Difference between revisions of "Os11g0545300"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
[[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 11]]
−
GeneName = Os11g0545300|
 
−
Description = Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 family protein|
 
−
Version = NM_001074590.1 GI:115485828 GeneID:4350688|
 
−
Length = 11021 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os11g0545300, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 11|Chromosome 11]]|
 
−
AP = Chromosome 11:21932287..21943307|
 
−
CDS = 21940220..21940249,21940326..21940486,21940593..21940689,21940765..21940956,21941043..21941104<br>,21941173..21941319,21941647..21942460|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008404:21932287..21943307
 
−
source=RiceChromosome11
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008404:21932287..21943307
 
−
source=RiceChromosome11
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atgtttggtggaaaattccgtcgcagtaaagtttgttccaaatgtggaatgctttctaattctgaagaagattttactttgctaatgtttaatatacctcatcgtgaacaagttgttgctgcaacattagaagattgtcttgatcacattgtggaagaaaacgtacatgattcattatcccgttgtgaaagctgtatgaatgaccagaagtcaaccagtaagtgtacatttcatgaaactagagatgttgttattgtgttgcaaagatttgaaccacttacacttgggggttatcgaaagattggagaactaattaactttcctacggagctggacatttcaccatatatgagtggtgttgtaactgacaagcatatatatgaactgtttggaattatagttcatgaaggcggtgttatagggggtcactatagaagttacgtgaaaacaaactgttggtatgaagtcagtgatagagatgtgaaaagagtaaatgaaaattttgtcctaggggcacaagcatatatcctgttctacaacaggaaagaagaggccaaatcattcgatgaggttttagcttttgctgctacagctatgtcttcatctgatgccgtgcctacatcaacttcaaaagattacactgaaagaacattatcacctgaagtatcgtctgctgctctgtcatgttggattgatgctgcacgggtccttgagcccaagagttactcagaccaggatatcctagaaaaatatatcatttgtatggaccgtgacagttcagatgtatctgagaggataaggaatgccatgcggaattgtaatgagtccagacaggagtatcattttaatctccctacaacggatggacctttttatgatgacaacttggggcagtactgtcttcttcggggagctagatttcgaaccattagtacaagcagtaatgtagaagcgaagagagatagggctgttagaatgcacttccttctttctgaaatcttaaaactcctacagctgaaaaaagtgattgacgttggagctattggctatctggagaaatttaagtttgggaattattccaggagtgctcttttacggcgaattaatgatgcatgtatgctcttggggactaacagattatcccttaatatctcagttatgtcaagaggatctatcattgggccagtgctgttcaaagttggagaagatgtgatgattgatgcaagcttaagggctgtacagattccacacgacattcacttggtggaccatattaagttgaaaaaaccagtcagctttgttcttgttgttgaaaaactatcaatatttaacatgcttgtcaatcttaactttcatgtcacacacaattgcataatcatcactggatgtggaaaacctgatatggcaacaagaggtgcagtttttaaacttaattattgcttgccagtcaaagtttatatccttgctgatcttgacttggatgggctccagatatacttataa</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MFGGKFRRSKVCSKCGMLSNSEEDFTLLMFNIPHREQVVAATLE                    DCLDHIVEENVHDSLSRCESCMNDQKSTSKCTFHETRDVVIVLQRFEPLTLGGYRKIG                    ELINFPTELDISPYMSGVVTDKHIYELFGIIVHEGGVIGGHYRSYVKTNCWYEVSDRD                    VKRVNENFVLGAQAYILFYNRKEEAKSFDEVLAFAATAMSSSDAVPTSTSKDYTERTL                    SPEVSSAALSCWIDAARVLEPKSYSDQDILEKYIICMDRDSSDVSERIRNAMRNCNES                    