Difference between revisions of "Os03g0680500"

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{{JaponicaGene|
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    [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 3]]
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GeneName = Os03g0680500|
 
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Description = Tetratricopeptide-like helical domain containing protein|
 
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Version = NM_001057438.1 GI:115454604 GeneID:4333725|
 
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Length = 7177 bp|
 
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Definition = Oryza sativa Japonica Group Os03g0680500, complete gene.|
 
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Source = Oryza sativa Japonica Group
 
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  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
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            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
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            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
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            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
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Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 3|Chromosome 3]]|
 
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AP = Chromosome 3:27782077..27789253|
 
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Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001057438.1 RefSeq:Os03g0680500]|
 
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[[Category:Genes]]
 
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[[Category:Japonica mRNA]]
 
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[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
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[[Category:Japonica Genes]]
 
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[[Category:Japonica Chromosome 3]]
 
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[[Category:Chromosome 3]]
 

Latest revision as of 07:26, 14 May 2015

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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