Difference between revisions of "Os05g0219300"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
    [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 5]]
−
GeneName = Os05g0219300|
 
−
Description = HAT dimerisation domain containing protein|
 
−
Version = NM_001061477.2 GI:297604065 GeneID:4338123|
 
−
Length = 6310 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os05g0219300, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 5|Chromosome 5]]|
 
−
AP = Chromosome 5:7313375..7319684|
 
−
CDS = 7313375..7313510,7314175..7314199,7314305..7316076,7316459..7316505,7316620..7316736<br>,7316860..7316996,7319600..7319684|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008398:7313375..7319684
 
−
source=RiceChromosome05
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008398:7313375..7319684
 
−
source=RiceChromosome05
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atgtcagtcgcattactgctgtcaaaggatctcgttctcacgctcatcccatgcatccacatacatgacacgacgtgcatctatgacagtccagtactctccaaacctagcgtcatcagtcgtccatggctccactccttccgccgccgccgctccctccccttgcttcgcctcctccacctctccgccaccgtccgcgaatccgccgccaagccgtcgccggtgcaggtgaagcagaagaagaggaaggtgcgtgcgccgccgggcgctggcgaggatgtcctcctctggcggtccggccgcgtcgccaatctccctgagaagcccaagtaccacgacgagttccaagatttcaagaagaagataaggaggtatagtgaatgcagcttaagattgacagccaccaaaaagtcaggaacaagtcaccttattaatcacatagccgaatcatgtccagctattgatggtgatgctagaatcaacttccttgcaacaattaagaaacagactggggaaggtttcgtgtttgttcccaagagaagccgggagctaatggtcagattcttcattcatgcagaggtgccattcaagaaaattgaggatccttattttttggagtgggtggagtccatgcagccaactttcaaagttgtggggtgtcaaacacttcgtgatgatgcctttaacttgtatgagcgaatgagggaagacttgcatgctgaattacataatcttgattcgcacgtatgtctaacatctgatatgtggacttcaattcaaaatataggctacatggttgtcacagcacactatattgatagagagtttaacattaagaagaaaattataagctttaaggaattgaagtatccccacacgggattcgccattgaagaagctataatgagttgcttgacatattggggcattagaagcaaactgtttactataactttagataatgccagtaataacaattctgcatgtcaagagttgataaagaatcacaagaatgcattgatgtttgagggtcagcatttgcatgttagatgttgtgcccatatcctaaatattttggttcaggatgatatgaagataattaaacctacaatacacaagctacgtgagttgttgaagcatttagattcttcagtatcaagaatgcaagatttcaattctatggcaaactcgaaaaatcttccttcgaagttgagtttttcttttgatacaccgactagatggaattccacctataaaatgattgtagaaggattaatgtacagatctgtcctggatagctatgcaaatcaacatggtgaagttgcacctactgaactagaatggcagaaagttgaatcaatttgtgcttttcttaaagtttttgaagaagccacattatcggtgtcagcagataggaaaccaacagcacataggttcttgcccttggtgctacaaattcgtcatgcattgaatgaccctgattggcagactagtgatattttaaaggtattggctgcagctatgctctcaaagtttgtcaaatattgggacagtgggtttaactctgcacttgtcattgccacaatgttagatccaagaagaaaaggagattatttgaatttcttttatgagaaaacatctaacagtgtgacagagattgtagaaaaagtgggttctgctgaagattggttgaaggattattatgaaaaatacgaagggtttgtaagaagaaatgatgaacacatgctttcacattctcgtgaaggcagcagcagtgttggatcacctgttcttgggaaaagaaaactcgaggaagagtttgctttatacaagtctcgaaggaggactgcacggcaaacgaaatcagaatttgccatatatttagaagaagatgttgaggaggatagtgagagtttcgatgttttggactggtggaagagacatgctcaaaaattcccggtattgtcatctatggccagagatttcctagcaatacccctcagcactgtatcttccgaattagcattcagttgtgggggcaggatacttggtgacacacgaagttcgttaacacctgaaatgcttgaagctctcatttgtgcgaaagattggttaattaaagccaacgatcctttgatcaatattccaggcgctgaaggtggtgaagtgaagaagatggaaagtgtgagtgttcgccggctgctctgctctgctttgcttcctgccgtggattgggtatgggttggaaaatggattccacccgtggattgtgttgaatttggactgagcaactttgtgggttgggttgggtggggttag</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MSVALLLSKDLVLTLIPCIHIHDTTCIYDSPVLSKPSVISRPWL                    HSFRRRRSLPLLRLLHLSATVRESAAKPSPVQVKQKKRKVRAPPGAGEDVLLWRSGRV                    ANLPEKPKYHDEFQDFKKKIRRYSECSLRLTATKKSGTSHLINHIAESCPAIDGDARI                    NFLATIKKQTGEGFVFVPKRSRELMVRFFIHAEVPFKKIEDPYFLEWVESMQPTFKVV                    GCQTLRDDAFNLYERMREDLHAELHNLDSHVCLTSDMWTSIQNIGYMVVTAHYIDREF                    NIKKKIISFKELKYPHTGFAIEEAIMSCLTYWGIRSKLFTITLDNASNNNSACQELIK                    NHKNALMFEGQHLHVRCCAHILNILVQDDMKIIKPTIHKLRELLKHLDSSVSRMQDFN                    SMANSKNLPSKLSFSFDTPTRWNSTYKMIVEGLMYRSVLDSYANQHGEVAPTELEWQK                    VESICAFLKVFEEATLSVSADRKPTAHRFLPLVLQIRHALNDPDWQTSDILKVLAAAM                    LSKFVKYWDSGFNSALVIATMLDPRRKGDYLNFFYEKTSNSVTEIVEKVGSAEDWLKD                    YYEKYEGFVRRNDEHMLSHSREGSSSVGSPVLGKRKLEEEFALYKSRRRTARQTKSEF                    AIYLEEDVEEDSESFDVLDWWKRHAQKFPVLSSMARDFLAIPLSTVSSELAFSCGGRI                    LGDTRSSLTPEMLEALICAKDWLIKANDPLINIPGAEGGEVKKMESVSVRRLLCSALL                    PAVDWVWVGKWIPPVDCVEFGLSNFVGWVGWG</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>6175..6310#5486..5510#3609..5380#3180..3226#2949..3065#2689..2825#1..85#atgtcagtcgcattactgctgtcaaaggatctcgttctcacgctcatcccatgcatccacatacatgacacgacgtgcatctatggtttacttttcctattgtagctcagatcttggtcgccaaggaattaaggtcaagtagaaaggtagagttcaatatagtttcttaattaataaatatcgagaccattcttctataatagttgagacaatataaatgagaccattcttctataatagttgagacaataaaatttatatgtgctaatgatagtttaattagactcaaaagattcgtctcacggtttgcaagcgagtaattatgaaattagttttttcattcgtgtccgaaaaccccttccgacatcccgtcaaatatctgatgtgccaatccaaaaattttttttcgtgaactaaacacaccctgactgaagataatcttatgtacactctgtcagttagaggtgcaaaatctattactctaagtcttatagtccccaaaagaatccctaaatatacttagacttgtttaaaggtcttataatataaagttccgtttgatctaaaccaacaccactaatacaagtgagctacctcacagactcctgaggcaaggtgaagtgaatagcaattcaagtcaagtgataatctagtggactggtcgcctagtctctcttcacctgttaattcttggaaacttgttctgaaaattaggatgagaagactttgaggttttctacattcaaggaaaaagcaccctagaacatgacccacattatggtctgactagtctattgtgttatcctctttttccctttagtgagtggagctgttgttcctcacataaggattttaacgaggcaacaacgtgtaatgtatgagcaacaactattttattcccattaggttttggtaggagttatgatgaggcataggttagtcgtggatacatccaaggggaagtgttacggaacaatatctcctacggagataaattactttcttctggaccaatccgaaccggagtgaagataaaatctatctcctttctaagacccctatatatacaagagtagagtgagatatctaaggttggcttatactcgagatcagatctataatgaagagatagcttcacctaaaatctgtatttgttgtgtacttctgcattgttcttaagggtaaagggatgggatgggtgttgtacatcttctcacaccttaattaatgttgcggaaaggataaagaacggattcgatgatccacacagcaagacttaggttgtgttcgtgaggatgggttgggaaccatgcacgcaaaacgaagcgaccgtttaatacataattaattaagtattaactaaaaaatggattaatatgatttttaaaagcaactttcctatagaaaacttttaaaaaaactcacattttaggaatttgaaaagcttgcgtgtggaaaaatgagggatgtgagttgagaaaaaaggggaaagaacacgaccttacagtttgatcccatttttctcctcgtcttgctccatagcagcggcggagctagggcccggcaactctgggcagttgcctaggctccggcgccgcatgtatcattagattagtgctaaatcttagtgcttagccacatcatgcagcagtatacttggttgggacacttaataatctgtgtaagtattagagagcatgcttaaccacagcatgcagtagtacatgtaagagcactcgcaatggtaaagtatggtgctcttaaaatatgtgcatctcagcaatagactagattaatagtaaaccacctcaatggtatgtctacatgggtatctatagctctctaatgcattgcctcatttttctctatagactatctctaggttagtagatagttttgctctccctcttcatttaatctcttccaagtaggaaaatatgctgacatggatctctattgtgagtgccctaagtacgtttttatattctgttaatagatgttagagacaaaaccatttagaataacctgaagcaccataattgtttattagatcagtgtacccattacttaattgcaaactattagatgtctgtaacataaagacagtaaattttctagcactcatgttgattttttttcttttcaagataataaatttctaagtcccttagtctgtaaaaacacaaccattgttttcctctaaattagaatacgataaaaaattgttgtatggtacactctatagagttacatgaatttgttatatatccgttggcgttattaattagacttgcttaaggtaacaaaaatttctagatccagcactgctctatggtgcattttctcatgaaggcgccttccaccgtcaccgtgtacatttccttcatttgaacttgctgtttctgacgggccggcggccggcctcagagatgattgctgttccgactttctcttcggctgctgtcttagcccattggacctaagcctgccaatgggctggattgaaatgggcccaatggattggtttcaggtttgggtgttgtttggatggatggaaatggattgaggagtttaatgggctggactggttagggtggaggtggaaacggtttggattggattggtttttggtttctgatttttggatccaaattggattcagtccatggatttctttggatgcactagacagtccagtactctccaaacctagcgtcatcagtcgtccatggctccactccttccgccgccgccgctccctccccttgcttcgcctcctccacctctccgccaccgtccgcgaatccgccgccaagccgtcgccggtcagattccctcccccaccaccattgcttttctttttccctggtttttctcggtctttgatctatcctggttgttttgtttgtgtttttttttgggtctcttcctgatcttggtggttgcaggtgcaggtgaagcagaagaagaggaaggtgcgtgcgccgccgggcgctggcgaggatgtcctcctctggcggtccggccgcgtcgccaatctccctgagaagcccaagtaccacgacgtatgtgaacagtgtgattggtgtgatagtttctataagattttgttttttttgttggttttactgagaagttaacttgctcaagattacaatcttcgatgggtttatgtgcaggagttccaagatttcaagaagaagataaggaggtatagtgaatgcaggttcccttcatctcccaatgcaaattatttaacatatcattacagattgagtcctgatatgattttgagatgcaaattaattctatggtcaatcgaattttagtgtgcaatttttagattgtagcacgtgtacaatgtgtgaaaaaaataattatagaccatgttctttcaactatcttgattttagatttcttcctctatgcagacaattgaacaaactcaataataaatatgtccatacaaatgtcagagagttcaggtactaatagtccaaataataatcaatcttcaagaacacgtaagagagctaaagtatgggaacactttcagcaagaggttgtaatgatagatggtgtcccaagactcaatgcaaatattgtagcttaagattgacagccaccaaaaagtcaggaacaagtcaccttattaatcacatagccgaatcatgtccagctattgatggtgatgctagaatcaacttccttgcaacaattaagaaacagactggggaaggtttcgtgtttgttcccaagagaagccgggagctaatggtcagattcttcattcatgcagaggtgccattcaagaaaattgaggatccttattttttggagtgggtggagtccatgcagccaactttcaaagttgtggggtgtcaaacacttcgtgatgatgcctttaacttgtatgagcgaatgagggaagacttgcatgctgaattacataatcttgattcgcacgtatgtctaacatctgatatgtggacttcaattcaaaatataggctacatggttgtcacagcacactatattgatagagagtttaacattaagaagaaaattataagctttaaggaattgaagtatccccacacgggattcgccattgaagaagctataatgagttgcttgacatattggggcattagaagcaaactgtttactataactttagataatgccagtaataacaattctgcatgtcaagagttgataaagaatcacaagaatgcattgatgtttgagggtcagcatttgcatgttagatgttgtgcccatatcctaaatattttggttcaggatgatatgaagataattaaacctacaatacacaagctacgtgagttgttgaagcatttagattcttcagtatcaagaatgcaagatttcaattctatggcaaactcgaaaaatcttccttcgaagttgagtttttcttttgatacaccgactagatggaattccacctataaaatgattgtagaaggattaatgtacagatctgtcctggatagctatgcaaatcaacatggtgaagttgcacctactgaactagaatggcagaaagttgaatcaatttgtgcttttcttaaagtttttgaagaagccacattatcggtgtcagcagataggaaaccaacagcacataggttcttgcccttggtgctacaaattcgtcatgcattgaatgaccctgattggcagactagtgatattttaaaggtattggctgcagctatgctctcaaagtttgtcaaatattgggacagtgggtttaactctgcacttgtcattgccacaatgttagatccaagaagaaaaggagattatttgaatttcttttatgagaaaacatctaacagtgtgacagagattgtagaaaaagtgggttctgctgaagattggttgaaggattattatgaaaaatacgaagggtttgtaagaagaaatgatgaacacatgctttcacattctcgtgaaggcagcagcagtgttggatcacctgttcttgggaaaagaaaactcgaggaagagtttgctttatacaagtctcgaaggaggactgcacggcaaacgaaatcagaatttgccatatatttagaagaagatgttgaggaggatagtgagagtttcgatgttttggactggtggaagagacatgctcaaaaattcccggtattgtcatctatggccagagatttcctagcaatacccctcagcactgtatcttccgaattagcattcagttgtgggggcaggatacttggtgacacacgaagttcgttaacacctgaaatgcttgaagctctcatttgtgcgaaagattggttaattaaagccaacgatcctttgatcaatattccaggcgctgaaggtataatagtgataaatgattcctccataaatgttctgtgtatttcaatcatgaagtagtgatcatatatcatttacaggtggaaatttgtcctgatttattcaggtggtgaagtgaagaagatggaaaggtgactttccatatacatatatgcaactttaaattcaacttttcctttggcgtattggaaatttggaatggaatacttctcttgaacctgcatttttccaaaattgagtttaccactttgttgcctattctgtttgtatataaaatgttactattcattatttaccaattgaatcaatttggcacattgttttgataacactgcaaaggtcacattatttaaattgttattgtaattttgtatatttgctttcttaagcaacgaagtcacaattttctagttattcctggatataaatttttgatgacatctacttctttcaggttactgtcatctgcaagaatgtgtggctgagaattggaagggtttttggttttggttatcttagaaggtaatctaaagattgagacatgaagaaattgttggtgttcagttatacatggttctgaggcttgtaatgcttgatagctttttttgttggagattttctcttgagcctgttgctctagtagaatctctagtgataattgtaatatttagttgccaaaacttgttggatggcactacttaaagcatcaaaagttctaagtatgctagtagcgttgattgattatttttgcatcttgcttatgttatttgtaagtatgctagtagctgtatgcagtgtgagtgttcgccggctgctctgctctgctttgcttcctgccgtggattgggtatgggttggaaaatggattccacccgtggattgtgttgaatttggactgagcaactttgtgggttgggttgggtggggttag</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001061477.2 RefSeq:Os05g0219300]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 5]]
 
−
[[Category:Chromosome 5]]
 

Latest revision as of 08:22, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information