|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 4]] |
| − | GeneName = Os04g0466700|
| |
| − | Description = Armadillo-like helical domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001059568.1 GI:115458865 GeneID:4336098|
| |
| − | Length = 7887 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os04g0466700, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 4|Chromosome 4]]|
| |
| − | AP = Chromosome 4:23717435..23725321|
| |
| − | CDS = 23718101..23718235,23718546..23718869,23719402..23719533,23719611..23719759,23719922..23720056<br>,23720147..23720281,23720383..23720476,23720585..23720704,23721482..23721568<br>,23721659..23721772,23721906..23722034,23722352..23722656,23723346..23723409<br>,23723577..23723723,23724022..23724180,23724434..23724603,23724741..23724863<br>,23724975..23725047,23725151..23725243|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008397:23717435..23725321
| |
| − | source=RiceChromosome04
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008397:23717435..23725321
| |
| − | source=RiceChromosome04
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggggaggccgaagggcggcgccgcggcgtcctcctcctcgtcgaagaagcccaaggcgaagccgaagcagcgcggcggcgtcgacttcaagaagtacaagcacaaggtggggcggaagctgccgccgccgaagaatgccaccgacacggagatcaagtccagagcgatcgtgctgccggagcagagcatggcgtcggagagggctggcatggccgtgaacaagcgcgggctcacgctgcgggagctcttgcagcagacgggccactacaatgccaatgtgcgccgagctgcgctgaatgggataaaggatcttgttgctaagcatccatcagagcttaaacttcacaaggttgcaattgttgagaagctacaggaaagaatatgtgacactgacaaggtggttcgtgaatccttgttcagtatactgcagtctctcgtcttcccatctttgaaagaggacaatgcaatatcgacacgcagtacactgtttctgctgatggccaatattttgaacggaatgacccatctatccatggatatccagttaatgtctttcagatttttggagcttgttgttattaatttcccatcctcctttccaggatacgctgaacaggtcttcaacaactttcttgctgtactgagcaatgacaggattcatctccaggataagagtaaacttaacagtgtccttagtgggctcgggcagtgtctttctcaggttgcttatgcaacagaaaatggtgatgcatcaaatcgactggttcataatctttctggtagggaactttggaaatgtactcttgatgaagataactcaggaagtagagcatttgcgatgtccaatatattaatgaagcttcaaaacctcttccagattctcgttaattctgtagaggtctcagtttcagaactttttgcaaagtcaactattgatgctcagtcaagtgaagcattattatcagctcttcactgtctggatctaatatgtaacatatgtattcaagaggtaaagaaacctcagatgaaatttggaagatccaaaattcaggttggacctgaatggttgaaaagttccgtgttagtatatgcaaagaaattgtggggagtaaaccgttcattccacgaaaagggagatgacagatattatgttttcaatctgaagattgctgaaatatttttgtgcttgagtgcatgtatggacaacaccatatttccagctgatgaattttgccagtttgtatcttctctacttgcaaaggcaaaaacacttcgcaataaggataccatggaaaagcatttgagcccacttataactttcataccagatcttgtatccaatgccccagatgactcaaaaggatatttattagaggcatttacagatgcattctgggattgcaaggtggattgcaagctgattttcccatatttggatgcagtgggaaaaatgctgtttcctgaaaaaacaggaatattatttgtggaaaatgattcaggctctgaataccatggtgtgtgggtaaaagagctacctggaattctactacaatcaattgacaaagccccctcagtaacaaaggttgttttggagctacttctaagaattggacagtacttccccacaatggagtttggaaatctgcgttccttcattaagttatttggtgttaaatcatcatcaggaaccatagagcttggtccattcgttaaccttccacgtgattgccaagaacttgccatttcatgcctttattacttctccaacctgcttcccgacacaatggagctgttggcttcttgttgcttaagtgatgtgctggaacccaccatattgtttagaattattgaggttctacagtcaacatacaaggctgggaatttacatataacagagcaactcagtttcttgtcattgctaatggcacgattcagagttcatcctgggtctttctctacccaggataattcccagaagggctcaaatatgaatacttttaaatcattgaaccgcctaattttaaattctctatctgaaatgggtgatggctccctggttcttgagttaatgtgggataatttatctaaagagattgcacagataccatctttacataacatgaatggattgtttagaattattgtcacacttgatgcaggaacttgtaagctcatgaacgaagatgctataaaaattatagctggctacttgattgatgctgctatggatttgtctaaaaccattgagcttggctttcaatctgataggacaagactatttcaatactttataaagccttgcataatcatattttgccagaacgagaaggttctttgctgcgcattggagatgcttaaatctttcgcaacaggagatgaccacgtgctttcatctgcatccaagttaaactacccaggagagctttcacatcgaatttgtgttgtcacaactatactcatattcttatgcaatgatggaaaactccataaaaacctttctttgggcaaatgtgttattaaaggtatcctgcaacatacaaggcatctcatggattctaatgttcttgatgtaacatatgaggacaagcagaagttaagatttgcatttgagcaactaaagacgaaagcattgcagttgaactgctgggacagaagtgagctggaagggttttcaagcaccacgtaa</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MGRPKGGAAASSSSSKKPKAKPKQRGGVDFKKYKHKVGRKLPPP KNATDTEIKSRAIVLPEQSMASERAGMAVNKRGLTLRELLQQTGHYNANVRRAALNGI KDLVAKHPSELKLHKVAIVEKLQERICDTDKVVRESLFSILQSLVFPSLKEDNAISTR STLFLLMANILNGMTHLSMDIQLMSFRFLELVVINFPSSFPGYAEQVFNNFLAVLSND RIHLQDKSKLNSVLSGLGQCLSQVAYATENGDASNRLVHNLSGRELWKCTLDEDNSGS RAFAMSNILMKLQNLFQILVNSVEVSVSELFAKSTIDAQSSEALLSALHCLDLICNIC IQEVKKPQMKFGRSKIQVGPEWLKSSVLVYAKKLWGVNRSFHEKGDDRYYVFNLKIAE IFLCLSACMDNTIFPADEFCQFVSSLLAKAKTLRNKDTMEKHLSPLITFIPDLVSNAP DDSKGYLLEAFTDAFWDCKVDCKLIFPYLDAVGKMLFPEKTGILFVENDSGSEYHGVW VKELPGILLQSIDKAPSVTKVVLELLLRIGQYFPTMEFGNLRSFIKLFGVKSSSGTIE LGPFVNLPRDCQELAISCLYYFSNLLPDTMELLASCCLSDVLEPTILFRIIEVLQSTY KAGNLHITEQLSFLSLLMARFRVHPGSFSTQDNSQKGSNMNTFKSLNRLILNSLSEMG DGSLVLELMWDNLSKEIAQIPSLHNMNGLFRIIVTLDAGTCKLMNEDAIKIIAGYLID AAMDLSKTIELGFQSDRTRLFQYFIKPCIIIFCQNEKVLCCALEMLKSFATGDDHVLS SASKLNYPGELSHRICVVTTILIFLCNDGKLHKNLSLGKCVIKGILQHTRHLMDSNVL DVTYEDKQKLRFAFEQLKTKALQLNCWDRSELEGFSSTT</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>7087..7221#6453..6776#5789..5920#5563..5711#5266..5400#5041..5175#4846..4939#4618..4737#3754..3840#3550..3663#3288..3416#2666..2970#1913..1976#1599..1745#1142..1300#719..888#459..581#275..347#79..171#accacgccgccgccgccgccgccgtctcgtcagcaagcgctgcccggagagagagagaaagagagacgcgcccgcgccatggggaggccgaagggcggcgccgcggcgtcctcctcctcgtcgaagaagcccaaggcgaagccgaagcagcgcggcggcgtcgacttcaaggtgagttccccccctcccctcccccaactgaagcgacgcccgctccgacgagctcactggtgttcgggtgtgtgtgtgttttttttctcttcgtggctcgcagaagtacaagcacaaggtggggcggaagctgccgccgccgaagaatgccaccgacacggagatcaagtccagaggtgagctgcgggcgcctcttttttttttttttccctcggtggcctgaggttttcgcagcagggcgcgtaatttagggtttcggattgtgatgtgcgcgtgtgtggttgcagcgatcgtgctgccggagcagagcatggcgtcggagagggctggcatggccgtgaacaagcgcgggctcacgctgcgggagctcttgcagcagacgggccactacaatgccaatgtgcgccgaggtgagccaccgataggcagtctctgcgcggactgccacccagatggccagataaacagttgattcgatcgatcgattcggcctgtgcttgatgagactagctaacttgggctgcattgttatgttattttgttgaagctgcgctgaatgggataaaggatcttgttgctaagcatccatcagagcttaaacttcacaaggttgcaattgttgagaagctacaggaaagaatatgtgacactgacaaggtggttcgtgaatccttgttcagtatactgcagtctctcgtcttcccatctttgaaagaggtatttccccacttcttgccagttatttctgaattcgtgagagatctcacgaggttgctatgattcacaagctattggtaacttgatcactgtttttcttcccccaattgtctattttagtttcatcatgctgaccatacgggctcttctagctactaatggatttccatatcttattccttctatcatttccattttctagttctatgctattggctgcatatgtgagacaattggtatctatttatggcaggacaatgcaatatcgacacgcagtacactgtttctgctgatggccaatattttgaacggaatgacccatctatccatggatatccagttaatgtctttcagatttttggagcttgttgttattaatttcccatcctcctttccaggatacgctgaacaggtgaatgggtttctttcatgtattggtgttttgaaagttgaaaaggttcttgtgttaggaggcaatgtattggtggctacttgcccctgacatgtgcccttcttccttttatctctatttacagaagatgggaggtgttaaattaacataaaatatttcatagtctatctttcatcaactaattatatgtaccaaggcatatgctattgaaacttcttctaattcctgctaggatttatgtgagatttagcacattcatacctagtaataatctcagtttcattatttcttctgataggtcttcaacaactttcttgctgtactgagcaatgacaggattcatctccaggataagagtaaacttaacagtgtccttagtgggctcgggcagtgtctttctcaggttgcttatgcaacagaaaatggtgatgcatcaaatcgactggtttgtacagttgaatcatcattttatattattttactcttaaaattagttggagctatagcaactaacttagtgaaacagaaaatttgcatgttcagcaatgtatctgtatcaaacaccttctttgtcatattggaatgatcagaatattttctaatcgtctacaggttcataatctttctggtagggaactttggaaatgtactcttgatgaagataactcaggaagtagtaagtcttctacatgtttcccatgttttattggtccctaatttgatattcaatttatgttgctacgcctccttaaattcaaattcatttgtaagataaccagagaaagctctgcagtaaacatatcagaccactcaacttaatctatattcatttacaatttagccttgtttaccatgcatttctagcttgctagctttttcatgaaacaacacactaaacaacaaatttactatctccaatgaactgttgatttatttatttattttattttattattatttattattattttattattattttttttttgggggggggtcacagttgcactttccttttggttatgtggactggaaaatgtttaatcagaatagttaattgattgttaatggaaatttgtttggtttagtttagaatacagtggaagaacaatactatatggaaatgacactgttgtattataaaatatcttttacgcttttttaagttttatgcacatcctacatgaatactccctccgtccaaaaatataaaggattttgggtagatgtgacgcatcctagtaatatgaatttggactgactcccttatattttgggacggaaggagtacttgttatttcttttcttgtgccattaagttaagacaggcttgatattatgtcttataaacctgatgcactgcaggagcatttgcgatgtccaatatattaatgaagcttcaaaacctcttccagattctcgttaattctgtagaggtctcagtttcagaactttttgcaaagtcaactattgatgctcagtcaagtgaagcattattatcagctcttcactgtctggatctaatatgtaacatatgtattcaagaggtaaagaaacctcagatgaaatttggaagatccaaaattcaggttggacctgaatggttgaaaagttccgtgttagtatatgcaaagaaattgtggggagtaaaccgttcattccacgaaaaggtttcaatttcttccccttttcatttctacctccatactactggtatgataatatttaaaacgtttcgtgaccaattaatagataaaatatgctactaatatgatcaaccaatagataaagcatgccatttttgtgttctctactcatagtgatatctgactctctgtggtatcaaaacttttggaaccctggctggagattaatttcagattttgttctattccagactgttaattgtgttcttcagaaagcctggttatagcatatcttttgctgacaatctcagtgatttcttatggaactcttttcatggcagggagatgacagatattatgttttcaatctgaagattgctgaaatatttttgtgcttgagtgcatgtatggacaacaccatatttccagctgatgaattttgccagtttgtatcttctctacttgcaaaggttgtctgtggctgccagtttcaaggactgatttctatcactggctagttgaaagttctttagtccgcttgtgcatgttgttctatagctatcgtcttatagacagctattaattattcatttattttgtcaggcaaaaacacttcgcaataaggataccatggaaaagcatttgagcccacttataactttcataccagatcttgtatccaatgccccagatgactcaaaaggatatttattagaggtatgactaattttccttttactgatctctagaaagtatttgggttactttttaacgttacgaaaaatgagagactatattcaactgcaggcatttacagatgcattctgggattgcaaggtggattgcaagctgattttcccatatttggatgcagtgggaaaaatgctgtttcctgtaggttccttctatgggatacatactaaacttcctttgctacataacttcttctctctttttttcttttttttttttttgtgggtgacgtgttcaggttattaagaaataggacttgatgaagagcatgcctagtgaaaattgcctacttggtgctaacacacaaatatcttttagggagaaatgcatctccacatgtacatgcattacatgcactattataactgtaagtgcttgaagatttgggtgatggtatgaagatctgtaggttgatttgaattttcagtgttcgaatctggattctggaaccacatttgatggtgatgttagttcatgtacctgcatgaacattggtgggttgtcaaattagttattagttaaaaaaaaagatggtgaatagtccttgtaccaatttatatcacatgaaattccaaaataaatctttaaaccgctgtatagagaaacataaaagagaacctttgtctaatgatgaatatagatataatcaaacaaggcaaaacttgctgtccccaaacaccatccatgctgagatttgaaaatttacaggttgttaagtcacttggtagatcgtatgttcaacttgttcctggaggactttgcattcctccttattagatgctcaaagcctcaaactaaataattttgcatatttcatcatgctgagaattacctccctacagctactagcgccaaaaatgtgctagtggataacggcttacatatgctttctattaatattcatttgcctgtggttaggaaaaaacaggaatattatttgtggaaaatgattcaggctctgaataccatggtgtgtgggtaaaagagctacctggaattctactacaatcaattgacaaagccccctcagtaacaaaggtctgctataggtttatttatccagtatagagttggaatactcagattgggcattaatgaaaccttttcaataaatagtgtactttatgatcatatgaattatcataggttgttttggagctacttctaagaattggacagtacttccccacaatggagtttggaaatctgcgttccttcattaagttatttggtgttaaatgtaagtataaaattactggttgaagatcttttttatcctctatgatttatcgctttatgtgtaattccatttttcttggactaatgacattttgctaatagcatcatcaggaaccatagagcttggtccattcgttaaccttccacgtgattgccaagaacttgccatttcatgcctttattacttctccaacctgcttcccgacacaatggagctgttggcttcttgttgcttaagtatgcatttttgcttctctgttctgcgtttagtgtcgttatattctttcctttaaggattacaggtggtacataatttatggaatgcaggtgatgtgctggaacccaccatattgtttagaattattgaggttctacagtcaacatacaaggctgggaatttacatataacagagcaactcagtttcttgtcattgctaatggcacgattcagagttcatcctggtgagtacttttttttttggaaggcaaacttttcttagtttaagtggcttactttaggtgaaaatttcatactatgtgttttgctctttaagttttatcctctaatggttattttatctgacatttttttctaacagctttccttttgttttgttaaactagggtctttctctacccaggataattcccagaagggctcaaatatgaatacttttaaatcattgaaccgcctaattttaaattctctatctgaaatgggtgatggctccctggttcttgagttaatgtgggataatttatctaaagagattgtgaggattcaaaccatgctatgtttttatgttttcacccaaaatccattgaactcatatatgtttgttttgtgcaggcacagataccatctttacataacatgaatggattgtttagaattattgtcacacttgatgcaggaacttgtaagctcatgaacgaagatgctataaaaattatagctggctacttgattgatgctgctatggtgtgtactcttctgaattctaaagctctggactctggtatttgcagtcagtaatttggtaaatttgtacgctaattcaggagaacgtagtcgaaaatggcagattagtcgaaaatggcagattggcgtattttgatgttagaaaacctattgcctatagatctgatataatcggatctaacattattttatgcatattctttgaaaactatgagagttcactaacagagcatatttacgtggtagcatagggagagtatcgtgagtaataagctcttcacatcacctggtgaagcgcagagtgtcagattgaatgcattacggcataaacgtttttttcagttacactagcttatggatggtaattatgagtttgacacctgcaaagcttttggcaaacaggtgcattaattcattgtcatataaattagaagcgcatctccttgattagttcataagcattgctttatcgctgtacttttttgggttttgatgagaattgatttcacccaattttattgtgtacatgcaggatttgtctaaaaccattgagcttggctttcaatctgataggacaagactatttcaatactttataaagccttgcataatcatattttgccagaacgagaaggttctttgctgcgcattggagatgcttaaatctttcgcaacaggagatgaccacgtgctttcatctgcatccaagttaaactacccaggagagctttcacatcgaatttgtgttgtcacaactatactcatattcttatgcaatgatggaaaactccataaaaacctttctttgggcaaatgtgttattaaaggtatcctgcaacatacaaggcatctcatggtaagtggtgataacataaatgcctttgtttggtagccatattaactgatgagatttcagtttcctacattttagtcatttttcatattaatcttaaattcagggaggtcagaatatcaagggcaaaattgaacatttgtgcatgtgaatcgtatgtagactagtttgttgaatttgttcctactatgagagaatatttgtcctgtgctgtacctagatcactatcactagcttgctctattatgcctaaatgtcgttgttgtgaaactggccttcctaatgagtttgctctattcaatacttgctgcaggattctaatgttcttgatgtaacatatgaggacaagcagaagttaagatttgcatttgagcaactaaagacgaaagcattgcagttgaactgctgggacagaagtgagctggaagggttttcaagcaccacgtaaatagtaccaaatactaatggtatgtgggctccttcgtcattgtttgctaattatgttgatttattgtttttttttaaaaaaacgaatgaacttacttccatcccatatgataggtactgccgtaatgtgaaaccttactctgcacgggatgaaaattttgacgaactgaaggtgaagatggagagtggacatggtgactggtgaggggcagaaggatatgtgccatccgacctgcgtcagactccagtatacacctctgctgttcagctgttaccaacactttacgaaggtctgtactttacccaaagattaatttcacacttcgattctatcttaatcctatgtttcccaaacggtctacgatttgccataaacacacgagtttctcaggagcactaggtagatttgtcatgtttgacaacaacgtgcctgacagtaatatcttgctattgcaggtggccggaaaatgcattgttcacatgttgggaacgaggtggtccactggtccatgtatcattgtggtacagcgcttggttttgatgcaacagaattgcagtttagactgctcaatagaccataggttatttcaccgaaaggtttacatttcaacctacatgtccatgtaagaatcccgatgtaaatgtagaaattttgttttggaagttc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001059568.1 RefSeq:Os04g0466700]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 4]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 4]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information