Difference between revisions of "Os05g0349200"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
    [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 5]]
−
GeneName = Os05g0349200|
 
−
Description = Similar to AMP deaminase 1 (EC 3.5.4.6) (Myoadenylate deaminase) (AMP deaminase isoform M)|
 
−
Version = NM_001061804.1 GI:115463338 GeneID:4338495|
 
−
Length = 6854 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os05g0349200, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 5|Chromosome 5]]|
 
−
AP = Chromosome 5:16455454..16462307|
 
−
CDS = 16455966..16456034,16456135..16456230,16456412..16456495,16456700..16456873,16457044..16457154<br>,16457223..16457276,16457348..16457500,16458125..16458265,16459676..16459789<br>|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008398:16455454..16462307
 
−
source=RiceChromosome05
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008398:16455454..16462307
 
−
source=RiceChromosome05
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atggctgaatataggatttcaatctatgggaggaagcaaagtgaatgggacaaccttgcaagctggatagtgaacaatgaattgtccagtgaaaatgttgtctggctggttcagatcccacgcttatataatgtgtacaaggaaatgggtattgttacatcattccaaactcttctggacaacattttccttcctctgtttgaggtcaccattgatccagcttctcatccgcagcttcacgtcttcctaaagcaggttgtagggttagatttggttgatgatgagagtaaacctgaaaggcgtccaacaaagcatatgcctacacctgaacaatggaccaatgtcttcaacccagcattttcatattatgcatattactgctatgctaacttatacacactcaataagttgcgtgaatcaaaagggatgaccacaatcaaattccgtccacatgctggcgaggctggagacatcgatcacttggcagcaacatttcttctttgtcacaatatatcgcatggaatcaacttaaggaaatctcctgtgcttcaatatctatactatcttggccagattggtctggcaatgtccccattaagcaacaactccttgtttcttgattaccaccggaatcctttcccaatgtttttccaacgaggcctgaatgtttccctgtcaacggatgatccattgcaaattcacctgacaaaagagccattggtggaagaatacagcattgctgcttcactctggaagctcagttcttgtgatttatgtgaaatagctagaaactctgtctatcaatcagggttttcacatgctctcaaggcacactggattggcaagaactattacaaaagaggacctacagggaacgatattcataaaactaatgtgcctcacatcagggttcagtttagggacttgatttggagagatgagatgcgtcttgtatacctaaacaatgtcatcttacctgacgaggtggaccagtaa</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MAEYRISIYGRKQSEWDNLASWIVNNELSSENVVWLVQIPRLYN                    VYKEMGIVTSFQTLLDNIFLPLFEVTIDPASHPQLHVFLKQVVGLDLVDDESKPERRP                    TKHMPTPEQWTNVFNPAFSYYAYYCYANLYTLNKLRESKGMTTIKFRPHAGEAGDIDH                    LAATFLLCHNISHGINLRKSPVLQYLYYLGQIGLAMSPLSNNSLFLDYHRNPFPMFFQ                    RGLNVSLSTDDPLQIHLTKEPLVEEYSIAASLWKLSSCDLCEIARNSVYQSGFSHALK                    AHWIGKNYYKRGPTGNDIHKTNVPHIRVQFRDLIWRDEMRLVYLNNVILPDEVDQ</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>6274..6342#6078..6173#5813..5896#5435..5608#5154..5264#5032..5085#4808..4960#4043..4183#2519..2632#ttgaatgttgatttactagatgtccatgcggacaaaagtacatttcatcgttttgacaaattcaaccttaagtacaatccgtgtggccaaagtaggctcagagagattttcctcaaacaggacaatcttatccaaggtatcgcttgtttcaattattttgttgacacttttgtgcatcttaccttttttgttgttgctaaacgggcttgcagtttctcctaaaatgtttgtccttgggagtcatatagatgtatgtccatataaaagcagggtgcattgccttgatgcaaacattatcacattcaagctagtggttacattgaaaactacttgtattttgtaacctctgcttaatcctgtccagttgtttttaatgaagcacagttaccactaatatttccattggtatatcctccagcgttatgctaatgtttttatttaggtcttataagcatgtgattagcgtcatttcatacaaggttgtacctagaagttaaactattgacattttaagcctttgaagtgtaaaccaatgtatttgctagctattttcattatcaccaaatgccaaaagcaaaaatggaagtgtttaagctgttgagttgcatggttgataagttgatgatttgcccaagagatctggttggtcttggttttatgttggtttatggcattttgcataaaaataacaaataataatgcatatcttgctggacatccgctgttgttttttttgtgacctccatgagaatttcttgtcattcaatactacaatggcatccagcaaatgcaatttaagggtaatattttagcaaattgaactccacaggttattgcacaagcgcactagcaaaattaagatggaaacaccacttgagttgttttgttctgtaagagtgcatcacacaaatacttgatcttttgtgtgttggccatgtcacatattggatcgtgtctcacgtgttgatcaatgcccaaagggtgctgggccatgtctcagcttttggaaataaaaattaattttagaaagagcatatgatttggcatgcccttgagatatatgagacagttgcgaagccagaaccaaaacccttttctgaactcctttatagtattggaagttttttgtgttacaagaaagcagtactggattccaaaaaactctgttcacctggcctcacaggtttggacgtgactctgccactgatgactggcatgatgaggttcaatttagttacattatgtatgcttagaggaagtggccattcagcattgctgcctcacaggggtagggaattgtggaaaatcaaaatgaccatatctgaaagtcaatttgtgaatatgaaatggctgtaaggctgttacagatttagtatataatctggcaacagattaatatattgattgattgttaaaagagaagcgatgctatagatcacttcttggataactatatacacaacaaataacctcccaagaaagcttaaacatttttctttaggagtgtctactagaataaatgcacttgtaccttcagatatggcaggtacattagagctgccatagtacatgttcctccataatggtgctaacttcatccaaattctgcagaaaagctgtgaaattcttgcgcttcgtgctcagattttctacagtagccagcttaaagccttaagctaggcctttatattggtatacatttttttctggtgggggatatacattgtttgttaaccatataattcacaccctatctaaaataagttgatttgcggggtttgtaaactagattatatgataagacctaaatatatttggtgaccttatggtctactgactcctgaccatataaatccataacctacccatccttaagcttcagcttctctttgaagaatggacttccacataaatataagctaaatgtaaagcgcttgtttggtactgtttccggtttctatcaagtttggtgaaaaatacctacatattctcatttggaagacttagcgcatattgtatatgtagccacatgcccatgcattgcaagggaattctcaaacccatctatagttgagtttttgtaactgtacgtcctgaaatttcagatgggaatgcatagcaaaggaatgggtgcagagttggaagtgagatggcaaagatgggtaattttagtaaaaaaaatgtgtgaactcaccattacggatgtgttcttttgaagtagtaaagaaatgcacttattctgttttgagagggaatcaccacgattgattactatatccactcgtgtcctatattttatgtttccttgagagctgtcttggttccttttattaacattttatctgttgctgtttggtttaaactaggtcgttttcttgccgagctaacaaagcaagttttctccgaccttacagcaagtaaataccaggtaaactcctcttttttttttggtatatgcaaatgtaatgcttatttgagatatccatatttaacctgctctaatttttgttttcaccagatggctgaatataggatttcaatctatgggaggaagcaaagtgaatgggacaaccttgcaagctggatagtgaacaatgaattgtccagtgaaaatgttgtctggctggttcaggtaccctttcactatttctgctcgtacttagctctagaaatttctataattgtcttgcagttattgaacctacatactctgaattgatttttgtgctttactcatctgttatgtctgcataatgccactgctttgtagtaaagcgtgaagaaaaatgggaatagttaggaagatttacctttctctgctttaatgagggccagccggcctggctgcctgggataccacaattttgtgcttttgttatcttgctgttgttttcttgatttatttctgtgctattactgtaaactagtaatatgcccgtgctttgcaatgggtcaggcccatataattggggaatggggattggctggatgggacatgggtgggtggattgaggagaaagtgatcatacggtggttatgcacacacgaagaagcgcacaacctccgcgcacggtgagaaggggatgaaaggaggacgactgtgcttttaaagtagtacagagataaccatacttttgtagatgtatttctacctagcatttacaatgatgacttagcataatatcaattcttatccatggctgttttcaaatccataagctaataaccggtaggttgcatttttttaatttcatttgactagttctgttagcccacactttcactcaaggtgtggtagcaatatttgggccaccttctgcttcttcagttcccatacggcaagtagtttgctactacctccgtttcatattacaagtcattttgacttttttctattcaaacttctttaggtttgaccaagtagaaaaatttagcaacatctacaacaccaaattagtttcattagatgtaacattgaatatattttgataatatatttgttttgtgttgaaaatattgttatatttttctataaatttggtctaacttaaaaaagtttgactaggaaaaaagtcaaagcgacttataatatgaaacagagggagtacctttttgtgtaagtaaagtaataaaaaagatgaaactgtgctaacagaagggtaaattacatcagatttgtgcacctttattatcttgaaagttccatatctgcttccttttgatcttttgcaagttctatctgatatttacaggaaataggctacctggatgactagttgtgttctgtatctgcttccttttgatcttttgcaagttctatctgatatttataggaaataggctacctggatgactagttgtgttctgtattggtttatgatctgtgagcgatcttaataaacaaaccattaattctttgtgaaattaaatctttagtttatttattcaaagtggtatacacctcgttatgttactgatatatttatgatatttgatattcggagttgcattcagataattgtttttctacattcctttgcagatcccacgcttatataatgtgtacaaggaaatgggtattgttacatcattccaaactcttctggacaacattttccttcctctgtttgaggtcaccattgatccagcttctcatccgcagcttcacgtcttcctaaagcaggttcaatagttttctcactattttgtgatttgcataactgttgtttgtattgatgctgtgcattttgtctcagaattaacacatatgtagtaaagattaactcgttatttttttaatgtaaattcatgtttggtacagtcactattatgtagcacaagttctagccttctaggagattacatggtgactttgctttaacaaatgatgatgggcgacatgtcatgtttatttgaggcctgtatgtcatttggacagctgttttggtttagttgggaggctgttcagttgtctaatttctaaggaaaaaaatccagctgtctaatttctcaccacaatttcaattttcacagatcaaatgttgtgaatcagttcttttcatgtcaatcatgacttgttttaatactcaaagagccatctttacactgtagggtagttaggcaagtttcatgctctttcgtgggcttcataaaactatactggttaatttaacagctgaatttcatttttatcttggaaatgactagggactaggtaatttttatttttatttaaaactactaaatatgttaatatcgcacacatcacaagcaggcaactttaggatactcttttttggccttgcaggttgtagggttagatttggttgatgatgagagtaaacctgaaaggcgtccaacaaagcatatgcctacacctgaacaatggaccaatgtcttcaacccagcattttcatattatgcatattactgctatgctaacttatacacactcaataaggtaggaaaattgccctcatacctctaattttcctcattttgctggaaaagtaacacttctgtgcaatttagttgcgtgaatcaaaagggatgaccacaatcaaattccgtccacatgctggcgaggtagaatctcttcaatgttccactgtctttctgttattgtgtttgtctataactgtatggtgtcacaggctggagacatcgatcacttggcagcaacatttcttctttgtcacaatatatcgcatggaatcaacttaaggaaatctcctgtgcttcaatatctatactatcttggccaggtaattcttcatattttcataatccagcatgatttttaaaaacctctgtagctgtaattttatgagtaaaaagcatgacagatttatctaattagtgcagtttggtttgcttttaagaaactttttaagtcactatcatttcttcaatctgttgctttcaattttatcagattggtctggcaatgtccccattaagcaacaactccttgtttcttgattaccaccggaatcctttcccaatgtttttccaacgaggcctgaatgtttccctgtcaacggatgatccattgcaaattcacctgacaaaagagccattggtggaagaatacagcattgctgcttcagtactccctctttccctctcccctcaccctattcatcttatgcagacactaatgtacatacttatgtttatatatgtgcatgtacaagacatacatgaatgcagttcagtgtgcacctttatgcttgttcatggaacaaataaaatgctaaccactttttttcgaacaaaaggacaaactcacttattgtggtttttgtttcagctctggaagctcagttcttgtgatttatgtgaaatagctagaaactctgtctatcaatcagggttttcacatgctctcaaggcaagtaaacaacctttgtcaactactttcaaagctcgttggtgatctttaccttattacattcatttcagccacaaaccatttttcacaaattatggttgagcaacttattgcttgatatgctctgtaagtaatgcattatatggcaccgtgaagcatatcatcatttcatctattgcaggcacactggattggcaagaactattacaaaagaggacctacagggaacgatattcataaaactaatgtgcctcacatcagggttcagtttagggacttggtacgaacaaatttccttcacttctgttggacgaaaaacttgaattttcatgttcccttgctagccgcgttagctgatcagaaaattgcgtgattttcagatttggagagatgagatgcgtcttgtatacctaaacaatgtcatcttacctgacgaggtggaccagtaacatgtacctggtgtatatggcgcggttgccatgggagttacatttcatgtttgggtaagcattattcaccttttatctgccggttcatactctacatctcatttcatttctttattaatcgatcactgaactgcatgcctaaaccgtacactttctctcaacattgcagttattggaagtcagcatgagaagtgttgtgatacacatcgtgtccgggttccaagccgacgagagagaaacttcaaaccaagtagtgcccccaaaaagcacaaccaaaagtacaacaagatatacacaataaaattggatcttactagattaggaaggatgaagcggctcagctgggtgctggattttggggtgtagtgtaggggaggcaggcaaacaattgcttcggcgtgattgtaattgtgcagcctctcgtttgtgaaggatgctataccaacattgcatgtactttaactggtcttacacagttatactcctgcgaataaagtggcgccgcttgtttt</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001061804.1 RefSeq:Os05g0349200]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 5]]
 
−
[[Category:Chromosome 5]]
 

Latest revision as of 08:26, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information