|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 3]] |
| − | GeneName = Os03g0223700|
| |
| − | Description = Armadillo-like helical domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001055960.1 GI:115451648 GeneID:4332109|
| |
| − | Length = 8067 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os03g0223700, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 3|Chromosome 3]]|
| |
| − | AP = Chromosome 3:6495679..6503745|
| |
| − | CDS = 6496117..6496203,6496811..6497077,6498317..6498385,6498950..6499078,6499161..6499322<br>,6499400..6499520,6499655..6499770,6500539..6500604,6500852..6500933<br>,6501078..6501169,6501272..6501379,6501486..6501572,6501761..6501855<br>,6501934..6502076,6502178..6502206,6502294..6502413,6502487..6502576<br>,6502958..6503023,6503109..6503222,6503324..6503416|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008396:6495679..6503745
| |
| − | source=RiceChromosome03
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008396:6495679..6503745
| |
| − | source=RiceChromosome03
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggccgccgacgcgctctccatcatcccgggcgccgtgctgcgcaacctctccgacaagctctacgagaagcggaagaacgccgcgctcgagattgaggggatcgtgaagcagctggcgacgtcgggagaacatgacaagatatcagcagtgatcgctctgctcaccaacgatttcaccatgtcgccccaagcgaaccatcggaagggcggattgattggtcttgcagcagtcacggttggactcaccagtgaggctgctcaacatttggagcaaattgtgcctcctgtgcttacctccttcctggaccaagacagtagagttcgctactatgcgtgtgaagcactatacaacatagcaaaggtggtaagaggggatttcatcatctacttcaacaaaatttttgatgcattatgcaagctttctgcagactctgatgctaacgtgcagagtgctgctcatcttcttgacaggcttgtcaaggatatagtaactgagagtgaccagttcagcatagaagaatttataccactcttgagggagcgcatgaatgtgttgaatccttatgtgagacaatttttggtggggtggataacagtgttagacagtgtgcctgatattgacatgcttggtttccttcctgattttcttgatggtttatttaatatgctgagtgattccagccatgagattaggcagcaagcagatgcagcactttctgagtttctgcaggaaattaaaaattcaccaaatgtagattatggtcgtatggctgaaatacttgttcggagagctggttcttctgatgaattcactcggttgacgtctatcacatggattaacgagtttgtcaagcttggtggggaacaacttgttccttactatgcagatattttgggagccatcttgccctgtatttctgatcaagaggagaagatcagagtggttgcgcgtgaaactaatgaggaactttgtgctataaaagctgatccaactgaaggatttgatattggagccattctctcaattgcaaagagggaattgaatagtgaacacgaggctacccggattgagtcattgcattggttttccactctcttagttcgatatcgtgctgagttcttggcatacttgaatgacatcttcgatccactcctaaatgcactctctgatccttcagatgcggttgttctattagtgttggaagttcatgcgcgcatagctgaagagtctcatcactttcatcatcttgtatcctacttaatccacacttttcacaacaatcatgttctactggagaaacgtggcgcattgatagttcgtcgactttgtattcttttgggtgctgaaaaagtttatcgagagttctctactattcttgagaccgaaggtgaccttgaatttgcatccaccatggttcaggccttgaatttaattttgctcacatcaaccgaacttgctgagctgcgttctcttcttaagaaaacattggttgattcttgtggcaaggacttatttcaatctttatacgcttcttggtgtcactctccgatggctacaataagcttgtgtctacttgcgcaggcatacaatcatgcaatttctgttatccagtctttgggagaggaagatataaatgtgaagtttctcgtgcaactagacaaattaatccgtcttttagagactcctgtatttgcttacttacgtttgcagcttcttgagcctggaaaacatacctggcttctcaaaacactttatggtctcctgatgctactgcctcagcaaagtgcagccttcaagatcttgagaactcggctgaagactgtgcctttcagtgaaaatttgaaacgcacatcttcaacaaatccatactctcagattctacaagtgacagaagatggtaatcgaaatcacgacactcagagctacaatgcaatcaatttcccatcccggctccaccagtttgagagcatgcagcagcagcacagagttcatctaaagaatcaactgcaatcccaaaaatctgcttcagctatagtattatcacaggaaattcaaagatacgaagaagcacattcctcttcgacatcagagattggcaggcccccttcgagaacatccagaggcatttcatga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MAADALSIIPGAVLRNLSDKLYEKRKNAALEIEGIVKQLATSGE