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| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 5]] |
| − | GeneName = Os05g0292200|
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| − | Description = Similar to Transcription factor IIA large subunit (TFIIA-L1)|
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| − | Version = NM_001061636.1 GI:115463002 GeneID:4338303|
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| − | Length = 6398 bp|
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| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os05g0292200, complete gene.|
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| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
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| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
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| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
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| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
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| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
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| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 5|Chromosome 5]]|
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| − | AP = Chromosome 5:12843807..12850204|
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| − | CDS = 12843945..12844064,12844175..12844363,12844492..12844659,12844740..12844794,12844918..12844976<br>,12846056..12846181,12848553..12848681,12848758..12848812,12848905..12849080<br>,12849175..12849258,12849874..12849897|
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| − | GCID = <gbrowseImage1>
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| − | source=RiceChromosome05
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| − | </gbrowseImage1>|
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| − | GSID = <gbrowseImage2>
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| − | name=NC_008398:12843807..12850204
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| − | preset=GeneLocation
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| − | </gbrowseImage2>|
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| − | CDNA = <cdnaseq>atggccagcagcaacgtctccacggtctatatctccgtcatcgacgacgtcatctccaaggtccgcgacgacttcatctcgtacggcgtcggcgacgctgtcctcaacgagctccaggcgctctgggagatgaagatgctgcactgcggcgcaatctccgggaccatcgaccgctccaaggcggctcccgcgccgtccgcaggcacccccggcgctggaaccaccccgccggtacacgacctaaacgtgccctacgaggccacctcggaggagtacgccacccccacagcggacatgctgttccccccgacgccgctacaaaccccgatccagacccctcttccaggaacagatgcagggatgtacaacattcccactgggccttcagactatgccccttccccgatcagtgacgtgaggaatggcatggccatgaatggagctgatccaaagactggtcgcccgagtccctacatgcctccaccctctccctggatgactcagaggccgctgggcgttgatgtgaatgtcgcttatgtggagaaccgtgaggacccagataggaccggacagcctccgcaactaactaaggattttctaatgatgtcctctgggaaacgcaagagggatgaatatcctggtcagctcccttctggttcttttgtgccacaacaagatggaagtgcagatcagatagttgaatttgttgtctcaaaggacaacgcacaacaactttggagttccattgtgaacaagcaaggaacagcaacaaaagaatcttccacaaaggaaacaataattgctccaacgattcctcaacgggatgggatggatgactataatgatccattttacttccaaggagttccaactgaggattacaatacccctggagaatcgtcggaataccgagctcccacaccggctgttggaacaccaaaaccgagaaatgatgtaggcgatgatgatgagcctccgcttaatgaagatgacgatgatgatgatgagttagatgaccttgagcaaggggaggatgagcctaacacacagcaccttgtcctcgcacagtttgacaaagtgacaaggacaaagaaccgctggaaatgcactttgaaggatggaatcatgcatttaaatggccgagatgttctattcaacaaggctaccggcgaatttgatttttga</cdnaseq>|
