Difference between revisions of "Os08g0225400"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
[[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 8]]
−
GeneName = Os08g0225400|
 
−
Description = Protein of unknown function DUF266, plant family protein|
 
−
Version = NM_001067818.1 GI:115475372 GeneID:4344976|
 
−
Length = 11782 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os08g0225400, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 8|Chromosome 8]]|
 
−
AP = Chromosome 8:7651635..7663416|
 
−
CDS = 7653087..7653419,7653898..7653996,7658061..7658161,7658253..7658324,7658518..7658608<br>,7658791..7658871,7662127..7662189,7662278..7662400,7662499..7662537<br>,7662889..7663017|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008401:7651635..7663416
 
−
source=RiceChromosome08
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008401:7651635..7663416
 
−
source=RiceChromosome08
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atgaaggttgttccagtgccgcgtgcaagagcagctccaagaaggcacatatggataccagtgattctaattcttgttgccgtcaccgtgctatggatttacttataccctccacaggattatacctatcctgttagggattggtatcctgttagggactggtttcctgcagaacctgcccgggaactgaccgatgaggagactgccgctcgagttgtctttagacaaatcctctcaacgcctccattcccatccaggaaccccaaaatcgctttcatgttcttgactcctggcaagttgccatttgagaaattatgggagttattttttaagggccatgaagggaggtacactatatatgttcatgcttcacgtgagaaacccgaacatgtcagtcctgtatttgttggccgagacatacacagtgataaggtaggatggggcatgatttctatggttgatgcagagaggaggttgctggcaaaggccctagaagatacggacaaccaactatttgttttgctttctgacagttgtgttcccctacacaattttgactatgtgtacgacttcttgatgggatcaagacacagttttcttgactgctttgatgatcctgggccacatggagtatttagatactcgaagcatatgttgccagaagttcgagagattgattttagaaagggctcgcagtggttcgcaatcaagaggcaacatgcaatggtggtggttgcggatagtctgtattacacaaaattcaggcgtttctgcaagccaggaatggaagagggtcgcaattgttatgcagatgagcattacttgccaacactattccttatgatggaccctgctggaattgctaattggtctgtgacttatgttgattggtctgagggaaagtggcatcccaggtctttccgagctaaggatgtaacttatgaactcctcaagaatatgacatcggttgacatcagctaccacataacaagtgatgaaaagaaagagctcttgcagaggccttgcttgtggaatggactaaagagaccatgctacttgtttgcaaggaagttctacccagaaactttgaacaatctcatgtacttattctctaactacaccattttctaa</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MKVVPVPRARAAPRRHIWIPVILILVAVTVLWIYLYPPQDYTYP                    VRDWYPVRDWFPAEPARELTDEETAARVVFRQILSTPPFPSRNPKIAFMFLTPGKLPF                    EKLWELFFKGHEGRYTIYVHASREKPEHVSPVFVGRDIHSDKVGWGMISMVDAERRLL                    AKALEDTDNQLFVLLSDSCVPLHNFDYVYDFLMGSRHSFLDCFDDPGPHGVFRYSKHM                    LPEVREIDFRKGSQWFAIKRQHAMVVVADSLYYTKFRRFCKPGMEEGRNCYADEHYLP                    TLFLMMDPAGIANWSVTYVDWSEGKWHPRSFRAKDVTYELLKNMTSVDISYHITSDEK                    