HDKISAVIALLTNDFTMSPQANHRKGGLIGLAAVTVGLTSEAAQHLEQIVPPVLTSFL DQDSRVRYYACEALYNIAKVVRGDFIIYFNKIFDALCKLSADSDANVQSAAHLLDRLV KDIVTESDQFSIEEFIPLLRERMNVLNPYVRQFLVGWITVLDSVPDIDMLGFLPDFLD GLFNMLSDSSHEIRQQADAALSEFLQEIKNSPNVDYGRMAEILVRRAGSSDEFTRLTS ITWINEFVKLGGEQLVPYYADILGAILPCISDQEEKIRVVARETNEELCAIKADPTEG FDIGAILSIAKRELNSEHEATRIESLHWFSTLLVRYRAEFLAYLNDIFDPLLNALSDP SDAVVLLVLEVHARIAEESHHFHHLVSYLIHTFHNNHVLLEKRGALIVRRLCILLGAE KVYREFSTILETEGDLEFASTMVQALNLILLTSTELAELRSLLKKTLVDSCGKDLFQS LYASWCHSPMATISLCLLAQAYNHAISVIQSLGEEDINVKFLVQLDKLIRLLETPVFA YLRLQLLEPGKHTWLLKTLYGLLMLLPQQSAAFKILRTRLKTVPFSENLKRTSSTNPY SQILQVTEDGNRNHDTQSYNAINFPSRLHQFESMQQQHRVHLKNQLQSQKSASAIVLS QEIQRYEEAHSSSTSEIGRPPSRTSRGIS</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>7543..7629#6669..6935#5361..5429#4668..4796#4424..4585#4226..4346#3976..4091#3142..3207#2813..2894#2577..2668#2367..2474#2174..2260#1891..1985#1670..1812#1540..1568#1333..1452#1170..1259#723..788#524..637#330..422#gcagccgcgcccggatccccacctcctcctccccctcctcctccagatcacaccaccgtcgtctccaacctccaatccattgagataggcttcgccagggtgccccgcgagcgagcggaggtgggcttaggtctctagggtttggcggggcgcaccccctcgtggtctctcgtcgtcgccttcgcctgttcggggggctagggttgcgtcgacggtggggggtgggggtgcgggtgcggggggcgggcggtcgatgcggcgatcgcgggcgatcgggagggtgtagcggcggcaggggaggggggatctccttggcggtttgttcggagatggccgccgacgcgctctccatcatcccgggcgccgtgctgcgcaacctctccgacaagctctacgagaagcggaagaacgccgcgctcgaggtgagggatttcggctcgtcatagggggtctggttttggaacaatcgacgatggatttgagctggaattgtttttgttcgtggtgggctgtttgtgtatagattgaggggatcgtgaagcagctggcgacgtcgggagaacatgacaagatatcagcagtgatcgctctgctcaccaacgatttcaccatgtcgccccaagcgaaccatcggaaggtttgcttacatcgccgtcatcttcatattccctgctattggggatcagatttgttgaagttctgtggcgcttttttgttagcagggcggattgattggtcttgcagcagtcacggttggactcaccagtgaggctgctcaacatttggaggtctgttagctctttactggtcttatatccccgttgatttctctaatttaatcaaattgctattctgtgtatgctgaactcagtgcttgggatttagtattaaattttaagcagtgtttggttgtactgctaactggacaaaaaatagctgtagttttctttcctgatggtaaaacctaccagttttcaacacaccatataatcttgtccatggattaatctaagtctaaattgtttacttttgtatgttatagtatttacttgagacatctatcctgttaagttagggctatgatggactgcgtttcaggtcttcattaatggtgtgttctatcaagtgtcattttggttgcattaaacttttttgctctattcttccagcaaattgtgcctcctgtgcttacctccttcctggaccaagacagtagagttcgctactatgcgtgtgaagcactatacaacatagcaaaggtaaacattttgtcaagtaatggtacatgaattatgcgtttgctttgctgcattaatcttttctttattgtaggtggtaagaggggatttcatcatctacttcaacaaaatttttgatgcattatgcaagctttctgcagactctgatgctaacgtgcagagtgctgctcatcttcttgacaggcttgtcaaggtacgatcgtttgggcaactgatacatcctgtacgtattgcatccttgattagccctgataaacattgtttgtaatttataaaccaggatatagtaactgagagtgaccagttcaggtatgctacatatgtgatgtcctttttcaatctcaatatcatgcacaacttaatctagtatcgatttctgatagttcctgtatcttaattttgctatttagcatagaagaatttataccactcttgagggagcgcatgaatgtgttgaatccttatgtgagacaatttttggtggggtggataacagtgttagacagtgtgcctgatattgacatgcttggtttccttcctgattttcttgatggtaatgcctctcttacttttcaagtatattacttattacgttgacagttcagcaaccttttatttgtcacccctgcaggtttatttaatatgctgagtgattccagccatgagattaggcagcaagcagatgcagcactttctgagtttctgcaggaaattaaaaattcaccagtaagtccatcctcattgaaattgcttgtctatctgtatcagtcactgaacagtgagatgcaatgcaacatatgtatcttgcccgatgaatatccctttaataactttgtcttcatttataccacaaaattacatttttcattttttgggtatgcttccaatgctgatttgcaaccttaaatgaaaagaatgtagattatggtcgtatggctgaaatacttgttcggagagctggttcttctgatgaattcactcggttgacgtctatcacatgggtatttcttttgtcttctatgttttcttttgttaattttgatatcgaaatctaaaatatttagtctactttgatacacctgagtaatattttgtcacattctgcagattaacgagtttgtcaagcttggtggggaacaacttgttccttactatgcagatattttgggagccatcttgccctgtatttctgatcaagaggagaagatcagagtggtaattccctctcttctttggacacagacaattcttgaagatgtagcctgcttgtctgtcggaagtcatttctttaatctttatttactttttgttggctaggttgcgcgtgaaactaatgaggaactttgtgctataaaagctgatccaactgaaggatttgatattggagccattctctcaattgcaaagaggttctctactaaaccacttgcataggaaatttggtttcatgccgatgtatctatattcatggatcaagagttaaaaatatgtgcagtcacttgtaacatggcatttgtgaaataacaccgagcctttttcaatttcaatttcagggaattgaatagtgaacacgaggctacccggattgagtcattgcattggttttccactctcttagttcgatatcgtgctgaggtgctcaactatgatgctttttggggctacacaacatatattttaacaagctgtacctgcataatttgttcacatttaattttttatggactgtgggaggtttttcttcagacccttaggatttagctcaatttaaactctctcctgaaagtcccaaaggaatccccctctaacatggacatgtggtacacacagttcaaattcattattggatggtttatgttaatatttttttcttgtgtaacagttcttggcatacttgaatgacatcttcgatccactcctaaatgcactctctgatccttcagatgcggtgagctctcttacaaagcctttgaaactgcaccttttcattacaactttctgtgagcagctgattaattgctttatttgttatacaaatgatctgtgaccaagtcttgaaataaaatcaatgaaggtttaacttagtgagaacagtgtgtgctaatttattttttgacttggtgcaaatttagtgcatcgtgggcctattctttcttccatggataatataccaaggggttacttcatcccttcaaatgtttttttataagtaaccctcatggccctatatcagccatctgagtgtttggctttccaaaacatatacaattacacagacatgattgcgcttgcagtatagaaaccataatgggatgcttttcagtgttggcgttggcaatgattgaatccattttcgcttgctgttggcaaggatagatttgctgttgtttcccttccaaaaagaaaaacacctgctgttcttgccattggatttgtaatatcctttgtttcataaatcttaataaagtctacttctccattgtcacctgggcttgacacaattatatgatagctataaataaccttcacatccccccaaccaccactgccaccaaaaaggaaaaatcatgctaaccctttgcatcatagttcaataaatgactgatgggctgatggctttatagggttattgaccattaatattttgctaattcaataaatttgttgtaccgtatcagagagcttggctattgtcatcacattttttcatgtgcaggttgttctattagtgttggaagttcatgcgcgcatagctgaagagtctcatcactttcatcatcttgtatcctacttaatccacacttttcacaacaatcatgttctactggagaagtatgcacatttccccactcaaaagttgattacatagtatatgtttctttgttattagtcctacttttagggttacacagttcactattacataaattgcttaccaaacaatggtttatgacatacttatacagacgtggcgcattgatagttcgtcgactttgtattcttttgggtgctgaaaaagtttatcgagagttctctactattcttgagaccgaaggtgaccttgaatttgcatccaccatggttcaggtatcccccactgttgcaacactatactactgcctaatttaactgtagacattccgtaactgttaaatttcttgtaggccttgaatttaattttgctcacatcaaccgaacttgctgagctgcgttctcttcttaagaaaacattggttgattcttgtggcaaggacttatttcaatctttatacgcttcttggtgtcactctccgatggctacaataagcttgtgtctacttgcgcaggtaatgaccaacttctaacttttgcagtttgtgtttcttacttgggcactgatctttggatgttcttttccaacatgtgtaggcatacaatcatgcaatttctgttatccagtctttgggagaggaagatataaatgtgaagtttctcgtgcaactagacaaattaatccgtcttttagagactcctgtatttgcttacttacgtttgcaggtagagctccattttccaataatacctcatctttgtttcattcggttgatatgaaactacttcctccgtcccagaatataagaagttttagagttggacacggttattaagaaagtaggtagaagtgagtggtggagggttgtgattggatgagtagtggaggtaggtgggaaaagtgaatggtggagggttgtgattggttggaaagagtgttggagaagttgttatattttgggacaaatcctgagggctaaaagttgttatattttgggacggagggagtagttgttttttggtttgcattttatttaaactttttgatatctcctaatgcttccacattcagtacaaatgctgtaaagcccatatgtatgtgttattcagtttatgtgatgtgtcacactgacactgtgtcagtagtagtttatgaatctttggtgacatgggcactgttcttgttatcttacttgtggtataggcgtatagcagtatggagaattgaatgttctgatgatactattctatgatatggtactccaatgatttgtttaataaaatttgcagcttcttgagcctggaaaacatacctggcttctcaaaacactttatggtctcctgatgctactgcctcaggtatgtttgatatctcattttttgtgaccctacggtcttgctttgatagtttcatgcatattctgtttccaaactgagaagcggaacacttgatacacatagagaaggaaattctcgtgtgttagattgttaggttggatgcaggaatatgcttaagttatgcctaacatggactagttagaactgttttagcttacttaaagtaagcaaagtatctggttgatgtggcaatctgatgttaacataggtgtctgatgacctattattaagttgtaagctttagcctagttccgtgagaagcgacttggcagctacttagtcctttcagttttgactaggatggcagttgctgatcaataaaagctgatgctgaagccgtctgcttgacattcgctgttgtcgataactctctgccgcttctccttcctcaacctatttcattctgttgttgctacttttgctgctcctccctgcagttgcaaatagcttctctgggaagcttgctgaggccatctccacctcctattgatgtggcatggtcacggtctggttggccaacaggataaagctgatagggagatgtcgaggtggccgatgatgtggggagaagcctgtgagaaacaaacggcatggggacagagagaggtggccagctatttatagtgataggctgagctgggctaccccacctgatcacctcttctcttccagagggcaaaaaccattgtacaaagcatggtgagagactgagcttgcttggcccacctggctatgtccattcttcgctgccgtccttttgttcgccaatcaccagcaccacctctgttctctgcagcatgcatggcgctctgttgctaacataaccattacctttcccttttcccctccgttattctagcatcatgcttttcggcctgcatatgctgttcgaagtgaggagcccaactacgctagtatgcgttggttcacatgtccattgatgattttggtgagacaatccatttcctcatttccccacataagtaaacttgcggtttcaagttctgaggtattgattatcaattcatcgtctcattcttcaagccaaacatgacattttcaccagattctgtaggaaaggttgagcttttgtaaaccttatgtgtccctcatgttatttacagactacgggaagttttcaatagtcatttttctaagtagttctagaattgaatgactaagctttatgtgtttgtgcagcaaagtgcagccttcaagatcttgagaactcggctgaagactgtgcctttcagtgaaaatttgaaacgcacatcttcaacaaatccatactctcagattctacaagtgacagaagatggtaatcgaaatcacgacactcagagctacaatgcaatcaatttcccatcccggctccaccagtttgagagcatgcagcagcagcacagagttcatctaaagaatcaactgcaatcccaaaaatctgcttcagctatagtattatcacaggtaatgtttctcttgcattaagccattaacatatatctgattatattgtatacctatacgtagttgcttcccccattaaagtgtaactaggtttttagttgcgtactgaaaatggttccttagcttacctatgcaactaagatctgtgttttcttggtgttgaacacttcttcttcttcttcttctttttttttttttggggggggggggatgggggggggtggtctttaatcctttcatctacaattggttgtgagagtttcttcgtgttaagttgtaaatccttctctttgcagatatattaaatatctgatgtctcccgtatcaactgtaggtctacctgaatcatcatcgcatcataatttaatcttgtaacacatttgttagtccctttgatttgctactaaaatgttatttcccagaaacctgactgttttcagaaatctgccaactgcaactaggaaaagttgctcttgaatggcttctttgattgtgtaccatagtttctcactgcaaaccttcataacttagtcaaacaaaggttgccactaagatgcttattctttgataggaaaaccgctatgtaacttttgtgaattgcatgcaggaaattcaaagatacgaagaagcacattcctcttcgacatcagagattggcaggcccccttcgagaacatccagaggcatttcatgatgcattttggttgattgtgatgtattatacatttgcaagacgcatcgtcacaaatttgttggggctttggttagtctcctttatttttttttcaaaggaggttcatagggtacatagagtgtaatctttttgtttggttcctagatttttgtcatgggatggcaattatttgttggagaaagctcgtttccctctttcagctattattttcccttttcttttagctgtttcactgctcatgtggtttctgtaatttttcaattgaaggccaatgagcaaaatagtatttggagatatgtcacgactgttctgcttatcaatctccaataaattagtgatgcaatgtaaatttttgttcctagctcttgtgatccacgccatctgtaattttctaccacatgataatcgtgaacttttaaaattggtaatttacttctt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001055960.1 RefSeq:Os03g0223700]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 3]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 3]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information