|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 8]] |
| − | GeneName = Os08g0201900|
| |
| − | Description = Similar to Pol|
| |
| − | Version = NM_001188501.1 GI:297726132 GeneID:9270829|
| |
| − | Length = 8891 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os08g0201900, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 8|Chromosome 8]]|
| |
| − | AP = Chromosome 8:5905942..5914832|
| |
| − | CDS = 5905942..5906001,5907952..5907997,5908087..5908324,5909024..5909134,5909906..5910728<br>,5911988..5912090,5912174..5913049,5914726..5914832|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008401:5905942..5914832
| |
| − | source=RiceChromosome08
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008401:5905942..5914832
| |
| − | source=RiceChromosome08
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgagtgtgcctcactcaccaagacctgctgctgctaagtgccattgccaacatgaagcctgccacagatggaggagtttggtgattggagtttgggagaggacaggtaggatgcaatcttacattatggctgaagattatgatatttggagaaaagtttctcatgcttatgtgattcctgaagttattaatactgctgctgaaaaaactgcttttgaacaaaattgcaaagctcgcaattttcttttgagtggtatttctcattctgattatgatcatgttgcacatcttgaaactgctcatgagatttggaatgctttgaagaattttcatcaaggaacaaataacattaaagagcttcgtcgagatctttttaaaaaggagtacattaaatttgagatgaaatctggagaggctttggatgactatctttctagatttaataaaattttgagtgatcttagatctgttgattcttcttatgatgctaattatccacaatctgagatttctcgtcactttttgaatggtctcgacatgtctatttgggagatgaaagttacatctattcaggagtctgttaatatgtctactttgactttggattcactttatactaaattgaaaactcatgagatgaatgttctctctcgcaaagttgattctaaatcgagtgctttggtttcttcttcttcctctttggttgttgatgcttcttcatctatgccctcttttcttgctgcttttaatgccacatctgatgatcaactcgaacaaatcgaggatgaggatttggctttggttgctaaccgaattgctcgagctatgaataatgccaggaacaggaaaagaggtggtccaaatcgttgctttgagtgtggttcaattgatcatcttcgttcgcattgtcctaagcttgggagaggcaaaagagaagacaaagatggtgagaagaccaacaacaacaagcccaacaactacaatgatgtagatggtgaaagtggagatgatgataagggaaagaaagtctctgatgtttgcttcatggcgcgtggtgaatctgacacagagtatgaagataatgagtactggattcctaaatttttattatcatctaaccccagtactgaggcttcgacatctgcttgtgtgtcgactttggtggcaaggaaggagaacgtgtggatcgtggattccggttgttcgcggcacatgaccggtgataaaaattggttctcctccctcaaaaaggcatccaagactgaatcaattgtctttgctgatgcttctactagtgccgttgtcgctacatgtttggttaaggtaaatgaaaaatttgaattgaagaatgtagctttggttaaggatttaaagtacaatttgctttcggtttcacaaattgttgatgaagagtttgaagttcactttaagaaaactggaagtaaagttttttattctcgtggtgattctgtgttgaatatttctcgctatggaatagtgtttaaagctggttttgaaaattctgtttcacctgtgataacatgtttggttgctaagtttgataaagcagtgatgttttggcatcgtagacttggacatgttggttttgatcatctcactaggttaagtggtttggatcttgttcgtggtttgcctaaacttaagaaagatcttgatttggtttgtacaccgtgtcgtcatgctaagatggtttctacttcacatgctcctattgtttctgtgatgacggatgcaccgggacagctattacatatggacactgttggtccagttagagtgaaatctgttggaggaaagtggtatgtgttggttattgttgacgatttttctcgatactcttgggttttctttatggcaactaaggacgaagcctttcaacactttcgtgagaattcaacttcgaccagtactgaaacagaacttggatcaacttcagaagttgctgctcctttgcacattcaacgacgacatccgccagaacaaattattggtaatatagtagattttgctgagactatgcgcagggaatttgagatgagcatgatgggtgagttatcgtactttttgggattgcaaattaagcaaacacctcaaggtacctttgtgcatcaaacgaagtatacaaatgatcttttgcgacggttcaagatggagaattacaagccaatttcaacaccaattggttctacagctgtgttggatcctgatgaagatggtgaagccgttgatcaaaaggacgtctcctcgtgcttcacatcgtcaagcggtcaagcgaataatgaggtgactcgatgtctcgggagagtatttgcggtgatggaccgggagtcggcttggggataa</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MSVPHSPRPAAAKCHCQHEACHRWRSLVIGVWERTGRMQSYIMA EDYDIWRKVSHAYVIPEVINTAAEKTAFEQNCKARNFLLSGISHSDYDHVAHLETAHE IWNALKNFHQGTNNIKELRRDLFKKEYIKFEMKSGEALDDYLSRFNKILSDLRSVDSS YDANYPQSEISRHFLNGLDMSIWEMKVTSIQESVNMSTLTLDSLYTKLKTHEMNVLSR KVDSKSSALVSSSSSLVVDASSSMPSFLAAFNATSDDQLEQIEDEDLALVANRIARAM NNARNRKRGGPNRCFECGSIDHLRSHCPKLGRGKREDKDGEKTNNNKPNNYNDVDGES GDDDKGKKVSDVCFMARGESDTEYEDNEYWIPKFLLSSNPSTEASTSACVSTLVARKE NVWIVDSGCSRHMTGDKNWFSSLKKASKTESIVFADASTSAVVATCLVKVNEKFELKN VALVKDLKYNLLSVSQIVDEEFEVHFKKTGSKVFYSRGDSVLNISRYGIVFKAGFENS VSPVITCLVAKFDKAVMFWHRRLGHVGFDHLTRLSGLDLVRGLPKLKKDLDLVCTPCR HAKMVSTSHAPIVSVMTDAPGQLLHMDTVGPVRVKSVGGKWYVLVIVDDFSRYSWVFF MATKDEAFQHFRENSTSTSTETELGSTSEVAAPLHIQRRHPPEQIIGNIVDFAETMRR EFEMSMMGELSYFLGLQIKQTPQGTFVHQTKYTNDLLRRFKMENYKPISTPIGSTAVL DPDEDGEAVDQKDVSSCFTSSSGQANNEVTRCLGRVFAVMDRESAWG</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>8832..8891#6836..6881#6509..6746#5699..5809#4105..4927#2743..2845#1784..2659#1..107#atgagtgtgcctcactcaccaagacctgctgctgctaagtgccattgccaacatgaagcctgccacagatggaggagtttggtgattggagtttgggagaggacagggtgaaggagatgaagagagagggtggtctagactgcaacaaaaaggaaatattaactagcccaaactgaaaacataggtaaaggggtagttcaaagtgaaagcttggtaataaaaggtggtccaatatgcaatttactctaatttttataatagacataaagatatataaacatatcaataaatatatgattttgttgaagtattttttttagattaatctatacatatgagctctgtatttttaagataaatattttagaaattatttataatgaaagatttcaaagtttaacattaagcttatccagaacgataagggttattgtaaaatcaaaggtgttttttactattattctgtgatgaacaattgggcattggagattattggttttgttatttggaatttattcacgaagtggttttggagatgattggatttacaggtaaatttacaggatactgctgtgattttatgtggaccggtcagactgggctctggtagccggtcagaccggcgtgtaatgcgcggtcagaccggtgcagcccgcggtctgaccggccgacactgtgtcggtttcggtttcgggttgtttatttggatatccgagtttattccatgattatgacttctagatggatactatacgtatgtaatactattgtttgctgctaatgagtcaagttggagatagcttggtttcggaatatggtttctttgtttgttccatgtgtaggtgactcgatgtctcgggagagtatttgcggtgatggaccgggagtcggcttggggataagacgacgtccgtggtggtcagagatcatgcgggatacttaggctagagttgatgcacgtggttgatggagattccatatggcatacgatggaggaattgtgtgcgtatgggatgcggagtcgaatttggaaggagtccaaatttggtacgtttggttatgtaaagtttctttcttgtactagtgggtttcctaaggtgtttaggactcctagtatgagtttggttcgtggctttaggctgcctacctcatgtataaatagagggggagcgtgaggcttctcggtatcgctttagagagcaattgagttgagttttgagttagggtttcgagtttagtcgaaatttttgtaaggagtgctgttggtgcactttgtaaacacagagagaagtaatagagtcgtcatccactttaagagttcttcgatttgtgtttcaccgggtttcgacggtctaaccggcggcgcaccggcggtcagaccggcggcatcgtggcggtccgaccggcgggcacacggcggtcagaccggcggctacaggagtcgacgacaggcgttttcggcggttcgaccgatcgatctacatcggtcagaccgacgttcattaggcggtcagaccggcgcaactacttcggtcagaccgcgatccatcgatttcgagggtaacttttatttccgctaaaagttttcggtttttgggtataccaaccattcaccccccctctggttggcttagttcttgtgattcgatcctacaagtggtatcagagcctcgttttcttctctggatttttatctatctaaagtttttgccattgctactcctgctaggttttcaactaaggctcatattttcgatggaacggatttttctcattggtgtagtaggatgcaatcttacattatggctgaagattatgatatttggagaaaagtttctcatgcttatgtgattcctgaagttattaatactgctgctgaaaaaactgcttttgaacaaaattgcaaagctcgcaattttcttttgagtggtatttctcattctgattatgatcatgttgcacatcttgaaactgctcatgagatttggaatgctttgaagaattttcatcaaggaacaaataacattaaagagcttcgtcgagatctttttaaaaaggagtacattaaatttgagatgaaatctggagaggctttggatgactatctttctagatttaataaaattttgagtgatcttagatctgttgattcttcttatgatgctaattatccacaatctgagatttctcgtcactttttgaatggtctcgacatgtctatttgggagatgaaagttacatctattcaggagtctgttaatatgtctactttgactttggattcactttatactaaattgaaaactcatgagatgaatgttctctctcgcaaagttgattctaaatcgagtgctttggtttcttcttcttcctctttggttgttgatgcttcttcatctatgccctcttttcttgctgcttttaatgccacatctgatgatcaactcgaacaaatcgaggatgaggatttggctttggttgctaaccgaattgctcgagctatgaataatgccaggaacaggaaaagaggtggtccaaatcgttgctttgagtgtggttcaattgatcatcttcgttcgcattgtcctaagcttgggagaggcaaaagagaagacaaagatggtgagaagaccaacaacaacaagcccaacaactacaagtcgaagggttttaaccaagggaggaagatggagaatcttaggaaggcttttcaacaagttcgtgccgctttcgagccactagtgatgtagatggtgaaagtggagatgatgataagggaaagaaagtctctgatgtttgcttcatggcgcgtggtgaatctgacacagagtatgaagataatgaggtgagtgcttttgaggaagctattaatattttgagtgcaaaaaataaaaagtgtgagaagatgtataaaaaacaggaatttatcattgaatctcttaaatctgaaattgataggttaaaatctcttattcctaatgatgatgattgtgaaaattgtgaggttttaatgaatgagatttcaaaaattagagatgttaatgctgcacatgatttgaaaaatagatcttctcttgcttgtagttttgctttgcacacacgcactttggatgagtagttcttaactaaaaagttgttgcaaaaatatcaaattgcttttcatgctagtttgatgtttaatatgatttctgctaaaaagttaaaacaaccttatggtgttttggattgctcaatatgtaatttgaataagatgaaactaaaagatgctttaggtcgtgttgagtacatggaagatgttgtgaaaaacaatgaagtgctttcttgccccaaatgtcgtaaaagcaaaggtgtcatggtagattgtgaaaattgtgctaatttggaaaaagaggtttcttatttgaaaaattctttgctaagattttctgatggtaaaaagaacctcaatttgattttggatcaatcaaaggatagcacaaataaccgtggtttaggttttgatccttatgcttataattctagacatcctcctgttgtgttagatgttagtgctagaagaggtgagattttggttaaacctaatactaataaaactgtgtttaaatctgctggtatcatgtctaccatgaatgcatcttcttcaaaatccaatgttgtgcatgcaaaacctcttgtttctgcttgtgttgctaaaacttctagttctaacaatgtgtctaaacaacgtgagaaatatacttgttcttttttggcaaagatggacatattgttgatttttgtttcagattagctcataaacagaaaaaggagagagagattgcttttgcaaaatcaaagtggcaaaaatctggttttccctcgaggaaactagtcagaccgcagtgggtcccgcggtcaaaccggcgaccggtcagaccggcgaccggtcagaccggctgaacagcctcggtcagaccggcggtacagaggcggtcagaccggcccccggtcagactggccactgtacctcggtcagaccggcctcggaagaatttttctgaaaattctaaaattgattttgcacgtggatatatgcctattggatcttttggtcgtgtgtctcagtactggattcctaaatttttattatcatctaaccccagtactgaggcttcgacatctgcttgtgtgtcgactttggtggcaaggaaggagaacgtgtggatcgtggattccggttgttcgcggcacatgaccggtgataaaaattggttctcctccctcaaaaaggcatccaagactgaatcaattgtctttgctgatgcttctactagtgccgttgtcgctacatgtttggttaaggtaaatgaaaaatttgaattgaagaatgtagctttggttaaggatttaaagtacaatttgctttcggtttcacaaattgttgatgaagagtttgaagttcactttaagaaaactggaagtaaagttttttattctcgtggtgattctgtgttgaatatttctcgctatggaatagtgtttaaagctggttttgaaaattctgtttcacctgtgataacatgtttggttgctaagtttgataaagcagtgatgttttggcatcgtagacttggacatgttggttttgatcatctcactaggttaagtggtttggatcttgttcgtggtttgcctaaacttaagaaagatcttgatttggtttgtacaccgtgtcgtcatgctaagatggtttctacttcacatgctcctattgtttctgtgatgacggatgcaccgggacagctattacatatggacactgttggtccagttagagtgaaatctgttggaggaaagtggtatgtgttggttattgttgacgatttttctcgatactcttgggttttctttatggcaactaaggacgaagcctttcaacactttcgtggtttgtttcttcgattggagtttgaatttcctggttctttgaaaagaattcaaagtgataatggtggagagtttaaaaatgcttcatttgaacaattttgcaacgaaagaggtcttgaacatgaattttcttctcctcgcgttcctcaacaaaacggtgttgttgaaaggaaaaatcgtgttttggttgagatggctagaacgatgttggatgaatacaaaactcctagaaaattttgggctgaggcgattaacactgcttgctatatttcaaatcgagttttcttgcgatctaaacttggaaaaacttcttatgaacttcgatttggtcatcaacccaaagtttcacatttgcgtgtttttggttgcaagtgctttgtcttgaaatctggaaatttggataagtttgaggcacgctctaccgatggattgtttcttggttaccccgcacacactcgtggctatcgtgtacttattttagggactaacaaaattgttgagacttgcgaagtttcttttgatgagactagtcctggtactagacccgatattgcaggtacactgtcacaggttcagggggaggatggtcgtatttttgaagacgagagcgactacgacgacgacgacgaggtcggctcgaccggtcagaccgggcgctaggccgatcagactgccggcacacctccggtcagaccggcgcatgacgtgcggtcagaccggccagggtcatcgggttcgggtactgttgatgctgatcgagatggtcctccagagaattcaacttcgaccagtactgaaacagaacttggatcaacttcagaagttgctgctcctttgcacattcaacgacgacatccgccagaacaaattattggtaatataggtgagcggactacaaggtctaaggtaacgactcatgatgtttgtgcaaattctgcatttgttacttcttttgaacccaaagatgtgtcacatgcattaactgatgaatcgtggattaacgccatgcatgaagaacttgaaaattttgagagaaacaaagtttggactttagttgaaccaccttctggacataatgttattggaaccaagtgggttttcaaaaataaacaaaatgaggatggtttgattgtgagaaataaaactaaacttgttgctcaaggttttactcaagttgagggtttggattttgatgaaacttttgctcctgttgctagaattgaggcaattagacttttgttggcttttgctgcttcaaaaggttttaaattgtatcaaatggatgtgaaaagtaattttctaaatggttttatacaggaggaagtttatgtcaaacaaccaccaggttttgaaaatcttgattttcccaaccatgtttttaaattgtctaaagctttgtatggtttgaaacaagcttctagggcatggtatgataggcttaagaactttttgcttgcgaaaggttttacaatgggaaaggttgacaaaacgctttttgttcttaagcatggtgataatcaacttttcgttcagatttatgtggatgatattatctttggttgttcgactcacgctttggtagtagattttgctgagactatgcgcagggaatttgagatgagcatgatgggtgagttatcgtactttttgggattgcaaattaagcaaacacctcaaggtacctttgtgcatcaaacgaagtatacaaatgatcttttgcgacggttcaagatggagaattacaagccaatttcaacaccaattggttctacagctgtgttggatcctgatgaagatggtgaagccgttgatcaaaaggagtatagaagtatgattggatctttgttgtatctaactgcttctaggccagacatacagtttgctgtgtgtttgtgtgcacgttttcaagcgtctcctcgtgcttcacatcgtcaagcggtcaagcgaataatgaggtatttgaatcatacacttgagtttggaatttggtattctacttcatattctatatgcttaagtggatattcagatgctgattttggaggttgtagaattggtaggaaaagtactagtggaacatgtcattttcttggtacatcattgattgcatggtcttctaggaaacaatctagtgttactcaatcaactgctcaatctgaatatgttgctgctgctagttgttgttcacagattctttggcttttatctactttgaaagattatggtcttacttttgagaaagtacctctcttttgtgataatactagtgctatcaatattgctaagaatcctgttcaacactcacgcacaaagcacattgatattcgttttcactttttgagggatcatgttgagaaaggagatgttgagttgcagtttttggacacaaagttgcaaattgctgatattttcactaaacctttggattctaatcgctttgcttttcttcgtggtgaattgggcataattcatccttttggcatggtttgagggggagtttgtacctcatggttttatcaagcaataatatgacaatgaaaaaaattaagaaaagagagctttgtttatgcatatggtatttttttgtgcatgctagcaatattttgaaggtttatttgtctctagcatagcttatatgtattatagtcttttcatgagatttagattttgcttttaagggagatgatgcatgacacttaaattctatacttgaattaagaaaatatgcaatgttgatgctagcatatggtttgatttataagtgctctatatatatgctttattgacttgttattcttcaaatacctttaattgctcattgtgaaaaagagaataaaacatataaaaaaatgaataccgaatccctggaaacagtcttgacgacagggacatacccggaataaaagagaaaaatatgagcaaaaaggctcaagaaaagaaaaagttcaaaaaattctcttggttattttgtgctaaaggttatttgagaaagagtgataaatgcaataggtatatgtgtttagtgtttattcttcaacctatgtgcttgttaagatgttgcattataaatcgtatgaaatcatgaattttgattgttgattcaagcttaattgtaaaatcgttggttcatggttatactttaatgcatacttgttttgttatatatgggtttatcttctttttattgcaacacatgacttgatatgctatatgtatgctaagctcttgaacattaatgaacataattcctatgcttgatgaaatcattatcaaaagggggagaagtaatgtggatttttgaaggtgaatttttggagagttgttgagaagagcatgtttttggttcaattgggaatttctttcttttcaaaagggggagaagttttcttttggatttttgagcacgatgtgtacatttgtacgaagtgtgctttttaccaccaaatatcaaaacatttttatgagtttgccaatgtgttcatcaagggggagaatgtaaaatcaaagatgtttttgattatcattctgtgatgaacaattgggcattggagattattggttttgttatttggaatttattcatgaagtggttttggagatgattggatctacaggtgaatttacaggatactgctgtgattttatgtggaccggtcagaccgggctctggtagccggtcagaccggcgtgtaatgcgcggtcagaccggcgcagcctgcggtctgaccggccgacactgtgtcggtttcggtttcgggttgtttatttggatatccgagtttattccatgattatgacttctagatggatactatacgtatgtaatactattgtttgctgctaatgagtcaagttggagatagcttggtctcggaatatggtttctttgtttgttccatgtgtaggtgactcgatgtctcgggagagtatttgcggtgatggaccgggagtcggcttggggataa</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001188501.1 RefSeq:Os08g0201900]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 8]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 8]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information