Difference between revisions of "Os01g0818600"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
    [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 1]]
−
GeneName = Os01g0818600|
 
−
Description = Leucine rich repeat, N-terminal domain containing protein|
 
−
Version = NM_001185697.1 GI:297720528 GeneID:9267172|
 
−
Length = 7577 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os01g0818600, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 1|Chromosome 1]]|
 
−
AP = Chromosome 1:36628908..36636484|
 
−
CDS = 36628908..36628995,36629171..36629242,36629324..36629392,36629594..36629662,36630074..36630148<br>,36631929..36632000,36632087..36632158,36632252..36632395,36633324..36633395<br>,36633669..36633740,36634271..36634418,36635197..36635298,36636095..36636332<br>|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008394:36628908..36636484
 
−
source=RiceChromosome01
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008394:36628908..36636484
 
−
source=RiceChromosome01
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atgcgacagctgcacgggctgaaaagttgcagcagcagtagtagtatatgtccccccgcgccgcgggggttgtcgctgtgggtgaaggtgcggtgctcgctctcgcctgcctttcccgagttcgttggtgagggcaatctccggccgggcgcctcgtcggctggtgctccccgatcggggggctgctgcaaatcgctgttcggattggagcggccggtcggtctgcgtttgattgcagacatggcgaacttcagaggttttcggcgcgcagtgatcgtggttgttctgtgcatttgtcatgtgaatgtcgtaaggggacagagcactgaccctgctgaagtaaatgctctcagagctatcaaaggaagattaattgatccgatgaataatcttaagaattggaatagtggagatccatgcacatcaagttggaaaggagtcttctgtgacaatataccaataaataattatcttcatgtaacagaattgcagttatttaagatgaatctttctgggactttggcaccagagatcggtcttctatctcaattgaaaacattggatttcatgtggaacaacttgactggtaacataccgaaagagatagggaatatccacacactcaggcttataactttgaacggtaatcagctatctggttctttaccagatgagattggctatctccaaaacttgaacagattacagatagaccaaaatgaaatatcaggacccatacctaaatcatttgctaatttaacaagcatgagacatcttcacatgaacaataactcattaagtgggcaaatcccatctgaattgtcaagattgcctgaactcctccatctccttgtggacagtaacaatttgtctggacctcttcctccagaactagcagagactcgcagtttacaaatacttcaggctgataacaataacttcagcggaagttccatccctgctgcatacgaaaacataccaacacttctaaagctgagtcttaggaattgcaatttgcaaggaggtattccagatataagtggcattcctcaatttggctatttggatcttagctggaaccaactgacaggatctataccaactaataaacttgcttcaaacgtcactacaattgacttgtcacataactctcttaatggaactattccatcaagcttttcggggctgcctaatcttcaattcctatcgattgaaggaaatcacatagatggtgctgttccatcgacaatttggagtaacatcacttttgtgggaaatcgaagccttgttgtg</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MRQLHGLKSCSSSSSICPPAPRGLSLWVKVRCSLSPAFPEFVGE                    GNLRPGASSAGAPRSGGCCKSLFGLERPVGLRLIADMANFRGFRRAVIVVVLCICHVN                    VVRGQSTDPAEVNALRAIKGRLIDPMNNLKNWNSGDPCTSSWKGVFCDNIPINNYLHV                    TELQLFKMNLSGTLAPEIGLLSQLKTLDFMWNNLTGNIPKEIGNIHTLRLITLNGNQL                    SGSLPDEIGYLQNLNRLQIDQNEISGPIPKSFANLTSMRHLHMNNNSLSGQIPSELSR                    