|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 1]] |
| − | GeneName = Os01g0819900|
| |
| − | Description = Protein kinase domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001051179.1 GI:115440728 GeneID:4327606|
| |
| − | Length = 10186 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os01g0819900, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 1|Chromosome 1]]|
| |
| − | AP = Chromosome 1:36705015..36715200|
| |
| − | CDS = 36705196..36705563,36705670..36705918,36706104..36706213,36707286..36707359,36707825..36707894<br>,36708436..36708535,36708633..36708708,36709160..36709234,36709339..36709392<br>,36709655..36709744,36709826..36709942,36710045..36710155,36710237..36710376<br>,36710550..36710631,36710812..36710891,36711526..36711634,36711883..36712005<br>,36712560..36712632,36712926..36713077,36713617..36713715,36714846..36714971<br>|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008394:36705015..36715200
| |
| − | source=RiceChromosome01
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008394:36705015..36715200
| |
| − | source=RiceChromosome01
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgttcaagttcctcaaggaggtggtcgcgggatccggatcgggcctcaaggacttcccctacaccatcggcgagccctacgcctccgcgtggggctcgtggacgcaccaccgcggcacctccaaggatgatgggtcgcccgtgtcaatcttttctctgtcagggagcaatcctcaggacaggcacttggttgctggtcggaatggtgttaagagattacgaacagtgcgtcatccaaacattttatcctttcttcacagtactgaagcagaagttcctgatggacctgccatgaagcatacaatttatattgtaacagagcctgttacgccactttcagaaaagcttaaggaactgaacctgggaggcacacagagagatgagtactttgcttggggtcttcaccagatatcaaaagctgtgagctttctcaacaacgactgcaagcttgttcacgggaatgtatgcgtgacgagcgtagttgttactcaaactctagattggaagcttcatgcttttgatgttctttctgaatttgatgctaacaacgaagcctctaatagccccatgttgcaatttgaatggttagttggaacacaatataagccaatggagctaacaaagtcagattgggtgtcaattaggaaatcacctccatgggcaattgattcctggggactggggtgtttaatttatgagctcttttctggtgcaaagctaaccaggacagaggaccttcggaacactgcttcaatcccaaagtctttacttccagattaccagaggctcttgagttctgccccttctcgtagaatgaacccttctaaacttattgacaacagtgagtttttccagaacaagttagtagagaccatacagttcatggaagttcttaacttaaaggacagtgttgagaaagatagctttttccgtaaactaccgaacatagctgagcagcttcctcgtgagatagtcctgaaaaagttgctccctgtgctggcatctgctcttgagtttggttcagctgctgcaccagccttggttgtattgttgaagatgggttcctggcttccagctgaccaatttagtgcaaaggttttgcctacaattgtgaagctttttgcctctaatgaccgagctatccgagttagccttttgcagcacatagatcagtttggggagtcattgacagctcaaactgttgatgagcaagttttcccccatgttgccactgggttctctgatacttctgcttttcttcgtgaactgaccttgaagtctatgcttgtattggcacccaaattatctcagcgtacgatttcaggatctctcttgaagtatctatctaagctccaggttgatgaagaacctgcgatcaggacaaacactacaattcttcttggaaatattgcaaactacatgaatgatgggactaggaaaagggtattgatcaacgcatttactgtccgtgcattacgtgataccttcccccctgctcgagcagctggcatcatggcgctaagtgtcactagttcatactatgaaatgacagagattgcaactcgtattctgcctaacgttgttgtcctcacatttgatccagatagtgatgtgaggaccaaggctttccaggctactgatcaattcttgcaaatagcaaaacaacatcatgaaaagcttactatgggagacaacagcgcagccgaagctactggtatccagttaaagcctggaaatgctggtttacttgggtgggctatgagttctcttactcagaagggaaaaggttctgaccatggtccggtttctagtgcaaatgctagcaactctcaaatttcagcaacctccagtgtcacatcagataatagatcttccaccgtagcatatgcaccatccacttctagctctcttgatcaaactgcaccagcatcagcaaggtcctcggtggatgggtggggtgaaattgaaaacgataatactcaggaagagaatggtagtgataaagaaggatgggatgatgtagatccgtttgacgagaagcctccaccatctcttctctctaacatacaggctgctcagaaacgtcctgtggcgcaaccaaaacaaccagtatcaaattcgtcaagattaaatcaaccaaaggtgcccaaaccagaagaggatcctctatggggttctatagctgctccagcacccaaaaatgcatcgaagtcttcagacatcaaaccttcaacgtcgcacaatgatgacgatgacctctggggttcgatagctgcacctccaccgaaatcagctgggaagcccttgaagccaccagcagcagcaaacagtgacgatttatggggtgccatcgctgcacccccaccatcaaccaaagctagacctctagcttcatcaggtaggggtcgaggaacaaagccagctcagccaaagcttggcgcacaaagaataggcaggacgtcttcaactgggatgtga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MFKFLKEVVAGSGSGLKDFPYTIGEPYASAWGSWTHHRGTSKDD GSPVSIFSLSGSNPQDRHLVAGRNGVKRLRTVRHPNILSFLHSTEAEVPDGPAMKHTI YIVTEPVTPLSEKLKELNLGGTQRDEYFAWGLHQISKAVSFLNNDCKLVHGNVCVTSV VVTQTLDWKLHAFDVLSEFDANNEASNSPMLQFEWLVGTQYKPMELTKSDWVSIRKSP PWAIDSWGLGCLIYELFSGAKLTRTEDLRNTASIPKSLLPDYQRLLSSAPSRRMNPSK LIDNSEFFQNKLVETIQFMEVLNLKDSVEKDSFFRKLPNIAEQLPREIVLKKLLPVLA SALEFGSAAAPALVVLLKMGSWLPADQFSAKVLPTIVKLFASNDRAIRVSLLQHIDQF GESLTAQTVDEQVFPHVATGFSDTSAFLRELTLKSMLVLAPKLSQRTISGSLLKYLSK LQVDEEPAIRTNTTILLGNIANYMNDGTRKRVLINAFTVRALRDTFPPARAAGIMALS VTSSYYEMTEIATRILPNVVVLTFDPDSDVRTKAFQATDQFLQIAKQHHEKLTMGDNS AAEATGIQLKPGNAGLLGWAMSSLTQKGKGSDHGPVSSANASNSQISATSSVTSDNRS STVAYAPSTSSSLDQTAPASARSSVDGWGEIENDNTQEENGSDKEGWDDVDPFDEKPP PSLLSNIQAAQKRPVAQPKQPVSNSSRLNQPKVPKPEEDPLWGSIAAPAPKNASKSSD IKPSTSHNDDDDLWGSIAAPPPKSAGKPLKPPAAANSDDLWGAIAAPPPSTKARPLAS SGRGRGTKPAQPKLGAQRIGRTSSTGM</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>9638..10005#9283..9531#8988..9097#7842..7915#7307..7376#6666..6765#6493..6568#5967..6041#5809..5862#5457..5546#5259..5375#5046..5156#4825..4964#4570..4651#4310..4389#3567..3675#3196..3318#2569..2641#2124..2275#1486..1584#230..355#aaattatttttctccccccgtcttcctcgcctttcctgcaggtaggcccccgccaccgagccctctgttacctccccccttctcctccgcttcacccgacgcctcctcctgcccgcccggatctacctcggcgccgcgtcggcgggcggaacccaccggcggccgcgcggggaggaggcgatcgaaaaaacccgaggggggaatcgcgccgggataatcctagggcagaatgttcaagttcctcaaggaggtggtcgcgggatccggatcgggcctcaaggacttcccctacaccatcggcgagccctacgcctccgcgtggggctcgtggacgcaccaccgcggcacctccaaggtacgctctcctcccttcccctcaccgctcgatcgggggcgcggatcgatttgatagatccccatgagatggggcggcggagatatgcgagagcgtgccgctgattcggttcggtggtggtaagctagtgagtgatccgggtcaagctaagtttgagttggagctgatcgtgcgctgattctaacggcgagtctgagtgggtgctccctgggtacggtttggagctcgtgttaggtcgatattagcttgagtaatacctcaggaagtagaattggtgggctcagtgctgagtttatttgaggctgatctggtttaagggagcctgtgatttctgccagattactgggagttcgtcattgctcactgcacagttgcatgccatctggtaatagtgaggaccttactgatgtcagcacttagtcattagatttttttttttggctgtggaattagattattcgtgaggtttccttcatggttagtgatgttattgatttcagttggtggtaattgagcatccaaataaaagttatttttgatgttgttgcattgggatgctggagattgtgtcaggttttatcttttgttgactagtgggggcatgccttgtgcatgcgtgttctgcaaatggtgctgtagattagcacactctgatgatatatgtgacattggaggcctcatactgatgcttatgtcgattggagatcatggctcattcaactagggatgatcagatgtctaattatgcctaatgtacctgtgtttgggtggctgttaatggactaaaagaccaataatccatttctttttggcagttatggatgacctttcagggtgcaatgatctaagtcaagatggattgtatgtaacttatagtggcctttgtgtagttcaatatagagatgtgtagaacattcatgcgtcaattttaccacccagatggttgtgatgtgatgttgatcaaaattaggaggtctgttaagtgtgttatctggttccatttctttttcgcaagctttgatttatttgcgcagcatactcttttcccccaaatgattacatattgcattaattttacaacatatgtatatgatgctatcaacataattgttgccttgtcttttctgcaggatgatgggtcgcccgtgtcaatcttttctctgtcagggagcaatcctcaggacaggcacttggttgctggtcggaatggtgttaagagattacgaacagtaagttactaatgttgatcttaaatatttgtaatgtctacttgtactgcaagtgtcttattttaacagatgagaatggagtctatggtgatatactattgagttctagaagggtacaacaaaaacaaggaaaaaaatctgcacagagaagattcaataatggtggcattatatcatgccatattggcatttttttaaaaccaaaggccctttgacccagctttataagaaagccaaaaggttcttgcaacaatagattttggtttttgctgggatttccagcttacattaaagagtaggcaggaaattccatctgggcattagccattaggtacgaggttatgcatgccggtccacttttttggcatctcgcattaaattttctcagtgacttgcttctagtggacatctttacttaaatatcactttgtagtgcaattgagttttgcttttgtcatcggtttcattggacttctttactctcaatatgacacctgctaagttagttcagtgttattgacctgctgcacttattgcaggtgcgtcatccaaacattttatcctttcttcacagtactgaagcagaagttcctgatggacctgccatgaagcatacaatttatattgtaacagagcctgttacgccactttcagaaaagcttaaggaactgaacctgggaggcacacagaggtattatgagcttcccctatcctttggtgtttaacattatgacatatatatttgtgcagatatggagtacggttgctgcttaatttagtgtgagcaatatgttttttttgcttaatagtctagaactattggggctaatcaattctagtgcactagtcttgtcagagttggcagtttgcatgtttactgcaccatattgccagtagctatttctcgagagcaaaatttcatattgctcagtttttgtttacaatcatatttattctcactattgctgataaattatgggccagagatgagtactttgcttggggtcttcaccagatatcaaaagctgtgagctttctcaacaacgactgcaagcttgtaagccctccccccccctctctctctctctcacacacacacacactctctctctctctctctctctctctctcaaacggagtacaatcgcataatgcaagctgttgatgtggctactacttatctcacagaacttttcaatttccatcacaacaaaattatttctggtgggcataatttgctcatttttaaaattttaaaaatatcaatttatatttagtataagttacccttggaattagattgcacaaccaaattatcgtcaggatcttcttgtttacatgccaaattcttttttatccagatgagaaaagtatcacaatcagccagcttatactgtgtcatttcttcttgaccatttgatttcagaatttgtacttgtataactttgttgatatgatgttttactcttattttgttaatggcggataatgaacaatagtcaatataaatgcatgttcttatttgtgcaaagtcatgtaatgacacacgaaaacaatgtatgttggaagttctttggtcataaaatttgaaattgtcatcatcaatttcaggttcacgggaatgtatgcgtgacgagcgtagttgttactcaaactctagattggaagcttcatgcttttgatgttctttctgaatttgatgctaacaacgaagcctctaatagccccatgttggtatggtctcttaatcacagtcccgcacctttatatatagatatagaactattacaactctcttttggacatgtttggtgaatgtactgaaacaaatgcttttacaccgtgcttgtcatgttatcgtatgtcgagtttccattgtttctagaaagtaagaattggtactctttaatatcagggaaattcaacatgatagagggagatatataccatacttctttttacatacttatgttcctttgcagcaatttgaatggttagttggaacacaatataagccaatggagctaacaaagtcagattgggtgtcaattaggaaatcacctccatgggcaattgattcctggggactgggtaagcagagctaactccttttccttcattacattcttgtttgattgttctgtttccataattttacaattcggaaactgttcaacagttccttgtcggatgtgcactcggcattattgtactttaattgcaaaagttgtttattttctttaaatggatatctctctatgggcctgtatcgtagtttcaaatcttttatggtaaatactataaagttttgcactatagaccaggtcaagatcgaccaagaaaagacatgtctagagtcaaattaataaactatggttacctgaattcctttgttatttgcattttgcttttgtttgctttgctgcatatagactctctttaatattatttccagaatgatgaaatattgataataaatggcacccagcggaggatatatttttcgaattagagaatccattgtttgtaatcaacaagaaaaaaaatgggaaagtaagacaatctaaaggcaaaacacacagagaatagtcatatgttactaagctgaatctctttcacataatcacattcaaggagcacctgaaagtttcttatagcagtatttaacagtaaaaatggtttttagactcatctccaaaaatattgatctctggactcattgcagggtgtttaatttatgagctcttttctggtgcaaagctaaccaggacagaggaccttcggaacactgcttcaatcccaaaggttagtttgcacgatcatggtcctgaatctgtctctatttagctattgattttttttgttggtaatttttgtattgcttctccactgtttgaagtctgtaatgtagagcattatgctgactaatctatacattgttcatgcgtatcataaagttgttggtttccttctattttgctgcagtctttacttccagattaccagaggctcttgagttctgccccttctcgtagaatgaacccttctaaacttattgacaacagtggtaagttcaacatatttttctctcatcatttcaggaattactttttgtatttcgacacttattacatcgacgcccataaccttctacttttgctcttaatgctgtaattctatgtcaattatttggattactttaaataagctgcagtgacaattgtggttcttcattttcagagtttttccagaacaagttagtagagaccatacagttcatggaagttcttaacttaaaggacagtgttgagaaagatagctttttccgtaaactaccgaacatagctgagcagcttcctcgtgagatagtcctgaaaaaggtaatgttcaagtcatgaatagaacccattattcccccggttcttgtttatatgcttatcggttggttactctgtcaatagttgctccctgtgctggcatctgctcttgagtttggttcagctgctgcaccagccttggttgtattgttgaagatgggttcctggcttccagctgaccaatttagtgcaaaggtttgacttcatttctttcgttttcacccaatattcgttagtcattccagtaaatgtgtgttacgatgttataacacaagttaaaaccactggcattttcaggttttgcctacaattgtgaagctttttgcctctaatgaccgagctatccgagttagccttttgcagcacatagatcagtttggggagtcattgacagctcaaactgttgatgagcaagtatgctatcatttcctgtatggacatctgcatgtgtttctggaatgttgatgcttgacaggataaatatctctaatgcaggttttcccccatgttgccactgggttctctgatacttctgcttttcttcgtgaactgaccttgaagtctatgcttgtattggcacccaaagtaagaccctcccaaccctctgcatgatcaacatttgcaccccgaacaaaatccttgtggatgtctttcatttttactgattgtgctgtgttaacagttttctttttaaaaagtgttctaaatttatctatcgctctctctggttgtgtgcacagcgggcttttaaagaaaaaaaaatcctgggattgcaaatttctgtggtattattttttcaggaagattattgcttctttatgactaattcaccaatctgttactgtagttatctcagcgtacgatttcaggatctctcttgaagtatctatctaagctccaggtgatgttctgttctaactgaaatgcctcagatggactcagtttgacatgtgaaggtatacaatttagttaaaagtaaaaaaaatcattgttatctgtgttcaggttgatgaagaacctgcgatcaggacaaacactacaattcttcttggaaatattgcaaactacatgaatgatggggtatgtcctttttattgcttttttactaattttccttgaaatttcactgtagcaagctgactttaagataggtagccagtatatctggatttctgaccagcaagtttctcaattatttaaaatccacatgttttttgtaccatttatctccatggtctgtgataaactttgttaaaaactggctggttactggagattactgatcatagtgatcctggctagtataaggccaaggaaatgcataaatgcatgatagtaaagaaagaaagacaagaggaaataataatcacctgaaaattactagaaaatatgtttttgagttttgacccaaagaaagcaacacaaatatatcctggagttctccattcccttgcctagatatcgagttcattttctgtttgtactaaataagtaaatagtcattcctaacaatgtttggctattttgacagactaggaaaagggtattgatcaacgcatttactgtccgtgcattacgtgataccttcccccctgctcgagcagctggtacattgccctgtagagttgttctgttttactacttacaatgctatatcgtactaattattgacaagtaagtattgctttaccatttgtctggcaggcatcatggcgctaagtgtcactagttcatactatgaaatgacagagattgcaactcgtattctgcctaacgttgttgtcctcacatttgatccagataggtataacatacagcatttagctctcagtctctactttctcattgttgcttgttgtaacaagcaattaaaggctcagagatctgttagtttgatagaatagattattgtctcactaaccactagtagttatatccaagtaaaattcaaatggttggtaccctttccaacatgaatcatagcaccattgctcaatgttttgcatatgctagtagctatcagtctgatttgactttttttcttagaagcaagctttgcttattaactttctggcctaactgtcattgcacgattcattagcatatggtttccagaactaagacatctttgtgcattagatgtacccatgcacaattgatcgaaaaaatgtcctgtatggatatattataaaagttgatatggattgaaatatgaagtttaacagacaagacagttaaaactaacatgggagatttttgcattgacaatactactttctttaagttataactgtacgatgcatcttattttggtctttcaactaaggcatccaatggttttgtagtgatgtgaggaccaaggctttccaggctactgatcaattcttgcaaatagcaaaacaacatcatgaaaaggtatgcacatttagtcatacagtttatttgcttataatatatccactattctggaccgtttgttacactactggtttgctctagatggcatgctaacacaatgcatgtgtgttatgaccataatatgttggtagataacttactgtcactgtaaaatatcttttgtttttcattttcttttgctactaattgtatcataggttttagatatgccattacttttatccggttgtcatttctccactagtttagaaatgccagacgacttccaatggttttggctgttagaacaatgtcaaaagtctgaaaaaatacctcctctggcacatagagctataccccacatcctttttgcaacactagtctaaatactccaatctgtgttcatatatttttcatggctttggcactgtacacttgttgcttcaatttattgacatagcttcatacttacacttattgtagcttactatgggagacaacagcgcagccgaagctactggtatccagttaaagcctggaaatgctggtttacttgggtatgttgcctatgttccaatcactatatgcttgtttcatttcttgatattggagcctcatagatttataggctatcctctatcttacatgtcaatagaaataaatatttctttaagttgattgtcttgatttgatccagtcgtttttctaattactatttgaatactgggacaattatagtgaagtttctcatcctatcactaatacatttggctgcctcgtataggatgtgcatatggccagccttatataataaatggcttggtaacctctctaatactccctccgtactcgtaaaggaagtcgttttggacagcgacacggtctccaaaacacaactttgacctcttgtttctataaaaatatttattgaaaagtgatatatgtatacttctatgaaagtatttttcaagacaaatctattcatataatttttacattttcaaactcaacaacttgagagttattcatgatttatattcccaaggtttgacttaaacattgtcctaaacgacttcctttacaagtacggagggagcatttgataataataaataggaagctccttctctaagaatatcccttcctgcgtcatagatttgtatctttaggtcacagtacaacatttttttatgcttctctcttacacatgctgatgctttatagacatttatgctaccttccttttttatgactatttttcataatgtcttgtcctaagttctgatgcttcgtttacaagcaaatagaatctgttatgtatgatcctgaggtccatggttgtcaccggccattgttcttgttgaacaccaagttttggaggggccaatttgtcaaatattctgtgctgtgctgtgggatcccatttcatgggccctgtaatgtaggtttttctctagtcagtatatacaaaagaagaaaagaaaattgtaggtaaattcgtttctagttagccatcagccaaaggaattcataatttgtttacgtgtgtggaagtcatcttatgcttttgcagtttattatgatcctgtatgcaattgaattacttattagaaacatatccatgtacaggtgggctatgagttctcttactcagaagggaaaaggttctgaccatggtccggtttctagtgcaaatgctagcaactctcaaatttcagcaacctccagtgtcacatcaggtattagactttttttcaaattgctctaatcatgagtattaagctcagttttcatcactagatagggatcacgggctataaatgaaagaggaaaaatgtaaatatcttaaaagaggattaacaaagtatatgacgtgttacagttgaatgtgagctcttatcatttgtcaattctactgtcacagataatagatcttccaccgtagcatatgcaccatccacttctagctctcttgatcaaactgcaccagcatcagcaaggtcctcggtggatgggtggggtgaaattgaaaacgataatactcaggaagagaatggtagtgataaagaaggatgggatgatgtagatccgtttgacgagaagcctccaccatctcttctctctaacatacaggctgctcagaaacgtcctgtggcgcaaccaaaacaaccaggtaggctttgtttttgttactgtatctgttatatacacatatttgctaaaagagctgaaaataatgccattactttcttttatttattcaaatttgtcaactgtagtatcaaattcgtcaagattaaatcaaccaaaggtgcccaaaccagaagaggatcctctatggggttctatagctgctccagcacccaaaaatgcatcgaagtcttcagacatcaaaccttcaacgtcgcacaatgatgacgatgacctctggggttcgatagctgcacctccaccgaaatcagctgggaagcccttgaagccaccagcagcagcaaacagtgacgatttatggggtgccatcgctgcacccccaccatcaaccaaagctagacctctagcttcatcaggtaggggtcgaggaacaaagccagctcagccaaagcttggcgcacaaagaataggcaggacgtcttcaactgggatgtgaagcgccatcgtcatacaagtgttgtacaaggatgaatttttcttttctttttttttctttcgctttctgtcgagaatattcccattttgtaaactagcccaatcatttatatggacatgattatgcccaatgtattatttcacaattgtgtattacgatagcttcaggatatatgtacatc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001051179.1 RefSeq:Os01g0819900]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 1]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 1]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information