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| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os12g0594200|
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| − | Description = Vacuolar protein sorting-associated protein family protein|
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| − | Version = NM_001073709.2 GI:297613454 GeneID:4352686|
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| − | Length = 18182 bp|
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| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os12g0594200, complete gene.|
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| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
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| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 12|Chromosome 12]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 12:25128901..25147082|
| + | |
| − | CDS = 25128901..25129184,25129447..25129534,25130045..25132278,25132622..25132736,25133229..25134026<br>,25134223..25134505,25134583..25135061,25135827..25135953,25136033..25136157<br>,25136271..25136808,25138941..25138996,25139084..25139301,25139925..25140322<br>,25140428..25140711,25140813..25140898,25140965..25141051,25141812..25142073<br>,25142164..25142241,25142386..25142586,25142661..25142737,25143599..25143839<br>,25143972..25144082,25144266..25144433,25144577..25144705,25144814..25144903<br>,25145017..25145123,25145216..25145364,25145667..25145749,25145832..25145927<br>,25146040..25146162,25146263..25146346,25146454..25146594,25146735..25147082<br>|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008405:25128901..25147082
| + | |
| − | source=RiceChromosome12
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008405:25128901..25147082
| + | |
| − | source=RiceChromosome12
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggtgctcgcggaggcggcgcgggcgcggctgctggcggcgctgcggccgtggctggcggcggagccacgggagctgcgggtggagctgggcctgctccgctcccgcgccgtcgcgcgcggggtggagctcgacgccgcggcgctcggtgatgccgtgccggggtccttcccggccagggtcgaccgcgtggccgtcgccgaggtcgagctcgtcgcctcgccctgggccgcccccgggctcgacgccgtcgtgcgcggcgtggacgtggcgctcaccctcagggagcctgctccgaagaagcaacggcccgacatcaaggagtggatctccaatgagaagaaaagagtaattgcagcaatggaccctcagggccaaatgttgcatgggaagattgaagatttagttagttctttggaagacaagtttacctcagtattttccactgcacttctaaactgtagtaaggttcggtttgatgatgtcacagtacaagtccgatatcttgatgattcccatcttgtcatattgaggacacatgacctacaatttggtcctgagcttgttttccgttgctctctgttcagaggattagttgggtcttatatgccatctagaaagaagaatcatatgtttgtcaaatgtgatcactttgagtttttgctgaaggggaatgatcatacagattgcactgtatctttgactgggacaactgcttctgttaggttagacaatctccatcttactgcttttggaattcatgttgccagtgcattctgggaaattgcacccaaatttattccatcattgatggtgatattggaaattacaagccaaaaggaagattatgaggttaggagtggtagagagctttggaaaatagctgcacaaaagcttgaaaactcaatagcatgtcgcagattttctttaaggaaggccatgagctgtgcctctttctggcagcactatgttcatacttatattttgttattatcattacttggatatccttctggcgaagttataaaaagaaactgcagtagggtacaaagcaccaggaaagtcagggaaactattagaaatcatttgaaaactgtcagtgaattagaggagaagatccctgtagaagctattgctagaggacgaagtgcagcacgttcaaaactaaccgtgtcacagcaacagagcgagcaagaattatcaaaagcacttttggtttcaaacacattgaaatttctctcacccttgttatatgtttggaagtttcttgtattcatatgctggtcactgtggagatttatgagctctagaagcagagggtgcaaatccagtgtgcaaaattttccttgtgcttctgatgattcagaaatcaaggtacagttcagcatctgccttggtgaactttctgtaacatttttacccctcagtgatcaccacttcactggtacaccaaagttaaataatgggaacaaggcttatcacattgacacaccttcagtacatcttgtaataaaatcatcatccatactttacacagatggtttcaccacacagtcattttttttcgtaattggtgaactgaaggcagacgtttctggtataccaaagttgttacaagcagccaatggcagcattactaggaggaattcatcttttggaacagaagagttttctgaagatattaattcaaagacaatactctggagtgactctgccagtatgcatccattttctggaaaacagcctgatgagtccttttcctacaatggtgattcatctattgcccttctacagagtgatatggaggaactgtggtccttctggacggtagtaagcactttctacaatgactcaggtgtgatgcatcatgaaaaaccttctgttatttttgaattcaaatcatttctcattgatccttacaaaagtacaagtggttttcagcaatgtagatttacagttgggagggtaaaccttgatgtggattatttatgtgcttcatcaacttatctcctctacaggcaatttgtgcactacaaagagctgaaagaactaactgaaaaatcagcagaattttcaaacagaagtgatagctgtgcgacacgtacaagtggaattgctgataaattgagatcattcaatcagagactgaagtttttgattgcagatgctattccaataaacacccttcagatttcagcactcattgcaggtccaagtatcaggttaatatttgataaaaacagcctgttgcaaaacagcaaaaataagcaagtccccctgttttctcagatgaataacacgtcatgcataactctcagccttgcgtatgttgaatgtgttatctggccagcatctctatcttctttaactcagaaagctgatttgcatgccaaagaatcacatgatacatttgatggagtggaggagcagctagagtctcatcgtttagcactggatagtgcaggacatgtttattcagggactgttgtgttggattcttgcttcaaatttgctgatttaactcttctagtggatcatatagaggcaaatcagcagtttcacatttttggaccaatgtcagccaatttccagctgtcaacaagcaggaagtatgccagttccttctttgtcaccagaaacattctctcaataaacttgggaggaaggattgttggttgtatggctttcttattcatggacgatctgtttcccattttccaggttatcaaaggcatgcaaatgttggcattgaattctgagttgggtgacattaagtattctcaatgttttattggaaggttagcatcgttttgcaacaggcatatggatggaagcacaatgggtactgctgttgagtatattatccatgaagaaacagttgactgttatacagaactcgtggctgagatgaaacttgatttggaaccaacacacatcatcgttagtgcttcacgcgatggacttatctttaatcctgctatgttctccaacagtgacataaactacatcagtagctcaactgtgtttgagggcgtagcagcactggaatctcttgacatattagctttaggtatttggttttccagcagaagctcttctctgaaacttctgcttgatggagaatgcacagacctccttgttaacttgtctggaattcagtctgtcgttttcgagaaccaacctcagatgagtatttgtgatgatatactacagtacagtaccgtgcttagcagctctccatatgacaagagtcagttcattttatcggattgtgtatttcatctgtgtgctggtcccaataaagacagcctgatgaatgataaaatgcaagttgaatctataagtggttgcagtaccgattcttcaggaatttattattttattgaacttgaatttactgaggtttatattggagactacaacatgcacaattttttaattgaagtcaataaaccaagcaaacagaaaattgctctgctcattcatgatgatcttcagattgtcaaatgcaaaatcaagggtggtttgatcttcctggaaacgttgtctctagctaagtttgttgtctgttgcaaaatttactttcggcttcttatggatctctcatcgtgggcagcttccaactcagtcaaagattcagttacttcagtatctgcaggaagtgagactactgtgaccaacagaccacatgtgtctagtggtgttcattcccaaagcgaggaatcacaattgggttccgtcaaatgtctagatgttgatttgtctcagttttctcttactcttgctattgcggatgaatctggtagataccagggattaacacttgaagttgatgcgattcttcaacaattgaatcttggcatgaagattttgtttgaagtgaagcgtatttcgatttccagtattagtatcatgcctaatactggccatgtcaaattgagagatgtgccagcaccccgttttcgatccagcaaatctcttgctcttccatcacagtcagaaatccaagaatatcttcccttcctagaagcagataatgtgcttacttatgatcatgatgctccttcaagctcaaattctacagtggaaagttcgacaggcaacccaccactagaactttcttcacacaagagttacatccttaggcatttcgctacttatctgaagcttgagaaaaaagaattgaatggcgactctaatctgatgcgctcaagtggcgattggtttggaaacggttctgtttctggtttggaggtgacaatgtcactctcaagcatcgagatgatattgtctttattcgctccatttcatgagattctgaggtctggctcaactcagaaggaaatacagactggtgacactcctcaccaggaattgctggacaatagggattatactatacctgatggagcaattgtggccatacgggacctcgatcaacagatgtatgtatcaataaaaaacactggaaagaagtaccaagtggttggcacataccattattctctttctagtgaatgtgcattatttaaggtgaaacaccataagggatggagatcagatacaccatgcatttctcttttatctttatatgcaaaaactgatgaaggcaaagaactggctcttagtttctctcatggatcagatttggttgaagtttcttcatctgttgacaagccttcttcactttggaccacatctcctcttaggtttgatggatttgaggatgatggtgatgatggtaaatattgcaagattatttcaagaagttctaaccaccttgtcaacaagaaaagcaattatggcattgcatttaatgatggcttactggaatttgttagaaagccaggaaatccatttaaagtgaaggttttggatgaatcccttttttctgatgttgcaaggccctttgtacccaatgtgaacttggacaataacacttacttagatgttgaaaatgaattgccttttggcatgggggatagcttggaaactggtgtgagttcacaacatgtaatcatcagtatcgataagatcgtttttaccatcacccatgaggttcttgatactgattcaagaagcttctctggaccatttgttgtggtcaaggtctcccagaactctgaggaaggcttatccctttcagttcaacctttgttgaggatctataataagagtgacttcccccttgaacttcggtttcagaggccacagaaatcaagcgaggaagcggcatttgtcacagttagaagtggagacatggttgatgaatctactggagtatttgactctatggatttatctggaggatccaaaagagcattaatgtctctagctcttggcaaacctgagatttctgaacattctggaaattttggtccgacaactctagtgaaatggtcagaggacattactggtgaaaaagctgtccgcatatctggtgttatggaaaagcttaattataacataagaagagccttcagtattgattccatgaagtcttctttcagctctttgagttgcgatgtttctatcgatggccaacatgtgacagctcttcatttcttagttcatactctaagtagagaggtccctttgcatcctacaaatggaagtcctgtatttgacaggaacgcaacagttgcatttcagttacagagagaaatttttatttacccaactgttcaagtgtataatttcttgcagacagacatacatgtgattctgaccgactgtgaaccagaaaataccagagatgataactttgatattattggcaagcaggcaacaatcacaagtggttcaagtgcttatttatatgtgaatcctgccatgtttactttttcagtcaaactaatatcatacggttcaaagtccaaggcagttaatactagtgattgggttaagagaatgcaaaagcagataagtcgagctcaatttcttgatatggagctagaatttgttattgggactgggagattccattcttctttgagattattacgccaggagaaaggcttcttggaggttgcagtgttcacaagatacacactacataataccagtgactaccctttgttgtgcacagctccccacaaaaaatcactacctatgtctggaactgtaaaggaaaccattaaccttcctcctcaggatggctgtattctggcctcaatgtcaatgagctcctggtttacaaggtcaagtaaactgcgaataggcctacaacatgagaaaggatcagaagcttttattgatttggaagcattgtctggcttcactgaattttctctggagatccatgataatatattgcctcgtagaatggcaacatttggcatgtatttacaacctgtcctgtatgacttgcctgtgccatcacaagttgtattaattgttccaagatatgttttttcaaatgagtctgctactgcagttgctgttcgccaatgtttcgttgaggatgatatagatggagtgacaatcgaagcaaagcagagggctaccttacatacatggaaacctgaaaaaaggcgagaatttagaagatcacaaggcacggtgacagatgatatgaaaaggggtaccttacaagatgggaagtggaagcagtttgcttctgttgacgtcatacaagaaactgcttcttttgttctacacttcagtaagcccccaaaggctgcactaccatatcggatagagaattgtttgaatgaagcatctatcatgtatttccagaaggattcagttgaatcggatgtattacaccctcaagagtcagaacaatatacatgggatgacttaagcttaccccgcaagcttaatattgattcctcattcaataatggactaagttcaggaaaacaaagatttgatgaatcatttggactgagggtgtttaagattggctatgaagtgtatgctgatggtttaactagagttctacggatatgtgaacacaaagacaatcctaaagctgataacattgaacaccctatagcaaatgtacagttcagaatgacttatatgtgtattcatctccttgagaagggccagcagggtgaggaaaagggccaatcaccatctgcaatcttagcagcaagattccagcacatatctgctgactcagttatcacagatagatacaggcacatctctcttgcaattcactcagttaacttggatgaaaaatgggaaggagcttcatttgggtcaattcttagaaggaacaagcttcaggatgctactctcagtgaaaatattcttcgcataatcattaagctgaattcgaccaactcaagtgtcaaacaagtccaatattgttccataattctacagcctattgacctgaaggttgatgaggaaacactaatgaagattgtgccattttggagaacatcccttgctcctcctggaacgccaagcacacaattttactttaggcattttgaagtacatccaattaagattatcgcaagctttcgacctggaagtccatacacaacttatagttctgctcaagaggctctgagagcattattgcatagtgttataaaggtgcctgagattagcagttcagccgtggagctcaatggtgttctcctaaatcatgctttggttactttccgtgagctatttctgaaatgtgcccagcattattcatggtatgtcttgagggcaatctatgtaacaaagggaagctcattgcttcctccatcttttgcctcaattttcgatgactctgcttcttcagttattgatgttttctttgacccttctgatggctcactcaaccttcctgggcttaccataggcatgtttaagtttataagcaaaaatatgaaatcaggcggtttttcaggaacaaagcgataccttggtgatcttggaaaaactgttaaaactgcaagttcaaatgcactattcgctgctgtaacagaaatttcagatagcattgtgagaggcgcagaagccaatggttttaatggcatggttactggcttccaccaaggtattttaaggttggcaatggagccatcagtattaggacaggctatattggagggtggtcctgacagaaagatcaaacttgaccatagtcctggacttgatgagctatacatcgaaggatacctacaagccatgcttgatgtcatgtacaaacaagaatatcttcgcatcagggtgattgatgaccaggttattctaaagaatctgccaccaaatagtgctctcataaatgaaatcgtcgacaacgtaaaaagctttcttgtgagcaagggattattgaaaggagattcttccacaatccgacccttgcgacatctacgaaatgaacctgagtggaggattgcgccgacggtgctcaccctcgcagagcacctgttcgtgagcttcgccgtgcgcgtgctgcaccgggaggccaccaaggccatcgccggagtcgtctcaaaggcgaagagaccagccggaggcggcgaagacgacggcaagggcgagtcgccgtcgtcgtcgtccgtgggagtcctcgcgaggcggagcagggtgtggagcgtggggaggttcgccgtctccggcatggtcgcctacgtcgacggccggctctgccgccacatacccaaccccatcgccaggagaatcgtcagcggcttcctcttgagcttcattgacagcagagacaacgactag</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MVLAEAARARLLAALRPWLAAEPRELRVELGLLRSRAVARGVEL DAAALGDAVPGSFPARVDRVAVAEVELVASPWAAPGLDAVVRGVDVALTLREPAPKKQ RPDIKEWISNEKKRVIAAMDPQGQMLHGKIEDLVSSLEDKFTSVFSTALLNCSKVRFD DVTVQVRYLDDSHLVILRTHDLQFGPELVFRCSLFRGLVGSYMPSRKKNHMFVKCDHF EFLLKGNDHTDCTVSLTGTTASVRLDNLHLTAFGIHVASAFWEIAPKFIPSLMVILEI TSQKEDYEVRSGRELWKIAAQKLENSIACRRFSLRKAMSCASFWQHYVHTYILLLSLL