Difference between revisions of "Os05g0306000"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
    [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 5]]
−
GeneName = Os05g0306000|
 
−
Description = contains InterPro domain(s): IPR000348, IPR009038|
 
−
Version = NM_001061687.1 GI:115463104 GeneID:4338367|
 
−
Length = 8351 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os05g0306000, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 5|Chromosome 5]]|
 
−
AP = Chromosome 5:13818372..13826722|
 
−
CDS = 13818674..13818742,13819204..13819278,13819519..13819554,13820986..13821033,13821514..13821594<br>,13821771..13821822,13821939..13821998,13822534..13822614,13822729..13822845<br>,13822982..13823022,13823249..13823327,13823404..13823560,13823854..13823986<br>,13824067..13824194,13826420..13826582|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008398:13818372..13826722
 
−
source=RiceChromosome05
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008398:13818372..13826722
 
−
source=RiceChromosome05
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atggcgacggaggggctggtgcccatcacgcgggcatacctcgcgcgctactacgacaagtacccgctgcccccgctccccgacgccgccacggccctcgccgaccgcctccgcgccatctccgcggccctcgccctcgccgccgccgcccccatcacgccagatgaggagctcttggaaaaagaagctaatgggatacctgctcacaaaattgatgaaaacttgtggaaaaatagagaacaaatggaagaaattttgctcttgcttaacaaatctcgtcgtcctgttgcacttcaacagaggtccacggcagaggacactgagacatttattatacttgatgatgttgaaactaaattgaaggacatgctgaagaagttagaacagtttcaaataaaaaatgctgataatgttttcaatacagttatgacctacatgccacaagatttccgtggtacactaatcaggcaacagcgagaacgctctgagagaaataagcaagctgaggtagatgctttagttaatgctggtggaagcattcgtgatcgatatgcattgctgtggaaacagcaaatggacaggcgagtgcaattggcacaacttggttctgcaacaggtgtatataagacgcttgttaggtacttggtcggtgtccctcaggttctgttggacttcattcggcaaattaacgatgataatggacctatggaagagcaaagagaacgttatgggccagcactttacactcttacgaaactggtgcttgcaattcgattgtatctacacgtgtcattagcacgatatgggcagaggaaaatagaaaaggatgacattgctgtgttgcagcaggctgtggctatctacaccgaggaatttgagaagttcactgaattcataggcgaagtttttgtgaatgccccattcttcatatctgctgaggatgcaggtgctgaatcaaggaacagcgacgactacaaagaaaccattattccagcaggaaagacacatgaggttattcttagtgttgaggctgtcaactcatacattgcatgggacttctccttgcaacaaggggccctcaacatggtcttggatattggttttcatgtggagtacataagcccatcaggccagaaaactttaatacttccctaccgacgatatgaagctgaccaaggtaacttctgcactgtctctgccggatcatacaagcttgtttgggacaactcatattcgtcattcttcaaaaagagcctccggtacaaggtggacgccgtgccgccggttgtcgcgccggcagagcccgccgcggaaccctga</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MATEGLVPITRAYLARYYDKYPLPPLPDAATALADRLRAISAAL                    ALAAAAPITPDEELLEKEANGIPAHKIDENLWKNREQMEEILLLLNKSRRPVALQQRS                    TAEDTETFIILDDVETKLKDMLKKLEQFQIKNADNVFNTVMTYMPQDFRGTLIRQQRE                    RSERNKQAEVDALVNAGGSIRDRYALLWKQQMDRRVQLAQLGSATGVYKTLVRYLVGV                    PQVLLDFIRQINDDNGPMEEQRERYGPALYTLTKLVLAIRLYLHVSLARYGQRKIEKD                    DIAVLQQAVAIYTEEFEKFTEFIGEVFVNAPFFISAEDAGAESRNSDDYKETIIPAGK                    THEVILSVEAVNSYIAWDFSLQQGALNMVLDIGFHVEYISPSGQKTLILPYRRYEADQ                    