|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os10g0170300|
| |
| − | Description = Conserved hypothetical protein|
| |
| − | Version = NM_001070768.1 GI:115481279 GeneID:4348186|
| |
| − | Length = 6326 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os10g0170300, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 10|Chromosome 10]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 10:4516500..4522825|
| + | |
| − | CDS = 4516523..4516755,4516902..4516936,4517032..4517153,4517396..4517485,4517611..4517730<br>,4517841..4517924,4518023..4518100,4518249..4518374,4518464..4518553<br>,4519083..4519118,4519194..4519249,4519469..4519616,4519697..4520165<br>,4520255..4520346,4520459..4521011,4521149..4521284,4521495..4521536<br>,4521625..4521793,4522371..4522454,4522560..4522655|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008403:4516500..4522825
| + | |
| − | source=RiceChromosome10
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008403:4516500..4522825
| + | |
| − | source=RiceChromosome10
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggcggcgccggggagccacacccgccgccgcgcgtggccgctgctgttcctcgccgtcctcatgttccactcgctcgccatctacctcttcacccgcggcttcctcctcacccgcaccgagctcgacgtccacagccaccgcgacgaccgcatcggcatctccccgggctgctcctcctggcccccgcccgccgtcgaccgcctcgtcatcgtcgtcctcgacgccctcaggttcgattttgtggcaccaagtacattctttcaagagaggcaaccatggatggacaaactgcaggttctgcaaagattggctgctgatgagaagacctctgctaggatattcaaagcgcttgctgatccaccgacgactagccttcaacgtcttaaggctctgacgacaggtggtctgcctacatttattgatgtgggaaatagctttggagctccagcaatagtagaagacaacataatgcatcagtttgccaaaaatggaaagagggtcgtcatgatgggagacgatacttggatccagttataccctgaacatttcaacaagtcatatccttacccttcttttaacgttaaagatcttgacacagtagacaatggtgttattgagcacttgcttccatcattacacaaaaatgattgggacgttcttattgcacatttccttggcgtggaccatgcagggcatatattcggtgttgactctaccccaatgatccagaagttggagcaatacaatcggatcctagaggatgtaattgacacattgaaaagtctatcaacatcgggtggtccccatgagaatactttacttcttgtaatgggggatcatggccaaacactaaatggtgatcatggtggaggaactgctgaagaggttgaaacatcgctctttgcatggagtccgaagaccccaccaaatgctgtcttgtctgttcttggtaaaaatttatgcaacgctgatctgcatggtaaagaggtgtgcgtcagcactatgcagcagcttgattttgcagtaactatagcagcgctacttggtataccttttccttttggaagcattggacgtgtaaacccagaattgtatgctctgagtgctggaacatgggataatcaacagatcggtgccaatgattgtacacagcagaatgatctagaagcatggatgcggagatatgctgaagctctctgtataaattgttggcaggtaaagaggtacattgatcgatattctgccacttctgttattggatttcgagcagaagacctgaaccatgttgcagatctgtattcaaaagctcaggcaaattggtcctctgtcctgaggtctacatgtccagtggaaacaagcagtcaggatgaattaaaggagtgcgcaaataaggaatgcacaagttcagctctgcggttgcaaattgatgcatactctgacttcttggagagctttgcaaagcttgctcgctctgcatggactgagtttgatttatggctgatgggcattggtctttcagttatgatactgtcagttagtactcaggcatgtatgcttgtgaagttgaatattgatcaaatttcagaaaaggaaagagcaagttcaagtttcattccgaaaaatttctttgcttttgcattggttgcaattcgggcagcaagtttcctatccaatagctatatattggcagaaggtagagttgcaaactttcttttggccacgagttgcattgccagtgtgtggcactcagccacaaaaggaaaattcatcatagaagagtttgtttttctcctccttaatattttcatacgatttgggattgagtttgggatgtcaaaacaaatttctgggtcaataatttcaaatgaccacccagtcagcattatttgtggcctgtttggttcaagtttttgcagtgatctcatggaaatattccccatcatatctcttaccttagtggcctatataattttgaagtgcatatcctatgcgatcagtcatagattcttgaagtactctgttatgtctggaagcatcttgagttatatatttatagcaattcattgggcttctgaaagtactttgctctctcatactaaagctactagagagactggaataagtttagctcctcgccttgtatacactattggaggtttatcattagcaatatctgcattttatcggttgtttgggtcaactgatcatttgaagatgaatgaaaggataactagtttgtcagctgtcatgctgtgctcctggagtcctactatcttgatcttgttgggaagacaaggtccctttgtggctctaatttgtatgactatagcatggtgtataataaagttacagcagaaaaatcagagagagctgaaacttgacaaaggaatacatgctgctgactctgtttcagtaacacaatggagctttctggcagtttgtctattttatctgacgggtcattggtgtacctttgatggcctccgttatggtgctgcattcattgggtttgatcatttccatattatccgacaaggccttcttctttccattgatacttttggcgtttctcacatactgcctgttcttagtcttccgtttattgccatatgctggtacaattctgcatccaagaacagcaaggtgaatgatgccactgtcaccagattaatacaggtgcttttgatgtatggtttaattacatcaatcacaacaacgcttacaatcatttgtgttaccattcaacggcgtcacttgatggtctggggtttatttgccccaaaatacgtatttgatgctatcgggcttcttctgaccgacttgttagttgttctggcatctatctattacagctga</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MAAPGSHTRRRAWPLLFLAVLMFHSLAIYLFTRGFLLTRTELDV HSHRDDRIGISPGCSSWPPPAVDRLVIVVLDALRFDFVAPSTFFQERQPWMDKLQVLQ RLAADEKTSARIFKALADPPTTSLQRLKALTTGGLPTFIDVGNSFGAPAIVEDNIMHQ FAKNGKRVVMMGDDTWIQLYPEHFNKSYPYPSFNVKDLDTVDNGVIEHLLPSLHKNDW DVLIAHFLGVDHAGHIFGVDSTPMIQKLEQYNRILEDVIDTLKSLSTSGGPHENTLLL VMGDHGQTLNGDHGGGTAEEVETSLFAWSPKTPPNAVLSVLGKNLCNADLHGKEVCVS TMQQLDFAVTIAALLGIPFPFGSIGRVNPELYALSAGTWDNQQIGANDCTQQNDLEAW MRRYAEALCINCWQVKRYIDRYSATSVIGFRAEDLNHVADLYSKAQANWSSVLRSTCP VETSSQDELKECANKECTSSALRLQIDAYSDFLESFAKLARSAWTEFDLWLMGIGLSV MILSVSTQACMLVKLNIDQISEKERASSSFIPKNFFAFALVAIRAASFLSNSYILAEG RVANFLLATSCIASVWHSATKGKFIIEEFVFLLLNIFIRFGIEFGMSKQISGSIISND HPVSIICGLFGSSFCSDLMEIFPIISLTLVAYIILKCISYAISHRFLKYSVMSGSILS YIFIAIHWASESTLLSHTKATRETGISLAPRLVYTIGGLSLAISAFYRLFGSTDHLKM NERITSLSAVMLCSWSPTILILLGRQGPFVALICMTIAWCIIKLQQKNQRELKLDKGI HAADSVSVTQWSFLAVCLFYLTGHWCTFDGLRYGAAFIGFDHFHIIRQGLLLSIDTFG VSHILPVLSLPFIAICWYNSASKNSKVNDATVTRLIQVLLMYGLITSITTTLTIICVT IQRRHLMVWGLFAPKYVFDAIGLLLTDLLVVLASIYYS</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 10]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>24..256#403..437#533..654#897..986#1112..1231#1342..1425#1524..1601#1750..1875#1965..2054#2584..2619#2695..2750#2970..3117#3198..3666#3756..3847#3960..4512#4650..4785#4996..5037#5126..5294#5872..5955#6061..6156#gccgcggttcgctgacgggatccatggcggcgccggggagccacacccgccgccgcgcgtggccgctgctgttcctcgccgtcctcatgttccactcgctcgccatctacctcttcacccgcggcttcctcctcacccgcaccgagctcgacgtccacagccaccgcgacgaccgcatcggcatctccccgggctgctcctcctggcccccgcccgccgtcgaccgcctcgtcatcgtcgtcctcgacgccctcaggtaaaatcaccacccctcgaatcttagattccccaagagagaaattaaatctcttgttggctactgcgattatactcagtgttgggttaccgagaaagtaggataagtttggagctgacacagttgtgcaatgcactgtcctgcaggttcgattttgtggcaccaagtacattctttcaaggtgatttactccttttatgtattactataatgctcaacgtgtaacatgtgagaatgtgatttgtaactctgagatgaggccatgattcgctgcagagaggcaaccatggatggacaaactgcaggttctgcaaagattggctgctgatgagaagacctctgctaggatattcaaagcgcttgctgatccaccgacgactagccttcaacgtcttaaggtgatcaactctgtttctgttgttgttaatccagatattcattcattcatcaacagagttaccctgaaaaattgttgtcctttcctcaattcagtgcagtataagattatcgcattatatgcattcatgaattgagttgacctgatatgctctgcacgattcagtgcaatcaaatggttgtaactttgtgtgttcttcaccccccaggctttaacatccttgctgtaaaattctatactcaggctctgacgacaggtggtctgcctacatttattgatgtgggaaatagctttggagctccagcaatagtagaagacaacataatgcatcaggttcttgtcacaatctcatcttgcatctaacattacaaatatggtgtcagtaaacttactcagtttattctggataactaaccgtggaagtatgtgttgcctattgtttctttgtactcaatcagtttgccaaaaatggaaagagggtcgtcatgatgggagacgatacttggatccagttataccctgaacatttcaacaagtcatatccttacccttcttttaacgttaaagatcttgacacagtatgtcatatcttttgtaccattcttttccttgttctgcagtgcgagtttttttcctcccataaattttccatgaaattaccagtaattgtatttatcgtatatatcaggtagacaatggtgttattgagcacttgcttccatcattacacaaaaatgattgggacgttcttattgcacatttccttggcgtggtaagttattgtgcattctcttatgccttagcttaaaaatttaatccttttatcctgtccgttttgaataaagaacatgtgagatcaacttcctttaggaccatgcagggcatatattcggtgttgactctaccccaatgatccagaagttggagcaatacaatcggatcctagaggtcagtcacctcatgcacaaatatataatgtggctttatgcttacctgcttatcattcttttaaatttgacctcattatgttctttattcccatatgatggccatattaactatgataatcaaatgctgctatatttaactcatacaggatgtaattgacacattgaaaagtctatcaacatcgggtggtccccatgagaatactttacttcttgtaatgggggatcatggccaaacactaaatggtgatcatggtggaggaactgctgaagaggtgatctatcttatgttttgttgctaaatgctgaagaggaacactaaatggtaatcatgtctacataactaatgctgttactattataggttgaaacatcgctctttgcatggagtccgaagaccccaccaaatgctgtcttgtctgttcttggtaaaaatttatgcaacgctgatctggtacattttcttatcctatatgttctgctaactaattatgatttgagctatcttgccatgtatggcgataatgttatgatcaggactaagttttcaaacaattataattaatattcattggccatattataacctgagttacattttttttgtctagaacacttaaactagaattgcgtacagaagatatttttctaatcccttgcttccatattgaatgccttactgttgtatatttggtttgacatctaaaaccgtagggcaaagtgattgactattttaaactctactctgactgtgttatgcatggctatgaagtactgcatgcagcgttttttaatgaaaagagtgggaatgagggcctgtagattttaggaatgtaaatttgaaataagcagtgattgatgtaatacagtttttggccaagatacatgttaatcgtagtacattttgtttagccagattttgcttgcttttatttgtgactgtagtaatgtgcctactaatcacacgtttatttcttttctagcatggtaaagaggtgtgcgtcagcactatgcagcaggtcagtgctaactgcattcttttatgttgatggcttatatgatcaatattgcttaatttttctccttgttcttagcttgattttgcagtaactatagcagcgctacttggtataccttttccttttggaaggtgtgtacgctttacttggtacttgcttgtttctgttgtttgcagtgtgtgctactatctggtttgactagagacactatctagttgcttttttttttcattatatatactgattcgacttgattttatttttcaattgctattgtccctacatccttccatagttgtagtacttaattcagtatatttacgaaatgtgttctattgtgccatatctagcattggacgtgtaaacccagaattgtatgctctgagtgctggaacatgggataatcaacagatcggtgccaatgattgtacacagcagaatgatctagaagcatggatgcggagatatgctgaagctctctgtataaattgttggcaggtaatatgaaagttcatttgtatttgtttggttgggtggattgctgaagctctacgctgattttcagttaaccctcataggtaaagaggtacattgatcgatattctgccacttctgttattggatttcgagcagaagacctgaaccatgttgcagatctgtattcaaaagctcaggcaaattggtcctctgtcctgaggtctacatgtccagtggaaacaagcagtcaggatgaattaaaggagtgcgcaaataaggaatgcacaagttcagctctgcggttgcaaattgatgcatactctgacttcttggagagctttgcaaagcttgctcgctctgcatggactgagtttgatttatggctgatgggcattggtctttcagttatgatactgtcagttagtactcaggcatgtatgcttgtgaagttgaatattgatcaaatttcagaaaaggaaagagcaagttcaagtttcattccgaaaaatttctttgcttttgcattggttgcaattcgggcagcaagtttcctatccaatagctatatatgtgagtttgtcagatataccaacctcatcaaatattataaatttatttggtgcacctgcttattcatgcatctatttcttgtgatgcagtggcagaaggtagagttgcaaactttcttttggccacgagttgcattgccagtgtgtggcactcagccacaaaaggaaaattcatcatagaagttaatattcttatcacaattaatgctcccaatttccctgtgttgacctcagttttattctattattatgtatagtcaacttctgatctacttttactctatttattcgcaggagtttgtttttctcctccttaatattttcatacgatttgggattgagtttgggatgtcaaaacaaatttctgggtcaataatttcaaatgaccacccagtcagcattatttgtggcctgtttggttcaagtttttgcagtgatctcatggaaatattccccatcatatctcttaccttagtggcctatataattttgaagtgcatatcctatgcgatcagtcatagattcttgaagtactctgttatgtctggaagcatcttgagttatatatttatagcaattcattgggcttctgaaagtactttgctctctcatactaaagctactagagagactggaataagtttagctcctcgccttgtatacactattggaggtttatcattagcaatatctgcattttatcggttgtttgggtcaactgatcatttgaagatgaatgaaaggataactagtttgtcagctgtcatgctgtgctcctggagtcctactatcttgatcttgttgggaagacaaggtccctttgtggctctaatttgtatgactataggtactgtgagctctattcctagacatatggttgcttctcagaacatggcaattactactttgggcactatttgagattcttttcctgttatgtcctaattaagagcatggcatgtgattttctttttcattttgcagcatggtgtataataaagttacagcagaaaaatcagagagagctgaaacttgacaaaggaatacatgctgctgactctgtttcagtaacacaatggagctttctggcagtttgtctattttatctgacgggtcattggtaatttctttgctgtgtggatgttactgacctttatcttttagttagaatttatctttctgttaataatgcatttttagtatgcaatttgtttcctagtctggaataaaatgcatgtacaatttgtattttctgtatctgatgtgatttaattcatatttttagatggagttgttgaaaatacattgttgatcaaaaattatgtttcaggtgtacctttgatggcctccgttatggtgctgcattcattgggtgagtgtaatcatgttccaaatataaatgctgaaaggcatctctcatgatgcacacggtttacttatcacaacaattaattttacaggtttgatcatttccatattatccgacaaggccttcttctttccattgatacttttggcgtttctcacatactgcctgttcttagtcttccgtttattgccatatgctggtacaattctgcatccaagaacagcaaggtgaatgatgccactgtcaccagattaatacaggtaattagttagaaatatggagtagttttatttttttctggaccagtttaacgttacaaagcagcagcctaaaatactaacttcaaggtatctatgccaaattcaaatatactgcaagtagttaggcactaaaatattggatacaaaaaataatttggagctcccagaatataaacaataggacaaagcgtagtactccctctcgtttcataattcttgacgttttggacaatgacacggccttcaaaatacatctttgactttgtttttctattataatatatatatacaataaataaatgcgtgtttacttttttatgttgttctacttcctttaaactaaatatatttattttttatgttgttctacttcctttaaactaaatatatttaaagttattgatgttcaaagttacaaaagtttgacctcaaccctatccaaaatgttaagaatcatggaaccggagggagtactgatcttgcatgcattatggaactccatttggagaccaaattatgttttctgtttgtttgcttactgatcgatggggccccttgtctgttttgtttcacttaggtgcttttgatgtatggtttaattacatcaatcacaacaacgcttacaatcatttgtgttaccattcaacggcgtcacttgatggtaatttttaccccagcgccacataagaataccacgagtattcctgcttttgctaattaattatggtggactttatgtgacactatgcaatgtcaaactttgcaggtctggggtttatttgccccaaaatacgtatttgatgctatcgggcttcttctgaccgacttgttagttgttctggcatctatctattacagctgaccttgctattttgtttcttcagatagacaggtagttttaaaattaacgcatttacgatttgattgcatctatagagctgaaatattttttttgtcactacagtcagtggtgtaaaatcatgtgtatattcaattaaattcatgtattatcgttgaatcaaatttgtcatt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001070768.1 RefSeq:Os10g0170300]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 10]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 10]]
| |
