Difference between revisions of "BGIOSGA001819"
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Revision as of 18:13, 20 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001819 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001819, complete gene. |
| LocusTag |
P0682B08.14 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001819-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001819-PA |
| Length |
13002 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:12088676..12101677 |
| Sequence Coding Region |
12101579..12101677,12101407..12101472,12100316..12100402,12100084..12100140,12099931..12099995 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:12088676..12101677 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:12088676..12101677 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATCCCCGCCTCCTTCTCGCCCTCCTCTGCCTCGCCGCCTTCTCCGCCGCCGCGTATGCCTCCGACGAGATCCACGGCTGCGGCGGCTTCGTCGAGGCGAGCTCGGGGCTAGCCAAGTCGAGGAAGGCGTCGGACTCCAAGCTCGACTACTCCGACATCACGGTTGAGCTGTGTACTATTGATGGTTTGGTTAAGGAAAGCACTCAGTGTGCCCCTAATGGATACTATTTTATCCCAGTCTATGACAAGGGTTCATTCATGGTCAGAGTTAAGGGGCCCAAGGGGTGGTCTTGGAAGCCTGAAACTGTTCCTGTTGTCATCGATCAAAATGGATGTAATGGCAATGCAGATATAAATTTTCAGTTCACTGGGTTTATGATATCTGGTAAAGTAGTGGGAGCTGTTGGTGGGAAGAGCTGCTCTAAACATGGAGGACCTTCTGGTGTCAAAGTTGAGCTATCGACAAACTCTGATGAGTTAGTTGCTTCTGCTTTAACATCATCTACAGGAGAATATTCATTTGCAAATATAATTCCAGGGCGCTATAAATTGCGTGCTTCTCATCCTAACTATGAAATTGAGACAAGGGGTTCATCAGAGGTGGACTTGCGATTTGGAAATGCTGTTGCAGATGATGTCTTCTTTCTATCTGGATATAATATTTATGGCTCTGTAGTTGCACAGGGAAATCCAATCTTGGGAGTTCACCTTTATTTATATTCAAATGACGTAACAGAGGTGCCTTGTCCACAAAGTATTAGTGATGCACCCAGAGAAGGTGCTCTTTGCCATGCAGTATCTGGTGCTGATGGAAAGTTCACGTTTAGTTCGTTACCTTGTGGTAGCTATGAGCTGTTGCCGTACTACAAAGGGGAAAATACTGTTTTTGATGTCTCTCCCCCTTCACTGCTTGTTTCTGTTGAGCACAGTCATATGACTATCCCCCAAAAGTTCCAGGTTACTGGGTTTTCTGTTGGAGGGCGTGTTGTTGATGGGTATGGTGCTGGTGTGGAAGGTGCTAATGTTATCGTGGATGGTCAGTTGAGAGCTGTAACAGACAATCTTGGGTATTACAGACTTGATCAGGTTACCTCCAAGAAGTATACTATTGTGGCTGAGAAGGATCATTACAAATTCAACCGTTTGGAGAATTTCATGATTTTGCCAAACATGGCTAGTATTGATGATATCACATCAGTTCGGTATGATGTATGCGGTATTGTTCGAACAGTAACCCCAAATTCCAAAGCAATGGTGACCTTAACACATGGGCCTGAAAATGTAAAGCCACAGAGGAAACTGGTGAGCGAAAATGGAAGATTTTGCTTTGAGGTTCTTGCCGGTGAATACCGCTTATCTGCCCTACCTGTAGATACCGAAGGTTCTTCCAGTCTTATGTTTTCACCAGGATTTATTGATGTCAATGTCAACAGTCCATTGCTTGATATAGAGTTCTCTCAGTCACAAGTCAACCTTCATGGTAAGGTCCTGTGCAAAGAGCAATGCAACCAAAATATTCTGCTGTCACTTGTTAGATTAGCTGGGGGAATCGAGCAGGAAAAGAAGACAGTTACTTTGGAGCAAGATAATGTTAATTTTGCATTCAAAAAAATATTTCCTGGGAAGTATCGTCTAGAGGTGAAGCATTCATCATCTGAGGCCGCTGCACAGGATGATTGGTGCTGGGACCAAAATGCAATGGATATAAATGTTGGTTCTGATGATGTGACGGACATTGTGTTTGTACAGAAGGGCTATTGGGTAGAGCTAGTCTCAACTCATGAGACCAAAGCATACATTCAACATCCAGATTCTTCTAAACTTGATTTGCTGATAAAGAAAGGATCACAAAGGATCTGCATAGAAACTCCTGGGCAACATGAGCTTCATTTAATTAATTCCTGCATTTCCTTTGGGAGCTCGCCAGTGGTATTTGATACAAAGAATCCAATGCCTGTTCATATCAGTGCAAAGAAATATCTTGTAAGAGGTGAACTCCATGTGGAGATGGGCTCCCTTCAAGAAATTGATTTATCCAAAAATATTGGTGTTGATGTCTTCAAGAGTGATGGGAGTTTCATCGAAAAAATCTCTGCTACACCTGTTCTTGGAAAGAGTTACCAAAATGACATTAGTGCCTTTGAGTACTCCATTTGGGCTGAATTTGGGGAGGACTTCATTTTTGTTCCCCGTGATGATAGCACTGGAAGGAAAAATATCCTCTTTTATCCATCAAGTCAGCAGTTTTCGGTGGCTGTGAATGGATGCCAAGACACTGTTCCTTCAATAACCGCTAAAACAGGTCTATACCTTGAAGGATCAGTGTCGCCTGCAATTTCTGATGTTGACATCAAGATCCTAGCAGCAGGGAAGAGCAAGTATGCATCTCTGAAGGAAAGGGACATAGCAATGGAGACAAAGACAAATTCTGAGGGATCATTCTTTGCAGGTCCCCTGTATGATGATATTGGATATACGGTGGAAGCTTCAAAGGCTGGCTATCATCTAAAGCAAACTGGCCCGTACACCTTTTCTTGTCAGAAGCTTGGTCAGATATTGGTACGGATTTATGGTGAACAAGATGCCGAGCTTTTACCTTCTGTATTGCTGTCTTTGAGTGGTGAAGAAGGCTACAGAAATAATTCTATTAGTGGTTCTGGTGGAACTTTCAGCTTTGGTAACTTATTTCCAGGAAGTTTCTATCTCCGACCTCTTCTCAAGGAATATAAATTCACTCCATCAGCAGTTGCTATTGATCTCAATTCTGGTGAGTCTAGAGAGGTTGAATTCCGTGCAACTCGTGTTGCCTACAGTGCCATGGGTTCTGTAACCCTGCTGACTGGCCAACCAAAAGAGGGAGTATTTGTTGAAGCAAGATCTGAATCAAGAGGTTATTATGAGGAAGCTACTACTGATTCTTTTGGTAGGTTTCGCCTTAGAGGACTCGTCCCTGGCTCAATTTATTCTGTAAGAGTGGTTGCAAAAGATGATCACAGGTTTGCAGCAGTTGAGCGTGCTTCACCTGAATATGTGTCAATTGATGTTGGTCAGGATGACATCTCTGGTATTGATTTTGTTGTTTTTGAAAGACCGGAATCAACAATTTTGAGTGGCCATGTGGAAGGAGATGATCTTGACATGTTGCAACCACAACTGTCTGTTGAAATTAGATCAGCTGCAGACCCTTCTAGAATAGAATCTGTACTCCCTGTTCCTCTCTCGTACTACTTTGAAGTACAGAATTTGCCAAAAGGAAAGCATCTTGTTCAGCTTCGTTCTGGTCTTCCATCACATACCCATAGATTTGAGTCAGAGATAGTTGAAGTTGACTTGGACAAGCAACCTCAGATTCATGTTGGTCCTCTTAAATATAAAACCGAAGAGCGACATCACAAACAGGAATTAACTCCAGCCCCTGTATTTCCTCTTATTGTCGGAGTTTCTGTGATTGCATTGGTCATCAGCATGCCAAGGTTAAAAGACTTGTACCAAAGTGCTGTGGGAATGACTACCCTAGGTTCTGCGGCTGCGCCGATAAAAAAGGAGCCAAGAAAGACAATCATGAGAAAGAGGGCGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPRLLLALLCLAAFSAAAYASDEIHGCGGFVEASSGLAKSRKASDSKLDYSDITVELCTIDGLVKESTQCAPNGYYFIPVYDKGSFMVRVKGPKGWSWKPETVPVVIDQNGCNGNADINFQFTGFMISGKVVGAVGGKSCSKHGGPSGVKVELSTNSDELVASALTSSTGEYSFANIIPGRYKLRASHPNYEIETRGSSEVDLRFGNAVADDVFFLSGYNIYGSVVAQGNPILGVHLYLYSNDVTEVPCPQSISDAPREGALCHAVSGADGKFTFSSLPCGSYELLPYYKGENTVFDVSPPSLLVSVEHSHMTIPQKFQVTGFSVGGRVVDGYGAGVEGANVIVDGQLRAVTDNLGYYRLDQVTSKKYTIVAEKDHYKFNRLENFMILPNMASIDDITSVRYDVCGIVRTVTPNSKAMVTLTHGPENVKPQRKLVSENGRFCFEVLAGEYRLSALPVDTEGSSSLMFSPGFIDVNVNSPLLDIEFSQSQVNLHGKVLCKEQCNQNILLSLVRLAGGIEQEKKTVTLEQDNVNFAFKKIFPGKYRLEVKHSSSEAAAQDDWCWDQNAMDINVGSDDVTDIVFVQKGYWVELVSTHETKAYIQHPDSSKLDLLIKKGSQRICIETPGQHELHLINSCISFGSSPVVFDTKNPMPVHISAKKYLVRGELHVEMGSLQEIDLSKNIGVDVFKSDGSFIEKISATPVLGKSYQNDISAFEYSIWAEFGEDFIFVPRDDSTGRKNILFYPSSQQFSVAVNGCQDTVPSITAKTGLYLEGSVSPAISDVDIKILAAGKSKYASLKERDIAMETKTNSEGSFFAGPLYDDIGYTVEASKAGYHLKQTGPYTFSCQKLGQILVRIYGEQDAELLPSVLLSLSGEEGYRNNSISGSGGTFSFGNLFPGSFYLRPLLKEYKFTPSAVAIDLNSGESREVEFRATRVAYSAMGSVTLLTGQPKEGVFVEARSESRGYYEEATTDSFGRFRLRGLVPGSIYSVRVVAKDDHRFAAVERASPEYVSIDVGQDDISGIDFVVFERPESTILSGHVEGDDLDMLQPQLSVEIRSAADPSRIESVLPVPLSYYFEVQNLPKGKHLVQLRSGLPSHTHRFESEIVEVDLDKQPQIHVGPLKYKTEERHHKQELTPAPVFPLIVGVSVIALVISMPRLKDLYQSAVGMTTLGSAAAPIKKEPRKTIMRKRA</aaseq> |
| Gene Sequence |
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