KELLQRPCLWNGLKRPCYLFARKFYPETLNNLMYLFSNYTIF</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>1453..1785#2264..2362#6427..6527#6619..6690#6884..6974#7157..7237#10493..10555#10644..10766#10865..10903#11255..11383#ggatcctgcatgcgcacgccgggcgcttccctctcggatcggccaatcggacgcacaggtatgggcacaccgcgtttcttttgattccccgccttgtgatcgatgatgcttaattgatggaggttcttggagatggttgatttggtctaatgattgattgaatcgttttggggaggatggatggattttgcctgggggttagagggggatggattgagctgcgtgattttgccacattgattctgaatccttgaggggtgtgaaattctggtggattttggtgtgcattggtgttcctgggtataaagatgtcatctttaggtgaatgcatattgcatatgctagatgaactgttcgtcttcttgcttgttgttttttcggcaagaggggaatttggggatgtaagaaatctgtgattcctttcaatgtttggttcatttcgcgattgcatacttgcaaatttatggttgtttacgcacatgtctaaggagttctgaattcctgatacatattgggaccatttgggatttgacacatcgtatcacacgttttgtttgattagaagaacacagacattttaattcccaagacaactatatattattctctttatatatgattctgaacaattcttggcataagggaatatgcagtggtagaacatgagctattgaaggttataccagaaggggagcaaatgatgtatacaagtatgggcacttcaatagcaacattccagctgaatcgacctatttagattgctcattactacagttatcccacatgataccttggtagccatgcattactactgtttggtttgctttccgcgcttttaggtgtgcggcattctattaacctgcataacgctctacttgtcatagacatagctcaatcatatctgtgttgcacaacttattatcttccgcaaagactggcacaacttacccaggggaggaacagaaagtgaattttgagtaattctcatctctattgaatattgatgaccgcaatatgagaattcaatcacgtggaaatgtaaattccaaggtttccaatatttggttcttttatagaagtacaaacatgtatagtgaaatctgcaaacggattgacctgtttatggacgtttgctgataagcaacatgcatgatttcgtcatccattttcctatttgtagaacaggtcaaatcttctgtaagcaatattagtttcctttttataaccagagtgaatcatgttatcaatttgatttgcagtggtatgtctcataattcaattgacatcgccccatttttgttctgcagagcacttgcagaagcaaggtggaagctgtgttaagattgttttctaggtccggtgaattctgagagagatgaaggtgcggagctgtactgtgagaggaagaaaagagtgaagtggcatcagctgtggccatcaagtgccaaggatatgaaggttgttccagtgccgcgtgcaagagcagctccaagaaggcacatatggataccagtgattctaattcttgttgccgtcaccgtgctatggatttacttataccctccacaggattatacctatcctgttagggattggtatcctgttagggactggtttcctgcagaacctgcccgggaactgaccgatgaggagactgccgctcgagttgtctttagacaaatcctctcaacgcctccattcccatccaggaaccccaaaatcgctttcatgttcttgactcctggcaagttgccatttgagaaattatgggagttattttttaaggtacaccatgagttcccccttttttgtgcactcatgcgtatgtactatatcatgatttctgttactgatactgagtttgttattccttgtgtacaacctttgtgggttttatgaagtaaataaaatgaaaaacttaaaaataatggttgtttatttgttctgttgccactcaccggttataaggaagacagttgagttgagtggattggattgaattggttggtatcaaaggcacatatatcgttttcctttgaagcattaatagttaatagtcatgcaaattgaacataatagggatataaattttattctacccccataaatattgggccacatttgtacctttctacttgatctttcatgccatgaagcatgccagtttgcttccttttaatttccttttatgcgtggtattagacaatgtcatacaccttaattcgatttgccttttctgtggcatttcccataatttttgcagggccatgaagggaggtacactatatatgttcatgcttcacgtgagaaacccgaacatgtcagtcctgtatttgttggccgagacatacacagtgataaggtaatcattttctcagtatgaagccttggtgaacttgtaaggcatgtgcatttaggacttctgaggtggtaagatgcagagaattttccatatttcattcaattgtgctactcacataacaaggttctctcccatattgtactggtaatatattcttttcctcatgatcctgcttacactaaaatttcatagggtaatgtaatctatgccacgagctaattggaaggagggattcaacaaagattgtattaaaaagaagtagcaggacgcggtattggaccttgtcggcgcggcggagccgtgatcagcgatgcacccatgaggcgtagtggcatcccctcatgacatctttccctccctctaggagcagctcgtcttctagctgaaaatctggatacaaagcacgaaattcgtccaggcacatccaagaagcctctgctgccggcttatctttccattccaccaaaacttcacgaacgcctcgtgccaaatgactgaggaacggctgctggttgcagacaaacccgaccatgttgcgtcggaggcaaggcagagacacttcaggcggcttgagcaatccaacgtgaaacacattgtggagttgagccccaggtggtaggcgaagccgataggctaccaagccaattcgtttgacaatctgatatgggccaaaaaatttaggtcccaacttgctgcgccctttaacgccgaggatgatgtcgtagccgagtgggcatagaagtcgatgatgaatgcgtgcgcaccgatggtgacgtgctggggtgggcactgtccttgcgagttgacgcggtcgacgttcgccattgcggcgctgaggctggagtgaggttggaggggaacgtttgcccgatgcactgcgcagtcgttgatgaagttgtgggtggcgtgacgacgagtggtggcgatgaagatgtgtgtcaccatcctcgaatggagggcattcatctcgggggaagtgcgaggccgagctaagcacttggtacaacacctcgatgcgcttgacggtgagattgagggctcggacctgctacaaatactcgaaagcggatgcctggacttgggtaacgtgatcgggcaggccgttgagctttgatgcgagcggaactagtggctctagggcgctcatcttccgggacggatcttgaatttgggaagccatggaggtgagggttttggcgatgtcatcgagttgtgtttgagtggaacccatgagatcggaactagagcaatctaataccaagttgtcacgagctaatgaattggaaggagggattcgacgaagattgtatttaagggaagtagcaggacacggtcctggacctcgttggcgcggcggagccgtgatcggcgatgcacccacgaggcaggaactaaagaactagattgatctcaaattgcttggattaatcgatatgtttacagcttaatataagccatctaaagaggtaagatcctaacaacccaaagagataaactaacaaaacaaattggataagaaaagaacctaacaaaatattgttcctcatcacgctgttgtcggcgatgacggacgtagtggcgtccccacatgacaatctaatactgaaactcgttggaaattgcttcctaaccgcccaaccttttgtttaaaattattcttcttctagaatattttgttggaacccgttcccaaattcaatagacaaacttgtcatctttgctccctaaaggactggaatatgtcagaactactagtatttcttctgaaatttaatgttgaccttgtgttgacgaaaaattcaaacacaccggcctgggagatctgcttaactcctgtgcaggtccaaagattgttgagatgcgggcgtgctagtcagtttgatactgcaactgacaagatatgtaaacagttgatcaaatagccgatcggctaaacagccgatggagtagttgcagccgatagtcgataatagccgatgccgataccagccgatagcgatagggtttgagcaatcggctatgtgttcaatgtagataatgatgcaaagacaatcggctgatgatattaaaatataacaataatataatccagtagaaaccaattggctaacaatgacatgatagaataagcactaatccgatggttaaagcatacatcggctggaggtccgatgttataaaatccacaagattagattaaacgataaaatctttgttgcgatcggctaaatccaatatgtatgtatatgcaatccttacaagccgatgcaacgtccagataactcatcggctgaaaccccgatgaaacccttattggcagtcaaaaagcaggctagagattatggttctaagcacgacttagtagatcaaactcaactgatgtagcactaagtatgaacagaaacacaatatctagacaatcaagccgttgactgagttttcagggtggtagatgtctaaactaatctaatctaacaaggcgatttagccgataccggtagaaaccctaaaacgagaagcagccgatagagctaaattgatatgctaagactagattaacagagacatatgataaataggtaggcaagtatgtcatccaaaccagagcaatccaagaggtcgaatgtcctgatgcggccttgaacgacgctgacgtagacgatataattgcctgggccgacggaacattggacttaccccttagccggagatcgaacaccgttgcagccccgcgtcgggtgccaagttccgccggaacgtagaaacaaaagtaaaagtaaaaagggtggcgatgcgccgaattgtattgatcgtgaggattgattacatagaccccaggtgtacatatttataaccatggtttgacacaagtccttgtcggacaagaaagaaactttcttagagataaaaggaaaagataaagtccttataggacactaaacacactttcctaaagataaaaggaaactaacaaactattcctaattaatagataacttgccatgccgcattctctttgaactcggtctcttctggataagtttccattaatagatcaatttcttcaaccgaatatagcaagaatccgacaactgacgacttgacaactctcatcggctaatctcaggacttcgaagccgatgctgagtctaagccgatgattactccgggcttaccaaatttcactgttaacaccttgctagtccttgaagaagccaacatacaattcagtagagtactatttttttaaaagaacacaaaaaaaatggttgtatatgttgagtaagtagagcactatacaggaacaagaatactatgacttcagactatgtatatatttatccagatgaaatcatcaaatttgtgaattcaaacaaaatcaatattccctttcataagtagtcaatagatacaatggtgcaacagacagcaggtatatttaaatttattcatctgttcgatgatacacttatatgattaatcaagctgtaccgactctataatcagacaatggctaatttttcaccattggtttcaaccacaataatttcttgtgcaaagagtacttttgtattgaagtaaatttagcagctcttctatctatttttttttctcttgtgtattcttataccttagatcaagtctagcagtttttttctaaagtgtattcctgtaccttcaaatgatgcacttacatggatccatatattaaaagcacacaacaatcttgaatgttaatagtactcctattagagtatgtgtttgttttagtttaggtttaatagtatattgataataatctacactagtatccatcacattcgcatactctacacacctggtcattgatttacaatagtggtactataattaattccctagttttctgaaattgaattggagtctgatcaattcttaattgtcactggtgcatatttaggtcttgtttggatgggctgtgatgggtctgcatcaacctaaacgcaccgatgagcacccaatcatacgcatcatattctgaattgaatactttgcaaatgcttacattgccaaatacctttcaggtaggatggggcatgatttctatggttgatgcagagaggaggttgctggcaaaggccctagaagatacggacaaccaactatttgttttgctttctgacaggtaatccacattttacaaaattactttaatcctattttgctgcacaataaagtctcttagttcttaactattgcttgctcaatgatgtcagttgtgttcccctacacaattttgactatgtgtacgacttcttgatgggatcaagacacagttttcttgactggtgagacattgagtcaatattctatctcagatgctttccttcatgcatatccataagttcactaacccaaagtattccagaaaagttttacatctttaattaaaattttatttacaattctcatataatcaacttaaatttatttgaaatcatgtttttatcctgcttatcttcttgtttcatctatgaccagctttgatgatcctgggccacatggagtatttagatactcgaagcatatgttgccagaagttcgagagattgattttagaaagggctcgcaggtgagcatcatttttccatgcaagttctcaaactttggattgtgaatcaaactagagaggatacatagtttctgttttgaataaagatgcacaattttagttctattattttttatgtaatatgtcttccaaattttgtctgggtttgaactgtcttcaaacacaatttctgaatatcacagtggttcgcaatcaagaggcaacatgcaatggtggtggttgcggatagtctgtattacacaaaattcaggcgtttctgcaaggtaatcaaattcatattttggtagcatgccctgcacacgatgtagattataggcattattagtacctttggagttcaataatcaagttatttgtaaagttggcctgttagattcatattgaaaaagggagataaaataaattatttgcattaaggattcaaatgggcaatctcactacctgcataaaaacccacttaatattttttcatttttcatttggtagtacaaaatttggaagaaaaaatgaactagaagtgggataagtgggcaaaaaaaaaaaacccgcttgccctccccacttgcatccttaatttgcatccaaaagaatggaacttcgtgtttttgtcactctagagattccacgtagaggatttgtcagaaagaacattaaaataggtagaaagtgttaccctttctgtaatctggccatttctttctctgtactacgagctaaatgcccatgctttgctacagttaaaacatacactacaatattgtcctttttcttgaaatggcaggagaactgcgtttcattcatcgaggggaagaaaaaaacaaagtacaaaatatttacaaagtaggaggacccgagccctcccaccgagaccacccaagaccacaccggggagtgctaattgcctaggttagctggtccactaaggagcttctgaaatgcgaaagctcctgcagaacaccaaagatttccctcattttctaccacttgcaagaccgacgcaactctaggattggtgtcattgaaaacacagttgttgcgatgcttccaaatctcccaagccactaaagtcgccaaagagttaatcccttttcgcacctcgttcatccggtctttagtagcttggctccaccatctcaaaaaacgatccgttgaaggttgaggcgccgcttcggataaccccaacctcaggaagagtgttgtccaaacttggcgagaaaagacacaggaaattaaaatgtgttggatggattcctcgtttcgatcacaaagggaggaggccacagggtgctgcagacctctcttcgccaattgatcggctgtccaacacctattattaacggccaaccaaatgaagaacttgcatcggaggggagcccaacacttccaaatgcgtttccagggagcaaacttgattgatcatagaaaataggcttcataggtagatttacatgtgtaaataccatcagcagcgagtttccacacatactgatcttggacatcttgtatcaaagccacttcttctactagctcccaaacagccaagtattcatggaacttatgctgttggctgcttgaaatatctggaaggagagaaataacttgatttataatggggtgcagcctgatgttctctcttggaagagaagcttaaaattggatttgagactacatttacctaggctcaaggaaactcatcatcctatggtgcaatcatggattgatctgttgtaatttgttttttgtttttgttctccttttatgtaaataacctattttatttaatatatatatatataccgtggaggcctcctccactgtgctttcttgaaaaaaaaagccaagtattcaacaagaacctggaccgaaagtccccatgaatatcaacaatccatctcctgtttgtcaaagcttgcaccacagtacgttgctttcttgctcttttagggattaaggcaaagagattaggggccagctctactattgttttcccttgcaaccacctatctttctctgtgccaatcatttgctggcaagcttgtaaaccgaaatattctgctcactgcccagtgcccagtatgagtaaatgaggggtacatgcgtcttttggcaacatccttattttggccaaacagtgctcagtcccatataatgtgggacagagggagtattttctccatttccaactatagttttaacaaccatatcaaagagggagtggacattctttggcacattaatagataaaccaacccatggtctattacaatcagttttttggagccataacaacctcaagcgtaatgcccatcccatcttttcaaggttaagaataccgagacctccataagacagcggccgacacacatgatcccaagagaccaaacaatttcctccattagcgttatctcttcccttccaaagaaaaccacgacgccttttatcgatggccttaaccacccacttaggcaggcctaaagccatcattgcataaattggaatagctgagaaaaccacccgaacttctgtaagtctacaagtcctattcatcaaagaagcattccatcccggtaaactatctgccactttgtccacaagaggtaacaaatctgtcatggtgtgttttcggactgaaagaggaagtccaaggtaagtgcaagggaaacttgtcacttcacaggacagctcgttagagattacttccaaatcatcctccaaacagtgaataggggtacaggagctcttcatcatattggtttttagcccagagatttgaccaaagaactccaaaatttgcttgatcagagatagatccccacttgtaggacgcaaagacatgaccacatcatccgcataaagagaacgactataatactatctaaaatagataaacatatatatttttcatgaaatgcattacccatctttgtttatagggaatattcaccttaatttgattttatatgtggttatgcatttagatttaattgaattttaatattaagaagtccagggggtaatttgcaaaattcacaatgagagtaggtagggtgatagtcactgccaccaccgctatgttcttttaaaggagtatagatgctaaaagatgatatgatggtggacatggtttgtgaattgccccttgaagttcttcaatatacattatagtttacaaaatgttattatcttcttaattagttagccttcaatacatatttaacatgtcaatgcccaagatgaccgaagtgtcacatatgtgtagcatacaagctaattcgcaatgtgaagatgtgttcaatggaaacaataaaaaacaaattcttcctgaacattagtaggacatgtctctttcattgttattcacgacaaacacctgggcatttagctaggttaccaaaagcaaaactctactagtgaatgtcctgttcttaacctcaccaccctgactgctaccgcactgaaatattcatgacttgtaattgtgctaaaatatcttacagtgtttttttctcctttcgcagccaggaatggaagagggtcgcaattgttatgcagatgagcattacttgccaacactattccttgtcagtagttcagtatacaatgcccattcttatttgaaaacctactattatcaatcatatctgctgaattcgtttaaatgccaaccagatgatggaccctgctggaattgctaattggtctgtgacttatgttgattggtctgagggaaagtggcatcccaggtctttccgagctaaggatgtaacttatgaactcctcaagaatatgacagtacgcttaacctttttctgggtcatcttaatattctctttggatggacttttattttccttttcatgggatacctctaacttcagtctttgctgcagtcggttgacatcagctaccacataacaagtgatgaaaaggttcttccttgcctctagcttagtttgccattaatgttttgctaactactccattttactaatactagtgaaggcccatgtgctgcagtgtttcaaataaataaagtgaataatctaaaaatgccaagaagaaacaccctcaaatctaaaaaaatcccatatacaaaataattctcatattcagacacagtatgtctaatatatgtgtgtatttcacaatcacctctgttccaactctgtttggtctagaattctagctcacgaagaggcattgtacatctgtatgtgatgtcatcaaactacaggagtggacaactaaagatcatgtaccgtccttgtttttgaatgcagaaagagctcttgcagaggccttgcttgtggaatggactaaagagaccatgctacttgtttgcaaggaagttctacccagaaactttgaacaatctcatgtacttattctctaactacaccattttctaagctctaacgggaaaatcctcacatattggaagcacttggtgcttcaaaattcttttgtacatcgcgggagaagcaaatttatttacactaattgggtatagaaataggggaagtattggattctactgcagcaatattagggtattgtggccatgggtatagtttaggattatattatttaaatttcttagtttttcagggttctttgtcttcctacaaacgttgttcattctggcaaattttgccactatcagttttctcttatagcccagttatagaattttgccacttatccatgcacaaaaaatgtgtgtaaatggaattctatgtattctctattcatcctgtatgcttgtattctacagagggataacaaaaaagttttgcaaagcagaattc</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001067818.1 RefSeq:Os08g0225400]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 8]]
 
−
[[Category:Chromosome 8]]
 

Latest revision as of 12:58, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information