|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 5]] |
| − | GeneName = Os05g0481100|
| |
| − | Description = Protein kinase-like domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001187539.1 GI:297724208 GeneID:9272054|
| |
| − | Length = 8970 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os05g0481100, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 5|Chromosome 5]]|
| |
| − | AP = Chromosome 5:23700563..23709532|
| |
| − | CDS = 23701701..23701797,23702673..23702817,23703352..23703423,23703680..23703751,23703886..23704029<br>,23704115..23704186,23704284..23704355,23704453..23704527,23704611..23704679<br>,23705063..23705131,23705199..23705270,23705794..23705880,23705975..23706046<br>,23706374..23706870,23707290..23707442,23707642..23707925,23708014..23708065<br>,23708285..23708535,23708614..23708748,23709017..23709385|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008398:23700563..23709532
| |
| − | source=RiceChromosome05
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008398:23700563..23709532
| |
| − | source=RiceChromosome05
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgatcaatttcggaggagtactctgtgcagttacccttgtggtgttgctccccttcttagaggctgcagatggaaaatctactgatccttcagaagtcagtgcacttatggctatcaagggaagcttagttgatcctatgaacaacctcaagaattggaataggggagatccatgcacaaaaaattggacaggggtcttctgccatgatttgggtgatacatatcttcatgtaacagaactgcaactgtttaggaggaacctctctggaaatttggtaccagaggtcagtcttttatctcagctgaaaatattggattttatgtggaacaatttaacaggcaacatcccaaaagagataggcaatatcactacgctcaaacttatattattaaatggaaatcagctctctggtcttttaccagatgagattggcaaccttcaaagcttaacaaggttacaggttgaccaaaaccatctatccggcgcaatacctaaatcatttgccaacttaagaagtgtgaagcatcttcacatgaataataattcattaagtgggcaaatcccgtccgaattgtccagactgaatacacttttgcacctccttgttgataacaacaatttgtctgggcctcttcctccagaactagctgcggcaaaaagcttgaaaatacttcaggctgacaataataacttcagcgggagttccatccctactctgtattacaacatgtccggactatttaaactgagtcttcgaaactgcagtttgcagggtgctattcctgatctgagtgccatacctcaactggactatttggatcttagctggaaccagctgacaggatctatcccaactaataagcttgcttcaaatatcactacaattgatttgtcacataacatgcttaatggaactattccatcgaacttttcagggcttccttatcttcagctattgtcacttaaaaataatcttttagatggttctgttccctcggaaatttgggctggcgtcaaccctaacagaaacggaagccttgtactggacttccaaaataattctctcaatatgcttccagctgaaattagtcctcctccaccaaatgttactgtcgtgttatatggaaatcctatatgtgagaattctagtgaaactctgataatcaacctttgccgcctccagtcaataaacctggaaaaatctaaacaggaaacaagcactgccatggtttgtggagcttgcccgacagaaaaaaattatgagtacaatccttcattctcggaccaatgtttttgtgcggtgccacttggagttggacttcggttgaagagtccaggagtcacagactttcatccatacgaaaatgctttcaagattgacctaacttctttgttgcagttgtttccttaccagctatatattgagaactacatatgggaagttggtccaaggctaaatatgcacctaaagttatttccaagcaatacaagtttgttcaacatgtctgaggttgtccgactcagacacgtacttgctggatgggaaattacacttttagatgtatttggtccatatgagcttctcaatttcacacttggttcctatgaagatgaatatccaaatctagcttcatcaggtttaagcaaagctgcactgggtggtatcttggcaagcacaatagctagtgctattgcactttctgcagtagttactgctcttataatgagaaggaattcaagaactaatagaatttcaagacgttcattgtcgagattttctgtcaaaattgatggggtcagatgcttcacatatgaagaaatgacttctgctacaaataattttgatatgtcagctcaagttggtcaaggaggttatggaatagtctataaaggaattctagctgatggaacaattgttgcaatcaaaagggcacacgaggattctcttcaaggttcaacagagttttgcacagaaatagagctgttgtctagattgcatcatcgcaatctggttgcgttggttggttactgtgatgaagaaaatgaacagatgctagtttatgaattcatgccgaatggcactttacgtgatcatctttctggaaagtccaaaccacctctcggttttggtttgaggctgcacattgcattgggtgcttcaaagggaattctgtatctccacaccgatgcagatcctcctatatttcaccgtgatgttaaggccagcaatattttgttggattctaaatatgtcgccaaggtagctgacttcggtctttcgaggcttgctccagtaccagatgttgaaggggctttaccagctcatgtctccaccgttgttaagggcacccctgggtatcttgatccagaatacttcctaactcataaattgacggataaaagtgatgtgtacagccttggggttgtttttcttgaattgttgaccgggatgaagcctattgagcatggtaaaaacatagtgagagaggtaaaaaaagcttaccgatcaggcaatatatctgaaatcatggatacccggatgggcttgtgttctccagagtgtgtggatagcttcctccaacttgcaatgaagtgctctcgggatgagactgacgctcggccatccatgacagagattgttagagaacttgagctcatcttgaagataatgccagagggtgatcttatccagctggaaactccacagacatactcaggacgtgctatgagcaaggaccctatgagtaaatctacatcaaattcaacaaatgggaattacttggcctcatctcaaacttttactagtgttgatgcaagtagtagcggcgtgctttctgggatggtgagtcctcggtaa</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MINFGGVLCAVTLVVLLPFLEAADGKSTDPSEVSALMAIKGSLV DPMNNLKNWNRGDPCTKNWTGVFCHDLGDTYLHVTELQLFRRNLSGNLVPEVSLLSQL KILDFMWNNLTGNIPKEIGNITTLKLILLNGNQLSGLLPDEIGNLQSLTRLQVDQNHL SGAIPKSFANLRSVKHLHMNNNSLSGQIPSELSRLNTLLHLLVDNNNLSGPLPPELAA AKSLKILQADNNNFSGSSIPTLYYNMSGLFKLSLRNCSLQGAIPDLSAIPQLDYLDLS WNQLTGSIPTNKLASNITTIDLSHNMLNGTIPSNFSGLPYLQLLSLKNNLLDGSVPSE IWAGVNPNRNGSLVLDFQNNSLNMLPAEISPPPPNVTVVLYGNPICENSSETLIINLC RLQSINLEKSKQETSTAMVCGACPTEKNYEYNPSFSDQCFCAVPLGVGLRLKSPGVTD FHPYENAFKIDLTSLLQLFPYQLYIENYIWEVGPRLNMHLKLFPSNTSLFNMSEVVRL RHVLAGWEITLLDVFGPYELLNFTLGSYEDEYPNLASSGLSKAALGGILASTIASAIA LSAVVTALIMRRNSRTNRISRRSLSRFSVKIDGVRCFTYEEMTSATNNFDMSAQVGQG GYGIVYKGILADGTIVAIKRAHEDSLQGSTEFCTEIELLSRLHHRNLVALVGYCDEEN EQMLVYEFMPNGTLRDHLSGKSKPPLGFGLRLHIALGASKGILYLHTDADPPIFHRDV KASNILLDSKYVAKVADFGLSRLAPVPDVEGALPAHVSTVVKGTPGYLDPEYFLTHKL TDKSDVYSLGVVFLELLTGMKPIEHGKNIVREVKKAYRSGNISEIMDTRMGLCSPECV DSFLQLAMKCSRDETDARPSMTEIVRELELILKIMPEGDLIQLETPQTYSGRAMSKDP MSKSTSNSTNGNYLASSQTFTSVDASSSGVLSGMVSPR</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>1139..1235#2111..2255#2790..2861#3118..3189#3324..3467#3553..3624#3722..3793#3891..3965#4049..4117#4501..4569#4637..4708#5232..5318#5413..5484#5812..6308#6728..6880#7080..7363#7452..7503#7723..7973#8052..8186#8455..8823#acttccacggcgccaaccgccaacccactccctcactcctccgcactaattcctcgcctctacaatctccttctcctcttccgctcgcgctcgcgctcgcggcggctactatgacgcagctcaggcgatccacctcgcggagcgcggagtggatataggataggatcgaggcggatcggaggaaggaggaggaatcctgggttggcttgattccccgccccagttcgagtgagcttccggagtttaatttggggtagtgttcttcttcgcaacaaggtatattctccccgcttgaatcatgggggcgcgtttgcctgtgtgtgagttttttttttttgtgaatttttcggtggttcggttggattattctcagccacattttaccacaggaatttgctggggttttggcgttccttcctcttttatataggagtagtagtcgacaggtcccatctcgagttttcatcctgatttgatgggattttcggcatttctcgcgatttttttgcacttgttgagttggtactagtacaaaagtaggagtactactactagctagtagctgccgctgcatgcatctgcggagtttagttgggacgtcgtggttgcgaattaggatggtgttactgtcaggtttcgttggcctgatgttgctgagtggcagatgtgttatttgtctctagtttgattgattttgatcgcacagagccattgcttgagcacaaaagcgactagctaggcaggttgttagaggcagaagaagtaggtacaagtaaacgatacaaatggggtgatcttcttttctgaagaactttcatgtcacttgcatactgttaccgtcaaatttggccatctgtttcagttttcattgatccaactttcattaagcaacggagtatagagaaccggagtgatttgttttcttgatattggggaattttctgaaccccatgtaccaaactgggcatgcatatgcaaacacccaaaacctcgtgcttcaaaaagaggaataaatgatatctaacatcataaacaatggtggtattcataaactcttcttttttcctagttaggatcctgaaattttggaattttgctgtcgtggatatgactagttgctgctgattatcttgaagacatgatcaatttcggaggagtactctgtgcagttacccttgtggtgttgctccccttcttagaggctgcagatggaaaatctactgatccttcagaaggtaatctttgcaagcgtattcttcactatgagccaaatcattctttgcaagcatattcttcatgctgagccaaacctgggctgggtcatattaagctggttttgaactaacacgttctcctgatcacaaattcctcattatatgttgacacatggggtaggcttaggtttggactaggccttggggcaagacatgcttgattagttgattggaccattttaaactggcttttgaaccaatattctcttatgatatctctgtaattacatcaacttttagtttcttatttgcacaatactccgttcatttctagatgggtgcttcagtgttctcccactattgattctgtaagacagtgggagtaatttgtttatgcccttgaaaaacaacaaaccagaaattgtacttcatggattacaaacataccggaactctggtctaatgaaaacatgcaagaattctattttatgcctgctgtgatgccagagtccatttctagtaactgaagtaggtattttttgacgacaatgagccgaacatagtatttgtggctatacagttttcctactaggtaggtatttgtaaatcataccctaccagttagtatgtttgtctaacagagaatgatattatacacagctcttatttgaaaaatgaaataaagagttgcaaaaatgtatgctaacgttgtaaatgaaataattctctcataggatttgtaaaaaatagtttgttatctcttgtgctcgataaccactttctatcaacagactatgagatgtttaatgccaacagtattttacattgagtttctttagttaaaagttctaaaatatttgctgcaaaatatatgttgtttttctccctatatgcagtcagtgcacttatggctatcaagggaagcttagttgatcctatgaacaacctcaagaattggaataggggagatccatgcacaaaaaattggacaggggtcttctgccatgatttgggtgatacatatcttcatgtaacagaactgtatgaccaatacttctacataatttatttgccatatcctcactttcagtttggttgtcataataggaactatgaatgctagtggtcatagaaaacggttctatagttaaatgctgatgactatgttttccatagctgattaggaattacaaatttctgatgcatgattaattgtataatctattaaagaaataaatagttgatgtcttacaagtgtcttattgccatactaaacatttgaagcatactgaattgaagtgttatatttagtctttattattgaatggtggcaatgtggcatgatgctacatttactggtaactatgcatctcgtttgatagtaataatatgtcccaccatgttaccgcagggaacctcagtcctgtctgtacgaggccccttttttaaaaaaaaaattctaagcattgttggagcagccttttgaagcttttctttgcttgaaatattcgataagggcatacagttccagtaaatttcaatctgttgctgattatattattttgctccatgtaggcaactgtttaggaggaacctctctggaaatttggtaccagaggtcagtcttttatctcagctgaaaatattgtaagtatactctaatgactgaagattttattttttgtaagttctgcattcattaaatattaatccttagtactatcttcatatcactatattttccataaaataaattaatggtgtcttcctggataaaagattagccttcatcttttacttgctgaaaaattactaaagaaaatactaattgatcagcatatagttgatttttttgcatcaatctcttataccatatattaacttattgctgtttctcttgaagggattttatgtggaacaatttaacaggcaacatcccaaaagagataggcaatatcactacgctcaaacttatgtatgtattctctttcaattaattctacacccctcttcaatatgcacagaaaacaacggaactccttaattaaattatttgctatttttcttatatctaccaatactttactctttttttcatgctttatgtagattattaaatggaaatcagctctctggtcttttaccagatgagattggcaaccttcaaagcttaacaaggttacaggttgaccaaaaccatctatccggcgcaatacctaaatcatttgccaacttaagaagtgtgaagcatctgtaaggattgttcatttccattttgttcctgctttgttcttcaatctgaattcagtgctagactcaatttcccctttcatttcagtcacatgaataataattcattaagtgggcaaatcccgtccgaattgtccagactgaatacacttttgcacctgtaagtggaagcctattggttgcatttttttctaatgcatgttgtatcaggtaacatggaattaatcttattatatactctaactaaaactttgcagccttgttgataacaacaatttgtctgggcctcttcctccagaactagctgcggcaaaaagcttgaaaatactgtatgtatccattgtcaattgtcaaactcaattgaaaatagcttgctatgatagcatacacctgtttcttatattcgtattttttttctgtttctagtcaggctgacaataataacttcagcgggagttccatccctactctgtattacaacatgtccggactatttaaactgtgagcactatatgttctctctctactatatatgtctaaatactgtgttgttatgctgaggataatatttcttgtcacatcaggagtcttcgaaactgcagtttgcagggtgctattcctgatctgagtgccatacctcaactggactatttgtgagtacagtaaaaatcatgccgaaagtactaccatcttaattttgcaatcaatatatcttaacatcattatcaatttatcactgattgctacttcaaatatggcacttaatgctccctatttctgacagttgctctgtggttaaattggtaatttccttcaaaaaagaagtttagaataattttcttaaagataacgggaatggcttacatctctagcctctgttgttaggcacaaccaattagttttgttgaagaaatttagagttatagttttcttccaaaaagaaagatttcttaacaatgtgcaaccatttctctagaacatgagctcatgagataaatctatagatgtctaaactaatcctcacatgcattttcagggatcttagctggaaccagctgacaggatctatcccaactaataagcttgcttcaaatatcactacaatgtatgcagcttttataatttttatttctgttctttaatcattgagctgatttctaattttctggcagtgatttgtcacataacatgcttaatggaactattccatcgaacttttcagggcttccttatcttcagctattgtaagttgtaacatttagctttgttaaatcttgctccagatagctttgtgttcgatcagaattttttttttgcacctacttcttcttattccaaataaaaatcacagacctgtgtgttctctctctcaaatagaaaagaatgtattttagttttttctttaatggaaaggcagcagctctgtcagttttacttagatgagggggggggggggggactgagcaacgagcaggcagatcaccaaagaggatagcaaatttaaagaggtgctcgcatgtgatcaacctggtggtttgggggaatttgattttaaaaatttcttctgttcttctcatgcattttacattatttcttatttattacatacaaacttgaggttatatcagttcttgctggtgcatattgtgatccactcattattgcttacaatttccactcgttttgacataacacaaattaaaccctctatgaacttttttttaaaaacaatgcatttaaaaacatgtcaatgttgcaaatttgcaggtcacttaaaaataatcttttagatggttctgttccctcggaaatttgggctggcgtcaaccctaacagaaacggaagccttgtactgtatgattctttttgggaatatatatatatattttttcatcttgttctaagttctgacaataacatatatttgacatggttgtcaattgtgcagggacttccaaaataattctctcaatatgcttccagctgaaattagtcctcctccaccaaatgttactgtcgtgtacgttcctacatatatgcaatacactatcaatctacattcctgcataaaaattctgtgttgcggatggatatttaactgtgagcacgcaagtttcgcagttaatttccattttgatgattaacaccatttcatttatttaaagcaagcttatactgcttatataacagttttcaggctacactattcttatttgagaatggacatcataaccaaaaacagtttattcatcatcgtattatgagtgaaaatctggactataactgaatattgcttacataaaatactcagttcttatagttgtcacaaccaatgttatttgtgcaggttatatggaaatcctatatgtgagaattctagtgaaactctgataatcaacctttgccgcctccagtcaataaacctggaaaaatctaaacaggaaacaagcactgccatggtttgtggagcttgcccgacagaaaaaaattatgagtacaatccttcattctcggaccaatgtttttgtgcggtgccacttggagttggacttcggttgaagagtccaggagtcacagactttcatccatacgaaaatgctttcaagattgacctaacttctttgttgcagttgtttccttaccagctatatattgagaactacatatgggaagttggtccaaggctaaatatgcacctaaagttatttccaagcaatacaagtttgttcaacatgtctgaggttgtccgactcagacacgtacttgctggatgggaaattacacttttagatgtatttggtccatatgagcttctcaatttcacacttggttcctatgaagatggtatatacacttgaagctaaagtgtataaaactagttttgcgatgaaactcctcgttttaacttattaaggataaattggaatttgttttgcacatttttttctgaaattttttttgatggatcatttaaacaaagattgatcgtatctcagctgtacacagtgactaattactaatggaatacaagtctgtactatttaatgttcattaccaaaatgttagtgtatgaatgttcattaagattattgtacaaggtaaataagtaatcatcgtatttatatttttaacacatatattgaataacaaccaaagtttttattttttttaacctgtggttcaactgcggttctctgccttttccggttgctctcttctgattactaatatagtatatctgtttttcgtttttttttctgtagaatatccaaatctagcttcatcaggtttaagcaaagctgcactgggtggtatcttggcaagcacaatagctagtgctattgcactttctgcagtagttactgctcttataatgagaaggaattcaagaactaatagaatttcaagacgttcatgtaagtcattgtaagaagtaagctatcattacattgcattccaagcggtcatggatgtatgtactttgtggcactcctgttatcttcataattgttcttttgctccatgctaattgaatatctgattgtgcaaggcaatttttgtcttgatttttcaagagaaaaaacatgaaaatatatgtcatattaccatttgcagtgtcgagattttctgtcaaaattgatggggtcagatgcttcacatatgaagaaatgacttctgctacaaataattttgatatgtcagctcaagttggtcaaggaggttatggaatagtctataaaggaattctagctgatggaacaattgttgcaatcaaaagggcacacgaggattctcttcaaggttcaacagagttttgcacagaaatagagctgttgtctagattgcatcatcgcaatctggttgcgttggttggttactgtgatgaagaaaatgaacaggtgcatctctttgattttatttatttgtgtggaaataatattctggcaaaatcatcctgataagataaaaattgtgttttttttacagatgctagtttatgaattcatgccgaatggcactttacgtgatcatctttctggtaagcacatggctagttcttttatcccactgatctactgcaatcctgaactgactcctatggctttgatatcaagatcagccattcagttgtcagtttactgaatcttatagttgatgtgccttcttgaacctgcttatagtgaattgtgtaatactttgttctgttgccaatatccttgttctacttcaatctcctcgttttatttttcaatcgcaggaaagtccaaaccacctctcggttttggtttgaggctgcacattgcattgggtgcttcaaagggaattctgtatctccacaccgatgcagatcctcctatatttcaccgtgatgttaaggccagcaatattttgttggattctaaatatgtcgccaaggtagctgacttcggtctttcgaggcttgctccagtaccagatgttgaaggggctttaccagctcatgtctccaccgttgttaagggcacccctgtaagtactagttgcacacggttgttctttctcttttacagctatactatactaactatatccttgttactttggcaggggtatcttgatccagaatacttcctaactcataaattgacggataaaagtgatgtgtacagccttggggttgtttttcttgaattgttgaccgggatgaagcctattgagcatggtaaaaacatagtgagagaggtacacgctcttcaactttgagtaatacgttcagttaactgttgtaaaccaactgaaaacatatacaaaaccgaagtcttttcttttttattgaggaaaaatggttttgtaatcagttaaactttatgaggagaacatcagttgttcttaacctggttgtttgcttccttggaaaaaaaaaacaaattgttcagcgtatacaagtcgaaattaaatgacaacagtttagtagtttaatgaaagaactacatttttgctttttctgcaggtaaaaaaagcttaccgatcaggcaatatatctgaaatcatggatacccggatgggcttgtgttctccagagtgtgtggatagcttcctccaacttgcaatgaagtgctctcgggatgagactgacgctcggccatccatgacagagattgttagagaacttgagctcatcttgaagataatgccagagggtgatcttatccagctggaaactccacagacatactcaggacgtgctatgagcaaggaccctatgagtaaatctacatcaaattcaacaaatgggaattacttggcctcatctcaaacttttactagtgttgatgcaagtagtagcggcgtgctttctgggatggtgagtcctcggtaatgttatggtagttctaaacatgcagcaatactctgtaatattatggacttcacactttcatttgtcaatgaaccagccagccttgctggaaaatgcaatacatgatagtaacaattgataatgcaagaaaaatgtaaatgttcgtcg</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001187539.1 RefSeq:Os05g0481100]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 5]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 5]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information