Difference between revisions of "Os08g0295300"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
[[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 8]]
−
GeneName = Os08g0295300|
 
−
Description = Similar to Threonyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (EC 6.1.1.3) (Threonine--tRNA ligase) (ThrRS)|
 
−
Version = NM_001068010.1 GI:115475757 GeneID:4345200|
 
−
Length = 9581 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os08g0295300, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 8|Chromosome 8]]|
 
−
AP = Chromosome 8:11975902..11985482|
 
−
CDS = 11976088..11976183,11976397..11976468,11976718..11976789,11977796..11978017,11978096..11978188<br>,11978756..11978848,11979793..11979879,11980205..11980237,11980338..11980432<br>,11981837..11981921,11982025..11982111,11982226..11982322,11982416..11982504<br>,11983004..11983093,11983176..11983303,11983629..11983704,11983915..11984004<br>,11984096..11984155,11984321..11984558,11985099..11985433|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008401:11975902..11985482
 
−
source=RiceChromosome08
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008401:11975902..11985482
 
−
source=RiceChromosome08
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atgctcgtctgcctccggcgacgaggcctctcgctcctccggcagcgcccgccccgccccttcccccctctcccgcgcccgcgcagcagcccaccccgcgtcgcctccctccgccccctctccgccgcggcgatgggggagaactccgccgccgccgccgggaaggggaaggaagcgaaggggaaggcgacgacctcggcctcggcctcggcaccgaacgtcgagcccgacgtggcctaccttgaggcggtgacgcagaagcggatccggcagttcgaggagatccaggccaagcaggccctcgagcgcctcaacatcggaggcgagcccatcaggataactttgccagatggtgcagtcaaggacggaaagaaatggatctcaacccctatggatattgctaaggagatatcaagtggattagcaaatagctgcttgatagctcaagtgaatggaacactgtgggatatgacgaggccactggaaggtgattgtgaattgaagttgttcaagtttgatagcaatgaagggcgtgacaccttctggcactcaagtgctcatattcttggagaatctcttgagagggcatatggctgcaagctgtgtattgggccatgtactacaagaggggagggtttctattatgatgcctactacaatgatctgacattgaatgagacacattttggtatcattgatgcccaagcacagaaagctgttgcggaaaaacaaccatttgaacgaattgaggtctccagggcagaggcccttgaaatgttcgcagaaaataaatttaaggttgaaatcattaatgagttgcctgaagacaagaccattacagtatacagatgtggtcctctagttgacctttgccgtgggccacacatccccaatacttcctttgttaaagcttttgcttgtcttaaggcatcatcgtcgtattggagagggaaagcagatcgagagagcctgcagagagtatatggaatttcttttcctgattctaaacgtctcaaggaatataaacatctgctagaagaggctaagaagcgtgatcataggctattaggacagacccaggatctcttctttttccatcaacttagtccaggaagctgcttcttccttccacatggtgctataatatacaacaaattgatggattttttgcgacagcaatacagagatagaggatatcaagaggttttgagcccaaatatttacaatatgcaactctgggaaacctctggacatgctgcaaactacaaggagaatatgtttgtttttgagattgagaaacaggaatttggtctcaagccaatgaattgtcctggccattgcctaatgtttgagcacagggttcgttcatacagagaattgcctctccggatggctgattttggagtccttcacaggaatgagcttagtggtgcacttacaggtttgacacgtgttagaagattccagcaggatgatgcccatattttttgcagagaaagccaaatcaaggacgaagttaaggctgttttggacttcatcaattatgtttacgagatatttggatttaaatatgaattggagctatcaacgagaccagaaaagtacttaggtgatattgaaacctggaacaaagcagagcaacagctgacagaagccttaaatgagtttggaaagccatggcagatcaatgaaggtgatggtgccttctatggtccaaaaattgatattggtgtgtttgatgccctcaagaggaaatttcagtgtgcaactctacagctcgattttcagctgcccctacgcttcaagctgacttactctgcagaggatgaagccaaacttgagaggcctgtgatgattcacagggcaatcctaggttctgttgaaaggatgtttgctattcttttggagcattacaatggtaaatggcccttgtggttgagtcctcgccaagccattgtttgctccatatcttccaattcagtggaatacgctaaacaggtccgtgctaggatacatgaagctggttttcatgtagccatcgatgagacagacaggacaatacagaagaaggtacgggaggctcaattagcccaattcaactacattcttgtcgttggtgcacaagaagcagagactggacaggtcagcgtcagggtaagggacaaagctgaactagccacagtgagcattgatgacatcatcacacgttttaaggaggaagtagcagcttacaaatga</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MLVCLRRRGLSLLRQRPPRPFPPLPRPRSSPPRVASLRPLSAAA                    MGENSAAAAGKGKEAKGKATTSASASAPNVEPDVAYLEAVTQKRIRQFEEIQAKQALE                    RLNIGGEPIRITLPDGAVKDGKKWISTPMDIAKEISSGLANSCLIAQVNGTLWDMTRP                    LEGDCELKLFKFDSNEGRDTFWHSSAHILGESLERAYGCKLCIGPCTTRGEGFYYDAY                    YNDLTLNETHFGIIDAQAQKAVAEKQPFERIEVSRAEALEMFAENKFKVEIINELPED                    KTITVYRCGPLVDLCRGPHIPNTSFVKAFACLKASSSYWRGKADRESLQRVYGISFPD                    SKRLKEYKHLLEEAKKRDHRLLGQTQDLFFFHQLSPGSCFFLPHGAIIYNKLMDFLRQ                    QYRDRGYQEVLSPNIYNMQLWETSGHAANYKENMFVFEIEKQEFGLKPMNCPGHCLMF                    EHRVRSYRELPLRMADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCRESQIKDEVKA                    VLDFINYVYEIFGFKYELELSTRPEKYLGDIETWNKAEQQLTEALNEFGKPWQINEGD                    GAFYGPKIDIGVFDALKRKFQCATLQLDFQLPLRFKLTYSAEDEAKLERPVMIHRAIL                    GSVERMFAILLEHYNGKWPLWLSPRQAIVCSISSNSVEYAKQVRARIHEAGFHVAIDE                    TDRTIQKKVREAQLAQFNYILVVGAQEAETGQVSVRVRDKAELATVSIDDIITRFKEE                    VAAYK</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>9300..9395#9015..9086#8694..8765#7466..7687#7295..7387#6635..6727#5604..5690#5246..5278#5051..5145#3562..3646#3372..3458#3161..3257#2979..3067#2390..2479#2180..2307#1779..1854#1479..1568#1328..1387#925..1162#50..384#ctatctaccctaatccatccgccgccgccgccgccgccgccgccactttatgctcgtctgcctccggcgacgaggcctctcgctcctccggcagcgcccgccccgccccttcccccctctcccgcgcccgcgcagcagcccaccccgcgtcgcctccctccgccccctctccgccgcggcgatgggggagaactccgccgccgccgccgggaaggggaaggaagcgaaggggaaggcgacgacctcggcctcggcctcggcaccgaacgtcgagcccgacgtggcctaccttgaggcggtgacgcagaagcggatccggcagttcgaggagatccaggccaagcaggccctcgagcgcctcaacatcggaggcgagcccatcaggtgagccccgttctgcgattcgttgtgaatttgatgtagttaagaaactgggagggctttgattcggaaaccgtaatgcttgcggcgcgttatagatgaaaatggagttagatactacatggatggcagatgtctcaggcattgagatgtagatataggcatatagcacaccaagggaatatcctcgatagccatgctttgtgctgcataatttggagtcggattttgagtgttgggaatatttgaatgtcgatgcgacgacaaaatgggcgctgcgcaaactgcataataatgccataatgttattcaactttaacatccatctgtctttaataagaaaatagagacggcaagcatttcttctgcctaaatattctaatatagaaaacccttgattatatggtgcttaggtttccttttctcaatgtacctttgctagttacaatacaaatgtggcacactgtgacctgcaatgtgcagcacaatggcaatggcaattaattcttctcatgtgatttttttccctgcaactttcttcaggataactttgccagatggtgcagtcaaggacggaaagaaatggatctcaacccctatggatattgctaaggagatatcaagtggattagcaaatagctgcttgatagctcaagtgaatggaacactgtgggatatgacgaggccactggaaggtgattgtgaattgaagttgttcaagtttgatagcaatgaagggcgtgacaccttctggcactcaagtgctcatattcttggagaagtgagttaaagcttcataatttccttgtatcatgtttttttctttaagcaagttgtatggttgtctctttttcttttttgtttacacatcgagtgattttgcatgtctctctgctataagtccttttgaattcagtattttctaattgaagatgcacttttgcagtctcttgagagggcatatggctgcaagctgtgtattgggccatgtactacaagaggggaggtattgaattaatcaaaaatcgtgttcagtgcaagaaagataataagccctcttagtgattaacataatgtttctacttttacctgttaagggtttctattatgatgcctactacaatgatctgacattgaatgagacacattttggtatcattgatgcccaagcacagaaagctgttgcggtatgctcttattttgaactcattttaaagtttgtgtttacccttttttgtggacgctacttagcagttttactctttgacttatttgatattaatctgtcatgaagtgtgatatcgttattggattccatgattatgccatgttttctttgtaacgtaattggaatcatctatctgctaactcttggtttttaacccaacatggtgcaggaaaaacaaccatttgaacgaattgaggtctccagggcagaggcccttgaaatgttcgcagaaaataaatttaaggcaaaattcctgatttatgcttgttcttgatcttttcttgtactctaacagtcccattgtttcgcttattcatatgcttatccgaattgcttattaacaaacaaaaaaaatcatttgtgactaaaacgactcaaaagaaaatgctgtaaaataaactataatgaaagaaacaagaaaaaaattaaattaaattaagttctaaatttcaaaacttgacttataagcataagcataagcgaattaatgaggccctaaatatctatttctgcttatatcacatttgagattttattaaattttttatttgtttgaattgtgtttctaggttgaaatcattaatgagttgcctgaagacaagaccattacagtatacagatgtggtcctctagttgacctttgccgtgggccacacatccccaatacttcctttgttaaagcttttgcttgtcttaaggtaattctttggttgtcttaagcttttgcttgccaatatttttatggaactatccaatttgtacttgcatgtaaatatgtaggcatcatcgtcgtattggagagggaaagcagatcgagagagcctgcagagagtatatggaatttcttttcctgattctaaacgtctcaaggtatagcatatgattttggctattgttcagatatgggcgttcattaattaatgtggagtctgtttttgtgctatcatgtctgtgctactggacacaataatgtaccctctatgtttgcattttagacactagagtattaatatttcattgtgataagattggagttgatttggcaggaagtttagcgtgcactacatggcatgtaaattgcacaaaatatacaactatatctcaaaagtgtatctatgggctctgtgctttggtggaggttggggttgatttgcccaactgaacaacaattgtcattacagaagtatatggtttctttttattagtcagttattacgaatttcttcaattaatacatggttaggttcagacagtgcaacccttgtcagctattttacaagttactaattcctaagttcttttttatccatttgttttatcactggtacactatggttttcatatatgtttcctgctcaataatccataggaatataaacatctgctagaagaggctaagaagcgtgatcataggctattaggacagacccaggatctcttctttttccatcaacttaggtaactcaaggttttcggtttgactttttcatatcttaatttaccttggcttctattctgcctcaggatgtttgattcactttgactgtgcagtccaggaagctgcttcttccttccacatggtgctataatatacaacaaattgatggattttttgcgacagcaatacagagatagaggatatcaagaggtgggcattaatttgattggctggtcaatcttttgttcagattatgattagattactagatcatgggcatgcatttccactgtttctctctgttcatgatgtctgtattttcaggttttgagcccaaatatttacaatatgcaactctgggaaacctctggacatgctgcaaactacaaggagaatatgtttgtttttgaggtaagtctagtgtgcagaggatttgctctgtacatattatagattacattttggatgaattacgatctttattactgggtgcttgttggtcttattcttgcagattgagaaacaggaatttggtctcaagccaatgaattgtcctggccattgcctaatgtttgagcacagggttcgttcatacagaggtaaatctccttcataatggcatagttgtatcacaaaatgtatctcttttatcaagtgaaaattcctgctgtcaaagtaatcgcttcaaccttctgcctgtatgaactgtttttcttctatgatttaattctccctctatttctttgatattgtgcatgcacatttattatctagtggcttgtgctttctcattaaaattttcataaactgaaaatgtaggcagcaaaaacagttccttagttgtctggcaattaaactaggggtgggcataattaaccgtgacgaagaactgaacccgaaatgacccaaactggaatccagtaaaaatatcgggcttcagctctcaataactgaatttagtcctgttattttggttattaggctcgggtaattgagaaatcgaaacatatcaataagccttgtccagttcagcccaagagagaaaaccctaacttcccctcacctccccactcttaactccccagtccccacttctcctaccactaccccgactcctcccacacacggcaaacgctgctgttgccgccccgccctggctcccgcctgtgcccccacagcatgctgctgtctctgcaacactctgcctccgttgccgcaattccacgccatcaacagtggggaccaccttcaccagagatctcaaggaggctctcggtgctctgccacgccggagagctcaaggcggcggttgctggggaacactggtgtcgccaccgttgtgaacatgcggttccctgcccatggtcccctgatggcagcggattggtggacacgtctatgcccgctggctacatctcgtgctctttgctccaaattgtgttgatttgaacttcatctatgtagggtattgtgcatagatctaatttgtgttgatttctgttgattctgtggctgattttgggattatatgagttgattctgtggctgatttgagtattctatgatttctttttggatgtgtaaaacagcagttgtaatatcttggttagtttggtcacaaccggagaccgaactgaactagccgaaaccgaattcgtcagtattcatttttttttccaatgtgtttcggtctctattttcagatgaccgaacttttcaaaacaccgacgaactgaaccgaatgcccacccctaaattaaattcctaattcggcaaaagtaacggctctagaattacttagtgaattgttttttggtgaatgatgtagtactgaaattgttgtccacatgtacattttgaactattggcttttgctattgatataaatgatgaacttcccttttctaatattatagcaaggggaattttatatatgatgtgttgtgtttttgtgttttgacaacctttttcttaacactaacaacttaattaaaatgctgcagaattgcctctccggatggctgattttggagtccttcacaggaatgagcttagtggtgcacttacaggtttgacacgtgttagaagattccagcaggtaatgctaatgttgttttgtgggttgttaatttctatactaattcaatccagttagtaatctccttgttttaaccacttctgatgcattttccctgtaggatgatgcccatattttttgcagagaaagccaagtaagtttgaattctgcaccattctgtatatctgtttttagtagggaaggggtgccattgcaatcataatgacatgctactgaacagtgtatttacactgtgtgacataaattagtttaggcaccagaagctcataatatttagatgttcatgacttgcatactgtatggatgctagtttgtattcccatttgttttcacaatgtttcagatggtgttaatcacaacctccttttaacagctgcactgtgcttcggataattttaaatagtgtcccctgattgtataagggcctacttttcttaagagttctttctttgttgcagatcaaggacgaagttaaggctgttttggacttcatcaattatgtttacgagatatttggatttaaatatgaattggagctatcaacggtaatcatctcgttgttgctgtatgattaatagcatctagaaattcacaggaactaggattcttggaacttcaatatgtattcgagaagtcacataaatagatgcttagcaagtgttaggttgctgttataatctggatgaagttggttaagtatctttttaccatttctgcttcccatgtctactcctgcctaaatcccaacataccaggtaactttgtgatgattgcatttaagagaaaaaaaggttatctctatacaaatttttaaaggttaacaagtcatttcatctcctatggtcctactggaattcctgtgcacatttcttgaacaacgtagaaggaaaatcgaactggctatgaagtataactatgttggtacgatacaatccatttttgcactgtgtattgtgaacctgaggttggtgaggtttatgaaaggcctatgaacctgctagtctctgttttggcatcgtagatcatttcatactttttgtttaatttcaatcgttgtaggcgaatcataatttatcattgtatgtgggctttggacatgtgctgagaaaataagcatgccagatgttgaacatgttacttgtattttgcatctatgtactccctctgtccacaaatataagcattccatgtgtttgatatttgttcacaaatataaggcattccacagtactaattgttccattcctcctttaatgaggggcaccaaagtctttctcctcaaccttaatatctgctgaacaacctagaaatgcttatatttgtggacagaggtagttgttttcccattttcctatcactattgtgaactgctaatgtttgggaaattctcagcatcctacggaacaatatgtgaataactgatggttatggcttgatcctcagcatggttgtaatgttgcatatctttctcttttttttttttttgcagagaccagaaaagtacttaggtgatattgaaacctggaacaaagcagagcaacagctgacagaagccttaaatgagtttggaaagccatggcaggtactatgacagtcactcccctcagaatgtttgtttcagtctatgctattagaagtgcatttccaacattcattattttcacaatatggttaacgagagtttgcactaatttcttccactatttttaattttacctgcactcagcattatcactagagtcctttgtcaaaaggtattatgctttatttagttttggcttaactctaatgtcgttttggtaacaacatgtactgtatgttgattactattgatagaaatatatttttttaatactgatttctattgatacaaatatatttctttatgccggataatattgatagaaatataatttagtggtaatgttttcagtaaacatcttaggagagattattcttctttgactcaattggctggttcctgtcatttttaaatttcaaataatttcatattctcaatctgaagtttggatgtaatactggcggaatacccaatcttgaagtctggctcgcaagttgtgattactggttgtttcctagcagtttttttatcccttattggtgtacttatttagatgtctacatgcagatcaatgaaggtgatggtgccttctatggtccaaaaattgatattggtgtgtttgatgccctcaagaggaaatttcagtgtgcaactctacaggttatattgaatgtcattttgtttttaattgtagacagaatagaaggttatttatctaaacttcatttcctgttacagctcgattttcagctgcccctacgcttcaagctgacttactctgcagaggatgaagccaaacttgagaggcctgtgatgattcacagggcaatcctaggttctgttgaaaggatgtttgctattcttttggagcattacaatggtaaatggcccttgtggttgagtcctcgccaagccattgtttgctccatatcttccaattcagtggaatacgctaaacaggtaaaaggtccttgtgtcatagaatttactaattactattaattagtagctcttctccattgatcaaagtgtgaaaatcttctagtaccttctgattcgataggtggtgctttgtcttagttttccgtggtggtccaaactatatttcttttagttcaataaaaactacttgttaaatttgagttgcctgatgggttttaaacatgtataatttttttatatgttactattattttgacgtggaatttgtctggtgaacctatcgctacaacccccagctgtgaaatatttttaaactttttgtactgcatgatgcactgtgtcaacttatttcatagaatacttatgtaccgaactaaatgccaaacaatttacacgtgtcattagactgtagtatgcatgatgcaggtttttattttaaattatagcctgatgtcgttcgaatgcaagtccaatttgatacagattatccacagctaagggcttctttttgatttatcagatctcacacatttgtctgacataagttttttgatatgtttgcatgagtaactattcagctaattgttaatttaagtcccagacaacattagctttctttttgcaaggtgaggatggcttttaaaaagtctcatgatgaaatgataacaacagtacaagattgtctttggtttcttatttgatcatatatacttcctcgatttcttgatggatataaacatccatgcagtgctggaaatgtttattccttattaattaggcttcgtttttgtattgagtggatttcatcacacagcattggaagtctgtctagtccattattattttaattggctcaatttatcttaaatggattccagatgacacttgggtgtattagtaatgtactttttataaacataatacattttgaagttcgcccactaattccacgcatggtcaaatgaaaccttgcttacagtggagtaagaattttggtaactaatcagttctcttctgtactcaggtccgtgctaggatacatgaagctggttttcatgtagccatcgatgagacagacaggacaatacagaagaaggtagttccatcatgtcatagtgtaatttatgtttgtcctttattattgtttgctttcaactctttgaatagcaaaacggaggtatgcaacaatatgtggtatgcattgttctgattttttgttgcagggactgttccattttggttttgcccatgctgcaagaaagttctattattttagtaatttagtttacacggttctcaacaatgtaatctgtgaattggtcacgaccatttttcatctttgcaggtacgggaggctcaattagcccaattcaactacattcttgtcgttggtgcacaagaagcagagactggacaggtttttaccctttgcacccctgttttcactagagatgtggaataattatttctttctgccatccatatgtacaggtgaactagacaattaaattcaagagatgaagtagtcatcctcagataactaaaaaaaacagcccactggttcatatgaaatgtgtagtcctatattatttatacggttgccttatcattatggcttacgctattgcaggtcagcgtcagggtaagggacaaagctgaactagccacagtgagcattgatgacatcatcacacgttttaaggaggaagtagcagcttacaaatgattttgatttcacacccttttgctaagaatttactccaaatttgtgattttgatggtgtagcgggcagtgtaatcttgctattttatttcttgacaaaagtacatctgattgtcttttcttaataacgaaagtgtgctattcttcatcagcgacatatatagggatgggtgtttgatcaactcttgc</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001068010.1 RefSeq:Os08g0295300]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 8]]
 
−
[[Category:Chromosome 8]]
 

Latest revision as of 13:01, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information