|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 4]] |
| − | GeneName = Os04g0489100|
| |
| − | Description = Lipase, class 3 family protein|
| |
| − | Version = NM_001059690.1 GI:115459109 GeneID:4336232|
| |
| − | Length = 8991 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os04g0489100, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 4|Chromosome 4]]|
| |
| − | AP = Chromosome 4:24830035..24839025|
| |
| − | CDS = 24830688..24830769,24831575..24831997,24832148..24832366,24832487..24832584,24833032..24833162<br>,24833362..24833483,24834400..24834554,24835285..24835390,24835637..24835728<br>,24835808..24835929,24836753..24836853,24836939..24837158,24837482..24837620<br>,24838537..24838893|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008397:24830035..24839025
| |
| − | source=RiceChromosome04
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008397:24830035..24839025
| |
| − | source=RiceChromosome04
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggcgggcgccggcgaccccgtggccgctgctgcggtggcggcggcgtcgtcgtcggctggcgcggccgccgcctccttccggctcgggatggtgcgggtggtctcgttcctcgtcgggggcctcaacgtggccgtgctgctgctcgggctctacctcatcgacggcgtgctcccaccggggtgcggcggggggctcgcgctcgccgcggcgcccgcgctggcggggatccgcgtgctcgccatgatcggcaccgcgcgcgcgcagcacgccacggcggatgccatcgcgaggcgccacctcgacgaggccgcagcgtcggtcgccgctgacgccgttgcgcgccacgagatcagggtgaggtataaacgctggttgtggtggactagattcggcatggcagtgggtgcaatgcaattggttggggcaatttatctcatgcttgtcattgtcagagatatttcaaatgaaagaagagccacttcctgtttctttggacaggatgaagctgatcatgtctcgaaacgagcattaattgctttgtttcttattctttcctgggttgtggtcgttgtccaatgcttcacgggttctgatatattaaggtggaggtcgttctatgcaacacatgacatggcatggaaagctcattacagggaagtgttcgatcatggaattcgagaagctttatgctgcctagggcgtgcaaagtatctaaccgtattggaagaggatgaggtttactctgtggcaagacttctgggtgatttggttgcatatcgtgcttctgggacaggacatttggaacttttagcagggcttgcactattacagaaaaatgaaaatttgcctcatttgcaaactgaccttacggaagcgccactgaaccttatgcaagaagctgctatccttcatccctttgctgaagcatgttacacgggacctctccttgatgttgggagaaaccctattttgtttccatgtgcatgggtttacagacaaggtgttttaactccatggtcgcgcagaaggcgccctgcacttgatggtgacaactggtggcgagggcatgctgccgctttccttcgatttgttcacataccagctgcagcacttctacggggccgtgtttgccagagcaagagggaagctgcttactttgtcgtggtcctccatgacaaaaagacagttgttattggagttcgtggaactgaaacaccagaagatctcataaccgatggattatgcagagaatgtgcatttactatggaggatttggatggactagtaaaatgtgaacagttacctgcaactacaagggagagagttatttctacctttccgcattatggacatggtggaattctagagtccgccagggagcttttcatgcaactcaacgactgcacaggagataattcgtcatccctaacagttggatttcttcctgcactggtgggggaaggcagtgaatgccatggatataaaattcgagttgttgggcattctttagggggttctgttgctacagttcttggaatgatgctttttggcaggtatccaaacgtgcatgtatatgcatacggaccactaccttgtgtggactttgtaatagctgaagcctgttcgcaatttgttacaaccattgtgtgcaatgatgagttttcttctcgcctttcaatcaactcaattctgaggctgcggtctgctgcaataagggctctttcagataactctccagctgatacagcaatgatacagaaacttgctcgcagaattttgaatgttaacaagtatcatgataatggtcctgatggtggcataatggaggactatagtgctaggcaccacacatttgaagggagggcagtatctactgaacgacggtttcctcaccaggatgcaccttgtacttctgagccagacctcccaattttgcaaaatggcatcaatgggtataatgggtctaattcatccatagatgttatgagctctcagggtctacatactgattgtgatgcccagacaatttcccttcatgggctcgattctggttcagaacagcgtcacacatcttatagggatataccagttgagcctcctgaaatgtttcttccaggcctagttgttcatatagagcggcaaagaagaagcctcttccctctttggaaatgctggagcttgcagggaagtgaaccaccatataaagctttttttgcaaaaagggagaacttcactgatcttgccgttactccttcgatgtttacggatcacctaccatggaggtgtcactatgcaatgcagagagttctggaagcgcaaacggcagcaagttgtcctgattcaccggtagaacgtttggtctga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MAGAGDPVAAAAVAAASSSAGAAAASFRLGMVRVVSFLVGGLNV AVLLLGLYLIDGVLPPGCGGGLALAAAPALAGIRVLAMIGTARAQHATADAIARRHLD EAAASVAADAVARHEIRVRYKRWLWWTRFGMAVGAMQLVGAIYLMLVIVRDISNERRA TSCFFGQDEADHVSKRALIALFLILSWVVVVVQCFTGSDILRWRSFYATHDMAWKAHY REVFDHGIREALCCLGRAKYLTVLEEDEVYSVARLLGDLVAYRASGTGHLELLAGLAL LQKNENLPHLQTDLTEAPLNLMQEAAILHPFAEACYTGPLLDVGRNPILFPCAWVYRQ GVLTPWSRRRRPALDGDNWWRGHAAAFLRFVHIPAAALLRGRVCQSKREAAYFVVVLH DKKTVVIGVRGTETPEDLITDGLCRECAFTMEDLDGLVKCEQLPATTRERVISTFPHY GHGGILESARELFMQLNDCTGDNSSSLTVGFLPALVGEGSECHGYKIRVVGHSLGGSV ATVLGMMLFGRYPNVHVYAYGPLPCVDFVIAEACSQFVTTIVCNDEFSSRLSINSILR LRSAAIRALSDNSPADTAMIQKLARRILNVNKYHDNGPDGGIMEDYSARHHTFEGRAV STERRFPHQDAPCTSEPDLPILQNGINGYNGSNSSIDVMSSQGLHTDCDAQTISLHGL DSGSEQRHTSYRDIPVEPPEMFLPGLVVHIERQRRSLFPLWKCWSLQGSEPPYKAFFA KRENFTDLAVTPSMFTDHLPWRCHYAMQRVLEAQTAASCPDSPVERLV</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>8257..8338#7029..7451#6660..6878#6442..6539#5864..5994#5543..5664#4472..4626#3636..3741#3298..3389#3097..3218#2173..2273#1868..2087#1406..1544#133..489#gggcctcgtcccccgctcctcctcccccaccttcgtcgcctcctcttccccctcctcccccgccgccgccgcgccccctcctcgccgccgccgccgcctgcatcccgacggagggccgccgcggccgccgccatggcgggcgccggcgaccccgtggccgctgctgcggtggcggcggcgtcgtcgtcggctggcgcggccgccgcctccttccggctcgggatggtgcgggtggtctcgttcctcgtcgggggcctcaacgtggccgtgctgctgctcgggctctacctcatcgacggcgtgctcccaccggggtgcggcggggggctcgcgctcgccgcggcgcccgcgctggcggggatccgcgtgctcgccatgatcggcaccgcgcgcgcgcagcacgccacggcggatgccatcgcgaggcgccacctcgacgaggccgcagcgtcggtcgccgctgacgccgttgcgcgccacgagatcagggtgagaactcgagctccttgccggctagcttaggccactttagttgggtgatttgctcggcttaactctgacgtatcgtaaagtcgtgataaattgtgctttgatttcagttggttcaaccgttcaaggataaaccaacgcatttttttgtttgtttgtctaggtatggttacaatacgggattatttgagacacgatcaatctgaacaagtggacttgatttcaccatttatcagaattttgaggcgagttaatgcaaatgcgtgtaactgacgggagttgtcaatggtgctaagatacagcgtattaagcttagatgaactgcgaatacatcttattaagagcttttatctgatgcatatggctggaggacaatgtgcttatagccaaacactatgaagcgactcagtgttacactgtgaccgtgagcttgagcacctttttattagatcacagagacctgacatgagggtttagggttaagatttcgaattggaatctaatatcatatttgtggatttgaattgttttcctgccacttgttggcattctgcattgttcaaattgagttcattaactttgtaatcatatttaatctattgatataggtaatcataaactttttacaataaacaacacgcattaatatcattataaatctggagaatattgttgacgatatatcagtgaggatcatggattcatagttcttaactctctagcatagcattataaatctgtaatctggataccatcctttaagatgtatcagtgaggagggctcagaatattctttatgggtactgatgggatatttgaattctgccatagaagctagagtaggtgtaagaagagtagaatttctactgagcacttatttatcatactgctatttctgttttgttttgctcaacaggtgaggtataaacgctggttgtggtggactagattcggcatggcagtgggtgcaatgcaattggttggggcaatttatctcatgcttgtcattgtcagagatatttcaaatgaaagaagagccacttcctgtttctttggtatgtttgagtcagatgatcagatcctgtcatatatctgtagtgcatttcagctgtgaatggtgaacctttgttagatgaaatctttctgccaagtaaactttatacataaacattactggagccttctccccttagagtttccaaatgaaaaaaaaatatgggtaaaaagtgtcaataacttttgcctttacttaatatagtactaaattatgataggttttgatggcactagtattttatccactgcctacttgcttatgattttttgtcctgctccatcaattctgttcaataattggcctgccttgctcgcaatctaggacaggatgaagctgatcatgtctcgaaacgagcattaattgctttgtttcttattctttcctgggttgtggtcgttgtccaatgcttcacgggttctgatatattaaggtggaggtcgttctatgcaacacatgacatggcatggaaagctcattacagggaagtgttcgatcatggaattcgagaagctttatgctgcctagggcgtgcaaagtatctgtaggtcactacctattctttttatgctgagaaatatcactatttatttacctatatgagctagttgtcttacatactgatgcagaaccgtattggaagaggatgaggtttactctgtggcaagacttctgggtgatttggttgcatatcgtgcttctgggacaggacatttggaacttttagcaggtcagttttctgtttcattgctttcacattgaatatgttctgtgtcctatttggactttcaaaattaaatttgatgccaacacacatgatgacatgaatattctaaattttgtcacttaccttctaaagacgtgcacagctatgtaggtgtttaggttttcaataagcagtgagtaaattctactaggctcaattgtaccattcagaactccaacataaacttccgtttttgttaccacctacttgtagtcatatgtgtgcaatctgtccacctcctaaaaacatgacttatgtacaaaatctagagaggaatctatttagcacagaaaattggaggtgagtaaattgtaagacagtaatacagtgttcccgatgaaacccctctcattgcaaaaatctataatacatatattgtgaattcagatgtttaaatgaatatgtataagttacattcttcataggatatagatgggtttggtgcaatttacttgatagaccacggaaatttcaatattgcaaaaagagtacagagcttaaagtgctgctctgtttggagttaaattacatagcaccatgctttcatcttttctactttgagtagttgcctgctagcggttaggttaccatggatagttgactaaacaggaccagattctccgcatgggttgtattgccgtgtcactttatgacaaactattttatcagtataatgtagactgttatgagtgtacaagcatcacatatgatttttttatggaattccttgttattgtcactatattgagagcatactaaggatccatttttacggtgcatgttttagggcttgcactattacagaaaaatgaaaatttgcctcatttgcaaactgaccttacggaagcgccactgaaccttatgcaagaagctgctatccttcatccctttgctgaagcatgttacacggttggaaacactatctaactggaacaagtttaatacctcccttccttgtataattgcatttgacgtggtattatttcagggacctctccttgatgttgggagaaaccctattttgtttccatgtgcatgggtttacagacaaggtgttttaactccatggtcgcgcagaaggtatatctcctgaactctcttatacttctcagttgtgtgtttattgccaaatacccctatggttgatgatcctctttttggccagttcagctggagattttgttcggtaaaatgtgaagcaagctaaatttgatttttattttgcttaatcctccttgaactggaccaactgttacattgagataagtttgaacatcttatgctgttcttgccttatatgacatccacatattggtcttcatgcaggcgccctgcacttgatggtgacaactggtggcgagggcatgctgccgctttccttcgatttgttcacataccagctgcagcacttctacggggccgtgtttgccaggtaacacgagtttggataaaattggaatttataaactaaaattgcaatgatgaaaaatatatttcagccaattatgcaatcgttccaagtgacatttgtaacctgccacatgttaatgttactttagctcatagttgatatctactttatggatcccgcctgtacctaattatgtacatttcgacgttatttggtgaattggttaaagtaagccatcctttaggttgcagtaatgtacttcacataccttaagtagctgtgtcatgtgcggcacatgtatacatgccatgcttggtgacccaggcaaatgggcctgcataaatagaggttaagagataagcatccctatgttttagtcaatagaggcaaatcatgtattgaaggctctatcatgctttaccacctttgcagccctcctgctcattctcctccctagccatgttattaccagttcactatctatggctcctggctggtgaggcctttgcccaacgcacacattgccacatttacctcatacatgccctctgggaatgcaacgaactgagagcctgagagtaatgtggatgaccaaatatgtttgccgtactgtgctgattttgttgttacattagacatgcttacagttgaagggaggcattgaaacccagccatacttgataaagagcatagcacggttggtttttcagtaaaatcattgaacttgatttgattctttttatgtatgcagagcaagagggaagctgcttactttgtcgtggtcctccatgacaaaaagacagttgttattggagttcgtggaactgaaacaccagaagatctcataaccgatggattatgcagagaatgtgcatttactatggaggatttggatggactagtaaagtaattccctcttgatagccatctcgtctattcttatctaatctttctactcttgtggtcaaaattagtctttttttttcctcacggactacttgctgcaagccatttgctgatagttaaataccaatggtcaaccctgtggtgctctgattagcattcacatgattagaagaacatgaacaatcacaaaatgatttaacctgaaatttcaaaattaattattctgatccttaaactcctgctcttctgaacttattatactaattttcttatttacttctacttgccagttttgattatttttgccatcatatgatcagttttctcaatggaacacgatgcaatgcaagttgttttgtaccgttcaattgcatattatagggtttattgtgttaatcaattggagtttatgtggtaaatatgattataatggcgaggttctattgaaggctcataggaaaatacatctgaaatatcaccatttgtcaaagtccacaacatgtacacccaagctttatgttactggtaatcaaatcagataatttgatcttagtgatggacgtaagttgtccagttgatctaccttacttaattgtctgttcacattccatttaatttggcagtccactttgtttacatcctcgaattgtttgtgaagtaaatggcctaggatgggtaaatgggtcagccaaaccagatactcttgcatccctatttgacctactttagtacagtgtatgagtgtataatatcttgaagtaaaactgatagaaggatgagaattaattagttcatgaggttgagggaccactttagaaactgtgcaacgttttcagggagcaaacctatatgctggccattttattgtgctatctactgtccacaatctgttttgttgacactgctaattcttcagatgtgaacagttacctgcaactacaagggagagagttatttctacctttccgcattatggacatggtggaattctagagtccgccagggagcttttcatgcaactcaacgactgcacaggaggtgctagtctagttactgtttgttgtctgatattgcaatatttgactgtttgcagcagaatatgtactctttgtttttaggaaactagtacctcatattagaagattagatgcaatgtgtgtgttaatattgttaatttaagtacaataaatgactatagtggctaatctgctcttctcttgtcacaatgccaacccagataattcgtcatccctaacagttggatttcttcctgcactggtgggggaaggcagtgaatgccatggatataaaattcgagttgttgggcattctttagggggttctgttgctacagttcttggaatgatggtaatgctggctgaatcttcaccttttatctttagcatagcatgttgttattaatcatattctttctgcagcctgacattacctttttctgatttccctattgaccaacatccttctgcaccgctataaaagtgggttactgtagtataggcattatatacgacaacataaagaacatctatgactatcccattaagcttgtctgaactacgggaacagcagagtcatctgtgtgtgtgtgttcgcgtgtgcgcatctgacgtattgcccaaaaggccaaaacttctcagtgaactttgtctggaccaggtcatcgtatgattgttgatttgtatttttgtttttgactttctttaattccctgcctataattcctaatgagtgttacttttgtttggagtgtatggtgtccatggttctccatagtttaactttgttctctcacagctttttggcaggtatccaaacgtgcatgtatatgcatacggaccactaccttgtgtggactttgtaatagctgaagcctgttcgcaatttgttacaacgtaagactaaactaagaatcaattacaaaattcatttatcaatggttttcaattcatggtgtgttgccctcttgacaatttattaacttctttgagtattcgtttcctcttcctttccagcattgtgtgcaatgatgagttttcttctcgcctttcaatcaactcaattctgaggctgcggtctgctgcaataagggctctttcagataactctccagctgatacagcaatgatacagaaacttgctcgcagaattttgaatgttaacaagtatcatgataatggtcctgatggtggcataatggaggactatagtgctaggcaccacacatttgaaggaaattattttatcttacccttttgttccttttggacaaatatagaagaactgatgactcgaatcaatcttctatgctgttcagaacctttttttaatctcatttgaattttcaacaagtttctttctgaattcattttcactattacagggagggcagtatctactgaacgacggtttcctcaccaggatgcaccttgtacttctgagccagacctcccaattttgcaaaatggcatcaatgggtataatgggtctaattcatccatagatgttatgagctctcagggtctacatactgattgtgatgcccagacaatttcccttcatgggctcgattctggttcagaacagcgtcacacatcttatagggatataccagttgagcctcctgaaatgtttcttccaggcctagttgttcatatagagcggcaaagaagaagcctcttccctctttggaaatgctggagcttgcagggaagtgaaccaccatataaagctttttttgcaaaaagggagaacttcactgatcttgccgttactccttcgatgtttacggatcacctaccatggaggtaagattcgaacagtatttaattataagaaatgcacacataatacagcatattttataggtactacctccatcccataatataaaaagttttagagttggacacagttattaaaaaaataggtagaattaaatggggagatgttatgattgattgagaagtagaagtagatgggaaaagtgaatggtggaagggttgtgattgtttgggtagagaatgttgatagagaagttgttatattttgggacaaattccgagtgctaaaagttgttatattttgggacggagggagtaccttgtatagtagccaatgtactgttgctagtaccttttccatggctatgttgctaagaatttgttggaccatatgacaacaaaacaacacacaaagaatgaatgaagaactgatggttagtccctattgtgttcttatgtttaatgtgcatctcagtcaagtatgcgtgtttgtctgtcatgtcaaatataattttgttgatttctcgtgtgaagtattcatactctgaataggaactccatttctagactggggttttcttgtaatgtcacgttgatttgagttagtaaccttttttgaaaaatgattcctttggagtgcggtagtaaccatttattttcaacagctgttgacaattcaatggtatgcctttgctagttggcttttggcaaactcgccttttatctgcgcacaagaaagttgcatgctcactcagttgccgttacatttgcattgatttatcctaaaaacctagagctattctaatgtactgttctttttaaattttaggtgtcactatgcaatgcagagagttctggaagcgcaaacggcagcaagttgtcctgattcaccggtagaacgtttggtctgaccaggagtccaggatagagttgttctcagtacagctgaaagcaaatagagagaatgtatatgaatgccactttaggagcaatgcagcttcactgaagactgaaggagcaaaattttcacatgctgccagcatatttctatggaaagcagttatgtctgtttacatgagatctctgtgacgacagctctacattccgctgagcttactgacagtcctagactggctaggcaggcaccggacgcatggatcaaaagaaatctgacgacttcatatacagcaaagcaacatcttatttctatctacctacctaccttggcaatgccttgtgcgtgtacattgatcatctagtgcaggcctacaccctgatagtagcggtttgttctcattctttattctgcagccattcctgcttgttcatatccattttttaatttgtgcaagttaacatgatgtacatattcacacgtgttagctagattgactgattgacaggtgaaaatttaaatgtgaatatttaacaccgagatcaactaagatggttacgacattttttttccactgtccagcattttcttatccaatactgcattcattcagagatgtaaaggtatacagtctgatgatgtttgttgattaatatatggcttgtgcgc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001059690.1 RefSeq:Os04g0489100]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 4]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 4]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
