Difference between revisions of "BGIOSGA014529"
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Latest revision as of 15:56, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA014529 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014529, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_17024 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014529-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014529-PA |
| Length |
13803 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:27422431..27436233 |
| Sequence Coding Region |
27436080..27436233,27435904..27435968,27434801..27435071,27434545..27434608,27434281..27434433 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:27422431..27436233 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:27422431..27436233 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACTCGGCGGCGCTACTAGAGGTGTACCGCCGCGATCGCCGCGCCCTCCTCGGATTCATCCTCTCTTCCGCCGGCGGCCGCGCCGTCGACCTCTCCCGCGTGGACCTCGACGCCGTCAGCGCCGACTACGCCCTCGGCTGCGTCGCCTCCGGCGTGCAGTTTGATGCCTCAGAGGCCACCAGGAGGTATTTTGACGAGAGGAGATACCCGATCATGATGGGCTCTCCATCAGTGAATTCATATTTTCTTCTTTCAAGGCCAGAACGCTCTGGTTCCCCTCCAAACAAAGCAGCACCTGACATTGTCCCTCAAGCACCTGCTGAAGAGAACCCAACTCCAATTAGAGAACATGTTGATTTTTTTAGAGCAGCTATTAACATTTTGGGAACAGATAATGGTACTAAGGATGTTAGTCTGGCAGATATATATCCCAAGCAAGTAAATAAAATGGATATTCTTTCACTAGGTCTACCTAAATTAAGCACAGAATTGTCAGATGACGATATAAGAGAAACAGCTTATGAGGTCCTTCTTGCCTCACTATTTGTCAGCGGAAAAATACTGTTCTCCGAAGAGAAGAAAGAAAAGAAGCCTAAATTCTTAAAAGGTCTAAGGTCTAAAACAGAAGTATCAAATCCATCTCCTCAGCCAGAAAATCATTATTCCCAACTTCTTGATTTGATCCGTGTACAAATGGAGGCAAGGCAAATGTTCTCGAAGAATTACTTCTCTTCCCAGGATCGCGATTGGGTAGTTAGTGTCCCTGATGGGCCTGTTGAGGTATTGACTATCATTGAAAGATACAACGCAAAATTATGTGAAGCCCCAAAGAAATTCAACCTTAAAGGCGAGACCTATCATTGGATCCAGAGCTATCATCTCAACTTTAGACTATATGAGAAATTACTTTGCATCGTGTTCGATATTCTCGAAGATGGGCAGCTTGTGGAGGAGGCTGATGAAATACTGGAAACAGTAAAGCTGACCTGGACTATATTGGGTATCACCCAGAAATTGCATGACACACTCTTTGCTTGGGTGCTTTTCAAGAAGTTTGCTGAAACTGGGGAAATTCTTCTACTTAAGCACACATGCCTTCAAACACAGAAGCTTCGATTACATAATGATGCTAAAGAAATAGAGTTGTATACAAACAGCTTTGTTTGTTCAGCGGAAGCCTGTGGCGGAAACATGGCTCTAAGTTTGGTTGACAGTGCTATTCTTAAAATAAATAAGTGGTGTTTTAGACAATTGGAGAATTATCATTCATACTTTAATAAGGTTGACAACTCAATCTTTGAGGGCATGCTAAACTTGGTAGTTATTTCAGAAACAAGCCGCACTGATGATGATGATGATGATGATGAAAAAGCCATGCTCATTGGGACCCCACTAGATGCTACACAAGAATCTAAGTTGATTCACATTCTTGTTGTCAGATCCATTCAAGCTGCATATAAGCATGCCCTAATTTCATCAGATTGCCAATCAAAGGCAGAATTTAAGCATCCATTAATAATTCTTGCAAACGAATTAAAGCTAGTGGCGGAGAAAGAGTGTACTATTTTCAGTCCAACACTTTGTAAACGATACCCTGAAGCTGGAAGAGTAGCTCTGGTTCTCTTGCACCTACTGTATGGGCAACAGCTGGAGCTATTTTTGGAAAGGATGGATAATTCAGAAAGTTTGAAAGAGATACTGGCAGCAACAAATAATTTTGAGCTTTGTGTAGCTAAGAAGCTTTACTTAATGAATGAGGGAGCTGTTGGTTCTTTGCTGTCCAAATATTTAAAGCCATACATGATCAGTCAATTTTCTTCACCTCTCATTCTTCAATGGCTGCATGTTCAACATGAGAATGTCTTGGAGTGGACAAAACGTATCATTGAGATAGAGGATTGGGAGCCTCTATCAGCTCATGAAAGACATGCAACATCTGTGGTTGAAGTATTCCGGATAGTGGAGGAGACCATTGAACAGTTCTTTAACTCAAGTCTTCCTCTGGATACTGTCCACTTGCGAAGTCTACTTATTGGAATTACTAGTAGCCTTCAAGTCTACTTGCATCACATGGAAAATCAACAAGTTCCTAGAGCTACCTTGCTTCCCAGTGCTCCAGTCTTGACACGTTATGCAGAATCAGTGAACCCATTTGCAAAAAGGAAACTCATTGTGCCTACAGTTCCTGAAGAGAAGGTGGCTAATAAATTGAACAATTTGACGGTTCCTAAATTATGTGCGAAACTCAACACTCTTCAATTCATTAGGGATCAGCTCGATAACATAGAAGAAGGTATCAAACAATCTTGGGTCTCAGTTCAGTCAGCTGTGGGATTGCTAGACTATTTGTCTTGCATTGCTAGTGGACAAACTCTCCCAAAAAACTTATCTTCTGAAGAATCAATCGATGAGTTGTTTACAATATTTGATGATGTGCGAAGGACTGCAGTGAGTACAACTGACAGAATCCTGAACTTCATTGGAACAAGGGCTGTATTCTGGGATATGCGGGACTCGTTACTTTTCTCCTTGTACCGTGCTAGTGTTGAAAGTGCACGTATGGAGATGTTTATCCCTACTATTGATCAAGTTCTTGACCAGGTATGTGATCTGATTGTTGATGCCCTACGTGACCAAGTTGTGCTGAGAGTATTTCAAGCATGCATGGAAGGGCTTATTTGGATCCTACTGGATGGAGGCCCATCCCGAGCATTTTTGGAGACAGATGTGGACTTGATGCATCAAGATCTTGCTATGATCAAGGATCTCTTTATAGCTGAAGGCCAAGGTTTACCATTGGATTTAGTTGAAAAGGAGGCTAGACTAACTCATCAAATACTAGACCTATTTGTGTTAAAGAAAGAAAAGTTCTGCAGTAGCCAACTAAATGAAAATGATTTTCAGGCTGATACAATCATTGACATGTTAATAAATGTAAGTGATCAATTGCCTCACCATCTTGAACTTACAACTACTCGAAGAAGACATGTACATGATGCCCATACCCTTCTTCGAGTTCTGTGCCATAAGAAGGATAAAACTGCCTCTACGTTTTTGAAAATTCAATACCATCTTCCAAGGTCTTCAGATTATGACGATATTTCTACAAAGAACGCACCATCAAAAGCACCTATGTTTTCTGACATGCTGAAAAGTACTTCTTTCAATTGGTCAGAAACAGGACAGCAGAGTTTTAGGGTTATGAAGAAGAAACTGCAAGATACCTGGCAGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDSAALLEVYRRDRRALLGFILSSAGGRAVDLSRVDLDAVSADYALGCVASGVQFDASEATRRYFDERRYPIMMGSPSVNSYFLLSRPERSGSPPNKAAPDIVPQAPAEENPTPIREHVDFFRAAINILGTDNGTKDVSLADIYPKQVNKMDILSLGLPKLSTELSDDDIRETAYEVLLASLFVSGKILFSEEKKEKKPKFLKGLRSKTEVSNPSPQPENHYSQLLDLIRVQMEARQMFSKNYFSSQDRDWVVSVPDGPVEVLTIIERYNAKLCEAPKKFNLKGETYHWIQSYHLNFRLYEKLLCIVFDILEDGQLVEEADEILETVKLTWTILGITQKLHDTLFAWVLFKKFAETGEILLLKHTCLQTQKLRLHNDAKEIELYTNSFVCSAEACGGNMALSLVDSAILKINKWCFRQLENYHSYFNKVDNSIFEGMLNLVVISETSRTDDDDDDDEKAMLIGTPLDATQESKLIHILVVRSIQAAYKHALISSDCQSKAEFKHPLIILANELKLVAEKECTIFSPTLCKRYPEAGRVALVLLHLLYGQQLELFLERMDNSESLKEILAATNNFELCVAKKLYLMNEGAVGSLLSKYLKPYMISQFSSPLILQWLHVQHENVLEWTKRIIEIEDWEPLSAHERHATSVVEVFRIVEETIEQFFNSSLPLDTVHLRSLLIGITSSLQVYLHHMENQQVPRATLLPSAPVLTRYAESVNPFAKRKLIVPTVPEEKVANKLNNLTVPKLCAKLNTLQFIRDQLDNIEEGIKQSWVSVQSAVGLLDYLSCIASGQTLPKNLSSEESIDELFTIFDDVRRTAVSTTDRILNFIGTRAVFWDMRDSLLFSLYRASVESARMEMFIPTIDQVLDQVCDLIVDALRDQVVLRVFQACMEGLIWILLDGGPSRAFLETDVDLMHQDLAMIKDLFIAEGQGLPLDLVEKEARLTHQILDLFVLKKEKFCSSQLNENDFQADTIIDMLINVSDQLPHHLELTTTRRRHVHDAHTLLRVLCHKKDKTASTFLKIQYHLPRSSDYDDISTKNAPSKAPMFSDMLKSTSFNWSETGQQSFRVMKKKLQDTWQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
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