Difference between revisions of "Os04g0278200"
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Revision as of 19:50, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0278200 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001186902.1 GI:297722934 GeneID:9267104 |
| Length |
33160 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0278200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:11812944..11846103 |
| Sequence Coding Region |
11813635..11813646,11814281..11814433,11815727..11815831,11816990..11817090,11819716..11819794 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>LVKQDDSAGLGATRNEQTEENATGLQRIEDGSVVSNEHTVKWRI FTDNARDFLLKRNLDEAEKFFQAALHEAKEGFGLRDPHVASALNNLAEFYRLKKEYEK AELLYLEAIEILEESFGSDDIRVGTALHSLGICYHLQRKFALAQTCYERALKIEGRVM GIGHPEYASTMYLLGKVLSQQGKDAEALIEESIRILEESGLGESPICIQRMRYLSTEL IKSNRLAEAENWQRKILHNLELSKGWDSFDTTNAAELLTMTLQTMGKLKESEELLERC LEVRKRILSEEHFQITYQVFEFFTTSSALLAINTDWEVFVPCAPATMLDWEAM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>692..703#1338..1490#2784..2888#4047..4147#6773..6851#7398..7409#8169..8234#9692..9754#9838..9894#16220..16295#17792..17891#17978..18023#18156..18275#accgtcatcctcgccgtccccttcttctgcgccgccgccgccgccgccgccgccgccggagggcggtgccgcccctctcttcctctctcgtcaacgcagcagcaaaagctagcgtgcgccgccggcacgcaaagcttcccccgctcctcttgccctcctctagctcctcccccatccccgacctagggcttcttccaatcctccgctgccgccgccgccgccaccttccatccagcctccgccgaccgctgccaaccatggcgctctaccgccgcctcctccacctccgccgcctccagcccccggccgaacacgcctcctccgtagcctcagcgactccccgctcttcccgctgctcacgccgtcgcgccccttcgccgccgtctcctcaatcccccgcgtcgagccgccgctcctcgtcgtcccctccggttagtacctattctactctggtggaacgcgtttgggaaaggatttcatgagtttctatgtgatggattcgatgaatctgcggttattctgctaaacggatgatgaaacttacatacgtcctcgaaatttctgtggcgtgagctaatgaggaggcatgatttcatcctaaatgcattgcttctcctaggtttggcgcgcgatggtttcttcggacgtaggggggatcgccagttcttttcaactgttggtgctgtcttagttggtcaagcaggtctgctttctatctctctcctgtgtataccgctcatatgttagttttccttatgtgtatccgctgtttgcacattacatgttgcttgcccgtacctcaattagcaaaatttgagtagtatataattactttactaaatgaatctttaacttgtgccttctgtactggttgcatatatgcaaagaacccaaatgtatttagcatccgattaggacaacaaaactaagctgcagctgcaggttctttgtctaggttgtaggatccttgatttagatcacttggcactgatcaatggaagtatactaactaattcctgaaacagccacatgcataatgttgtgatggttatatgcactgcgtagtgtgtaagacaacttgttttcttgatgttactattgctatatacaataatttcgttgttgtttcattttttgctacctcttaccagttctgtgtatgtgttacaacgttacactttcaaatttttacagctatttagttaaacacttatttatattcattttcttcttttacatctctttaagtgaattttcatattatgccctgaaatcccaacttcaatctgaatacagctatttttcttggtctatgcaatgactctgcactggctcaggatgattcagctggtctaggagctacaagaaatgagcaaactgaggaaaacgctacaggtttacagcgaatcgaagatggctcagtggtctcaaatgaacacactgtcaaatggagaatcttcactgataatgctcgagattttttactgaaagcaagtaactcataacctgtagatttattcaaaccaccttttgtctctaacttacttttatactgttttaccgtttattctaagcaatagatctttctaaagaacagaacagcaatcctattagatatatataacagaacaacaatcctattgtatagtccagaaggtggttgatttttcagtgaatcaatttgtactcgttccacactttccggtcacctgctgatactgccagtaggatgacatcatcagaaaccttggatatgcacttctagttttcctattaagctatttatcgcttcacatatgtattccacaaccataatgttaggaaaataatttgcttttgctcgagagcttggttcagcacttccttccctgacagggaacttatgtgtttattattggatggggagaacaaggataacttgtatccatgtgccggaccttcattctgcatttctgcttggtggagaaccctaccaagcatataacatggatctcctatctgcggaaaggaaaaagaatttcacattcttcctttcaggatgggaggattccggaagtcttattggtatcagcctatgcccagtggcttggctctcgagccatatgtgagttcttttctaggtgcagccatgccatcctggatttgaactagagacctctcataattatttgttccaaaatttgatgctcttatgaagccatcaggctggatatgggttcatgattgtgcttatccttctatttctagtaattgaggaattttgttttatgctacgttaaaatataggattgcatctcgtgttttgagtcttaaagaagtataccttcaaacaatggctttggctgtatgcctgtatctataatggctttgagggaatgtgcattgaagtgaaccactggacagttctctttcatttttagtagaaactgggacttgtcactctccagtttccactcttgcgtattgagtggcttaaagggtatacttctacccatggtttcattttgtcacttgagtggtatttagtgcagcatgttaaagtgaacccttaacaatctgcaatgttcttgcattgtagcaaagttattctcctcaaaattgtgatgtgagccaggttagacatgtacactgatatgaatatattagattggaaattttgaatcatattttctgcacatttatatcttggaagttgctcattgtctgagagattgtctaaaggctgaatctttagtcatttatactctttattatgccatcaaaggtttctttccattttgtagagaaacctagatgaagctgagaagtttttccaggcagccctacatgaagcgaaagaaggatttggactgagagatccacatgttgcgtcagcccttaacaatctggtaattgttagtttggttatttactgaagactaatatgctctttaatccataatataaccttgagttttacaaagttgaatggccttgctttgctttgaataaataaataaacaaattcatatacacatgcacattgaatcggcaacttatttgttgtggtgcttggttttctccgtgacctcattctgttgttatccttagaagagctgcatgttagttgccatcgctccttcaccatgctcaacgctagttacatgctagcttcaccactttgccctgaaccataatttggtctaaagttattttgtttattgggatacattttattatatttttgattttttttgttaagatatactccccctgttgtcttttaaccgttgttaggacaaggacattgtctccagggcattacttttcctattttatattcataaaaatattaaagatataaactgcatggaagggattcgaatgaggtcattatcagataccaaatcttaatgttgttacacatgttaatgagttaagatttcgaggttttactgcaccacgttctagggcatcatctatttgagaacacagggaggtggaagggggaggtcagagggatgaacgaaccattatcaccaacacaaatatttatagtaaacataattgataataggtatacattcttgctcttcttgagtaccttgttgagggtctcagtatagtgttcgcctttctcgctgaacatgttgggtgattttacatctaggggatagcatattccaaattgcttagggttacttactaatacgttaaaattacatggtaaaatatccaaattgccatgtggctatctgatcttggttgaagagagcataacacacacagatgtcagcttacattcacttagctgaagcagattattgatgcaaggacaatggtggggaaaaagagggaattgatgaggaggattaggatctagtaccatgatatgttttgccacccacaactactcttcattctgtttgcgctaatcacactcaagttaaatgggccaggtgtagacagggctatgtatatgtcaatactattaacaccgcaaacaattaatactaggctggatggagccaaatattttaataaattgttactcccaaattttgcaggctgagttttataggttaaagaaagaatacgagaaggctgagctattgtatctggaagcaattgaaatcctggaagaatcatttggatcggacgatataaggtacatttggatcttctttttctgctatcattcattatgggtagactgcaaatgttgtattatcaacttggagtattcactaatgttaccactgtaactaaactttatgccagtatagaatggtgagaaaattaggtataaccagtacagtactacccaaatcctatgcaccattaaaacaactagttgataccccgcgctttgctgcgggatatgtggatgaatgcatgttatacattctagaaatgatagatgtacatgtttaaataatgtgaaaatgataatgatttgacattggttgcatattgagttctaaaaatacaacaaaattgtaaatgatatgttatatttgcatgatatttaaaatactatagataataattgctagtgggtgatgacgtagcacacttgcatgtgatttaaaatactctagataataattgctagtgggtgatgatgtggcatacttgcatgttgatctttagaagttagtgggcatcaactttatagtaaaataggattaggtccactttaatcgaaacttttcaagttctctcactttatcattcctgttgctcctgtcaaatcgcccaactggcactaaacaccagattcttcttgatctcctccctgcctctggttggtagacaacccccagatgcacctcatgctgagttcccagccccttcc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