|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os04g0529500|
| |
| − | Description = Similar to C-terminal domain phosphatase-like 1|
| |
| − | Version = NM_001059916.1 GI:115459561 GeneID:4336474|
| |
| − | Length = 10465 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os04g0529500, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 4|Chromosome 4]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 4:26882666..26893130|
| + | |
| − | CDS = 26884176..26884441,26884933..26885143,26885335..26885492,26885577..26885647,26885823..26885928<br>,26885996..26886082,26886707..26887264,26887361..26887424,26888468..26888601<br>,26888684..26888737,26889437..26889533,26890736..26890941,26891017..26891100<br>,26891381..26891446,26891999..26892072,26892169..26892271|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008397:26882666..26893130
| + | |
| − | source=RiceChromosome04
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008397:26882666..26893130
| + | |
| − | source=RiceChromosome04
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>gacagaattgatgcacttcagagaaagttgagtaacgagattgatcctcaacatattagtggtatgtcggcagagatcaagaggtaccaagaagacaagtctatcctaaagcagtatatagaaaatgatcaggttattgatggtggcaaggtttataaagtacagactgaggttatcccacctttacctgataatcatcagcctatgacacgtccaatcataagattacaagagaaaaatattatcctgacgcgtataaatccattgataagagataccagtgttctggtacggttgaggcctgcatgggaggatcttcggagctacttaattgcaagaggtcgcaaacgttttgaggtatatgtgtgcacaatggctgagagggactatgctttggaaatgtggaggttgctcgatccagattcaagattgataaactctgttcaacttactgacagacttgtctgtgttaaatctggctctcgaaagtctctgctgaatgtattccatgatgggtcttgccacccagaaatggccctagtgattgatgatcgcttgaaagtttgggatgagaaagaccagtgtagggttcacgttgttcctgccttttctccatattactctccccaggcagaggcaaacttctctgttccagttctctgctttgctagaaatgttgcatgcaatgtcaggggtggttttttcaaagaatttgatgaggtccttctgccacggataagcgagattcactacgaggacgaaataaatgattttccgtccgctcctgatgttggcaattatttgattaccgaggacgagaatgctgccattttgaatgtaaacaaagatcctcttgcttttgatggtatggcagatgcagaagttgagaggagattgaaggaagtgtcttgcagtgttcaagctgtgaatccaataccaactaatgctgatgtgatgcctgtggcccctaaccagcaacttattacatcatctgttccagaagcaccatcattgggcatgattcctttgaataatgatcaaggtcctcagcctccttcaagctggccggttgctcaatctgctcctgtggatccatcgcaaagttctccagctagagaagagggtgaggttcctgaatctgagttggatccggacacaaggagaaggcttctcatattacagcatggtcaagacacgagagatcctgcaccaccctgtcctgcaggatcacccgtacagacctcagtattgccagtgcaatctcatgggaattggtcacatgtagaggatgagatgaatccaagaagcctaaataggacctcaacagggttccatttagaatctgatgatataaattatgataaaaagcaaccacataatccaccgtattttcctgatgaggataatcttataacttctgatagatataaccgtcggatccatagatacccctcacagctgcctcacagtgaggatcatcatatgctgaatcgttcatctatagcctacagatcttttcctggagaggacatgggaaaccgatttggtccttcgaatcatagaagcagtaaaatagaaccaggacaccagtttgtacaaaacgcagagacctcagctggtgtgttggaggaaattgcagtggaatgtgggtttaaggtggagtaccaatcaactttgtgtagtactgcagagttgcaattctccattgaggttaggattttaggagaaaaggtaggtgaaggaattggaaaaacaagaaaagcagcaaaacgccaagctgttaatatgtccttaagaaatctggcagaaaaatttctaacgtctgatccggataagatgatgattctgaaggagaatggttttagtagtaattcaaactcattcagatattcgggaggtagtagagatgacacatcaccagttgcaagcacttcaaacgagtctagatacatgggcgagagagttgatactttaagaaaacctgctggttctgttgctgctctcaaagagctttgtacggttgagggttacaacttagttttccaagagcagccatcacgtcctcgtggttcatcaggtaaagaagcttatgctcaggtcgaaataggtggtcaaatcctgggaaaaggagttggagcaacatgggaacaagctaagctgcaggctgctgatgaggctctaggaaatttgaaatccatgcttggtatctttgcacataaatcatctggatttcaaaggtcatcggtatcaaattttaatcgcttcaaaccagatttccagcggagtctacaaaccataccttctggttgggactctaggaacaatggtcgtgttctttga</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>DRIDALQRKLSNEIDPQHISGMSAEIKRYQEDKSILKQYIENDQ VIDGGKVYKVQTEVIPPLPDNHQPMTRPIIRLQEKNIILTRINPLIRDTSVLVRLRPA WEDLRSYLIARGRKRFEVYVCTMAERDYALEMWRLLDPDSRLINSVQLTDRLVCVKSG SRKSLLNVFHDGSCHPEMALVIDDRLKVWDEKDQCRVHVVPAFSPYYSPQAEANFSVP VLCFARNVACNVRGGFFKEFDEVLLPRISEIHYEDEINDFPSAPDVGNYLITEDENAA ILNVNKDPLAFDGMADAEVERRLKEVSCSVQAVNPIPTNADVMPVAPNQQLITSSVPE APSLGMIPLNNDQGPQPPSSWPVAQSAPVDPSQSSPAREEGEVPESELDPDTRRRLLI LQHGQDTRDPAPPCPAGSPVQTSVLPVQSHGNWSHVEDEMNPRSLNRTSTGFHLESDD INYDKKQPHNPPYFPDEDNLITSDRYNRRIHRYPSQLPHSEDHHMLNRSSIAYRSFPG EDMGNRFGPSNHRSSKIEPGHQFVQNAETSAGVLEEIAVECGFKVEYQSTLCSTAELQ FSIEVRILGEKVGEGIGKTRKAAKRQAVNMSLRNLAEKFLTSDPDKMMILKENGFSSN SNSFRYSGGSRDDTSPVASTSNESRYMGERVDTLRKPAGSVAALKELCTVEGYNLVFQ EQPSRPRGSSGKEAYAQVEIGGQILGKGVGATWEQAKLQAADEALGNLKSMLGIFAHK SSGFQRSSVSNFNRFKPDFQRSLQTIPSGWDSRNNGRVL</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 4]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>1511..1776#2268..2478#2670..2827#2912..2982#3158..3263#3331..3417#4042..4599#4696..4759#5803..5936#6019..6072#6772..6868#8071..8276#8352..8435#8716..8781#9334..9407#9504..9606#gggagcacctccattgggcatgtggaggtgtggcccaagggcgggacggacctggcggtggcggcgtgggcgcgggagatccgggtggaccacctgtcgccgcccagcgagcggtgcccgccgctcgccgtgctgcacgccgttgccgcgggcggtcgctgcctcgtgatggagtccaggcccacggccaccgcggatgagcccccgccgccgctcgtcgccatgcacgccgcttgcctcagggacggaaaggtacatgaattactcccaacaagaaacccacagacaaataataaaagaagggaatgaacgaacgaatggaacatttgattttacatggtcaagtttacccgaacagcaaatagttttttagcacatgaaagaactagtctatttttttccctgaaacatttattggtaatttatctctggacaagtaatttgacaacgatggtgacatgactaatgatactgactggaacctattccagaattcacttttcttcatgattattgtgtgtactggacttgattttattctatctcaattttcaataattgaactaatcgaaatacagaatctggcctgatgctgttgaatgacagaggtttcaggaacagcatttcatgtttcagaaatggagaagttttgatttttgagtgtgacacttttaatggttgttgaaacatacccaatgcagcgaagaatttgcttttcttcaatagttcttgactttggacttgacacacttgctatcaggagttcattgctgcaattgatcatgaaccgtgaactgctgaactctgcgtattgaaagacattgtttgagggatgagtgaaggttacttgaataatttgaacgcattaatctaactcatctgctagcaacttaatgtgtttcttgcttccacttgaattatttgataattacatctatattaagaaacacactattttcggcctaatatttcctttacatagttggattaaatagcatttaactgtggtcaggacagtgctataaatattcctggtattgatttcgctattttaagatttggatggatatagagtttttaatccacacatgccttttttttaacaagtatccccttttttgcatttctgttgtaccttttattttctgtactactttgtggatgttactctgatatgcaggtatgtgaacaaatgtactagatgccatgccttttacatgattgcattttgtattagtgacgaacatttctcctttttcttaatccttttcatttcctttcattctctcctgcttgcagactgctgtttttcctctaggagcagaagagatccatttagtggcaatgacttccaagagaaacttgccgaatcttgcttgtttttggggctataaggtgccatcgggcttgtataattcttgcttgagcatgttgaatcttcgttgccttggtattgtgtttgaccttgatgaaacattgcttgtcgccaataccacacggtcctttgaagacagaattgatgcacttcagagaaagttgagtaacgagattgatcctcaacatattagtggtatgtcggcagagatcaagaggtaccaagaagacaagtctatcctaaagcagtatatagaaaatgatcaggttattgatggtggcaaggtttataaagtacagactgaggttatcccacctttacctgataatcatcagcctatgacacgtccaatcataagattacaagagaaaaatattatcctgacgcgtataaatccattggtatgtatttcttcaatcaacctttttctagagtcatgtgatgccagatgtctgttgtctctacatctgttacattgattaacataaaaatgaaataccacaattcactttattttgcatcatgtgctttgattgagtttaccatcataactcaattaaatctattttgtactctaattttactaattttatttggcactgctttttaaaagaaaaatatagcaaccttttggttttggtgctgtcagttcttaatgtattacaaatcatgtaattaatgtgactcaaattgaattggcaaataagccttgcttagtggttggtactgttgagggcaagttgcattagctggtgtggcaactgaaaatttgatctcctattgcgatattttgagcgctaagcacttcccgtctattcagctttgatacaaccatgttccatgtttccatgctgttatactgcctagttgattttccctttttcttaattagataagagataccagtgttctggtacggttgaggcctgcatgggaggatcttcggagctacttaattgcaagaggtcgcaaacgttttgaggtatatgtgtgcacaatggctgagagggactatgctttggaaatgtggaggttgctcgatccagattcaagattgataaactctgttcaacttactgacagacttgtctgtgttaaatctggtaggtgttagcattactattactttcaaacaacacaactaccaaaggaatatagtgtcatttggtatattttgtacaccgcaatcaatgttttgtgttgtctaatttccttcatacaaatttccatgtgcatgaacataatgtcttggaattttccatcttttgacgttaatgctacaccactcttataggctctcgaaagtctctgctgaatgtattccatgatgggtcttgccacccagaaatggccctagtgattgatgatcgcttgaaagtttgggatgagaaagaccagtgtagggttcacgttgttcctgccttttctccatattactctccccaggcagaggtaaggtttatctgtactttacaccaacacaaatatatattttttagtattggttattgagggtaccttgtcttgaactatcaggcaaacttctctgttccagttctctgctttgctagaaatgttgcatgcaatgtcaggggtggttttttcaagtaaggatatccatctttgcctatgtgatctaagtaaattcattgccatgactcattgtagtcccagctaaatttaatatactccgttctgccacacaattttttttcttgttattgtgccatagaccaagtgtgaattattttgagatacagaaatttacgatttaattgacagagaatttgatgaggtccttctgccacggataagcgagattcactacgaggacgaaataaatgattttccgtccgctcctgatgttggcaattatttgattaccgaggtaaactttgtaaaatgcatgttcgattccctagtaactgccaacttacactcagtctcttcaataggacgagaatgctgccattttgaatgtaaacaaagatcctcttgcttttgatggtatggcagatgcagaagttgagaggagattgaaggtgttcacttctacaaaccattagttcactaccctgttcttcttggttaatattgatgtgaatagaaactgaataccaagatgtacttttcctaaattagatgctgcatattaataatatactctagttattttttaggttttgcacaatgcattttggaacaaaaaaaatacactgtttaatatttcatgtgtatttttttgttcattaggaattatgctaggcacaaaatctcatggtcaacagtattataaaattttgtttgaatatgcagttgcaatagactattggggcattagatcaatctaatgtctcattcaatactttaatatattatactgttcagcatagtgtttctctatttacatgatcttaatctgcataaatcatttatttatttgaagtgaacaagagggtgtattaagttatcctaatccttttcgttggaccagccaattgcgaatgctatagctatgcccctatgactatgttgttactccaatgggttgactggtcgtcttgtgagaaaaaaaatgctgagatcaattacaagcctatattatcatgtttcttagcaatgactactgtttttaccttttacgtatgtatatgcactattttcaggaagtgtcttgcagtgttcaagctgtgaatccaataccaactaatgctgatgtgatgcctgtggcccctaaccagcaacttattacatcatctgttccagaagcaccatcattgggcatgattcctttgaataatgatcaaggtcctcagcctccttcaagctggccggttgctcaatctgctcctgtggatccatcgcaaagttctccagctagagaagagggtgaggttcctgaatctgagttggatccggacacaaggagaaggcttctcatattacagcatggtcaagacacgagagatcctgcaccaccctgtcctgcaggatcacccgtacagacctcagtattgccagtgcaatctcatgggaattggtcacatgtagaggatgagatgaatccaagaagcctaaataggacctcaacagggttccatttagaatctgatgatataaattatgataaaaagcaaccacataatccaccgtattttcctgatgaggataatcttataacttctgatagatataaccgtcggatccatagatacccctcacaggtcagtggtcatccaccagatcgattattcaattaatatatgtttgttaatgaagtatatctggacaatctgttgacaaatgcctgatttattcagctgcctcacagtgaggatcatcatatgctgaatcgttcatctatagcctacagatcttttcctggtatgttttgttttacctctgatggttctaaagttcttctgaagattactagctgcatagggtagtgcatgatctatgtcttcccgttgagctcgctgcattaagcttaagatgttagcataagccaatctactagtctcttgtcttgcatatttctagagttgagtacttgtgtacctgtctaaatgcaacctttctgtcttagatccttaataaaattttggtttgtcatcataactaaagttatatttagtttgataatatgtttgctagtttagcatcacattttggtttgagttgattcagaagcaacaacacattatggcttacacataagtgctggattaatcttttttgagttagtttggctggcttgttatatgccatcaatcatgatttcatgggtttacttgaatccatctaactgccaagtctactgaaatttttggcccagagatgatttgccgtaattgtactttagctgcagaaatgataagttgaatttattgtagctcttgaggtcccattcaaaacacatctgaagctcatgactcattttaatattttaatatctattgtgttcatcatgtcttgtttttcccactcttcacttggtatagtgtaacgttattatgtaaaatgcttcattattcatgacaactaattgaatggttctgtgtgtttcctcgatccagttaatttctgaaattctagctcattgaaatgtcttttattacatataataatattagattggtcttattgccattaacgaagcttgtgggctgcatacatggtagttttcaagcttatacggggacatgttatcaatgggttgagaattaaaactggttaaatgactgcttcctttatttcaatcaattaaatgtgtgttgcctcttgctcgctcaatgttgcccgcccccagtatcatgaatgacccctcttaaacttcaactttaggctttcactttagagcatcttaaactttccatggataaaaaaagtatcattttaaactgtctgctgtctgctatgtgaaggagaggacatgggaaaccgatttggtccttcgaatcatagaagcagtaaaatagaaccaggacaccagtttgtacaaaacgcagagacctcagctggtgtgttggaggaaattgcagtggaatgtgggtttaaggtagtttggatgtgaaataacagtattattatcttcttcctgtattactttgctgttgatgtatttattcattcatttttaggtggagtaccaatcaactttgtgtagtactgcagagttgcaattctccattgaggtaaagtaaaaacttctgcgaattccactctcctttattaccacataaatctctattattataaaaattgaagatgtttttaccggtatttttggtacgccatccgtatttgagtcggtttttaagttcgttcgcttttggaaatacagattcgtgtttgagtcggatcttaagttcgtttgcttttgaaaatataaaaggagtcgtataagaaatctttttaaaaatactcgcatgctaacttgagatgaaagtcagactcctaattgtagcttataatcttctaaaaaaatatccaagcgaattcccacagtgaatttcatcatggctaaaccatataacaataataagattaaaatagcattcacccgttgcaacgcatgggcattttttctagttttatttaaatgatcatgttaatgggcagttatatttgttatcatgagaaattgtgaaaacttgtggacttcaggaaataaccttggcaccaggaatttctctatctctacaaagatcatgtggcttaaggcctaacttacattttcccaaattatttgaacttgttttttcccaaattatttgaacttgttttttcccaaattatttgaacttgttgcttcacgcaaattgttctaatcttcttgcagtcttataagattgcttcatgtttagtcatatctttctttgtgcatgtttcaggttaggattttaggagaaaaggtaggtgaaggaattggaaaaacaagaaaagcagcaaaacgccaagctgttaatatgtccttaagaaatctggcaggtaagttcgttgagaacttcttggtttcttgattctgcgtggcaaatgccaaatgtataactaaagtatggggccatggtgtttaatatttttgttgggtcaacagagaagtccaggttgaattttgttaagacagagaggtacacatagcacatctgacaataatgctgccaacaaattacatgatcacccaatggcgaacacagtactaaaatttagcgggtgctagttaattaaatctaccacacaagattatcatcaaagtaaatggtatttatatgttttgccatgatgccattgaaattaaaaccataacttttattagttgacttatattatcattagcacgaggagtactacttgtagacttaattggaaacaaactatgtaatattgatgtcgccaattgttgcaaatctacgaatagataaatgtaaatgcaataatagtcaatacatgaattagaaattataatgcagttgtgtataattagttgcacaaggaatcttggattaaggaattaaggcaaatgtttaacgcgtgagttgagtctgcttaagcacgaattgcttcctgcttgccaaagtcatactgctacactgtgccacgctgctccttgcccccctggcacgtctcctgctatggacagacttacagatggatttcatgggattggttcattgttggattaataggcttggttgctggaaataatggattatctaccctagcccccgttcaatggaggtgctaggggggtggggttgcaatgggtcgtgcggctgccgggtgtgtgcgaatcccctttgctgccttctgcatccgctactgagatcatctcacgagaacactctcgaggatacaagtgaaaattgcttgatcatggggttattttgttttaagcaacttctaaggtatcatggaggtctcgagatattggaaaacattgttgttctgacttggcatctctgaactattctctgctgaagttgttgaattattttctgcctttgtattatttgtatatatatctgtccttaaccaatttccatttggcctcatgattgatcttttcaaattgttatatagaaaatatagaacactataccaagagaaatcctcatgaaagctttatataagttttggtatctttcccatgtaaaatattttgagcctgattggccaatgatgttcacttgcagaaaaatttctaacgtctgatccggataagatgatgattctgaaggagaatggttttagtagtaattcaaactcattcagatattcgggaggtagtagagatgacacatcaccagttgcaagcacttcaaacgagtctagatacatgggcgagagagttgatactttaagaaaacctgctggttctgttgctgctctcaaagagcttgtaagtggctgccttaattatcagcttttagacgagtgcaatttatttactgaactatgttgtgatgcattgcagtgtacggttgagggttacaacttagttttccaagagcagccatcacgtcctcgtggttcatcaggtaaagaagcttatgctcaggttagtacttcagtgaatgaatgtccatcgaacttctatatggtacatgattaacctctaaagtaggttgtttagaaaactaaaattgcaccaactttacaacttacaggccatcaaaagatctctttgatcaatctgtatttgatgtgatatgatgccctttaacactaatacaatggaagtagtataagatgttccttttgttgtcttgtcaagagctgttatccttttagaactttttgagtttgcatgtttcgtttacctgcatttggtttttcaggtcgaaataggtggtcaaatcctgggaaaaggagttggagcaacatgggaacaagctaagctgcaggttgtaaatagataagatagatgaaatgatttactctgatcacttcaatttgttaaagtttcaaaaccaacaaataaaccctgaggtctgagtttctgccttgctatgagcagagggagagggattgtttcgtttaactaagttcgatttgtggagtaaagaatctttatactagctgtttggactcatagtaactatttaaatgttttcttttctctttgggacttataaggagggtcatttttcaatgtgtacagcaagatgctgcctttctcttgtatttgttttaggaaaaaacatacaacatgtacaacattgacaacatcaaagataatagttatttaaaacttctagtaatgataaagatactactacgttggtagatgcagcaattgcctctagaaaatattaaaagtgcacacatgttaaatgtttacagactcaacttggttcttgtgtagatgttgtctcttccactagacaactttgtatgcgcccatttgtgcattattcctgcactgcttttttacttaatattatgttcttttataggctgctgatgaggctctaggaaatttgaaatccatgcttggtatctttgcacataaatcatctggatttcaaaggtgattttaatctccacaatattagtcctctatttaatctaaattggtttgtgcacatgcaatgccaatgtttataatatttattcttttccacaggtcatcggtatcaaattttaatcgcttcaaaccagatttccagcggagtctacaaaccataccttctggttgggactctaggaacaatggtcgtgttctttgatgttcgtcttctggacatctgaacttgatgggatcaatagcatggaacctgttggcccagaagaacttcaaggactgcaagtatggacgagatggtcatggaaggagaaatcgctgtgcacatgatgcctgcatgtttcgttctgtcgttctcgatttggtgatagaattgtgttgctgtcatttccaatctagtaactcggtaactcccaacaggtgctctgtttgaagatgttgtaacctggcctccgagtgagctcacgccacacggtgctcggctgtgatttgccctgactctgttacccgtgataccccagtggagtgtggatattagaagcatgacagttggtaaaatggcttccttgcgtgcagtagattagccaattgtattgctcgaattaatttgtttcttcagatcttagatttagggtggtagcttgattggacagttttgctacgtagtggtagcttcaattccatgggggtaattcccatggctttgattccagttttacactgcttcctgctgctcttcatggccatgtttggttcatacagcaaccgggttcggctggtgttggtccaaggcttaaggaggttggctatgtatacagattggtgccatactcctgcattgggtgatgcatgatgctgaattgctgattgatgctacagagtatatacctgcattggttgaagatctttatgagaagctcgaatcttggtggctacgtgcacaatgttgtccctctttctgtttatctgtatgcttgagataagcagactttggccttctatttccgtgaggagatagaggccggagggtgtatttcttatcacctcaatcaaaaaagataatt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001059916.1 RefSeq:Os04g0529500]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 4]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 4]]
| |