GYPSGEVIKRNCSRVQSTRKVRETIRNHLKTVSELEEKIPVEAIARGRSAARSKLTVS QQQSEQELSKALLVSNTLKFLSPLLYVWKFLVFICWSLWRFMSSRSRGCKSSVQNFPC ASDDSEIKVQFSICLGELSVTFLPLSDHHFTGTPKLNNGNKAYHIDTPSVHLVIKSSS ILYTDGFTTQSFFFVIGELKADVSGIPKLLQAANGSITRRNSSFGTEEFSEDINSKTI LWSDSASMHPFSGKQPDESFSYNGDSSIALLQSDMEELWSFWTVVSTFYNDSGVMHHE KPSVIFEFKSFLIDPYKSTSGFQQCRFTVGRVNLDVDYLCASSTYLLYRQFVHYKELK ELTEKSAEFSNRSDSCATRTSGIADKLRSFNQRLKFLIADAIPINTLQISALIAGPSI RLIFDKNSLLQNSKNKQVPLFSQMNNTSCITLSLAYVECVIWPASLSSLTQKADLHAK ESHDTFDGVEEQLESHRLALDSAGHVYSGTVVLDSCFKFADLTLLVDHIEANQQFHIF GPMSANFQLSTSRKYASSFFVTRNILSINLGGRIVGCMAFLFMDDLFPIFQVIKGMQM LALNSELGDIKYSQCFIGRLASFCNRHMDGSTMGTAVEYIIHEETVDCYTELVAEMKL DLEPTHIIVSASRDGLIFNPAMFSNSDINYISSSTVFEGVAALESLDILALGIWFSSR SSSLKLLLDGECTDLLVNLSGIQSVVFENQPQMSICDDILQYSTVLSSSPYDKSQFIL SDCVFHLCAGPNKDSLMNDKMQVESISGCSTDSSGIYYFIELEFTEVYIGDYNMHNFL IEVNKPSKQKIALLIHDDLQIVKCKIKGGLIFLETLSLAKFVVCCKIYFRLLMDLSSW AASNSVKDSVTSVSAGSETTVTNRPHVSSGVHSQSEESQLGSVKCLDVDLSQFSLTLA IADESGRYQGLTLEVDAILQQLNLGMKILFEVKRISISSISIMPNTGHVKLRDVPAPR FRSSKSLALPSQSEIQEYLPFLEADNVLTYDHDAPSSSNSTVESSTGNPPLELSSHKS YILRHFATYLKLEKKELNGDSNLMRSSGDWFGNGSVSGLEVTMSLSSIEMILSLFAPF HEILRSGSTQKEIQTGDTPHQELLDNRDYTIPDGAIVAIRDLDQQMYVSIKNTGKKYQ VVGTYHYSLSSECALFKVKHHKGWRSDTPCISLLSLYAKTDEGKELALSFSHGSDLVE VSSSVDKPSSLWTTSPLRFDGFEDDGDDGKYCKIISRSSNHLVNKKSNYGIAFNDGLL EFVRKPGNPFKVKVLDESLFSDVARPFVPNVNLDNNTYLDVENELPFGMGDSLETGVS SQHVIISIDKIVFTITHEVLDTDSRSFSGPFVVVKVSQNSEEGLSLSVQPLLRIYNKS DFPLELRFQRPQKSSEEAAFVTVRSGDMVDESTGVFDSMDLSGGSKRALMSLALGKPE ISEHSGNFGPTTLVKWSEDITGEKAVRISGVMEKLNYNIRRAFSIDSMKSSFSSLSCD VSIDGQHVTALHFLVHTLSREVPLHPTNGSPVFDRNATVAFQLQREIFIYPTVQVYNF LQTDIHVILTDCEPENTRDDNFDIIGKQATITSGSSAYLYVNPAMFTFSVKLISYGSK SKAVNTSDWVKRMQKQISRAQFLDMELEFVIGTGRFHSSLRLLRQEKGFLEVAVFTRY TLHNTSDYPLLCTAPHKKSLPMSGTVKETINLPPQDGCILASMSMSSWFTRSSKLRIG LQHEKGSEAFIDLEALSGFTEFSLEIHDNILPRRMATFGMYLQPVLYDLPVPSQVVLI VPRYVFSNESATAVAVRQCFVEDDIDGVTIEAKQRATLHTWKPEKRREFRRSQGTVTD DMKRGTLQDGKWKQFASVDVIQETASFVLHFSKPPKAALPYRIENCLNEASIMYFQKD SVESDVLHPQESEQYTWDDLSLPRKLNIDSSFNNGLSSGKQRFDESFGLRVFKIGYEV YADGLTRVLRICEHKDNPKADNIEHPIANVQFRMTYMCIHLLEKGQQGEEKGQSPSAI LAARFQHISADSVITDRYRHISLAIHSVNLDEKWEGASFGSILRRNKLQDATLSENIL RIIIKLNSTNSSVKQVQYCSIILQPIDLKVDEETLMKIVPFWRTSLAPPGTPSTQFYF RHFEVHPIKIIASFRPGSPYTTYSSAQEALRALLHSVIKVPEISSSAVELNGVLLNHA LVTFRELFLKCAQHYSWYVLRAIYVTKGSSLLPPSFASIFDDSASSVIDVFFDPSDGS LNLPGLTIGMFKFISKNMKSGGFSGTKRYLGDLGKTVKTASSNALFAAVTEISDSIVR GAEANGFNGMVTGFHQGILRLAMEPSVLGQAILEGGPDRKIKLDHSPGLDELYIEGYL QAMLDVMYKQEYLRIRVIDDQVILKNLPPNSALINEIVDNVKSFLVSKGLLKGDSSTI RPLRHLRNEPEWRIAPTVLTLAEHLFVSFAVRVLHREATKAIAGVVSKAKRPAGGGED DGKGESPSSSSVGVLARRSRVWSVGRFAVSGMVAYVDGRLCRHIPNPIARRIVSGFLL SFIDSRDND</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 12]] |
| − | DNA = 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