Difference between revisions of "Os04g0185500"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
    [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 4]]
−
GeneName = Os04g0185500|
 
−
Description = Similar to Protein containing C-terminal RING-finger|
 
−
Version = NM_001058727.1 GI:115457183 GeneID:4335112|
 
−
Length = 8871 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os04g0185500, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 4|Chromosome 4]]|
 
−
AP = Chromosome 4:5794472..5803342|
 
−
CDS = 5797482..5799164,5801038..5801109,5802046..5802141,5802277..5802423,5802967..5803098<br>|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008397:5794472..5803342
 
−
source=RiceChromosome04
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008397:5794472..5803342
 
−
source=RiceChromosome04
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atgcatcaacataggatcactatgctatcttcctcagaaacatgtcaccttggttctagttcgaacaaccaagccatggatcagcagaatttactgcccagcaaccccaccgcagatgaacagaatttacttccaaatactctagaggatgatgattacccacattatttacttggtagtcatgaggtggaaatgccaaatggaagcgtgattggtcagcaaaatacaagcttgaacttatgggattcagctggatctagctcgatgggctgtgtagctgatcatgatagtctttttgaggccaaaagggaacattttgctcctgctttgtctatccgagctcccttaattattggagggagaagacatgaaggcagtagttcattgccttcacagagcttaaacttagaccttaatcttaatcaggctgatcagtttgattctgaggatgttgatatgattcagagtaatggacaaccagggataaacgcttttcctctcaacaggggcctttccattcctgagcatgttctgcgccatacaaattcttccagtgctacaggaaatccttcacaggttgcaagcttttctgatggaatgacaggccaagaagttaacctgtttggtgggcatcgttcatcttgcaagagaaagaatattgatgggagtcttgcagagtcttctgccaatggtagttcacgtaataatcagcgaaataatattatactggaaccttctccatccagtcatgaaagcacttctggtttaactgcacctgcccctacaaaccatgttttttcatactctcctgtggaacagctaaaccagaataccaatatgtctgcaaatgctatgttgtctgatcattattcactatatggtgatcatgagcgtgagagatttctgaggaatacccggatgagaacaagccctaatgagtatgatcaatcatcgtccaatctcttgcctgaaggaagtctcaggtgttctgtttatcagcctactcagcaacagtctttgtttattccagtacaacctagagcatcgagctcttcaacaagttctcttagtcggccttatgtgcctgctgtcactcaattctcacaaaatttgcaccgtgctccatcaagtggcaattttggttcgagaatagggatttttcctagttctgctgatacaacaaaccagttatcttcacaagatcccaacaggagctcggtgagaggcaattttcctgagccccttctgttaggttcttctctgtttccttctgactcggcagaattgctatctatgccgggaggcagaagcaaccaacaaaattccagctccacaattcgaactgctgtaaatataggagctcaacagattgctgggttaaatgcatcccagcctacttcaagctcaaggggttcggttgatattgttaggagatccttgcaggctgctagcgttcctcagtccagaggttcaagcattacatcacagcagcaacgtgggcattcatccacatcacatgagattcgaagccatcaacctggatccagctctcgtgccaatcagcagcattatgtcagggctgttcctcactctgtagataggcaaaactcgaattacttggacctgcagtcttttatgcaaagcattgctgcttcaagagacggaattaggacagtctcagagtctgccaatcaacttgtgcatcttcgcaatgttgttgaacaaattcgtcagggaagaggtggaaggtttgaggatcctaattttgaacgtgcactttttgcaaggcgtgccagtttaattgacagacatcgtgacatgcggcttgatgtggataatatgtcatatgaggaattgttggcacttggtgaacgcattgggtatgtaaacactggacttagtgaggataaaattaggactggtttgaagcaatggaaatatgtgagcataccgattgaagaacctctaactggtgttgaaccatgctgtatttgccaggaagaatatgccgaaggtgaggacatgggcagactagactgtgggcatgacttccacaccgcatgcatcaaacaatggctggttataaaaaatctgtgccctatctgtaaaaagacaggactgggcacttaa</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MHQHRITMLSSSETCHLGSSSNNQAMDQQNLLPSNPTADEQNLL                    PNTLEDDDYPHYLLGSHEVEMPNGSVIGQQNTSLNLWDSAGSSSMGCVADHDSLFEAK                    REHFAPALSIRAPLIIGGRRHEGSSSLPSQSLNLDLNLNQADQFDSEDVDMIQSNGQP                    GINAFPLNRGLSIPEHVLRHTNSSSATGNPSQVASFSDGMTGQEVNLFGGHRSSCKRK                    NIDGSLAESSANGSSRNNQRNNIILEPSPSSHESTSGLTAPAPTNHVFSYSPVEQLNQ                    NTNMSANAMLSDHYSLYGDHERERFLRNTRMRTSPNEYDQSSSNLLPEGSLRCSVYQP                    TQQQSLFIPVQPRASSSSTSSLSRPYVPAVTQFSQNLHRAPSSGNFGSRIGIFPSSAD                    TTNQLSSQDPNRSSVRGNFPEPLLLGSSLFPSDSAELLSMPGGRSNQQNSSSTIRTAV                    NIGAQQIAGLNASQPTSSSRGSVDIVRRSLQAASVPQSRGSSITSQQQRGHSSTSHEI                    RSHQPGSSSRANQQHYVRAVPHSVDRQNSNYLDLQSFMQSIAASRDGIRTVSESANQL                    VHLRNVVEQIRQGRGGRFEDPNFERALFARRASLIDRHRDMRLDVDNMSYEELLALGE                    RIGYVNTGLSEDKIRTGLKQWKYVSIPIEEPLTGVEPCCICQEEYAEGEDMGRLDCGH                    DFHTACIKQWLVIKNLCPICKKTGLGT</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>3011..4693#6567..6638#7575..7670#7806..7952#8496..8627#atttctccccacctcctctcctcctcctccttccagccgaagccacgcgcggacgggagagaggggaaggacgcggccgcggctcgcctctccccccccccctcgcttgccgccgatcggcgatcggggcggcgggacgatccccggagggagcagccggcgcggagtccgtacggttttatttctatatattttttttcttttttaccttgtctcgtggttgtggtttcgagttgatgggcttgatgcttggtatgggtgggcgggcggtaggtaggggttgggggaggcgcttggattggggacggatgggttcgtttcggtgggggaggatgagatctgtgggggatttcgggggaggggatctgggggcgaggttttcggcggaattctgtggaatttcgttgatttgaagggggtagggttaggtttcggagggcgtttccgtggtagaaaagttgggatatgggtggattaggcgggatatggtggtttgggatgtgtttataccatggatattatgttggtaggaggctatctgtccatgtatctttggtggaaatcctcttcctagtggttgcaatccgcgcgaaatttaggagatatgagattctgattttgttaaatgttggatgcatagaacgggagttgtttcatggaagacactagaaaacctgtaatattgcctgtgataacttggccaaggtggaaaatcgtgagctgttctttttgttgtcctgcattataatatattcttcagaattctgaactgttcattgtgtattcaatcttatttgcttgtttgcagacctaatatgttcatacaacctatcaatttattagataataagctgtctgtcctgataccagctcatattagaaatgctttgaaatgtttacttttgtttttttcatttgtatttgtaagattgcatcacatatagaaaactaacttatgtcccctctcttctatttgctgatgccagggaagcagttttgtagcgttatccaattggcttccgctatctgcaacagtttccaccatttgtcaataaattactgaccttgtagttgaggtatgtttattgcagacacccccacattgctacagttgatcataatgattgatgttgatttacagtgtaccctacagtatatattgatttgcaatcatattacaacttgtaatctaatttatttttttctattctgacaagaatcctcctttttaaaatttatcatagaaagtttaatatgcactcatgattttagtatttctcgcaccctagattgacgtttctttattgtgtttgaaatataacaagaaattttgcatccagttgtatttaatgtggtattaaatgacatggttttcagcattacaatttataagcaaaactaaggcaatgttcatggtaggataaggtgcttgagtttagtctaccagccaaatatccgtgctgtgctacggattaaaacaaattaatagtgaggtttttgggacaattttgtacctgtagatgttatattgtataggtgaaatatgatagaatcatatatgtagagggattattttataacataaaagtacatgggctagttggtagaaaacatgatggagtagatggtaactaaaaaaaaatactacttggtgaggtggtggcagattcactgccaccaccattgccctcttttaagaagagtatagatccatgggtatgttggtaggaggctatctatccatgttttgccggtgtatctgtgagaaatttaggagattgggatgctgattttgttgaatattgcatacgtagtgtagaaatggttctctttgcatacatctttttgttaaagctgtagacactagaaaagtgatagcattgcccgtgataactcggccaaggctggaatttgtcagttggttttttcctgcagtatagtaaatttttcataactcttcaattgttctgtctctgattgtattcaatcttattttctcggatgctgacctaatatgatcatacgacttatcagtctagataatatctgtctgtcctgactcctgatacagggtcatattagaaatgctttgaaatgtttacttatgcctttttgtctttgttaggttgcatcacatatagaaactcacttatgtaccctgccggttttttttttttttttgctgatgctagggaagcggttctgtaacattagccgattggcgtccgctatctgcgacggattccaccatttgtcaataaattattgaccttgtagttgaggtgtgtatatcactgacacccccacattactacagttgatcataatgatggatgttgatttacagtattacctacagtatctgtagattcaccatgtatttaggaaactaataattataaatctaatataacctttttattctgaaaagaatcttcctttaaaatttcccatgtgaaatataatatgcacttgcgatgttagtatttcacacatccaagattgatgtttttgtttgtgtttgaaatataataagaaattgtgagttcagttgtatttaatgtgctgtttagattttgaatggcatgtttttcatcattataagcaaaactatgtcaatgaccatggtagggagcatgtgtcattgcacctctgtttaacagactgcaaaaggaactgtgccgatgcaggctctgcatgcatgtttatctggccatatacccatatgtagtattcaaggaatttctggcaacacagtgattgcgcatgactcagtccatttcaggatttgagcatttagattgttttatactttttttttagtttgtctgtaatttgtaactttgatatacgattgtgtaaagtactgattggttccttcattttgcttatatttgccaggatcgtcaacctcaagttgtaaaacattgatttttaatgggtgatgttttattacattgaactcatttaagtacctcataagttatccaaggaagacagtaaagtttcgatgcatcaacataggatcactatgctatcttcctcagaaacatgtcaccttggttctagttcgaacaaccaagccatggatcagcagaatttactgcccagcaaccccaccgcagatgaacagaatttacttccaaatactctagaggatgatgattacccacattatttacttggtagtcatgaggtggaaatgccaaatggaagcgtgattggtcagcaaaatacaagcttgaacttatgggattcagctggatctagctcgatgggctgtgtagctgatcatgatagtctttttgaggccaaaagggaacattttgctcctgctttgtctatccgagctcccttaattattggagggagaagacatgaaggcagtagttcattgccttcacagagcttaaacttagaccttaatcttaatcaggctgatcagtttgattctgaggatgttgatatgattcagagtaatggacaaccagggataaacgcttttcctctcaacaggggcctttccattcctgagcatgttctgcgccatacaaattcttccagtgctacaggaaatccttcacaggttgcaagcttttctgatggaatgacaggccaagaagttaacctgtttggtgggcatcgttcatcttgcaagagaaagaatattgatgggagtcttgcagagtcttctgccaatggtagttcacgtaataatcagcgaaataatattatactggaaccttctccatccagtcatgaaagcacttctggtttaactgcacctgcccctacaaaccatgttttttcatactctcctgtggaacagctaaaccagaataccaatatgtctgcaaatgctatgttgtctgatcattattcactatatggtgatcatgagcgtgagagatttctgaggaatacccggatgagaacaagccctaatgagtatgatcaatcatcgtccaatctcttgcctgaaggaagtctcaggtgttctgtttatcagcctactcagcaacagtctttgtttattccagtacaacctagagcatcgagctcttcaacaagttctcttagtcggccttatgtgcctgctgtcactcaattctcacaaaatttgcaccgtgctccatcaagtggcaattttggttcgagaatagggatttttcctagttctgctgatacaacaaaccagttatcttcacaagatcccaacaggagctcggtgagaggcaattttcctgagccccttctgttaggttcttctctgtttccttctgactcggcagaattgctatctatgccgggaggcagaagcaaccaacaaaattccagctccacaattcgaactgctgtaaatataggagctcaacagattgctgggttaaatgcatcccagcctacttcaagctcaaggggttcggttgatattgttaggagatccttgcaggctgctagcgttcctcagtccagaggttcaagcattacatcacagcagcaacgtgggcattcatccacatcacatgagattcgaagccatcaacctggatccagctctcgtgccaatcagcagcattatgtcagggctgttcctcactctgtagataggcaaaactcgaattacttggacctgcagtcttttatgcaaagcattgctgcttcaagagacggaattaggacagtctcagaggtatgtcgctctagagctccacccaaatctcctgttttaattagctgtaatattgtgcagaattgtttttgtttctttgataagtactgatctgataatgctacatatagtttctaaatatgaacttttatctataaattgagaaactttctacctagaaactttcaactataaattaaatacttcacagaaatactacgtagagaatttttaaaccgagaagaaactttcatctaggaattagaatacttgttacgaaataattgactaaactcttgtgattaggaaactttcacttacaaaataaaaagatcgtacagtaaaacttttacattaattgtgaaaatgtagagatttaatgaaaatgggaagtatcaaggaaaatagaaaaaaataggaatgcatgatatccatgtagcccatttgacctggctgacacaggcccacagcagacagtttccatcgagagaggctaccaaatttggtatgtaccatgtgtagtaggattttctggcacactgcactctcgcgctgtaggtattcctgctgccacacccttataagcattggtcaggccaccacgccactgcttgagctgcttcttgattactccctccttccaaaagtctaagacctattacatgttttggtttttccaaaaatctaagtcctatttgtagtcactatgtgctatattaaattttttattggaacccaagaaaccattttagtacttattggttgcatgttcattggttttgtcacatgatgaatgaatcaattactcctttgtcttgatgcaaaaagaaataggacttagacttttggatggagggagtatttgggagtctggtttgcgaggcattggggtagatggtaagcgctgcctcatgaggcgctgcagatgccgtcgccatgccttcagatgccatgagcactggtcctggatctgcgcatgtgctgttcacttgttgttactgagaaagaaccatgtgaaagataaaactaaggaagatgagggtaattggggtatttgaagaaaaaaaattgacgagagccaggtcactaatggtagaacaaactaataaggctaacgacagtggcatgtgagggtagcaaaatttagtttgtggcaaataaggtgacaacaaattttcagtggcaaataaggaaactggttaattttgagttgcaaataaggaattttctcctcttggttctgttcattattcattgttttgttagatttttagaatatgagctatttgaagttagtagatttatggtttacacaacaatgcattgcacaaatattttgaaaggtatgctgggcatgatgacaaggaaaatagaaatgtgcgattgaactagtcagaaaaggacagtagatagagaggtatgcgatttccttcattgaaccaaatttgttgtgaaatggaacgattcctacaatggtgatccttaagatccattacgatgagatattattttgtttcgagatagactgtcctgtttttgtgttttgctaatgagatcggtatcacaagctatattgaatttggctagtcatcctgtagcccttgtattgagattaaaactgttaatcatttatttggttaatttccctaaactaaatttgacgctatcgattcggttattaattagtcctatacaaggtgtatttgcttattgtaagaggtggatcttagttgcctatgttgtccatgtttaactaataacaggttgatttaactgtaacttggcttccttccatatctatctcaaaattagcatatgtcaacattttgaagagatctgctattaaagtcactaataatttcaataacttcatcatttcttttgtggttgtcagtctgccaatcaacttgtgcatcttcgcaatgttgttgaacaaattcgtcagggaagaggtggaaggtttgaggtcagaattgaatcttttgttgtaaattatattttccaatggtgcatgtattttctctgcgggtctgttaattgtgtaacttgagccttcgatttagtgaagataatgcaatcgatttctttgctctagataggaccttgcaaactgcctcatctaggaactatttgccatgagataagtcttagtgtacaacctgctattgaatttgcttcaattaggtaactcaatagtgcccatgtttcatttgaaatggtaaatagcatctttctggcttttattatgatgtatgcaaccttcatttcttcaagtacactccaaaagctctctaatcataactctggtttcaaattaatgaattcaaccttgttatgtacattgcaatatcactttatgctactccctcatcctcaaatagagatcaaatagaggttttggaatacgtgatcaaactttaaaacattttaacacaaatatgcacagcatattattgggatcttcattatgtgaaaatgcacttagtagattaatcatgaacaacattttgaaatgattatattttaatacttctcatgaagatacaattggaaaaagtaattttcaaaggtgcaaattgaagtgccatgttgatccatcctagttacgaagaagtacaaaagaatggaggaagtgtatataatcttcgattgaaaactatgttgaaattctatttgtattgtttccacgatttaaatagcatgtccagtaatcttccaaggaaatatattggtaaaagtggaagacaaatcaactatgacatgtgatttgaattttattgtaataatgcttgtacttctgaagtaatcagggattatcatgtataatttctgccattcatctgcttatggaatatctttgtcactttgatccgactcttatgttgtatcttttttgggacaggatcctaattttgaacgtgcactttttgcaaggcgtgccagtttaattgacagacatcgtgacatgcggcttgatgtggataatatgtcatatgaggtaataagtcatagcagtagttccgtccatgatttaggatttgagaattagctaaagacgatcactgataggtataaacttaaaaagaaaatgctagaatttgtgtttattgctgtaatttgctgttttccccaggaattgttggcacttggtgaacgcattgggtatgtaaacactggacttagtgaggataaaattaggactggtttgaagcaatggaaatatgtgagcataccgattgaagaacctctaactggtgttgaaccatgctgtatttgccaggtaattcgaagaccctatattttctaaacttgttaggtaatttcttgattattcttgttctgtttactgcttctgctttaagacttgagaggtataggtaaggaatgttaatgagtggtgaaaagcaattagtccaattgattttagcactagtttgtagattaggctgcatctctttacaatctgtattctgcagtggttaatttttgtataaagtccaaatagaaagtgcttatttgtgccaaattagtatagagtccaaataggaagtgcttattttgaatgagcctcttctatagtttgctaattgctctcacagtagcggttaattctagatgcagtcgactttgtttgttttacatagatccatatgccagaattacctttttaaaggcatgtacaatgcaagatgcttgcagttggggcttattgagagaatgcagtgacatcaccaaacatccattggagcacgtgtctgattttagtttagcaccttaattgtatcttattgccttgctgaatgtgcattgttgggtcttgcaggaagaatatgccgaaggtgaggacatgggcagactagactgtgggcatgacttccacaccgcatgcatcaaacaatggctggttataaaaaatctgtgccctatctgtaaaaagacaggactgggcacttaattttgcgtgcttccgcctgcgaggaaagcggataagcctctttagaccgagtggttggttataaggcatgttacaccttccaagatccaacatacaggtggaatttatactatagggtggtacatggtactttaccagaaaggcgatggttgtagacctggagtttctttttcccttttgtttaaacctagatttgaagtttaaaatttattcaataacattcaattgcaattgggcatttcct</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001058727.1 RefSeq:Os04g0185500]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 4]]
 
−
[[Category:Chromosome 4]]
 

Latest revision as of 07:47, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information