|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 7]] |
| − | GeneName = Os07g0497400|
| |
| − | Description = Transglutaminase-like domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001066242.1 GI:115472216 GeneID:4343301|
| |
| − | Length = 10412 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os07g0497400, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 7|Chromosome 7]]|
| |
| − | AP = Chromosome 7:19303178..19313589|
| |
| − | CDS = 19303310..19303465,19303626..19303802,19305947..19306048,19306149..19306235,19306927..19307009<br>,19307714..19307827,19308918..19308972,19309074..19309160,19309870..19309925<br>,19310012..19310071,19310179..19310266,19310371..19310594,19310933..19310987<br>|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008400:19303178..19313589
| |
| − | source=RiceChromosome07
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008400:19303178..19313589
| |
| − | source=RiceChromosome07
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggtggcccgccggttcgtcgtgcggcaggggggcggcggcggcggaggcggcgaggcggaggagcacgaggtggagtacgacacggagcacggcctcgacatcctccgcctccagatcttctccctcacctccgtcccgcccgagctccagaagatcgtggtggaggcggacgggtccgtggtggacgacgggaccgacctggaggccatctccgagggcctccgcctcgtggccatcaccggggaggaggaggaggctgaggctgcggctgcggcggaggcggcaagggcgcaagagaagtcggatgaggagctcgcgcggatgattcaggcggaagaagaggcacttcttctacaacagtacagcatacgcaatgatggaggggaggaattcagagaaagagttgagccatacatgcaccaggttctgatgtacgaggatccaatgcgtcaagaggcagcacggaagactgttccaatggatgaacttcaggagaaggcactggtttcactagctaaggaagggaacttcagtccttcaaaagatgaagaggatcatgcctttctcttgcaattgcttttctggtttaagcaatcattcagatgggtcaatgcaccaccctgcgacagctgtggccgtgaaacattcaatgttggaatgggcaccgcacttccctcagaaattaaatttggtgccaatcgcgtcgagatctataggtgcaactattgttctagtaccacccgttttccaagatataatgatccatataagcttctagaaactaggaaaggacgctgtggagaatgggccaattgctttacattctactgtcgaagttttggatatgaagctcgtctgattctggatttcactgatcatgtgtggacagagtgtttttcaaacttgtatgggaggtggatgcatctagatccatgtgaaggagtctatgataatcccctattgtatgagaaagggtggaacaagaaactagattatgtaattgctatttcaaaagatggagtacgtgatgtaacaaaacgctacaccagaaagtggcatgaggttctttccaggcgaataattacctcggaagataccgtttcagctatcttgtcatcgataacagggaaatatcgcagtggattgtcaattgatggactcacagccttagaaaatcgtgacaagaaagagtccgaggaacttagtaaagctgcttatcttgaagttgacaccagcatatctttacctggaaggcaaagtggttctgtggagtggagaaaagcaagtcagaaatgcagtacatacatccttagcattaccagtggcaatggatgtggttga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MVARRFVVRQGGGGGGGGEAEEHEVEYDTEHGLDILRLQIFSLT SVPPELQKIVVEADGSVVDDGTDLEAISEGLRLVAITGEEEEAEAAAAAEAARAQEKS DEELARMIQAEEEALLLQQYSIRNDGGEEFRERVEPYMHQVLMYEDPMRQEAARKTVP MDELQEKALVSLAKEGNFSPSKDEEDHAFLLQLLFWFKQSFRWVNAPPCDSCGRETFN VGMGTALPSEIKFGANRVEIYRCNYCSSTTRFPRYNDPYKLLETRKGRCGEWANCFTF YCRSFGYEARLILDFTDHVWTECFSNLYGRWMHLDPCEGVYDNPLLYEKGWNKKLDYV