|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os09g0533100|
| |
| − | Description = Similar to Pantothenate kinase 4 (Fragment)|
| |
| − | Version = NM_001070301.1 GI:115480344 GeneID:4347680|
| |
| − | Length = 8761 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os09g0533100, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 9|Chromosome 9]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 9:21761270..21770030|
| + | |
| − | CDS = 21761270..21761309,21761807..21761862,21762452..21762568,21762736..21762855,21762945..21763039<br>,21763127..21763220,21763441..21763572,21764225..21764337,21764458..21764648<br>,21764983..21765196,21765815..21765856,21765937..21765985,21766478..21766560<br>,21766721..21766837,21766928..21766991,21767092..21767237,21767368..21767521<br>,21768078..21768161,21768242..21768436,21768542..21768613,21769497..21769586<br>|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008402:21761270..21770030
| + | |
| − | source=RiceChromosome09
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008402:21761270..21770030
| + | |
| − | source=RiceChromosome09
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>tgtttagacttcatttcttccaaacaactacatcgtggcggggttgattcaccttcgtggcgctcaggagctcagcctgacaacattgtaatcaaggcaacaggtggtggagcattcaaatatgctgatctcttcaaggagagattgggagtcagtcttgaaaaggaagatgaaatggactgccttgtagctggagcaaattttttgctgaagtctatacgccatgaagcctttacgcacatggatggccaaaaggaatacgtgcagattgaccagaatgatctgtttccattccttcttgttaatgtggggtctggtgttagcataatcaaggttgatgggcatggaaagtttcaacgagtaagtggaacaaatgttggtggtggtacatactggggtttggggaggttaatgacaaagtgcaagagtttcgatgagttactagagctgagccagcgtggagacaacagcacaatcgacatgcttgttggagatatatatggtggtctggactactccaagattggcctttcagcatcaacaattgcctctagttttgggaagacaatttcagatgacaaggaactgtcagattatagaccagaggatatttcactctctctgctgcggatgatttcttataacattggtcagatttcctatcttaacgcactccgatatggacttaagaggatattttttggtggattcttcattcgtggtcatgcctacactatggacacaatttctttcgctgtaaatttttggtcaaaaggagaggcaaaagccatgtttctgcgtcacgagggttttctaggagcacttggtgcatttatgagttatgagaagcatggtcttgatgacttgagaatacatcacttggttgaacgcttcccaatgggtgctccatatgttggtggaaaaattcatgggcctcctcttggggatctcaatgagaagatatcatggatggagaagtttgtgcagaagggtactcagattacagcacccgtacctgttggatttcctgtgacaacaggtatgggaggttttgagaggcctaccgccaagggagacattttgcggtcagatgcaagtgcagctctgaatgttggtgttctccatcttgtacccacattggatgtatttccgctgttagaagatccaaagatgtatgaaccaaacacgattgatctcgacctgaatgagtacaagtactggttcaagattttgtcagaccatttgcctgaccttgtggacaaggcggttgctagtgaaggtgggactgatgatgccaaaaggaggggtgacgcattcgcacatgctttttctgctcatttggcaaggttgatggaggagcctgctgcttatgggaagtttggtttagccaacctgttggagctgagagaagaatgcctgagagaattccagtttgtcgatgcatatgttagcattaagcaaagggaaaatgaagcttcactggctgttttacctgatcttctgatggaacttgatagtatgaatgaggaagctagattgcttgcactaatcgagggtgtccttgctgcaaacatatttgattggggctctcgagcttgtgtggacctttatcacaagggaactataatagaaatttatcgcatgagccgcaagaagatgcaacgtccttggcggattgatgactttgatatgtttaaaaagagaatgcttgctgataagaagggccaaccatacaaaagagcactgctttttgttgataactcgggtgctgatgtggtccttggaatgattcctttagcacgggaattattacgcaatggaactgaggtggttttggttgcaaattcattgcctgctttgaatgatgttaccgctaatgagcttccaggaattgtggctgaagctgcgaagcattgtggtatacttcggaaagctgcagaggcaggtggattgatctttgatgccatggctggcatccaagatgatctgaaagatgaaccagtatcagttccccttatggttgttgagaatggatgtggcagtccgtgtattgatttccggcaggttagctcagaacttgctgctgcagcgaaagatgcagatttgttaatcttagagggcatggggcgatctctgcataccaacctcaatgcccgttttaagtgcgatactctgaagctggcgatggtcaagaatcagagattggcagaaaaacttttcaatggaaatatatatgactgcatctgtaaatttgaacctgttccttga</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>CLDFISSKQLHRGGVDSPSWRSGAQPDNIVIKATGGGAFKYADL FKERLGVSLEKEDEMDCLVAGANFLLKSIRHEAFTHMDGQKEYVQIDQNDLFPFLLVN VGSGVSIIKVDGHGKFQRVSGTNVGGGTYWGLGRLMTKCKSFDELLELSQRGDNSTID MLVGDIYGGLDYSKIGLSASTIASSFGKTISDDKELSDYRPEDISLSLLRMISYNIGQ ISYLNALRYGLKRIFFGGFFIRGHAYTMDTISFAVNFWSKGEAKAMFLRHEGFLGALG AFMSYEKHGLDDLRIHHLVERFPMGAPYVGGKIHGPPLGDLNEKISWMEKFVQKGTQI TAPVPVGFPVTTGMGGFERPTAKGDILRSDASAALNVGVLHLVPTLDVFPLLEDPKMY EPNTIDLDLNEYKYWFKILSDHLPDLVDKAVASEGGTDDAKRRGDAFAHAFSAHLARL MEEPAAYGKFGLANLLELREECLREFQFVDAYVSIKQRENEASLAVLPDLLMELDSMN EEARLLALIEGVLAANIFDWGSRACVDLYHKGTIIEIYRMSRKKMQRPWRIDDFDMFK KRMLADKKGQPYKRALLFVDNSGADVVLGMIPLARELLRNGTEVVLVANSLPALNDVT ANELPGIVAEAAKHCGILRKAAEAGGLIFDAMAGIQDDLKDEPVSVPLMVVENGCGSP CIDFRQVSSELAAAAKDADLLILEGMGRSLHTNLNARFKCDTLKLAMVKNQRLAEKLF NGNIYDCICKFEPVP</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 9]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>1..40#538..593#1183..1299#1467..1586#1676..1770#1858..1951#2172..2303#2956..3068#3189..3379#3714..3927#4546..4587#4668..4716#5209..5291#5452..5568#5659..5722#5823..5968#6099..6252#6809..6892#6973..7167#7273..7344#8228..8317#tgtttagacttcatttcttccaaacaactacatcgtggcggtatgcaaccatttctttgtattgttaaaaatcgaaatcatttatgttttggggtttggattgtccacaaattttgtgtactaatgttattttaatactgcaaattgctttggtggtcatagattgatgtttaccacattatgaacagggatttgagaatatgtagatagttgctagagttactaatttacttttatcacatgcatttatattagcaatttcaagttggccattatcttctgtgtttggctgaattgtgccctgaatatctttattatgatggcatacttgagtttgttcatttcatgttttttcacattcttcattgtcctgtccattctggaagtttaccagctgtctaatttgctagagtttggctgaatttgatacttaaactgtgatcatcacatttttgtccacatggtttcctaaggttttgttagtctaggccgttggcctgcactttcttagcattgagtagaacttttttgctgcaggggttgattcaccttcgtggcgctcaggagctcagcctgacaacattgtaatcaaggtgacaaataatgagacagcaccctttaggtttatgaaagtttgtttggtcaatgtttcgattaatgtttgttattgttcattagcacttgaatatttggatagcaatccattattctcaatctaccttgtgttgttggtgtagatgatttcaacctatggttttggtgaataacaatcataacgctgtagaacaacttgtagtaaaccatgacaagaataccttccttcccatttccccaagattagctcttgtatagcacttgaatatttggctagcaatccattattctcaatcctaccttgtaggtgttgttgtagatggtttccacctatgattttggtgaataacagtcattacactatagaccaacctgtagtaaacagacaagaatgtcttccttcccatttcccaagattaactcttgtgtcataatgactgtatctcatagaagcaaagtctttttcccccacttatcaggaacagactgcgtactgatgttttcatgtacaaaatactgactgagttatcattatcttgatggcattaaagttatatattttagttgactatgatattttgtggaaaggcaacaggtggtggagcattcaaatatgctgatctcttcaaggagagattgggagtcagtcttgaaaaggaagatgaaatggactgccttgtagctggagcaaattttttgctgaaggtttctatctctgagttaccctaccctatttaggttgagactattcagttttatattctatatgatctatgtaatggactaaggcagtaagtcatatttcaaatttatctgaagattgttcacattcaaaaaattaaattacattagtaagacttatgtgttttcagtctatacgccatgaagcctttacgcacatggatggccaaaaggaatacgtgcagattgaccagaatgatctgtttccattccttcttgttaatgtggggtctggtgttagcataatcaaggtaccttgcagtttttttttttaaatatcttttttggattggacttctttttttggtttgctggattttgttggtcgtcgtttttgaaggttgatgggcatggaaagtttcaacgagtaagtggaacaaatgttggtggtggtacatactggggtttggggaggttaatgacaaagtgcaagaggtatttcttcttctgctcatggacatcatacatttctgttgagatctgagaagtttgagaactcctaaaagtatgattttctttcagtttcgatgagttactagagctgagccagcgtggagacaacagcacaatcgacatgcttgttggagatatatatggtggtctggactactccaaggtaatagcaccgatgatggaaaccgtcttgttaacatttcatgttccataaagttatcacacaatgtagacctatgtttgaaactataaattgttaaaatctgctagtcagacttggtacttgcacaactcacgatgtgtcagaaacttcagaatagaggtccttcaagtgcccaattcttctttcttactaattgctgcgtgcttcttctttatggcagattggcctttcagcatcaacaattgcctctagttttgggaagacaatttcagatgacaaggaactgtcagattatagaccagaggatatttcactctctctgctgcggatgatttcttataacattggtcaggtatgacaaataatgataactatttgatacaagtggcccaatcttcatcagaatttttccatagagatgcacatttaccatttcttttataaatttggaagtttgaaaaagtggtccaaatattgtagcggtgagtctaattccacacaaacaacagtaatcttatctgaaaaagaaaatcaatagaagaacataatttttttacttgtattttgttatgttgtgttctttaatggaaaaaaaaggtggtataggtgtcagtagggttggaaaaaatgagtctgggtagtaatactgccaaagatgatattagatgacaattctaaacaatgggttttggtgttaagggtctattatcacttcctatggctcaaggtagtgatttaggataatgtgtgttgttacctattgtaggatgtaggctaatagcataatgtgctcaaagctggtgttaatttgtcttccatgttccgggttgagtttatggtgtactgatttttcaaaaatatatttagccaaaggatttacaggcccattgaattttatcagtggctgtatcaattgtgatgttaattctctcgtttattttactgctttttccaacttttttgcctctttccattgaagctaattcaattgttttggtttgtagatttcctatcttaacgcactccgatatggacttaagaggatattttttggtggattcttcattcgtggtcatgcctacactatggacacaatttctttcgctgtaaatttttggtaaaacttccatataggttcttgtttttatgttgctcgacagtagcttagcttattttgaaaacagtttcctccacaagttctgttcaagaaaccaacgtatgctatatatttgtaaaggtcaaaaggagaggcaaaagccatgtttctgcgtcacgagggttttctaggagcacttggtgcatttatgagttatgagaagcatggtcttgatgacttgagaatacatcacttggttgaacgcttcccaatgggtgctccatatgttggtggaaaaattcatgggcctcctcttggggatctcaatgagaaggcaagtacatctactcttgatcatggtaaccttaatggttttgttggtcattggggttttagttgttttagaacaaatttattgcttgaaagaagtccacattgaaatggaaaccacactcatccaactaaaatgaacacatgaactgaaacgcacactcttggacttctttttcccccctataaacagctgctgggatgagttgaaatcttttccacctgttgttactcttggctcgtggttaacattctctggctccctgttattctgtttgatctattcatcatgtatggctgctagattaataatcatgtggaactgtacttcttcccagatatcatggatggagaagtttgtgcagaagggtactcagattacagcacccgtacctgttggatttcctgtgacaacaggtatgggaggttttgagaggcctaccgccaagggagacattttgcggtcagatgcaagtgcagctctgaatgttggtgttctccatcttgtacccacattggatgtatttccgctgttagaagatccaaagatgtaagccacagtcatccagttctctataacaattattgcaattttgaaatataagggtacctgcagtaaattcattatggaagctggaggcacacttttggtactgtaaaaggtccaaaaggttgggtgaataatgggtaatttgcctcaaaaagctaaagaaagcatcaaagtcatcacttctcaaaacatttttaggcagaagtaattgagatactttagcatattatctaaatatttgaaattgcagtctccattttttttaatataaagagctgcactgcaccccagccaaacagaggtcttgatttgaacttaagaatcatcttgtgttagctcagggttaagaaatatgagctctttcaccgaatcacctaagcagctcttactgtatttaccaattaaaacaatagtagtctatctatagttctataccttttttctgacattgtggatcaacttatttaaagcatttttatcctacatatacatgccaaaattgcttgaggacaagtggttttattgtgcataagcttgctgatggtctgatggaacaattgccatgtgcagctcaattttagatcatgcgtaagttgtaatatattatctgtattgcaggtatgaaccaaacacgattgatctcgacctgaatgagtacaagtattatttctgcttcccctatttctagatatcttgtaggaattgaatcatttgatgatatctgagatgtacaatgccaggtactggttcaagattttgtcagaccatttgcctgaccttgtggacaaggtatggtgtacttcttgcaataaccttgtataacttacgagataagacaccagagttttctttgacaatatggcttagtgataattatttttttcatgctcccctccctccatatgagtgtgcatgtgtgctgctacctatctcatcctgttcctaaaacaatgtcccattgggtcctcataagttatagctaaatacaagccccaataacatgccaccagtttgcagtattttttttattgcttttgttggtttacacctaagaatgattatactcactcaaatgttcccacaaactcaacatttcttattaagaaaatttggcattataactagtaacaggtcaatcaatattatacgttataatttatttgttagcaatttatgaatacacaagtaactgtttatgttggaatctccacctcaattcctcttgtgaatgtgtgaaaaatgttcttttttgtactaatgtgcgcatgttattgttggtaggcggttgctagtgaaggtgggactgatgatgccaaaaggaggggtgacgcattcgcacatgctttttctgctcatttggcaaggtacgcagttgccattacatgacattagttagtacggagtatatttcagttttcttcattcaaaatcgagcattgataatctgttagtctgtaaagattgatattgtaaaactcattacactatgtcacttagcttcctaactcttttggttaagtttaggttgatggaggagcctgctgcttatgggaagtttggtttagccaacctgttggagctgagagaagaatgcctgagagaattccagtttgtcgatgcatatgttagcattaagcaaaggttagttcctgtctttctcgctctttatgtgtgtacgttcatgtgttcatgtgcttttatctaatcttacggttttaattgtgtgtgaagggaaaatgaagcttcactggctgttttacctgatcttctgatggaacttgatagtatgaatgaggtaggagatagcagggcttgtcattcaggcgtcattctgcttagctcagcacccaacagaattgatctgaatatttgttgttgtgcaactatgttttcaggaagctagattgcttgcactaatcgagggtgtccttgctgcaaacatatttgattggggctctcgagcttgtgtggacctttatcacaagggaactataatagaaatttatcgcatgagccgcaagaagatgcaacgtccttggcgggcaagtattccaattctgaccttttaaatgttatatttgtactgcaagatttacccaaagtttcaaattacttgcaaacttcttttttataattgctttgctgtgtttatatttttgtctcttatttcagattgatgactttgatatgtttaaaaagagaatgcttgctgataagaagggccaaccatacaaaagagcactgctttttgttgataactcgggtgctgatgtggtccttggaatgattcctttagcacgggaattattacgcaatggaactgaggtataagttaagaaaaacaataagctaaagacaagtcgcccttttgttatctttatgcacatttgtgttcaaattataggtaacagacatgatgctgtttcaagagatttaatcatggaaacaggaaagtttggatattaacaatgtatttaattaacattcctgtgttcctgcacatcaaagtacagtgaatgatagattgggagattgtcctttataacctagaattgagatgacttataaattttaccggccctgtgaaatattccttccgtttataaacatgtcgttttagacattgacatggtttccaagatgcaaagttgaccactaatttctattttagtatatttgtataacccaataaaattgtaatattatgaaagtggttttcgagacaaatgtacatatcattttcacgcatccaactattaaatgtaaaaaaaaaatcacacacctttattatagtccattttaatattatttgagtttaattgtatcagatctgatatccatacagttgacttgagctggtaacaaaatgttgattttgtaggtggttttggttgcaaattcattgcctgctttgaatgatgttaccgctaatgagcttccaggaattgtggctgaagctgcgaaggtacaaatgaatataaattctattttcttgtccatcctattgttatcttaagttctgttgttgcttgtaatgtactacagcattgtggtatacttcggaaagctgcagaggcaggtggattgatctttgatgccatggctggcatccaagatgatctgaaagatgaaccagtatcagttccccttatggttgttgagaatggatgtggcagtccgtgtattgatttccggcaggttagctcagaacttgctgctgcagcgaaagatgcagatttggtaagatagactgtagctctttgaactgaatgcattttctcatgtaaaataaattggaaagttatgtggtttgatatatcggttgttgttttaaatgttgtgcagttaatcttagagggcatggggcgatctctgcataccaacctcaatgcccgttttaagtgcgatactctgaaggtacttgtttctgcaaacagctgatttattgatgcgcacaattacaaacttgtcattcccttggctaaataccagtacaaagtaactctgctgtaattattgtactgaatatcttggaaaaaaatgttgaatcaacagtgtgaccagtatcggatctagaattattttagagcccgggcaaacttcactatagctagtatttattaccgaaattatatctcaatttttcctaattacatggaattttagtggattatccgctgacgagcctgggcagctgcctggggtcgccaggtggtacatccaccactgagtgtgaccatggtagggatgtacttacgatagagacaattctcaaatgcaaccatcagaggaaaaatacaataaccttgaatgaaatatgcaccatttggtcaacagccactgcgttgctgaatgctgacactttgctagcgaccactgcactgccagagccctgcttgcacgcctcagtcctcaatcgacctcccagcatgccagcaccaatctctgcccagatttgggtagagagtggtggtggtggagcaacaccaatggtgtgggagtggaggtataagagtaagaaagtccggaagtggacaatatgggggaaggggagtgcttagtaggaggaaaaggaaaaatattttaaaacagaacttttaaggtctaacagcgtagttgctttttgaagtaatggttctggcatctatgggttgaacccaactggaaatttattgccttacttgtcagtatgttcgggattgataagaaggctacattaaatctttgaataattgaattgtggtgtcatacttaaatcttgtgtgtttttacaaggttaacaaaatgactttatttgcagctggcgatggtcaagaatcagagattggcagaaaaacttttcaatggaaatatatatgactgcatctgtaaatttgaacctgttccttgaacaatgcggaagaatgtgccgtggatttggtttgctctagcacagaagcagctaataacaggtactgtgacactgtcagcacatcactttatcttatatggcactaaaattgtttgctgaaatgacgacttcgatttgtgcagaacctagataataatttgttcttaccagttttatcattttactgtaatttgcaggtacatctcacttaatctgtaaccagtggggtcatggtattagcagtgtcacatatccaagcaaaaagccataagaacaaatttcttatataagaactaaaagatcctctcaatgtactaaatgctcctttagatggtaaagaatcaaagaagtgttgttgacttgttgtgaatattgttatcaaaacaatttttctgaacatggagtagcgacataataaaggtttttaaagaatttgtagaaagc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001070301.1 RefSeq:Os09g0533100]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]]
| |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 9]] | |
| − | [[Category:Chromosome 9]]
| |
