Difference between revisions of "BGIOSGA003224"
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Revision as of 18:22, 20 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003224 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003224, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_01322 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003224-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003224-PA |
| Length |
10632 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:10145994..10156625 |
| Sequence Coding Region |
10145994..10146017,10146481..10146552,10146922..10147002,10147100..10147156,10147838..10147894 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:10145994..10156625 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:10145994..10156625 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCGGCGATGCTTCGTGCCAACACACATATTGTGGATTCCATACTTCCATGGTCACATACTGTGGATTCCATACTTCGATGGTGGTTCATGGAGCGTCTTAGAAGCATTGGATGGAGTTCGCACAAGGCCTGGTATGTACATTGGAAGCACAGGATCACGAGGGTTGCATCATCTGGTTTATGAAATATTGGATAATGCCGTGGATGAAGCTCAAGCAGGCTACGCCACTAAGATCCCTACAGATATACACCCTCAGACGAAGAAATCTTGCGTGGAAACCGTCTTAACGTTAATGCACGCTGGTGGCAAATTTGGAGGTTCAAAGAGTGGCTACACTGTTTCTGGAGGGCTGCATGGTGTTGGCCTATCAGTTGTTAATGCTTTGTCAGAGGCACTAGAAGTTACTGTTTGGCGTGATGGAAAAGAATACCGACTAAATTACTCACGTGGAAAAGCTATCACGATGCTAACTAGTAGGACATTGTCTGATGAATCAAGTTCTCGTCAAGGCACACGGATCAGATTTTGGCCTGATAAACATATTTTTACCACCACAATGGACTTTGACTTCAATACGATAGCTGGTCGCATCCGGGAACTTGCCTTTCTAAATCCTGAGCTGACAATAGCATTGACAAAGGAAGAAGATGACTTACAGGTTCAACACAATGAATACTGTTATGCTGGTGGTCTGGTTGAGTATGTTAAATGGTTGAATACTGACAAGAAATCCCTTCATGATCCAATCGCATTCAGAAAAGAAATGGATGGAATAACAGTGGATGTTTCCCTTCAATGGTGCTCTGATTCATACTCTGATACGGTGCTAGGATATGCTAACAGTATCCGTACTATTGATGGTGGTACTCATATTGATGGGCTGAAGACTTCATTGACAAGAACAATCAATAACTTCGCAAAGAAGTCGAAGACTCTTAAGGATAAAGATATTAGCTTGAGTGGGGAGCATGTAAGAGAGGGAATGACCTGCATTATTGCAGTGAAGGTCCCTAATCCAGAGTTTGAAGGGCAAACAAAGACGAGGTTGGGAAATCCAGAAGTCCGAAGAATAGTTGAACAATCTGTTCAAGAAAATTTAACTGAGTACTTAGAGTTACATCCAGATGTTTTAGATTCGATTCTGTCAAAGTCCCTTAATGCTCTCAAGGCTGCATTGGCAGCTAAGAGAGCTAGAGAGTTAGTGAGGACAAAAAGTGTATTGAAATCTTCTTCACTTCCTGGGAAATTAGCTGACTGTGCATCTAGTGATCCTGAAGAATCTGAAATCTTCATAGTTGAAGGTGATTCAGCTGGGGGTAGTGCAAAACAAGGACGTGATAGGAAATTTCAGGCTATTTTGCCTCTAAGAGGCAAAATTCTTAACATTGAAAGGAGAGACGAGGCAGCCTTGTACAAAAACGAAGAGATCCAAAATCTAATTGTCGCTCTTGGATTAGGAGTAAAGGGCGAGGATTTTAACAAGGAAGCTCTTCGATATCATAAGATAGTCATACTCACTGATGCTGATGTAGATGGTGCACATATCCGGACTCTTCTCCTTACTTTCTTCTTTAGATATCAGAAAGCACTATTCGATGAAGGTTGCATTTATGTTGGTGTGCCTCCTCTTTACAAGGTTGAACGTGGGAAACAAGCGCACTACTGCTATGATGATGCTGACCTTAAGGAGCTAGTTAACACCTTCCCAACAAATGCTTCTTATCATATCCAAAGGTTTAAAGGTCTTGGTGAGATGATGCCGGCACAATTATGGGAGACAACAATGGACCCTGAGAGGAGGATGTTGAAGCAGCTAAAGGTTGAAGATGCTGCTGAGGCCAACGTTGTGTTCTCATCTCTTATGGGTACCCGGGTTGATGTCAGGAAGCAACTGATCCAGAATGCTGCAAGCATGGTCAACCTAGAACACCTTGATATTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRRCFVPTHILWIPYFHGHILWIPYFDGGSWSVLEALDGVRTRPGMYIGSTGSRGLHHLVYEILDNAVDEAQAGYATKIPTDIHPQTKKSCVETVLTLMHAGGKFGGSKSGYTVSGGLHGVGLSVVNALSEALEVTVWRDGKEYRLNYSRGKAITMLTSRTLSDESSSRQGTRIRFWPDKHIFTTTMDFDFNTIAGRIRELAFLNPELTIALTKEEDDLQVQHNEYCYAGGLVEYVKWLNTDKKSLHDPIAFRKEMDGITVDVSLQWCSDSYSDTVLGYANSIRTIDGGTHIDGLKTSLTRTINNFAKKSKTLKDKDISLSGEHVREGMTCIIAVKVPNPEFEGQTKTRLGNPEVRRIVEQSVQENLTEYLELHPDVLDSILSKSLNALKAALAAKRARELVRTKSVLKSSSLPGKLADCASSDPEESEIFIVEGDSAGGSAKQGRDRKFQAILPLRGKILNIERRDEAALYKNEEIQNLIVALGLGVKGEDFNKEALRYHKIVILTDADVDGAHIRTLLLTFFFRYQKALFDEGCIYVGVPPLYKVERGKQAHYCYDDADLKELVNTFPTNASYHIQRFKGLGEMMPAQLWETTMDPERRMLKQLKVEDAAEANVVFSSLMGTRVDVRKQLIQNAASMVNLEHLDI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..24#488..559#929..1009#1107..1163#1845..1901#2284..2385#2692..2842#2926..3002#3796..3903#4759..4829#5621..5762#5978..6076#6187..6315#6520..6634#6861..6928#8485..8598#8662..8778#9154..9207#9296..9401#10347..10477#10564..10632#ATGCGGCGATGCTTCGTGCCAACAGTGAGCTGCCTTGAGCCCTTGATCGATAGGTTTCTAGAACTAGACATTTAGGGTTAATTGTGTTTTTAATCTATTTTAAAGTATAACAACCATTTAAACATGATGTTTTAAGTCTGCTCATTTAGCTTTTTTAATAAAAAATTAGATCTGACCTATTTCATGAAACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATACAGAAATCGTAAGCTCTTCCCCCTTAAATCGTCATGCTCATTTTTTTAAGGGGAAGATTTCCTCATCTTACGATTTCTGTTAACATGACGATTAGCTGGTTTTTTTTTCTCATGGAGTATTCTTATTTTGTTGATATTTAACTCTTATGATACTAGATTATCTGACTTTGTGAGCTGTTTACCCAAATAACATGCAATATATACAATTTTATATGCCATGCAAATGTTCTATCTTCTTTAGCACATATTGTGGATTCCATACTTCCATGGTCACATACTGTGGATTCCATACTTCGATGGTGGTTCATGGAGCGTAAGAGGGGATAAGATTGTTACTGTTTAAGTTTGTTACAACCTAAAGTTAGTATTTATGTCCTTGAAAATTTGTCTAGAAAATGCTCTTTACATCTAATTCATTTTCCAAAGGACTTTATTATACACTGTATCCAGACGTCAGAAGCCAACAATAAATTAGTCATTAGCTCAACAGCGTAGTCATTGGACTTATGAACTCAGCTTAGTATTAAAATTCAATTATCTTTTTTGAAAGCAAATAAATATAACATTGTATACCTTCACAGCTTTGTTCAAGATTTCTCCTATCTGACACCATCATCTTTTCAAACACAAGCTGTACTTTTTAGCTTTATTTTGGTTGCATGCTGAACTGCTAATTTTGTAGGTCTTAGAAGCATTGGATGGAGTTCGCACAAGGCCTGGTATGTACATTGGAAGCACAGGATCACGAGGGTTGCATCATCTGGTATATTGAATGCAGATTAGGCTACTGTTTTTTTTCTGTGGTACAAAGTATTCCATATTGTTCTTTTCTGATCATTCGTCTGAATGGTGTATCACAGGTTTATGAAATATTGGATAATGCCGTGGATGAAGCTCAAGCAGGCTACGCCACTAAGGTTGATGTTATCCTTCATGGCGACATTCAGTTAGTGTAACAGACAATGGTCGTGGGGTATGTAGTTCCTAAAACCTTATCAAGATGTACTTCCTGTATGGCCAATGCATTTTTTGGGGAAATTTTGACGACCTTGTGTTAATGATGAACACTCATGTTTCAGCTACAGTATTTAGTTACTGTTGTATTGAGTAATCCCACATTAAGAAGAAGTGAACAAACATGGAGGAAGCTTTTCTACATTACTATATATCATAGTTACACGAAAGGTTAAATTTATGCTGCTAACACATTCTGATGTACCAAGTACTCCCTCCATTCACAAATATAAGGGATTTTGGCTATATATCTGGACAAATACTTGTCCAGATACGTAAACAAAGATACAGAATCCCTTATATTTGTGGATGGAGGGATGACTTGGTGGGAAGCAGAACATGTTTCTTGATACTATGCAGTTCGAGTCCATTTTGCATAGTTTGTTGATTGAATAACTATGCTAGACTATTAATGTCATCGTTTGTTTGAAATTTTGTAGTTTTACATTTGCTTCCTGGAAGTTTTTATAATTTGCTTATCACACTTTTTGACTATTTACTTGCAGCATCTTTCACTTGTAACTCTTTGTGGATCATCTGTCAATTGTTTATTTAATTACTGTTTAAACCTACGCATACTGCAGATCCCTACAGATATACACCCTCAGACGAAGAAATCTTGCGTGGAAACCGTCTTAACGGTACTGTTAATTTCTTTTTTGTTATACTCCTTTTAGATTCAATCAACTGTATTATTTTTTTCTATTTTTCAACCGTCTTTTTCCCAAATAAGTAAACCCATGGGGCATTTCATTTTCTAGGGAGGGAGCATGAAATATGACATGCTATCTCATGGTTATATTTAGGTGTCAGAGTCCACACCTTAATCCTAAGGCCTGTTTGTGTGCTGTTGCTATGTGCATATCCAGACTTCAATACATGTGTTGTGATGTTCATTTTCTGTGCAGACCTGTTAATTCATTACCTTCTAAAAAACAAATATGTGCGACATTGTTTATCCATTTGGCATACCCAGTGTTCAACATGTTGGATGCCAATCAATCTAATTTTTTAACCATGCAGTTAATGCACGCTGGTGGCAAATTTGGAGGTTCAAAGAGTGGCTACACTGTTTCTGGAGGGCTGCATGGTGTTGGCCTATCAGTTGTTAATGCTTTGTCAGAGGTTCTTGCTTTCACCTTTATTTACTTATTATTCTAAGATTTCTTAAGAAAATGAAAGCATCTCTTGATAAAAGTTCAACAATCATGATTCAGACAGAAAAACTCTTTCTAGTCTCTACACGAAGTCATTTTTGTCAGGTTTTGGTTTAAAATACAAATCTGGTCATGTGGCTTTATCTTTACGTATACTGGCTACTCTGCACTAAGTTTAAGAACCTTCCAACCTTCCAGTCTCAAGACAAAAACAATACATATTACTCATGAGCTTACATTGATAATTTGTTTTGTTGTGATATTATAATGACAGGCACTAGAAGTTACTGTTTGGCGTGATGGAAAAGAATACCGACTAAATTACTCACGTGGAAAAGCTATCACGATGCTAACTAGTAGGACATTGTCTGATGAATCAAGTTCTCGTCAAGGCACACGGATCAGATTTTGGCCTGATAAACATAGTATGCTTCTGTCTTTACATATTTTTTTAGCTGTACCATTACTACTTATGTTCCCCAATGTGTAATTATTGTTCTTGATGTAGTTTTTACCACCACAATGGACTTTGACTTCAATACGATAGCTGGTCGCATCCGGGAACTTGCCTTTCTAAATCCTGAGGTATAAATTGTATTGTTTTATATTTCCTGTTGCTAGTTCTCGAAGATATCATTGAACAATCATTATTTCCTTTATTTGTTTATCGGTCAGCTAATGCTTGAATCATGATTGCTCTGTTGGATTATTTGATATTCTAAGAAGTTACTTTTAACCATTGCTCTACCCATGGCTTAAAACCAGGCCACACACTTGGGAGCTAGGATTCCTAGTGACACACCATGGGAATATGTTTAATCCTGTTTTTTTTCAATCAGTAGAAAAAACATACAAGTTATTATCTTTTCATCATTGAAGGATGCAATTCATTTTGTATACTTATTCACAATCAAGACAAATCATGTTATATATAGTTTGTTCTTCTCTCCATGTACTCTAATTTAATGCCAACGCTTATTTATCTGATATATGTAATATGGGAGTCCACAACAGCTATGATTGTTTATATTTGTGGAGAGCACCCATAGATATTGATGATAAAAGTAACAAAACCAAGTTTAGGAATCAATGTACTTGAAAAAAATGCTATGATGGAAACCTGAATTGTCACATTCATTTATTGGTGCTGTTACGGTCACCTTTAACTTAGGTCAAGTTTTACTTGGAACTTTTTCCTCCGTGAAATCCCTATATGTTCATTCAAAATTCTGGAAAGTTGCCACTTTGGCAGTTTTGTTTGAACATCCTTATGCCTCTTTTTTAATGTTAATTTGTATGCACAACTTACCTCACCAGTAATATTTGATATTCTTAAAGTAGGCCAATGTCTAATTTCATATTATTCTCTCAATGCCAGCTGACAATAGCATTGACAAAGGAAGAAGATGACTTACAGGTTCAACACAATGAATACTGTTATGCTGGTGGTCTGGTTGAGTATGTTAAATGGTTGAATACTGACAAGGTTTGACCTGTACCATTGGAAACATGTTCATGCAGCTCCATTTCGGCACTTTTTCAACATAGAAAATGGTTCATATCTGCTACTTGAATGGCTCCTAACATAGTAGTACCTGTTGTTACGAATTGACTTATTTGATCCTTTCAAATGACTCATTAAAAATATCAGGGCTAGCTTTACTTCTTTCTATCTTTGTTTCGACAACCAACTAAAAAGAGAAATACACATTGTAGTTAACATTTACTGATGGTAATCCTTGGATCCGAGCTAAAATTTTACATAAACCAATCAACGCTAAGGATGCAAGTGGATTGACCCACGGGTAGTCGGGTACCCGTCCATGCTATTCTATTTGGTTTATAATTTTATATGCAATATAAAAAACACTTTTAGTTGAATGGTGTGACCATGTGGGTTAATGGGCACACAAGTGAGCAAACTTGCATACCTAACCAACTCCTGTCATACTGATGCTAATACGGTAATGAAATGAAGAAATATATGCTATGTTTGCTTTATTCTTTGGACAAAATTCACAGAGTTGAATTAGACAGTATGCTTATAGGCTGAATCTACACTTGCCTTATGTTTACGATATTTTAAAATGTTGAAGGATCTATATTTATTTTGGTTATATTTTCCTGTCATGTGAATTTCTTTATTATTCCTTTGAAGAAACTTACATTAATCTACCTTAAATTTTAGAGTAATAATGTAACGTATACTATTATTAATATGCCACCAGATATGACTATATGAGTGATGAGTCCTACTTCTGCACATAGCAATACATGATGCATTTATAATGTTATCCAGCAGCAACCCTAATACTTTGCTTGGTCATGTTTTCTTTCCTAGA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