Difference between revisions of "Os09g0527100"

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Revision as of 21:02, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os09g0527100

Description

Similar to RNA-binding protein

Version

NM_001070264.1 GI:115480270 GeneID:4347640

Length

12336 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0527100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:21445030..21457365

Sequence Coding Region

21451060..21451095,21451168..21451336,21451463..21451524,21451618..21451696,21452131..21452234

Expression

GEO Profiles:Os09g0527100

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MSPLYSHHLNDQLQMSYVAGTNQSAIPLGGMARYSVGMDSGIHG ATRTESRTLYVEGLPSNCTKREVAHIFRPFSGFREVRLVNKESRHAGSCNLLCFVDFS SPPEARAALETLQGYKFDEHDHESSNLRTQFSLTPRRRSIGGPCVRN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6031..6066#6139..6307#6434..6495#6589..6667#7102..7205#acgtgacacgtcatacgccgcatccttcgttcacgccgccgccgcctcgcgctcttgccgacggccaccgcgccgcctcgccggtcgccgctcccacccttccacggcgaccggagccaaagacggtgaccggcgggcgcgacgacctaggggaatgtgtacctcacctaccccacatcgtccccgcacccgcattccctaaacccccaaaccctagcccgctcctccgttgtcggatacgccaacctgctatatgcgagagaagggcatccacaactgtttgatgatctccaccggagccgccgtttaccggagtaaccgtgcttacgcgtcagctggaggggtgacctcggattcggtggagggctgatggctccgacccagctggtcgatcgctgcggcggcggcgcccccgcgagtcgctgctgtgagcctgtgatcgcctgtgatgggggtgtccgtggtggcgcaggcgccatgggggaagtaactcatgagatgggatgtggccgcaggcgcgattgtcgctgtgatggcgcccttggctatgcttggggcgacgatggtggcactgatgcccctgcaagcggcttcggtgcccacgattggtggttcattcgtgatggtggacttgtgaccttgccaccgcctcctccgcaagacgaatttgtgatgatgatgcagcctatgatagtatgatagcacattcatcgatgactgcgatgtcgctgtgatgccgtacccacatgccagagctgcgatggagctgctgcctttgtgcgcaggccttccaccttattgacatggtattgcagccccaacaagctggacctatgatgccattgttggcacagccgcctttggccatggcactcctctactcaagcttcaacatctggactactttggttcgttctaacactccacctcccctgtactttacattggcaacataagacatgagatatttttaatgttgctagtcgtagctattattattgtcaggttgatataagcttcttttgtctaaaataaataaataaataaataaataagcaagaaatgaagtgagctgcatagcacatcagcgattagcctcttatattccttgtaatgttaagatgtaacccagtgattggatgtagtttcaacatggaggtatgcaatgttttgttcgttgttttgattgtagcttttcttaagcatgactgcaattgcttggtgttatctactgatcatcattgatctgtgatctttggctttgttaatgaactttagaatataagtgatcactgatcattgatctgtgatctctaatctatgtttttctggtaagcttcaagataatcttaggaacagttgttgttttagaattgaggttatgccttttccttttatgctttggcttgtacagtttttaaacatttgttcagtgtagcctacccttttcggttgttaagcaaaatggcacataaggttttcttgtagagtttcaattttgggttagggaaatgttttcaactgctcttgtgaagaaatttggaatgtctgtttggaccaaagagacgatgcaatttataatctgttgatggcgatttcacgtagatctgatcggttagcttaggatttgcatgatactgcattttttgccgctcttacttcatgcagttattgaaagtgcagtaatgcaatctcctgtttccttttaatattggagtatcatttatcgataggatgttttcttgttacacttgctatctcgaaccgagcaagagcattagtaattgccattttggcaattgtttggaaatttgtgtgtacacaattatagcgctgctgacagcatgatggttcaaataacttgccattctcagatggccatctattaatttttcaactcaatagccatatgcttatgtgataaaaatgaaccatacatattcgaaagaaatggttgtggttttcccaatactagtcaatgcctgtgtattgcaatggatttgtgaaagattaattgtgcatgtttctgtttttagcccattgggatggttttttgggttgtttttaaaaccttttttttgtggtgggtgggggagggggggggggaggcaaggatgtgccctgcatgtttatttcttcttgcattgcatgcggtggaggaaggggagggcggacgaacgattgcccttttaagtagtttagagagaaatttcagaatttgccaccgaatacgtaggcctttaaggatttgccacccaatccgcactcctttcaaaatttaccactgaggatgcgaatttcttcattccgtgccgcttcgtccacttgtgcagctgagccttctgtccttccgctggctccatcctcgtccatccgccatacacgcgaacccagctcggcgccaacgtcatccatccgctgcctgtgtcagcgtaatctgtccgcttcgagggtgtcgcgtgggcggacgtcacgggcaaggtggagctgacacgctcgtgttccctccttctctaacggctctcacctcccagcatccaccgcaggagaaaccaagctgcgacgcatggggtcccatcctccctcttccctctcgtcgatcccatcccccaaaacactcgagttacgacgcgggagagcacacatccgtggtgcaccgcgggaataggaagcggcagcggcggtgcacggactcccctcacccccattctctggctcctcacatgtgaagtgcggcgtatatgtccctcccaaaccctagaaattcgacgggctggtgcttcttccacacagttggctagcttgggatcggttgtggtcatagatggtggcgatgcacactgggctcgcaaagtacgttggtggcagatggaagatgatggagccaatgcaaaagatagacggcatgacttcacgggcaaacggagtggtatggaacgaagaaattggtaccctaagtggtaaattttgaaaggagtgtggattgcgtggcaaatccttagaagcctgcatattcggtggcaaattctgaaatttctcgtttagatatgcaccatacacattcttaccatgatttgcagagaacctaggccattggcgaagctaggatttaaacttgagggggccaacttaagctcattaccgagtgacaatgaccataaaaaagttgcatcataatacgcacaaaattgaaacattttgacatggataataaatcatatgaatatatttgttagttttgaccatacaaaaggatgttttcctgcctattatttagtcattggctacatacatattttttgttttgaagattttagtatttcaaattaaagtgaagaggtaaataaaaataaagtattagggcttacaaaaaaatgcatatttagaacacggtatgcggacattggaacaactgagctgtccaagtgtgttgtgttcttcgtgttagcttgttaggtctgcttagcctaggaagcagtcatcaccatctaaaaacgatatactgctatgtctcccaaataacttgtttgcatgcaatcctagctggtagtggtagcattggaagcctgaatacgccaatgcaccaagtacatgacataatcatgtatttgatgattaattagccggtacttaagaaaaaaaattcgccgttgggggaggcctgacctccctccacccctccctggctctgcccttgacctaggctttttctccacattaatgtatatgcactttcatgatgtattatttgatcacctccatcttgatggacacactctaaccccatgtcatgcaacaccacccggcacatgtaactgacaaacaacacatgaatagtaactgccaacaaatcactacatgtttttgcacaattaagcccattcaatccacaccaacacacctctatcaaagaaacatccaccgtatacgaatatggattaaaaaacatataccaccggtaaattgtgactcacctaatgcctccccagttactgaccacaccactgtccccatctcagtctcatcttatctgtgcctttttatgtgggcatctggtagaggtgctctcttcatctgcatccaccatttcattcaccaactaagtaggcctttttgagctaggtggttggttggccttggccttattaatttttcatgtggtactacaatatgccattatgtccctaagttgtgtccttcacattttatttagtatctatgtagttatgtcttttacatttatttacatagttatgtcttttacattttttttacatagttatgtcttttacttttttttacatagttatgtcttttatgtggttatatgatggagaagaagcttccgatttgtctttcttgccgttttgagtttcttttcttgtggtcagagcagaatgcaagaattaaaaattaggtgagaaatggaacagaaattttggatttaaactttgtttcttctcttgttgttatgccctctgatatttggccatggccacacctcaatgttttccaccactgcttctaccatgcacctgcagtttgatctctcattgttctgcatttgatgcgtgcgtttgtagcagttgttgccttgttggtactaagttgttgttgttgttgttgttgtttcttcaatgctcaaaattgcaacttgggagataaagtttggcggagaaagagaagtgtgagaagaaatatcgatcctaataacaatggatgatgcaataccggcaattttttggggcatccaaaatagttttgactaatcaacccatgttaccctgaaaattatgtggcctatatctgcattaagtcacctgtttatacaacatttctggtttcttatcctttttctttcttagtgtaaatgttgtatgctgattgttattgttagctgggcctctgttgcttcgtgtaattattcttgc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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0527100, RefSeq:Os09g0527100