|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os11g0298400|
| |
| − | Description = Ribulose bisphosphate carboxylase, small chain family protein|
| |
| − | Version = NM_001074260.1 GI:115485168 GeneID:4350322|
| |
| − | Length = 10245 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os11g0298400, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 11|Chromosome 11]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 11:11057563..11067807|
| + | |
| − | CDS = 11057751..11057832,11057957..11058042,11059534..11059611,11059721..11059852,11060139..11060189<br>,11060283..11060423,11060508..11060630,11060743..11060820,11061202..11061291<br>,11061374..11061493,11061690..11061773,11062403..11062498,11062589..11062777<br>,11063459..11063534,11064261..11064364,11064462..11064721,11065754..11065840<br>,11065938..11066165,11067018..11067094,11067166..11067231,11067306..11067415<br>|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008404:11057563..11067807
| + | |
| − | source=RiceChromosome11
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008404:11057563..11067807
| + | |
| − | source=RiceChromosome11
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgggaggcgcgcgcgcgcaggtgaacaagccgcacaagacacgcttcgcctccaaggcgtcgcgccacgcgcacaagatcgataaggtcaggaccgggaagccggagggcagccaccgcgccgccgtcaagggggcccgcgccgcgcgcgtccagcggagcaaggcgatccgtgatcagaaacgtgctgctttgctgaaggagaagcgctcttccgttggatcttcgagtgcgccccgtgtcgttgttctttttggcctttcctcgtcggcaaatgtcagatcacttgccaaagaccttttaaccattgcttctggtgatgaagagaaaccaacttcttccactgttgcttctcctacatataaacttcgaaccacggtacttgaagcaccttatggtgatcttacatcatgcatggaactggcaaaggttgctgatttgctagcatttgtactatcagcaaattcattatacgattgtgattcgagcagtccaattgatgattttggatcacaatgcttgtctgtttttcgggccatgggcttacctagtacagctgttttcattcgagatcttccatcagaaaacaaaagtaggcaggaattgaagaaaacagctatttcttttgtttctccagagctacctgaggattgcaagttctatgcagctgacacaaaggatgatttgcacaagttcatgtggcttttcaaggagcagcacctttcatgtccacattggagaaaccagaggccttatgttatgtctgaggaggcctgcataaaacctgatgacagttcagggctgtgcacattgcttatgtctggatatttacgtgcccacaatctttctgtcaaccagcttgtccatctgtcaggtgttggtgattttcagttgggtcaaattgatatcctcaaggatccttttcctattaatgagaggaaaaactccaatgccatggtttctgaagatagtggtattcagattgttgacacctttgttccagacccttcaagtcaagagcctttgcttgttgaaaacaccccagatccacttgaaggggagcagacttggccgacagaagctgagatggaagaagcctatttgaacaacaaacagagaaagctaaaaagaaagcttcctcgaggcacttcagaataccaggctgcttggattgtggatgatacagatgatgaagatggtgattctgagaacgacaaccaggatggtgctggaatggttatagatgagcaagatcactcagacaatggaggtgatggttcagatatggatgtggtatctcactttacggagaaatttgatgaagaaacaattgggggtaccgagatggcagacgatgaaaatttgaccaaagagcagatagaggcagagattaagaaaataaaagaagctaacgctgaagacgaagaatttcccgatgaggtggagacacccttagatgtcccagcaaaaaggcgatttgcaaaatacagagggctaaagtcatttaggacatcatcctgggatccaaaggaatcactgccacaggattatgcaagaatatttgcattcgataactttacaagaacacaaaagcatgttcttgctaaaatggcagagcgagatgaaggaaccttgaaggattgtgctcaaagaggatcatttgtgaggctccatctgaaaaatgttcctactgagattgcctcaaaacttgttcatccatcaaggagattgcctgtggttgtttctggtcttcttcaacatgagtcaaaaatatcggttctccatttcagcataaagaaacatgactcctatgaagctcctatcaaatcaaaggactccttaattttcaatgttgggttccggcagtttactgctaggccattgttttcaactgacaacatcaattgcaataagcataagatggagaggtttctacatcatgggcggttttctgttgcctctgtatatgctccaatttgctttcctccactccctcttattgttctaaagagcagagatggggagcagcctgccattgctgctgttggttcactgaaaagtgtggatccggaccggattattcttaagaaaattgttttgactggttatcctcaacgggtctcaaaactgaaagcagtagtgcgatacatgttctacaatcctgaagatgtcaagtggtttaagcctgtagagttgtggacgaaacatggtcgacgtggccgaatcaaggagactgttggcactcatggtgctatgaaatgcatattcaatagcagcgtccagcagcatgataccgtgtgcatgagcctttacaaacgcgcttaccccaaatggccagaacagctctaccagatatga</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MGGARAQVNKPHKTRFASKASRHAHKIDKVRTGKPEGSHRAAVK GARAARVQRSKAIRDQKRAALLKEKRSSVGSSSAPRVVVLFGLSSSANVRSLAKDLLT IASGDEEKPTSSTVASPTYKLRTTVLEAPYGDLTSCMELAKVADLLAFVLSANSLYDC DSSSPIDDFGSQCLSVFRAMGLPSTAVFIRDLPSENKSRQELKKTAISFVSPELPEDC KFYAADTKDDLHKFMWLFKEQHLSCPHWRNQRPYVMSEEACIKPDDSSGLCTLLMSGY LRAHNLSVNQLVHLSGVGDFQLGQIDILKDPFPINERKNSNAMVSEDSGIQIVDTFVP DPSSQEPLLVENTPDPLEGEQTWPTEAEMEEAYLNNKQRKLKRKLPRGTSEYQAAWIV DDTDDEDGDSENDNQDGAGMVIDEQDHSDNGGDGSDMDVVSHFTEKFDEETIGGTEMA DDENLTKEQIEAEIKKIKEANAEDEEFPDEVETPLDVPAKRRFAKYRGLKSFRTSSWD PKESLPQDYARIFAFDNFTRTQKHVLAKMAERDEGTLKDCAQRGSFVRLHLKNVPTEI ASKLVHPSRRLPVVVSGLLQHESKISVLHFSIKKHDSYEAPIKSKDSLIFNVGFRQFT ARPLFSTDNINCNKHKMERFLHHGRFSVASVYAPICFPPLPLIVLKSRDGEQPAIAAV GSLKSVDPDRIILKKIVLTGYPQRVSKLKAVVRYMFYNPEDVKWFKPVELWTKHGRRG RIKETVGTHGAMKCIFNSSVQQHDTVCMSLYKRAYPKWPEQLYQI</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 11]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>189..270#395..480#1972..2049#2159..2290#2577..2627#2721..2861#2946..3068#3181..3258#3640..3729#3812..3931#4128..4211#4841..4936#5027..5215#5897..5972#6699..6802#6900..7159#8192..8278#8376..8603#9456..9532#9604..9669#9744..9853#gttcgcgcccacttccagccaggccaccgccgccgccgccgaccgaagcagccgacggcgaccaccgccgcggcgagggatcggtgcgtaagcttggcggcgggccgctccgcacgcgggagggagcgccgtagccgcccttccccccaccctctacaccccctcgccggcggcgaacacggcgcgcgatgggaggcgcgcgcgcgcaggtgaacaagccgcacaagacacgcttcgcctccaaggcgtcgcgccacgcgcacaagatcggtacggcgcccatggcggtctccccttctccttctcctcgtcctcctcccgcccccggcaatcccattcctcttcttcgttgccttacgctgatggatggcggcgtctttttgttgttcggcagataaggtcaggaccgggaagccggagggcagccaccgcgccgccgtcaagggggcccgcgccgcgcgcgtccagcggagcaaggcggtgaggcttcagctctcgcagtgcatcgcacctttacttttgtgcttggttattagctagagtatgtgcttgactgattgtgacttttgggtagatgtcaaagctggctaattccgattcgggtggctgtatggagctatttttttttcttctgatgtttattttgtgaagcacaaagcatattgataagaccagcagccaattaatacaaatgtttattaaaattgttaagtactccaagaaataagacatgtttccaataaatcaataataatacctgcgacatgatagggaacacatctgacagccagtatactcagtctcagagtgaatggcaattaatctttgacagtgcagactaaaatgatatctgaaaaatagatggctagtggaccgtccaaacttcagcttacacagctgaacttcaaccttcagcttgtacagcttatagcattcccataaaattttagaagaccaacagtgcacctgtgtgttgcatctgaagttgattttcattatactggagtgtaacaacatataaacttttctaacaagaaatgagcttttgctattttagttcttgtgttatgataggtggacaagggacatggatatcttcattacaacacgaactcaagtagtttacaaagtaaaaacaggaatttgtacttttttttttgcttatcctggttcactgtcctcagtgttgttagttgtaaggtccttcagcatgttcaaccattcatctactgaagcattgttgactgttgggtagcaagcctcataggctggtgtcagaggccaatggtgcaaacatctactttaacagcatcttgattatttgtgaagatagaaacatgataattttccagaactagactgacacaagacaggaagtggcctgcaacgcaaggagggatccagcaaggctgggctttttgtatgatcagtgatgtatcctaatgtttattttgaacaaaactatcacttccttctttatgttagatggcagattgatctctgcatattctctattcatccagattcttggaaaatttgttattacagtaatagtttgctagatgcagagatcttgaaagtgtttcttctggttggcttgaagaaaccattgttttgtactattttttttattattatggtaaattcattcaacatatagttagttattctttctgtatttctttgattcatctcctttcatgctagacagtaaagtggaaagtattgcaaattgccgtgcagccactatgttcctttgtcctagttatgatggctccaaagcatgtcttccaactgtcatccaatttatttgttctttaattcattttctctgttttgatctctgctcaacttggattacatatactgatatggtcgctgagcattatgttttggtttgttaagagctcttgttttttctagcctcatcagttttttcttgtttactgtaatggttttgcttggttgcagatccgtgatcagaaacgtgctgctttgctgaaggagaagcgctcttccgttggatcttcgagtgcgccccgtgtcgttgttagtatttatgaacttagctcttgttgtcctactttgattgtcacttttgttgtttcctacggtcagatgatagacatttccttggggtaactgatgattattgcaggttctttttggcctttcctcgtcggcaaatgtcagatcacttgccaaagaccttttaaccattgcttctggtgatgaagagaaaccaacttcttccactgttgcttctcctacatataaacttcgaaccacggttagtttaatttaaatacagttgtaccacacatacctgtaggcaggacacactatttagtaatatctctattttcacgttcaccaaaaaattatgaccattgtatcatctctctgatgtgcatgtgttgaactatagataggtctttgaaccattgtatcagcacttggtctcatgttttagttgttctttatatatattgctgttaatttcttaatttccattcattgaatctgcacacgacatgaatgataacattgcttttatattcatatggttcttgaaggtacttgaagcaccttatggtgatcttacatcatgcatggaactggcaaaggttcattcaatcaaaatcaatttgtcataattgtttttgttgaaatttcttgcctctaatctggatcttgcaaactatatctttcctacataggttgctgatttgctagcatttgtactatcagcaaattcattatacgattgtgattcgagcagtccaattgatgattttggatcacaatgcttgtctgtttttcgggccatgggcttacctagtacagctgttttcattcgagtaagttcccatcataagcatttgtcatgccagacattgtataattgttatcaacttccatcttttaacattggtacttgtcaggatcttccatcagaaaacaaaagtaggcaggaattgaagaaaacagctatttcttttgtttctccagagctacctgaggattgcaagttctatgcagctgacacaaaggatgatttgcacaaggttttctttggaaccatatattattaaataatgaaatgatatttatatttttcttcaccttttctatccttccaatgctgtaatgtaattatttatgcttaaatcttttcagttcatgtggcttttcaaggagcagcacctttcatgtccacattggagaaaccagaggccttatgttatgtctgaggaggtttgaatgatttgatactctatctctcttttttgagtgttgacagctgtatcttggtgtagaatatttggcccaaaatcacatccatgtttcccattttgaaaatttgtctgtgcagtatgcttgacaattaagactggttctgctaaaattaaaataatatgtgaacttttcctaggtgtgttaaatctttgacaaggcatatgcgagattgtgagcacatgcatcacatcaccttaggtttccatgtaatgatatattaagttggctttgaacctacattattcagtgctagtggtgattattcacaagttacaagtcatgttggctttgccttttctttcagtttaaaactgattgacataagatgtttgttttcaggcctgcataaaacctgatgacagttcagggctgtgcacattgcttatgtctggatatttacgtgcccacaatctttctgtcaaccagcttgtaggtgatctatgtttttatttctagtgagctattttatgattttctgttcctattttctaacacctttgccactcaaaaggtccatctgtcaggtgttggtgattttcagttgggtcaaattgatatcctcaaggatccttttcctattaatgagaggaaaaactccaatgccatggtttctgaagatagtggtattcaggttgttatacatcataaattcacttttacaaactgaattatactgttcacaactacattagaatgatctgatgcaagtaatgctatttagtatcataataagcataataatcaatgactaagttatcttttacatgttcagtttcatttattttgataacaccttttaaacttctcattatttggccctttttcagattgttgacacctttgttccagacccttcaagtcaagagcctttgcttgttgaaaacaccccagatccacttgaaggggagcaggtgatctttctcccatttggcttaatgatgtgatgttgacaagccattgttttgagttctgtcgtatcaaaaccttttggtattgaagggaaaatacaaggggtctatctattacttcatatagtcctactcttagaaagttggatttagtgcacagtttctataatagcacattgacttttaaaaagtttcatcattgttactgtgaagcatcttagtgttggtttgacaaaaaaaaatgttggtaatattcttgatgtcacgacttactatttttattttcaatgtgttgtcatctgttgttctgtgttattttcttctcttagatgaagtcagaagtttgtttgcttttaacatactcattaagctctgtatctttcttaaaaatacaacatatgtcatcagatagaatagactcgcttagcttaatggaaacctttgctgtcaatctgtttcttttggctcagattgcattcattatttgtcatattttactgaaccaaacattatgtttcctatgtttgtttcatcctatcaaatcttatttgctctcttgtgaattagtgaaattaaattatatcaatatatctatatttgagaataagttctcttttgtattattatcttagacttggccgacagaagctgagatggaagaagcctatttgaacaacaaacagagaaagctaaaaagaaagcttcctcgaggcacttcagaataccaggttcacaatgcttatcaagattatattacctattgcttactttttttaataattacttattgaaaaattctcctcaaatgctattgtcaggctgcttggattgtggatgatacagatgatgaagatggtgattctgagaacgacaaccaggatggtgctggaatggttatagatgagcaagatcactcagacaatggaggtgatggttcagatatggatgtggtatctcactttacggagaaatttgatgaagaaacaattgggggtaccgagatggcagtgagttcccttattccttcaatctgatacattataaagcatttgctttcaaagaacttattagtgggcaaaacagagaaattatagctgcagtctatcatttttatattttgatttttcttgccctagtgtgtagttgtactagttaaaagacacctaaatgactgctattatgcataaaaagaatcatgtacatttccattttgttgggaactgaacatgttcattaatgtttttgctatagggaaaactgaacacttacaatgttttcacatctaatactagtaacttagctttctatactacataacattggcaattcattcatcttggaccttcccacactatatattcggattcactaaggctaacttggaatttataaaaaaaatgtggaaaaagtgttctgcaatgaaggtgtttcaggagtagtacacaaaaatgcaatgtagagtgaggcgtcagattgacaacaatcaccaccactgccttctcttagagtagtgagatagcagatatgccttttgtgcaatgtttataaattcgtagggcatgcttttttatccaatgtcgaattcttcttctctttctgtataatctggttttcttcttctagcatgagatgaatatgcatgctttaatctgtctcaactttaagtaaggtccattgtacattggcaggacgatgaaaatttgaccaaagagcagatagaggcagagattaagaaaataaaagaagctaacgctgaagacgaaggtatgggtgccaataatcacggatgtaactcgtccaaaaagtgcaatatattgaaatacaacctgttcctgatttttttcttaattcttaattgctggctgttgccagtatttcctgtaaataatggtgaaatcctgataacacatgccatggaatcttggtaccttttgagtttcatgttttatcaattctgcaaaaacatgccatggaatcttggtggtagccttttgagtttcatgttttatcaattctgcaaaatgacattgatgtcatcatagctactagaaattttattgtttcacttcagtaatcttttatagaaatacacataccttgtttttaaatttcattacaatatgcattctttgatgtaacacttcacacattgttgatttcctctaactgcacagaaaccttatatgtggggggctaacctctagctgacttctgtgacccacctgtcagtggaaaaattagtggttttagtaagtgtgctgagtatttgttatggttttgacaagtatctgtagtttttttaaactttactgagaagaacgtaaatgcaaactatttatttatggaatataccttacaaattagaaatgctcaaatgcttcattttctaatcaatagctattcagtggacatattatgattttactatagggtacatttgcattatttgattttcaaagaatcatattcaattgtcatttaatgtttcagaatttcccgatgaggtggagacacccttagatgtcccagcaaaaaggcgatttgcaaaatacagagggctaaagtcatttaggacatcatcctgggatccaaaggtaagtgtgattgaattatctttagctgctgcagtttgaccttatgaatttcacgtgtcatttattatggttctttttcttcattttgtttctgtaggaatcactgccacaggattatgcaagaatatttgcattcgataactttacaagaacacaaaagcatgttcttgctaaaatggcagagcgagatgaaggaaccttgaaggattgtgctcaaagaggatcatttgtgaggctccatctgaaaaatgttcctactgagattgcctcaaaacttgttcatccatcaaggagattgcctgtggttgtttctggtcttcttcaacatgagtcaaaaatatcggttctccatttcaggtattcacctacccattgcactcaacaaattcgtgtgatctagttttaggctgtggtgtcatttccactactaaattgtgatgtactcctccgtcccaaaatatagtaacctagtactagattagacatggacccgccaagattcatagtattaggatatatctaatccagtcctaggttgctatattttgggacggatggagtagttgatgatatttggccaacttttagcatgtgttgtttctttactgtatatcagtaataagatttcttatgctctgtgattcatgccaaattggcaatcattgagagctgcatttcctttctcatccctggtagatcatatatggactataggtggagggtgaagaacctgagactgcatgagattaatcttcaatacttaattccaaaagactagccgaaaatctcttatgggcttgcacttaacaatccaatctgatagataataatcattctaatcaaatcctatgtctaaggaaacctccttccccaaatctggccatggtcttgtgtgccttaggcaccaccttggctgtctatgccccttccttggcctcagtggacctcggcctttggcccaattcccattacaataggctgacattattttggtgcagttcaatgcagatacatttgacggtgttgccacccagaatggtacaaaattagttttcttttctaaaaaaagaatttttcatgccgtggtattccaaaccatgacatcagcaaagtctgtaaaatgcatctgtaatcagtaattttaaaatctatttttatatatttgtagaaccgacacaactgttatgcatgaaagcagttttcaagagttgtgcatcttatttttatttgtccattattccaatctatatctatatttaaaagtgtattgatgctcaaagttctgaaagatgacttgactatgtccagagtatttcttttttttgactaaaaggagtaataatataatgctatcatgtgatcattcattacatttcctttttgctgcagcataaagaaacatgactcctatgaagctcctatcaaatcaaaggactccttaattttcaatgttgggttccggcagtttactgctaggtaggtagtggaagctcagtcatgctaatgcagaaaaaacagatgctcgtcttttcattgagaaatgtctcattggttatttatgaatctatcacaggccattgttttcaactgacaacatcaattgcaataagcataagatggagaggtttctacatcatgggcggttttctgttgcctctgtatatgctccaatttgctttcctccactccctcttattgttctaaagagcagagatggggagcagcctgccattgctgctgttggttcactgaaaagtgtggatccggaccggattattcttaagaaaattgttttgactgggtaagtttcgaattatcctttaataggcaaacagttctgcaattttcattttgcctttttggtccaataaatttatgttgatgtgctctatcgatattttctaggaaataattactgttggtggataaaaatttcttataataatgttcacacaatctatcttgttatttggaagaaaatatgacaatactgtttgcatcgaaaaagttatgtataacatccaatcacagtcttcaaataggtgctataacatcccatcatgtatagtcttcaaaagttgtttcgttattcgaaggaataatataatactgttcgcaacaaaatgtttgttgtcttacagctgtttgccagttgtttgtgttggtgaattaatgaaaagagagaacttaggattgaggacaagtgcttgtgctctgtaaggtggtatttgttgttctgacttggcagatttgccaaagtgggggagtggggatttctacaacaatttgtgccagtttgatttctcttttttcttgttctgacagagattatataatatctaggaaaacaaaatatcaactactcaggatttccaatcaaaatctgtacaaatttagctattgatatttatgatgaacatacaaaaatcattggtgtagatttgtcttgaaaaattcttttgcaatattatgattttagaatgttctatatttatatgtaattgaagttagttctcaaagttgtgttatgaagataatgttgatgcttaaagtgtcgattgtttgagtgttattctactacattatttgagaaagaggaaaagattagtcctttcttatgccggtcatgtttctgacttcacatctcatgcagttatcctcaacgggtctcaaaactgaaagcagtagtgcgatacatgttctacaatcctgaagatgtcaagtggtttaaggcaagtgttttacagctaattcatacactgctccatatatattcaacgtcaataacaccattgttttgcagcctgtagagttgtggacgaaacatggtcgacgtggccgaatcaaggagactgttggcactcatggtacgtttgctagacccatttcgacatgtctgatacatcgctgatccttcactcaccgtgctcttgcttaacaggtgctatgaaatgcatattcaatagcagcgtccagcagcatgataccgtgtgcatgagcctttacaaacgcgcttaccccaaatggccagaacagctctaccagatatgatcatatcagggtcatggatatgtgcttgcacgttggcatgtacgtctcaaagttttgacagattgagctcatcgatgtgcttcctgatgcagctcatatatgtatactagtgctagcagaaaaagaaacctcatgtcaacaacgacatgtagttagctgtattctgtatgttaacatttgttttacgttaacagctatgatttttgatttttgctgattttcggcgtgctttcatccgcatttgtgattgattgagccggtaattcaagctgcaatgttacaagatatcgtgttaaatgttacaggtgcaatcaggagctcacctgtaatccatgcccatgggtggtggttaaagagaaaccttatatggcataatatgttaaattgcttcc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001074260.1 RefSeq:Os11g0298400]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]]
| |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 11]] | |
| − | [[Category:Chromosome 11]]
| |
