Difference between revisions of "BGIOSGA016140"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA016140

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016140, complete gene.

LocusTag

OSIGBA0137O04.8

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA016140-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA016140-PA

Length

14428

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:13161163..13175590

Sequence Coding Region

13161163..13161252,13163064..13163199,13163269..13163356,13164130..13164282,13164670..13164832
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,13175439..13175590

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:13161163..13175590 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:13161163..13175590 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGATCTGCAGAGCCTGGCCGTGGTGCTGCGCGCGGCGCTCAGCCACGTCCCCGAGGAGCGCAAGGCCGCCGAGGCCAGCCTAACCCAGTTTCAGTACACACCACAACACTTGGTTAGATTGCTACAGATTATTGTGGATGGAAATTGTGATATGGCTGTTAGACAGTTCGCAAGCATTCATTTCAAGAATTTTGTTGCGAAGAATTGGTCACCTACTGATCCTGAAGAAAAACATATAATTCCAGAAAGTGACAAGTCCATGGTCCGTGAGAATATATTGGGTTTTGTTACTCAATTACCTCCATTGCTAAGAGCCCAGCTTGGAGAAAGTATCAAGACCTTGATCCTTGCAGATTATCCTGAGCAGTGGCCTAGTCTTCTTCCTTGGGTAACACATAATCTAGAATCACAGGATCAAATATTTGGAGCACTATATGTGCTAAGGATTCTTGCCCGGAAATATGAGTTCAAGTCAGAGGACGAGAGGATACCTTTGTATCAAATTGTTGAGGAATGCTTTCCTCGTTTGTTGAATATATTAAGAAATCTTGTTCCGATTTCCAACCCTCCAATTGAAGTAGCTGACTTGATCAAGCTGATATGCAAAATTTTCTGGTCATCCATTTATCTAGAAATTCCAAAGCAACTTTTTGATCCAAATGTCTTCAATACTTGGATGATTTTGTTCTTAAACTTACTGGAGCGACCAGTTCCAGTGGAAGGACAACCATTGGATCCTGACGCGAGGAAATCTTGGGGATGGTGGAAAGTCAAGAAATGGATTATCCATATATTGAACCGTTTATACACTCGGTTTGCTGATATGAAGCTTCAGAGACCAGAAAGCAAAGCCTTTGCTCAAATGTTCCAAAAGAACTATGCTGGAAAAATTTTGGGGTGCCATTTGCAGTTGCTCAATGCAATACGTACTGGTGGCTATTTGCCTGATAGGGTTATCAATCTTATTCTTCAATATCTTACCAACAGTGTCACGAAGAACAGCATGTATCAGCTTATGCAACCACAAATTGACATAATTCTATTTGAGATAATCTTCCCATTAATGTGCTTCAATGATAGTGACCAGATGTTGTGGGATGAAGATCCTCATGAATATGTTCGGAAAGGCTATGATATTATTGAAGATTTGTATAGTCCTCGAACAGCTGCTATGGACTTTGTGAGTGAATTGGTAAGAAAACGAGGGAAAAGCAATCTGCAAAAGTTTATCCATTTTATTGTGGAAATATTTATGAGGTATAATGAGGCATCCATTGAAGTGAAGCCATACCGCCAAAAGGATGGTGCGCTTCTTGCAATTGGGACATTGTGTGATAGGCTAAAACAAACTGAACCATATAAGGCTGAGCTGGAGCGAATGTTGGTTCAACATGTCTTTCCGGAGTTCAGTAGTCATGTTGGACACTTACGTGCGAAGGCAGCATGGGTTGCTGGGCAGTATGCTCATATCAATTTCTCAGATCAAAACAATTTTCGCAAAGCTATGCATTGTGTAATCTCTGGTTTGCGTGATCCAGAACTTCCTGTTAGGGTGGATTCAGTCTTTGCACTCCGTTCTTTTGTTGAAGCATGCAAAGATCTAGATGAGATCCGACCAATTCTTCCTCAACTACTTGATGAATTTTTTAAGCTTATGAGTGAAGTTGAGAATGAAGATCTCGTTTTCACCCTTGAGACAATTGTTGACAAATTTGGTGAAGAGATGGCACCATATGCACTTGGTTTGTGCCAGAGTTTGGCTGCTGCTTTCTGGAGATGCATGGCTAGTTCAGAAGCTGACGAAGAAGTTGAGGACACTGGTGCTTTGGCTGCTGTTGGTTGCTTACGTGCGATAAGCACAATCCTTGAGTCCATTAGTAGCCTTCCTCATTTGTTTCCCCAAATAGAGCTGACTTTGTTGCCTATTTTACGAAGAATGTTGACTTCAGATGGTCAAGATGTGTATGAAGAAGTTCTGGAGATAGTCTCCTATATGACATTTTACTCACCAACCATTTCACTGGAAATGTGGGGCTTGTGGCCTTTGATGATGGAGGCCCTTAATGATTGGGCCATTGATTTCTTTGAGAATATTCTGGTACCATTAGACAACTACATTTCCCGTGGCACTGATCAATTTATTGCATGCAAAGATCCTGATTATCAGCAAAGCCTATGGAGAGCACTGTCATCTATTATGACAGACCAAAACATGGAAGATTCTGACATTATACCTGCTCCCAAGCTGATTGAAGTCGTTTTTCAAAATTGCAAAGGTCAAGTCGATCATTGGATTGAGCCGTATCTCAGGCTAACAATTGATCGGCTGCGTCGTGCAGTGAAGCCGTATCTGAAAAGCTTACTTGTACAAGTGATAGCTAATACACTGTACTACAATCCTTCATTGACATTGGGAACATTGCATAAGCTTGGAGTTGCTACTGAAATCTTCAATCTTTGGTTTGGCATGTTACAGCAAGTAAAGAAAAGTGGCATAAGGGCAAACTTTAAGAGAGAACATGATAAGAAGGTTTGTTGCTTGGGATTGACTTCACTAATTAGCCTTCCAGCTAATCACATTCCACCAGAAGCTCTTGAGCGCATTTTCAAAGCAACACTAGAGCTTCTTGTTTCTTACAAGGATCAAGTTGCAGAATCTAAACGGGAAAATGAGGCTGCAGCTGAAGATTTGGATGGATTTGATGGTGATGAAGAAGATGAGGATATTGAGTCTGATAAGGAGATGGGATATGATGATGAGGATGGGGATGAAGTATCTAGTGTCAATCTTCAGAAACTAAGAGAGGCAAGAGGTTTCCAGCCGCACTATGATGACGACGATGATGATTCTGATGATGACTTTAGCGATGATGAGGAGTTGCAATCGCCAATTGATGAGGTGGACCCATTCATCTTCTTTGTTGATACCATCCAAGGTATGCAAGCATCTGATCCAGCCAGGTTCCAGAGCCTGATGCAGACTCTAGATTTCCGCTACCAGGCACTCGCGAATGGCTTAGCTCAACATGCCGAGGAAAGAAAAGTTGAAATTGAGAAAGAGAAGTTGGAAAAGGCGAATGCGCAGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDLQSLAVVLRAALSHVPEERKAAEASLTQFQYTPQHLVRLLQIIVDGNCDMAVRQFASIHFKNFVAKNWSPTDPEEKHIIPESDKSMVRENILGFVTQLPPLLRAQLGESIKTLILADYPEQWPSLLPWVTHNLESQDQIFGALYVLRILARKYEFKSEDERIPLYQIVEECFPRLLNILRNLVPISNPPIEVADLIKLICKIFWSSIYLEIPKQLFDPNVFNTWMILFLNLLERPVPVEGQPLDPDARKSWGWWKVKKWIIHILNRLYTRFADMKLQRPESKAFAQMFQKNYAGKILGCHLQLLNAIRTGGYLPDRVINLILQYLTNSVTKNSMYQLMQPQIDIILFEIIFPLMCFNDSDQMLWDEDPHEYVRKGYDIIEDLYSPRTAAMDFVSELVRKRGKSNLQKFIHFIVEIFMRYNEASIEVKPYRQKDGALLAIGTLCDRLKQTEPYKAELERMLVQHVFPEFSSHVGHLRAKAAWVAGQYAHINFSDQNNFRKAMHCVISGLRDPELPVRVDSVFALRSFVEACKDLDEIRPILPQLLDEFFKLMSEVENEDLVFTLETIVDKFGEEMAPYALGLCQSLAAAFWRCMASSEADEEVEDTGALAAVGCLRAISTILESISSLPHLFPQIELTLLPILRRMLTSDGQDVYEEVLEIVSYMTFYSPTISLEMWGLWPLMMEALNDWAIDFFENILVPLDNYISRGTDQFIACKDPDYQQSLWRALSSIMTDQNMEDSDIIPAPKLIEVVFQNCKGQVDHWIEPYLRLTIDRLRRAVKPYLKSLLVQVIANTLYYNPSLTLGTLHKLGVATEIFNLWFGMLQQVKKSGIRANFKREHDKKVCCLGLTSLISLPANHIPPEALERIFKATLELLVSYKDQVAESKRENEAAAEDLDGFDGDEEDEDIESDKEMGYDDEDGDEVSSVNLQKLREARGFQPHYDDDDDDSDDDFSDDEELQSPIDEVDPFIFFVDTIQGMQASDPARFQSLMQTLDFRYQALANGLAQHAEERKVEIEKEKLEKANAQ</aaseq>

Gene Sequence

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