Difference between revisions of "Os04g0341500"
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Revision as of 19:51, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0341500 |
|---|---|
| Description |
Terpenoid cylases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid domain containing protein |
| Version |
NM_001186951.1 GI:297723032 GeneID:9267045 |
| Length |
13674 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0341500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:16172606..16186279 |
| Sequence Coding Region |
16172606..16172899,16173427..16173675,16175990..16176125,16178731..16178949,16180218..16180596 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaaaatgtcgacaggccatcctccaatctggccgccggttgggctcctttctgctggtgccccggcaaaagtctccttccgacgacaaagcaatgcgcatcgacatgctgcacaagttgtgtccacacaatcaatcactcctgcgaaggaggtgtctagctttgagccctctgtgtggggggacttctttatcaactatgacacaaagccactacagagatcggaggattggatgatggaaaaggctgataaactaaaacaggacgtccgtatactgtttgagacccacaatgatacagccaagaaaatgcacttagtagatgcagttcaacgtcttggaatagatcaccttttccaagatgagataaacaatgtaataagtgacatcaaagaaagtgaattcactagctctagcctccacgaggttgctctccactttcgcttacttagggagcatggcatttgggtatctccagatgtattcgaaaaattcaaaggagaggatgggaggttcatcaatacaatagctgatgaaccaagggcattattaagtttgtacaatgcagctcacctccttgtccatgatgagccagaacttgaagaagctatgtcttttgcaaggcaccacctcgaatcaatgagggatggaagtaggctcaaggcccctctagataatcaaatcaaccgtgccctacacttaccattaccgagaacctacaagagagttgaaatgttgcattacatgctggagtacggacaggaggaagagtgtattgttgttcttttagatcttgcaaagctggaatttaaccttctgcagcatgtccacttgaaggagctcaaagctttttctcagtggtggaaagatctttatggatatgtcgagctaagtcatgttagagatcgtgcagtggagtcatatctttggtcctatgcgctattctatgaagaaaacttaacactcacacggatgatccttgccaagataattgtattcattgtccttatggatgacacatatgatgatcatgccaccatcgaggaatgcaggaagctgaatgaagccatacaaagatgggatgaaagtgctatctcattactaccagagtacatgaaaaagttctaccgtgcactgcagaattacttcagggagactgaagctcaagtagaggccagtgacaaataccgggtgacctgcatgaaaaaagagttccaaaatctatccacgtattacctgcaagaatttgaatggttgcatcaaaattacaagccagcatttaaggagcgggttgctttgtcaaccctgtccagtactgttccactactctgtgtgactgctgcagttggccagggtgatgcagtaacgaaggaatcatttgaattgacaacagtacgatcaagtgccgttatagcttgtgcaaagattatgcgtttcatgaacgacattgctgcattcaagtctggaagaaagaacaaaggagatgccgcaaacactgtagagtgctatatgaatgagaacaaggttacaagcgaagttgccttagacaagatcgaatcaatgattgaaagtgaatggagaaccttgaatcaggttcgttgtgatcatcaccagcagttccctgtggtgcaacgacttttgaacttggccgtatcagtgccattcttttacgataagaagaaagatgcatatacattttccaggtatattcaggagattgttggggatctgtttgtgaatcctgtccccatctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MKMSTGHPPIWPPVGLLSAGAPAKVSFRRQSNAHRHAAQVVSTQ SITPAKEVSSFEPSVWGDFFINYDTKPLQRSEDWMMEKADKLKQDVRILFETHNDTAK KMHLVDAVQRLGIDHLFQDEINNVISDIKESEFTSSSLHEVALHFRLLREHGIWVSPD VFEKFKGEDGRFINTIADEPRALLSLYNAAHLLVHDEPELEEAMSFARHHLESMRDGS