|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{IndicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Indica Group]][[Category:Indica Chromosome 1]] |
| − | GeneName = BGIOSGA005122|
| |
| − | Description = Putative uncharacterized protein|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA005122, complete gene.|
| |
| − | tag = OsI_05095|
| |
| − | tid = BGIOSGA005122-TA|
| |
| − | pid = BGIOSGA005122-PA|
| |
| − | Length = 5058|
| |
| − | Source = Oryza sativa Indica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Indica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Indica Chromosome 1|Chromosome 1]]|
| |
| − | AP = Chromosome 1:45005085..45010142|
| |
| − | CDS = 45005085..45005126,45006134..45006371,45006589..45006837,45006944..45006994,45007568..45007828<br>,45007946..45007998,45008477..45008591,45008674..45008928,45009055..45010142<br>|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=IndicaChromosome01:45005085..45010142
| |
| − | source=RiceIndica01
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=IndicaChromosome01:45005085..45010142
| |
| − | source=RiceIndica01
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>ATGGACGCCGAGGCCGGCGTCGGCGGCGCCGACCAGCTGCCGTGGAGGCAACACTACAGGAATTTACTGCTTTTAGCATACCAGAGTTTTGGTGTTGTTTATGGGGACCTAAGCACATCACCTCTTTACGTTTATAAAAGTACATTCTCAGGAAGACTACGTCGATATCAAGATGAGCAAACAGTCTTTGGTGTTCTTGCCTTGATATTTTGGACCTTCACACTTATTCCTTTGCTGAAGTATGTCACTATTGTATTAAGTGCTGATGACAATGGTGAAGGTGGGCCGTTTGCTCTTTATTCGCTGCTTTGCAGGCATGCGAAACTTAGTTTTCTTCCAAATCAACAATCAGCAGATGAAGAGCTATCGACATACTACAGAAATGGTTTTACTTCACGTCATGGATCTTTACCTTGGCTAAGAAGGTTCATGGAGAAGCACAAGAATGCCAGAACCGTGCTTCTCCTCATAGTTCTGTGCGGTGCTAGCATGATGATTGGTGATGGTATCCTTACTCCAGCAATCTCAGTTCTGTCATCTATGTCTGGATTGAAAGTTCGAGCTACTGGTTTACATGATCGTTCTGTTGTACTCCTTTCATGCATTGTGTTGGTTGGTCTATTTGCATTGCAACACCGAGGTACTCAGAAGGTAGCGTTCATGTTTGCACCAATTGTCGTCATCTGGCTCTTTTGCATTGGTGGAATTGGTTTATACAACATAATACATTGGAACCCAAGGATATACCAAGCTCTCTCTCCATATTATATTGTTAAGTTCTTTAGGACGACAGGTAAAGATGGTTGGATTGCTCTAGGAGGCATACTTCTTTCTATGACAGGCTGTGAAGCTATGTTTGCCGACCTTGGTCACTTCACGAGTGCATCTGTCAGGCTAGCTTTTATCACCATCATATACCCATGTCTTATATTACAATATATGGGTCAGGCGGCATTTCTGTCAAAAAATATCCTTGACATGCCCACAGGTTTTTATGATTCTATCCCAGGACCTATATTTTGGCCTGTGTTTGTGGTGGCCACTCTCGCTGCTGTTGTTGGTAGCCAAGCTGTCATTTCAGCAACATTCTCTATTGTGAAGCAGTGCCATTCGTTGGGATGTTTCCCTCGAGTGAAGGTTGTCCACACATCAAGGTGGATCTATGGACAGATATACATTCCTGAAATAAATTGGATCCTTATGGTGCTCTGTGTAGCTGTCACAGTTGCATTCCGTGATATTACACTTATTGGTAATGCCTATGGTGTTGCGTGCATGACTGTTATGTTTGTCACTACATTCTTGATGGCATTGATCATGATCTTCGTTTGGCAAAAGAACATAATATTTGCTCTATCTTTCTTTTTATTATTCGGATCCGTTGAAGTTGTTTATCTCTCCTCATCCCTCATGAAGGTTACTCAGGGAGGATGGGTGCCGCTTGTGCTTGCTTTAATATTCATGTCTGTCATGTATATTTGGCACTATGGGACAAGGAAGAAGTACCAGTATGATCTTCAGAATAAGGTAGCAATGAGATATATCCTGTCCCTGGGTCCAAGCCTTGACGTAGTTCGTGTCCCAGGAATTGGTCTGATTTACACAGAACTGGTGACTGGTGTACCCAACATCTTCACACATTTCACTACTAATCTCCCTGCCTTTCATGAAGTCCTAGTCTTTCTTTGTGTCAAGTCAGTACCAGTACCATATGTGTCACCAGATGAACGATACCTTGTGGGCAGGATTGGACCTAGAGCATATCGGATGTACCGCTGCATTGTTAGGTATGGTTACAAAGATGTTCAGAGAGATGATGACAATTTTGAGAACATGTTAGTTATGAACATTGGGAAGTTCATTATGATGGAAGCTGAGGATGCATCTTCTTCAGCAAGTTATGATACTGCCAATGAAGGACGAATGGCCGTCATAACAACATCTGATGACTATGACTCTCCACTAGCTGTGAGAGATTCCAATGACCTAGCTGACTCCATGACGACGAGGAGCACTAAATCAGAGAGTCTTCGAAGCTTGCAATCCTCTTATGAGCAGGAATCACCTAATGTGAGCCGGAGGCGACGTGTTCGCTTTGAGCTGCCAGAGGAGGATGACATGGATCAACAGGTTAAAGATGAGCTGTTAGCACTTGTGGAGGCAAAACATACAGGGGTAACCTACGTCATGGGGCATGTCTATATCAAAGCTAGGAAGAACTCTAGTTTTTTTAAGAGATTTGCAATTGATGTTGGCTACTCTTTCCTCCGGAAGAACTGCAGAGGTCCATCGGTCACACTGCACATTCCACATATTAGTCTGATAGAAGTTGGAATGGCGTACCAAGTGTAG</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MDAEAGVGGADQLPWRQHYRNLLLLAYQSFGVVYGDLSTSPLYVYKSTFSGRLRRYQDEQTVFGVLALIFWTFTLIPLLKYVTIVLSADDNGEGGPFALYSLLCRHAKLSFLPNQQSADEELSTYYRNGFTSRHGSLPWLRRFMEKHKNARTVLLLIVLCGASMMIGDGILTPAISVLSSMSGLKVRATGLHDRSVVLLSCIVLVGLFALQHRGTQKVAFMFAPIVVIWLFCIGGIGLYNIIHWNPRIYQALSPYYIVKFFRTTGKDGWIALGGILLSMTGCEAMFADLGHFTSASVRLAFITIIYPCLILQYMGQAAFLSKNILDMPTGFYDSIPGPIFWPVFVVATLAAVVGSQAVISATFSIVKQCHSLGCFPRVKVVHTSRWIYGQIYIPEINWILMVLCVAVTVAFRDITLIGNAYGVACMTVMFVTTFLMALIMIFVWQKNIIFALSFFLLFGSVEVVYLSSSLMKVTQGGWVPLVLALIFMSVMYIWHYGTRKKYQYDLQNKVAMRYILSLGPSLDVVRVPGIGLIYTELVTGVPNIFTHFTTNLPAFHEVLVFLCVKSVPVPYVSPDERYLVGRIGPRAYRMYRCIVRYGYKDVQRDDDNFENMLVMNIGKFIMMEAEDASSSASYDTANEGRMAVITTSDDYDSPLAVRDSNDLADSMTTRSTKSESLRSLQSSYEQESPNVSRRRRVRFELPEEDDMDQQVKDELLALVEAKHTGVTYVMGHVYIKARKNSSFFKRFAIDVGYSFLRKNCRGPSVTLHIPHISLIEVGMAYQV</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>1..42#1050..1287#1505..1753#1860..1910#2484..2744#2862..2914#3393..3507#3590..3844#3971..5058#ATGGACGCCGAGGCCGGCGTCGGCGGCGCCGACCAGCTGCCGGTACGCGCCCCCCGCCTCCGGCCGCTCTGCTCCCTCCCCCCCTCATTGCCCTGTCTCTCTGCTCTCCTTCACGCGCTCTCTCTCTCTCTCTGTGCTGGTGCGGATTGCGCTTTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGGAGGGTGGATCCTAGGTTTGGTAGGTTAAGTGGATTACGAGGGATGATTTTGGGGGTGGGATTTTGTGGATTTGAGTTATGTTTCGGATGGGATCAAGGGTTTCATTGCGAGGAATTTCACCCGCGATTTTTTTAAAAAAAAATCGGCGTTCGATGGCGAGGGTTTCGCTTGGAGGAACCGGTCGTCATTGGGTTTGTTTGTTTGTTTCGCTTGGTGAAATCCTTAGGTCTTCATTTTGTTCTGGTCGTGTAGAGTGGTTTGATCGTGTAGGTGGTCCAGGGATTCGATTATGATTTCAAAAATTGATTCAGAGGGGACGTACGATCACACCTGCTAAGCAGATAGATTTATCATTCGTAATGGAAGATCCCCATTGGCCACTTTGCGGTAGTCCACATACTACTATAGTCACATGATACAAAAGCCTGCAATTCATTGTAAATGGAAAGGACTGTAACTTGTCGGGATGAAGTTATCGAATTAAATTGTAGTTTTCTTTGGTTAGATTTATTCGCAGATATAAGTTACTATATTACCATCTGTTATCGGTAAATTCAGAAACATCAGTATACACTTAATGCCTGTCCCTTTCCTTAATGCTATATACTAAACGGTAACTCTGCTTGAGTTTGTGAACGTACAAGTGTTGATAATTTTGATTAGTCATATGATGCTTGCAAGTTTTATTAATATCAGCCTGTTATATGTAAACCTTAGTACTTGCATATTCATGGTATTGGTACGTTCTCTTTGATCATTTTTTTGGTTATTTGATGATTGATCATTATGGTACTTAAGAGTAACTAGCATGAAAATTCATACTTCCAAGGAAACATTTCCTGATGGTAGTTTTTTTTTCCACATATTTTCAGTGGAGGCAACACTACAGGAATTTACTGCTTTTAGCATACCAGAGTTTTGGTGTTGTTTATGGGGACCTAAGCACATCACCTCTTTACGTTTATAAAAGTACATTCTCAGGAAGACTACGTCGATATCAAGATGAGCAAACAGTCTTTGGTGTTCTTGCCTTGATATTTTGGACCTTCACACTTATTCCTTTGCTGAAGTATGTCACTATTGTATTAAGTGCTGATGACAATGGTGAAGGTACACAGTACACACTATTTCTTGGAAATTTGGTATAAACACACCTGACCTTACATTATCTATCATCTTGATGAATCAGCTTACAGTAAATATATTATCAATCTATTTGCTGGAGTATCACACTACCAGGCTTCTTCTTGTCTTTTTCTTTTTACAAATTTACTCTGTATCTCTGTTCAATCTGAAGAAAAATAAGTAATTCCTGTCACTTTTGTAGGTGGGCCGTTTGCTCTTTATTCGCTGCTTTGCAGGCATGCGAAACTTAGTTTTCTTCCAAATCAACAATCAGCAGATGAAGAGCTATCGACATACTACAGAAATGGTTTTACTTCACGTCATGGATCTTTACCTTGGCTAAGAAGGTTCATGGAGAAGCACAAGAATGCCAGAACCGTGCTTCTCCTCATAGTTCTGTGCGGTGCTAGCATGATGATTGGTGATGGTATCCTTACTCCAGCAATCTCAGGTGGATAGTGCCATCTCTCTCTGTTAGTTCATGTAATTCAAAGTTGTTACATATCAACCTCTTTGTATGTTGATGTGCTTTGTTCTGCTTGTTTTTCCCCCTCCAGTTCTGTCATCTATGTCTGGATTGAAAGTTCGAGCTACTGGTTTACATGATCGTAAGTATAATATACCTCTAACTCATAACTCCTTAGTGCAACAATTTTAGAACACATCTAGGCTGTTGAGTGAGTATTGTCAATTTCAAATTTACAGCCCTATGTAATTACGTTCGTAAGTATTAATCAATAGAATTATTCTTTCTCTGAATGCATTCAAAAGTAGGCACCTCTGTTTTGACTGTAATTTCATATTATTGTGGATTTTTTACTTATGTGAACATCTGAATGCACTTGATTTACTTCCCTGAGAATATTAGTTTGTCATGTCAAGATGCACCTGCACAGTATCTTGCAAAATTTAAGTTCTGTAGTGTCTGCCTGCTACTACCATGTATTTTGTAGTGTCTGCCTGCTACTACCATGCACCTGCACAGTATCTTGCAAAATTTAGTATTTTGTATTTACCATGTCAAAGGTTGGCCAGTATAAGTTTCTGGCTACTATATTTTTTTTCTGGTGACTATTTCTATATAGTGAGACTTCCATCCTATTTGCGTGATAAACAATTTCCTTAGGAATTATTGCTATTCTACTTTTGGGATTAAGTGTAATAACTTATTTTCTGTACAGGTTCTGTTGTACTCCTTTCATGCATTGTGTTGGTTGGTCTATTTGCATTGCAACACCGAGGTACTCAGAAGGTAGCGTTCATGTTTGCACCAATTGTCGTCATCTGGCTCTTTTGCATTGGTGGAATTGGTTTATACAACATAATACATTGGAACCCAAGGATATACCAAGCTCTCTCTCCATATTATATTGTTAAGTTCTTTAGGACGACAGGTAAAGATGGTTGGATTGCTCTAGGAGGCATACTTCTTTCTATGACAGGTTGGTTACTATTTACTCCTTACTCTTGGGGTATAATCTGTATTCTTGTTGTACTTTACTTTGGTAAGTAAAATACTTGTTGGGATTTAAGGTTCATTTTCTGTTTCAATTTTACAGGCTGTGAAGCTATGTTTGCCGACCTTGGTCACTTCACGAGTGCATCTGTCAGGGTGAGTTAACTTATCTGTCTTTAGTTGCTCACTTTGTGGAGATATACTTCTAGGTCTGTTAATATATGTTATGGTGTGATATTGTGTTGCCTAGTAAAGCAACCATGGAAACTTAGAGAAAGCAATTTGAGGGAAAATATAATGGAAGCAAAAAGTTAATGTACTAAACAGCCTTATCTGAAAATAAATTTAGTTAGCTTGTGAGTTGTGACTACATATTTGAAACCAACCAGAGGCTCAAAAGGAATGGAGGAACCTAGTCATTTTCTTTGTTGTGGACTAATGTTGCTCGTACAAGTTCTCTCATGTGACCTATCTGGTTCATTTTTATTTTGAAGCCTCCTCCTGGATTCCATATAGTATTCTTTGCTAGTAATTATAATTTATGTTTACTAAACTTTGCTTGCTTCTTCTGCCAGTTTTGCTCATTATTTTTTTTCTATTGCTGAAATATATCCATGTTTTGTCCTTGTTACAGCTAGCTTTTATCACCATCATATACCCATGTCTTATATTACAATATATGGGTCAGGCGGCATTTCTGTCAAAAAATATCCTTGACATGCCCACAGGTTTTTATGATTCTATCCCAGGTTTGCACTGTCACCCCTCTCTCTCACATGCATGCATGCACACAGATATGTAAGTGTAATGTTAATTTTAATTGTCATCCAGGACCTATATTTTGGCCTGTGTTTGTGGTGGCCACTCTCGCTGCTGTTGTTGGTAGCCAAGCTGTCATTTCAGCAACATTCTCTATTGTGAAGCAGTGCCATTCGTTGGGATGTTTCCCTCGAGTGAAGGTTGTCCACACATCAAGGTGGATCTATGGACAGATATACATTCCTGAAATAAATTGGATCCTTATGGTGCTCTGTGTAGCTGTCACAGTTGCATTCCGTGATATTACACTTATTGGTAATGCCTATGGTAAGCGCCTGTAACCATGATTTTTCACGTGATCAAGAGCTCCTTGCATATAGCCTTTTGTATATTTCCAGTATACTCAAGTGCTAAGAGTCTAAGCACTGCCATTGCCATGGTTTGTCATTGCAGGTGTTGCGTGCATGACTGTTATGTTTGTCACTACATTCTTGATGGCATTGATCATGATCTTCGTTTGGCAAAAGAACATAATATTTGCTCTATCTTTCTTTTTATTATTCGGATCCGTTGAAGTTGTTTATCTCTCCTCATCCCTCATGAAGGTTACTCAGGGAGGATGGGTGCCGCTTGTGCTTGCTTTAATATTCATGTCTGTCATGTATATTTGGCACTATGGGACAAGGAAGAAGTACCAGTATGATCTTCAGAATAAGGTAGCAATGAGATATATCCTGTCCCTGGGTCCAAGCCTTGACGTAGTTCGTGTCCCAGGAATTGGTCTGATTTACACAGAACTGGTGACTGGTGTACCCAACATCTTCACACATTTCACTACTAATCTCCCTGCCTTTCATGAAGTCCTAGTCTTTCTTTGTGTCAAGTCAGTACCAGTACCATATGTGTCACCAGATGAACGATACCTTGTGGGCAGGATTGGACCTAGAGCATATCGGATGTACCGCTGCATTGTTAGGTATGGTTACAAAGATGTTCAGAGAGATGATGACAATTTTGAGAACATGTTAGTTATGAACATTGGGAAGTTCATTATGATGGAAGCTGAGGATGCATCTTCTTCAGCAAGTTATGATACTGCCAATGAAGGACGAATGGCCGTCATAACAACATCTGATGACTATGACTCTCCACTAGCTGTGAGAGATTCCAATGACCTAGCTGACTCCATGACGACGAGGAGCACTAAATCAGAGAGTCTTCGAAGCTTGCAATCCTCTTATGAGCAGGAATCACCTAATGTGAGCCGGAGGCGACGTGTTCGCTTTGAGCTGCCAGAGGAGGATGACATGGATCAACAGGTTAAAGATGAGCTGTTAGCACTTGTGGAGGCAAAACATACAGGGGTAACCTACGTCATGGGGCATGTCTATATCAAAGCTAGGAAGAACTCTAGTTTTTTTAAGAGATTTGCAATTGATGTTGGCTACTCTTTCCTCCGGAAGAACTGCAGAGGTCCATCGGTCACACTGCACATTCCACATATTAGTCTGATAGAAGTTGGAATGGCGTACCAAGTGTAG</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://plants.ensembl.org/Oryza_indica/Gene/Summary?g=BGIOSGA005122 EnsemblPlants:BGIOSGA005122]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Indica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Indica Group]] | |
| − | [[Category:Indica Genes]]
| |
| − | [[Category:Indica Chromosome 1]] | |
| − | [[Category:Chromosome 1]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information