IAISKDGVRDVTKRYTRKWHEVLSRRIITSEDTVSAILSSITGKYRSGLSIDGLTALE NRDKKESEELSKAAYLEVDTSISLPGRQSGSVEWRKASQKCSTYILSITSGNGCG</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>133..288#449..625#2770..2871#2972..3058#3750..3832#4537..4650#5741..5795#5897..5983#6693..6748#6835..6894#7002..7089#7194..7417#7756..7810#acacgcgattcctcccctccaagtctccaactaacagagaggggtggtggtggactcattcgcgcgaccaagtatccgctagtacgcgccgcggagtggaggagacggagagagcccgcgcgcgcgcgcgcgatggtggcccgccggttcgtcgtgcggcaggggggcggcggcggcggaggcggcgaggcggaggagcacgaggtggagtacgacacggagcacggcctcgacatcctccgcctccagatcttctccctcacctccgtcccgcccgagctccagaaggttcgcgactgactgacttagtttcccccccgccgcgccgcgccctgcacgggacagcctccaccgaccaccgtccccgcgggtgttccggttggttggctggcctctgctctgatcgatttcggcgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcagatcgtggtggaggcggacgggtccgtggtggacgacgggaccgacctggaggccatctccgagggcctccgcctcgtggccatcaccggggaggaggaggaggctgaggctgcggctgcggcggaggcggcaagggcgcaagagaagtcggatgaggagctcgcgcggatgattcaggtgcgccgaagttaaattgatgtcccctctagctgatggctctgtgtctgtgcgaatcggaacttgcgtagacgtgtggtagttggtccgggacagcgtggaaattaattttaagttggatggatttacgatgttgtagtgtgtgactgtagctgtcacttgattttgtttggtttgataagtttatggttggaaattggaggaagtgggtgttaaatcaagctgcattttgatcagaacgggttgccgtttggctgcattgtggccggaatgatacggctatgtcggtatttataactgcttagtgtgatttggacatcatgattctatttggtttcggtttgcctgaggttcagattgcggcctcaaccactttgctttgatctgagcaccgagtgcactgctttgcattgctcatcatctggtgtgatgcaatgctgtggcgtgtgcagatcgtggtggaggcggatggatcaagggtggacggtggaaccgacatggagtccatctgtgagggtctccgcgttgtggccatcagtgagggggatggggaggacatcgctgcggcagaggcagccagggtgcaggagaagtctgacgaggagtttgcaaggatgcttcaggtgtgacatgattaattgaaataactgagagctgagctttgtgcatttggaatcgagtagatagcttagacatccttttattttgcttggttaagttggacatactatgtgatgatgttggatttgctagtgactgttggggttacttacttttgttgggctagtagggtatttagcttgaaattgatcacaattagggcttcgctgttgcttgggtttcacagttattaatggtattcagagtcgcttcacatgatttatacatcaaagttccctttggttccagtttagttcatcagctgaggtttgaagcaggtgtgaaatatctgaattcaattaaggtgcctgaataacttgcgttctataggttcttcaatggaacctttgagctttgttatttgattgagaagtgagttgaatgatctacatgccaatttcgtgaagcattccacattacagtttggatagcttatgctgttaccactggttggacattgtcttggtttgaatgggaactttttatgagcaggggttagttcagttcaggtgcagtctaacttcattttgttcgatttttaggcctttccttagtttgaggtggctcatgtttcatgggtttgatttggtttatttggtatcaaattggaacaaatgtaaactgagctgcaatacagcatacaatgcagtttcttgtccagatattttagttggtggatagctgaataccacattgaactcattttacctgtcattgagtggatactatgtgttatctgaattttagcttgcaatagaatggagtttagttttcttggttccagtctttgcttcaatgttctgggaggcaggcaaatgttgtgtaaaagaacccgtcaatatagtttggttctcatctgatttggtggatctttatgacttttctcagttggctgatcagattgatttcagttcttcagctagacatgtatactatgcaacatattctgtgtctgaatctaggactcaagctcattgtagatcatattcatttattttgatggccttgttagctgaggtgagagtacatgaattatctaattagatggaactggtcatcatcaagtcatgcaactgcatgagtcggctagacggctacttccactattttttttctatatgcattttgtgagtagactacacatgaactgtttattcagtctgttcatgctttgtttgcaattgcaatatacatgaggggtatttgaataggcttcttattgtttagtggagtaactggagctgactgaaaattcatatctgtatagtattttacttagtaaaaatgtcataggtgttgctcagaattgcctcatctcgcacccatggattataagtatggactaaacagtgcccacaaagcataacctagcatgacaatgaaatgaagtaatcgttagtttaaatattctatccagggaaaaagtagggactccaaattatcattctcatcagaactatgcttatttccttaacaaatcttaggcggaagaagaggcacttcttctacaacagtacagcatacgcaatgatggaggggaggaattcagagaaagagttgagccatacatgcaccaggttctgatggtatggtcttagaatgtatttcatatacaaagctatatttgtgatgattgcatttatatttaatatataatccttgtttgttgacaccttttgaatgcagtacgaggatccaatgcgtcaagaggcagcacggaagactgttccaatggatgaacttcaggagaaggcactggtttcactagctaaggtttccgttctctatttaaatttccagctctgtttgtttcttctttttcctctccatcatcttactcccttcgttccaaaatgtagctatttctagagttcaaatatgctcctacaccatcatggtgggattgcaccatggtgagtgtgtggagtgatcctgaactgttgctttcctttcttttacagtggtaagcctgaatgtaatcaaacaacttctgtcattttgataatgaaatgggggagcaatgcctctctttctcaaaacaagtttctagagttcaaatttgtcccaaaatgttgatattctccacctaccccccatcacaatcatctcccatttattttttcacctactttctcttctcaacaaatcacaaccttccaccattcaatttcacctacttatataattcccatgaaaacctctagaaatgcttacattttgggatggagggagtaatattcaacatggttgtgttgtcttgcatttattgataatgcttcttttgattcttgtcaacatggctctccaaggaaagatgctgtactttatgatttctcttatcattctaccaccatggctgtgtcttttttctaatgatatggattttggggaaaaattgctatattgcattttgcatttgaagagatgcgtgatcaatatgttcttataaaagattctgtagtaggaagggaacttcagtccttcaaaagatgaagaggatcatgcctttctcttgcaattgcttttctggtttaagcaatcattcaggtcattgaaacacttctgtgccttatttctcagtttttattttctgcatgtcatgtgtgtgcgcgcgctaccatctagtacctatatttctgttacatcagtactctacctaaccatttatattataaccaaagtactgttttcagttaagatacttcttttgtgcgtatgttttaattggcatatttttcaccatttatgtaatagtggtatagtgaggttgttcacagactactgatggacatgaaataccaatgatcttgaagatatgtcaaaccgtataaactaagtacaaacacatttgttctattcggactggaaaagaccactttgatatatatatagtcttgaatctagtttctgaaaattagctctatttgaaacattggagtcaaacaaagcagagcatgaatgataaatgacttgtgtgaatgtgtgatatttgcatgtctttgctttatggtacatagaaaaatgagagtaatgtttctttttctttttcaagttcattgatttggaacaaaggtgtcaattctagtgataactttgagctcaaattatgggattgcctgtgatttactggtggtttacattttgggttgatatactttcatgatgcttacagaacactgtacttttcatagaaagacctacgatggaactcatatgtgctcatcttgtgatgatgatgcttttgtttgcagatgggtcaatgcaccaccctgcgacagctgtggccgtgaaacattcaatgttggaatgggcaccgcacttccctcagaaattaaatttggtgccaatcgcgtcgagatctataggtagcagtctctagatgtcaatcaattgttcttacatcttcatcttttacatcaattctaaatagaagaatcatttgtacctgaagcttagttgcatgtactccctctatccaaaatacaaggtgtccatattttgaggaaaaatcaacatttgtaatttttgactaatagttaagctaactatatatatgtttggtgtcacacatgtgatatcattagatttgtatttgaaagtaccttcatcgttaatttcgtagttgttgataatatattatgaatgatcaaagtaaaatgtggagaccgtgtaaaagctaatacggcttatatttagtgatggagggagcactattttatttttgaactcccacatacatgatgttaaggtgtcaataaggtttgtttccatatgcttcaaatgcaacagttgtcaactatcattctaatctgttctttaccctgcaactgtacctccagcttaaggcaaatctaaggtgcacttctttgtgacatctctgtctgagcagcaaatgctgtcactatcatggtctaggcaggattttttttgtgtgtttgtcaacaagatcaggataatacagtgatgataggttttagttagaaagtcatgactctgaagatttttttagggaatgtgcaaagatttgcacacttttcatgaagtaaggaaagtaaacaaagtcataaattctatggtgttacctgaaaaagatcccactgagcattggaatttgaatgattcatggtattgtgtcgtatcatggtattttgtagtactggttagacaggttagtcctagcagcattgtgtataactgctgaatcgggctatgctcatttcctagctgttacatctatgttatgccagttagagataggtgaaatacaacaccagggtcataatattctaaggtatccctctgttctaagttgtctcaccaataagttgatgacactggaacagagaccaaatgcacttcttaatcttttacccgtcagggctcagcccttatgcctgatgctttatgatcattttcattttcttatttgcatatactgagtatgtctatgtttaggtgcaactattgttctagtaccacccgttttccaagatataatgatccatataaggtatgaataagtcctgttattgtgtgagataaggtgttatttttcaaccaaactgaaattgatggtcaaattgtctgttccaatatttattgctttggaagcttctagaaactaggaaaggacgctgtggagaatgggccaattgctttacattctactgtcgaagttttggatatgaagctcgtctggttagttccataatattcataaatttgttttatccacaatgatatacaatttgcttataattgtaagcggctctccattcgtccacttgtcagtatacttttggttttcctgtctgaccgtctgttactttcacccttaacatcttggaagtctctttccttgcctgttaccttcacccttaatgcccaatttagtggtcaaacccaaaactgataaagaattatgcattatctgcattgtctgattatcgaatttcattgggcgcaaatatgaattaggtttttcccatgcaaaacttgtttctgtgatacttgaattcacaattggatcctataaaaatatgtggatgcgattgtttaactattgcacaattatctgtatgttcgatgtcagctgaattatgcagaaatttgattcatatgcagattgttattcacatgattcataccaaaacatcttaaaacagttataccaaacaaggttaccatgatccactctaatagcaaacagagccttagtatgcctaaatttatgttgccactaattactgatgactggtctttgctcttgtgtaatgcaatataacactccttttctatttcaatgttcacaaacagttccatttggaagaagaacgagtgcactaaagtttattctagcattgtcaatatactgtaactttgcttacctgagtaatttaatttatagattctggatttcactgatcatgtgtggacagagtgtttttcaaacttgtatgggaggttagtgaatatacccactgcttctaatttggtattctgtcacgcctattcctactgacaatctgacagagttctggaatgtttaggtggatgcatctagatccatgtgaaggagtctatgataatcccctattgtatgagaaagggtaaaatatgttcttagccaactggtttatgcatactgccttgtcgtaaagtgcatagtttatctaatttatctggatttagtgatacaactctgtggactttccaggtggaacaagaaactagattatgtaattgctatttcaaaagatggagtacgtgatgtaacaaaacgctacaccagaaagtggcatgaggtagaaaattttggcttggttaagacctgtgttgaggctgggtaggataggtgtgtttagaatgttttgatttttatttcatgcatactgcttgtcaattgcaggttctttccaggcgaataattacctcggaagataccgtttcagctatcttgtcatcgataacagggaaatatcgcagtggattgtcaattgatggactcacagccttagaaaatcgtgacaagaaagagtccgaggaacttagtaaagctgcttatcttgaagttgacaccagcatatctttacctggaaggcaaagtggttctgtggagtggagaaaagcaaggttagaactgagccaagttgaatcactcgcatgctcatcttgccctgctcgaaaatgtgtggatgctcatgtttcaaaaatatatgatgctctttctgctcttctttcacatttttgtgatggagacatccctaaagaaagagttattgaagtttttgactcgctgaagtgcttgatgcaaaatcttaaagatgcaaagtttaaaagcaggagagctacattggacaaaaaaacacaactggtttttgaggagatttttccttctgtcgaaagattgctttgtgctatgtccttgaaagcagagttgggtactgatggaaaatgctctgtgacaacagtcagaaatgcagtacatacatccttagcattaccagtggcaatggatgtggttgatgagatactgagtaattacaagagtaatgcggtttgcacaaaaggtcaccaattcccaagaggcaatagactctgttcaggttctgtccttgcaagtggtgaacaactcccaattggaattgtatgagctgcaacctgtgcattctcttatgttcattcatcatcattagactacaatattgattttcaaattgtttcaggcaacggcggcatttgatggcattcgctcatccaaatgggaagagcctgatggagccaaaggtgatccggttgtagtattactaatatgatcttttaatcatttctttattatttctcatctgtactagtgactctacgcttattgattaattctaacatataccttgagtatgctaaatttatataaatttaaactgtactgtttcaagtacaaaaactatctcggaattttaagctttgaaatgattagtttgtgccatgtcgatatcccaactttgatgaaaatgatggtgcccatgctttatcatatagtttaatccttttatttggctgttggtgtaataattgtgaataaatgtcattgatattactttcatctcatttcttctccagatgaatctatctacctttgatttgctagattggaactaaaatttttgagtttatgatgatccagttagaattgcagggtttgttctataattgctgcagaatttcattttctatatgagtagttcatatgcttctggtcctgtctgattgccaatatgcacattgaaatttaagctgttcaccaatttttggcgtgggttagaatttcgtgctctctaggtcatgaagtctttcatgagcgctcccctgtaaacatctgtcgttgagtggagcttttctcctttttctgtcttaatacaagtaatagagttctcctgagtattctctaaaggaaaaaaaaaggtattagtgtccagtcagtattttcatgctgtttaaaagaacatgtgtttcaaatagttataaacataaattttcactgttcccattatattatctaacatagtcatttttcaggatgttggataatttacaagatgcttgatggccaaacttgcgagttggattcatatgatttgatgtcagctaatgatgttccagagagggatccaatggactggtatagcaactttgtttccttacatacctttttacacacataacaccgttgataagcaaccattacagtgccaaaatcctagtaacatgaagtatgcaacaagatatgtcaatttaagagaattatgggcgacaaaatataatattaaaataaatctggattacaagctaaattgttgttatttggcaattgaactttgttttggtgggtagtcggctctagtgggacctgcaaatgtcttggttaccattgtttgttgcaatacaaaatgttagattagctgttgggcttttgcaatgccggtgttttgacatggcgctacttttttaggctagaccattatcttttgatccactcaagcagacatacttatcgcaggacccagctcttataccagcaactgtagagaacctgtacaaatgtttggccttctcttatgctcctccaggaaaagtttggaaatctttctgttttgacatatttccttgcactctatagtttttgtttttaatactgtaaaatggtgttaatcgtttttttgtggggaaaaatggtgttaattgttaacagaattttgagaagttctaaggaataaagtgctacgacttatgattagttctaagattttaaaaggcataaagctgttaaaacttacgagacacaagtttttggcaaacatcaattgaagttgatgatagatatggcactagctttgctttctttgaatcttctttaaagcgatgatattccatgagccacaagcaattgtgtcacagggttcttgaagggagcactgatggaggctccacctggaatacaatagacgcccggagttctgtaattttcgacagtcgtttctataggaaaacatttactgtggacaagagatataaagcaaatgcttttcggtatgttcaatatctatctgctggtagtgattgctgaattttctcccttttggctaacaatgttttatatgcgtttgacaggtttcggtttctgcgagtgagagaatctaatggcaatccaaggtttcagataggttcaattgacctctacgggaaaagcacatgagctttcttgaaagtgtgttacctcgaatagaaagccttttaaaccttctcgaagctaaactatacgtggctgtgaccatggctattatttgcaaccaacgcagttgcattatttattggaagattgtaaaatgtgaaattcaactatggaaggagtgattatcccttcaattcttgagaagactctttatatgcccccattgccttaagtctctagttgtttcctacaactcaagagtactgcagaataaggaagcacagaggagctatctaagtgttgtgtgatatatagacatgtatatgtcagtttgtaccagtatctaattgtttaattaaaagccttaccaaatgttcatttggtagtgtttttgagagt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001066242.1 RefSeq:Os07g0497400]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 7]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 7]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
