|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os06g0561200|
| |
| − | Description = Similar to Potassium/proton antiporter-like protein|
| |
| − | Version = NM_001064407.1 GI:115468545 GeneID:4341306|
| |
| − | Length = 8079 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os06g0561200, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 6|Chromosome 6]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 6:22370258..22378336|
| + | |
| − | CDS = 22370346..22370715,22370921..22370964,22371739..22371797,22371913..22371985,22372104..22372165<br>,22372247..22372322,22372441..22372515,22373360..22373431,22373522..22373605<br>,22373770..22373838,22375034..22375111,22375291..22375379,22375691..22375787<br>,22375907..22375960,22376466..22376561,22376753..22376941,22377023..22377100<br>,22377334..22377378,22377551..22377643,22377730..22377810|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008399:22370258..22378336
| + | |
| − | source=RiceChromosome06
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008399:22370258..22378336
| + | |
| − | source=RiceChromosome06
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgctgccgcgtcgccgcgcggggcccctccgcctcctccgtctcctcctcgtcctcgtcgttgccttcgcggcggtggtcgcattctgccccgcggcggcggctgcggcgggggagggggtgggggtggtggaggaggaggaggtgcgggtgggcgaggcggcggcggcggtggcgcgcggggaaggggacgacgcggtggtggcggcggcggtggcgggaggggaggtggcgggcgaggcgggggcggggttgggggagggggcggcggcggccaatgcgacggggaaggaagggagcctcgcggagatgatcgaccgcgcgctggagaaggagttcccggagtccgagggcgagcagggcggcggagagaaggaccccggcagcttcaacaacacggtggctgagaagcagggagtcctggaaactgtggccagaagagtaacaaagaagaatgagaccaaagacaataagtcattcccatttaaggaagttttcttggatcggccagagcaagaggatgttcccacattgattgatcggaaggataatgtttttattatatcaaatccgaagtcaaaataccctgtgctgcaactggaccttagattgatatcggatcttgtcgttgttattgtgtctgctacatttggtggaattgcctttgcttgccttgggcaacctgtgattacaggttatttacttgcaggatctataattggaccaggaggttttagctttgtcagtgaaatggtgcaagttgaaacagtagctcagtttggtgtgatatttctgctgtttgctctgggacttgaattttctacagcaaaacttcgagttgttcgtgcggttgctgttgttggaggattgctccaaatcatcctgttcatgttgctttgtggtatttctgctacgctatgtggaggcaaaacaaaagaaggtgtttttgttggtgttcttctttctatgtcttcaacggctgtggttttgaaatttctgatggaaagaaatagcatcaatgcccttcatggccaagttacggttggcacactcatattgcaggactgtgctgttggtcttctttttgcacttcttccaattctgagtggcgcttctggtcttcttcaaggagttgcatcaatggccaagtcgttggtggtattgataacattccttacaatcctttccatcctctcccgaactggtgtgccttggtttcttaagctgatgataagtctttcatctcagacaaatgaactgtaccagttggcagctgttgcattctgcttgttgtttgcttggtgcagtgataagttgggcttgagtcttgagttgggttcgttcgcagctggagtaatgatatcaacaactgatcttgcacaacacacacttgaacaaattgaacctattcgaaacttcttcgctgctcttttccttgccagcattgggatgctaattaatgtccatttcctttggaaccatgtcgatatactccttgcagctgtgattttggtgataactgtaaagacgtttattgttgctgttgtcgttaaagggtttggctatagcaacaaaacatctcttcttgttggcatgtctcttgcacaaataggagagtttgcttttgttcttctaagccgtgcttcaagcatccatctgattgagggcaaactttatctgcttcttcttggaaccactgcactcagtctggtaacaacaccccttctattcaaaatgatacccgcggtggtccacctcggtgttctcttgagatggttttctgttgatagcaatcaggtggagttgggcctaaaaagtgatggcctccgcatcgatagcggcaagcgcataaatttgatagtccaaggctcacatgactcatga</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MLPRRRAGPLRLLRLLLVLVVAFAAVVAFCPAAAAAAGEGVGVV