LPELLHLLVDSNNLSGPLPPELAETRSLQILQADNNNFSGSSIPAAYENIPTLLKLSL                    RNCNLQGGIPDISGIPQFGYLDLSWNQLTGSIPTNKLASNVTTIDLSHNSLNGTIPSS                    FSGLPNLQFLSIEGNHIDGAVPSTIWSNITFVGNRSLVV</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>7490..7577#7243..7314#7093..7161#6823..6891#6337..6411#4485..4556#4327..4398#4090..4233#3090..3161#2745..2816#2067..2214#1187..1288#153..390#attaataactccccgaattcgccaaagcacaaccttcccccaccaacccaccgcacccagagcttcgcctcgacctcgccttcgccttcgtcgctgtagctgccgcgatccaggaggaaagggagtggggtgcggatgggattgggggaggaatgcgacagctgcacgggctgaaaagttgcagcagcagtagtagtatatgtccccccgcgccgcgggggttgtcgctgtgggtgaaggtgcggtgctcgctctcgcctgcctttcccgagttcgttggtgagggcaatctccggccgggcgcctcgtcggctggtgctccccgatcggggggctgctgcaaatcgctgttcggattggagcggccggtcggtctgcgtttgattgcaggttcgcttcttcgattcctcgaggattgtgcggttggtttgttcaggatttgtttctagtgtgagttcgatcttgttgttttcttttcttggattgaaatttcacttcagattacagttttctcgctatttgccaaaaaaaaaagaaggcttggatttttttttttatccctattcgttgttctcctagcttcttggtcttcttcggctcctcgcttctcttctttgtatctgtacctttgaagctataaaagtttggtacttttggtgaaaatattcgacggagaaggtatgcggaaaagggcatatttgtcgccataaaaatttacctaacgttgacaaccattagtagctcgaagtcctgaaccttgtgtactgtgctcttgtgccgtacagtctgcaggcttagttgggaagtcccagttgctggttgtgatgtggctcttgctgtcagtgttaataggttgttttcaccttatgtggaggagcttaagtaacttgcaagctcgcttacttttctttagtcaagaggagagttgattttgattgtgcccgggccatattttttccatggttgttggtttgaacacaccatggttaggtcaggcgcgttaagcatcatatggagttgacacgctttcacaccttagatactggatgctagtcttctgtgggtaggataagcgcctccattttggactaatcgatcatttagaatggtagcaagcgtgctggatgtctggatcgtgcagggatgactaagttgctgatcacttgctcctgattctcttgtacagacatggcgaacttcagaggttttcggcgcgcagtgatcgtggttgttctgtgcatttgtcatgtgaatgtcgtaaggggacagagcactgaccctgctgaaggtaatatacagtaatctctagtaggacatgtgctgtactgcatttgcttgcttgctttctgttatacttttgagccaggcagtttgaattgccggagctcagaatagctactagttctatagttcaggaagacagaattgggctttaagctttcaaagtttcaattatgcatatcccatctgtgcggatttaagcatatctttttgtaagtagtgctatgttttgaaagtatctcgaagatcccgtcccccccatctgaacctgttgtgaattgtccgtttctacaatgttcatgccatcaattgccgcacactcaattgttgtcacaccagtaatcagttatattcatgtggtaatttaaaaagttcatgatataacatgtttttaattcagagttaaagaagttcataatattacagattttaaattaaagaagttcacaatattgtaagtaaacttacaatattacataacattatattgcctggcaattacataacattatgttagttaatctggtatgaacaactttgttagagaagtagaataataactatttgaaagggttgcttcccagtagttcttccaaagaaatatctgaagaatagttttttaatagataatctgaagatagctgtgcaatcaaagtaagaataatcattattagtttttttgttgttgctgagatgtgtgatgcttagtttaaacagtaatattgactcagatacttaaaattttaaaactgctgtgaattgaactgtttccctcttatgtgcagtaaatgctctcagagctatcaaaggaagattaattgatccgatgaataatcttaagaattggaatagtggagatccatgcacatcaagttggaaaggagtcttctgtgacaatataccaataaataattatcttcatgtaacagaattgtatgataatctttcaaccttattattttatacgcttactcttctccctctttttttagtggtaacggtggtttgttctttcccaagtacttgttgagtgagccctctgcaattgttgtttgtataattgtcttagctccagccagaggttctggctttctctctttttctttaagcaggttcatcacctgtactatgagttttctacctcttaatgcaaaatgcgcagccctcgtgcgtctttctgaaaaaaaaaagaatacctcagccttgactgggtaaaataattcaagttcccattgtgttcgctatcatcaatgacacatacctctagttacttttagcctaagttgctattttcatgttttggtcaaagccgtgatcattctctaatgaaatccattttgcattctgatatctgtttattatctacttctgtccattctgtatgatgtgcaatatgataattggattgccaatatcatgctattttttttctcttgaaattgcatacttttttctggatgcaggcagttatttaagatgaatctttctgggactttggcaccagagatcggtcttctatctcaattgaaaacattgtaagtaccaacttgatagaaagctggaatagttaactgaatttaaagataatattgtatctcatggggtactacatttagtatattttaagcaaaaaaacataattctgactcacaagaaagaagaaacttacataatataataactgggacataaaggaattgtttcttgcatggttgactcttattgtgcatttagtctcgtgaagccttttcttttgttacatttccaaaattttggtacctaactgctatattttgttcttttgaaagggatttcatgtggaacaacttgactggtaacataccgaaagagatagggaatatccacacactcaggcttatgtaagtttcatctgtgcaatccaatttttgtgctctcttttcagtgtgcacattatccacaggccgcagcatcttacagtttatcttgcaaaaccacataagcttaggaatctaaaggtttcttcattgtcagcaagtattttatatacatatggacaaagtccggattgcccttcttaacccaaaggtactgtgatggggctaatagtactaagctttggacatataggatccttacaataatatactagctatagcttaaagatatttcattttggtaggttcgttttggttctaaatagttgttttgggttttcagtggaacattttctattaaatatcccaatcagttgctaattgacagtactatcagagagatgtgcagacagttaatagtggttgcatatttccacgggtaaaacattaggataaatttttcgccgggctggcgtaagagagccagccgaaatttatgaagaggaaagggagaaaatgttacaagctacagcagagttacatgccagcaaagccggcaacacacttttacaaggataaattgatcccctttttgtgtaaaatgatatctcaatgagaccacagagagtttattccaaccgcttaatttcagtaaaatttgtaaaggaaaagtatgcactgtaaagtattctatataaattgccatgaattaatagctgaatattgacatatcttagtttaatgcagtatatcttagaacttttatacaccatgcgacactattttattttgaggattacttttattacctgtttcccaagcattaaacatgcagtaaatgttgtagttctctttgcagaaattctgtaaatttctttatatgaattgcatccaggataataggtgctcgtatataacaaaatgttgactgttgtcgcaataacttttgcagaactttgaacggtaatcagctatctggttctttaccagatgagattggctatctccaaaacttgaacagattacagatagaccaaaatgaaatatcaggacccatacctaaatcatttgctaatttaacaagcatgagacatctgtaagtataaatatttaaattttgatctttcctccccatgttgcccccatattttaaacttaattataatcttgactcttcttctaccatcagtcacatgaacaataactcattaagtgggcaaatcccatctgaattgtcaagattgcctgaactcctccatctgtaagtgggacttcacttgtgtttttttttaccttttttagcatgagctgtgtaattaattttatcttataccacaaacttgacagccttgtggacagtaacaatttgtctggacctcttcctccagaactagcagagactcgcagtttacaaatactgtaagtgtatttttctttctacccgaatgttgcttttaaaaatttacctacagcgcatcagaatgtgtctcctgttttctttggactgatatctatcacttcatttaattaagagtatcatgggtttatagttgcttgaagctgactgatgataacttcaatttcaaatttagaaatattaaatggtaccaattgggtcttgagcgctatacctatatatctcttggtcgctattgacgcccctaagtgggtaatcaagggcatcgacaaaattcgtcgcggcttcttatgggctggcaaagtgcaggccaagggaggttgttgtcgggtcgcatgggcaaaagtttgctcgccaaaggagtatggtgggctgggggtaccaaatcttgagctcatgggcatcgcccttcgatcccgttggacatggctgcaacgagtttcctccggaaaaccttggcaaggtttaaccatcccgggctcgcagaaggagaagaattttgtggccgcttcaacgatatgcctcgttggcaatggcacttccattctattctaggaggattgctggttaaaggaaggggcggtccgctccattgcgccatccctcttcaaccagattccagtgcgcattcggaagagaagaacggttgccgaggcattgctcaaccgaacctggatatcagatatccgaggtggcctcggcattcaagccatccttgaatatctgaatctctggtcgataatccaagcggttgatcgaacggccacagaaccggacacactgctttggagatgggagaattctggcaactactccaaatcagcctatcaggccctcttctttggtcgcatccaattccaatcggcaccgatatggaattccctcgcaccaccacgctgccgatacttcctttggttggtagcgctgaatagatgttggactgccgatcgcctccgcagccgcgggctcccacatcctctgtgatgcgtgctttgtgaccaacacgaagaaaccatcgatcacatcttggtcgcttgtccagaatcaaggcaacttggtggtgggcgctgcgcgcgataaggctgcaggattgcctgccaataaacgaagcatccttccatacctggttatgcagcgcaagggagaaggtccacaaaccacatcgtcggggattcgacacaatagcgactctgattgcttggacaatttggaaggaacggaacaatcgagtgttcaacaatgagagcaggacatgggtcgacattgcgaaaggaatggccgaagaagcagcgctctggcgggcggcaaactcggtgattccatccctcacttcgcagctcccaggaggtcgtggtagcacaatagttttgcgagattagctcttattgtttatattccagtatcggtcccgtgctgtttttaaatttgttacttgtaaataaactttattcctcttaatgaaaaaatgtgcgcctcacgtattcctgaaaaaaaaattaaatggtactgcaaatttgttgagcatgtgatatcaagtccagaaatttatttaaggtgtggttttctgcatcttctgatgcagtggccaggatgctatattccattatctaaaactaaggcaattttattgtttgctagacagatagagcatttttttattcctttacttttatgtatatgtgggtttacatgactttttatgagcacagagctttccacttgggtagcgttttgatactctgttagcttgtgacactcaattcttatatgtgctacttaaagtcaggctgataacaataacttcagcggaagttccatccctgctgcatacgaaaacataccaacacttctaaagctgtgagtccaaccttctttctttcacaagttcatgttgtacttttgttcttcttactacttgtagatgcaggggactcgattattttagaaagtacataggccacctttaagtttggatggagaagattaacatggtacataatataattgattaatgtaagcagattccattcgaagtttgatatgttgaggctcacgatgagtagagattcctcactggaaaagacaaaaagaaaacaaaaggagtaaaaatcaatcttcttaccttaacaacctaaggtttagtagatatggttgttgtagacttatatcagaagtccaggaaatacaaaacaacagaatccaatctctatcattcttaaactcagacaaagatatgtgctcagtagatattccttttcactttaccaggagtcttaggaattgcaatttgcaaggaggtattccagatataagtggcattcctcaatttggctatttgtaagtacagatcaaatatatcactcatttcattttattaggggggaagcgcaccattggtgtggtggtttagtcatgggttcatgactccacccagcaaggttcaaatcctaagattggccattcacttcatgaatgagaataatccaggaggttattgtgtacacacctttactaactaactctgtcaagtactttcagggatcttagctggaaccaactgacaggatctataccaactaataaacttgcttcaaacgtcactacaatgtacatcgtcgtttataagagcaatgattttttacttgtatttttccctttaaagaaaagctaatttctagtttttgacagtgacttgtcacataactctcttaatggaactattccatcaagcttttcggggctgcctaatcttcaattcctgtaagtaaatatttaacttgctacatgtttctttcgtgtcaacaatgcttttatatactacacagccaacctgccctggcatcgtaaattaatgctttatctgttgaacttgtgttgtttgttggccagtactgttctgttacttatttgttagaggtatatgattatttttcagatcgattgaaggaaatcacatagatggtgctgttccatcgacaatttggagtaacatcacttttgtgggaaatcgaagccttgttgtg</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001185697.1 RefSeq:Os01g0818600]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 1]]
 
−
[[Category:Chromosome 1]]
 

Latest revision as of 05:00, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information