIVIFDVSPHMDRNGEGQSTLAREIKEHNPLHFAFEVSSGGRTIKLRTRSSAKVKDWVSAINTARRPPEGWSHPHRFGSFAPPRGLTEDGSVVQWFLDGQAAFNAIASSIEEAKSEIFITDWWLCPELYLRRPFHHHESSRLDILLESRAKQGVQIYILLYKEVSLALKINSMYSKQRLLNIHENVKVLRYPDHFSTGIYLWSHHEKIVIVDNQVCYIGGLDLCFGRYDTPEHKVVDVPPSIWPGKDYYNPRESEPNSWEDTMKDELDRTKYPRMPWHDVQCALYGPACRDIARHFVQRWNYAKRNKAPNEQAIPLLMPQHHMVIPHYMGKIKESNEEVSKQTHVEDIKGQKLSSLKAPASCQDIPLLLPHEPDHQASNNGELGLNGLDNNHGHSDHPNKTHWKQPIPNRKAKQDTSLQDLQMKGFVDNLGTPDVSSVIGHYDTSKQNVHHMDNEWWETQERGDQVDYVLDIGEVGPRATCCCQVVRSVGPWSAGTTQIEGSIHNAYFSLIEKAEHFVYIENQFFISGLSGDDTIKNRVLEALYRRILRAEKEKRCFRVIIVIPLLPGFQGGIDDGGAASVRAIMHWQYRTICRGPNSILKNLYDVVGSKAHDYISFYGLRAHGRLGDGGPLVTNQIYVHSKLMIIDDRMTLIGSANINDRSLLGSRDSEIGMIIEDKEVVSSIMDGRHWEAGKFSLSLRLSLWAEHLGLHPGEVSQIMDPVDDLTYNNIWMGTAKANTKIYQNVFSCVPNDHIHSRSQFRQGFAHRKEKIGHTTIDLGVAVEITETHKDGDLAGTDPMEKLQAVRGHLVSFPLEFMCQEDLRPFFGESEYYTSPQVFH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..84#1073..1174#1664..1782#1949..2090#2240..2407#2501..2674#3857..4096#4184..4300#5346..5485#5563..5712#5858..6014#6081..6620#8395..8505#8665..8811#8886..9083#9218..9319#9954..10085#10609..10674#10886..10947#11040..11289#ATGATCGTCGGGGTGTCGCGGGGCGACGCCGGGGACATCACGCCCATGCTGCTCTCCTACACCGTCGAGGTCCAGTACAAGCAGGTCCGCTTCCTCCCCCCTCCTCCTGCTCGGGTTTTCGTTTTGGGGTGGGGTACGGGTTGCGCGATTCGGTGGTGAGGCGGGGTTGGATTCGGCAGCGTCCATGGTGCTTGGCATTGTAGTGTTGTTGCGTAAATTGATGTTTGATGGTTTGTTTCGTCGATGCCTGCGCGTATTTGATTTCCAATTGACTTCTGAATGTGTTTTTCCCTTTTTTTTAATGAAAAGAAAAAAATACTACCTGATTTTGTGCGGTTTAAGATAGAGTGAGCCTCCACCGCTGCTAGAAAACGAAAAGAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGGGTCCCTTTCTGTTGTCTGTGTAGCAACTATGTCAATGAGTAGCTTGGTGGAGCTTGCACGAAAGAGTGGTTGGTACTTTGTTTCACTGATTCGGTGGGGTATGAAACTCAGGCGACCTGATCATTAAATTTTCAGTGCAAATGCAGGCGAATTCTTTGTTTTTTTTTTGGGGGGGGGATCAGATACAGTGCTGTGCGTGTGACTGTGAAATTTCCATGTTATTTTCACGTGAATTTAGAGTTGACTACCTATGCCTATCTGTAATTCATTTTTTTTGGGTCCAAGGAAGTGTACTGTTTGAACTTCTTGTAATGTTAGGTTCCAATTTGGTGGATGCACATGTATGCTTTGTTACATGGAAACATAAAACCCAAGTCAAGGAATAACATGAGCTGTGCACTATCACAGCTTATGTCTAGTTGATATGTTCTGTAAAAAAAAACTAACACCATTAGTCTGTTCCCTATGGATTCGTATCCTGAACCTCTTTTCCATAAGGAAAATGGTTTTCCTTTTCTGTAAAAAAAAATCATATGAAAGTGGTTTATTATCCAGGACATGCTATTTTCATTTCACCTTTTTGCATTGTTGAGATTTTACAGTTCTGTGAAATGCGAATTATGAACATTTTATCCTTCGGTAATGTTAACTAGTTCTTCTATCAGTTTAGGTGGCTTCTATATAAGAAGGCATCACAGGTTCTATATCTACATTTTGCGTTGAAAAGGCGTGCATTTCTTGAGGAATTCCATGAGAAACAGGAACAGGTCGGTTACATAATCATCACAGTTCGTTAGCTGTATTTGCATCTGTTTATCTTTTCAATTGAAATGCTGAATGCTGTGATTGGACACCAGAAAAATCTGTTACTGGAAGTTTTGCAGCGCCACTTTTGTTGACAGTCATTTTGACATTTTATTGTATGTTGTAAACGTATTAGGAAAAACATAATTTTCTCTGGTTTACTATTTTGCATTTCATTCGCCATGAACTATCATGCCCCACTTGTTTGTGGAAACATATAATATTTGTTGCAAGCATCTCTAGTATGCCATTCCTATTGTTATTATTATAGCCATGAAGAATGCACTTAATAAAAAATGAGAGAATCCTCAGACCTTTGTTCCACTGCTCTTTCTACTCTAATTACTCGGCTGCTAATTCATAGTAGGAGAGATATCACTGCTCAGAACAAAACCTCCTTTTCAGTCGTGAAACTGAACCAACCTCTTTTTTCTTTTCAAACAAAATTAAAGGTCAAGGAATGGCTTCAAAATTTGGGAATTGGGGAGCATATGCCAGTTGTGCATGATGATGATGAAGCGGATGACGTGCATGTTCCTTCACAACATGATGAACACTCTGTCAAAAATAGGTAATGCTGTTCTATTAATAATTTTGACCTTAATGGACTAAAACGAAGACGAAAACGTCAGCAATGAAATCTTTCTGTAACCAGTTTATTGATGCAATTGGAGTAGTTGACTTGCCATAAGTTTACCTGTGCATATTAAGAAATGAATACAAAACTTTTGTTGCAGAAATGTTCCCTCTAGTGCTGTCTTGCCTGTCATTCGTCCAGCCCTTGGTCGTCAGCAATCTGTTTCTGATCGTGCAAAGGTTGCCATGCAAGAATATCTGAACCATTTCTTGGGAAACATGGAAATTGTCAACTCAAGAGAGGTACCAAAAAGCCTATATTTTCTCTATACTCTCGTCATATTTGTTTTGGTTATAATGTCTATACATCACCAAAAACATTGAATTTGTCAATTAGGATATATTTCTGTGGTGCTACCCTCTTTTGGACTGTAACATGAAATAAAATGCAGGTTTGTAAATTTTTGGAAGTCTCTCTGTTATCATTTCTACCAGAATATGGGCCTAAGCTAAAGGAAGATTATGTTACAGTTGGACACTTACCAAAAATTGACGAAGGTAGCAGTAACATATGTTGTTTGTGTGGATGTTTTAGTTTCTGCAACAGTAGCTGGCAGAAGGTATCAAATGATGCGCATTGATGTTATTTTATATCTATTTTTATCCTTATTAGTCCTTGTTTGTGACCCGTGACATTGAACACTTCTTCATAGGTTTGGGCTGTACTGAAGCCAGGATTTTTAGCTTTGCTCCAAGATCCATTTGATCCAAAGCTTTTGGATATAGTTATCTTTGATGTATCACCTCACATGGATAGAAATGGAGAAGGCCAAAGCACTCTAGCAAGAGAGATTAAGGAACATAATCCATTGCACTTTGCATTTGAGGTATGCCCTGGTCTACAGCGTGTTCCTCCCTCAAATGAAAAAAAAAAAAACTTATAACCTTGTCACCGTCTTCCCACAACATTAAGACTTTGTTGACCCATGGACCTCTTTAACCTGATTTGTTACCCAGATAAGTTTTAAGTCCAGTCAAAACAAAATGTGTTTGTTTGTATCTAATTGTAAAATCTAGTTTCATTTAACTTCTAAATATGGTAAAGCAAGCATGTTTCTGAGTTGATGTAATTGTAAAATCTAGTTTCATATGACTTCTAAATATGGTAAAGCAAGCATGTTTCTGAGTTGGCGACAGTCTCAACTGGCATCGCTCCTCTAAGTTTAGTTGAAAAAAATCATTGTTAAAATATGATCTAGAAAAACAATATGCTAGTATGCCTCTAGGCTCTAATACGTGTGCCTGAACTGGTGACATGAGTGAATAAAACGAGTAAAATTTTCTAAAGAAGGCATTGCCCATTTTGATAGCATTTTGCTTGCCTGGCACTTCACAAGATACTCTAGTCTTCATCTCCTTTTAACAAAATGGATAATGCTCATACCAAATCATTGTTAACTGGTCTGTGTTTGTTGGATACATCCAATGACCAAAAGGTTTTGACCATATTTTCCTTTTTGTCAGATGAAACCAGACCAATACATGAACATAATTGTAGTAAGATCAGGAGGCTATAATTGTCCAATGTACTCCATCCATACCATGAACTTTCGTTAAGCAAGATAGAGTGGGTATACACCTAAGGCTCTGACTCATGGTGAATCTTCTTTAGTGCTTCATGGGAGTCGCTGAGCTTCTTCCTAGGAGTTGGATCTTTATGAAAGTATTTTTGATTTTAGTTTCTTCCTGAGAAACTAGTAACCATAACAGGTTTATTTATCACCCATCTTCTGCACGTTCCTTATATTAGTACTTGTTCTACATATGCTCCCTAGTTGATCTACAGCTATATATCCTGGTACAAATCAGCTGTCCATAGTTCTGTCATAGAAAAACGTAGGAACTAATGTATAGTACTCCGCTGATGTTAATAAAACTCAAGCTCTTTTGTGATACTGGCCTTGGCCTTGATCTTCCTATTGTAAACCAACATGGTAGCATGCAATAAATGTGGGCATGCGGCATCTGTTTTTTCACTGTAAGTTTCTAAGTGCTAATACTTGTTGAAGGTGTCTTCTGGGGGGCGGACAATAAAATTGAGAACAAGAAGTTCTGCTAAAGTGAAAGATTGGGTATCTGCAATAAATACTGCTCGACGACCCCCAGAGGGTTGGTCTCACCCACACCGTTTTGGTTCATTCGCACCACCTAGGGGTTTGACTGAAGATGGTAGCGTCGTACAATGGTTTCTTGATGGGCAAGCTGCGTTTAATGCTATTGCTTCTTCAATTGAGGAAGCCAAATCGGAGGTTGATTTTCATTAGCTCAACTACTATTTCCGAAAAAGGTTAAAATTTTGACCATGCAGTGGAAGATAATTAAACTGTTAAATGCAGATATTCATTACTGATTGGTGGCTGTGCCCAGAACTGTACCTTCGACGCCCTTTCCACCATCATGAATCCTCTAGACTTGATATTCTTCTAGAATCAAGGGCAAAGCAAGGTGTACAGGTATGTGATTGTTTTATGGTGTTATCAATCAGTTCAAGCGCTAAAATCATGTTCAGTTGTGCACTCGTATATATTATTTTGCCGCTTTGCAGTATTTATTTGTTTGTAACAGATTTGGTAGCATCAAATGTTTAACTGGTAGCTGTCTACATGAGATGATAATAGACAAGTGTATGAAGTTTAACTTTGCAGATATTGGCTGTATGCATTTTAAAGTAAGTAATGTTCTGTATTTGTGAAGATACAAGCTGCATGTCGTGCTAATAGAGGAAGAATGTAATTCTCCAAAAATACTCATTATGTGTTCTGAAGCTCTTTACAAGTGATAAACATGCATTGTGTATCTTGCAAGGGTTATCTCCATTACTCACGTAGTTGCACTTTTATCCAAGAAAGATGCAAAAGTTGCCTCCATTTCTCACGTAGGTGCACTTTATCCATGGCGCATGCAAAGATTGCCCGAT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