|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os03g0389900|
| |
| − | Description = Cyclin-like F-box domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001056807.1 GI:115453342 GeneID:4333015|
| |
| − | Length = 7206 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os03g0389900, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 3|Chromosome 3]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 3:16165183..16172388|
| + | |
| − | CDS = 16165292..16165419,16166234..16166341,16166481..16166536,16166611..16166753,16166868..16167065<br>,16167139..16167338,16167823..16167922,16168007..16168588,16168672..16168794<br>,16169266..16169346,16169426..16169733,16169815..16170054,16170499..16170583<br>,16170667..16170844,16171291..16171465,16172064..16172220|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008396:16165183..16172388
| + | |
| − | source=RiceChromosome03
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008396:16165183..16172388
| + | |
| − | source=RiceChromosome03
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggcggcggggaacggccggatggaggcggcgctgggctgcctcgcggcgctccccgacgaggtgctctgcgccgtcgtcgacctcctcccgcccaccgacgtcggccgcctcgcctgcgtcagcagtgtcatgtacatactttgcaatgaggagcctctctggatgagcaagtgtctttcagttgggggtcttcttgtgtatagaggttcttggaagaaaacagcattgtctagacttaatctttgttcagaaaatgatgagatttaccagaagcctcgccattttgatgggttcaattccatgcacttatacaggagatggtacagatgttttactaatttgagtagcttttcctttgataatgggcacgttgaaaggaaagatgacctttctctagaccaatttcgcgctcagtatgatggaaaatgtccagttttgcttactaaactggctgaaacctggccagcaaggactaaatggacagcgcagcaactgacacatgattatggtgaagttccctttaggatatctcagagaagccctcaaaagataaaaatgaaactaaaagattatgttttttacatggaactccagcatgacgaagatccactttacatatttgatgataagtttggagaatcagcacctacactattggaagattacagtgtccctcatctatttcaagaagatttctttgaaatcatggattacgaccaacgaccagctttcagatggcttattattggaccagagagatcaggtgcttcttggcatgttgatccagggttgaccagtgcctggaatactcttctttgtggccgaaaaaggtgggcaatgtaccctcctggaagagtaccaggtggtgtcacagtacatgtcagtgatgaagatggtgatgttgacattgaaactcctacatctttgcagtggtggctagatatctacccaaatcttgctgagcatgagaaaccactggaatgcacacaattaccaggagagaccatatttgttcctagtgggtggtggcattgtgttttgaaccttgacatgacaattgctgtcacgcaaaattttgtcaaccaatcaaattttaagcatgtatgtttggacatggcacctggttactgtcacaaaggagtttgccgtgctggcttacttgctgctccagacaaatctattagagatattgaaaatcttcctagtataacgagtagattgaaccactctgacatggcctgtaaggaaaaaagactgaaaagttcagagcctataagaacttcaaataatgcaaatcagtgttctgcatttgagttctcagatgttcatgaaaacttgggggaccaagttttttcgtatgatatagatttcttatcccaattccttgagaaagaaaaggatcactattcttctgtctggagccctactaattcaattggccagagagaagcaagagaatggctacgtaggctatgggttcttaaacctgaattgagagaactaatatggaagggtgcatgtctagcaattaatgtagacaagtggtattcatgcttagaggaaataagtgcatgccatagtttaccaccaccttctgaagatgagaagcttcctgttggcacaggtagcaacccagtcttcattgtttctggcaatgtgatcaaaatttatgctgaaggagggttgggttattctatacatggtttgggcacagagcttgagttctatgatcttctgcaaaaacttggctcgccattgatcaaccatgtccctgagatcattgcaagtggctttcttgtgtacctggatggtgtctacaagacagttccatgggatggaaacggaataccagatgttctagctaaatactactctttggaggtgtcttatgcaaacggctcttttcctcttggattatggagcaagcaactgtttggattgagtaattcaactgatgctccagacagaccaatttgtccttacatggttaccagaaaatgcaaaggggatatttttgctcgcatacgtgataaattgaccaagactgatgttttgaatcttgcatcatccttgggagttcaaatgcgaaatattcatcaattaccccttccacatgtggaacacatatccaaatctgggaacgaagatatcaaagcaaaggaaaattcaatttctgatgtcactcatgttccgcctgaatggaaacaagtagtttctactctagacaggagaaagaaaagtataaagaagcatctaagtaactggggtggttcaattccacaggttctaattgagaaggctgaagaatatctccctgacgacatccgctttcttatcaagtttgttaaggacgatgatggtgattcagtctatgtggtaccttcttggatacattcagatataatggatgataacattctcattgaggggaccacagaaccaggaacttccactgattgcattgccgttgaagatctgaacaaaatggatgcaattcatatcattgatttcagtgatctgtccattggggatcctctatgtgacttaattccactgcacttggatgtattccgtggtgatattgatcttctcaggcagtttttacgaagctatcagcttccttttctgagagcagaatcaaataaagatatatacaagtcaatacaaaattctaaattcagcagggcatcgtatcgtgcgatgtgctactgcatacttcacgaggacaacgtcctgggagccatatttagcctgtggaaggatctgggcaccgcgacgtcatgggaagatgttgaacacttggtttggggagagctgaatcaataccagcagtcatgcagcgtgggcgaaattaactga</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MAAGNGRMEAALGCLAALPDEVLCAVVDLLPPTDVGRLACVSSV MYILCNEEPLWMSKCLSVGGLLVYRGSWKKTALSRLNLCSENDEIYQKPRHFDGFNSM HLYRRWYRCFTNLSSFSFDNGHVERKDDLSLDQFRAQYDGKCPVLLTKLAETWPARTK WTAQQLTHDYGEVPFRISQRSPQKIKMKLKDYVFYMELQHDEDPLYIFDDKFGESAPT LLEDYSVPHLFQEDFFEIMDYDQRPAFRWLIIGPERSGASWHVDPGLTSAWNTLLCGR KRWAMYPPGRVPGGVTVHVSDEDGDVDIETPTSLQWWLDIYPNLAEHEKPLECTQLPG ETIFVPSGWWHCVLNLDMTIAVTQNFVNQSNFKHVCLDMAPGYCHKGVCRAGLLAAPD KSIRDIENLPSITSRLNHSDMACKEKRLKSSEPIRTSNNANQCSAFEFSDVHENLGDQ VFSYDIDFLSQFLEKEKDHYSSVWSPTNSIGQREAREWLRRLWVLKPELRELIWKGAC LAINVDKWYSCLEEISACHSLPPPSEDEKLPVGTGSNPVFIVSGNVIKIYAEGGLGYS IHGLGTELEFYDLLQKLGSPLINHVPEIIASGFLVYLDGVYKTVPWDGNGIPDVLAKY YSLEVSYANGSFPLGLWSKQLFGLSNSTDAPDRPICPYMVTRKCKGDIFARIRDKLTK TDVLNLASSLGVQMRNIHQLPLPHVEHISKSGNEDIKAKENSISDVTHVPPEWKQVVS TLDRRKKSIKKHLSNWGGSIPQVLIEKAEEYLPDDIRFLIKFVKDDDGDSVYVVPSWI HSDIMDDNILIEGTTEPGTSTDCIAVEDLNKMDAIHIIDFSDLSIGDPLCDLIPLHLD VFRGDIDLLRQFLRSYQLPFLRAESNKDIYKSIQNSKFSRASYRAMCYCILHEDNVLG AIFSLWKDLGTATSWEDVEHLVWGELNQYQQSCSVGEIN</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 3]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>110..237#1052..1159#1299..1354#1429..1571#1686..1883#1957..2156#2641..2740#2825..3406#3490..3612#4084..4164#4244..4551#4633..4872#5317..5401#5485..5662#6109..6283#6882..7038#agccgcgtggtctccgactcccctcccctaccctacccacgcccaccgatctgatccacctcgcccctcccctcctctccttgcccgcctcggcctccgggctccggcgatggcggcggggaacggccggatggaggcggcgctgggctgcctcgcggcgctccccgacgaggtgctctgcgccgtcgtcgacctcctcccgcccaccgacgtcggccgcctcgcctgcgtcagcaggttcgccgccgtggactctctctctctctctctctccttctgctgccttcccccacctccttttatttaccagtagtactactttgtttatgctgggttttctttctcagcctcccttttttgttagtttgctggaaatgctgaggttgtgatgcttcggtatgtgatgagtcatgatcgctctggatgactagtaaagtgtatctgattgcgaattttgtttgatcgtggtcagttataagagtggaaaatgagccaatttgcacaaattgtagtttaatctatttaatcagttgaactgattgaagagctgaagccatgttaaattattacacattatatgttttacaatatgatggtatatatggtatgtgtgtttggggaaaagaatcagagaggaaacatttacgtttcagtgagactcttgtggattttttttaggcatgggccatccatggaaaaaatgaatttgcactttaagtaatgtttaaaacatgcgactcatggaaaaaaatgaatttacatttaagtctaaattagatgtcagcagtttagtttttgatttccgcatgcttgttttggtttttcttctaggcagcactgtcatgccaaatgaatacactacatgctttctgtaattgtgagatgtaataaagtggttcatagggataaggaaataaatgctacactattaacttcttccctgaccttgctatgattatttgctttcttatagcatctgcgcagttgcactgccttgttgtgcaatagctaataggatgtgactgtggcattaacttaaatttcttgacagtgtcatgtacatactttgcaatgaggagcctctctggatgagcaagtgtctttcagttgggggtcttcttgtgtatagaggttcttggaagaaaacagcattgtctaggtatgtgccaattctatattgtgatgttacttttagcgcagagatatgtagttatgttatgctcagtatcttggaaaccatttgcatataactatgatggtcactaaaatgattacatactgtttgcttcgccttccagacttaatctttgttcagaaaatgatgagatttaccagaagcctcgccattttgatggtaagatacgtttccttttgttagcattcattttgcttatataatctgctgcttatacacttaatttccttcagggttcaattccatgcacttatacaggagatggtacagatgttttactaatttgagtagcttttcctttgataatgggcacgttgaaaggaaagatgacctttctctagaccaatttcgcgctcagtatgatggaaaatgtccagtaagaactggttaaccttttgtttacttcatattgaacaacgtagaatttgtacactcttctctttattgtgtttgtctccctgaaagcactttaattatgttgcactgataggttttgcttactaaactggctgaaacctggccagcaaggactaaatggacagcgcagcaactgacacatgattatggtgaagttccctttaggatatctcagagaagccctcaaaagataaaaatgaaactaaaagattatgttttttacatggaactccagcatgacgaagatccactttacatatttgatgataaggtgatcataactttagttttgcttgtgttgttgaagtttcaaaaagagaatcttagttgacaaatcattgcagtttggagaatcagcacctacactattggaagattacagtgtccctcatctatttcaagaagatttctttgaaatcatggattacgaccaacgaccagctttcagatggcttattattggaccagagagatcaggtgcttcttggcatgttgatccagggttgaccagtgcctggaatactcttctttgtggccgaaaaaggttaggatcattatttttacatatagtagttgttacccaacggtgctcctgagtcattggtgtgttcttataacacttttactatttttgcttttacaaaattatcgtggcaatatttacaccttgatatactgatattgattttatcatcaatcctgcaacttctgttttggatggaagaatgtaatgtatatgttggaggctcatctgtagatgatgaggcattcagatgtgcaccaaacccgatagtatttaagggttcaagtcgtagactggcgtccactaattttacacttttaggggcacattcagtgggaagtgtgtgcacctttggagaccctcagtcagtgggtgcgtgtagtggacacaagtgtgtgcttgtagtgtgtgttgaatgtgtgcacccacgccatgctatctttctttaaaaaatgttataaaactaaaatgaatagtccactaacagtgtccatctatttcataggtgggcaatgtaccctcctggaagagtaccaggtggtgtcacagtacatgtcagtgatgaagatggtgatgttgacattgaaactcctacatctttgcaggtgttttacttactactgcctttgctttccttcagacttctcttgtttctccatgttactcaaattaatttgtttgtcttgcagtggtggctagatatctacccaaatcttgctgagcatgagaaaccactggaatgcacacaattaccaggagagaccatatttgttcctagtgggtggtggcattgtgttttgaaccttgacatgacaattgctgtcacgcaaaattttgtcaaccaatcaaattttaagcatgtatgtttggacatggcacctggttactgtcacaaaggagtttgccgtgctggcttacttgctgctccagacaaatctattagagatattgaaaatcttcctagtataacgagtagattgaaccactctgacatggcctgtaaggaaaaaagactgaaaagttcagagcctataagaacttcaaataatgcaaatcagtgttctgcatttgagttctcagatgttcatgaaaacttgggggaccaagttttttcgtatgatatagatttcttatcccaattccttgagaaagaaaaggatcactattcttctgtctggagccctactaattcaattggccagagagaagcaagagaatggctacgtaggctatgggttcttaaacctgaattgagagaactaatatggaaggtgagctttgttctcacaattatatgaagttttatagtccttgaatttatgtgtatgcaaatgacatctgattggtcctgcagggtgcatgtctagcaattaatgtagacaagtggtattcatgcttagaggaaataagtgcatgccatagtttaccaccaccttctgaagatgagaagcttcctgttggcacaggtagcaacccagtaagtgtactcttatgagaatggttaagtttaaactatcgataagctattgtggcttgttagcactgcaaaccttaaagtaaccaaagcactgagaatatttatagtatcatattaattatatataattaactccagtaagtccatatgctacagatatcacaacagcgatgaatccataatttcatatacattttatttatattttttaggggcaaccaaaggaagatgcgctgcttatattgaaagcataaagcaagaaacagagttcattggccaagcatacaaacacagtaacagacaacacaaactaccaatttaaatgcattcggtccttctgtttagtgaagctaactcaagaagatttgtaggtggtacatagttgctctctatggtaccatgacatgttatagctcatatgtttgccggtcaatttggtaatttatttaacctatactctgaacttttcaggtcttcattgtttctggcaatgtgatcaaaatttatgctgaaggagggttgggttattctatacatggtttgggcacagaggtattgcatttcgtcctaaagcttaggaagttagtactcgttggatgccacacttctgattttttttttctggctgcagcttgagttctatgatcttctgcaaaaacttggctcgccattgatcaaccatgtccctgagatcattgcaagtggctttcttgtgtacctggatggtgtctacaagacagttccatgggatggaaacggaataccagatgttctagctaaatactactctttggaggtgtcttatgcaaacggctcttttcctcttggattatggagcaagcaactgtttggattgagtaattcaactgatgctccagacagaccaatttgtccttacatggttaccagaaaatgcaaaggggatatttttgctcgcatgtaagtttgtttacttgagggaagtgtggttctcctaattaattttagaaattgtacttaaaactttttaatttttttcagacgtgataaattgaccaagactgatgttttgaatcttgcatcatccttgggagttcaaatgcgaaatattcatcaattaccccttccacatgtggaacacatatccaaatctgggaacgaagatatcaaagcaaaggaaaattcaatttctgatgtcactcatgttccgcctgaatggaaacaagtagtttctactctagacaggagaaagaaaagtataaagaagcatctaagtaactggtaggtggaaatattttgaagctggtttgtcggtatatatttttagtcactaaaaatgatttttgttttgctctgttttttatttatccaaaaagtaatattttttaatcattgaggaaaagattttttttccctccgaaataaattgcatagaatgtgaatacaaagatattatcaaactatataaaggttcagtacaggttatgtttagattgtgcccttggagttccggaaacattgttcgaggcttgtccaggactccagaatacagtggtagtcgtggattagattactagtcctatctcttttctccttatttaacataagcaaaatctaagatgcaatgactatgcatttatttggagttgacttgttatatcctgacaggcaatcactagatgcagttcataatgatactataacattctttacgtatctgtgtaggggtggttcaattccacaggttctaattgagaaggctgaagaatatctccctgacgacatccgctttcttatcaagtttgttaaggtaagttttgtgggtttgttgttatatgtatccactatccactttcaaactttgagtgtaatgttttctgatcaaataatcaggacgatgatggtgattcagtctatgtggtaccttcttggatacattcagatataatggatgataacattctcattgaggggaccacagaaccaggaacttccactgattgcattgccgttgaagatctgaacaaaatggatgcaattcatatcattgatttcagtgatctgtccattggtgagcagccagctaactttgttcacaataacaaagcttgattgctcagttgtttatatgcctactttaaaaataaagtgatagtgcatcactagttgattaaattcaagataaaataaatgtgatagtgcatcactagttgattaaattcaagataggataaccatgaaagattgtatgaattattgaattgagttaccctatctctgttattcactgatttcctcgtggaacaagatctacaattgtgcaaatcttggtgaactggatgtggagggtttagttgtgatcttttggttttggggatttagttcaaaattcaacactccgcccacacagatccgaataagccttaaaattttagcaaattctaatgaagtctgtgttgatctgttatattgatttctgtgttgatctgttatattgattgttatttcatttaacaggggatcctctatgtgacttaattccactgcacttggatgtattccgtggtgatattgatcttctcaggcagtttttacgaagctatcagcttccttttctgagagcagaatcaaataaagatatatacaagtcaatacaaaattctaaattcagcagggcatcgtatcgtgcgatgtatgtacctctctctctctgaaataagataatctcattcttcttgttttatccttttccattgcatcttgaattggcagtgtaggttactgttggttgatggaaattgtaactgctggcaaaatccgtcttactagaggcctctcagagtatcgacttggtgcttttcaaattgcatgatatatataactactagtagctaacaaatagataataatccagagaaacaaacagctagcagcttattctacgtcggcttattataatccagcttatggtaatctagttctataatctagattacaataatcttaagctgaaacaaacatggccctagttaagtagctaactcgcatttgctaaaaaattcatccctcattcttcttcatgtgcatataactatagcagtggctcaagcatagatttggctgaactcacccacttctctgcaagttctgtgtatcattgcagtaatccatttatagctggtttgttgatgaacaaggcacgaacactttgcaaccattgctgattctcttggtttgtcacctgacggatgacgatgatacattgaattgttgatctcctctgtttgcaggtgctactgcatacttcacgaggacaacgtcctgggagccatatttagcctgtggaaggatctgggcaccgcgacgtcatgggaagatgttgaacacttggtttggggagagctgaatcaataccagcagtcatgcagcgtgggcgaaattaactgacgcgatagagttttccatactaagataaaggcacaagaaatttgatttgtaacctgaaactgtaccacaaagtataccatcgaaacagtgtattatgttacactaacacatgcttgatatgcaataacaacgcatcgaaaggacaacttcgttcagatgcaacatatt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001056807.1 RefSeq:Os03g0389900]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 3]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 3]]
| |