|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os03g0586800|
| |
| − | Description = Similar to Lysyl-tRNA synthetase (EC 6.1.1.6) (Lysine--tRNA ligase) (LysRS)|
| |
| − | Version = NM_001057107.1 GI:115453942 GeneID:4333345|
| |
| − | Length = 8276 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os03g0586800, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 3|Chromosome 3]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 3:22425432..22433707|
| + | |
| − | CDS = 22426334..22426372,22426471..22426614,22427027..22427095,22427177..22427320,22427658..22427814<br>,22427920..22428016,22428264..22428546,22428631..22428756,22429347..22429427<br>,22431239..22431321,22431642..22431727,22432578..22432671,22432765..22432930<br>,22433026..22433100,22433331..22433406,22433508..22433596|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008396:22425432..22433707
| + | |
| − | source=RiceChromosome03
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008396:22425432..22433707
| + | |
| − | source=RiceChromosome03
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggcggagtcgggctcgtcgggcctggaggagaagctggcgggtctctccgcgggctgcggcgaggagccgcagcagctctcgaagaatgccaagaagagggaggagaaaaggaagaagcaggaggaggagcgccggttgaaggaggaagagaagaagaagaaggccgctgcaacagcagctgctagtggagagcccccgaaggaatctgccgccgacgatgaggaaatggatcccactcaatattatgagaatcgcctcaaggcacttgattcactcaaggccacgggtgtaaacccctatccccataagttcctggctaatattaccgtagccgattatattgagaaatacaagagcatgaatgttggggataagcttgttgacgtcaccgagtgcctagcagggaggatcatgaccaagagagcgcaatcttccaagctcttattttatgatctttatggtggtggtgagaaagttcaagtttttgctgatgccaggacctcagagttggaagataatgaattcattaagtttcactctactctgaaacgaggtgatattgttggtgtatgtggttatccaggaaagagcaagagaggggagctcagtatattcccaaagaaaattgttgtgctctccccatgccttcatatgatgcctcgacagaagagtgagggaagtgctgttcccactccatgggctccaggaatgggtaggaacatcgaaaagtatgttttgagggaccaggaaacccgatatcgtcaacgatatcttgatctcatggtaaaccatgaagtgaggcatattttcaagacaagatcaaaagttgtctcttttattcggaaatttcttgatggtcttgactttttagaggtggagactccaatgatgaacatgattgcaggtggagcagctgcaaggccttttgtcacacatcataatgagttaaacatgaggctttatatgcgtattgctcctgagctctatctgaaggaattggttgttggggggctggatcgtgtttatgaaattgggaagcagttcaggaatgaaggaattgacctgacgcacaatcctgaattcacaacatgtgaattttatatggcatatgcagattacaatgacttgatagagcttactgaaaccatgttatctggtatggttaaggagttgacaggtggctacaagattaaatatcatgctaacggagttgagaaaccaccaatagagattgatttcacacctcccttcagaaagatagacatgattgaagaattagaggctatggctaaactcaatatacctaaagatctctcaagtgatgaagcaaacaagtatttgatagatgcctgtgccaaatatgatgtcaaatgcccacctccccagactacaacacggttgcttgataagctagttggccatttcttggaggagacatgtgtgaatcccacgtttattatcaaccatccagagataatgagtccattggcaaagtggcataggtctcgacctggattgactgagaggtttgagctctttgttaacaagcatgaggtgtgcaatgcatatacagagttaaatgatcctgttgttcagaggcaacggtttgaggaacaactaaaggatcgtcaatctggtgatgatgaagctatggcattggatgaaacattctgcacagcccttgagtatggcctaccaccgactggtggttggggattgggaattgatcgccttacaatgttgctgactgattctcagaatatcaaggaagttcttctattcccggctatgaagcctcaagattag</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MAESGSSGLEEKLAGLSAGCGEEPQQLSKNAKKREEKRKKQEEE RRLKEEEKKKKAAATAAASGEPPKESAADDEEMDPTQYYENRLKALDSLKATGVNPYP HKFLANITVADYIEKYKSMNVGDKLVDVTECLAGRIMTKRAQSSKLLFYDLYGGGEKV