|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os01g0624000|
| |
| − | Description = Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase family protein|
| |
| − | Version = NM_001050153.1 GI:115438676 GeneID:4326680|
| |
| − | Length = 10391 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os01g0624000, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 1|Chromosome 1]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 1:26570470..26580860|
| + | |
| − | CDS = 26570689..26571237,26575355..26575521,26575651..26575714,26576207..26576332,26576408..26576678<br>,26576767..26577022,26577121..26577489,26578209..26578417,26579244..26579590<br>|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008394:26570470..26580860
| + | |
| − | source=RiceChromosome01
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008394:26570470..26580860
| + | |
| − | source=RiceChromosome01
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggaggcttcatcttggttgtgctaccaagctcgtggttttggttcatccagagtatggttatggcttcttctagctcttgttcttctgaattgcagcctggtactctcagcctcgccgtatctggtcggtatggggagcttcgacataacaggacctgcagcagatgttaacatgatgggatatgcaaatactgagcagattgcatcgggaattcacttcaggctgaagtcacgtgcatttattgtggctgagcctaatggaaagcgtgttgtgtttgttaatatcgatgcttgtatggcatcacagattgtgactataaaggtgcttgaaaggctaaaagcaaggtatggtgatctttataatgagaacaacgtggctatcagtggcatccacactcatgctgggcctggaggttatcttcagtatgtagtttatattgtcacgtctcttgggtttgttcgccaatcctttgatgtaattgttgatggcatcgagcaaagcattgttgaagctcataacaacctccgtcctgggaaaatatttgtgaataaaggtgacctccttgatgctggtgtgaatcgcagcccaagtgcatacctaaataatcctgccgaagagagaagcaagtacgagtataatgttgataaagaaatgaccctcatcaagtttgtagacgatgaactgggtccagttggaagtttcaattggtttgcaactcatggaacatcaatgagccgtacaaattctttgataagtggtgataacaagggagccgctgcacgcttcatggaagactgggctgaacaaatgggcttgcccaaacagtcagctcatgcaaattctgatgatttgagatctttgcacaagacatctgtacttcctcggagagtttctactataattcctgaaccaaatgagataactgatgacttgatacaattggcatcatcctatgaggcctcaggtggcaggcggttggcaggttcaagtatcactaggcgcattagaagtactcaacaaaacaaacctaaatttgtttctgcattttgtcagtccaattgtggagatgttagtccaaatgtccttggaacattttgcatagacaccaatcttccctgtgacttcaatcacagcacatgtaatgggaaaaatgaactttgctatggacgaggcccaggataccctgatgagtttgaaagtacccgtgttattgggaataggcaatttctaaaggctagagatctctttgattcagcttctgaagaaatacaaggcaaaattgactataggcacacttatttagatttctcaaaacttgaagttaaagtttctacaagtgcaggcggtcagcagaccgtgaaaacatgcccagcagcaatgggctttgcttttgctgctggaaccacagatggccctggagcttttgatttcagacaaggagatgtcaagggaaaccctttctggaagttagtaaggaacttgttaaagacaccagggaaggaccaagttgaatgtcattctccaaaaccaatattgctagacactggtgaaatgaaggaaccatatgattgggcgcctgcgatacttccagttcaaatgattagaattggtcagctggttatcttgtgtgttcctggagaattcacaacaatggctggcaggcgtctacgtgatgctgtgaaaactgttcttacaagtggaaacagtgaatttgataaaaatattcatgttgttcttgcggggctaacaaacagctactctcagtacattacaacttttgaagaataccagatccaaagatatgagggagcatcaacgttgtatggtccccacaccttgagtgcctatatccaagaatttcagaaacttgctatggccatgattgcaaacaaagaggtcccaacaaatttccaacctcctgatatgttggacaagcaaattggactacttcctggtgttgtttttgactcaactcctcttggtgtcaagtttggggatgtcaactcggatgttcctggtaactcaacattcaacaagggtagtactgtgaatgctacattttattcagcatgcccaaggaatgaccttcttacggatggtacctttgcactcgtcgagaagctagatggtaacaataattgggttcctgtctacgatgatgatgattggtcattgcgtttcaagtggtcaaggcccgcaagattgagttcaagaagttttgcaactctagagtggacagttcctgaagacgctgctgctggtgtttacagattgaggcattttggtgcctccaaaccaatgtttggttcggtcaggcattttacaggaacctctcgtgctttcgcggtgcgttag</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MEASSWLCYQARGFGSSRVWLWLLLALVLLNCSLVLSASPYLVG