Difference between revisions of "Os11g0147000"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
[[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 11]]
−
GeneName = Os11g0147000|
 
−
Description = Similar to Long chain acyl-CoA synthetase 6 (EC 6.2.1.3)|
 
−
Version = NM_001072271.1 GI:115484154 GeneID:4349764|
 
−
Length = 9315 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os11g0147000, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 11|Chromosome 11]]|
 
−
AP = Chromosome 11:2113793..2123107|
 
−
CDS = 2114158..2114253,2114327..2114413,2114524..2114610,2114831..2114916,2114996..2115099<br>,2116554..2116640,2116728..2116851,2117527..2117645,2117733..2117862<br>,2118009..2118097,2118229..2118317,2119092..2119185,2119294..2119373<br>,2119470..2119559,2120302..2120388,2120488..2120532,2120954..2121030<br>,2121104..2121209,2121365..2121446,2121537..2121608,2122114..2122191<br>,2122262..2122322,2122844..2123003|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008404:2113793..2123107
 
−
source=RiceChromosome11
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008404:2113793..2123107
 
−
source=RiceChromosome11
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atgcgaggcaacggcagggggcgggaggaggaggggaactccccaatgggccgccggttgcgggccgtctcggcccacctcctgccgccggcgtccaccaccaccaccaccggcggcgttgacctcgccgccaaccccaccgccggcgagtacgcgcacgtgcagggctacagtgctgtgctccctgagaagttgcagaccgggaagtggaatgtataccggaatgcgaagacacctcttaggttaatagatagattccctgatacccctgatattgcaacgcttcatgataatttcgtgtatgcagttgagacctttagggactgtagatacctgggcacaagaatctgcgctgatggaacagttggggactacaaatggatgacatatggagaagctagtacaaacaggactgcaataggttctggtcttatttatcatggaatacctgaaggtgcatgcattggtttgtattttataaacagacctgagtggatcatagttgatcatgcctgtgcagcatattcattcgtgtctgtgccactttatgacactcttggtccagatgcagttcagttcattgtcaaccatgcgacagtagaagctattttctgtgtgcctcaaacactaagcactctgttaagctttataactcaaatgccatgtgttcgccttatagtggtaattggtggagacaatgcaaatatgccatctaccccaacatctactggagtggaaattataatttactccagactactcaaccagggaaagatgagttctagaccttttcgtcctccaaaacctgaagatgttgccactatttgttacactagtggcacaaccggcacaccaaagggagttgttctttctcataggaacttaatcgcaaatgtagcaggatcaagtgtggtcattaagttttacccatctgatgtgtacatctcatatctacctttagctcacatctatgagagagttaaccagattgcactgcttcactatggagttgccattggattctaccaaggggataatttgaagctgatggatgatctggctgcactgagaccaacagtattttctagcgtaccccggctatataacagaatttatgctgcaattacaaatgctgtgaaggagtctggagggttgaaagaaagattttttcatgctgcatacaatgctaagaggcaagccattatgaatggacgaaatctgtccccaatgtgggacaaattggtatttaacaaaataaaagctaggcttggtggacgtgtgaggcttatgtcttcaggtgcttctccattgtcagcagatgtcatggaattcctaagagtatgcttcggttgtctcgtaattgaaggatatggaatgacagagacatcctgtgtcatcgctacaatggattgtgatgataggttaattggtcatgttggacctccaaatccatcttgtgagattaagctagtggatgtcccagaaatgaattacacctctgaggatcaaccatatcctcgtggagaaatttgtgttaggggaactacgatattttttggttactataaggatgaaatccaaacgagagaggtcattgatgaggacggttggttgcacactggagacataggtttgtggctgcctggagggcgtttaaaaattatagataggaaaaagaacattttcaagttagctcaaggagaatacatagctcccgagaagattgagaatgtctatgctaagtgcaagtttattgcgcagtgctttatatatggtgatagtttaaactcttctttggttgccgtagtagcagttgaaccagaggtgttgaaggcttgggctgcatcggaaggaatccagtacgaggatttaagacagctatgcgctgatacaagggcaagagctgctgtcctggctgacatggactctattggaaaggaggcacagctaagaggttttgaatttgccaaagctgttacccttgttgctgagcctttcacactagaaaatggtctcctcaccccaacattcaagatcaaaagaccgcaagctaaggcatactttgcaaaagaaatcgcagatatgtacgcacaactgcgtgaagcagaatcaacaaagtccaagttgtaa</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MRGNGRGREEEGNSPMGRRLRAVSAHLLPPASTTTTTGGVDLAA                    NPTAGEYAHVQGYSAVLPEKLQTGKWNVYRNAKTPLRLIDRFPDTPDIATLHDNFVYA                    VETFRDCRYLGTRICADGTVGDYKWMTYGEASTNRTAIGSGLIYHGIPEGACIGLYFI                    NRPEWIIVDHACAAYSFVSVPLYDTLGPDAVQFIVNHATVEAIFCVPQTLSTLLSFIT                    QMPCVRLIVVIGGDNANMPSTPTSTGVEIIIYSRLLNQGKMSSRPFRPPKPEDVATIC                    YTSGTTGTPKGVVLSHRNLIANVAGSSVVIKFYPSDVYISYLPLAHIYERVNQIALLH                    YGVAIGFYQGDNLKLMDDLAALRPTVFSSVPRLYNRIYAAITNAVKESGGLKERFFHA                    AYNAKRQAIMNGRNLSPMWDKLVFNKIKARLGGRVRLMSSGASPLSADVMEFLRVCFG                    CLVIEGYGMTETSCVIATMDCDDRLIGHVGPPNPSCEIKLVDVPEMNYTSEDQPYPRG                    EICVRGTTIFFGYYKDEIQTREVIDEDGWLHTGDIGLWLPGGRLKIIDRKKNIFKLAQ                    GEYIAPEKIENVYAKCKFIAQCFIYGDSLNSSLVAVVAVEPEVLKAWAASEGIQYEDL                    RQLCADTRARAAVLADMDSIGKEAQLRGFEFAKAVTLVAEPFTLENGLLTPTFKIKRP                    QAKAYFAKEIADMYAQLREAESTKSKL</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>8855..8950#8695..8781#8498..8584#8192..8277#8009..8112#6468..6554#6257..6380#5463..5581#5246..5375#5011..5099#4791..4879#3923..4016#3735..3814#3549..3638#2720..2806#2576..2620#2078..2154#1899..2004#1662..1743#1500..1571#917..994#786..846#105..264#acgagtgacgacgagtagtcctccacccctacgcctcgccttctcctctcttcttttcccacgcaaacgccggagacagaggaggagacaagagtccaagaccaatgcgaggcaacggcagggggcgggaggaggaggggaactccccaatgggccgccggttgcgggccgtctcggcccacctcctgccgccggcgtccaccaccaccaccaccggcggcgttgacctcgccgccaaccccaccgccggcgagtacgcgcacggtatgtcgtatcttcagtcccgtgtggtgatgcccgcgattcggatctctttggggttggattcccagctggtcgagcagactagcacttttgcttttagataataatctaaaattgtttctgattcccaaacggtggtggtaatacgcgtcgcaacactgtgttcatcggatttagttatggtcgtgtggagaggtttcgcttttctgaatttgtgctgccgagtccgcgcatcagttccatacttccgttgcttagctcggtagtatccttctcgctattggattagagtaatcgcttctaaagctccctttatatatctaaaaaattaaaaatatttagagtattcgcttgtgtgctgaataaaggtaaaagggatgaggccttttcttcctttttttagtatgccggcacacgaaagttgtggacttgtggattccccaactactgcatgtttgatttatctttcttgacaaaacagcctttttttagtttgtaactcaatgtcatagcttctccagtgcagggctacagtgctgtgctccctgagaagttgcagaccgggaagtggaatgtataccggtaggttatttatatttttggctgcatttgcttatgttgcagctcacaattgctgtttccaatcttgcaggaatgcgaagacacctcttaggttaatagatagattccctgatacccctgatattgcaacgcttcatgataatttcgtgtaagaatcctcgaaatctcatttgagcatccggcttttatttcttaatattattctcaacttggcgaagtctcagttatttacaaaatgttatgctatgatttatcaaattcttgttttgaattgtcagcaaacatgtgagtgcacaaacatagagttaagcaaaatgaacgctagttctgttttccctaggatgaattgtatcaggaggattcttaggaaaatctgattacataaaaagaattattggcaagggaagctgttctttaagctattttattgaaaccttggagccggaaaatgtttgtatctataagggaaaagtgagttaacctttatctattgttagatccacagcctgaatgcagatggtttttatctgatggttttatgaaagctgataaatttagatctgttgcaggctacatgctttacaagaaaattattattcttcaaatttaagttctgtgctaagttctgaggcaatataccccaaattgcgcaggtatgcagttgagacctttagggactgtagatacctgggcacaagaatctgcgctgatggaacagttggggagtaaggattagttcctggatatatgtgttattattggcttttgtagctttgttcaaatcttttaaatgatatatgtatggaactttgcagctacaaatggatgacatatggagaagctagtacaaacaggactgcaataggttctggtcttatttatcatggaatacctgaagtgagtcataatggtcgcaacaagtaccgtccttctttttttaactagtagcaggcagatcttgtcacacatggacaatgatataacatttgtatttacacttagagagtcccttttttttttaacttgctttattttttttaactctgaaccagggtgcatgcattggtttgtattttataaacagacctgagtggatcatagttgatcatgcctgtgcagcatattcattcgtgtctgtgccactttatgacactcttggtatgcactattcaccaaatgatcatctatatccttatcattcatctagcaacaatatttatgtaatctgcaggtccagatgcagttcagttcattgtcaaccatgcgacagtagaagctattttctgtgtgcctcaaacactaagcactgtgagctttaaccccttatctcagccttgtatagttattagtttatacaatcattaaaatttgcacttttcatgtcactggtaccagccattaactactgaaggtggcaagtagctagttatttccaggaaatagatctgtgctttcaggtgctgatctcatcctgctatgaacacacaatgtcaaaagactgcacactgcataaactgcatgctcatcatactgtttgttcttaaccatatccacatacgcacatgatcaatgggctgagcgctgggccctgaccatgaaatatgtttatgtggattctgatccttgtttcaaacactacatcagtttgtacctttaatttaatcatgatatattctttggaatgaagtatttttatgtttgcttatgtatatgtctctatttattgcagctgttaagctttataactcaaatgccatgtgttcgccttatagtggtaagttcgaaccatttataattagtatgttcaatcgagcagtcatgattttttaagaatctttgttctgttttttttttcttaacttgttttgtataggtaattggtggagacaatgcaaatatgccatctaccccaacatctactggagtggaaattataatttactccagactactcaaccaggtgaatttgctacatgatccttcagtttttgaaaactatattgtactaccttcatctcaaaatataagaacttttggggttgaacaagggtattaaggaagtatgtggagttaaatggcagaaggttttgattgatcgaaaagaggaagtagatggataaattaaatgagggaagattgcgattggttgaaaaaagaacgtaggtggagaagttgctatattttgggacaaacttagaatgctaaaagttgctatatttttggatagagggagtatatgggatactagtcttaacacctcatatagttttagagatgtctgcaccagatgagtttactaacactatatattgttcattgtatttgttctattccacgcaaaaaatgtatttgttctccaatttcagtcaaccgaatcaaactgcataccagttgactgcactccgtcatgtatgttgctctgattaaatttagacttgttccaaatgatttatccatatcagacaaagttgatgtggcatctagtttccacttatatttgtgtgagcagtgtgcctacgttttcatttttctttcttatggacacacatagtatgtgcattctgtacatattgtctttttaagttttgcgtcaaatgcctgcatatctgtatccagtcatatacataatctttggtgttagattgaaggttgctagcacttttgctcactatttttccatcgcttttgaatcttcaactcagggaaagatgagttctagaccttttcgtcctccaaaacctgaagatgttgccactatttgttacactagtggcacaaccggcacaccaaaggtaaataacccatgtttctgattattctttgctccattcaaagggcctttctaattcgacctttcaatcttgtggcacttgatgtcatatttccagggagttgttctttctcataggaacttaatcgcaaatgtagcaggatcaagtgtggtcattaagttttacccatctgatgtgtgaggagtttacattaaatctagattcatatctttctgctataacttaataaatttatatcatctctaaatgtttttgatagtagtcatgttgatatctctccacaggtacatctcatatctacctttagctcacatctatgagagagttaaccagattgcactgcttcactatggagttgccattggattctaccaaggggtatgcagatccaaaaccattcaggatgttaatttggtagttctttgcatttgctgtttgtgtaaataatagaacatgtagaacaatggagtttctgacttagaaaaggtatatatcaataaccggggccaggtgcacatgaaataaaccacttggaaaagcaattggtaatgctagttctcctgtaactgtaagttacccctagacataggagcagaattggatcaggtagtgcaatatttctaactgttagataagaatcatccagagatcaattgaacacagcagatttcgacagtctaatgtcgtttatataacagttctgaagtctgaactttctactcttcttaatacaatttcggttggttgagtttcggccgacccggctaaaaaattgaacacaatagatgcattttatgctggacctttcacctacaagatatcatcccattatagtagttgttatggcatccttgtcttaaatggatccattttgttatctcatgttagtttactgcacctctatgttgctcaccataatcctttcctcaccatcgcacctatcatattgctaccctattgctggatttccttgcgcacaggaatcagctagatatagggttatatcaggtgtgtttgctgcttgtttgcaagcagcaaacgctttgtgcaacacttgacaaatatgcatcacttccttttatatcaaatgttcatcttactgcatgcataataatcttttaccgccaattctgaattctttgtcatttccaggataatttgaagctgatggatgatctggctgcactgagaccaacagtattttctagcgtaccccggctatataacagaatttatgctgcgtaatacaactataccattaacttagatactttcgtgtttggcatgactatttctagtcatatcttttgcacgaaatcaattttttcccttttcagtaattctaactggctagttgtttattactctgtagaattacaaatgctgtgaaggagtctggagggttgaaagaaagattttttcatgctgcatacaatgctaagaggcaagccattatgaatggtaagaacagtatgaagctcattgcaattaagtgtcttatgtagttttgcaatgacattcctaggcagctcctacatgttttctgtcatcccattttttatccaccacatgtatgaaatgttaattctacatttttgtgttattaggacgaaatctgtccccaatgtgggacaaattggtatttaacaaaataaaagctaggcttggtggacgtgtgaggcttatgtcttcaggtgcttctccattgtcagcagatgtcatggaattcctaagagtgtaagctggcttcatatatgctcctttgggacagcatgattttataacttggattaactaataaattttgtcttatttttttaacagatgcttcggttgtctcgtaattgaaggatatggaatgacagagacatcctgtgtcatcgctacaatggattgtgatgataggttaattggtcatgttggacctccaaatccatcttgtggtaagatctgtgtttggattttcaaggatgtaactagatttgcttggataaaaaacttgtccttttgttcacagtaatccctcactgttatggtctgccactgtagcattaagattataatatttcccaaaataattaattagattaataggatcagttatttaatatcctatacatttggctctaggtttaactaggaaattagagattgctttgttgggatgataaggatccaattgttgatggtcgagatactgtaaagtacacaatgcctattggtacacatttctatctagcatatgtagtccaccggtataagtgaccgttgcatccctattatcatcaaaaaataaagtaaacacaaagttaggtttaacttgattatagtctcttggcaatcaggataaacccagcaccaataagagtgatcttgtctttatccctgctgtcagatccttatcgtatctatgaattagtgttcatgacgcccatcaagtcaagtctgcttcatatagttgtagtgcatagtaacccatcactgatgtaaaacatgtgacatctcatatttacctttcttaaccccaaataagtctaggtttcatcttcaactaaaatattgtttttttttgcgtgctatcacactctcataatgtaaatcctgttgccatttttcagagattaagctagtggatgtcccagaaatgaattacacctctgaggatcaaccatatcctcgtggagaaatttgtgttaggggaactacgatattttttggttactataaggatgaaatccaaacgtaacgtatcttgctatgtatttctgtctcctatttaagttcaaatatattaaatgagtttcagaaattacatttgaaaacatgcaggagagaggtcattgatgaggacggttggttgcacactggagacataggtttgtggctgcctggagggcgtttaaaaattatagataggtaaaactgaattactaccgtttgtgtttcagccatttcctttggaattaaaatggccttgtgccttcgtcatataatatctattttgttccttgataattttgccatcgcatcctttcaatcattgctaaacagtctcatgagtttggtgaagataggaataggattgatctactatccagcaaagttctgacttccaaattaatttttttcctaggcagaagaaaatatcatgctacaagttcctgcgaaaataaattatgatgcatagaagttttattagtgatgttttcatgtactccttccatttgaaaatatagctcttattttgggtgggcaagaggactaaggcggtacaatactaagaagaggagttaaaatgaccatgctacccatacttaattaaataccttaggaataggagagtggatggttagtgtcatgtgtgatgcttcctatatgcaagagagagtatgtgataaagggggcaaaataaagaaaaggctcaataaattcacatgaaagccttctgtttttcaacaagattgaaaaaactttaggcctcataaaaggaaacagagggagtgcatctttttttcttgaatacatgagaaaacaggaacaaggaagggagcaacgcccaccctcatccaaaccaccaacaaaccttagcctttacatgaaaaacacacaaactaaaaaacaacctcacccaagcgacctattaggaaactccctaagaagccctgggcatgatccaacattcattggtcactgtttggataactgtagttacactgagattaatgctgttaaacacacaattttttctatgcttccaaatcttccaaagagagggtgtacatcttaggacttacttttagcttccttgcagtttcctaatgatatccagatcagtgattgctaaattaagttgttaaatattaatgcatacttgaaatcttcattcagcttctactattttcttctcaccattatattgtttgttatatgagatttgcatggttggtgatgaaactctaatatgtgaaagctcactgctattctaaattatagaatttgctgtattttgtagttctgtgaatacataccatatactaagatggtagggacttgataaggttaaaactagtgtgctaaaagactaaagtaaaagcaagatattaactcctcatctactgatcgaagagcaaaccttaactatcctctactgttattgtagcagacagctttcaattgcgaaatgttgtaatgcatggatgttttttgagaaataaccacaactctattctgaaatctttttgtctgtaattatttatcctctttccacacaattttttaggctatctattttaatttattcccctggaactctgtttcgtctgattacttttcttattaaattttaattgatgcaattttcttttctcaaggaaaaagaacattttcaagttagctcaaggagaatacatagctcccgagaagattgagaatgtctatgctaagtgcaagtttattgcgcagtgctttatatatggtaatattcatgatcttatattggttattacgtactaattatttaccatgtatattctaagccgttgatttgaatgcaggtgatagtttaaactcttctttggttgccgtagtagcagttgaaccagaggtgttgaaggcttgggctgcatcggaaggaatccaggtaaatgtgctgaccttttttttgaagtaaagagtacatactatacatttgtacagcccagtttctccaaatcagcagattaccttcttgtatgttattatatattttccagttcactacacaaacactgcctttatttattaaaaaacagaactacaaatagagctccttacatccgcattgcctgcttatgttatgatcttccctttctaacctacagtacgaggatttaagacagctatgcgctgatacaagggcaagagctgctgtcctggctgacatggactctattggaaaggaggcacaggtttaattttcacttcttagttcttaccttacatgctctcttaataagtaaaagttctgtatgatgtgtatgatccttatctatctctctgtgcttacttactgtaccagctaagaggttttgaatttgccaaagctgttacccttgttgctgagcctttcacactagaaaatggtctcctcaccccaacattcaaggtaggcccgttaattctgttgcaggagatctcgatacctaaggtgctaattctctatctcaatgatgttgcagatcaaaagaccgcaagctaaggcatactttgcaaaagaaatcgcagatatgtacgcacaactgcgtgaagcagaatcaacaaagtccaagttgtaattacccgagtaacaaacagaataaaggttcaaccaacacaggagatttagttcgccaattgtatattcaacaggatgaaataagcgccttctatttactggccaagcaaacaatgacagcagtatttcacgagcccttccatctgacgacgaaatgaaacttcaccgatcaacagcagggaacagttggatgtagaggccggtttcttaatccattatctaaaaaacagcagggaacagtgcttgatgcataattcatatttgtttcttatttgagtgaagtaatactactgtttagtgggatatggactactcatttgtttgggacagtatttggtgcggaattaatatttgtttgttgctagc</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001072271.1 RefSeq:Os11g0147000]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 11]]
 
−
[[Category:Chromosome 11]]
 

Latest revision as of 13:46, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information