QVFADARTSELEDNEFIKFHSTLKRGDIVGVCGYPGKSKRGELSIFPKKIVVLSPCLH MMPRQKSEGSAVPTPWAPGMGRNIEKYVLRDQETRYRQRYLDLMVNHEVRHIFKTRSK VVSFIRKFLDGLDFLEVETPMMNMIAGGAAARPFVTHHNELNMRLYMRIAPELYLKEL VVGGLDRVYEIGKQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYNDLIELTETMLSGMVKEL TGGYKIKYHANGVEKPPIEIDFTPPFRKIDMIEELEAMAKLNIPKDLSSDEANKYLID ACAKYDVKCPPPQTTTRLLDKLVGHFLEETCVNPTFIINHPEIMSPLAKWHRSRPGLT ERFELFVNKHEVCNAYTELNDPVVQRQRFEEQLKDRQSGDDEAMALDETFCTALEYGL PPTGGWGLGIDRLTMLLTDSQNIKEVLLFPAMKPQD</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 3]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>7336..7374#7094..7237#6613..6681#6388..6531#5894..6050#5692..5788#5162..5444#4952..5077#4281..4361#2387..2469#1981..2066#1037..1130#778..943#608..682#302..377#112..200#agcgtcgcctaaccctagctaaaccccccttctcccttgcgcctccgcttcgcgagcctcatctcctcgatctctttcgattcagtggaaaacctaggagaccggcgcggcatggcggagtcgggctcgtcgggcctggaggagaagctggcgggtctctccgcgggctgcggcgaggagccgcagcagctctcgaagaagtgcgctttctcatcgcgcacgcagccggcatttcttcttattgtttttttttcctccgtagtgtggcttttgtttaatatgagttttgtggcgggtgcagtgccaagaagagggaggagaaaaggaagaagcaggaggaggagcgccggttgaaggaggaagagaagaagaagaaggtgaagcagtttgaacttcttaacctttgccgatttttttccagtgttgtttttatggagcgagttttggatgcgttcatttgtagatgatgccaatgtgacaagcaacactctttgctcttgttagatacggatatacctctgcagctagggtgtgagaaagagttttccatatcatgattgctaagctctaaatatatatacacccttttttaaaaaaaattttgtaggccgctgcaacagcagctgctagtggagagcccccgaaggaatctgccgccgacgatgaggaaatggatcccactgtatgtgatattgatgcccctttggtgctgctgtgctatttgttgtattgaattcttttgtttaggaaaattcagacatgtgtttcttgctgcagcaatattatgagaatcgcctcaaggcacttgattcactcaaggccacgggtgtaaacccctatccccataagttcctggctaatattaccgtagccgattatattgagaaatacaagagcatgaatgttggggataagcttgttgacgtcaccgagtgcctagcaggtatttttcgttctctttgactagatatgatagtgtagttgattagagatacatttgggtgggatttgtatttattattattttttattaaagggaggatcatgaccaagagagcgcaatcttccaagctcttattttatgatctttatggtggtggtgagaaagttcaagtttttgctgatgccaggtaaaactttgtctgttcaactgtattgcttaccttttatgccatttagctggtttgttcccagacactttcagcatttcactaaaatctcactatgtgcagatatgcctgactaaaatgcatcctttggttaattttcatatcagttaaatctattttttaatgttggtgaatttcataaagtttgtatcagttaaatatatttttcaacattggtgaatttcataaagtttattgccaaagaattctcactgcaactttataaacatatgctaggccatggattgtgatgaatgtcatagatttagagcaaggtttctgtagcttattatcttcctgcaaatgtgtcaatagtacgccgggtgctactcatgcttggcatagctggctacttatgtgtggtccgtattggcaataatcacattatgcacaaaaccccccttcttttacatagttgggttttcttcttgttttgtacatgttaatgcttagaatttttcttcttgttatttttgcatgctttcccaacttgggtaatatgcttcatgattatgcacataacagtatgtatgcttgtacatagtaaaagtgtaaaatacacgaggttgcatacaatccatatctcataaagtctgggggcttgctgacttgcaattttctattagttataatgtttaaacaaacaaaaaggtgcattcttttttgttattttgactaacggttctgtggctatcgttgttatctagtggctatcatttcgctcatgtttaagtactacgccggttactgcctactgttgtcggtctcataaaaagtaaactaatgatttaactgattttacctgatataggacctcagagttggaagataatgaattcattaagtttcactctactctgaaacgaggtgatattgttggtgtatgtggttatccaggtttgtaagcatctattcaagttcattttgaaattattacatagtcagatgttccaacatcaaaattaagtaggtacttatattctttcagttggaatgccaataggacattttgagtacatggatccttatctgattgagtttgtaattttatttaataaataacttaaactttatttgtagcttatgcccatacttgattgtacagtttgtttgttttaaaacaattaggagtataaatagtttgatggttactggaaattcttatattgttttactgtgtctgataatgacgacttctcaattttgatgaataccaggaaagagcaagagaggggagctcagtatattcccaaagaaaattgttgtgctctccccatgccttcatatgatgcctcgacaggtgagaatcagatttttttaggaagagatgtttccagatgatatacctaatatctcagagcaatttacttcatattaatctgaacttttatatttaaatctgtacatactaacatagagaccataaaataactagagttaagtctgatttacccccatcccccctctctctctctaactatagaaccggacatttgacacccctaaaattttggaaccgtacgaattaccttcctaaacataatctaggtggttttgtcctatgtggcagacaggtggcaataatctgaccatgtggcaacccagtcagaaaaacaatcaattgtttttaggaaaaaatatgttagcccacattgtcatccacctagttgtcttcttccgcccattctcccatttctcacattaggcatgggctgcaaactgccagatcctttgcctcgttagtctcagtgctccttgcttcggaggaagtccatggacaagcgcctcaaagcagtgctccggcctgcttgagacggccgagcttgagtgctcgacgggacatagcagcgctggcaccgcctcgcctccatcagtgtgcccgtgcaacagttcgtggtggttgtggggagcatatgtttgcccctgccggagtatgccaccatggcagctgcacagcagcaggtgcagctagccgccactgccagggagctgaagcaccagcaaggacggagacactctggctccgaaggccgtggagcggggacgccggggacggcagcttgtcctccccggctgtctcatggtcgtcacagaccacctccgcttcattacatgtgcgaatgagagagcagctttgatttcttggagtttttttttttcaaagagtgatttttcagaactatctagcttgattacatgtacgtatgacaacaaccgtcttgtggatcttgagggctgcaggtgagctagtgcttacacaggcttgggtagagattggaacagaaaggatagaggaagaagtgcatgccactgattgctgggtcccatggagagggagaagcatgttgctgatgatgcacctcctccctcatattggactgtcatgtgtgatagctttagatcgaaaccacctaaaaaagagccccaggggggttaagtatccggattgaatagtttaggggtgtccaatatctggtttcgtagttaaggggggtaagtcgtacttctgtgatagttgagggggtaaatcggacttgacccaaataattatgactgaaactaaagacattttgcgtagcgatgccttctctttttctgggtgtcacatacacattagcagcacaagaaagcacaacagccattattctggtttgcagaccccagacaggtcatttgattaaacccacaaatgcacctcatatttgcctagcttcttttctcaagtgcaatgcaatacagacactcactcacacctgtttatgcatttgttacgtgctacgcattctaggactagtagaggcatagataaatgcataatttgtccatcacctcatggagtatgggcgtgtcctgcacttgcatgtgtgtagtatatagtgagccatgcttgcttgacttgatgctaggattgaacgttggcattttgcatgcacgattgaactgcaaaacacccaactgctgagtccagcatgccaagcttctgagatatcaaaatatttcgtgtacacccaaccattgaccctttgctttccttccaagttcttatgctaattatatttgttgaaatgtagtctacatgatcatttacatgtattgtatacatctttacagaagagtgagggaagtgctgttcccactccatgggctccaggaatgggtaggaacatcgaaaagtatgttttgagggaccaggtttgttcattctccgtataattattgattgacctctcttgtctatgtaaatgctaattactgtgagttctttgtcagcaagtaaatacattgtcggtagtgtgattaatcataattaacaaatatctaggcggattttaaggttctggatgtgcatatgtgatccgctttgttgtatgcacaacaaaatcatttaaatttagattgaggcagctatgcaatttagtgcaaagttagattcaggtggatgaactaatcatgggatcagattctatctgaacaagtggataggtggcgcatgtctagtccattaagagagatttgcaatgttcttaaaattagtgaactcatttgctgacatgaatgccatatttggcatgctaatagaaatctgtccaattttattgactatctcatgcattcattctatttaaaaatctgcatttctaatttacatgagcaaatcataaatttggtgcaggttgctttaagtagcttgatcactcagtgattatcaattatatatctgtcttgttgcctttggtgcttagtagcgatttgattatcaattgtttgtcttgtgatatcaggaaacccgatatcgtcaacgatatcttgatctcatggtaaaccatgaagtgaggcatattttcaagacaagatcaaaagttgtctcttttattcggaaatttcttgatggtcttgactttttagaggtgggcctgtgcaatctattctgttattcttcttttgtatattcttccagtccttcaaatctgaatattctatgtcttttctaggtggagactccaatgatgaacatgattgcaggtggagcagctgcaaggccttttgtcacacatcataatgagttaaacatgaggctttatatgcgtattgctcctgagctctatctgaaggaattggttgttggggggctggatcgtgtttatgaaattgggaagcagttcaggaatgaaggaattgacctgacgcacaatcctgaattcacaacatgtgaattttatatggcatatgcagattacaatgacttgatagagcttactgaaaccatgttatctggtgattatctcttgatgtctctgaaacatcttttttttctttttattttaggaagtaatagtatcttcatgtcaattttgtatgcaactgcaaaatgacctaaatgcattttccttgttccgtaggcaattcatgatttgctattgttctgtcatatcatttttttgccgtcctatcttgtttttactgaaatcaacatgaagcagcctgttcattttatctaatgatctgattttatggttgacaggtatggttaaggagttgacaggtggctacaagattaaatatcatgctaacggagttgagaaaccaccaatagagattgatttcacacctcccttcaggtagagacattgggatgtatttggattacatgtattgctctatatgcacttttaactggtaatgttcagttgctacaatgttactttgcctttaccttgctgcagaaagatagacatgattgaagaattagaggctatggctaaactcaatatacctaaagatctctcaagtgatgaagcaaacaagtatttgatagatgcctgtgccaaatatgatgtcaaatgcccacctccccagactacaacacggttgcttgataaggttgtttctttacccactacacattctttttacactgtattttgatatgattttcgttaggtgattttgctatcttataatatcttatttacatatatgataagctagccactttgatatgaagaagaatgtccggtgtaatcctttttgttgcttccataatgtacagtacatttctgaacattttcacattagctcacaaacaaataaaagatctggggtatattgcaaaatccaacctgaagctatttgcttaaattttaatataccttttgcttttgtttcccttttggtattccttagccaaattaataaggtatatgctctgctctaacagctagttggccatttcttggaggagacatgtgtgaatcccacgtttattatcaaccatccagagataatgagtccattggcaaagtggcataggtctcgacctggattgactgagaggtttgagctctttgttaacaagcatgaggtatatactaagtcttcattgatactttcatacttgtcctcctttctgtttccttacagtgttatgaaatccattttttaggtgtgcaatgcatatacagagttaaatgatcctgttgttcagaggcaacggtttgaggaacaactaaaggtacttgttagattttgtgaacatttgcaaattgtatatttttctttggtaccagcctgctcccaagcttcgagttatttttggtattttggaacatctaaatagctttgcatagtatataattgttggaaaccaacctactcccatatgtggtatattttggtccatcattttaaccagcgtactcattatgcttgggagttttggatccatcatatatatacacacacttgtgtttgcattgttaaaagtagtggtaagtcattggaagggtgggatatgaagtgtcaaacagacaaacagagtatggacccttacaccagtggcagatttattgttgcatggtgtttccctagcttcctatgtggcttgctgaaaaactgtacatgttcttacgtatattatgtgccaggatcgtcaatctggtgatgatgaagctatggcattggatgaaacattctgcacagcccttgagtatggcctaccaccgactggtggttggggattgggaattgatcgccttacaatgttgctgactgattctcagaatatcaaggtctaattatttcttcatttgtacttttgttcctggcattttttatttggtctttattcagttgaggtatttaaaatgctcttttgatgcaaattcaggaagttcttctattcccggctatgaagcctcaagattagatatgtccacaaagcaggaacctgtcagaagggtacgtccatatacttctatatcacaaagtaattctttatgttttttgcccttttaagcatttatgaattttcatattgtacatgttctctaaaatgttaaatatccaggacaataataaaaaccatgcacttttttagggctagtagcaatgtagcattatgcgtataacagaactttgtaaagctcagggtttcatgcgcttattcaatcagcactgattcaattgtgtcgaactatggtcataaatgaatgaaatgtgcctcactattttcaacataccattatgtcaatgtttggttgggggttgtgtcgaactatggtcataaatgaatgaaatgtgcctcactatttcaacataccattatgtcaatgtttggttgggagaaactatatttgcattggacatgatttaggatgcaagtttgtctattgaatggtatgtgaaacatttcacagtatctcgttccaaaagaacaagtactgtaaagtttttttgtcatgcatctgtagattttggaaggaaaagactggaatatccctcaactgtagaattttgcccgccctttgtcaaatgccattgtgctaactgtacttctatgctgcagattaaagcagactgaatgctgactgagaggatttcaattggccctcgagatggaggatttgaaggaaacttataattttgttttaattgtgcatgtgaggtttccatgtcctattgtactttatttttggagaacattggtggtcagttaagcaaacagttaatctcgctgcaaagatatcaagcgtaacttataagatgacttaagtttgtgcaatttctgtggccttacttgaaaatgatagcgcgttatttgcggtcttg</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001057107.1 RefSeq:Os03g0586800]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 3]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 3]]
| |