RQEYHFNLPTTDGPFYDDNLGQYCLLRGARFRTISTSSNVEAKRDRAVRMHFLLSEIL                    KLLQLKKVIDVGAIGYLEKFKFGNYSRSALLRRINDACMLLGTNRLSLNISVMSRGSI                    IGPVLFKVGEDVMIDASLRAVQIPHDIHLVDHIKLKKPVSFVLVVEKLSIFNMLVNLN                    FHVTHNCIIITGCGKPDMATRGAVFKLNYCLPVKVYILADLDLDGLQIYL</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>7934..7963#8040..8200#8307..8403#8479..8670#8757..8818#8887..9033#9361..10174#atacgcgacacagaacacgggcttccctccatgaactcctcctcctttgtcgaagaatatcttccagcaggtgagacattggatctgtccctgtcaatagctacgagcaagatttatcgatgcagcgttggtcaggggcctctccgtctatctgttcctatggaacctgccggccgggggctgcttccatgggagagaaaaaaaatagtctggcggtggttcgttccatagaagcacggcggaagtagtctggctgcggttcgtcccattgaaccggatctgacctggtacgttactgttctttttttcagttttcgagtatgttttttaatgttaccacaacggccggcgatatccatggatctctttctgctgtcaatagcaatgggtgagatcgatgccgcagttacccgccacaggccagatcgatctaccggcgtcagtgatatcgccgtcgaacagttcccatgttcgagatcgagatgaactaacggcggtcgggcgagatcgatctaccggcgtcagtgatatcaccggcggacggggttctgatctccaaggggagtaaagtctgtcctgtctggtggtgttttttacgatattgtatagaacaacggcgacggcaatgatatcgatgaaaataatttgtcgccctgtttctattcttcagatagatcgtcgccatgatctctccaaggagggggtaagttactatttcttgttcagtcagttttccttaactccgttttctagcatttaattacctatagcggcagtttgcgtgcagtggcttcctacactgtacgattttgactggagattgtgctctgcatcttcaatacagattgggtggttagcatcgtcgaatccaggataaaaattgagggtaggctggactgaaagtcttaagtctaagttaacaatgctaatatgaggcatacaccattatcaagtcaaatgttacacttacatgattaaatagaaaaacatagttataaaagaagtaacttgacttaccagtaagttgctaattttcttagatcttagcaaagagttaagtgagaagcctcctggatatataaatgagcaaagttagtaatgcataaatggtagaagtaaacaaatattaactaaagaaagcaacatactgctaagttgttgcattttgttcacgaggcaaggatactttacaggatactttacaggttttcagggcttggaatcgcttcatgattacattatcattgatacttttaaatatctctattacaaatctaccaacaaatcaaatattaggaaatgtaaatgataaatcccctcacttgccacgagttagtactcactaacaagtagtaacaaataacaatgaagtaaagaacagtatagcttactcactctgtcacttagagactcactggaagcagccaagtagcaagccgagcagtagcaggcaagcaactccggcggcctgctgtgctgctctgcgcttgctgccgcggggccaccagccgtgcgcccgcgccgccgcgcgcaggccccttccccttgcagcttgcgccttgtcggctttgccgcttgcgctgtgcggctgtgccgctgccgcaatcgctcgtcgcccgcagctgccacgcggccgcaatcgcacgccgccgcagcgccacgaaaaatccccacagggcaaaggttagcagccacacggtccaaactccaaaaccctaagccaagacaaaacagacacaatgggccaagtgggcttttgctaaagtgataaatgggccattttacgcgtaccggtttagctacatgacttccatggctcctgttcttcttcctcgccgccagagacggagttcttcgcctcttctcttcttcctgccttctccagctgtttccatggaagagatgctatatacttaaattttttttgcaaaaattggagggtaggctagagcctgatggagcctacatgctagaatcgccactggttagcattgctataatctttctcataatagcacatatactttcacattttattattaaaaaatattagaaacagcaatatgattttaacagcattaggatactgcataacttgaccaatatgattttatatgtctgatatctgattgttaatgtaagtcctatgtccataaagcaaatatcatggatataaaccatggtaggtggaagatcaccattaaatactacataaggtcattatcttcgctatcattaaaaatttaaattattagtggcttctctttgctatctgtagtgatatccttatacctactaaagatgatatgtcatatcttatgttcatatacgggttataaaaagtgttcataacatagtggaacagttataaaatattttatatcgtattttataagttatgaacactttttcattgtcacgttagtatagggttggacaatccattctcatctgttgtagttataattttatacagcttagacaatctagcctttatacaacttattaacacgtgaattcaaagaattttcaattaaaatgaaaacatcgatgtattattaccctctagaattaatgtatcactcctagtaaatcctccaattaatttaagtaagaatatactctactctcaatattatttacctagatttaaaaaagttgtcctcattcatgaactattttccttaaatttaaaatatttttaaattataatacttacttttaatctaattttaaaatacttttaagagtaaattttactttggaccatctttattgaccgaaatttcacattgggctagggctaggctcatgttttcacttaacaccacgtatagttaccgttgtttgcactttggacctggttttatagttaccattacatgagttgttgtctaggtgcttagcattttacaagaaacaatgatatggaaatctttgccatgcaaatatgcttagcacaagaacaatgattgtaaatgttataggatatcctatcatcagattaatgggacttcattactactacatatgaacattcacaacccttatactatagagacaaaattggagaaatattgagtttaagaactatttttctacaaaagatattacatgttttataatacccaactgtagtgttagtacaaattattgaattctaagttttctaacacaaaaaagaaatgagatcagatctacagtcattatattatgtgtaatttgtgaaacttggtccaaagtgcaaatgatggtaactatatatgttaagtgaaaatataagtcttaactctagtccaatgtgaaaatttggtaaataaaggttgaccaaagtgaaatttactctatttttaaattatatactcctacataaacttatttctccactctatttattatagtgaattacgctttgggctacattttattacacaagttttactctggaccacgcttaaacctaccttctcactttgaaccaggtaagtttgtcattgttgcggtttggaccaccccgaatgatttttttcactacacaccaatgaccttaaacacattgcgatctcctccatgtatgtctacatggcgagaaaagttattcagggtagttcaaattgaaaagataggtaaaggtggtccaaagtgaaacttgggtaataaaaggtggcccaaagtgcaatttattctatttattttctagttccaaatttagatatctctaaattgtatttctatgtgcactcttttccttaatagtatttatttttaatctaattttcacatataaatttctttttctacgttgattcttgtctctattattatttttcagtttttaatccaaaatttggatttttccaaaattgtatttctacacgtactattatgtcaatatttactattatttgatccactgcgatgctattattttattatgatatattcttatgtagactcattagtcataatattatttaattttaatccaaatctaaaatatttcaaaattatacttctccatggaatcgcttatctatatatttattttttaattcaaattttagatatgtcaaaattgtattttgacctagactctcttaatattatttttatccaaattttaaatatttctgcatttccacacggactctactcccaatattaattattttttacgatattgtatagaataacggtgatggcaatgatatcgatgaaaataagttgtcgccatgcatccattcttcagatagatcgtcgccatgacctctccaatgaagggggtaagttgctatttcttgttcagtcagttttccttatttgtgttttctaacgtttagctatagtggcagtttgcgtgcaggggcttgggacatctttatgtaggattttggctgggtattgcgctctgcatcatccatgcatcgccgtcctaggtctagaacttataagaaagctgagatgaaatcggctatccctacatgagagggaagtccggttcggggtgtctacaattttccctccacgtcgaaagaacagaacatttggtaattttttatttgttttactcaatttgtcaagttatagtacatagtacttttgagaaacaatacatgtattttcatagatttcagtccattgtggagtcgttccttctaaggatatgaaggtagaatgtttcaaggtttattcacggtctattgcctgtttaatgtgcttgtatgctaatattgtgaatgccgttttttaaccctatttgaattttcttagtacatacaatcctttcttttatggctctaaattttcgaagtacatacaatgtttttttaccttttttaaatctgaattttgaaatgccattttatcaagaacagatatgttattctgacctcacattttttttgtttttagcgccttattttctatcaagaaattgcccaagtgaagattgtgagacctgattttcttagtatgtgatttggagagaaagacttgaaattcactttattgcatgaaaattttataggaaatgtctaaacttggtcttaatcaatacctcattgatggtggtgagcagcgaacatctgccaccacccaccaccacttaaccattaggacctgacacccaagaagaaaaggttgtatcctacaacaacaacaacaacaaaactgggcttgccttttttacttgttagatgagatgttcattatcgtagaagcttgttattggatctaaaaaagaatcattggtattttttttgtttatgttggctaaatttaaatggctgaatcattattattagaagaaagatatacaataattttgaactctgattttataagaattatctgtatgcatatttttttacttgtctccttggctattatgaaaatagatttaatattagaattaccctaaaattaagtactacataggcacagaactctcggtggcacacattggactaaatgagagttatgtgctgttttgccttttaccagtgctaagtgctatcaggctgcctgtgattctttgttatgtgctgtgattctttatactatgtatgcatatatgcacttgttctcctggtgatgctaaccgaataggactaagtataattcaaaccaagtcctattcggcccaaacggaaacggacgggagtttttacaatttttgtggaatcggacagattcgtttttttcgcccaaattttttttaccgcgtcgatcgaatcggatttgatttgtttttttaccgggtcgcatttttttaatcgcgtcacatataattccttttttttttcaatgggacagattcgttttttttcaccttttttttaccgcgtcaacggagttggtttcgtttttctttctcgcgattttttccagctttttttttggatcggacagattcattttttttctcccgttttttttttctacccgatatttttttcgcctagtgtttttgtcctttaacttataagtactacatatgaggaaccacatgttatttgatatgggaattggtggcagatttactgctccgttattttcttcttttaaagtggttgtatattttaaagttataatcgctacaaatggtgtgctctctattctattaggatttagtctaattttttttacctttgaatctttgtatctatatattagtcaccctgttacttggttaaacactttacataatacaacaaatgtgatttgggctttcttgtggaacaatcatgttgttttagtctgtatagaaaacatattcaaattatgttgttagattaaagggttttttttttccattctctcaccttctccctctcttctctccctcccaccctccaaatcctattcagatcttcctgggaactccacctctctctccctctctccctctccccctctcctctccctcacgccctccaaatctcttcctgggaactccacctctctctccctctcccactcttccccctcttctctccctcttttctctcttctctccctcttacaccgtccaaatccgaacagcagcaggaggaggaggtgctgcagtgagtggctggaggagatgctgcagtgagcggctggaggagatgctgcagtgaggaggaggaggagatgctgcagtgaggaggatgaggcggctgcagtgaaagaaaatacaccaggggacagatccaatcacttgaagtgaaagagaatacaccaggggatagatccaagcacttgaagtaagtactgatgaaatgtgtttgccattttttttggaaatgtgtttgtccaacaactaaatgttgaaaaatgtgcagattggtgtaaaatgttgaaaaaagatccaaataaagagtgagtgctttattattttttatttaaatattgtttaaggtgcataatcattccctaatgaatatcttttttttttctctaggacaattctgtcagtttcagttgctggtgcccaaaatggcagggaagctcaatggactgttgataggactgtgtacacttatgctaacttctatgatgattttaaagccaaggtttttgactttggtgataggctcaagatttcgtttatagaattagttcagcgtcaagaaaatgatctattgcttggatcttttgagaaagagttaagattaaaagtacttctagcggatgaacatgatgaggtatccataaacatttgcttaatcccacccatgttcggttgttaagctaaacgattatctaaatttgttaggagttaaatgactatctaaatttgttaggagctagcatggttgttaagttaaatggctctatctaaatttgttaggagctccaaagtgagaggtttgtcaagatgcaggggaagcatcaacctgttggtttaaaaaatgagaaaaataagcaagtattgttccttttttttccatcttttttgtcagtgtttgtttaagttccatgtccttaatgttttgtgtatagctgttttggtaatgtagtgctccaatgtttggcaatcacggaaccatttgtttcaagactctttggacaacaatttggagaagaatgtatgatttaatcacaatttttttagtaaaaaaaatatttgtttaagtactaaacgtgtagtgttttaggcctaggaaactgtcacgcttgcgacctgcgccgtgatctgaagaggataagaaaaactggtgcaccagccttctttcccactatctttaagcatattcgatcattaggtggtgattttgaggatggcttgggacgtcatcgtgactcttctgagttcttattgtaataacttaactcaacttttgttgttttagtttgcatttcagttatttttgtgtgttatagattatttttcttttccaggttattactacaaaagttatttgatggtacacatggatgtttaacagatatgtttggtggaaaattccgtcgcagtaaagtatgtttgttgttttagcaattttgacatgtgtttcactgattttacatatagcaatgttttaatgtatgtgcaggtttgttccaaatgtggaatgctttctaattctgaagaagattttactttgctaatgtttaatatacctcatcgtgaacaagttgttgctgcaacattagaagattgtcttgatcacattgtggaagaaaacgtacatgattcattatcccgttgtgaaaggtaaaatttccgatttgtgaatcttaatcgtgtatcatcatgtttatagtaagttcaagttgtttatagtaagttctttgtttataaaatattttcttttgtgtagctgtatgaatgaccagaagtcaaccagtaagtgtacatttcatgaaactagagatgttgttattgtgttgcaaagatttgaaccacttacacttggggtaagtaaatactgttatttgttgttatataatcacttaattgaccatctaacacctaataaatatgtctttaagggttatcgaaagattggagaactaattaactttcctacggagctggacatttcaccatatatgagtggtgttgtaactgacaagcatatatatgaactgtttggaattatagttcatgaaggcggtgttatagggggtcactatagaagttacgtgaaaacaaactgttggtatgaagtcagtgatagagatgtaagtttcataaccattttgtttaatgtgaatgacaatattgtaaactgattcacatgtcaaaatgacattgcttgtatttgcaggtgaaaagagtaaatgaaaattttgtcctaggggcacaagcatatatcctgttctacaacaggtatcgtagttcattttgacaatatgtgtgcctttatgtgagtttgaaaatctgaacttcattttcaggaaagaagaggccaaatcattcgatgaggttttagcttttgctgctacagctatgtcttcatctgatgccgtgcctacatcaacttcaaaagattacactgaaagaacattatcacctgaagtatcgtctgctgctctgtcatgttggtatgtttaagagctctttatttcgatgcaccttcctatttttaatgaataatgttgactttttaaatgaatgacgttgttaacttttctatactgtttgtcttgttgaaaaaaagttatgtgaatgtcaattactttcttgtgacttgttttatcttcaaataaactattatcttaacttatacttttacatatgtgtgcactaagtttttgaataagatgaaaggtcaaacatcatgcaaaaactcaacggagccataaaaagaaatgtagtagtatactgtgaataggagtatcatgaaatatctaatttattgttgtttctaggattgatgctgcacgggtccttgagcccaagagttactcagaccaggatatcctagaaaaatatatcatttgtatggaccgtgacagttcagatgtatctgagaggataaggaatgccatgcggaattgtaatgagtccagacaggagtatcattttaatctccctacaacggatggacctttttatgatgacaacttggggcagtactgtcttcttcggggagctagatttcgaaccattagtacaagcagtaatgtagaagcgaagagagatagggctgttagaatgcacttccttctttctgaaatcttaaaactcctacagctgaaaaaagtgattgacgttggagctattggctatctggagaaatttaagtttgggaattattccaggagtgctcttttacggcgaattaatgatgcatgtatgctcttggggactaacagattatcccttaatatctcagttatgtcaagaggatctatcattgggccagtgctgttcaaagttggagaagatgtgatgattgatgcaagcttaagggctgtacagattccacacgacattcacttggtggaccatattaagttgaaaaaaccagtcagctttgttcttgttgttgaaaaactatcaatatttaacatgcttgtcaatcttaactttcatgtcacacacaattgcataatcatcactggatgtggaaaacctgatatggcaacaagaggtgcagtttttaaacttaattattgcttgccagtcaaagtttatatccttgctgatcttgacttggatgggctccagatatacttataaacttggcagcaaagtaagggcttttgagaactttgtgttgcatctagagatcttatatggctgggtgctagaccagaagattctctacttttacaagaacccaatgaatttaccagagtgcagcagaaatctcttactgatcttcgtgattctcttcccaatatttcggacagagatcgtctaaacactgtgttggactggaactttacattgaatctgcatgacattcttgattatgagaatattgtagagtatttgactaatcgaatggcagagtttgaagatccttgatggagaaagatctgacctcagctgtttgcccataagtgaagctgaagatgggttgccaaacgtgtgtcgccatttatgccacttgtatattttgcacgattgcatcttgtttactgcaataggcgatactgtgccagtgtgccaccatctggatgatatcccctactgactgtagttctcattctgggtaattctaattctggtttttaagagtatgctgtaacgtaggagcaatacctctttgctgataagagtttaacagatcaggcaatttctgattaacttaaagactacgtgttttgattaaccgtcgcttaaaaagtgtgttagtatgacatttacttttgtttgtctttgaactgtgctgaatcctgggaagtccgatgggtgccacagctgtgatatggtcaaagatgagatctccgggcggtggtttcccggattgtagatttgtagcacagggagtattgctgattgtaatgcaaacttttggtcatatttacgtactttgcttggtgagattgacattacttacatggtgtgtttatttcacgct</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001074590.1 RefSeq:Os11g0545300]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 11]]
 
−
[[Category:Chromosome 11]]
 

Latest revision as of 13:56, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information