MGSFDITGPAADVNMMGYANTEQIASGIHFRLKSRAFIVAEPNGKRVVFVNIDACMAS QIVTIKVLERLKARYGDLYNENNVAISGIHTHAGPGGYLQYVVYIVTSLGFVRQSFDV IVDGIEQSIVEAHNNLRPGKIFVNKGDLLDAGVNRSPSAYLNNPAEERSKYEYNVDKE MTLIKFVDDELGPVGSFNWFATHGTSMSRTNSLISGDNKGAAARFMEDWAEQMGLPKQ SAHANSDDLRSLHKTSVLPRRVSTIIPEPNEITDDLIQLASSYEASGGRRLAGSSITR RIRSTQQNKPKFVSAFCQSNCGDVSPNVLGTFCIDTNLPCDFNHSTCNGKNELCYGRG PGYPDEFESTRVIGNRQFLKARDLFDSASEEIQGKIDYRHTYLDFSKLEVKVSTSAGG QQTVKTCPAAMGFAFAAGTTDGPGAFDFRQGDVKGNPFWKLVRNLLKTPGKDQVECHS PKPILLDTGEMKEPYDWAPAILPVQMIRIGQLVILCVPGEFTTMAGRRLRDAVKTVLT SGNSEFDKNIHVVLAGLTNSYSQYITTFEEYQIQRYEGASTLYGPHTLSAYIQEFQKL AMAMIANKEVPTNFQPPDMLDKQIGLLPGVVFDSTPLGVKFGDVNSDVPGNSTFNKGS TVNATFYSACPRNDLLTDGTFALVEKLDGNNNWVPVYDDDDWSLRFKWSRPARLSSRS FATLEWTVPEDAAAGVYRLRHFGASKPMFGSVRHFTGTSRAFAVR</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 1]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>9624..10172#5340..5506#5147..5210#4529..4654#4183..4453#3839..4094#3372..3740#2444..2652#1271..1617#atcaggagccgagccctccactttccccgccgctcgggccgctttctccattgccaagccgtaccttcgacgcttcgccttgtcagtcactgtccccttcgtggtcgtcttcgccacttctccccccgtctccacttgccccatatctgcggcagcctccctcctcctcgcggagatttgacccctgcgggctcgccttaaaatagaggcgcatcccattcccaagtggctgcttcctgcaaccacgaggtccgccgctctcgggagctccagcgagccgcgtcgccttctgcgcccgccgcccggtggccggcttaaatttgtgcgcggaggcgagccgtcgtcggtgccgcggggcttcctaattcctcccgggggagtgtggtcgagtgggggtttctggggttcttcgccacttcgccgcccgccggtgagttcgcttcctctcttccaagttccagtaagggcttgggtcactcgattgatgctgattcggcgcgtttcgcttgactgggaagttcgtcacgcgattgtcatacggttctcgcgtaattggtggcgtgtttcgatgagaatggccgttaggcttagcttgtagactgtgcaagactgtttttaggctgttgctaccgtggtctgtttggtgagaaaatggctggccttcctgattccttgtggtgttcgtagtggaatttgatgggggtctgatcgttgtggggggtcgcttgccggtgaaggaggctgctcttcggcaaatggttgggtgggtgggtcactgggtgctcaccgttttccggatctgggattctgaggtactgaaggtggtgtcgtctgtggttggggagtggtgcggttttcaagtttaggggcgtgtttaggacctgatgatgcaattgtaaatttgtaatacgatttgcaacgtccatatgtccacagcaacccaaatttattggtatagctctgatgaaacttcgggagtttcatttcagtatccctgttggtgaaaattatctcttctttcttgtattttgttcatgaagagtgatacaattaatagtattgccactgttactgtttttttctgaaaaaatttggcgccttcttttgtcttaacctgcttggatgatacgcatagttaatcacatcattaatccattatgctgtaatgatgtgtgaattttcttacaaactttgttttcttttgcagtttagtaaattcaacattttggacctacatgagttgattaacaagtccattccattgtccttcatggaggcttcatcttggttgtgctaccaagctcgtggttttggttcatccagagtatggttatggcttcttctagctcttgttcttctgaattgcagcctggtactctcagcctcgccgtatctggtcggtatggggagcttcgacataacaggacctgcagcagatgttaacatgatgggatatgcaaatactgagcagattgcatcgggaattcacttcaggctgaagtcacgtgcatttattgtggctgagcctaatggaaagcgtgttgtgtttgttaatatcgatgcttgtatggcatcacagattgtgactataaaggtgcttgaaaggctaaaagcaaggtaagagttaacatttcttgcgaccttattaatgcttgcatgtttgttgcaactttatgtgatatgcgcttatagatcgtgtataaaatgatccatcaacctttctacatgcatggtatgttccccaaaaaagcagacccgtaactcattgtcaagttactcatcatcatggattgagaatttgagatcctctgacttacttccctttgacttggagtcactgacatgtgggcccgctacctaaagggccaacatgtcggtgatccctgtcagaggtaagtaagtcataggatcctcttcctcaccatcatttgttgatggccgtcttattgttttcaaagattgttcaagtgaggcactgcctcaaaatcattggccattttgcaatgcatgttgcagaaacattgaggaacccagatgccctcatgttcactggtatgatcttgtttgaatctgttatgtcccaaagctcagtgaggcattatagcacgccatcatgtaggctggtgctgacaatgctgtagctaaggtactcatgttgcttgtctgttgtagcacgcctagagtctcagtcgagtcactttgttggaagttggaacattatctcttaaatcgactacctactcaacatggtattgtatttcctatgggtaaataaaccaaatttctagtttatattttgtccaactgaacctcaaaaccttgacttacagcatcaggattcttcccagtgcttctggccagccttgagacccttatgcagccatgcacctaataaagtctgctcagtagtttttcataacatcagggatcctcaaatttgcaggtatggtgatctttataatgagaacaacgtggctatcagtggcatccacactcatgctgggcctggaggttatcttcagtatgtagtttatattgtcacgtctcttgggtttgttcgccaatcctttgatgtaattgttgatggcatcgagcaaagcattgttgaagctcataacaacctccgtcctgggaaaatatttgtgaataaaggtataaaattagcttttgcttggactagccaaggttttccaaaaccgcctccggagccaatttttgctgctgtttaattaatgagtaaattacactttggtccaccttttattacccaagtttcactttggaccacccttaaatctatcttttcaatttggaccggataaatttaccattgttgcggtttgaaataccatgaaaaacttttcttgtcatgtctaacttccctttcggcaaacatatgaaccatacatagaggtgttcgcccgtatacaagagttgatgtgtttaaggttgttgattgtactgaaaaaaaatcgtttgtggtggtccaaatcgcaacaatggcaaatttatctggttcaaagtgaaaagatttgtttaagggtggtccaaagtgaaacttaggtcataaaatgtagcccaaagcgtaattcactcttaatgagtaaattacaatgcacctgttttctgttatttgtgacggttttaatctcacatatatgcatttcatttagttgcaagtaggccttcaaatgtcattacttgaattctggttatttctttcttatcattcagaaagctttataacaatagatgacttgaagcctgattttagatgtatgttgtgcacttacgctccccatatgatgcctactgagcatacgttgttactgcagtggttctttttttaaaaaaagggtacttgatttcaggtgacctccttgatgctggtgtgaatcgcagcccaagtgcatacctaaataatcctgccgaagagagaagcaagtacgagtataatgttgataaagaaatgaccctcatcaagtttgtagacgatgaactgggtccagttggaagtttcaattggtttgcaactcatggaacatcaatgagccgtacaaattctttgataagtggtgataacaagggagccgctgcacgcttcatggaagactgggctgaacaaatgggcttgcccaaacagtcagctcatgcaaattctgatgatttgagatctttgcacaagacatctgtacttcctcggagagtttctactataattcctgaaccaaatgagataagtatgaacctgaaccatatgccccttgatctgttcacatatatcggtgaaacatgttgggtcatgcctgaacttttattttcttcaattgctgttcagctgatgacttgatacaattggcatcatcctatgaggcctcaggtggcaggcggttggcaggttcaagtatcactaggcgcattagaagtactcaacaaaacaaacctaaatttgtttctgcattttgtcagtccaattgtggagatgttagtccaaatgtccttggaacattttgcatagacaccaatcttccctgtgacttcaatcacagcacatgtaatgggaaaaatgaactttgctatggacgaggcccagggtatccaccatgcctgaaaagtttaataaccttcctgtacatctgctagaaactgttataaatgaggttcttctttgctgctttgcagataccctgatgagtttgaaagtacccgtgttattgggaataggcaatttctaaaggctagagatctctttgattcagcttctgaagaaatacaaggcaaaattgactataggcacacttatttagatttctcaaaacttgaagttaaagtttctacaagtgcaggcggtcagcagaccgtgaaaacatgcccagcagcaatgggctttgcttttgctgctggaaccacagatggccctggagcttttgatttcagacaaggagatgtcaaggtttagcatgtcaatacatagtagcttcaaaatttgggtaacatgctactcactggtttatatatctcttaccagggaaaccctttctggaagttagtaaggaacttgttaaagacaccagggaaggaccaagttgaatgtcattctccaaaaccaatattgctagacactggtgaaatgaaggaaccatatgattgggcggtatggcttctctctctctctcttttaataatagtaggcaggcacatgtggtacctttatatttgaaacacctagttcatttactctttgagttttgatagcaaaggtcgaaggtggccattattatagagcaaatgttgctgcatgaaatcagtactgcaggtactgatataacatataattcttagtaacactgatgactggcaaatgctctaattcaatgattcggtttgtttgaccttttctggaatattcagatagtttcaaagcttaaaccatagccagtatcatgatatttatgaccagcatgatttgttgtgctagaggcaaagcaatgacatcaaatgagttgtcacttccaaacccagtcatgagtgagctccatgacatgtggactcagaagcaaaatctacaattaaactacttagtgaatttacaaaaaaaataaaatctgtttgctggtcctgtactgacttctgtagttttatgcagcctgcgatacttccagttcaaatgattagaattggtcagctggttatcttgtgtgttcctggaggtatattcccaactcctcgcccctagaatttctaccaagctaaaagtgcatatgatgtcttattccagtggattgtaatatgttatctgatactcacggtacaataattactgtcatgtttgggtacagaattcacaacaatggctggcaggcgtctacgtgatgctgtgaaaactgttcttacaagtggaaacagtgaatttgataaaaatattcatgttgttcttgcggggctaacaaacagctactctcagtacattacaacttttgaagaataccagatccaaagatatgaggtgtgtataaacttggccatctggtctatacattgacaacagtattgaatcaggcaaaatagactcatctcatagaccaattcatttatagctatctatgtgcatgtggtgtgtttattaatttagcttctttgctacgttaagtttgtacttaatctgccatgcttacatatgtccctgctcaactagaagccttagaacaactagctgggtggcccgcgcaattgcgcggctggcacccatacaaaattatctatttttaatatgattttacttataatttattcaatagatatttcattgtctttaagactttgaaagaccaaaccatatcatccccgtatttctaatgttgtaacttttataaaagtcacatcagttgttaccccttactttttttgtcaccctttctttatttgcttgttcgatctaccatggcttatattcattctccttttaacctttaaaaattggatcttatagtttttttgagtttattgtctcattgggtttcatttttttattttaagaagtcccgttaaaagctgccaatatacttctctacggcccatctgctgcttcctctctttattgtcattgggattttaaaaatcgaacataattatcgtttgagttcaatttttactttctagagtcccaccaaaccgtttgtactcctctacggctcgcccgcttcctcccactctttattatatttgagattttaaaatcgaatgtgattatcattgaggtttattttttaattttttggaaatcccgccaaccgtcgtgaccattctgcttaacggcatgtccgtcgtcactccttttaattgtcattgggattctatatggggttttgttaatagttcttagatgtctcatcaactgtcaccactctactcctttacaaccctgtaacttcttcgatatttattatcatttatcatcgttgtgttctagatgatttttttttgaaatttccatatttttcgttccgatagattttatttataaattatattcctagttgttttactctattttcagaatttattttattaattatttggaattttaattaatctcgttatgtattctagatggtgtattctttaaatagtctttattttttattacgaatttcagttacttttaaattgcattccaagttgaactcttcttttattttcttatttctaatttcggattttgttttattttttattttaaattttaattaatctcgtattgggttcttatatatggacttgtatgaaatgagggcactgtattatttttctgctgctgcagcctaagcatgctggcttggtatctccaccctatatatgtgcgggaatgtatgttggtttagaactctatactgtacagttctgcaattgatttttctaaacggacaaggactcctagtacggatggtatgatctataattagattgatatgattatcttttgtacagtaaatctatttagtaattttaaatttgtattcctactcgaactctcttttttcttttcttcttatttcagcaatttatttatttattattctgaattttaattaatcacgtattgggttcttatatggactcctctttcaatattgcttatttttaattccaaatttcagttatttttcagattgtatttctacttggactcttttttttctttttctctgattaatgtgggaatttctagcctccacagcgaacgtggtgccttcttttcgagctgtcttaataatataactagctaggtggcccacgcaattgcgcggctagcacccaaataaaatcatatatttttagtatgattttaattaaaatttattaaatagctatctcattgtcttaagactttgaaagaccaaatcttatcatcgtcgtgtttttaattatatagttttttaaaagtcacaccagttgctacccattatgtcatttccttctttatttgcttgctcgatctaccactatttctaatcattctccttagaacctttaaaaattggatcttacagtttttagagtttattgtcatgttgggttttgtttttataatttctagatgtcctgtcaaacgttgccattatactcctctatggcctgtccattgtttcttttctttattgtcattgagattttaaaaatcgaacataattatcgtttggcttcatttttactttttaaaagtcccgccaaaccatcagcgactttgccattgtacttctctacggctcgcctgctgcctcccttctttattgtcattgagattttaaaatcgaacatgattatcatttttttttactttttagaaattccgaacctttaaaaattggatcttgtagtttttagagtttattgtcttgttgggtttcattttttataatttttagaagtctcgtcaaacgatgccactatgctcctctacggcccgtccgccgtctactatttatggtcattgtgattctaaaaatcgaacatagctatcgttggaattcattttttattttctagaagtcccgtcaaccgtcggcggctctgcaactatactcctatacaccccgtccgatgcttctcctttttattgtcattgagattttaaaaatcaaatatgtttatcaatggggtttatttttttttactttctagaagtcccggcaaccgccttgctcgtctgcttcacggcctgcttatcgtccctccttttaatcgtcattaggattctatttggtgttttattaatagtttttatatgtcgtatcaaccgccaccactctactcctttatagtctagttaatttatctcgtcatgtgttttagatggtcttttctttcaatagtctttatttttatcacaaattttagttatttataaattgtattcctaattaaaatcttgtttttctttttctaatttcagaatttattttttcaaattttaattaatatcgtattgtgttctttcaatattcttattttttattttcaatttcagttgtttcaaaattgtattcctacttgaactctcttttaattaatctcgtattgggttcttatatcgatttttctttcaatattgcttatttttaattcctaatttcagctaattttaaattgtattcctacttgaactcttcttttattttcttttgctaatttcggatttatttatttttattccgaattttgattaatatcgtattgggttcttatatggattcttattttaatattccttattttttaattccgaatttcagccatttttgaattgtattcctacttggactctcatttccttttctaattttggattttattttatttttatttcgaattttgattaatctcgtattgggttcttatatggaaacttatttcaatattccttatttttaattccgaatatctgctatttttaaatcgtatttctacttggactctccttttcttttctaattttggattttattttatttttatttcgaattttgattaatttcgtattgggttcttatatggaaacttctttcaatattgcttatttttaattccgaatttcagctatttttatattgtacttctacttggactctactttttttttctttttctccgattaatgtgggaatttttagccccacaacgaacgtagtgtctcctttcaaagctgttttaataatataatagatagatagataggcctatgtgtcagcctgtcaggtactctactgcttgtttgcatgtcggcacttaaattaccatatcttgatcatgccccttatggtgcaatatatgaagtttcttaaggcgatctgttctgtttggtgccagaaaaagggtaaaaaatatgtaacttttttatatattagactctggacaattatatcagttggcagttattgatgttctgaagctgaatatgcaatttttgttttacccaaaattttcataatccttctggcagatagtgtactgtaggatcgcttgaatgaattttggatacatagtgtactgtaggatcgcttgaatgaattttggatacatgttgtctcatgaatcattcgttcaaatgaatacctttttcacagggagcatcaacgttgtatggtccccacaccttgagtgcctatatccaagaatttcagaaacttgctatggccatgattgcaaacaaagaggtcccaacaaatttccaacctcctgatatgttggacaagcaaattggactacttcctggtgttgtttttgactcaactcctcttggtgtcaagtttggggatgtcaactcggatgttcctggtaactcaacattcaacaagggtagtactgtgaatgctacattttattcagcatgcccaaggaatgaccttcttacggatggtacctttgcactcgtcgagaagctagatggtaacaataattgggttcctgtctacgatgatgatgattggtcattgcgtttcaagtggtcaaggcccgcaagattgagttcaagaagttttgcaactctagagtggacagttcctgaagacgctgctgctggtgtttacagattgaggcattttggtgcctccaaaccaatgtttggttcggtcaggcattttacaggaacctctcgtgctttcgcggtgcgttagttgatacgccttgagctttttatggcttatgaaggtttacagcaccaacttcatacatggaaaccctgccattatatccatagggcttatctgcttcttatttacttgtatttgagggtaataacactgttcaatcttatggaagtgtgaaactgctgtcccagtgcatgaactaagaatgggaaatatacagaatgtacataggtgctctttttatgt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001050153.1 RefSeq:Os01g0624000]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]]
| |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 1]] | |
| − | [[Category:Chromosome 1]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
