Difference between revisions of "BGIOSGA014328"
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Latest revision as of 15:55, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA014328 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014328, complete gene. |
| LocusTag |
OS04G0620000 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014328-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014328-PA |
| Length |
11042 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:30515270..30526311 |
| Sequence Coding Region |
30525982..30526311,30525676..30525857,30525521..30525560,30525288..30525447,30525043..30525157 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:30515270..30526311 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:30515270..30526311 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGTTTTGATCCACTGGAATGGTACTGCCAGCCGGTCAATGGCGGGGTGTGGTCAGATGTAGAGAATGCTTTTGGTGCATACACACCATGTGGCACTGAAACCTTGGTGGTGTGCATCTCATACTTTGCACTCTTCGGTGTTTGCTTCTATCGGATATGGAGGACGACGAGGGACTACACGGTGCAGCGCTACAAATTGCGGTCGCCATACTACAACTATATGCTCGGCCTGCTTGTGGTGTTGTGCATAGCTGAATCACTGTATCGGATCGCTACTGGCACCTCCATAATGAACTTGGATGGGGAGACTAGCCTTGCTCCATTTGAGGTTACCTCATCTATCATTGAGATTGCTGCTTGGTGTTGTATGCTTGTAATGATTGCACTCGAGACAAGAATTTACATCTATGAGTTTAGATGGTACATCCGGTTTGTGGTCATTTACATCTTGGTTGGGGAAGCTGCTATGTTCAATCTTGTGCTTTCAGTAAGGCAGTATTATAGTTCGAGTTCAATATTTTACTTGTACTGCAGTGAGATAATATTCAAGCTCTTGTTTGGAATTCTCATGGTGGTTTATCTGCCTAGCTTGGATTCCTATCCGGGTTATACTCCAGTCAGGCATGAGGCACTTGTTGATAATACTGATTACGAACCTCTGCCTGGTGGGGAGCAGATTTGCCCTGAGAGGCATGCTAATATATTTTCCAGGATATTCTTTTCATGGATGACTCCTCTAATGCAACAAGGATTTAAAAGGCCCATCACCGATAAGGATATTTGGAAATTAGACAGTTGGGATGAGACTGAAACATTGTACAACCAGTTCCAAAAATGCTGGAACAATGAGCTTCAAAAACCAAAGCCTTGGCTGTTACGGGCTCTGCATAGCAGCCTTGGTGGAAGGTTTTGGCTAGGAGGATTTTTTAAGATTGGCAATGATGCTTCTCAGTTTGTTGGCCCACTCATATTGAACCTCTTGTTGGAGTCTATGCAAAAAGGTGATCCATCTTGGAGCGGTTACATCTATGCTTTCTCAATCTTCGCTGGAGTGTCACTGGGTGTTCTTTCTGAAGCACAGTACTTTCAGAATGTCATGCGAACGGGTTTCAGGTTGAGGTCAACATTGATCGCAGCTGTTTTCCGTAAGTCTTTGCGACTAACTAATGATAGTCGAAAGAAGTTTGCCTCTGGGAGGATAACCAATTTGATTTCAACTGACGCAGAATCTCTTCAGCAAGTGTGCCAGCAACTTCACAGTCTATGGTCTGCTCCTTTCCGCATTGTTATTGCCATGGTCCTTCTATACGCACAACTAGGCCCTGCTGCATTGGTCGGTGCAGCCATGTTGGTTCTTTTGTTCCCAATTCAGACTGTTATCATAAGCAAAATGCAAAAACTTACCAAGGAAGGGTTGCAAAGGACTGACAGGAGAATCAGTCTAATGAATGAAATATTAGCTGCAATGGATACGGTCAAATGTTATGCTTGGGAGCAAAGTTTCCAGTCAAAAGTGCAGGACATCCGTGATGATGAAATTTCATGGTTCCGCAGCGCTCAATTGCTTGCTGCGCTGAATAGCTTCATCCTAAACAGTATCCCCGTTATTGTCACTGTGGTTTCATTTGGTGTATACTCTCTGCTGGGAGGTGACTTGACACCAGCAAAGGCGTTCACATCACTTTCACTGTTTGCTGTCTTAAGATTTCCACTTTTTATGCTGCCAAATCTGATAACTCAGGTGGTTAATTGTAAAGTGTCATTGAAACGTCTGGAAGATCTCCTCTTGGCTGAAGAGAGATTACTTCTGCCCAATCCACCTCTTGATCCTGAGCTTCCAGCAATTTCTATTAAGAATGGATATTTTTCATGGGAATCGCAGGCTGAGAGACCAACATTATCAAACGTCAATCTGGATGTACCTATGGGCAGTTTGGTTGCAATAGTAGGAAGCACTGGGGAGGGGAAGACTTCTCTTATTTCTGCAATGCTTGGTGAAATACCACCAGTGTCAGGATCGAATACATCGGTGGTCCTTCGTGGAACAGTGGCTTATGTTCCTCAAGTTTCATGGATCTTCAATGCAACTGTCCGGGACAATATATTGTTTGGGTCTCCCTTCCAACCTCCACGCTACGAGAAAGCAATAGATGTCACTTCATTACGGCATGACCTTGACTTACTCCCAGGTGGTGACCTAACAGAGATTGGAGAAAGAGGAGTTAACATTAGTGGGGGACAAAAACAGAGAGTCTCAATGGCAAGAGCTGTTTATTCTGATTCAGATGTCTACATATTTGATGATCCACTGAGTGCATTAGATGCCCATGTTGGTCGACAGATAGGCACACTTTCTGGTTGTTATAGAGTAATTGCGTCGATAAGATATGGTACACCATTTGTCACGGTATTTGACAAATGTATTAAAGAAGAGCTACAGCACAAAACTAGGGTTCTTGTTACCAATCAGCTGCATTTTCTACCATATGTGGATAAAATACTGGTAGTCCATGATGGTGTAATTAAAGAAGAAGGTACCTTTGATGAACTTAGCAACTCTGGGGAACTCTTTAAGAAGCTCATGGAAAATGCTGGAAAGATGGAAGAACAGATGGAAGAGAAACAGGACGAAAGCAAAAGACAGGATGACATAAAACACCCTGAAAATGGGGGCAGTGTAATAGCTGATGGTGATATGCAGAAGAGTCAGGACACTTCTAATAAAACAAAACAGGGGAAATCTGTTCTGATTAAACAAGAAGAAAGGGAAACTGGAGTTATAAGTGCAAAGGTCCTTTCACGCTACAAAAATGCATTGGGAGGGATCTGGGTGGTATCTGTTCTCTTTTTTTGCTATGCACTCACTGAAGTTCTTCGCATTTCAAGTAGCACATGGTTGAGCGTTTGGACAGATCAAGGTTCTACGAAAATCCATGGCCCTGGTTACTACAATTTAATCTACGGCCTTCTTTCTTTTGGGCAGGTTCTAGTCACTCTAACGAATTCTTATTGGCTGATCACATCAAGTCTTCGAGCAGCCAAGAGGTTGCATGATGCCATGCTCCGGTCTATATTAAGAGCTCCCATGGTATTTTTTCACACCAATCCACTTGGACGAATCATCAACAGATTTTCAAAGGATTTGGGTGACATTGACAGGAATGTAGCCATCTTTGTGAATATGTTTATGGCACAAATATCTCAGTTGCTCTCAACATTTGTTCTCATTGGCATTGTTAGCACTATGTCTCTGTGGGCTATCATGCCACTTCTGATTTTATTTTATGCAGCTTACCTCTATTACCAGACTACGTCTCGTGAGGTAAAGCGCCTGGATTCCATTACAAGGTCTCCTGTGTATGCTCAATTTTCAGAGGCATTGAATGGTCTGTCTACAATCCGTGCCTACAAAGCCTATGATAGAATGGCAAACATCAATGGGAAATCAATGGACAACAACATCAGATTCACTCTTGTGAACATGAGTTCAAACAGATGGCTAGCCATCCGTCTGGAAACATTGGGTGGCATCATGATATGGTTCACAGCAACATTTGCTGTCATGCAAAACCAACGAGCAGAAAATCAAAAGGCTTTTGCCTCCACAATGGGTCTTCTTCTTACTTACACCCTCAATATCACCAATTTGCTCACGGCTGTTCTTCGTCTTGCTAGTCTGGCTGAAAACAGTTTAAATGCTGTTGAGCGGGTAGGAACATACATTGAGTTGCCTTCTGAGGCTCCTCCTGTCATTGAGGATAGCAGGCCACCTCCTGGTTGGCCATCATCTGGTGTTGTCAAGTTTGAAGACGTCGTGCTTCGGTACCGACCAGAACTTCCTCCTGTTCTTCATGGCATATCTTTCATCATTAATGGCAGCGAAAAGGTAGGAATAGTTGGCAGAACAGGAGCTGGTAAATCTAGCATGCTGAATGCTCTGTTCCGTATTGTGGAACTGGAACGAGGGAGAATATTGGTTGATGATTGTGACACTTCTAAATTTGGAATTTGGGACCTACGAAAAGTACTAGGAATAATACCACAGGCACCTGTCCTATTTTCAGGTTCTGTTCGATTTAATCTGGATCCTTTTAATGAGCACAATGATGCGGATCTCTGGGAAGCGCTTGAAAGGGCTCATCTAAAAGATGTCATAAGGAGGAATGCTCTGGGACTAGATGCTGAGGTCTCTGAGGCTGGTGAAAATTTTAGCGTTGGACAGCGGCAGCTACTGAGTTTAGCTCGTGCATTGCTGCGGAGGGCAAAGATACTTGTTCTTGATGAGGCAACAGCAGCTGTTGATGTTCGAACGGATGCTCTTATACAGAAGACAATCAGGGAAGAATTCAAGAGTTGTACAATGCTTATAATTGCTCACCGCCTGAACACTGTTATTGACTGTGACAGGTTGCTTATTCTAAGTGCTGGGAAGGTTTTGGAGTTCGACTCTCCTGAGAATCTTTTGAGCAATGAGCACAGTGCTTTCTCCAAGATGGTTCAGAGTACAGGACCTAGCAATGCAGAGTACCTGAAGACTCTTGTATTTGGGGATGGTGAGGAGAGGTTGCGAAAGGAAGAAAGCAAGATGCAAGATATCCAGAGGAAGTGGGTAGCATCTAACCGATGGGCTGTTGCTGCGCAGTTTGCGCTTGCCGCTAGCCTTGCCTCTTCACACAGTGACCTTCTTGCACTGGAGGCTGCTGAGGGAAACAACATCCTCAGGAAAACAAAGGATGCAGTAATCACTCTACAGAATGTCCTCGAAGGGAAGCACAACACCGAAATTGATGATACACTCGCTCAGTATGAGGTTCCATCTGATAGGTGGTGGTCATCGCTATACAAAGTCATGGAAGGACTTGCCATGATGAGCCGATTGGGTCGCAACCGTCTACAGCAACCAAGTTATAATTTTGAAAACAACAGTTCTATTGACTGGGACCAAATGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGFDPLEWYCQPVNGGVWSDVENAFGAYTPCGTETLVVCISYFALFGVCFYRIWRTTRDYTVQRYKLRSPYYNYMLGLLVVLCIAESLYRIATGTSIMNLDGETSLAPFEVTSSIIEIAAWCCMLVMIALETRIYIYEFRWYIRFVVIYILVGEAAMFNLVLSVRQYYSSSSIFYLYCSEIIFKLLFGILMVVYLPSLDSYPGYTPVRHEALVDNTDYEPLPGGEQICPERHANIFSRIFFSWMTPLMQQGFKRPITDKDIWKLDSWDETETLYNQFQKCWNNELQKPKPWLLRALHSSLGGRFWLGGFFKIGNDASQFVGPLILNLLLESMQKGDPSWSGYIYAFSIFAGVSLGVLSEAQYFQNVMRTGFRLRSTLIAAVFRKSLRLTNDSRKKFASGRITNLISTDAESLQQVCQQLHSLWSAPFRIVIAMVLLYAQLGPAALVGAAMLVLLFPIQTVIISKMQKLTKEGLQRTDRRISLMNEILAAMDTVKCYAWEQSFQSKVQDIRDDEISWFRSAQLLAALNSFILNSIPVIVTVVSFGVYSLLGGDLTPAKAFTSLSLFAVLRFPLFMLPNLITQVVNCKVSLKRLEDLLLAEERLLLPNPPLDPELPAISIKNGYFSWESQAERPTLSNVNLDVPMGSLVAIVGSTGEGKTSLISAMLGEIPPVSGSNTSVVLRGTVAYVPQVSWIFNATVRDNILFGSPFQPPRYEKAIDVTSLRHDLDLLPGGDLTEIGERGVNISGGQKQRVSMARAVYSDSDVYIFDDPLSALDAHVGRQIGTLSGCYRVIASIRYGTPFVTVFDKCIKEELQHKTRVLVTNQLHFLPYVDKILVVHDGVIKEEGTFDELSNSGELFKKLMENAGKMEEQMEEKQDESKRQDDIKHPENGGSVIADGDMQKSQDTSNKTKQGKSVLIKQEERETGVISAKVLSRYKNALGGIWVVSVLFFCYALTEVLRISSSTWLSVWTDQGSTKIHGPGYYNLIYGLLSFGQVLVTLTNSYWLITSSLRAAKRLHDAMLRSILRAPMVFFHTNPLGRIINRFSKDLGDIDRNVAIFVNMFMAQISQLLSTFVLIGIVSTMSLWAIMPLLILFYAAYLYYQTTSREVKRLDSITRSPVYAQFSEALNGLSTIRAYKAYDRMANINGKSMDNNIRFTLVNMSSNRWLAIRLETLGGIMIWFTATFAVMQNQRAENQKAFASTMGLLLTYTLNITNLLTAVLRLASLAENSLNAVERVGTYIELPSEAPPVIEDSRPPPGWPSSGVVKFEDVVLRYRPELPPVLHGISFIINGSEKVGIVGRTGAGKSSMLNALFRIVELERGRILVDDCDTSKFGIWDLRKVLGIIPQAPVLFSGSVRFNLDPFNEHNDADLWEALERAHLKDVIRRNALGLDAEVSEAGENFSVGQRQLLSLARALLRRAKILVLDEATAAVDVRTDALIQKTIREEFKSCTMLIIAHRLNTVIDCDRLLILSAGKVLEFDSPENLLSNEHSAFSKMVQSTGPSNAEYLKTLVFGDGEERLRKEESKMQDIQRKWVASNRWAVAAQFALAASLASSHSDLLALEAAEGNNILRKTKDAVITLQNVLEGKHNTEIDDTLAQYEVPSDRWWSSLYKVMEGLAMMSRLGRNRLQQPSYNFENNSSIDWDQM</aaseq> |
| Gene Sequence |
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