GNFCTVSAGSYKLVWDNSYSSFFKKSLRYKVDAVPPVVAPAEPAAEP</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>7981..8049#7445..7519#7169..7204#5690..5737#5129..5209#4901..4952#4725..4784#4109..4189#3878..3994#3701..3741#3396..3474#3163..3319#2737..2869#2529..2656#141..303#ctctgctcccctgcctgcaaagctgcaaccgtccaaagcacgtgccccgcacctgactcccccctccccccacttccgtttcctccgccccacgccaccgccgccgacaagctcgacccacccgcgggcggccgccggagatggcgacggaggggctggtgcccatcacgcgggcatacctcgcgcgctactacgacaagtacccgctgcccccgctccccgacgccgccacggccctcgccgaccgcctccgcgccatctccgcggccctcgccctcgccgccgccgcccccatcacgccaggtgttgatctcccccttcccacccctggatctcgcccgcaataccgcttgctggcttctccgctgccgccgcagccgccgccgcgccggctctccacccccccctgatctcgcggggggtcctgggggttggaatctgttggcgtttcgcgtgggttgtttcgctagtgtcttccgtgtattcgctaactagctggttgcttgtggtgtgcttggaattcgatactgcttttagggacggcgcagcttagccttggttagttatgtcgacggtattagcgagagttgcttgctgggttagcaatggaaattcgcgtcttaatggagctaaacggtgttagtacacacgctgttcatagttgttcacttgttcgaaattcttaaatattggttcgtactcctagatattagcaagagttgttttaagttgaatgggttgattgcttacttccaaaattaatcttcaaagttcttaggaagctgccaatcggtgtcctgtccaacggctctctgtactggtaggcaggcccatactttaaatcacatttgaggttcttgtcttgtcttgtttcatatatgataaacctgtcacctgaaatttgccatctgtcacaactctcagtgctcttgatgccgatgccatggccacctcacgctgcatatatgtggttttctgataaaacgctatttttagtatgaccatgcaaactttctgtgtttgtacaatcaacgtgatagcaaatatttctagttgatttgatcatgggcacttgtttatcagcttacctggatcgaaaagaccatgatttcttatcacattggttggtcttcttataacagaggttacatatttacacaaatagatgtacccacacaagagggccttggtgtgcctgtaccatctcttgccagtcctgtggatgtgatgaagcctgtctgattttgaactgttgaacattgggactattatttgctgaaagatcatcaaacattggttaggatcatgtaattcttcattgctagtcaatatacattgtcaatggactagttactatcatgaaggattcttgtgattggatacgagtttagaatatatcaacttaatgcacataatcttctgaaatgtttgagaaaatatattattattaaaccaaacatacaatgatgggctggaggctctaagacaccgtaacattgcactttggtttcatttcatttaagagacaacatagaaaaacatttgtcttatccaattttaaatctattttgtttgttgtgctacttgttttttgagcaatttgttcttgctactaatctggcataacaatcttttccatctcctggactaataacgtaccattccagttgcaaaaacaaggtgtgcacattacttcatgacaaaaatgaaactggctttttaataggacaaaatacccaggatagcataatctagcaagtggcaatgcagtgcagatctcatgtttgaatgtcctaaccaaatttcagcatttatctgtaataaaatcctcgtccaagaatcagccgaggtatatacaatcaatatataaacagagtagaagtctttaatgtgaatgaacgtgtgcaatttattacagaggtggataggacctctcagtaaaatataaatgttttctagcagtagaaataaattaactagcatagatgactccactccacaatatgcttggaggactagactggatcccgatcaagatgcttgtggggtggagtcatctatgctagttaatttattttccgctgctataaaacatttagttttgattgagggctcctatccacctatgtaataaattgcagtcttttgttcatattaaagacttgtagtctgtttatcagtactgtatattccctcaactgattcatgtatgaggattttattacatcagcgctggagtttggttaggaaattccgggcatcacaagtttcatgttaattcctgtgttcattcacctatgtagggattgctggttaaatatttctgagtacgtaagtgtttaatgcttctaggcttgaaaattacaatttgatattcatacatttgtaaagaagttccttttcagttgactctaaaagtcagccccgatactcttttgtcccaaactctgaggcttacaatattacattatatttatgaagagaacattgttttgaaatgatgcttttatcattttttcatgtgcaagatgaggagctcttggaaaaagaagctaatgggatacctgctcacaaaattgatgaaaacttgtggaaaaatagagaacaaatggaagaaattttgctcttgcttaacaaatctcgtcgtcctgttgcagtaagattagcttttgatcactttgaatgaatggattgaaactttactttatttaacatttggcatctgcatgtaaccagcttcaacagaggtccacggcagaggacactgagacatttattatacttgatgatgttgaaactaaattgaaggacatgctgaagaagttagaacagtttcaaataaaaaatgctgataatgttttcaatacaggttgatgttctttccattgatttctatttcatgcgatacattgcataaaataataactaaatgcgaatacatattgttgaatcttatcatgaaaattctgtccttgccatgtgacttttcatagtttactataacatcagatatattagcaattaatttttctagaatataacaatgttacttttcttcctcttgacttgttcattctttagttccacaatttttggtgtatcagtactaatcaagtgcatttgtgtttaatgacctgcacttataaattataaatattgcagttatgacctacatgccacaagatttccgtggtacactaatcaggcaacagcgagaacgctctgagagaaataagcaagctgaggtagatgctttagttaatgctggtggaagcattcgtgatcgatatgcattgctgtggaaacagcaaatggacaggttctcattttaatttacagcctatgcctattcaatttcagtaaatctttatatcatttttcattttgtgctgtaggcgagtgcaattggcacaacttggttctgcaacaggtgtatataagacgcttgttaggtacttggtcggtgtccctcaggttagccaattttttggggtcatattcaccatcttgacaatgctagtatattttttgatgaagaatttcagttgtcacatctatccaagcttctttgaaggatcatgtgtttacattaatgacatgctattaacgaaatgtagattgctacttgaattctgataaaacttataatgcaatggtgacatcgtttgacatcctgattcttttattgactatattccaggttctgttggacttcattcggcaaattaacgatgataatgggtatatatgcctgcgtattttcttttatcaaacataatttcgcaaatagtaccatgtatactagatttgtggtttacggagtaatcagtaatggcatgaatagttgatttgtttttcaattgaaatttctattcagacctatggaagagcaaagagaacgttatgggccagcactttacactcttacgaaactggtgcttgcaattcgattgtatctacacgtgtcattagcacgatatgggcagaggaaaatgtgagaacttctatttggtagaattctccttgtcttttactaactattatatcacattcttttgagacatcatgaccttttcctaaaattatttatgaaaaaaaaaatgaacagagaaaaggatgacattgctgtgttgcagcaggctgtggctatctacaccgaggaatttgagaagttcactgaattcatagggtaatgatagtttttgttatcaaacaccatttattgcgcttaattatgcattttctgtttaaattatggcaatcttctgtttgtattctgtggaaagcgaatgtgcattttgcaaactagaaataaacaagactactattttctcctgttatattcaagaactattttgggtttcttttttttaaggctttgatatagatttaatgccgtagttgttctcttttttggttggcatggctgcggttttatatgttgttttacttattaactgtatggcattttgagtcgtcagttcagctcttctttagctatgtttgcacctcctgccaagcccccacccccaacccaagcaaaatcactttccgaaatcagctaattgtaatttcatttgtgggaataacaaaacctgcaaataagcataaaaagtttagtcaactctgcagttttgatgcttatcaaatgcagggttgccatgtaatactacaccttaatatatatctagaacttgttaactaaaagtggcactcaattgcagcgaagtttttgtgaatgccccattcttcatatctgctgaggatgcaggtgctgaatcaaggtactttctccttgcagtagagttatggtgcatcataccttggtaattgagcattttatctcagataagtttgcagaacaggaagattacctacttttcttctactccttttgtaggaacagcgacgactacaaagaaaccattattccagcaggaaagacacatgaggtatcagttgagttgggcacaattgtttttctggatattatagaataatatgtaaggaaaatttggtctgtagaaatcgaagtgcattgaactgtattttgttggaacatttagtacagtgcattgtcacttggagtgtcctgaagtgcttatgttgtgtcattcatattcttcaggttattcttagtgttgaggctgtcaactcatacattgcatgggacttctccttgcaacaaggggccctcaacatggtcttggtaaaatctctatccttatgaataaacatcttcccatgctataatgaatagcagagctcctggtttttactctacagaagaaaaacagtcctttcagttcaaccccctcacccccacggcgaacacattcttttttgcagcctttccttacctgttgttttcataatccttaaatgctagtaggaggtgatttaattactgtgttcagaactgacatcttcctcgttatacttttaatagcttagtccttcattatattaccgtatctttggtgtatagtggtcaatctaacatgaataaacggtacagctcaaagcctagaagattatatctaaattatgtagctgaaccaatggtcataatctaatacgttttgaattgactagtttgaagcttgatgacagttaatttctcagttgaaatgctttggtagtgcatgaaatgttcctaaatttttagtgatggatttgacatggacaggatattggttttcatgtggagtacataagcccatcaggccagaaaactgtaagtttcttttatctctgggaaaatatgacttatctttcatgttcataaaatgaactgaaataacctgaagacatcttgtttgctatgatatttcattcttctacattgatcatgtcaatgcatttagcagcatgaattatagctgctgtgcatactatggattgataccggtattctagatctagtttataatgggcatatggtgcaaattgtttgcgagttaacaattgaatagcaataacagtttgcaactggtgaaactgtgtacaaaatcaataaagctactgttggaatctggttgttatcttgaatgccatttgttcatgctaagataatgttttattttgacctgagacgcctggaacattctgatccagcacaagttcttgtcttgtcattccaagcatctatttagaatctagacatcacataaaagcatatatgccaagtatataacatcaagcagcttgcatttgtgttcatctccccttccaagatggcagcccaaccagataaagcagaaatccagtttgttaataggattgttttcatgcactcgacctgcttcaaactggtgaaagccagtctaactgggctggtttttcgcaccaacaaaaagcaggagataaccagcagctagaatttaattgtttaaagatttcctataaagatggactcacagattgtgacggcaaagctggactcgagctataaagccagaccattcctttgatgctaccgtcatgtgtaccatgtgtacaacattacacagttcacaattccagcaagaataagattttgagcaaagagtatttttggagtcggatagcaatttaatggagtatagatggtaacttgataaggattacccaagattgaagaaacacaatgcataccatttgagggggaaaaaagtagacaaccatgtcagccaaaaattgtctggaattggttggttcactgggacaggctgtggtggtatttttcctaacagcaataaatatcaatttctgactttcccaagaggccttatcttgtatctgctttagccttgtccttgtttctctatttggtgtcaactttttttgactaataaaaaaaataatgcatagggggcttaatttgtaaggtgtgcacgatatcaatatgtacacaatctgggaaacttagggtttccctttattattccacccaaaatcacctatagatgaacattcttttttaaaaaaaaaacattttctgtatacctagaaagaaatatagttagggttgcctgtggttttacgcgtttgtcctaattaggtacttgtagttaatggtatgacatttctccacattgttttgtttaataaaatatatttataacactggagtattgttgtttattttgtttctacttttttgtaacaagaactgtatgttttgcagttaatacttccctaccgacgatatgaagctgaccaagtgagtgcagtttcatgcttatgctctctttaaattaaaataccatattcttggattccatttatagctctgtttgtccaatcgatagatccaggttgtagcgagcgagttagaagaatgggtttggaaataatataacagtattatctctgaattaggctcagttttaagaggctatgatgtgaatgcatttcatttgtgttagttttgaatgcttcagctttggtttgtcctacacagggtaacttctgcactgtctctgccggatcatacaagcttgtttgggacaactcatattcgtcattcttcaaaaaggtatgatgcacgcaaattttcaaggatggctccaaatgactcaatgtcttaaaagccatttcctattttctttagggggtgtttgggaactagggactaaaatttagtccctgtcgcatcggatgtttggacactaatttagagtattaaacatagattaattacaaagcccatttcataaccttggactaattcgcgtgacgaatctattgagcctaattaatccatgattagcctatgtgatgctacagtaaatatttgctaattatggattaattaggcttaaaaaattcgtctcgcggattagttctcatttgtgaaattagttttttaattagtctatatttaatactccaaattagtgtctacacatccgatgtgacatggaatagaaagttgtagccccatctccgttgtggttcaatctacaagactactaacgatgctttcctccacgacagagcctccggtacaaggtggacgccgtgccgccggttgtcgcgccggcagagcccgccgcggaaccctgatggagcctgcttctctacgaagcgacgagggccattccctgcgacggaatagccgcgcagatataccacaggccctcttcacacagatgttgtaacacaattctttttagcaagccgcatgcgacagcggcgctgtaatcctcagggttcagacgatacaacacacacaacagctgctcactggcgtccatgtgagctgtaagatatatatatatatatatatatatatatatgtacctttgtgtgctcgtgtttacggaaactcgctaatgatatgaaactgactgcttccattcaaattg</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001061687.1 RefSeq:Os05g0306000]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 5]]
 
−
[[Category:Chromosome 5]]
 

Latest revision as of 08:25, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information