|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 4]] |
| − | GeneName = Os04g0340300|
| |
| − | Description = Terpenoid cylases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001059035.1 GI:115457799 GeneID:4335518|
| |
| − | Length = 10288 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os04g0340300, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 4|Chromosome 4]]|
| |
| − | AP = Chromosome 4:16078936..16089223|
| |
| − | CDS = 16079167..16079460,16080003..16080251,16082570..16082705,16085313..16085531,16086800..16087178<br>,16087718..16087976,16088885..16089148|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008397:16078936..16089223
| |
| − | source=RiceChromosome04
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008397:16078936..16089223
| |
| − | source=RiceChromosome04
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgtcaacttccatccctctccctttcttcttctctcatggtgttgtgcatgctaggataggccatcgtccaatccagccatcggttgggcttctttctgctggtgccccggcaaaagtctccttccgacgacaaagcagtgcgcatcgacatgctgcacatgttgtgtcctcagaatcaatcactcctgtaaaggaagtatctagctttgagccctctgtatggggggatttctttatcaactatgacccaaagccactacagagatcggaggattggatgatggaaaaggctgataaactaaaacaggacgtccgtatactgtttgagacgcacaatgatacagccaagaaaatgcacttagtagatgcagttcaacgtcttggaatagatcaccttttccaagatgagataaacaatgcaataagtgacatcaaagaaagtgaattcactagctctagtctccacgaggttgctctccactttcgcttacttagggagcatggcatttgggtatctccagatgtattcgaaaaattcaaaggagaggatgggaggttcatcaatacaatagctgatgaaccaagggcattattaagtttgtacaatgcagctcacctccttgtccatgatgagccagaacttgaagaagctatgtcttttgcaaggcaccacctcgaatcaatgagggacggaagtaggctcaaggcccctctagataatcaaatcaaccgtgccctacacttaccattaccgagaacctacaagagagttgaaatgttgcattacatgctggagtacggacaggaggaagaatgtattgttgttcttttagatcttgcaaagctggaatttaaccttctgcagcatgtccacttgaaggagctcaaagctttttctcagtggtggaaagatctttatggatatgtcgagctaagtcatgttagagatcgtgcagtggagtcatatctttggtcctatgcgctgttctatgaagaaaacttaacactcacacggatgatccttgccaagataattgtattcattgtccttatggatgacacatatgatgatcatgccaccatcgaggaatgcaggaagctgaatgaagccatacaaagatgggatgaaagtgctatctcattactaccagagtacatgaaaaagttctaccgtgcactgctgaattacttcagggagactgaagctcaagtagaggccagtgacaaataccgggtgacctgcatgaaaaaagagttccaaaatctatccacgtattacctgcaagaatttgaatggttgcatcaaaattacaagccagcatttaaggagcgggttgctttgtcaaccctgtccagtactgttccactactctgtgtgactgctgcagttggccagggtgatgcagtaacgaaggaatcatttgaattgacaacagtacgttcaagtgccgttatagcttgtgcaaagattatgcgtttcatgaacgacattgctgcattcaagtctggaagaaagaacaaaggagatgccgcaaacacagtagagtgctatatcaatgagcacaaggttacaagcgaagttgccttagacaagatcgaatcaatgattgaaagtgaatggagaaccctgaatcaggttcgttgtgatcatcaaaagcagttccatgtggtgcaacgagttatgaatttggccgtagcagtgccattcttttacgataagaagaaagatgcatatacattttcgaagtatcatcagggaaatgttgggaatctgtttgtgaatcctgtcaccctttag</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MSTSIPLPFFFSHGVVHARIGHRPIQPSVGLLSAGAPAKVSFRR QSSAHRHAAHVVSSESITPVKEVSSFEPSVWGDFFINYDPKPLQRSEDWMMEKADKLK QDVRILFETHNDTAKKMHLVDAVQRLGIDHLFQDEINNAISDIKESEFTSSSLHEVAL HFRLLREHGIWVSPDVFEKFKGEDGRFINTIADEPRALLSLYNAAHLLVHDEPELEEA MSFARHHLESMRDGSRLKAPLDNQINRALHLPLPRTYKRVEMLHYMLEYGQEEECIVV LLDLAKLEFNLLQHVHLKELKAFSQWWKDLYGYVELSHVRDRAVESYLWSYALFYEEN LTLTRMILAKIIVFIVLMDDTYDDHATIEECRKLNEAIQRWDESAISLLPEYMKKFYR ALLNYFRETEAQVEASDKYRVTCMKKEFQNLSTYYLQEFEWLHQNYKPAFKERVALST LSSTVPLLCVTAAVGQGDAVTKESFELTTVRSSAVIACAKIMRFMNDIAAFKSGRKNK GDAANTVECYINEHKVTSEVALDKIESMIESEWRTLNQVRCDHQKQFHVVQRVMNLAV AVPFFYDKKKDAYTFSKYHQGNVGNLFVNPVTL</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>9764..10057#8973..9221#6519..6654#3693..3911#2046..2424#1248..1506#76..339#aaagcaacgatcagactaccacactacaatagtatcagtgaactgctattgccctcccaagggaaatatactagtatgtcaacttccatccctctccctttcttcttctctcatggtgttgtgcatgctaggataggccatcgtccaatccagccatcggttgggcttctttctgctggtgccccggcaaaagtctccttccgacgacaaagcagtgcgcatcgacatgctgcacatgttgtgtcctcagaatcaatcactcctgtaaaggaagtatctagctttgagccctctgtatggggggatttctttatcaactatgacccaaagccactacaggtataccttttttattttcatattgtagaaaccctatcttgatccaatacaagcatcgtggcaatcgatatgagatgacataattaaggaataaggacgagatgatgtgagataaagagtcactagaggtcgggcagattgatgggcatattatttaggtttcgcctttttcacacgtggtgctattatgaggccgacctgtcaattgtttttatagacagctctgggtattttctattaaaaaatacgattttctcggcctttaagatgggcacctaaaagaatgatcctatttttctatgtgcctcctagctagcatgcttgcctatgaaaattgactctcatcgtagagccttgaccagagagcctacgcattttcacaggtaggtacttacttaggccgcctataaaaatatacgggttgttcacgaaaatagttctttatagcgtgggcaattactccctccaatgtttctcatttggtattctgacgtgcagattttcccaacacaacttcaactaagacttgacttttatagtaagaatggcatattttagctgtaaaatcaacggcaatattcacatgacaaattatataattaatacttctatatctatttacgtactttaaaaatgtttgcaagcactcattgtagaacggcacatatttggaaattaaaaggatggaggggcgacgtagttcacattttcctagtggatcaatggagttttatcatatttttttattacatttgatttaatgcagcttttggcaagaaaaaatttggtcaaatccacaacacaccaacaagttatctaaaaggaatgttttatttcacctaattattcattcctgtatttctttcatccgatactaacaaatcaaatttatgcatgcaaataaacagagatcggaggattggatgatggaaaaggctgataaactaaaacaggacgtccgtatactgtttgagacgcacaatgatacagccaagaaaatgcacttagtagatgcagttcaacgtcttggaatagatcaccttttccaagatgagataaacaatgcaataagtgacatcaaagaaagtgaattcactagctctagtctccacgaggttgctctccactttcgcttacttagggagcatggcatttgggtatctccaggtactaataaatactgaaagagataacttgcagagtgattttcacaaaattgcaacttggtcaaaactatctcactgcaacatttactatgtattttacaaacaacaacaatgccaaacaagtctattacaaaatacacccttcgtttctataaatctggtcaatcttaaagaagtttgactagcaaaaaagtcaaacgacttataatatgaaaaggagggagtaacaatttatccactatgtgcatatgacagataggcccaattttcaatagtgccagtatttcttatattggtgatgacttacatatacaaatttttgtatttttctctagatcacaaattttaagtcattgtattgtaggtattcattcattttcgtaattatggttgtgtcaaacaacttttcaatacaagtccagattagaatatatacataaaaattagtcaagaatatccgatgtattaaaaaattgtatgaaaagggaatctagtgtcttttggaaggaaaaatccacatttaatttagctgccttgcagatgtattcgaaaaattcaaaggagaggatgggaggttcatcaatacaatagctgatgaaccaagggcattattaagtttgtacaatgcagctcacctccttgtccatgatgagccagaacttgaagaagctatgtcttttgcaaggcaccacctcgaatcaatgagggacggaagtaggctcaaggcccctctagataatcaaatcaaccgtgccctacacttaccattaccgagaacctacaagagagttgaaatgttgcattacatgctggagtacggacaggaggaagaatgtattgttgttcttttagatcttgcaaagctggaatttaaccttctgcagcatgtccacttgaaggagctcaaagctttttctcagtaagagtctttctttgctttgtctttgtacatgtcttgtggatgtagataccaggtttattcatttcctttatctaaaaaaagagtatttatttgatatttatatatataataagtaaatatataccatgaaagtaattgattgtgccctttaggacagaaacaaaccactgtaataatctcaaatctgtgtatgtgcacgatacaactaccaaaatatgtttttcgatcttcgctctacagttagtaaagataatttagagaacatttagttattagtgaatgggccgtgcattacagtggagaatttagaagtatttgttttctaggaaagcttgataaaaacctattggaaattatttactcgtcatacctaaaaggactataatttgagctacgtagaagttgatgtgtaatttcaactcatgaatagttatgacaagtatgagagggattcgatggcttttactttctaggtgagatgttgctcaatacatcttgagctctaaagcaattatactaagtggttaattctgaatacacatgacatgtgggtagctatgatcaaagtaaaggaggaatccaaaggctgttgtatttcagatgaacttaatcaatacatgtggatattttagctctgactatataggatagacagatatagataagtgcaaaattctggagagacgttgtgttccttcgatgtactgaatggtaaatacataaaatgtgtacctcgttttagacaaattgacgctttgtttgtgcaaccaatttaatgttaattaatcacaaaatacatgtacaactttatgttttgtccagaagtagtcaatatatgtcatgttaatgaggtagttagtgtatccgagtttaggtatcgctttatctgtagtttcaagtattgaacaatagaaaattaaggtttatactactatataatttgtccactctcagataaaaaagaaggacagctagccttcaaggaatatccgaatattttatcaatctttgtctcagcatttgcagcagcaatacactagaggcttttatgcggctttaaacatccaataactagtgacatatactgaaataactagcaatatggctcttcatgttgttagtgttttcggtatgcctgatatgctatgtacatattattactatcataaatcaattaatactcattgcttctaatgatctaatatatatatcttaaatatacttcaaaacaagcacctaaaacaatcgatcattttaattttcaggtggtggaaagatctttatggatatgtcgagctaagtcatgttagagatcgtgcagtggagtcatatctttggtcctatgcgctgttctatgaagaaaacttaacactcacacggatgatccttgccaagataattgtattcattgtccttatggatgacacatatgatgatcatgccaccatcgaggaatgcaggaagctgaatgaagccatacaaaggtacgattaattaataggtcaaaaacaacagaaattaatatccttcatctcgagccaccaattgtaagagaaatcaagaaaaccgcacaacaaattatatttaaaagttctaaagtttcacagaatattataatatgttaaagatcaggcttttcaaaattgaaaggtacagatgatcaaatcagaagcccaaaaataaatcaaaatttaactattctacccctatacctgtaaatctgaatcaattgaaacttctaaacgctatgcatgaccgtgtgatataacctcatatacttaaagtaatttctatggaaaaatatacagagatagatagaaagagagagagagagagaacgtgctattgcctaacacgtagcatgttgtttaactaagcaatgtgtcacacgcgtgcccatcgatcctctgcacctctcccaccccttcattagctaccctctgcccctcccatgcagattcaatattttgtgtatttttggaagaccctacctatacttttacttctagatgggatggggaggggatagattgggatggttgtctctgacgcattgtctagatggccaaaagctggcagtctttttatttcaataataggcacatgcacatttttcatcgtaaccactacaaaccatttccgtgtccctatgaagatgactaatgccgcccagggtcatataacaaaagaaaactatttttacagatagctccttatgaaaaattgcatgtgaaaataggtctattaacacaaatgggtcgcgtaatttgaaaggtggggtcatttttatatacggatctcataagaaaaaatcaataaaattgatttttaagggcagttctattaggaaaccacttgtaactctttcctatgatgtcgcctaatgacaaatgttatgtgacaattatagttcttgttgagatgttgtagttaatgtttttctattttaggtagttaatgggatcaaaagttcattataagaagctttaaggtctacattagaattttttgttacatacgttgacgggtacaatttctataaaacaatatagcgctcgacaaggtttgtaactttctagtcaaagttatttcatttaagaacatttaggtgccgaaatattcgttacaaattcggaatctactttttaaaataggatgattttacaaacagatctttatgaagtctaaagttttaaaattcatagaaaatacaccttaagtccaattgagttaatccaaagttctatgagatccttacaatatttcctcaaatatggcctagtcaattttttttttgatatttcctttattatgaacattcacaaatgtcaagttgcataacacatcaaaacatacaatgggaacttgacataagtgaacaaggatattaccaaaatatggaccttacaaatttaatgaaaaaattgttgggatcatatataactttagttcacctcaatcgcacttcaaatgaacactacataaatctttaaggttttaatatgtgttacaagtttaggagagtttaaattagaagaccaacgtctatttcatagtaattaacaaagtgcttcatatgtaagatggtaataagtaagatacacatgaagggagagatcccggatttgaatcctacatactagatgcatattttgtgtgaaaaaattgcgaacttgtgataattaaaatatgaaatactttttgcgcctacaataattaaagacttgaaagtcgaacttaaaatacaaaaaaatagatttgttaacatgcagttgtgcaatccactagcacaaaactgtcgatttctataggccctatgtaacatttggttggctaaacacttccaaaaatgggggtaccaattatattgtaaccgcctataaaagtagttttccgagcattcaacattccacctctaattctagagcagcaaaacatgcgagtttttccaactactatgcaatgaccaagcagagtaccgctcatgcatacacatatattctactgtcattctatcaagaaacagctaaggccaacttttagttaattaaaacagagatgtgcaactggaggtagagctagctacaactaccaaaggtagctggcatcagtattcttgttaccgagctgttgctgccagcatgatatgaaccaacaatttccatgaacccgagctacttagagcaaataaaaaagaaattgtttattttaccttttgatgtttaatgcacctaaacaattaatctgagtaaagcacaactgaaaaaccatgttgatcctctaactaaataaatttgttgtacagttaccatcgaatttatcgatcactatacatctcaattaattatggtcacgcgtttcacacaatgttaacaagtctttcattcgagaaatattaaacatcatcaaaccactttattcgtcactggtacatggcgtgtccatttgagcataatttacaaagtatttcattcatttatttgtggtttcaacgcgatacatccctgtcaaactatctttttcggctagatttatttacacttgcctaattaagtaatttcataaaaattcccaattggcctattggacagatgggatgaaagtgctatctcattactaccagagtacatgaaaaagttctaccgtgcactgctgaattacttcagggagactgaagctcaagtagaggccagtgacaaataccgggtgacctgcatgaaaaaagaggtataccagttatatatgtactgcatctttccacttttatttcctgtatttgtttaaatcttcatattatgcattgatcgttaatggattcttcttactgtatgttatcgatatataccaagaaaagatcgtgtgcaccaatgaaatttgtcatctattggaataaactatccacatttattatatattcaatataagagcatcaccaacagttcccaaaattctatccctgaaatcttttgtttaaatcactaatgagaaaattttgggatagaatctagggctaacttttcaccaccaaacctaaaattttgaaaccatattgaacatctattactgatagaaaatcgtaataatccaggtaccaatacttatagctgtatgctcaacatgaatttgttaaaccatgcctaaacgataacacacgtgctttttcatcctcactttatgtaaaatgtttagtaagtgttgctagaacttggacaactagatacgtaaacttgtgtaaccctcccaaaattagcatggtaggactaaacttctcatttcatactgtacacacgtagacttctatgcactaccagacttgtgctaaccctacggatcaaaaattgtcagaaaaatagggtttatccgtagaaattgtatttttgagggaaccgacaagaattgccgatagaaaaatcacaacggagaaattatattttcctatgggtttccctatgtgtttaacacagaaaacttccattggcatcgggttttgtcgcctaaattgtgacgtgctgccgtcaggaaaaaagatcatgtggcaccataaaataaaatggctccaagacaacctcccgcccccccccccccccaacaattcaatccacatatccatatggattattgaacataactttttcaacaaaatatgcaaatgaactcttttttttttactgatacataagtgataaagctacagataggcatgcacaacaattcagcatcaaattttaagcaaacttcaatcctgtaagttatataaccaatacacgtacatgccaattcacatcaacaagaatcttttattcaccactataagttacaagttatggtactacatgtcctccggcagcaatattccaagctagatgagacaatgaatgcagatatcttatcccttttcgatgcatttttatctctatctattttctcctctttacttgccttgagaatactacagattatggtaaaaatatatcaacgtataggagacacacaatattgtaagctggtcaataagatcctgctatatgcttaaaaagttgtggttactgaggatactacaaacagcataatattgaatacatgtaagtaactgtcagtctaagaattccaaggatataaataactgattaatcatatggctgctattatcatgctttaatgttctatactatttatgaaattcatatattatttagcccaatagcttaaatggaattatctgccatatcaatctagctagcaggaagcacaattaacccatagcttatacttaatctaatcgtattccagcgggctttgcacaaaatatatatccttcactgacacacgaactacatatccttaacaagatggacagggactgaagatacacgcaaaataatgaactagctagagactttaagtgtatacatcgatctaaatatgttgttttttaatcataacaatattagaagaaaccaagggaaggccatggcttttttctacaataggaaactatgaagtcacaacctctcagcattcaagcaccttacttaatacagtagacaaaaagcattcgaaagaaaattacagacaaggatcccatcttagcatttcacaatagactggctttggctacaagcaaactggttagtttaaagtaaaatagatgcatcaacctgacattagcgtggatacattgaaacaacgctcacctccaaagatggctagctggctagctcgatcgggtagccggtgggtggtgactgccgaggatgaggggaagggggtggccggcacatgctctccttacagttggttgacctcgaaagcaaacggcagcgcacaaggatagtcaagtggaggaggggggagacactgtccactcacccataaataactcgacgaagttaacctttaactatgtataacttgcctaaaatgataattattggaaccgggtggagtatgtctttgtttgatgagtatggtagtagtgcggtaaaataattataatgatgtagctaactagttttttttggctaatttgatttgcatgggtgcagttccaaaatctatccacgtattacctgcaagaatttgaatggttgcatcaaaattacaagccagcatttaaggagcgggttgctttgtcaaccctgtccagtactgttccactactctgtgtgactgctgcagttggccagggtgatgcagtaacgaaggaatcatttgaattgacaacagtacgttcaagtgccgttatagcttgtgcaaagattatgcgtttcatgaacgacattgctgcattcaaggtatagatgcagtaattcaattttactgttttggaaaaaaaattgagagtactaattccatgtacttccctaatttattgtatttaaatatgtaaggctgtgttcggaactacgattcctaacttctactctcttattttccatgctcaagtttcgtgaactgttgagttgtgctttttttattaaaaaatctataaaaagttgctttaaaaatcatattaattttttcaagtttttaataactaaaagttaattaattgcgcgctaataagtcccctgttttacgtacactgggagaagttcccaacatagtttatggaacacagcctaaatgtgtatgcagtctggaattggatgctgaatgtggtccagctacttaatcactttacattactaaattattagtggagagctgaaatgttatatgtatataactagctatttcctacagcatataatattgaaacaaaaattgtcaagaaaacctaattatatattgtaaaatagaggaagtaacatatatttttttcacactcatgcagtctggaagaaagaacaaaggagatgccgcaaacacagtagagtgctatatcaatgagcacaaggttacaagcgaagttgccttagacaagatcgaatcaatgattgaaagtgaatggagaaccctgaatcaggttcgttgtgatcatcaaaagcagttccatgtggtgcaacgagttatgaatttggccgtagcagtgccattcttttacgataagaagaaagatgcatatacattttcgaagtatcatcagggaaatgttgggaatctgtttgtgaatcctgtcaccctttagaactgagctatcaacaatgcagcaaactatgtgcttacacaatgcttatgtaattctatctccatcttaaaataagttcacttttgtacataaatctggacatggtctatatccagactcatgtatagaatgaaatttattttgtgatgcaggtagcaattcttatgcgtatactctatgtgtacgttggtaattagtaaataaagatggcaccgtccgaagtgcattgcc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001059035.1 RefSeq:Os04g0340300]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 4]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 4]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
