|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os02g0639000|
| |
| − | Description = NLI interacting factor domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001054071.1 GI:115447512 GeneID:4330100|
| |
| − | Length = 9306 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os02g0639000, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 2|Chromosome 2]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 2:26513609..26522914|
| + | |
| − | CDS = 26514086..26514361,26515540..26516016,26516395..26516605,26516775..26516932,26517009..26517079<br>,26517197..26517302,26517376..26517462,26518069..26518620,26518705..26518771<br>,26519339..26519472,26519543..26519596,26519744..26519840,26520375..26520580<br>,26520655..26520735,26520911..26520976,26521393..26521466,26522134..26522239<br>|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008395:26513609..26522914
| + | |
| − | source=RiceChromosome02
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008395:26513609..26522914
| + | |
| − | source=RiceChromosome02
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgatcaggtcgatggtatatttcgggaacacctccatcggcgaggtggaggtgtggcccagcggcgacgcgagcctggcagcggcagcgtgggctcgagagatccgcgttgaccgcctttccccgcccagcgagcggtgccagccgctcgccgtgatgcataccgtggccgtcggtgctcgctgcctcgtcatggagtccaggctgcccaaggcagcggatgagccaccccagcctctcgtcgccatgcacgctgcttgcctcaaggaaaacaagactgcagttgttccactaggagaggaagaattgcatttagtggcaatgacatccaggagaaacctgacaaatcacgcatgtttctggggatataaagtgccatttggtttgtacaattcttgcttgactatgttaaatctccggtgccttgggatcgtatttgaccttgatgagacactgattgtcgccaatactacacggtcttttgaggacagaattgacgcgcttcagagaaagttgagcaatgagactgatccacagcgcataaacggtatgatagcggagattaagaggtaccaagatgataagtctatcctaaagcagtacattgaaggtgatcaggtctatgatgatggaaaaatgtataaagtgcaacctgagttggttccgccattatccgataaccatcaaccaatgacacgtccagttatacgattacaagagaagaatattatcttgacgagaataaatcctttgataagggataccagtgttcttgtacgtttaaggccagcatgggaggatctccggagctacttgattgctagaggtcgcaaacgttttgaggtctatgtgtgtacaatggctgagagagactacgccttagaaatgtggaggttgcttgatccagactcaagattgattaactctgttcaacttaatgacagaatggtgtgtgtaaaatctggtttaagaaagtccttgctgaatgttttccatgatggatcctgccatcctggaatggccctagtaattgatgaccgactcaaagtctgggatgagaaggatcaatctagagttcatgtggttcctgcattcactccatattatgcaccacaagcagaggcaaactgttctatcccagttctctgtgtcgccaggaatgttgcatgcaatgttagagggggcttctttaaggactttgatgaaggcctcttaccaagaattagcaatgttttttatgaggatgaaatcaatgaaatcccatctgctccagatgttggcaattatttgatttcagaggatgagaatgttgcggcagtgaatggaaacagggatccattggcttttgatggtatggctgatgctgaggttgaaaggagaatgaaggaagcatctggaaatgctcaagcttttactacaacagcagctaactttgtgatgccagtactccctggtcaaaatttcgtttcatcttcagtagcaccagtagccccatcccttggcatggtgcctttgagtaataatcagggtccacctccattcactcaaccagttgctcaactgagtctctcagatccactgcaaggctctccagctagggaagagggtgaagttcctgagtcagagttagatcctgacacaaggagaagacttcttatattacaacatggtcaagacaccagagatcctacacctcctcttccagcagtacctcctgttcaagtcccagttcctccagttcaacctcatggaaattggtttcctgtagaggatggcatgaatccaaataatctaaacaggggttctgcagggttccctttggaatctgaaactatgcactatgataaaaagcaactacctcacccattctttcatggtggggaaaaccctatatcctctgatagatttagttatcagaaccagaggtatccctcccagctaccgcatagtgaagatcatcgcgttcttcagaaccatgcaccgtcaagatacagatccttccctggagaggagctagcaactcggcatgtttcttcaagtcagagaaacaaccagatagtaccaggacaacactttgctcggcatgcagggagctctgctggcatactagaggagattgctatgaagtgtggttctaaggtggagtacaggtcagcactatgtgatactgcggatttacagttctcaatcgaggtttggattgttggagaaaaagtaggcgaaggcattggcaggacaaggaaagaagcacagtgtcaagctgcagaaatctcattaagaaatttagctaataaatatctgtcatctgatccaaataagatgactgatatgaaagaaaatggttttggtagcaatacaaacatttttggataccctggaaatagtagggacgatgtgttaccaattgcaagtacttcagaagaaactcgctttgtgaagatgggggagaacaattccagaaaagcaggaggttctattgctgctctcaaggaactttgcacagctgagggatataacttagtttttcaagctcggacatctcctgatagttcagtaggcaaagaagcttatgctgaggtagaagtttgtgggcaaattctaggcaacggagtgggaataacatgggaagatgctaagcttcaggctgctgatgaagctcttggaatgttgagatccatgcttggtccacttgctcagaaacggtccagttctccaaggtcactggcacccagttttgataagcgcttcaagccagattttccacgggcagtgcaaagggttccttatggtagatattcccgaattgaaggccatgttccttga</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MIRSMVYFGNTSIGEVEVWPSGDASLAAAAWAREIRVDRLSPPS ERCQPLAVMHTVAVGARCLVMESRLPKAADEPPQPLVAMHAACLKENKTAVVPLGEEE LHLVAMTSRRNLTNHACFWGYKVPFGLYNSCLTMLNLRCLGIVFDLDETLIVANTTRS FEDRIDALQRKLSNETDPQRINGMIAEIKRYQDDKSILKQYIEGDQVYDDGKMYKVQP ELVPPLSDNHQPMTRPVIRLQEKNIILTRINPLIRDTSVLVRLRPAWEDLRSYLIARG RKRFEVYVCTMAERDYALEMWRLLDPDSRLINSVQLNDRMVCVKSGLRKSLLNVFHDG SCHPGMALVIDDRLKVWDEKDQSRVHVVPAFTPYYAPQAEANCSIPVLCVARNVACNV RGGFFKDFDEGLLPRISNVFYEDEINEIPSAPDVGNYLISEDENVAAVNGNRDPLAFD GMADAEVERRMKEASGNAQAFTTTAANFVMPVLPGQNFVSSSVAPVAPSLGMVPLSNN QGPPPFTQPVAQLSLSDPLQGSPAREEGEVPESELDPDTRRRLLILQHGQDTRDPTPP LPAVPPVQVPVPPVQPHGNWFPVEDGMNPNNLNRGSAGFPLESETMHYDKKQLPHPFF HGGENPISSDRFSYQNQRYPSQLPHSEDHRVLQNHAPSRYRSFPGEELATRHVSSSQR NNQIVPGQHFARHAGSSAGILEEIAMKCGSKVEYRSALCDTADLQFSIEVWIVGEKVG EGIGRTRKEAQCQAAEISLRNLANKYLSSDPNKMTDMKENGFGSNTNIFGYPGNSRDD VLPIASTSEETRFVKMGENNSRKAGGSIAALKELCTAEGYNLVFQARTSPDSSVGKEA YAEVEVCGQILGNGVGITWEDAKLQAADEALGMLRSMLGPLAQKRSSSPRSLAPSFDK RFKPDFPRAVQRVPYGRYSRIEGHVP</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 2]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>478..753#1932..2408#2787..2997#3167..3324#3401..3471#3589..3694#3768..3854#4461..5012#5097..5163#5731..5864#5935..5988#6136..6232#6767..6972#7047..7127#7303..7368#7785..7858#8526..8631#aatccgatccgatcagacgcctagtttagggtttcagagctttctccccacctctcccctcccctcccccccctctctctgtcgtcctcttcctcccgctcgcgtccgccattgacgcggcgcggcgcacgagctccccctcagatctgaccaatccacaccgcgaaccctctcacctgacgcaaccccgaatcttgcctggaacggcgaagaattcgaacacaaatctgaagcacaccgtcgtcactaagaccacacactacatctgatttttttttgtttctccacaccctgattgtttctagatttttttttattctcgtttcggacgcttcataagaacagatctgcgagcgagttcgcggatcttatctatctgtgtgagaaccaagacccttttgttgcctgtggacacgatccgaacgaactttgacctgaggattcgtttgagatctgtttgctgctggtctcgagagaatgatcaggtcgatggtatatttcgggaacacctccatcggcgaggtggaggtgtggcccagcggcgacgcgagcctggcagcggcagcgtgggctcgagagatccgcgttgaccgcctttccccgcccagcgagcggtgccagccgctcgccgtgatgcataccgtggccgtcggtgctcgctgcctcgtcatggagtccaggctgcccaaggcagcggatgagccaccccagcctctcgtcgccatgcacgctgcttgcctcaaggaaaacaaggtatataaattattcctgacataaaaaaaaggagattcacgcagtgaaaaaaaggggacaaattcaacaaataatggaatctctctaattttacatggacatttttcaaggaatcacactaattttacatgatcgggttgaaggaatatttgtaatcttacttggacaagtttaccaggacataatcttaataatatttattgtattaataagcatgttaattttatctaaacaatcactcgggtgtggacaaggaattttcaaggatgtggacggatgactgaatgcactgaaatttgttcagtgctgatacggacttaaaacttacacaaggaatcactttatatacgttatgttctgtggacttggacttgcttttaattcattgtcatctcattaatagagtttgaacttggctttactgggattatttgagaggagtagagattaaaaaatgcagaaaccaggcactgaatgctgtagattttggtgtttagttgctgggactaaaaagctgatggttgtgagaggtggtttctgtttgatatttgtggacttaaaatgatattgagcataatgcccatcgttaattgctactgttagttttattctaactgaactggaatttagatcataatttgtgacaacaacttgaaggaacatataaggtttaactggtgcactctcaagtgctatttgaatcttgattttcacaagaatatacttgaagagcagctgagctaatggttttctagatattttatttatccctctcaagtgctgtttgaatcttgatttcacaagaatatacgtgaagagcagctgtgctaatggttttcttgacatttattgggttttgtggttccaaataattttgtatttaatgagagctacttttagtattttcagttcaactgatgttactttggcatgaacatttccaacttcatttctttttctgttttaaaattcaggagtgtggtttacagcagagtcagattccatactttagaaccacaattctaacctttttgtagtttcttataccccccttttccctgttaaaacgtacaaggtatattagtctacagaacttcatgggtttgttataaaacttccatctttgtcttcttatcgaaaaaaatattcatattgcagcttttaattcattcttgcagactgcagttgttccactaggagaggaagaattgcatttagtggcaatgacatccaggagaaacctgacaaatcacgcatgtttctggggatataaagtgccatttggtttgtacaattcttgcttgactatgttaaatctccggtgccttgggatcgtatttgaccttgatgagacactgattgtcgccaatactacacggtcttttgaggacagaattgacgcgcttcagagaaagttgagcaatgagactgatccacagcgcataaacggtatgatagcggagattaagaggtaccaagatgataagtctatcctaaagcagtacattgaaggtgatcaggtctatgatgatggaaaaatgtataaagtgcaacctgagttggttccgccattatccgataaccatcaaccaatgacacgtccagttatacgattacaagagaagaatattatcttgacgagaataaatcctttggtatgtgattcattagttgaatttgcattacaactgttttcacgagcatatattggtcagcagatagatacattgtgattccagtttatgctggatgtctttttgaattttccttgcacatcatacctcctaggagtcttatatttgtgctgtctagtatgcagttgacttgttccttgatctctctctctcattatcaagaaaggttctctagaatttacatgcattctctattgggaaaatagaagtttgtaagttgagcaatagcaatgacagttcagcgtgccttttcacattgctttgatgtggcctgactttggttgcataagtttgtacaaaacttccaggctaaggctttttttttttttttttgtgtagataagggataccagtgttcttgtacgtttaaggccagcatgggaggatctccggagctacttgattgctagaggtcgcaaacgttttgaggtctatgtgtgtacaatggctgagagagactacgccttagaaatgtggaggttgcttgatccagactcaagattgattaactctgttcaacttaatgacagaatggtgtgtgtaaaatctggtatgtgtctcttttctgattaagtatgtcatgaacttagtacaatgttgttttcaaatgttccacaattagagctctggtcatgattgcagcttcaatgcttccatcaccctttatgcatattgtttgatccatcctactgaagctaacagcgactttttttttctaggtttaagaaagtccttgctgaatgttttccatgatggatcctgccatcctggaatggccctagtaattgatgaccgactcaaagtctgggatgagaaggatcaatctagagttcatgtggttcctgcattcactccatattatgcaccacaagcagaggtaacggtcatgctccataccaatgcaaatagtatcttcttgcttggacactaaagaatctccttcaactttacaggcaaactgttctatcccagttctctgtgtcgccaggaatgttgcatgcaatgttagagggggcttctttaagtaagattatcggctctgctaatgcgctttccatattatatatcatgggctcatggtactctactatcaaactaagtcggactgattgacatagaactttcatgattcaatttgcagggactttgatgaaggcctcttaccaagaattagcaatgttttttatgaggatgaaatcaatgaaatcccatctgctccagatgttggcaattatttgatttcagaggtaaaaaaattggtaaatgcaatgctaccatgttcacctctcagtaattaactgttcttctgatcttcattaggatgagaatgttgcggcagtgaatggaaacagggatccattggcttttgatggtatggctgatgctgaggttgaaaggagaatgaaggtttgagctctttgcgcctttatctggatgtttgattgtgggctgacaaaatcacaaaaagaagagacatccaagaataattcatagaaagctgttttttttaacattggtttagatgttgaactcctgaagcatgttgcattattttaagtaacaattgttgaaacatttacctagtcaagtaccaatgatataacatatagattgtgctggatctgttctttcagtttgttacatcttccgatcttcctgtataatagctccacacatcttcctttaaagctgtattcaatatatgacggtaatagagattgcaacaactattaatgtctatatttctaatattgtctttaaaacagtaaaatgataagttattttgttaatgtggcatcaacaaaattataatttcagcatgagatacgcttgtcatgagctatgtaacatttaatgaaacattctgagcagaatattcgaaaggaaattatttgccgatagcttcatatgcttctttacatatacatctgttttgaaattttgcgtcatttctctcacatattgcacttgcatcatttctccctcacatattgcccttcaactatttttcaggaagcatctggaaatgctcaagcttttactacaacagcagctaactttgtgatgccagtactccctggtcaaaatttcgtttcatcttcagtagcaccagtagccccatcccttggcatggtgcctttgagtaataatcagggtccacctccattcactcaaccagttgctcaactgagtctctcagatccactgcaaggctctccagctagggaagagggtgaagttcctgagtcagagttagatcctgacacaaggagaagacttcttatattacaacatggtcaagacaccagagatcctacacctcctcttccagcagtacctcctgttcaagtcccagttcctccagttcaacctcatggaaattggtttcctgtagaggatggcatgaatccaaataatctaaacaggggttctgcagggttccctttggaatctgaaactatgcactatgataaaaagcaactacctcacccattctttcatggtggggaaaaccctatatcctctgatagatttagttatcagaaccagaggtatccctcccaggtaggcgattcaacttttgtagtctctgcaattgctatcaagacatttctataccactctgtaacaaacattttcttgactcagctaccgcatagtgaagatcatcgcgttcttcagaaccatgcaccgtcaagatacagatccttccctggtattcttactatttccatttggaattctgatgttgatcttttagggtggtcctgagaattaggcagagacgtcgtgcatttgttgataaacaaggtcctattttttgcgaaaaggagtttcttaggttcagccaccaacagacaaaaatgagaactcttcaaaacattaaaagacaatgaagttaaggtttagggctgtaattttgtttctagcacttggcattctggcttgctatactatctgtatgaccatatgagtttgttgtgctttactgcctgtgatgtagtaagttaactttgtttgttttagattatatatgctgttgactatgattttacaaactcaagtataggtgcactcattaattcattatggcttgtacactttctcacttaaacgagttctcaaatattttgcctagataattgttatgtaaagtgtaacttaatttccatagtggaaattgcaatcgaattccgtaagaacgttaaaaagcttttgttctttgcaaagttgagtatagcataaaaactttactatgcttaactgtatctccatcctgaaggagaggagctagcaactcggcatgtttcttcaagtcagagaaacaaccagatagtaccaggacaacactttgctcggcatgcagggagctctgctggcatactagaggagattgctatgaagtgtggttctaaggtagttttgaacattcaggtcgcaccatacaatccagtttataatcattgacacttttcattgtttttaggtggagtacaggtcagcactatgtgatactgcggatttacagttctcaatcgaggtagattggaacttctattcaatgtttattattggtatctctgcagtaaatttagttccaaaaaatcagagctcctctcctggacttgttgaaaattgtaagcttaccttatttatatccctttcttatgtctattacctctttcaggtttggattgttggagaaaaagtaggcgaaggcattggcaggacaaggaaagaagcacagtgtcaagctgcagaaatctcattaagaaatttagctagtaagtttgtttttcctgcttagtctacagcctattagtttccttactgcacatataacataatgttttgtgccatcaatcttgtcgcaaccaagacattcgttttaaataaaagattgacatgtttacttggggcatagggtgtgttttttcaaaatttgggcacatagcgcatttcagctattgccacttaatagtgctggattattctgtttacatatgtttcattgaagaatacttaatcaggttatcataaatcagagcctgttgacaatatacggaggttcgagtagattcatgaagcttactgtgtagaatgctggaattttcatggcattcaaatttgcctgcttgcatgttgtcagttttccttttggtttctgggatgaaaacatctggatgaagctatatttctgtaattgataggttgaaaaaagcaaaacattgtaactcttttattgttttgcgtctttttggaacttcttgttttatacaatattttgtattgatttgccatgccaacaatacttgcagataaatatctgtcatctgatccaaataagatgactgatatgaaagaaaatggttttggtagcaatacaaacatttttggataccctggaaatagtagggacgatgtgttaccaattgcaagtacttcagaagaaactcgctttgtgaagatgggggagaacaattccagaaaagcaggaggttctattgctgctctcaaggaacttgtaagtatcttagattgttggttgtttgacacagctctttttcaattaataacatagttgaaaatgtgttgcagtgcacagctgagggatataacttagtttttcaagctcggacatctcctgatagttcagtaggcaaagaagcttatgctgaggtcagttagcaactatttcctcattattttacttaaacaagttgttataatgctggggagaatgtctaggatcatgcctttttctcagtatatgtgtatggtgcacaacgatgtattagcagtattgttgtgggacctgcagcatcataattgtgtcgctaactttggctttcaggtagaagtttgtgggcaaattctaggcaacggagtgggaataacatgggaagatgctaagcttcaggttataagcagccctcgtacttaagcaactgttttcctttgttgctttagtgtttcctacttatggaagaataagatcatgaagtgtgttcaaagatatttctattttgccttttgactgactgaccgatgtggaagtcaggagggttttgttcgtcttttcagtttacgtaataacttgagttatgtttcacattcaattcttgttccactaaaccatttctagcttttggaaatggagccaattaataatgtggttctgactttggagtacatattttttgtgtgtctgaggtgtggggaataaaggttgtaagtgggatttttttttcttgtttttacgtgcaagggactacttataaaggataaacatgttgtatatctgaattgatgtttgtatgtttgatcactctgtaggctgctgatgaagctcttggaatgttgagatccatgcttggtccacttgctcagaaacggtccagttctccaaggtgattgttactggctttgtgcatgcaataaatttgataattattggctatctatatggttagctttgttttccatggacatgatggaatatccttttcagcccagatattacagcattgctaattacaagttttatggtagtgtcagttaatttccttataggtgctctatcattgtatccatgtgcccaattcacgacatgtttggtttatgcccccaatgagccaatcaaaattctgcgtgtattttagcctagcagatgccacaaccacaatatttggtaaaaagaaagatcttgtgtgagcagccaaaatcttgcatcttgtgtggaccgtttgattgatgcaatttgtagttgaatccccatttctgctaggtaaatggaaaatacaaattgagtttgataatattgtctgccaatccatgaccttgatggtaacccgggttaatatggatgcctagaggaagtggaggaaaaaattatggtggctggcttaagcttgtaatttaaaattagcgtgacatgtgcaggggtgtgacttttgcaatactcacagatattctcctgttgtcagattgtagtttgtttcttcctttgtttgtttagcctatcctttgtgtcttctgttttagtataatttagatatatgtttattatttcctcaggtcactggcacccagttttgataagcgcttcaagccagattttccacgggcagtgcaaagggttccttatggtagatattcccgaattgaaggccatgttccttgacattttaacggatacattggttctaaactctggattttttagctagatgagacgtatcaactttgcagagaataaaaaccatgacacccggtcatcttgcgcggcttctactggaaacatggatggttgtggatgcaccaagaaattgcaagcaattgtggtggccatgtcttcatgctgatacttgctttgggtctgatctcacgttaattgacatgtttgacttgaagtgtgcccatccttgtggatacccagacgtaccgcttccgtgggggcttgtgcagcttctgtcctgcttgggggaacttcaatccgtggctgcagaggcgctgcgaccgttttaacattttgtttgtaggataagtttgtagcttaggtttggagtaggtagctaattttgttgcggtggaagtaggtattaatcctacattaaatcccgtgtttatttttttaggtcaatactgacaaaagttcagtagctagatgtttattatttgtttctttatgtagtcattctttattatgttcttgtcattatttgtaaagatctacggtttgttgattgtgttgccggtgtaacctcgcatcgcggggtggcctctcgaatctctcgtatgttgtctcctgctgaaaaactgtacacgtctgctgtggtcgtgactacgaagttcttcc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001054071.1 RefSeq:Os02g0639000]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]]
| |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 2]] | |
| − | [[Category:Chromosome 2]]
| |