Difference between revisions of "Os08g0245900"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
[[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 8]]
−
GeneName = Os08g0245900|
 
−
Description = Conserved hypothetical protein|
 
−
Version = NM_001188537.1 GI:297726204 GeneID:9272267|
 
−
Length = 11899 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os08g0245900, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 8|Chromosome 8]]|
 
−
AP = Chromosome 8:8906896..8918794|
 
−
CDS = 8906896..8907013,8907512..8907843,8918069..8918126,8918544..8918794|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008401:8906896..8918794
 
−
source=RiceChromosome08
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008401:8906896..8918794
 
−
source=RiceChromosome08
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atgccacatgtcaggtataaccgtcccggaaaccgtcatagggacccacatgtcagcgccccggagaagtttggaggcttgcagggccagcccaggttcggccaagacgcgttgagtgctcactcgtccgtcgacatcgcaatggaggatgcagagttcacaccaagattgttgagtgacttcgacctcgacctcactggtgaccaggagatgcaagcctaccggatgctcaaggactggatttgttggagatctctctcatgctctctcgatcaaggttgcacaaccattatgctaagcttctacattgggagagaatcagatgctaaactgtgcgcttcaacggggatgatgaactcccttatacggaagctcgccactgtgtcgagcgaggacatcgatgtgagacccttggagaggaagatcatcagaattaactctgatcgcttgttgaaggtgatccatcatgtgggggacgcccaagccatggagtggatgcggcaaatcctggaggtggcctacgacgtggaggattggattgatctgtgcatccatctccatgggcgcgttagagcagatcaactggaacggatagaagaattcattgtccggatagacaacgtggaagaacgtctgagcagttctaacaatgaaatcttaccgaagatttgggtttgtggggtgggtccgtgggtggtgctggactgctggtggtctgccggggtgggtgggggtggggtgaggggcggttatatgtga</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MPHVRYNRPGNRHRDPHVSAPEKFGGLQGQPRFGQDALSAHSSV                    DIAMEDAEFTPRLLSDFDLDLTGDQEMQAYRMLKDWICWRSLSCSLDQGCTTIMLSFY                    IGRESDAKLCASTGMMNSLIRKLATVSSEDIDVRPLERKIIRINSDRLLKVIHHVGDA                    QAMEWMRQILEVAYDVEDWIDLCIHLHGRVRADQLERIEEFIVRIDNVEERLSSSNNE                    ILPKIWVCGVGPWVVLDCWWSAGVGGGGVRGGYM</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>11782..11899#10952..11283#669..726#1..251#atgccacatgtcaggtataaccgtcccggaaaccgtcatagggacccacatgtcagcgccccggagaagtttggaggcttgcagggccagcccaggttcggccaagacgcgttgagtgctcactcgtccgtcgacatcgcaatggaggatgcagagttcacaccaagattgttgagtgacttcgacctcgacctcactggtgaccaggagatgcaagcctaccggatgctcaaggactggatttgttggaggtatgtcacgagggcctttggccaattcttgaaaccattagagttatcaaaatgtcggttaagtcccttgggcgaagccgttgggcaaagccgaaggatgaggaccactgggtttgccatcaagtttgggcgaagccaggtagtgaagaccggtggattcgcatgttagggaaccttatgcatctaggtgattgatatttgagatatagtttagatgaaggaaattcttgtgttctatctcatggcaattggggatttgtttttaaaatcaaaaattcatttgaaagcttaatcctcatatgactttattcctacctaccaaggtcatacaccaaaatattaatgatgaaccttattaatgtgtatgacttcctgtcattatattgagctttaccaaattattgtgactcgtgttagatctctctcatgctctctcgatcaaggttgcacaaccattatgctaagcttctacattgtaagttggcaccattccatccatttccgttaccactgaaaaaaatatgatgaataaattctccatccaatttatgccttcttctcctagaaaaatccttggaaaagaaaaagtaacagaggggaatgcatggctatgaaaaatattgctctttcaaaaatatggagcaacattgaaaaaaaattaaaaaaaagaaagtttacaaaggagaaaattggagaagaaggcatatacaaaggagaagcatcttctttatttcccattttttcacatatatcatacactttccaggtgcaatccttgatccgagagtatgatcgactatcttcttgagtccatttatttggttttgcaatatatatatatatatatatatatatatatgatgcaggtatgtcccgaaattatccctaccaaactccacataaacggccttcagattagggaataattttggcaaaatatgcattggtaaggatccacagacattgcaaaatatttgagtgattgagggtaagtcattatgaggagaaaagctgatttgtgaaaatttacaaaacccaaaagtctgagatggagtatgagaaggaccggattcaagactgttgcatttttcaatcgcccaagatggtaagtcggagtaattccagagttgttggtaatcctcttcttatttcttttgctctgttaattactctgattataatagaaatatcttttgattaacttagttttgcttcatgagaattatctcttggttagttcctaattagcatgcaggatcatcgttcactataatccagtaaaatatagtgattgctttagtgtgtagctaacattaaagtaagttattaactgcgtagacacagtgtctaggtagttgattttcggtgtttgctccgcatcccacggtaggtgtgaggtgggtgtagaggtggtgatagccctcgagatcactgaagtcctccctgtccgggtgcgtaatagagcgatatctgggagcggcgagctggccagtgcccgagcagtggttctacacgaaccgggtgacagttaacacctgggacagatgctccaccacgttcctctccaaataattcccaatgggcaaaactaacgcccttcgcgagagaatatcaagtttccagcagaccagggatgagacgtttcccgaagcgtggaaacgtctgcaggagtatggagccgcctgtcctcatcatgggatggatgactggctcatcctgtagagtttctacaatggactcactcccccgtccatggatcacctggatgctactacttcgggtgctttcttctcaaagactgatacgacccctgtagggggatgtcccgatcttcacggtgtaggatcaagaaccgataactagcctcaaagagaccaagataactagctgcaaacagccaagataacagtgcaacctaatgatcgtactcgaagccaaccaccgtctctattacggcaacttgaatcgagagtttttccaaccacactctaagttaccaaccaacacaacctggaatcaatcaaggaaaaacctcgaagggaccaggagcaccaattggggggcgtcgaacgccacttctataatctcacaaggaaatcacaagagcaaaggggtagagatctctctctgaatttgttagcacacagctgaacaaaaggggttcatattctcattgtcaaaagtcttccaaatgataaaacataggggatatttatactaggaaagcccctcctagatggggataaacatggcttttgaaattcaaggtaagtgggctagctcaagtgtctccatgagtcattcccgagcaggttcaatagagcctttcagcttttgtgcagcctccactaaaatagacattactctctaataggaagtcgaaacgatgagccgtttattggaagtgaaactagacttgattatctttcgaaccatatatattatgcatggaggaatttgactggctgggtcacacacccccttagaagttgaagcatctatgcataaccggtctgctcgttgtcgttaaccatctccacttgagtgagtgccactccatcttctgtgcaatacatctcatcctttatgcaatcattcattgttgtagtagcgaaatgatcctcggacataaaccttaaaaatgcaaatgtacaccatttagatagtataaaattctcatcaatagtaaaaaaccgatagcacatccatgactcgcatggaacatgaataattgaagccggaaacaaagaactaaattgaaaccatattgcacatccatggcaagcatggaacttgaattatttaaccataaccagaatccggaatattgatacaagaataacgtcgtaaacataagataaacttgaaatctaaatggcatgaacaaccgtttgaacataagcggtcacatatcacatagaaatataatggaaatagatagatagagcaaacaatccatgaatcacacaattaattcgtcatgcacttgccttttaacctcgacggcaacccgacagaccaccctccacaccagatatctccacacctatggagcaaaactacaaataaaccattatattcaactaatgatagttgcaagggatatttactaaaaccgaaacctagaacatagaaactttgactgatttgtattaaacaacctacagcaattctgttactgttttatacataactcacaaacagtctaacggaatctggcaaataatacaactccgatcatctagaaaaaaatgtctacaactttcatgatggacgaaaaatcagattaagcctctgaaggtcttagattaaggaaaaacgaattgatgtcctcgtttccagacccggccagcagtactgttgattcaaacctttatatctcgaaatatatacattttggaaatcgacagaacaagacctacaacttttatgtagaaagcatatttttattctgccatttagatggtctaatttgcgcttgaatgcaaacttcagaatctgcccaagaattcagactatccagactaaaacaaccataactggagttctactcgcccaatcaaagtgtactttaacaatatggaaagctaagaaaaacctctacaactttgtttataggcagcctgactaattccgctatttagcccctccgaaaacagttcaatctactactatctagattatgaaaaaaaaacaacagtcatactaaaaaaattcatatcgcctaaaccacttgagataaaataactccctttggtcaaaagatagatcactacatgatctacaacttttatatggacactttgatcagaataaatcattttgaccacgaaattgatggaaaacagaggcgctataaatcttcccacgcccagaactacccatccgaatcacaacgcccaaaacgcttctctaaccctcctcaaccacaaattgaaccactaaaaccaccctagaacaacggatacatcaaggggaaaagcctcacctagggtttgctcggagaacttgtgagattatgatgggaacgccaacccaccactcctcctgcttccctcgtcttcctcgatccgtttttccaatcagattcttgattagggctatggttcttggagatccatggagtagggttaccaggggagaaaagaatatgtgagttccattggtgccaagggggagggtgtggcggctagggccgcaggagcgatcccccccttttttatgttggttaaatagagaggctactaaagatcgaacgaaccacattaattcaatccccggaacttcgttcggactccgattactataagcttatagtctatttcgcactacatgatgagccctacgcatccacggttcctgatcgcctattcgaacaacggtttaaaagttgaacttttgcgcgtttgttctaatttttcccaaaatacactaactcgaaactcggggtattacaaatgttaacttgtatatgcatatttcccttcttgcatgtttcctttccttgcatatttcctttcatgcattgcatttataacttgaaaacaacataaaaatttgcaaaatagaaactaccaaaaaatataggatagattttattatgctaggtaagacaacctagttctccatgttgaaatgatgaatagttgctctgttttatatctttaatgtatgtgttcatagttaagtactatctcaagttttaagtgaaattagccaacaattatccgggaacctgagagatatgagttgcacattgcgcgatctaagcctaagttattgagagatatgagataatgaaatagagttgctataatcttgatccaagcttgatataaattcctgatgatttgttcttcaaaatgataaatttgaaagttcattatttgatataaattcctaccatagccaaatatagattttactattgaaaccttatacttggttgcttgtatttccattgaactttgtcaaatcttgtgacttgtgtagatgcttttcatactttatgatcaagatcatacacccacatatacacacatgctaagctcctacattggaagatagcatccatgtcatccaccatatccatgtcattatccacaaataagccctacattcattcttcctttccaaagaaaaatcctttgcaaaagcaaaagaaaaaggagggaaaggtatggctataaataaaaaataaaataaataataaactcttgctcttccaaaagtggagcatgatgaaaaaaaatatatagccatactctctctatgaaaactaaaggatattttggaggaaaagcataagcacaaaggagaagcattttctttatccacatgtcattttgtaccatatattccacacacactttgcatgatcttgatctaagtatgacttgctatatgctttaatctagatttttagcttagtgatatatgtgactacaagtatgcctcatttgatccttaccaagctccacatattcaaccttagtataggaatcaaaaggcaatttttttggtgatgaataaatattcaaccacttttgagtgattgagagaatcacttgaggaatatagttttaatttgcaaaatttttgaaaaccatccggaatgaaaattaagcagggagatagaaaatggtactctatgatttgttcaatttctcaatctcttaaggtggtgagaagcgtgttgtcacgcccagaaatttagcccaaatttctagactattttgtgtattaaatccctgtctaggaccagccagggtagacaaaacgacaagtaatatatagttccaaacgtacataaagcgtaaaatacttacaggagaggctcttagtcctcgcaccgaaaaggaacgacagcagcggaaaaaggcgatcctagcggggcttcagctccactccacaggcaaaactcaactggggtctgagccttgggcttctaactttatcttcaactcagaagcactacacttctgaaaaggggaataatagcaaggctgagtacaaccaccgtacttagcaagccacaccaacgatgcagacgtgcaaggggatacaaggatggcttgaggctatttgcataaaggcggttgtaaaacattttattgagcaaaacagtaaagctattgagtaattaaggtaacattaaatctccactgatcaacgctacaccgcgttgaacaggcccaaccaactcacctgaactacagtgcattgagtcgatttattaaggtgagactaatcacggtgaatctggtcgatcgcccataaccgcgggcacggctattcgaatagttttactctggccagaggtgcacaactgtacccacaagacacaatccaccggcatgtcaccgtgcccggccggacacgccaccatgtcgagtgattgtgacaagacccttcatataacccgctctgaccaagcacaccacacctcaggtttcacccccgcccccagcaggcagcgggcagtcccctctcctgcctagatgaatccggaagcgataaagaccgtcgcagggcccgccccgctccatcatgcccacccttgccaataccggcagaaaccctaaagcgagaagcagccgatagaggtaaattgatatgctaagactagattaacagagacatatgataaataggtagacaattatatcatccaaaccggagcaatccaagaggtcgaatgtactgatgcagccttgaacgatgctgatgtagattagacaattgcctgggccgacggaacattggacttaccctttagccggagattgaacactgatgcagccccgcgtcaggtgccaagtcccgccggatgataaaataaagtagaaaaggtaaaaggtggcgatgcgccgaattgtattgatcgtagcgatagattacatagacctagagtgtacatatttatacccatgggttgatacaagtccttgtcagacaagaaagaaactttcctaaagataaaaggaaaagataaagtccttataggacactaaacacacttttctaaagataaaaggaaactaacaaactattcctaattaatatataacttgccatgccgcattctctttgaactcggtcttttctggataagcttcctttagtagatcaatttccttaaccgaatatagcaagaatccgacaactgacgacatgacaactctcatcggctaatctcaggacttcgaagccgatgctgactctaagccgatgactactctgggcttaccaaatttcactgttaacaggcccgtcctccgcctactctttattctaaaaacaaacataactatcgttggaatttattttttattttctaaaagtcccatcaaccgtcagcggctctgcaactatactactatacacccgccggctgcttctcctttttattgtcattgacattttaaaaattgaatatgattatcattggggtttacttcttttttactttctagaagtcccggcaatcgccttcctcatttgcttcacggcctcctgttgtccctccttttaaacatcattaggattctattcggtgttttattaacaattttatatgttgtatcaacagccactgctctactcctctgtaggccatttacttaagttatctcgtcatgtgttttagatggtcttttctttcaatagtatttatttttatcacaaattttagctatttataaattgtattcctaattgaaatcttatttttccttttctagtttcataaattttttttcaaattttaattaatacgtattgtgctcttttaatatttttattttttattttcaatttcagttgtttcaaaattatattcctacttgaactcttttttaatttttctaattttgggtattattttatttttttctgaattttaattaatctcatattgggttcttatatggattatttttttaatattgcttatttttaattccgaatttcagctaattttaaattgtattcctacatgaactcttcttttattttatttttttggctaattttggattttattttatttttattatgaattttaattaatctcatattgggttcttatatggaaacttacttatttttaatttcgaattttagctatttttaaattgtattcctacttggactctccttttcttttctaattttggattttattttatttttattttgaattttgattaatctcgtattcggttcttatatggaaacttctttcaatattgcttatttttaattccgaattttaactatttttatattgtatttctacttggactctccttttcttttttttctgtttctctgattaatgtgggaatttttagcccccacagcgaacatggtacctcctttcaaagttattttaataatataatagatagatactcttctttatacatcttcggtactttgtttagtatgagtaatgttcttattttatatttgtgtcatattgattgtgtgggtagcctaccagagaggtgcgggtttaatgtctgatttatcagttgctctatgtcatgtgcacgggtgtagagtaatatttagtaatgtaagcatggtgcttagattattaaatatcattaattgggcatatatattgcgggacagtagaggtgggctgctgatggtgacaactcagtacgagtattcctccacgttagtatatattcttaagacaaattcctagggagggtactcctttgtatttagccccggttggatggccataacaggttgtcgtaaggaactcggcaacccatggtggtctctcgaagtaccaggaggacactgttagggggtattggccacacaattgtatactagcagatgtaaactaggatttgagtgtatatcagaagtataggaattgagtgctttctaattcttcttccacttagttagaattactttattatgaggatttgattagctttgtttcgtgtcactctacccctatatattaaacttaactcatacttagactttgacaattacaagtaatatatgtataaaatacgttagcaaagtccactcttattatcttcccttgggattaaaaatacgataccttagaatacttccgggtgaaatgctacaatggtatatccgtgcgctcgcggattacttctgtaatcataaatataccaggactatttctgacgccattgctgggaatgaatatctctagtaatatcgttaagaaatactaacagtgcactagatgctagaaagaaatggtgacatagtgatttatactggttcagcccctcgggatgaggtaataccctagtccagttgtttggtgcctaaccctccaggggtgttgccaatacccagaggatgcgatatcccttataatccgggtacctgccatccgtcatgatatgacggaataggtttctatctctctattctccgctacttatagtaacagattatataggcctgggcccatatcacgcaagagatccagcctccgagtaccatgatgggctatcctggtacgataacttccacacaaccatcggagggagcaaatatcacgagtgtatacagtcctcaacgaccaagggcgtccgcacgtggacgcagtcctcaacaacgtccgcatctggacgctataaggaagagcgtccttcctatttctttaattttgaaactatgtttactacttatttaattttagagttattaattattacaaatttacaattaattttcttgttatccatcgatacgtaatgggcagtgcttcgaactttatttaaggaactgtctatatgagattcatatgattttttaggcttccatcatgcactgtctcaaccttcccatttatttaagcaaactctggaatgaattacattcgatgcacagcataacgtggcttagtaggtagggtatgtataaaggtagagtctaatataagctctctatactaattaatattactagagattatctataatagtagagacaataagatttctataaaccattaatgcaccaaatatttttattattatgcttatttccttttctccaccctcatgcaacaaattttccattaataaatgctaagagtcgactttgagctgttatcatgcgtagtaacgatgtttcccattacttccccctcattcttccacgtcactaaatttatttgaatgacaatgaagagagcccgttattagatactaccatttgtacatgccctaagcttatttatcgggaagcttatttatcgggaagactgtaagccttcttaggctgcgttcggagataactctttctctccgcacggaaaacggaatgatccattaacgcgtgattaattaagtatttgttaattttttttcaaaaatggattaatttgatttttttaagcaactttcgtatagaaattttttgcaaaaaaaacaccgtttagcagtttgaaaagcgtgcgcgtggaaaaagaaggagaagggttggaaaccctgagtagcaaacacagccttaattaatgtcaagttgttgtcctacaatactccctcggtccctcccacctatcgttgacctttgtgattactctatggtaatggcacactccaacactccattatattatcggtctgatgaggatgaggtgttagcttgttcgtctcacccatatcatttcttgttaggggagagaatcagatgctaaactgtgcgcttcaacggggatgatgaactcccttatacggaagctcgccactgtgtcgagcgaggacatcgatgtgagacccttggagaggaagatcatcagaattaactctgatcgcttgttgaaggtgatccatcatgtgggggacgcccaagccatggagtggatgcggcaaatcctggaggtggcctacgacgtggaggattggattgatctgtgcatccatctccatgggcgcgttagagcagatcaactggaacggatagaagaattcattgtccggatagacaacgtggaagaacgtctgagcaggtataatcttttatcatatattggacgaatttgaaccctattctgattatcctcctctgagccaatcacccatcggtgataatcctcacatgctctatgcgatggaggaagacttgatccatcactgtgaacggaaagtccggctgagaagggaccttgtcttgaatttgatggataagctggtggtggattccgaccagcagctgaaggtgcttttcattctcggggataggggtattggtaagactacactagccagccagatttatcatcgtacaattgaagaacgatttgattgccgagctttcgtttctgttggtcaatatagcctgtcagatcaaccatactgaactgtacatcaaatcaggcggcgatgagcaccaagtcattgataacttcaggaatttcctcagaaataagaggtaactgtttcacgacttgttttcaatcgggtcaaattttctcctttttttttctgctttctaaaattttctgcagttctaacaatgaaatcttaccgaagatttgggtttgtggggtgggtccgtgggtggtgctggactgctggtggtctgccggggtgggtgggggtggggtgaggggcggttatatgtga</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001188537.1 RefSeq:Os08g0245900]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 8]]
 
−
[[Category:Chromosome 8]]
 

Latest revision as of 12:59, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information