Difference between revisions of "BGIOSGA004748"
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Revision as of 18:31, 20 July 2012
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Expression
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA004748 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004748, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_04326 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004748-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004748-PA |
| Length |
10287 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:39169775..39180061 |
| Sequence Coding Region |
39169775..39169915,39171091..39171135,39172224..39172346,39172457..39172564,39172900..39173013 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:39169775..39180061 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:39169775..39180061 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGGTGTTCGACCGGCTGCCGCCGATGGACCACCTGCGGTCCGAGAAGATGTGCTTCGTGCAGCTCATCATCCCCGCCGAGAGCGCGCGCCTCGCCGTCACCTACCTCGGCGAGCTCGGGCTCCTCCAGTTCAAGGACTTGAATGAGGATAAGAGTCCTTTTCAGCGTATATTTGTCAATCAGGTAAAGCGATGCTCTGAAATGTCACGCAAACTAAGATTTTTCAATGATCAGATCAACAAGGCAGGTGTAAAGTCCTCTGTTCGACCTGCAATGCAACCAGATATAGATTTGGAGGAGCTAGAGGCAAAATTGCGTGAGCATGAGAATGATCTGCTTGAGATGAATACAAATAGTGAGAAACTACTACAAACATACAATGAGCTTCTTGAATTCAAGATGGTCTTGTCAAAGGCAGGTGGTATTCTTGCTTCTTCTCACAATCATGCTGCTCCAGCTGAGCGGGAGCTAGATGAACACATATATGACAAGGAAATGGATGATGGAAATGCCTATTTACTTGAACAGGGTGTACATCTAGGGGCTTCGGAGAATTCTGGAGTGAAGTTTGTTAGTGGGATTATTTTAAAGTCCAAGGCAATGGCTTTTGAGAGGATGCTATTCCGAGCTACAAGGGGGAATATGTTTTTCAATCAGGCGCCTGCAGGGGAACCTGTTACTGATCCCATTTCTGGTGAAGAGGTAGAGAAAACTGTTTTCGTAGTTTTCTTTTCTGGGGATCAGGCTAAAGCAAAAATATTAAAGATTTGCGGTTCATTTGGAGCAAGTTGCTACCCTGTTCCCGAGGAGATGGTTAAGCAGAGACAGATTTTTCGCGAGGTATCTGGACGCCTTGCTGATCTGGAAGCCACTTTGGATGCTGGAATCCAGCACAGAAACAAAGCACTAGAGTCAGTAGGTTCACAATTATGGAGGTGGACAATCATGGTGAAAAAAGAGAAAGCTGTATATGATACATTGAACATGCTGAATTTTGATGTCACGAAGAAATGCCTTGTTGGGGAAGGATGGTGTCCTATATTTGCTAAATCACAGATCAAGGATGTTTTGCAGCGTGCAACGCTTCACAGTAATTCACAAGTTGGAATAATATTTCATGAGATGGACACTATTGATTCACCGCCTACATATTTCCAAACCGATAAGTTCACTAACGCTTTCCAGGAGATAGTTGACGCATATGGTATTGCTCGATATGAGGAAGCTAATCCAGCTGTCTATTCTGTCATCACATTCCCATTTCTTTTTGCTGTGATGTTTGGAGATTGGGGTCATGGTATATGTCTATTGTTAGGAGCATGTGTTCTTATACTTCGTGAGAAGAAACTTTCCTCTCAGAAGCTTGGTAGCTTTATGGAGATGGCATTTGGTGGGCGTTATGTTATCCTTCTGATGGCATTGTTCTCAATATACTGTGGGCTTATATACAATGAGTTTTTCTCAGTTCCATTTCATATATTCGGGAAATCAGCGTATGAATGTCGAGAGAAAACCTGCAGTGATGCACATACTGCTGGGCTCATTAAAGTCCGTGATCCCTATCCTTTTGGAGTGGACCCAAGTTGGCGTGGAAGTCGATCTGAGCTACCCTTTCTAAACTCCTTGAAGATGAAGATGTCTATACTAATGGGTGTAACCCAGATGAACTTGGGGATTGTATTGAGTTATTTTGATGCAAAGTTTCATGGAAATGCTCTTGACATAAGCCTCTTTGGCTACTTAGCACTCCTAATTCTCATCAAGTGGTGCACGGGCTCTCAAGCTGACCTATATCATGTGATGATATATATGTTCCTTGATCCTTCTGGCAATCTTGGAGAAAATCAACTATTTTGGGGCCAGAAGGAACTTCAGATACTTTTGTTGCTTATGGCTATTGTAGCTGTTCCGTGGATGCTCTTCCCAAAGCCTTTTATCTTGAAGAAACTTCACAAGGAGAGGTTTCAAGGTCACACCTATCGCTTTCTTGGGACCTCAGAAATGGATCCAGATTCTGAACCAGACTCAGCTCGGTCACGTCATGATGACTTCAACTTTAGTGAAGTTTTTGTGCATCAAATGATACATTCCATTGAATTTGTACTTGGCGCTGTCTCCAATACTGCATCGTATCTTCGGCTTTGGGCATTAAGTTTGGCGCATTCTGAGCTATCAACAGTCTTCTATGAGAAACTGCTGGTACTTGCTTGGGGGTATGACAATCTTGTTGTGAAGTTAGTGGGGCTTGTAATTTTTTCTTTTGCTACTGCCTTTATATTGCTGGGGATGGAATCATTGAGCGCCTTCCTTCATGCACTTCGTCTACACTGGGTTGAGTTTATGAACAAGTTCTACCATGGGGATGGCTATAAATTCAGACCCTTTTCATTCGCTCTGCTAGCTGATGACGAAGACTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGVFDRLPPMDHLRSEKMCFVQLIIPAESARLAVTYLGELGLLQFKDLNEDKSPFQRIFVNQVKRCSEMSRKLRFFNDQINKAGVKSSVRPAMQPDIDLEELEAKLREHENDLLEMNTNSEKLLQTYNELLEFKMVLSKAGGILASSHNHAAPAERELDEHIYDKEMDDGNAYLLEQGVHLGASENSGVKFVSGIILKSKAMAFERMLFRATRGNMFFNQAPAGEPVTDPISGEEVEKTVFVVFFSGDQAKAKILKICGSFGASCYPVPEEMVKQRQIFREVSGRLADLEATLDAGIQHRNKALESVGSQLWRWTIMVKKEKAVYDTLNMLNFDVTKKCLVGEGWCPIFAKSQIKDVLQRATLHSNSQVGIIFHEMDTIDSPPTYFQTDKFTNAFQEIVDAYGIARYEEANPAVYSVITFPFLFAVMFGDWGHGICLLLGACVLILREKKLSSQKLGSFMEMAFGGRYVILLMALFSIYCGLIYNEFFSVPFHIFGKSAYECREKTCSDAHTAGLIKVRDPYPFGVDPSWRGSRSELPFLNSLKMKMSILMGVTQMNLGIVLSYFDAKFHGNALDISLFGYLALLILIKWCTGSQADLYHVMIYMFLDPSGNLGENQLFWGQKELQILLLLMAIVAVPWMLFPKPFILKKLHKERFQGHTYRFLGTSEMDPDSEPDSARSRHDDFNFSEVFVHQMIHSIEFVLGAVSNTASYLRLWALSLAHSELSTVFYEKLLVLAWGYDNLVVKLVGLVIFSFATAFILLGMESLSAFLHALRLHWVEFMNKFYHGDGYKFRPFSFALLADDED</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..141#1317..1361#2450..2572#2683..2790#3126..3239#3319..3492#3718..3855#4044..4151#4268..4375#4474..4622#5134..5287#6366..6526#7619..7825#7956..8103#8186..8269#9550..9743#9832..9891#10083..10287#ATGGGGGTGTTCGACCGGCTGCCGCCGATGGACCACCTGCGGTCCGAGAAGATGTGCTTCGTGCAGCTCATCATCCCCGCCGAGAGCGCGCGCCTCGCCGTCACCTACCTCGGCGAGCTCGGGCTCCTCCAGTTCAAGGACGTGAGTCTCTCTCTCTCTATCTCTCGCTCTCGGCGCCAGTCGCTGCCCGCATCAGAGGCCCCTCTCTCCCTCCCGGATCTGTGTGATCTAGCCTCGTGAATCGTGATCTCTACCGCGCTCGCTTATGCGCGTCGTGCTATCCGCTCATGTTGGATCTGGTTTTTGGCGGTGCTCAGATCGGAGGACTAGTTTTTTTTGCCTGGTGTCACTGGATCGCGACGGCTCGCGTGTTTCTGTCGTCTGAGCTGGTTTGGGCTGCTACGTTGATTGGATAGTGGGTGGCGGGGTTGTTTTAGATCAGAGGGAATGAATGCGGTGTTCATATAAATGCATTAGGTTAGGGAGCGAATCAAACAATGTGCTATTGCGCGAGATTATCTTATGATAAGAGCAAGGACAATAGTGCGCTATAAGCTAACTATAAGCTTATGTGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGAGAAGTGTTGGCTCTCATGCAAGAGCTAGCAACACAAAAAATAGAGTCTATACATGTTAGTTTAGTATGAGCTAATAGCCAATAGTTAGCTATACTATTAAACTTGCTCTAAGCATGAGTTGGAGCGGTGATGGTTTAAATACATTTATGTGCTTAGCTGATCCTAGCAGGTCTCATTGTTTTGCGGTCTATGCATGAATCTTTGCCTTGTAATTTGTACCATTTTATGCCAAACATATTATTTGCTATGGGGTATCATTCGTGGACAGTTACATGCCTTGCTATTCAGCAAGATTTATTTGATGAATCAGTTAATGGAATAGACACCGTATTTTTGTGAGTTGGGTCTTAAAGTACACCAGTACCTGTATGTTTAGAAAAAGCTTATGAACTCTTAGTTTGATTGCAAAAACGGGGTTGCGTACTCTGTTCACTTTATCCCATAGATGCCGCTGAAATCTTGGGACAATATGAAAGAAAATCATGAGAGGGAGACTAAATGTTGACTGTCATCGTTATAGTTGTGTACTACAGAACTTTGTGAGCATGGCATCATCCTAGCAGAGAACTTAGAGAATGCTTACATAGTTATGTTTGAACTTGTTCTTTTTTATTGGTTGTGCTCCCTGCTATAATGGTTTAATTGAGATTTGCAAAAAAAAGGCCCAATTGCTTATCTCTCTCTTTTTAACTTTATTCCTCTTTATATGCAGTTGAATGAGGATAAGAGTCCTTTTCAGCGTATATTTGTCAATCAGGTATTCCAACCTTTTATCTTCGATCTATCTTTTTTTGTGAATCACATCATTTTGCATGAACCTTGTTTTATTCCACTATGCTGATTTCTACCTGGATACTATTGTTCTGTGGCGCCCATTATTTTTTACTTCACTTGGCCTGCTCGTACCCAAGATATTTGTTTGAATATCATGTCCATGTGGTACTCATATACTCTCCTGAAAATTTAAGGTGGATTTTGTGTGTGCAGAAATATTACGATGATTATAAAATCAAGAGAACATAACTGAAAATGAGCATGCCATTTTTGTTTACCTAAAATGCCTAGGGAATTAATGAATTATAGAGAAAATGATTAGTGAGCATTCAAAGTATACATCGGGGAAAATAAGGTAAAGCATCAATAAATTTGCATGCAAGCTCTATATTTTAATAGAACTCAGAGAAAACAGTATGCCTTATATTTTGATGAGGGAGTACCACCATTGTTTACTTGGGACTAGTGAATGGACAAGTCAGGCGGTTACCTTGTTTAGCTTTAGGAAGCATGCAGCGGGGATTATCATGTTGAGAAATATTTTGGAGGAACTTACTTCTTATGTCAGACTATATTCATCGATACCTTGAATCGTGATCCAATCAAGTTACTACCTCTGTTTTTTTAATATATGACACTGTTAACTTTTTGACACACGTTTGACCATTCGTCTTATTCAAAATTTTTATGCAAATGTAATTTTTTTTAAGTCATGCTTATAGAACATTTGACGATAAATCAAGAGACAATAAAATCAATAATAAATATATATATATTTTAAATAAAATGAATGGTCAAATGTATCTTAAAAAGTAAACGGTGTCATATATTAAAAAAAAGGAGGGATTATTTCATAATATATATAACTGGTTCCTTGCTTTTATTTATTTATGTTCCACCAGAATATAATAGATTGATGCTGTAATTGTGATATTTTTTCTGTCAACTGTCACTTCTGTGCATGCGCAGATGCACATTGACACCTGTGTTTCCCGCCTGACGCAGAGAATTTTCTGCTGAATAACTTTTACGTAGTTTGATGTTGTTAAGTATGGTTCAATTCTCCTACAGGTAAAGCGATGCTCTGAAATGTCACGCAAACTAAGATTTTTCAATGATCAGATCAACAAGGCAGGTGTAAAGTCCTCTGTTCGACCTGCAATGCAACCAGATATAGATTTGGAGGAGCTAGAGGTGCATTACTCATGTCTTTATTACCGTTCAATTCTGTTATTTCTGAAGCTAATAGCTATTTTGAAGGAAAAAATGAATAATTTGTTAAGGACTTGCCTTTTTCCTTTCAGGCAAAATTGCGTGAGCATGAGAATGATCTGCTTGAGATGAATACAAATAGTGAGAAACTACTACAAACATACAATGAGCTTCTTGAATTCAAGATGGTCTTGTCAAAGGTTGTATCTCAATTCTTTGAAAACATAGAATTAATTCTTCCAGTTATTCTTTGACTGTTAAGATGGAACTAAAAAAATCAGCACCAGTACATGACACCTTTTGATGATAGGCATATGGAACTTTCTTTATAAAAAACATAGAATTTGACAAGAGCATGCTGCTTGTAACTGATGAGTAGTCACTTTATTTGGTTTAAATTGTGAACAGTAACCCTGCTCAGCAATCACAAGTTTTTATTGTAGCTGCTATCTGTGCCAGTCTAGTAATATCGATTGTGCTCAACTTCCTCCTTTGTTTGCTTCCTCCCATATTTTCCTCAAATAACTTCTTGCAGGCAGGTGGTATTCTTGCTTCTTCTCACAATCATGCTGCTCCAGCTGAGCGGGAGCTAGATGAACACATATATGACAAGGAAATGGATGATGGAAATGCCTATTTACTTGAACAGGTCTTATATTTAATTTTCGTACTTAAACACTTGACCTTATTTGATTGAAAACTGTAACACAAAAAAAAAATGCTCACAGGGTGTACATCTAGGGGCTTCGGAGAATTCTGGAGTGAAGTTTGTTAGTGGGATTATTTTAAAGTCCAAGGCAATGGCTTTTGAGAGGATGCTATTCCGAGCTACAAGGGGGAATATGTTTTTCAATCAGGCGCCTGCAGGGGAACCTGTTACTGATCCCATTTCTGGTGAAGAGGTCTGATTGTCATGGTTTGCTCTTGGTGATTCTCGTGTTAAATGAAATCTATTGTTTGTCTCCAATTATATGCTTATTGTTTTTTTGTCCTTGAAAGCTGGATTTATGAACAAAATTAATGCTTATTGCAGTACTGAAATCCAACCTTGCATGTGACAATTTCATCCAATACCTTGAAGCCTTAAAGTTTCTCAATAGTTTCAACATTCAATTTTACTTTGCCAGGTAGAGAAAACTGTTTTCGTAGTTTTCTTTTCTGGGGATCAGGCTAAAGCAAAAATATTAAAGATTTGCGGTTCATTTGGAGCAAGTTGCTACCCTGTTCCCGAGGAGATGGTTAAGCAGAGACAGATTTTTCGCGAGGTACTTTAATTTGCATATTTGGCACACAAATTCACTGCTTGATTTGACCGTGCTTGTTAGAATTTTATTGGAAGAAGCTTGAGTGTTATACTTATCTGACTTATTGTTCTCGTTATTTTGTGTCATAATGTTAATATGTTATCTGCTGAGATATTATGTAGTAGTAACGGTTTATGAAAATGTGTCAGGTATCTGGACGCCTTGCTGATCTGGAAGCCACTTTGGATGCTGGAATCCAGCACAGAAACAAAGCACTAGAGTCAGTAGGTTCACAATTATGGAGGTGGACAATCATGGTAATGAAGTAATATAAAATTTTCATTTTCTATTTGTGCGTTGTAATCCCTAAAATCTCTTATTTATGTCTGTTCTGATACATGGATTTCTGAACCATAACCCCCTTTTGTGTTAGGTGAAAAAAGAGAAAGCTGTATATGATACATTGAACATGCTGAATTTTGATGTCACGAAGAAATGCCTTGTTGGGGAAGGATGGTGTCCTATATTTGCTAAATCACAGGTCAGAAATATTACATTCATTTGAAGGTCTATTCATTGTGCTCATTCTGTTTAGGATACTTTTAAGGATATATATCTTATCTCTACTTTGTACTTCAGATCAAGGATGTTTTGCAGCGTGCAACGCTTCACAGTAATTCACAAGTTGGAATAATATTTCATGAGATGGACACTATTGATTCACCGCCTACATATTTCCAAACCGATAAGTTCACTAACGCTTTCCAGGAGATAGTTGACGCATATGGGTATGCACTTTGTTGCAAGTGTCAACTTGAATAAATGAAATTCATATGCTTTCTGTTTTTATGATTCATGAACTGAGTATTCGTGGGTATATGTTTTTCAAATGTTAAATTTCTTGAGCAAAGCAGTTGTTAAATCATGTGTACTACTAGCTACTTGATCCAGGTTTC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