Difference between revisions of "Os05g0203800"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
    [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 5]]
−
GeneName = Os05g0203800|
 
−
Description = Similar to MADS box protein|
 
−
Version = NM_001061424.1 GI:115462578 GeneID:4338067|
 
−
Length = 11215 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os05g0203800, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 5|Chromosome 5]]|
 
−
AP = Chromosome 5:6428944..6440158|
 
−
CDS = 6429209..6429212,6429716..6429777,6429962..6430003,6430105..6430146,6430246..6430345<br>,6430440..6430501,6431041..6431122,6439191..6439450,6440008..6440055<br>|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008398:6428944..6440158
 
−
source=RiceChromosome05
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008398:6428944..6440158
 
−
source=RiceChromosome05
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atgcacatatacaaagagcaggaggctgaaccatccactggcctgatgatgccagagccagcacctgttgcttcccccggctccggtggctcaggtggctcaggctcggtgggagctgagaagattgggagcaggggaaagattgagatcaagcgcatcgagaacacgacgaaccgtcaagtgaccttctgcaagcgccgcagcgggctactcaagaaggcgtatgagctctccgtgctctgcgatgccgaggtcgccctcgtcgtcttctccagccgtggccgcctctacgagtactccaacaacagcgtgaaggaaactattgagaggtacaagaaagccaacagtgacacctccaacgccagtacagttgcagagatcaatgcccagcactaccagcaggaagctgctaagctgaagcaacagatcaccaacctgcagaactccaacaggaccctagtaggtgataatatcaccaccatgaaccacagagaacttaagcagctggaaggcagactggacaaaggcctaggaaagattagagcacggaagaacgaattgctgtgtgctgaaattgagtatatgcagagaagggaaacggagctgcagaatgacaacatgtacttaaagagcaaagttgctgagagtgaaagaggactgcaaacagtgaacatgatgggttcagcatctacgagcgaatga</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MHIYKEQEAEPSTGLMMPEPAPVASPGSGGSGGSGSVGAEKIGS                    RGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRSGLLKKAYELSVLCDAEVALVVFSSRGRLYEYSNN                    SVKETIERYKKANSDTSNASTVAEINAQHYQQEAAKLKQQITNLQNSNRTLVGDNITT                    MNHRELKQLEGRLDKGLGKIRARKNELLCAEIEYMQRRETELQNDNMYLKSKVAESER                    GLQTVNMMGSASTSE</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>10947..10950#10382..10443#10156..10197#10013..10054#9814..9913#9658..9719#9037..9118#709..968#104..151#actccatctcatctcatccttccccaaccattctcttctccttgaacacacccctctcttcctcattataatctcttctttgattagagaggaattagcaaacatgcacatatacaaagagcaggaggctgaaccatccactggcctgatggtaattgtttttcttggcttggaaactcctaaatttcctcttctctttcagtgtcattttgcaagagggtttggatttcttttttaattgtatgcatatgggagctttgggaaagtagaaaagtagaatcatggctgctagctgatgtgtgagaatagctagatggccatgaagagggagagatatagctagagatctttagtctttaagcaaaacaagaaaaagaagaaaaaaaggtgaaagaaaggcacaagatcaaggagattgatcaccacaggaccaaagatctctccttttttttcccctcaaaaaaagatctctcctttttccttcgatctacaagaattatacaactcacaaaagggggctgtagttacatatattgatttttaagagagatgatggccatgatgtctccagcacttcttgattttcttgccaaagatccatcttccggtcttgcaatttcttgattatgttggctcatgctgtgctgctaagttcttacatagaggactgagtcatatctctggaattattttgtgactcaaatttagatgccagagccagcacctgttgcttcccccggctccggtggctcaggtggctcaggctcggtgggagctgagaagattgggagcaggggaaagattgagatcaagcgcatcgagaacacgacgaaccgtcaagtgaccttctgcaagcgccgcagcgggctactcaagaaggcgtatgagctctccgtgctctgcgatgccgaggtcgccctcgtcgtcttctccagccgtggccgcctctacgagtactccaacaacaggtactgcattcctcttcctctcttcagctctagaaacctaaattaatccatgtgatatatgttatcttgtcctaattggagcaagttagttgctaccttttcttgtgacaaggaggaggcatatatatggtgatgtgcgtccatctcaccttcttttctgttactacatatatgtgcttcagttaattaactgtcttgttgttacttctgtgctttcttgggggtagtagcaactagcaagtgagaaagaaattgcaggagtttctttgtgtgtgtgtgatgatctgtgtgcttgctgatgtggtgtgcacatttctggtttcttttgtgtttcctgtgaggtgagctagatgtgtagatagattcagcacaatgcatactttgtgaagcaagcatgagcatgtacatgcattcttgtgagcttttcttgtgtgtgatgggtgtctgtgactgtgtgtctgtgtgtgttgctttggcttggtggtcctgttcttttattgctccatttatgttctttcctttctctacctctgtctgtgtgatgaggcttgcttagatccttaatacctcactgcatatagcgatcatatattatattttctctattggctatgcatgtgtgcagtaacttgtaactactagtaactagtatgcaagattgtgggcatgtgaggtttgatgttttttttttcagaggtaaaaagtggtgtacacgagtgatgcacacattgatcattcatgattcttttgcatcatcttcttcaattggaggttagttagggttagggtttcatcacatcctccatctctctctctctctctctgcagagtgctgtagatgttactgttttcactagtcatttctctgttcatttacagccatgtgtggtttcctgtattaacaggatgccccatcacgagtgctctgggcccctagctacctatcctctctgacaccggcactgtacttctcatgaggtaccgaacacagtgaagtcagcagtaaataggaaaaacagtgcatgaattacccttttttttctccatctataaggtttggactttcatatgtatttttgttactacctaaggtttacagattagtaatttgtgcaatatttttagtagagaatcttaaggatttgttgtgcttctttttccttgtgcgattacagaagaaatacacgcacacatgacaccacacacgcagaccacactcacacaagtgtgtgcttagttatgcctatagttgttcagccaagaaaggataaagagtaatttatactatataatcaggatgtatgccatgataatacccttatgttctaaatcctaatcccatgtgaaaaaaaattatgaaatgtgtgatcccctgtgagtctgtgactacacatgaatgaactactagtagtagagatgagtaactagtactagtagcaaaaagatctagaaaaaaactctaaactagatcatgtatgatttgtccttcatttttaaaattacgttttaataacccgtcttggttaagaaaaaatatctttacttaaacaattaaacttcatactccaaatgttaataccctgcacaacactatctagcttagactctagtatcatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagtaaatttgttatatatatactcctgtattatcttgttggattacgacggactggtcaatacgtacgatagagatattttttgtgcatttcttaaaagtgatttataggactcccattaatttaacagtgaattttccttgttttgatctattgagtaataaaaaaattggtttaacaattgacgacttgtttggacaagaagcaaattctttgcacagcagcagcagacaaacacactctctcagtacgtgtgcgtgaggctgcaagtgtaaaactgtacactgtactgtgcagaagcaaaaattaaccaatggcacggtcagtagaatacgtacaaatggcagcgtttgcatcgggagactacaaagagaaaaaggctggtttacccggtcagaatggttaaggtccctgtctgcctggctggctggctaggttggaccgtagctgcttctctctcttgcattggctctctctttctctctctataagccattggtcacttgggtactcatatgattcactgtttgcagccagccaatcatgatcatgctggctatgtttagatccaaactttagatttaaatttctaactttttccatcatatcgacctgtcatacacacataacttttcagtcacatcgtaccaattttaatccaaactttcaactttggaaggaactaaacacagccgctgttgtcaataggatgctcgaagatattaaggttttgtaattcgttggtaaacattactacaagacaatgctaataaaatattcatttaggaagaattttagagaagtgttgctacttgttcacacatgctccatgttaatttgttccaatgagcttgcatctttgtatttttctttaaaaaataaattgttaagaaaatcattgttggtcaaatttgcttggaccatgatttcttcacatgttttttcttgtttaaaaatgtatccaataataccgttcctatgtgtgtgagagatagacagaagctgacttgcattgcttttatattggctcttgggaatagttacttggcactattatacgtatgtgacgtgacatttgctctgatcttgcctttgagaattcatgtttggtcttgacgaggaaagggaaatgatatgatagttttcttggttagatttttgtatggcactttattgcttatgggcatgcctgagattgacaaagtgacaaagtgttggagtacgaaatgtggccaaatgatcttgtctgtcaattttcagcaggagtacgtctttctataggaactttgtgatatcctctttggtttgtactctgtagtagtctcgatcagataggggtgtaaatgattaacccgtgacctcactcataagtaaatatataaaataagttacttatatgtcaaaataagctgtttattttattgacttataagtaggtttgtggttagccactaagtacacccttaatctaggacaatatcaaaggaaaattagttacacatattttgtactatttcaattagatgatgaacgtatatatactttgcgtatagtagtagtttttcttgtatcaagagaggaaaggacgttactctgagtcctttcttgaaacgtgtacaagatctatgatcaaggcatatatgcatagtttttatgttgttagtagaaaaaaatggctaagtaattttgcaaaattttttttggctaaaataatgaagacaactagaaaggtagcccgcgcacatgcgcgggcatcttctcgtataatgtgaatgaaattttattatgaatatttatatgcaggtggctttttattaaaatttcttgtattatattctaaactaaaattaaacttattttgtgtgctttgaaagctttttctatttttataattacccttgcaacatataaattctaaaataaaattacttgagatcatgtggttttgaattgatgagaaactattgtgtcgaaacaatggaggtggttcctatgataaaatttagggtattttaaatcgccaaaaggatagcttacaacctcaaaacaaattcaataatatcattttttttgtttgattgtattttaatatatatatatatatatatatatatatatatattcattctaaccgtccttgtaaaatgtttgaatttttctatcaagtattggttttaaatccaacaaaatttgttcaattttcaatttatttcatgcccatttttattttttttcttttggatagttttattctatgaatcatccttgaaatgatttgatctttgcaatttgggacaaaaatatcagaacacataacctagtatggggtaaaggtatacgttctaaattttctctcctgaaatataaaagtaatggtcataatgtatttagcgaatcatcactaaagtgtattgtcttataacaaatacatgtttctagattgttctacgtcaagactttacaatgtactgtagcaagcttaataaaaataaataaaaaaaggacatggtcattaattcctatatggaactgacttgatttattgctaaagccactgcaaggttgttccacggttaaaatccttaggtacaacccacatgcttatcgatatgatgttcaaccaaccacaccttcattttcaccctattgtctatattgctagatgaatacctgctatgattagtgacttcgtagatcatatgtgtaattcggacgctatgatcatctttcttaaaaatatttatctatgtactaaaaacattattttgaaagtatcaaggtcaatttgtataggcatgttaagagaaattaattaagttggcagaaagtctttagatgcctaacatgatataagtaataaatggaggtccatttgtgtttttttcccatatagataattttaattttaattgtcaaggagataaaaaatagagagaaaagaatggcgcacgctgtacatgggcagggagggagggagggaggtttgggatgtttttctaaatgattaatctaacagactaaaataatgtgtcagatgtttatgtcgaaaccgatggtcggatgttttgttttcttgtcagaattttattaggattttatttgatttaagagaataacataatatcttaagagcatttataagatgtgtaatcgacttttaacaccgtatgccgcaaaggagggagggaagaaggtttagggtgttcttttttttttaaaaaaaaagatctaatgacctaatataatgtgtcaattaatccattgaaaaaatgtgtccatcgatttatgtcatatctaatggttgggttttttttttccaaaatttctaagatttttctctaatttaagaatgccatataatagcttagaggcattaataatatatttaatggattttaacaccgtacggggatggggagggagggaggaagagaggtttgggttttttcttattaaaaaactaacaaatcgatagccaaatgttttgttgtttttttaatattttctagtattttatttaatttaatagcaccacgtggcagtttagaggcatttgtagaatatttagagttacagagcgagagctgctagacctaataggtggaggtctctttgtgatttttttaatgtaaaaataattttgattatgatttctcatgaacatagctcgttggtacgtacgtgacgggaggtttggaatgcgtgctttttttaaaaaaatctaaccttctaatataaaaataatggatcaccgatttaaataaaaatcgatgattggattagagtgcacttgacgacctaggagtgtttgtaaggtaccacttgacgaattaaaagtatttgtaagatgtttaatgaacttttattatataattgtctttttttgaaatttaagattttatttaatttaagtatgtgatatagtagcttagaggtgtttacaaaatgtttaatagattttaacactgcacaggggtggagagggagggacagaggtttgggattttttaattaaaaaatctaacaacttaaatccatcaatttaagtagaaatcgatggtccatcgttttgtattttttaagattttttaatactttctctaataatttaatagtaccacgtagcgatttagaaatagggagagctgctagtcctagtagttggtctatttgtgtttttttacctgtaaaagtatttttgtttttattttctcattaaacagaaaataacacatgaatgaaaatatggaaagacaaaagggaagtacgtacagtacatacgcacgtacgttcggcgttacgtacgttggtttcttttttctttataaataaaatagatctaactaaatccaaccatccaaaacaatgggtctaccaacataagtaaaaatagatggtcagatttttcttatttattatggtgccacttggcgatttgagagtgtttatagggtgtcacttggcggtttgagagcgtttataggaaatttaatggactttttagtatataatagatagatagataaagtggaactcttaggttatatggtttcctagtgttcataatagcaaagacattagctatttggtaaatccatagaatactgataataacttattagtaccaattacaatgacttcagatcagacttttaagtcctgttatagctatttatatatgcagctactccctccagttttataattcttaacgtttttgacagtggcacgaacttcaaattatatctttgacattgtttttctactataatatatacaataaataaatgtatgttttacttttattgtagaactttgaaagacaaattcatatatgtttttcttgttgttttaaactaaatactttttaaagttattgatagtcaaagttacaaaagttaaaccttgtccaaaatgtcaagaactgtagaaccaagggagtacaatttaagcagctattttcagagaattccttatgcttacatgtatgatgttgatcgattcccataaaaatattctgattacatgaaatcctaaggcgctggttaaatctcaccccaaaatttttcaccctatcacatcaaacatttaaacacctgtatgaagtattaaatataggctaaaaaataactaattgcacagattacgactaatttgcgagacgaatcttttaagcttaatttctacatgatttgacaatatggtgctacagtaaatatttgctaatgatggattaatttggcttaataaattcgtctcgcagtttataggcggattctataatttattttgttattagactacgtttaatacttcaaatgtgtgtccgtatatccgatgtgacacgtcaaaactttacacccctgaatctaaacacccccgaacagaacatatttatttctcatataatttgaaaaaaatcataaatcacatctgagcatgcaatacatgtatggctactgggcctctatggctctatagagttgagaaaagatgtcctcggtaaagcgcaacaactgtagcaggtagaatgacttgtgatgtaaaatttgtactagactcctgttcagactttttcaacctctccccggaccggtggatttggcattgttcttggagacaaacagatgaacacaacaatggtatatacagtacagtgtttgtacagtactatgacactcaatcttactggcttcctgatctttttgcaaattttattagcaatgactatatgaaagttagggggtgtttggatccagggactaaactttagtccctatcacatcggttatttgacactaatttgaagcattaaacataaactacttacgaaactaattatataaatgagagctaattcgcgagacaatttttttaagcctaattaatccataattagcacatatttactgtactatcacataggctaatcatggattaattaggctcaatagattcgtctcgtgaattagtccagggctatgaaaggagttttgtcatttgtctacgtacgtttaatacttttaattagtgtccatacatccaatgagatatatatggactaaaaatttttagctccatccaaacagcccctcagagtgacatttttttacaaccaaacaatgctttagattaaacattaaataagatcatgccacagttgttttattgtttagaaaatgaaaggtggcccaaactgccactaactccccttttttttttgttgatatccttcaggaaaaaccccatgttagtttgaagatttgaacttagacatatgtataattggtgaaaaaaaaaaattctagaagaaacttctataccgtggccaaaacttcgtagttattcttacttccatggacgtatgtgtgcaagtaaactaactatttatgtgtgctactatgcacaaatgcagcgtgaaggaaactattgagaggtacaagaaagccaacagtgacacctccaacgccagtacagttgcagagatcaatgcccaggtaacatcatctgaattctcaaacaaaaaaaaatcatctgtcagtacaaatgcagcatgcagtagttttctctggagcttttatcattcagcaacaatgcaacattccttgtaattaaccaatggtttctatgctgtaaaaaatgagttctctgaccaaaatcttcagattggacatcctgaatagaagctacagtgctttacacaatggaaattccagtgatgctatatatatagtagtagtatatagttttgaccaacagacatactcctatctgtgtttgtccactggacaaagttcttcatgattccatgcttgaaaattgaaatggctcactgcatgtttttggcacttttgtcattcattcatgcatatgcatgcatgcaggttgattacacagtttaatatggtatgatttgatgatgcacatttgaacaaaataaacatgaagagtcaaacattccagttagcaaactgacacaacttgtcatgattttaactaccagtactaaaaaaaaaatcaaattacaaacttgcagcactaccagcaggaagctgctaagctgaagcaacagatcaccaacctgcagaactccaacaggttcattatttcactcagctgcttagaatttttttcaacttgacaaagtagttcatctggttataactaaattctccattaattaatgaattaggaccctagtaggtgataatatcaccaccatgaaccacagagaacttaagcagctggaaggcagactggacaaaggcctaggaaagattagagcacggaaggtatattaattgtgtgctacatttacatagaattccaagttgaaaagggcatattgttaattaattcatctaatttgataagcattccatatcctgcagaacgaattgctgtgtgctgaaattgagtatatgcagagaagggtaaatactatcagcaaaataccactgttttctttcttgcaaaattatttggtctagttaattgacatcataagataacagcacgagtataatcttttcaggaaacggagctgcagaatgacaacatgtacttaaagagcaaagtaagtattctgttctacattgcaaaaaaaaaagaatgagattcgctttcaaaaagagattaacctagctacatggtaaatctgaattgaagttactgaaataacctacatatatagcaaatcatacctaattgactgaaattctacgtcatcatactaattaattataattattattgtgaaggttgctgagagtgaaagaggactgcaaacagtgaacatgatgggttcagcatctacgagcgagtacgtgcaaaatatgatccattatgatccaagaaacttcctgcaattcaacatcatgcatcagcctcagtattatcctgaacaggaggaccgaaaggcctttatgtcaggtaaaaaatattctcagtgtaacatagtcagagttcatagttcaacaaatgaaatttgaatgttcattaccttctcattgtaagcatctgagtcgtagttagagacatcaagtttttcaaaataaaaaaataaaaaataatgaagagttttcttgggaggattatattgcagggtcagaaatgtgtagggcttatctcacattctaggtattgtttggatttgcttgcaaccataagaattataactcaaatttcccttgcatcaaattatagaaggaattcggaggcataagttatagacaaataatgtggtcgagacaagtttgtgcaagtacgttcagatgcaacgcgtaactaattttgttttactgtttacattccttgcacttgcagatgaaagataaatatggatccgtatcatgcaactatctcaatcatgcatgtgccttcttcaaggagactgatcagttagatattacactgtgtcagtagaacttttatgtgtgaactcttgtatgcatgaataattaactttatcccataattcaggcttggcactatcaaggtgatgtacctaagtattggttcaacctgtgaaattaaaatacttcatacccttcctatgtttatatatgaaatattggtgataatatcttgtgtat</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001061424.1 RefSeq:Os05g0203800]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 5]]
 
−
[[Category:Chromosome 5]]
 

Revision as of 08:21, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information