Difference between revisions of "BGIOSGA005243"
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Revision as of 18:34, 20 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA005243 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA005243, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_05340 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA005243-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA005243-PA |
| Length |
9993 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:46653873..46663865 |
| Sequence Coding Region |
46653873..46653934,46654026..46654308,46654695..46654919,46655905..46656102,46656381..46656835 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:46653873..46663865 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:46653873..46663865 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCATCTCTTCAGTTATTGCAACTGACAGAGCACGGACGCAACCTTTTGTCTTCGAGAAGGAGAACTCTTGCAGTTGTTTCTGGTGCGTTACTTGCGGGTGGAACTTTAGCATATGCTCACTCAGCTCGGCGCCAAAAACGTCAGGAAGAATATTCTCATAGTGATGCAAGTACACAGACCACGGGTAATCAGAGCATTTGTCAAAATGGTGTTGATGGTAAATTGGTAAAAACAAGGAAAAAGAAAAATGGGTTGAAATCCTTACAATTTCTGGCTGCTATTTTGCTTAAAAAGATTGGTCCAAATGGAATAAATCATCTTCTCGGCTTGATGATAACAGCTGTGTTACGTACTGCCGTTGGCCACAGATTAGCAAAAGTTCAGGGCTATCTATTCAGGGTTGCATTTCTTCGGCGTGTTCCAACCTTTACACGCCTGATTATCGAAAATCTTCTTTTATGCTTCCTTCAGTCCACAATATATCAGACCTCCAAGTACTTGACAGGGTCCTTAGGTTTGCACTTTAAGAAGATTTTGACAGATCTTGTCCATGCTGATTACTTTGAGAACATGGTTTACTACAAACTCTCGCATGTAGATCACCGGATCTCAAATCCAGAACAAAGGATTGCTAGTGATATTCCTAAGTTCTGCTCGGAACTAAGTGGACTCGTACAGGATGATCTGACTGCAGTTGCAGATGGGTTAATATACATCTGGCGCCTCTGCTCTTATGCAAGTCCAAAATATGTTCTCTGGATTCTGGCATATGTACTTGGTGCTGGTGGTGCAATTAGAAAGTTTTCTCCTGCTTTTGGGAAATTAAAATCCATGGAGCAACAGCTAGAAGGGGAATATCGGCAGGTCCATTCACGTTTGAGAACCCATGCTGAGAGTGTGGCGTTTTATGGTGGTGAGAACAGAGAAGCATCGCACATCATGCAGAGGTTTCAGGCTCTTGTGAAGCATTTGAATGTTGTTCTTCATGAAAACTGGTGGTTTGGCATGATTCAGGATTTTCTTCTTAAGTATCTTGGTGCCACCGTTGGAGTTATCTTGATTGTTGAACCTTTCTTTGCTGGAAACCTTAAACCTGAATCATCCACTTTAGGACGGGCAGAGATGTTGAGCAATCTTCGGTATCATACTAGCGTCATAATATCATTATTTCAGTCTCTTGGAACCCTTTCTATCAGTTCAAGACGCTTGAATCTTCTCAGTGGCTATGCAGATCGTATTCGCGAGTTACTGGATGTTTCACGTGAGCTATCTGGGGTTCGTGATCTATCTATGAATAAAAAATCTTCTGTAGACAATTATATCAGCGAAGCAAATTATATAGAATTTTCGGGTGTTAAGGTGGTGACACCCTCAGGGAACGTCTTGGTTGATGATTTAACTCTTCGGGTAGAGTCGGGTTCTAATCTTTTGATAACTGGTCCTAATGGTAGTGGAAAAAGCTCCCTTTTCCGGGTTCTTGGGGGACTGTGGCCACTTATGTCAGGCCACATTGTGAAACCTGGTGTTGGCTCTAATCTTAACAAAGAAATTTTTTATGTTCCCCAGCGACCATATACAGCCGTTGGAACACTTCGGGACCAGCTTATCTATCCACTTACAGCAGACCAGGAAACTGAACCACTTAGCTATGGTGGCATGGTGGATCTTCTAAAGAATGTGGATCTGGAATATTTGCTAGAACGCTACCCTCTTGATAAGGAAGTTAACTGGGGTGATGAATTGTCTCTTGGAGAGCAACAAAGATTGGGAATGGCCCGGCTGTTCTACCATAGGCCAAAGTTTGCCATCCTGGATGAATGCACTAGTGCTGTGACAACTGATATGGAAGAGCGTTTCTGCAAAAGGGTTCAAGCAATGGGCACATCATGCATAACAATCTCTCATCGTCCAGCATTAGTTGCATTTCATGACATCGTTTTGTCTTTGGATGGAGAAGGAGGGTGGACAGTTCAGGAAAATAGAAATGGCTCCTTTATCTCTGCTGAACCAGAGTTTGATGCATTGAACTCATCAGAAACTGATCGTAAATCTGATGCACTTGCTGTTCAAAGGGCTTTTATTGCCAACACAAAGGGTAATGCTTTAATGGGCCCCAAGGATCATTCTTATTCTACACAGCTCATAGCCACTTCTCCCAATATGGAAATAGAACACACAGAACGGTCAAATCTAGTTCCACAATTACAGTGCTCACCAAGACCTTTGCCACTCCGAGCTGCTGCAATGTCAAAAATACTGGTCCCTAAATTATTTGATAAGCAAGGAACGAGCGTTAAGTATGTCCTGGAGCAGGACAAAGCTGCCTTCCTTCGGTTAATTGGGATTAGTGTGCTGCAAAGTGCTGCAAATTCAATTGTGTCACCATCACTAAGAAACCTTACTTCAAAGATTGCCCTTGGCTGGCGAATTCGCATGACCAACCATCTACTTCAATATTATTTGAAACGAAATGCTTTTTACAAGGTATTTAACATGTCAGGCATCGATATTGATGCAGACCAAAGAATCACACATGATGTGGAGAAGTTGACCAATGATCTTGCTGGCCTAGTTACCGGAATGGTGAAACCACTTGTTGACATTCTTTGGTTTACATGGAGAATGAAGATTTTGTCAGGGCGAAGGGGAGTTGCTATTTTGTACGCATACATGTTGCTAGGTCTTGGTTTTCTAAGAGCTGTTTCCCCTGACTTTGGTGATCTTGCAAATCAAGAACAAGAACTTGAAGGAACATTCAGGTTCATGCACTCAAGATTGCGGACACATGCTGAGTCAATAGCTTTCTTTGGTGGTGGATCAAGGGAAAAAGCTATGGTTGAAGCTAAATTCACAACGATGCTTAACCACTCAAGGACTCTTCTGAGAAAAAGATGGCTATATGGTATTTTTGATGATTTCGTGACGAAGCAGCTACCTCACAATGTGACATGGGGGCTTAGTTTGTTATATGCTTTGGAACACAAGGGGGACCGAGCTTTGACTTCAACTCAAGGAGAGTTGGCACATGCACTTCGATTCTTGGCATCTGTGGTGTCACAAAGCTTTATAGCTTTTGGTGATATTCTTGAGTTACATAAAAAATTCCTTGAACTGTCCGGTGGTATTAATAGGGTGTTTGAACTCGAAGAGCTTCTACAGACATCTCAAAGCAATGCTGCCATGCCCTCTAATCCTATTATTGCGGCATCGGAAGAAATTATTTCCTTCCATGATGTGGATATCGTAACGCCATCTCAAAAGCTATTGGCTACCCAGTTATCTTGTGATGTATCTCAAGGAAAAAGCCTTCTTGTGACTGGCCCAAATGGCAGTGGCAAGAGCTCCATTTTTAGGGTGCTCCGAGGAACCTTGAGGGATCAGATCATATATCCCCTCTCTCATGAGGAGGCAGAGTTGAAGGTTCTTTCATTATACAAATCAGGTGACAAGGCAATAACTTCTGGGTCACTGGATGATCACCTGAAGACAATTCTAGAGAATGTTCGATTGGTCTATCTTCTAGAAAGAGAAGGGTGGGATGCTACTCCTAACTGGGAAGATATTCTATCCTTGGGAGAACAGCAGAGGCTAGGCATGGCTCGTTTGTTCTTCCACTGTCCAAAATTTGGTATCCTAGACGAGTGCACCAATGCCACAAGTGTCGATGTTGAGGAGCATTTGTACAAGATAGCAACTAGTATGGGCATAACTGTCATCACCTCGTCACAAAGGCCTGCTCTGATACCCTTCCATTCGTTGGAGCTGAAACTCATCGATGGTGAAGGAAAGTGGGAACTATGTACAATCAACCAATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPSLQLLQLTEHGRNLLSSRRRTLAVVSGALLAGGTLAYAHSARRQKRQEEYSHSDASTQTTGNQSICQNGVDGKLVKTRKKKNGLKSLQFLAAILLKKIGPNGINHLLGLMITAVLRTAVGHRLAKVQGYLFRVAFLRRVPTFTRLIIENLLLCFLQSTIYQTSKYLTGSLGLHFKKILTDLVHADYFENMVYYKLSHVDHRISNPEQRIASDIPKFCSELSGLVQDDLTAVADGLIYIWRLCSYASPKYVLWILAYVLGAGGAIRKFSPAFGKLKSMEQQLEGEYRQVHSRLRTHAESVAFYGGENREASHIMQRFQALVKHLNVVLHENWWFGMIQDFLLKYLGATVGVILIVEPFFAGNLKPESSTLGRAEMLSNLRYHTSVIISLFQSLGTLSISSRRLNLLSGYADRIRELLDVSRELSGVRDLSMNKKSSVDNYISEANYIEFSGVKVVTPSGNVLVDDLTLRVESGSNLLITGPNGSGKSSLFRVLGGLWPLMSGHIVKPGVGSNLNKEIFYVPQRPYTAVGTLRDQLIYPLTADQETEPLSYGGMVDLLKNVDLEYLLERYPLDKEVNWGDELSLGEQQRLGMARLFYHRPKFAILDECTSAVTTDMEERFCKRVQAMGTSCITISHRPALVAFHDIVLSLDGEGGWTVQENRNGSFISAEPEFDALNSSETDRKSDALAVQRAFIANTKGNALMGPKDHSYSTQLIATSPNMEIEHTERSNLVPQLQCSPRPLPLRAAAMSKILVPKLFDKQGTSVKYVLEQDKAAFLRLIGISVLQSAANSIVSPSLRNLTSKIALGWRIRMTNHLLQYYLKRNAFYKVFNMSGIDIDADQRITHDVEKLTNDLAGLVTGMVKPLVDILWFTWRMKILSGRRGVAILYAYMLLGLGFLRAVSPDFGDLANQEQELEGTFRFMHSRLRTHAESIAFFGGGSREKAMVEAKFTTMLNHSRTLLRKRWLYGIFDDFVTKQLPHNVTWGLSLLYALEHKGDRALTSTQGELAHALRFLASVVSQSFIAFGDILELHKKFLELSGGINRVFELEELLQTSQSNAAMPSNPIIAASEEIISFHDVDIVTPSQKLLATQLSCDVSQGKSLLVTGPNGSGKSSIFRVLRGTLRDQIIYPLSHEEAELKVLSLYKSGDKAITSGSLDDHLKTILENVRLVYLLEREGWDATPNWEDILSLGEQQRLGMARLFFHCPKFGILDECTNATSVDVEEHLYKIATSMGITVITSSQRPALIPFHSLELKLIDGEGKWELCTINQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
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