|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os01g0702400|
| |
| − | Description = WD40-like domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001050529.1 GI:115439428 GeneID:4326934|
| |
| − | Length = 9403 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os01g0702400, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 1|Chromosome 1]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 1:30865781..30875183|
| + | |
| − | CDS = 30866311..30866427,30866516..30866600,30867160..30867262,30867386..30867470,30868002..30868085<br>,30868215..30868318,30869110..30869371,30869566..30870002,30870225..30870306<br>,30872501..30872677,30872748..30872801,30873228..30873320,30873400..30873465<br>,30873580..30873626,30873753..30874018,30874175..30874433,30874580..30874964<br>|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008394:30865781..30875183
| + | |
| − | source=RiceChromosome01
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008394:30865781..30875183
| + | |
| − | source=RiceChromosome01
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggcttcgcattaccaggctgccaccttgatcgcgtcgccgtcgtacccaaatgcaatcgcttggtcgactgagaacctggtggctgttgcctctggtcaccttatcactatcctgaacccatctgcactggaggggcctcgggaactggttgttcttcgtcctagcgacccatttcccataggagtggttaacagagaagatctctttgaaccatgtataatgcccacttccttagcacgtgaaactgaattatgcgctcgatctatttcatggtctcaacaagggttttctcctaactccggttgtctgttggctgtttgtactgttgatggtcatgtaaagctttatcggtcaccattttgtgaattctgtgatgaatgggttgaggttgcagatatatctcgattgctgtttaagttttacaaaggtatagaatttggggaaaatgatggtcctagttcacttcctcaggaaaaagaaaatactgaacaaaaccagcaagtcatgtgtattggtaaactgcaagagcctcttctgagcatgggtacagaacggagaaaaaggaaaccagcaagatttgaaggttttgtttatcatgaggataatggtggcgtagatgctccaatggatgcggactttttattggatccaatctctaatttaaagaaaaaaacattgaagaagcgcagtgtagatgctccaaaggatgtggactttatatcggatccatctaatttaaagaaaaaaacatcggagaaggacgatgtagatgatccaaaggatgcagacttttcattggatccaatctctaatttaaagaaaaatacactgaagaaggtcacgagacctggacttgacgatgctgtcagaaatggtcagggcaacactcaaaatattcagacaccatcatactgcaatggagaagacaaatctctcccacttattacggcaaaacagtattcatgtcgtgaagcacttttgtcttctctcgtagttgcatggtctccagttctaccatcacctgacagaagttcttatttcacgggacattggtgcattcttgctgttggttgcaagtctgggagtgtttccttttggaaaatacacaaacctgaatactacacaatagacatcggcatggttactagagatccaatgctgatcggggttgttcaagctcatttatcatgggtcactgccataagttgggaacttttttcctcaggctcttcaaaacctttgttgcttttggcaactggatgctcagatggaagctcaaagatatggctgggtgatattgaagggttaaatcaatgtacatgcgcaaaagaagtgcccttgacattagtggctgaggtcactactgattcattagcaccagtctcgtcaatctcattatctgcaccagctcagcatcaagactcagttaatctggcaattggaagagcatctgggtcactagaagcatggtcgtggaacatatctggtaacaaaattcagaagattcatgcatgtgacgctcatgatcaagtggtgacaggtctgtcatggggttttcatgggcattgtttatacagctgcagtcaggataattctgcacattgttggatgttcaacgaaaaacatctagaagaaattcctctgcacacagatggtccggagctgaaagagtccgtagatctcacagaagtatccgatcgatgttatggccttgcactagcacctggagaactaatgattgctgtggtgcgcagcttggactcaaacttgttaaatcagatgtatcaggccaggacacaaaaggcagtggttgagttcatttggattggtggtcagttccttggtattccattggacaatagcgttatcctcagtcttcagtctgccgccttatctgagactaatttcttgtggtggggatccaacattttttggtcactgaagaaatatgagaattgtgaaacagtgcttgtcttatgggatctcattgctgcactacaagggtttaagaaatctgcacctacctttcttgagacattgatgcataaatgggtgtcagaaaaaggtaatgatgtaatggctgatttgtggaacaatcttctggtaagaagtgaaagggagctgcaagagaggcttgtggctttcacttttgctgctgtcctcaaccgaacagcatatttgctcaagggtgcccctgctgaaaacagctggtttcctgttggagttgcccagatggactcttgggcatccatgaacgatggagaagtgagggatgagctcaaatttcttagaacgaggatcaatgatctaggagacaggatcaactcagtgtgcgagtactcagttgaagaatactgcacctactgcaatgcaccagtccccttcgagtccgcagatgttgccatgtgcagtggtagcaatcctgctactcccccagctgaagctcacaaattgtcaagatgcacagcgtcgatgcggctgtgccctgttcttcaaccaacatggcactgcgcgtgttgcgggaggacggtcgacaagctgctgccggaaatattcttcaccatgcccacatcattttgggatgtcactcatggtaacgaatcgcttgatttatcagcgccggccgtcccattttgccccttctgcggcatactgctgcagaggataaagccggagttccttctctctgtctcaccggtatag</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MASHYQAATLIASPSYPNAIAWSTENLVAVASGHLITILNPSAL EGPRELVVLRPSDPFPIGVVNREDLFEPCIMPTSLARETELCARSISWSQQGFSPNSG CLLAVCTVDGHVKLYRSPFCEFCDEWVEVADISRLLFKFYKGIEFGENDGPSSLPQEK ENTEQNQQVMCIGKLQEPLLSMGTERRKRKPARFEGFVYHEDNGGVDAPMDADFLLDP ISNLKKKTLKKRSVDAPKDVDFISDPSNLKKKTSEKDDVDDPKDADFSLDPISNLKKN TLKKVTRPGLDDAVRNGQGNTQNIQTPSYCNGEDKSLPLITAKQYSCREALLSSLVVA WSPVLPSPDRSSYFTGHWCILAVGCKSGSVSFWKIHKPEYYTIDIGMVTRDPMLIGVV QAHLSWVTAISWELFSSGSSKPLLLLATGCSDGSSKIWLGDIEGLNQCTCAKEVPLTL VAEVTTDSLAPVSSISLSAPAQHQDSVNLAIGRASGSLEAWSWNISGNKIQKIHACDA HDQVVTGLSWGFHGHCLYSCSQDNSAHCWMFNEKHLEEIPLHTDGPELKESVDLTEVS DRCYGLALAPGELMIAVVRSLDSNLLNQMYQARTQKAVVEFIWIGGQFLGIPLDNSVI LSLQSAALSETNFLWWGSNIFWSLKKYENCETVLVLWDLIAALQGFKKSAPTFLETLM HKWVSEKGNDVMADLWNNLLVRSERELQERLVAFTFAAVLNRTAYLLKGAPAENSWFP VGVAQMDSWASMNDGEVRDELKFLRTRINDLGDRINSVCEYSVEEYCTYCNAPVPFES ADVAMCSGSNPATPPAEAHKLSRCTASMRLCPVLQPTWHCACCGRTVDKLLPEIFFTM PTSFWDVTHGNESLDLSAPAVPFCPFCGILLQRIKPEFLLSVSPV</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 1]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>531..647#736..820#1380..1482#1606..1690#2222..2305#2435..2538#3330..3591#3786..4222#4445..4526#6721..6897#6968..7021#7448..7540#7620..7685#7800..7846#7973..8238#8395..8653#8800..9184#atagggcggaggaggacagcacgcgctccgctcgcccgccgccccacgccccccgcacgccgcggcccttcgctcggctgccggttgctgccgcgcccctccgctcgtccgctccactccgcgtcgcagcaccggggtgggagccggcgcggcgagtccggccggcctcggggaagcgctgccgcgctcttcccgactccggcgactgcaacggctgctccacctccgcctaacgtttcccatcgtcagcctcctccctcttatactcctgcagttttagctctccgccactattcattcctttcctttcctagggcttagctgaaatttctccgtagcgaagaggaattgggtggtgggggattaaacccgatccatctgcagtgaggattttcccccatgtgtcaaacaagcatgctgtggacttacatataggatgatagaacttagacgaggtgcaggtgcagtcagtggctcaactgaacccccttgtcccgcgttaatttccgcctggttttgttgtgagtgccatggcttcgcattaccaggctgccaccttgatcgcgtcgccgtcgtacccaaatgcaatcgcttggtcgactgagaacctggtggctgttgcctctggtcaccttatcactatcctggtatgtgtggtttcattgcattagtgtattcgaaccatgttgtcctcctcaggagttatgactgttcatcttgtgtttttgattctagaacccatctgcactggaggggcctcgggaactggttgttcttcgtcctagcgacccatttcccataggagtggttaacagagaaggtacggtttccagtgaaacacatgaatttgtgctgcattccttttgcttttcacgtgttatcagtttagacggataatatgattgccgaagtggagtggaagagatgctcggtgttaagtttctttatgttagcactgcatagtaagaaaaaatgattgggacagcttgagtttagcagttactttagagttctgtcaacaacttaaatgttatgggtggctgttgtgcttgagatcacggtggacaactccaaatgatgataaatatcatcaatatgtacactttgctttctttaaaaattattaagcaatgccttaggctaattgcatgtgaagatgcaattcaacaatatgcatccagaagttacgctttcttaaacatcaattcagcagtgtggatttgagttcctacaaaaataaaattgtaattttaatatgtaattatcttgattacatgaaatttttggcagtcaacttctcttgtgacaaactgaaaagtaacactggacatcgatagaaggtgcgcaccaggaatcagtttttattgcttattttgcagatctctttgaaccatgtataatgcccacttccttagcacgtgaaactgaattatgcgctcgatctatttcatggtctcaacaagggttttctcctaactccgggtatgtctttttttaagtcgtttcatcacatcatttttgtctctctctagatttattcttcagcactactaggttcatttgcttatctggcctctgtacttttttttccctatatggattcagttgtctgttggctgtttgtactgttgatggtcatgtaaagctttatcggtcaccattttgtgaattctgtgatgaatgggttgaggtaagcatgttcacctaatgtattattaatttagtttattgactaacttaatttgtataaacattgatagctgggcagcttgattggcctgccaaattcctgttatgcaacagtaatttgttccatgtaggtccaatttgccatgtcccatgcaaccatgcagccccctacattattttttcactatctaagaatttgaaaacatattggacaggcaatgcagttaaaataagcttaacaatcactgcaccacctagtagacattcaaccgtttgttcagtactacttctgacttcgattacagacaaaagaagatattctttttggcagttttgtttgtatttctctgtgtttttcttgctgtttgtcatgtcccttccttttccttttgccattagataaaatatttattttcattcaccacttgtaatcatttgaacctatcagttacatatgcttaggatatctcagggtgtatgtgttctttagttttctcatattctgcctgtcaacttaaatctattggtctaggttgcagatatatctcgattgctgtttaagttttacaaaggtatagaatttggggaaaatgatggtcctagttcacttcctcaggtattctcccatccatccactctatcaccagtgtctccctttcattggttgcctcagaaaattttttttttgtgaggcagaaatatatgttattgagttaacttacagaaagtttgtcttctgtgtcaggaaaaagaaaatactgaacaaaaccagcaagtcatgtgtattggtaaactgcaagagcctcttctgagcatgggtacagaacggagaaaaaggaaaccagcaaggtgagtcacactcttctgtttgctggccatcaaagtttaagataacaagatggtccaaaggggttagttcaagaaataagatgatgggttctatgcttacaatttgatgtatgataatgagtgcctagagtcgttcaaaaaaagataatgagtgcctagaagtataaaatgtatttaccagagaaagatctatgcttaacactggcagactggcctagtgcacttacttggtttctctggtggtacattgtcaatgggtaaatattctgcatgtgctatttgaatcaggtttaattttagccagggaaaattgaagataatctccaacaaactgaaaatggcaatgatagcaactcagtttcccctttcctgacagtctttgacttagacgagcagacaaatgtgtcaaggattgcaaaaaggccattttattttctatcattaggtggcgagaggctgcttataatgtggttgtataaagtaattcttttttcgtttggcacgacacacttgccatgtgtggttttggaataagattgataatttagaggctcttgtttgctaatttttacagttgaagtactgaattactgacgattactggtagaaaaactgtagtaagtatttgctatgggttgttgctaagcttattataggatgccaattgttcatatgtcaacctatccgccactgattaatgccttccttttcgcactaactttattttgcaagaagctatttttggcctataatcgtatgttaggtctgaattattttgtttcattttttagatttgaaggttttgtttatcatgaggataatggtggcgtagatgctccaatggatgcggactttttattggatccaatctctaatttaaagaaaaaaacattgaagaagcgcagtgtagatgctccaaaggatgtggactttatatcggatccatctaatttaaagaaaaaaacatcggagaaggacgatgtagatgatccaaaggatgcagacttttcattggatccaatctctaatttaaagaaaaatacactgaagaaggtaggatttacatgttcacatttaggttaaagtccccagtgtatgcccattagttgttaacattaaaagctaaaccttgtttcataactaaggagagaactatttgtgctgttaaatcacactcgcacatagcctattttatatgatttttttttctttggcatcctgtatcttttacctggttgtgattgtaggtcacgagacctggacttgacgatgctgtcagaaatggtcagggcaacactcaaaatattcagacaccatcatactgcaatggagaagacaaatctctcccacttattacggcaaaacagtattcatgtcgtgaagcacttttgtcttctctcgtagttgcatggtctccagttctaccatcacctgacagaagttcttatttcacgggacattggtgcattcttgctgttggttgcaagtctgggagtgtttccttttggaaaatacacaaacctgaatactacacaatagacatcggcatggttactagagatccaatgctgatcggggttgttcaagctcatttatcatgggtcactgccataagttgggaacttttttcctcaggctcttcaaaacctttgttgcttttggcaactggatgctcagatggaaggtcagtacaacttccgtcaccactgtaaaggattttacatttttgtcatactatgtgacagctaactcttgaatttgctcttccatggttccatctctctctctttctctctctctctcgacaatttaagcataaaccactaaaattgtgatgcttccttaatcctcccaaatacctgttttactcaaaacctttcaaattcgttttctggggttttttcagctcaaagatatggctgggtgatattgaagggttaaatcaatgtacatgcgcaaaagaagtgcccttgacattagtggctgaggtacataattaccattaccctgtgttgtctattgatatacatatttgattcgatatatgactaatatccaatattctattaataaaactagctgggtaacccgcgcaattgcgcaggtatctagttgtcttaagattttgaaaaccaaaccttattgtccccttgtttctatattatttttatagttttttaaaatcacaccagttgccacccttacttgtgtcatccccttctttatttgcttgctcgatctaccactatttctattcattctctcagaacctttaaaaattaagccttataatttctagagtttattgtctcattggttccatttttataattttagaagtcccgttaaatgctgccattatactattctgcggcccgtccgttgcctccgcttttattgtcattgggatttttaaaaatcaaacataattattgtttgggtttattttttttactttatagaagtccagccaaaccgccagcggctatgtcacagtactcctctacggctcgcccgctgcctctcctctttattgtgattgagattttaaatcgaacattatcatcattgttttttttttactttttagaagttccgaacctactttttagagtttattatctcgttgggttttatttttataatttttaaagtcccgtcaaatactgacactatactcctccgcagcctgtccgctgctttctctctttattgtcacattgggatattaaaaatagaacataattatcatttggattcttttacattctagaaattctgtcaaaccataagtgactttgccactataatactttcctttacggctcgcctacagcctcccctctttattgtcgttaagattttaaaatcaaacatggttatcattgggtttattttttaccttttagaagtcccgccaacagtcgtgatcatgttgtttaacggtatgtccgtcatctctccttttaatattcagtaggattctatttggggttttattaatagtttttagatgtcccattaaccgtcaccactctacttctttacaaacatgttacttctcccatatttattgacatttgtcatctgtgttctagattttatttttttaaaaaaattccatatttttcattccgatattttttatttacaacattatactcctatttgaactcttataattatttttctattttcagaatttattttatttgttatttggaattttaattaatcttgtcatgtgttctagatgtctcttcttccaatagtatttattttttattacgaattttagttatttataaattgtatttctagttgaattcttatttttcgttttgtcatttcagaaattattttttattttgaattttaatttaatcttgcattgtgatatatatggactattctccgattgatatggaaatttctaatccccacaacgtttgtctgtgttaattaaaccgacggaccatgataaaaaacgaaatccttgcgtatttttttattaggtatagatataggttttagaacggaacaacatgtgtccaaagtgaggactaatagtagtactcggattgtttgctttgctgtatgcatatactatcgtttatgtttttctctgcagcatgcaaactctctctgttggtatgtgtttctgacacccagtgtggaaagtgctacttctaaatagagttatgccagagtttagttggcttaagaataaacactaataagagtctgattattagaggtgactgcttatttttctttgatatttagctgggaattaggcagtcatccatgggaatcggacacaaattcgtacttatgtagctaaagctagttttctatttttgtgtttgtttccaacacttacatatggtaatatgcaaattatatcagattccaaataacaaaacaaatcaagtcaaacttacatatggactgtcattaaatctctaccattaaaatctagtcatatcacaatacaacggttaatatttttctctttttctccgattaatgtgggaatttctagcccccacagcgaacgtgatgcctcctttcaaagctatcttaataatataatagattgaaatgcccatcttgcactttctagttccagctaatgcctttctgttattaaatatactgctccaaacgttgtactgtcaggtcactactgattcattagcaccagtctcgtcaatctcattatctgcaccagctcagcatcaagactcagttaatctggcaattggaagagcatctgggtcactagaagcatggtcgtggaacatatctggtaacaaaattcagaagattcatgcatgtgacgctcatgatcaagtggtaaaatttcattttaccttagtatgtttacatcttgataaaagaaaaaaaatatctaacatcaccataggtgacaggtctgtcatggggttttcatgggcattgtttatacagctgcagtcaggtgtgtttatgtcctcgttgcactttgtaattaattctgattttgtttttaaataaaaccaaagttccgttgacagtatgttaacttttctattaaagtgtaaactattttctatgttctcagtgtattcacgatctctgtctttgcaatattactagctgctgattacaaaacgtgcataaataactgatggcagattgacgggagacattgatttctgtagtattttggagttgtgttagttaagacttggaaagctgaagttttctgaaagttatattttatgttctgctgctggatcataaaatcctatgcactgtgttgacttattttcttgaaccttcaaaaaatcctgcgcactgtgttaacttattttcttgaaccttttgttacttgcttatgcataaagccttgctactttgtcaggataattctgcacattgttggatgttcaacgaaaaacatctagaagaaattcctctgcacacagatggtccggagctgaaagagtccgtagatgtaaaacatatactcaataaccctttatcctgaacatgcaagttttttcttctggttgacatctgaaatgtgcatgcagctcacagaagtatccgatcgatgttatggccttgcactagcacctggagaactaatgattgctgtggtatgctttaggctatctcttatatctgacgcatattgcttaactgtgcaacatttgtacttgagctttcatatataataagctaaaacaatttatgaatgttatctccttcaggtgcgcagcttggactcaaacttgttaaatcagatgtatcaggccaggtaattttgtttgggagttcggtatgggaagtagtgaggtctgcttggatctaattaatgatttcttttatctaacatttagaaaatccactgtcatcacaataattttgtgaataaaaacaacaggacacaaaaggcagtggttgagttcatttggattggtggtcagttccttggtattccattggacaatagcgttatcctcagtcttcagtctgccgccttatctgagactaatttcttgtggtggggatccaacattttttggtcactgaagaaatatgagaattgtgaaacagtgcttgtcttatgggatctcattgctgcactacaagggtttaagaaatctgcacctacctttcttgagacattgatgcataaatgggtgtcaggtttgttttcagatgatccacattgtgcttctatcgacatcccatcacattcaattcacaacatgtccaaagtcagctcgcggaagttgcacttgctgaatatcgtatgtaggaaagtaatgcttagtgatcaaccgcagtattctcctggtgcagaaaaaggtaatgatgtaatggctgatttgtggaacaatcttctggtaagaagtgaaagggagctgcaagagaggcttgtggctttcacttttgctgctgtcctcaaccgaacagcatatttgctcaagggtgcccctgctgaaaacagctggtttcctgttggagttgcccagatggactcttgggcatccatgaacgatggagaagtgagggatgagctcaaatttcttagaacgaggatcaatgatctaggagacaggtaaaccatttttctaacatcatttcacttgtgaaacggcatagagcatatgccacatgatagttcagtagaattgccttgaaatggcttcactgaaagtaaaattggatgttgaacctgttcagtaactgttttgcgccatgcaggatcaactcagtgtgcgagtactcagttgaagaatactgcacctactgcaatgcaccagtccccttcgagtccgcagatgttgccatgtgcagtggtagcaatcctgctactcccccagctgaagctcacaaattgtcaagatgcacagcgtcgatgcggctgtgccctgttcttcaaccaacatggcactgcgcgtgttgcgggaggacggtcgacaagctgctgccggaaatattcttcaccatgcccacatcattttgggatgtcactcatggtaacgaatcgcttgatttatcagcgccggccgtcccattttgccccttctgcggcatactgctgcagaggataaagccggagttccttctctctgtctcaccggtatagaagctagtgacactaggcagcttccagctgtaagttgtaatactgaatacgtcactaatgcactttgaatttgttgttggtggggggctgcttctaaaaacatgtgcttaaaataagcatggctggtttgcgctaggtgtggtggtgccatcataatgtaacaacccgtgtaacatgtgacatctgtaactcttggcaataaagcgggcaatatatact</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001050529.1 RefSeq:Os01g0702400]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]]
| |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 1]] | |
| − | [[Category:Chromosome 1]]
| |