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| − | AA = <aaseq>MASSNVSTVYISVIDDVISKVRDDFISYGVGDAVLNELQALWEM KMLHCGAISGTIDRSKAAPAPSAGTPGAGTTPPVHDLNVPYEATSEEYATPTADMLFP PTPLQTPIQTPLPGTDAGMYNIPTGPSDYAPSPISDVRNGMAMNGADPKTGRPSPYMP PPSPWMTQRPLGVDVNVAYVENREDPDRTGQPPQLTKDFLMMSSGKRKRDEYPGQLPS GSFVPQQDGSADQIVEFVVSKDNAQQLWSSIVNKQGTATKESSTKETIIAPTIPQRDG MDDYNDPFYFQGVPTEDYNTPGESSEYRAPTPAVGTPKPRNDVGDDDEPPLNEDDDDD DELDDLEQGEDEPNTQHLVLAQFDKVTRTKNRWKCTLKDGIMHLNGRDVLFNKATGEF DF</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>139..258#369..557#686..853#934..988#1112..1170#2250..2375#4747..4875#4952..5006#5099..5274#5369..5452#6068..6091#gtccgcctccctcctcctcttccccccctcttcttccccaactcgccgccgtcctgcccgcctccaccctttcgcctcctcgttccccgcacccaaaccctaatcctagccgccgctgccgctgccgctgccgccgccatggccagcagcaacgtctccacggtctatatctccgtcatcgacgacgtcatctccaaggtccgcgacgacttcatctcgtacggcgtcggcgacgctgtcctcaacgagctccaggcggtaagcatcgccgattcctcgggtttccggccctagttgtgtctcgaattgctgcttggttggctcgatttgacggttggttctccgattcgggccccggaaaaccctagctctgggagatgaagatgctgcactgcggcgcaatctccgggaccatcgaccgctccaaggcggctcccgcgccgtccgcaggcacccccggcgctggaaccaccccgccggtacacgacctaaacgtgccctacgaggccacctcggaggagtacgccacccccacagcggacatgctgttccccccggtgaggaatccctcaaccgcccccgccccccgccccccccccccgcccccctctttcagattggtctcgatctctgcgaattgagtgattgacaggtagggtattgatgcggctgtatttggatgcagacgccgctacaaaccccgatccagacccctcttccaggaacagatgcagggatgtacaacattcccactgggccttcagactatgccccttccccgatcagtgacgtgaggaatggcatggccatgaatggagctgatccaaagactggtcgcccgagtccctacatggtagaatcaatttggttcttttgttgatttatttatgttgttccccctttggcttggaatttattattgttatgttgcagcctccaccctctccctggatgactcagaggccgctgggcgttgatgtgaatgtcggtatgtgcttatgttatgctcagtttttgttctcaggtctcaatattcgatcgcagttagactgattggagaaatattgactgggtaggagtaatgattttgccaactttgattcatgtgcagcttatgtggagaaccgtgaggacccagataggaccggacagcctccgcaactaactaaggtaaaaatgtccatgttatgttgaaactgaagtttgtttgctgttagcatttgtttttgttatttttggtaagaaatgccctgtgagaattaatcaaattgcaattgcacacaaagtgcaacttactaataactaatatgtagtaagtacttggattaatatttagtggcattccagtcatccagtgttcgaaattggagttgtcactcgctaatatgttttatatggtaaccaaattctagaaagattattacttggatctttggtttatattaccatatccttctgatgggtttacttggatctttggtttattaccatatacttctgatggattatttgggtagtgactagactatggtcaattctagcaatgagaaccgatacaattaaacattatgtgaccaataaatgccatcaatatgtttgtgctagtctttccttgactttctgacccctcttaatttggcatgttaccattacatgcatgaactcgctgcccatgcaagtaaagcatcccttttgaatgggtagtagggacatagtcatcaaatatattaaaggaacaatttccacctcttatagggtggtgatagacattttaaaataaagagggttccccatttttttaatgtattttcgctgtaatttcaggaattaaactgtttctcatgaaccatcattgaaaccgcgtttgtgtatatttttaagccagactacctgtccagtaacctaaccagtacagaaccaagcaccaattgcaactttgaaacattacttttgtatctctattaatacaaaagaagcagcagtggtaagtttaccatccctctgccactcgcatggagtttgtgggattttttttgaagtatcttcttcgaaatatttgtgcctttagaagtttagaacctgcatcatattgcttcaaaatccattgcattgcgcagctattggctgctttcattaagctcaaatttcccagcttgtcagcttctcactaatttgaccattagcttatttgaaatacttgattctactatagtagaatggattcatatttgatttatttcatattgtaggattttctaatgatgtcctctgggaaacgcaagagggatgaatatcctggtcagctcccttctggttcttttgtgccacaacaagatggaagtgcagatcagatagttgaatttgttgtctcaaaggtattattcattaatggaaagtgcaattcagtatcacaatttgtcttgcacttcaatctcataagtatgtgtggtagtgctccttagagttgtttaaggatgccactatagatttggtccctatctgatccttaggccttgttgaaaagggagggtttggatttgaatccttactcttcgatggttcatggaacccagtcaggttcaataattggagcaatgcaagtatatgtcaactagtatatgtcaagaatgtacgtggctatatagtttggtagattatagagcctttctctactcttatgaattcatcttctgttatatgtccataaaattgtttcaaaccgcctatttagtaccaaggtcttttgaattcttgatatggccaaatgtctgactctctgtagagtgttgatttttcattgttgcaatgccaagagatatccttgcatatgcacgagtggatggcaatttaaacatccaaaattcattaactgtcatgtcacatttctaacagtaactagtgggtttgcatgtggaacccatgtagccaagaaaatataacaagtaggatgtaaatatgagggggaacggtaggatgtgctgcatgtgcaccgggaggggtgagatgagttgagtggcgtcaggctgtcagtgggtgtctggttggtggttttgtgggctgggcagtatggcataattaacaggaagtataattagtggtgaaattctaattgaaatgaggataattgatgtataaattaatggttaggagggatgcatgcttttcatattggtttatataatacagctccaacacatgcgagggctctcagtttcttttgttgtacttgcatttttgtctgtcctatcacgttgatatactatattggagtatatttgtcatctaagtagatgtattgattgactagtttaaactgtctaaacctttatatgaatgatatgttgtactctatggcatgcatatatataatgttggctgtattacatgaataacatccacatatgttttaaacagtctgtagcaaaagcataccaacatacttgttttatagtggatagcagaaactatttgctgagctacagaacatgtacaatatttcaatcttaaactaacatccccatcgtaaatgcacataatttccttattatgaaatatcacaatttttttgttccttttcttgttctgttgagttgtactgttccatgtcatcttttaattgccatgatagataaccaatacaacctgataccaaactcaccacgagaataggaaattgaactgaaaacagtattggaaatgttcactcagtgaagcgcgtacaagtatcacagcacataaatattgatcgattcattttttgttcctgaacctaagaactatcattttccatgcatgtgcttccgtccatatgtggttaaaactggcagggcatgtcatggcatgttaaagaaaaaatgttttaggcaaaccgtttaacccagcaataattgaggttgtatgaaaatcatacatgcatcagcttatccccagctgaaaatggactgatgctggttttcatacttgggttaactgcttatgatcaccactagtgtatatcttgtgtggtggcctgctgtaatggagatatactagcattatacatgagcagtgctaatcgtatatggtagcatttgtgtgaagaattgtcctggtagaaatgaaattacttggactaattttactgaacatttcactgggtgataggtagcttgatgtatttaagtggtgatggtgtattggtttttggaagtacttcccagactaagaaaatcatactttgtaaccgagtagttagctagtatagtattaggtttgtgataactgaatcaatgaggcaattaggatccacagatggaattttctaaaagaatttgagaaatctaatggtaattttctaagccaacgcagtagaattttttactttatgtgcacactggagaactctttatgtatgaattcttgagcttgcttaatactggcttgaactcaagagttcgttgtgttagtaggataattgaacttcatgtttctcttctttgtaaatatttggacacttttgagcaaaatttatgaaagttttctgtatggaaatgaggatatattgaatatatgcagtaaattgcaattcaatttatcatatcttcaattcatgatgcattcttattcttgtcctgtagttctcatcctgctcatgttctgttttaccatatactgttaacaagtgcttaattagataatttaaaccaagcttctaatattaccattttgtgtgaggaatcctcattctccttttggtcctttttttaggacaacgcacaacaactttggagttccattgtgaacaagcaaggaacagcaacaaaagaatcttccacaaaggaaacaataattgctccaacgattcctcaacgggatgggatggatgactataatg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| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001061636.1 RefSeq:Os05g0292200]|
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| − | }}
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| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
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| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 5]]
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| − | [[Category:Chromosome 5]]
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