RLKAPLDNQINRALHLPLPRTYKRVEMLHYMLEYGQEEECIVVLLDLAKLEFNLLQHV HLKELKAFSQWWKDLYGYVELSHVRDRAVESYLWSYALFYEENLTLTRMILAKIIVFI VLMDDTYDDHATIEECRKLNEAIQRWDESAISLLPEYMKKFYRALQNYFRETEAQVEA SDKYRVTCMKKEFQNLSTYYLQEFEWLHQNYKPAFKERVALSTLSSTVPLLCVTAAVG QGDAVTKESFELTTVRSSAVIACAKIMRFMNDIAAFKSGRKNKGDAANTVECYMNENK VTSEVALDKIESMIESEWRTLNQVRCDHHQQFPVVQRLLNLAVSVPFFYDKKKDAYTF SRYIQEIVGDLFVNPVPI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>13381..13674#12605..12853#10155..10290#7331..7549#5684..6062#4882..5140#2541..2748#1..11#atgaaaatgtcgtgagtctctctctctctctattggaatctttctactactggtagataaacaagtctttaatacgctggccttctactgatcaagaacaaatgaatcagaatctgacaaggttgccagaaataaaaataagcagattagcagatggtacacatccatatgtaggatggctgctttttcatcacaaacacgactcatgcattctaacatagagaaaccaaaaaattcaaaccacgtgaattccaggccaaaggaacgtacgtatacctgactaacctgcattatattatcctacaagtcattttttgctgaccttaaatattgttttgatcgaagaatagtttcatttatttatatatatttttagtactcctttcgaatgtcgatctaaaaaaaaatgtgcgtgtattgattagtacttgtagtacttctactccctctgtcacaaaaatatctaactctgaagatgaacacatgttcagattattcatctatggaattggattttttttttacacagggaagaagtacatggagtcttaatcctgagtgagcatagggaagtctaatactaattgaacgctactggaatgaacgtcagaacggggcagttgggatagggagatgagggaattcggcagatgaatccacgagtggtatactgttgatcgacgtcagcaagcaccggaatttctgcctgcagggccattctcctccacacaagaccatcatatgtaaatggtctcgaatggaccggcagcagttagcgtgcagctcttggtctctcaaccatcgtactactccctccgttttataatgtaaaaggatcttaagtttgcttatagtgtttgaacattcgtcttattcaaaaaaattttagaattattatttacttttttatgacttactttattatccaaagtactttacgcataacttttcgttttttatatttgcataaactttttgaataaaacgagtggtcaaacactataggcaaaaactcaaaatcccttatattaaggacggagggagctaataactaattagcactgtacttgttttggaagactcagcgtacgtgcttcatgtttatcatctgccagaatctagcggcatctttttccttgcttaccacgagcacgtactgtacgttttattttttaaaaaatcatgtagaagtccttttcaaaatcaaatgaactaatttttaaaatttctaacagttaatatttaattaatcatgcactactagcttccctcttgtttaatttcatttggcaccgacttatcaaatcctacggctctatcaaactaagggtatcaacaatgtattatttaccaactactccctccgtccaaaaaaaacgaatctataattagatgtgacacatctcagtacaacaccctcattttacataccttcagtacaaatctggacagaacaatacatcccttataccaaataataaatattgtagtacataccttctaaaataagttcattttacacattccacctaccaatgtataaccaacacaactagaatacccttactttcttaaaacccaatgccattattccttactaagagtaacaatgcttttttattccttcctatgaggttgtagtgctattactacctgatattagttgcttagtaccttcacaatgtttactaattggtactataagagatgtatttatcgcttactatacccttgtcccaaatatgtatttatcccacggtaccaatacaagaccaaaacgaccataataccgttacttgctgagatgatcaatgtttttttattccttgctagcaggttgtaatgcaattgtcacatatttgtagcttactacctccaaaatgtttactattcggtataagtgttgtatttggtgcttactacaccctcatcccaaaataagttcatgtttcacacatctcacaccaatacaaaacaaaaagaccacaatacaatagttttctcaaatgacaatgaaattcttgctaaaagaattaatgtttttttattccctactagcaggttgtagtcctattgctctatatgtgttgcttagtacctccgtatgtttactatttggtataagggatatatttattgcttattacaccccgctcgtaaaataagtttatttctcacacatcccacacatagcaaccactatctatttaatttatttatctattttttcttctcaaccaatcacaaacttcatccaattatttttgttacttctttaatatccatgcccacctaatatttgaacggagaaagtatctattttgtgacaaagacagtatccttttcaagagttcattctggaagccctatgccttatcctatataaagcagctagctagctagctaaagcaaccatcagactaccacactacaatagtatcagtgaactgctagctgttgccctcccaagggaaatatactagtatgtctacttccatccctctccctttcttcttctctcatggtgttgtgcatgctaggacaggccatcctccaatctggccgccggttgggctcctttctgctggtgccccggcaaaagtctccttccgacgacaaagcaatgcgcatcgacatgctgcacaagttgtgtccacacaatcaatcactcctgcgaaggaggtgtctagctttgagccctctgtgtggggggacttctttatcaactatgacacaaagccactacaggtatacattttttttttcattttcatattgtgtacattttgctctacagcaaaactgtacaactgttctgtagaagaatatcatctggttttctagtcaacataaacatataacctgatctaacaagcatatcaaaagattgctgacaggcctgaaacaaatttcaccaccatgttatcacgtacaaaacccttaggaattaatatatctgttcttgtttacttgtcaccttaaccaccttttgaagtttggaaatatttatcgatcactacacggttacgaaggtgataattctcattttgcatatgttacccatatgcatgtagaagagattacatatcccaccaacatatgggtattttggttgtttcattaaaaaaagttgattacatgggtatgtgtgcatggtcaatagtgagcaataaacaaaaatggtgggactaataccggcacatgtttaacgtcaaacacgctccggctgcctaggccacgcaggcaacttgtttacgaagatccgaattttcccagataggcatcaaaaccacacacaaaaaactggttttcactggctgacacgttaagatgctcgagtgcataagatttttgctcaaaaaacaaaaaaaaatccaaaataataaaattctagaaaccctatcttgatatccaatacaagcatcatcgcaatcaatatgagatgacataattaaggaataaggacggaatgatgcgacataaagagtgactagaggtcgggcagattgatgggcgtatttattttggcttcgccttttcacacgtggtcctattatgaggccaactaggattgtttttatagacaattttgggtattttctatgaaaaatacgattttatcgaccgggtctttaagacgggcacctaaaagaataatcctatttttagacgcgcctcctaggaagcttgcctatgaaaattgactctcacagtagagccttgatcggagagcctacgctttttcatatgtaggtctttacttaggccgcctattaaaatataggggttgttcatgaaaatagttctttgtagcatgggcaattactccctccaatgtttctcatttggtatattgacgtgcagattcccaaaacaacttcaactaagtcttgacttctatagtaagagtggcatattttagctgtaaaatcaacggcaatattcacatgacaaattatataattaatacttctatatctaattatgtactttgaaaaagtgaaaaaaacacaaatatacatattttttcaataatttacgtttatatacctgcacgagatttgcaaaaatatacccgcttcgaggaacggaaacgtgggaccgcgatggtcccgcagttctaaaacacgggaccgatgtcccacggaacggtcgcgcgggaccgcgatggtcccaaaacgcgggagcgaactggccagcgatttatttactgagtcggcactgtttgacaatgtttcgggtactgtttgccactttacatcactgtttagacctgtttatggccagttccgcacattgaacctgcggtaccgccttacaaaactgtgtcaaacagggctacacagtgtccatagtgctaaacaacgttaaaaatcactggctgcctcgctcccgaattttgaacctgcgggaccgtcgaggtcccgcgcaaccgttttgtaggatcgtcggtcatgcgttttggagcggtcacgcgttttagagctgcgggaccatcacaggcccgcgtttccgtcccgatatttttgcaaatcgtctgatgtagatatataaatgtaagttattaaaaaaaataagtatattagcaaattttttttctttaaaaagtttgcaagcactcattgtagaacggcacatatttggaacttaaaaggataaaggggcgacatagttcacattttcctagcggatcaatggagttttatcatattttttttattacatttgatttaatgctgattttggcaagaaaaaaattggtcaaatccacaacagaccaacaagttatctaaaaggaatattttatttcacctaactatttgttcctgtatttctttcatttgattctaacaaatcaaatttttgcatgcaaataaacagagatcggaggattgga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