EEEEVRVGEAAAAVARGEGDDAVVAAAVAGGEVAGEAGAGLGEGAAAANATGKEGSLA EMIDRALEKEFPESEGEQGGGEKDPGSFNNTVAEKQGVLETVARRVTKKNETKDNKSF PFKEVFLDRPEQEDVPTLIDRKDNVFIISNPKSKYPVLQLDLRLISDLVVVIVSATFG GIAFACLGQPVITGYLLAGSIIGPGGFSFVSEMVQVETVAQFGVIFLLFALGLEFSTA KLRVVRAVAVVGGLLQIILFMLLCGISATLCGGKTKEGVFVGVLLSMSSTAVVLKFLM ERNSINALHGQVTVGTLILQDCAVGLLFALLPILSGASGLLQGVASMAKSLVVLITFL TILSILSRTGVPWFLKLMISLSSQTNELYQLAAVAFCLLFAWCSDKLGLSLELGSFAA GVMISTTDLAQHTLEQIEPIRNFFAALFLASIGMLINVHFLWNHVDILLAAVILVITV KTFIVAVVVKGFGYSNKTSLLVGMSLAQIGEFAFVLLSRASSIHLIEGKLYLLLLGTT ALSLVTTPLLFKMIPAVVHLGVLLRWFSVDSNQVELGLKSDGLRIDSGKRINLIVQGS HDS</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 6]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>89..458#664..707#1482..1540#1656..1728#1847..1908#1990..2065#2184..2258#3103..3174#3265..3348#3513..3581#4777..4854#5034..5122#5434..5530#5650..5703#6209..6304#6496..6684#6766..6843#7077..7121#7294..7386#7473..7553#cccgacacgcgcactcacacgcacaccgcaccgccacacccgcctccacaatctaaacccctctctccccctcccctcctctccggcgatgctgccgcgtcgccgcgcggggcccctccgcctcctccgtctcctcctcgtcctcgtcgttgccttcgcggcggtggtcgcattctgccccgcggcggcggctgcggcgggggagggggtgggggtggtggaggaggaggaggtgcgggtgggcgaggcggcggcggcggtggcgcgcggggaaggggacgacgcggtggtggcggcggcggtggcgggaggggaggtggcgggcgaggcgggggcggggttgggggagggggcggcggcggccaatgcgacggggaaggaagggagcctcgcggagatgatcgaccgcgcgctggagaaggagttcccggagtccgagggcgagcagggcggcggaggtgcgttggatctggttacctcggggggggggggggggggtgggtgccccgtgatccgcctggggatctggttactcccactcggcgcctcagggtcggcggcgtcgagatctcggcctccgtggccgcggcggtgggggattttgggattatttgggactgccattttgtgcttacttgtttcggcggctctggttttttgcagagaaggaccccggcagcttcaacaacacggtggctgagaagcaggtgatttcatttgcgcacttgtgtttgcttgcttactttcagccattcgttcccatttgagggtagaatctggttaaatttcttagtatcatatgctgcgtgtggaaacgggtgggatatttggatcctgccgactttagttttggaagttcaaatcgttatttgtgcctggaatttgagtgagaattggttcgatatgggtgtgtgcctctaaagaaatttcttacttggcatgcttaaattcgatggagttggcgtttaaactgaggatgcaactgttaattctggctctgatcatgctaaattgataatgctccactaggttttctaccgctgtaaactccatgagccccgtgatgctttcatatgttgctatgtagtttttgtgccttttgacccagtatattttgacctggtgtagttaagttgacattttcctagtgctgacgacaataccttggatgatgtttgtagcttgtcattgtactagactagataataatgaatatttatttatggtggaactaagaaactttcaaacacaactaatattagtttatggtgtacctaggttaatgtatttacttgcttgaaaaatcttactaaacttaaactagttatattcttcttctgaagttccttgtattaaactagttatattcctcttctgaatttcaatgtcttcattactttttgtgaaatattgttggctatactgtatacatcgcacatgtgtctctgtagaagtgctcatcttgttctttatcctaccagggagtcctggaaactgtggccagaagagtaacaaagaagaatgagaccaaagacaataagtatgttattgatcaaaatttgactttgtgatattccttgtttaagtgattttatcctatattatttatcttactctttattaaaccccccaaatctatgatcttaaccccctaggtcattcccatttaaggaagttttcttggatcggccagagcaagaggatgttcccacattgattgatcggaaggtacaagcactgcaattggttgaaggatttatttgactttaaagctaccacttgtgcacaacgtgccagttcttatcttctgatttactgtcctgaattgacacaattgcaaatccaggataatgtttttattatatcaaatccgaagtcaaaataccctgtgctgcaactggaccttaggtatgttatccaattctgatgttgaatattcataaagtatccttaagtattaacttatttgttgattgtgaactattgtagattgatatcggatcttgtcgttgttattgtgtctgctacatttggtggaattgcctttgcttgccttgggcaacctgtgagtgctatacattcttcctctcattacttgtacaaggcatttattcttgtggctatttgagtgttgtggttttatattaagccacctaaggctacaactctaaaatatattgcaggtgattacaggttatttacttgcaggatctataattggaccaggaggttttagctttgtcagtgaaatggtgcaagtaaggtgctttttcctttgttggttgcttttctcaaaatatgtttgtgcttttgctcaattgtttgacttcttcagctatcagctaaatcgtaattgtttttctattggcaatttgttgtgcacatggagagaaatatataccgcttaagtgcttttacatttctatcttcacaccctacaagttcatgggaacactctgtttctttcactatcagttgttagatagagatgtacatgaaaattaagattcgcttcatctaattgctggaaaatggcatggtaacctggaattgttttgagatgaagccatataatgagatatgttttgcattgtctgaaattggtaactgtattcgtacaatacatgtgtagtggttagtgaacttcacataaataacagtgaggccattaactttggacttattgaagaaaccaaatcccatccatgtaaaagatcaaggttctagtttaaatgcctaagtttacttcaattgattttcgagctgtatgctcgagaaattccctctggcatttgactagaaaaacatcatgcttctcgtaacattgcaaatatttatttatctgtgcacatttcttttttttatgtgtatatatctcaattgttgctcatctgttttttcttggaccatttctgtcctgccaacttaccattgttatcttctttactggtatacacattcgtgtttcctgcttattttggctttcagacactgtagaaattgtaatgcaatcaataaatctacatgtaaaaagactgagtgtaatgcatatatctacttgtatataatttgtgtgtttatgactcatactttaccatacaggttgaaacagtagctcagtttggtgtgatatttctgctgtttgctctgggacttgaattttctacagcaaaagtatacatctttgatttttttatatatttgcacttatgcaagcatggacttgacataataacaacatgaggtgtttccccattgtctcagcttcgagttgttcgtgcggttgctgttgttggaggattgctccaaatcatcctgttcatgttgctttgtggtatttctgctacggtatgtttcattgttgtaatttaaataaccatgttttgatgtttccattttcaagcataagtactgtacaccctgttatatgttgctctggattatggattaggattaaaaaacacgtcttacagctcttttaatttttgtttatatttaatatcacattgcagctatgtggaggcaaaacaaaagaaggtgtttttgttggtgttcttctttctatgtcttcaacggctgtggtaatttctaaatctttgaacttgcatatctgtgcattcgattgcctttcatccaagtttacaatggaccctacaggtccgcttatgatttataacatcaatggcttttagttgcttcaatgtgcgtagtccttgagccgtttactgttctttgtctctttaaatagcaatatgtccattctctctcgcatgtgttttatgacagtgttatcgataatcttattgatactacttagtaatcaggccatcatcaggatatattgaaccaaacaaggaaatttggggcatgcagttgttttgttcggtttgattttttctctcccagtgtccgttgtcaggagtgcttctgcctccctctctcggttcccccaccctccacaaaaagctagccacatctactgttttggtgccaaaattgagtagattgggcagttggaacttgaagtatgcaggacctggcagtaggaggagaagaggaactgcaaacgggagatgatttagcggcagggagagaggagctcttcttggcagcgagaggttaatatggcaaggaacttgatagttaattcatcatcaagagctctaatttttgtggcagggtgcccaatttgttggtgggagctctgattgtgttggtgacgaccattgggcagagccggtggttccttatctattagtcttgcctctgccaactctgccacaatcaaggacttggttgcacaatctgactgggactcaattttttttgtgacgttgagtttcatgggttttaatccggaaaacactgtgcttggttcagttcctccagtggtttatgcacaacaattctgttctcctttctgatgtgcagagacagtggagatgacccttttgtgttgctaattaactcctcatttcactccaccgtggaatgccactcttatcttttagtgttttgctacacatcctctcaagcagcttttgttgtaaatcaacttgttcgtcttggttcgtagtggaaccattacccctttcatagacgatagatgccaaatggttttcaatttagcacgttgttacctcgtagatggtgcttgactcatgtgccaactgtttcctgaatgtcgtataacttgcaatatggttatgttcgtgttgtaaatcccatttccatctccttttgcttaacttttctgggaaaatattttctatgtaggttttgaaatttctgatggaaagaaatagcatcaatgcccttcatggccaagttacggttggcacactcatattgcaggtatgaaagaaatggataccatcttctaaatttgttgagttgtttggggagatgaattcgtaaagttgcacgttttgcttgcttcttcttaagaatcgaacgagtggactgattattctttctttatctgagcttcactactttccttgtattggtgatttgacattcctttgtctcaggactgtgctgttggtcttctttttgcacttcttccaattctgagtggcgcttctggtcttcttcaaggagttgcatcaatggccaagtcgtaagtgtagtgtgtttttggcttgaaacttttatttacatataattttttaccactacaataatctgtacactagaatcatgtctcctgcagtaaattcatgccacatcaatgtctaaatggtggtacttaaaatagcagtgctacctgcctttacatcatgacagcacaaaagtttattgccttatatcttgataatgacatcatgttgtcctatgtatatttgaacttcctattgtctgtgaaagttgttccataatataatcaggtgttggattaaattcttttgtcacaatttctgacattctcaggttggtggtattgataacattccttacaatcctttccatcctctcccgaactggtgtgccttggtttcttaagctgatgataagtctttcatctcaggtgaatataatcgacaggcactacatgaatagttttgttgagcatttaatttgcatttaatttagttctggttcagatcatcatgttatcctacattaacatttctgcatttcttgcagacaaatgaactgtaccagttggcagctgttgcattctgcttgttgtttgcttgggtgagtttctttaactgctcgtatgttagtatcgaatgcaattgttcagtaatgggaaactatttttctttaaacactggatgactggagtagtgcagataactgttacatgtactaaacctggccaaaagttgtgacactctaactggatccggtaaaggatgctaaacattaaatttattcaaagaaaaattgtgaaagtaacaattttgctaaacttgatcttttacactattctagattgatttatagcatgtattatagtgaatgtgtagtgcagactctagtgctttgcctctatctttcttctgttccaagtttctgcactaatctttgtaagttttgctcttcagttttcagcaactctttctttactgttatggctcatgcacagttttcttgcaagaaaatgtagttatgtttatccttttaacagttctatttgctctcttctatcggtatcctaaaacttatgtttactcatgtgcggccttctatgatgcagtgcagtgataagttgggcttgagtcttgagttgggttcgttcgcagctggagtaatgatatcaacaactgatcttgcacaacacacacttgaacaagtaattccttgccgtgaaattatatgcttttttttttgggtgaagtttgtcagttctgtgacaatttgaatgacaatgcactttttttttgttttatgtttcttttactgctttagtcaaagttttagctagattcatgtagttaatgattcattatatgttctcttatttcaggtttgttgtttctgcagattgaacctattcgaaacttcttcgctgctcttttccttgccagcattgggatgctaattaatgtccatttcctttggaaccatgtcgatatactccttgcagctgtgattttggtgataactgtaaagacgtttattgttgctgttgtcgttaaagggtttggctatagcaacaaaacatctcttcttgtaagtcttgattgctttacatgtgctcccttctgttattgctcatgcagttacactgatctcatgttattttccttgtaggttggcatgtctcttgcacaaataggagagtttgcttttgttcttctaagccgtgcttcaagcatccatctgattgaggttatttctccatattttgttcctatcatgtgttgctccaaagcttcctgcctgtcaatgttgttttatactctcatggttacactcagttctagctagcttctgactaattttgctctagcttgcttttggagtagtcaatagtttaactgttctgttatgataatatatgttgtcttgtgagcactgaggtgcgtgtactttcatctgatagctgaattgcttttcttcagggcaaactttatctgcttcttcttggaaccactgcactcagtctggtatgcacctatacgcttcatttctttttaagctatattctgttctcactgtaaatgatactcagcaaacatttgaaggagcggctcaaatgagagcatgatcaccaaacctttgtgacattgttgtggtcatgatgcgtttaccttatgtcgtgcgtgtgtaccattgcaggtaacaacaccccttctattcaaaatgatacccgcggtggtccacctcggtgttctcttgagatggttttctgttgatagcaatcaggtggaggtacacgttcatatcaactgagttccatctctcgattgttttactctgggaatcagtttccaaccaattcatcggttctttttcagttgggcctaaaaagtgatggcctccgcatcgatagcggcaagcgcataaatttgatagtccaaggctcacatgactcatgacatattttggcaccacgcaaaaggcttactactttttaagtatggcttacgctaaacagctccacattgtaaagtgttttttcgcatgtacgaaaagtgtttgtaccacacatgcacggccgtggaacctgtggagtggagtggaggcaaaagaaatcaatcaatctcgtttcggttgtcttgggatagattgatctgcgagtggtgcaatgggcaatagagtttgccggttttgggaggagagcagcatgcagcatacctgccttgggatgaatggcggtgtgctgcatcgctcgctggaaatttgagtgtgtaaaccccacaaatgagggttttctatgtaacataacaatgtatgctgattaattgattggattagcgagatagggtttagtttggcttggtcgttaccatgccattgtattcattttgtcagcgcttgtgtacgcgtttctcatcgcgaattttgctgtgtagtttgtaactagtgaccttttaccattatctaaccttgtccgtttctatt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001064407.1 RefSeq:Os06g0561200]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 6]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 6]]
| |